4CBXA

Crystal structure of plasmodium berghei actin ii
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
369
structure length
358
Chain Sequence
SIALVVDNGSGMVKSGLAGDDAPKCVFPSIIGIPKECYVGDEAQNKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWRHTFFNELRVSPEEHPVLLTEAPLNPKTNREKMTQIMFESFDVPAMYVSIQAILSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHTVPIYEGYVLPHAINRTDMAGRDLTYYMMKLFTERGYTFTTTAEREIVRDIKEKLCYIALDYDEELKKSEERTEEVEEMYELPDGNLITVGSERFRCPEALFNPSLIGRECPGLHITAYQSIMKCDIDIRKELYNNIVLSGGTTMYNYIGERLTNEMTSLAPPSMKIKVIAPPERKYSVWIGGSILSSLSTFQKMWITKEEYDESGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Motor protein
molecule keywords ACTIN-2
publication title Structural Differences Explain Diverse Functions of Plasmodium Actins.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium berghei
total genus 115
structure length 358
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbxA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbxA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4cbxA03
4H0XB 1T44A 3L4IA 2AA4A 1ZXOA 4FWPA 3WQUA 3ZEUB 2ZGZA 1MDUB 3FZFA 3QB0A 1HKGA 1T6CA 3MCPA 2YI1A 1BO5O 4BVPA 3VF2A 4FWMA 3JXUA 1NGDA 4BRLA 5KQDA 5AFUH 5KPTA 1XC3A 2V7YA 5BPMA 2A40A 4IZ9A 1NLVA 4PL7A 1Q18A 4Y0WA 2DPNA 4B1XB 2Q97A 5CE3A 2I7NA 1NMDA 3O80A 4IWVA 3I33A 4BQLA 4EHTA 2QWOA 2AP1A 3GOIA 2EWSA 3CJCA 3ZX3A 1BU6O 3UKUB 4BRHA 4CZGA 2P9LB 1NGCA 2E2NA 4JN4A 4XH4A 4DB3A 5AQKA 4WQ4A 4B1YB 5FPDA 3CETA 4BRDA 2P9IA 2VYPA 3CJ1A 1EQYA 3FFKB 1TUUA 2D0PA 1HUXA 1GLEG 5AQXA 3HSCA 3ID8A 5F1XA 3EKUA 5EY4A 3C7NA 2FXUA 1QHAA 4H5NA 3JS6A 4M7YA 1KAYA 3MDQA 2GUPA 2WUSA 4FWOA 4J8FA 3KZBA 4YDUC 5F0XA 4DCHA 2CH5A 4FWNA 1S22A 3VEVA 1R59O 5JLFA 4JD2B 3VOVA 4EIAA 3VEOA 1K8KB 4K25A 3VEYA 4FWLA 1CZAN 5FPNA 3GL1A 4BC4A 3ATVA 1TYQB 4CBUA 3O08A 5AQUA 1XQSC 1MA9B 2E88A 3HTVA 1KAZA 4JHDA 4WQ5C 4BRPA 1YVNA 3UE5A 2CGJA 5AQLA 4BR5A 3VENA 3CJ9A 3ULEA 4IO8A 4LC9B 4BR9A 2PBDA 3EL2A 3O1WA 3FZMA 3HZ6A 2ASOA 5AFUA 3U9ZA 1HJOA 1ZBSA 5LJVA 4GNIA 3H3NO 4EHUA 2P9SA 4BC2A 4FOEA 1XUPO 2NLXA 1G99A 3DXMA 1QZ5A 5EOYA 1RDWX 4BRAA 2GEMA 1YXQA 1JCFA 2ZF5O 5AQYA 4CD1A 1NM1A 1TUYA 4FWKA 3QBWA 5EVZA 2Q31A 2P9KA 3VETA 3SK3A 1NGIA 3H3OB 2FF6A 2V7ZA 4DHYA 5AQPA 4WQ4C 3TPQA 1X3NA 1V4TA 3A5MC 1KAXA 2H3GX 4IJNA 4Z94A 4K42A 4EFHA 1NGHA 1GLFO 2HF3A 3D2EA 1BA0A 1BA1A 5AQTA 5BR9A 4CZFA 3M1FA 2P9UB 3FLCO 2D4WA 5BPNA 5AQHA 2QWLA 5ADXH 5AQQA 4CD3A 3CI5A 3MMVA 4FO0A 1QQOA 3DXKA 3VEXA 4FPBA 2E2OA 5BRHA 2P9NA 3UKRA 3WUHA 2GTDA 4CI6A 1QQMA 3CERA 2QM1A 4PKIA 4B1UB 3C0BA 4H5TA 3O1BA 4RWTA 3W3DA 2QXLA 4BRQA 5AZJA 2FSKA 5AQJA 2YHWA 5AZIA 3LM9A 4BRIA 3WEEA 3M3ZA 3A5LC 1HX1A 4NO7A 1YAGA 4BREA 2YJEA 3OHRA 4RTFD 1U2VA 1NGEA 1NGBA 1NGAA 2J4RA 5AQZA 2CGLA 1SAZA 1HLUA 5LY3A 3CJBA 1GLCG 3D2FA 3O4WA 3MN5A 5AR0A 4BG9A 1T6DA 3ZETA 2A5XA 4JAXA 1NBWA 4BR7A 4HTLA 2P9IB 4MLEA 3W0LA 2ZGYA 4XEIA 4ISEA 5BREA 4BQZA 5B8HA 4AM7A 4BR0A 5EX5A 2CGKA 2PAVA 3VGLA 3F9MA 2Q36A 4BR4A 3C7NB 4CBXA 2A6AA 1HPMA 4BG8A 5KPRA 2E20A 4XH1A 2GELA 1HKCA 2HMPA 4BRNA 5ADXA 3SLCA 5LJWA 4L3QA 3FE1A 3CQXA 3GDQA 2Q0RA 3VGMA 3D7EO 4BROA 4DQ8A 2Q1NA 2VCPA 2A3ZA 3WXJA 3EO3A 2D0OA 4JHDB 4K43A 3WXIA 2V51B 3R6MA 4FPAA 4KBOA 1OKJA 1Z05A 3I8BA 1U6ZA 4BVOA 4F9OA 3VF4A 3ULEB 4M63C 4BGBA 2E1YA 3HM8A 3ZX2A 1X9JA 4H03B 1BWFO 4XH5A 3LDNA 3WT0A 3A5OC 2Q0UA 5AQIA 1IJJA 2P9PA 3LL3A 2YHXA 2W41A 4H0VB 3SMPA 4BRKA 5BRDA 5I9EB 4B1ZA 2ASMA 4BR2A 4CBWA 1Z6RA 2P9SB 5JICA 3DXMB 3O5BA 2I7PA 5AQOA 1LCUA 2A41A 2V52B 3AAQA 1NGGA 4A2AA 3IUCA 2E1ZA 2P9KB 5BN8A 2IVPA 1SZ2A 3SMSA 3H6EA 1ATNA 4FSVA 2IIRA 3MN7A 1WUAA 3IMXA 2FSJA 2E2QA 3A0IX 4IJAA 5BRFA 4B1VA 3AAPA 1ATRA 1LOTB 2QWPA 2ZWHA 3EZWA 4I6MA 3WQTA 1C0FA 3D2EB 5F2RA 3L0QA 1BOTO 3FGUA 1BUPA 4BRFA 5EXWA 4CZIA 1GLLO 3MN6A 3ENHA 5BPLA 4FWQA 4BRMA 2YJFA 3QFPA 3DXKB 4NB4A 3BF1A 2P9NB 3UKRB 1Y64A 4WYBA 4CZKA 1GLAG 3RSEA 5BN9A 2E8AA 5FPMA 2A42A 2BTFA 4PL8A 1D4XA 1ESVA 3O8MA 4HWIA 5AZJB 4BGAA 4RCHA 3UB5A 3L6QA 3QBXA 3QFUA 2FF3B 4ISGA 2IVOA 1QQNA 5AZIB 3WEEB 3QDKA 3O6WA 3IDHA 2QWMA 3U4LA 1DGKN 1U2VB 2VWBA 1QZ6A 2HF4A 5FPEA 1P8ZA 2CH6A 3LDQA 1RFQA 3CQYA 3VEZA 4CZMA 3D2FB 1YUWA 4GY2B 4QS9A 2KHOA 5AQMA 4C23A 3ZETB 3FZLA 4O8KA 2GWKA 4B1WB 1GLDG 3CHWA 3CIPA 5AQGA 3ZEUA 3LDOA 5AQVA 2FSNA 3VPZA 1J6ZA 3VEWA 4H0PA 1DEJA 4MLHA 1NGFA 4PKGA 4PKHA 3GE1A 3KVGA 1JCGA 3ENOA 3A8YA 4E1JA 1H1VA 2GWJA 4A2BA 2QWQA 4CZJA 4BRGA 2F9TA 5JLHA 3GG4A 4CZHA 3LDLA 3UKUA 1BDGA 3CJAA 3BP8A 2P9LA 3WXKA 1HKBA 4FWRA 4B9QA 3MN9A 5ELZA 4QS8A 3WXLA 2OANA 3BF3A 4BC3A 4BRCA 3DAWA 4H0TB 3QICA 3U8XA 3ZX0A 4ISFA 4O5FA 4M7XA 3LM2A 3VESA 5E84A 3S41A 1IG8A 1BG3A 4H0OA 2FLOA 4EAHD 1NWKA 2QWNA 1JCEA 2IVNA 2P9PB 3HI0A 3DJCA 4H0YB 3CJ7A 4JD2A 4H5WA 1K8KA 1WOQA 1X3MA 1GLJO 2F9WA 3H1QA 4MO4A 1C0GA 3AY9A 3BEXA 4H5RA 5AQNA 1S3XA 2BUPA 3HBTA 1TYQA 3MK6A 3H1VX 1E4GT 4CZLA 3H46O 1GLBG 3P4IA 2Q2RA 4H5VA 3FZHA 2HOEA 3GBTA 2YCHA 5AQSA 1MWKA 3ATUA 4FL9A 4IXCA 2D1KA 4JNEA 4AM6A 3U9DA 1ATSA 1V4SA 4I6MB 2QW9A 1E4FT 3M6GA 3G25A 1NGJA 5JMVA 2YHYA 4CJ7A 4QS7A 2E2PA 3J8AA 4K41A 1ZC6A 3EKSA 4MO5A 2W40A 3KHYA 1DKGD 3DWLA 3BUZB 2UYTA 3FR0A 4FOIA 5E26A 2NRHA 1KXPA 2NZTA 1RGIA 3RSEB 4BC5A 2ASPA 5AQWA 3VF6A 3VERA 3AARA 3SJHA 4A61A 4YDUA 3VGKA 3FZKA 1MWMA 3A5NC 3LDPA 5KQ8A 3B8AX 3R8EA 3H45C 5KPZA 4A62A 2P9UA 2ITMA 3EN9A 5TKYA 3IFRA 5AQRA 1SQKA 4CZEA 4FWSA 3QMLA 5AQFA 2QWRA 4WQ5A 3R9PA 3TU5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DLKA 3WQUA 4CEBA 2ZGZA 2Y1IA 2IS3A 3QB0A 4KHQA 1HKGA 3MCPA 2HBLA 4FWMA 3JXUA 1OH7A 2HHXA 2WBNA 4BRLA 1JJ2M 3OYDA 1XC3A 5BPMA 2A40A 2UUAK 1CZBA 3KLHA 1NLVA 4JI4K 2DPNA 3VN5A 2I7NA 1WSJA 2QKKA 4EHTA 2QWOA 2AP1A 4CCHA 3CJCA 1BU6O 4JKAA 4JN4A 5AQKA 3CETA 4BY9C 1EQYA 2D0PA 3HRGA 3WXMB 1HUXA 5AQXA 1VQ8N 5M1OA 3V1QA 1T8EA 4FZXC 4E72A 2X6NA 3C7NA 3K2PA 1QHAA 3SBTA 4DWIA 4M7YA 4BEBA 4DV2K 2GUPA 2WUSA 1S6PA 4J8FA 4A57A 5C0YA 1K8KB 4CF2A 1KLNA 3AVMA 4NCBA 3OY9A 5AQUA 3LP3A 4BDYA 3HYFA 1F21A 3MEGA 1KAZA 4DMNA 1JLGA 1S1WA 5AQLA 3IAYA 2F96A 3J7ZO 2RPIA 3FZMA 3HZ6A 2ASOA 3OS1A 4MDBA 3U9ZA 4B3TK 4Z4IA 2QEXN 3KLGA 3VA3A 3CFRA 1ZBSA 3NVKA 5LJVA 3TWHA 2HNZA 4ILGB 2NLXA 2NRWA 3DXMA 1QZ5A 1YTUA 2PYLA 4KHYA 1T03A 4LFAK 1D8YA 2PZSA 4E1NA 4DV0K 5HOOA 2Q31A 3EYZA 3KKRA 1VRUA 3TTDA 2FF6A 2HHIA 1G15A 4CJVA 4W5QA 3TPQA 2IDOA 1IKWA 4F2SA 1X3NA 3A5MC 1KAXA 4X65K 5DMRA 4Z94A 2EHGA 4Z4HA 5HRPA 1NJWA 4HUEA 4CZFA 1KSPA 2E5LK 3NF8A 3VQQA 2A1RA 3K5LA 1RBRA 4DTJA 2ITGA 4PUOA 4ICLA 2HHQA 1NMNA 4QAGA 3E9OA 4H5TA 2B5JA 2FC0A 4GKJK 2O8BA 1E3MA 2QXLA 4BRQA 2C1GA 5I42A 4FJJA 4M3YA 4BRIA 3ZSOA 1J54A 4OKKA 1HX1A 3T19A 1LAWA 4BREA 4Q5VA 4RTFD 4ID5A 2WC9A 4LF6K 4FW2A 4DLGA 1GLCG 4FXDA 3O4WA 1K6YA 1C6VA 3T1AA 4A5BA 4JAXA 3SQ4A 3PLAA 4ISEA 3WNGA 4AM7A 3HP6A 1J5OA 3VGLA 5FDLA 1NU0A 3HVTA 1N33K 3CCQN 4CEAA 2A6AA 3HVRA 4E7JA 4GVMA 4CJKA 3NAEA 2NRTA 4BG8A 1EWRA 4B8CA 5KI6A 2E20A 3B6PA 5TKWA 1HKCA 3D45A 3V9XA 5LJWA 4KI6A 3PV8A 3I0RA 4B3RK 3SAHA 2Q1NA 4JI3K 4R5PA 3OYBA 4K43A 3D0PA 1TKDA 4CESA 1Z05A 3LZJA 4LSNA 2DFEA 3SYZA 5DM7L 1X9JA 3WT0A 1Q7YO 3E01A 2ZJRL 4DU4A 3LL3A 4CFCA 2YHXA 4H0VB 3M8RA 4E7LA 2ASMA 3MXJA 3BZKA 4H4MA 4KH6A 3O5BA 1K73O 3SCXA 1OH6A 1VQ4N 4JRPA 2X74A 5BN8A 4IOCL 3NCIA 3H6EA 2OZSA 3ZT3A 1EXQA 1IH7A 2BE2A 2IIRA 3VQ9A 3K5MA 2E2QA 4IJAA 5BRFA 1RBSA 4B1VA 2ZWHA 4JKGA 5J1EA 1C0FA 4MFBA 1SL2A 1TAQA 4CJFA 2W42A 3FGUA 1BUPA 5EXWA 3ENHA 3MWTA 4BRMA 3DXKB 4IOAL 3EE9A 3C6TA 3SUNA 4B9NA 4JI6K 3UKRB 1RT1A 1QSSA 4ID1A 4WYBA 3M8PA 3RSEA 1S9EA 3QNOA 2D5RA 5FPMA 3OA9A 4R79A 3EZ5A 4F3TA 3O8MA 5AZJB 3UB5A 2WTUA 3PUFA 3WEEB 3ZT1A 2ZM6K 2YX6A 5J2PA 4JS4A 4HCBA 4FJKA 1GOCA 3U4LA 1XNQK 1U2VB 1T05A 4CF8A 3RMAA 2OPPA 3THYA 4BECA 4RW9A 2B6AA 4M3UA 5FPEA 5M1KA 1RFQA 3CQYA 3VEZA 1YUWA 5H1SQ 5GAGP 3PIOL 4QS9A 1XI1A 4NYFA 4HCCA 4DR1K 4M3TA 4JV5K 3FZLA 5AQVA 4FJLA 3AVHA 4H0PA 4CJEA 4KH5A 1O13A 3CYMA 4PKGA 4PKHA 4KHUA 1T7PA 1JCGA 3A8YA 4E1JA 4JI5K 4A2BA 3JAMO 3OJSA 2F9TA 4DQSA 3O3GA 4CZHA 4W5TA 3LDLA 1W0HA 3BP8A 4CE9A 3NF6A 4B9QA 3HPGA 3OS2A 4OLBA 3BF3A 4CK1A 3LPTA 4LSLA 1X9WA 4FZYA 4KHPK 4GKKK 1N32K 3TR8A 3TTFA 3ZX0A 4B08A 5J2MA 4YOYA 3QIOA 4N47A 3ZSQA 4I9LA 2QXFA 4EAHD 1NWKA 4KTZA 3CJ7A 4H5WA 2YHAA 4DV7K 1WOQA 3P83D 2XY8A 3KD1E 1ITGA 3BEXA 4JK8A 3F5TA 1A5WA 1ZBUA 4JKDA 2DFHA 4OGEA 1CXQA 4CHNA 3L3UA 4OVLA 3OYNA 4KFBA 4RW7A 4LFCK 1OVYA 4CHQA 4H5VA 4DR4K 2RF2A 4IXCA 2D1KA 3PX4A 3AA2A 3KLIA 2QW9A 3CFOA 4E19A 3ZSWA 2QK9A 2Q3SA 4DU3A 1C1BA 1YVUA 4NYNA 3VQBA 5JMVA 4AHSA 4ELTA 4C8OA 3L2VA 4N76A 2UXBK 2RE2A 3JYTA 4E89A 3EKSA 3AA4A 1C0MA 2W40A 1DKGD 2HNDA 5SWMA 1U47A 4IOXA 3AGKA 5E26A 3THWB 5LMUK 2YNGA 3V81A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1HNI A;  2XHB A;  4ILH A;  2B4J A;  3WXL A;  4FM2 A;  1ZBH A;  4BDP A;  2OAN A;  4BRC A;  2F8S A;  1JLA A;  1DTQ A;  1REV A;  3OYE A;  4O4G A;  3VTI A;  2KFZ A;  4O5F A;  4KHS A;  4M7X A;  2XRI A;  1I39 A;  4H0O A;  4YNQ A;  1JKH A;  2IVN A;  5M1N A;  1Y97 A;  4FVU A;  4JD2 A;  3MCA B;  4DV1 K;  2NNW A;  4NXN K;  3NHG A;  4MO4 A;  3AY9 A;  5FRN A;  2HBJ A;  3HBT A;  2VG5 A;  2OPQ A;  4FK2 A;  4CZL A;  4FJ8 A;  2PFU A;  1CXU A;  1GLB G;  1T3V A;  4BE0 A;  3GBT A;  3FFI A;  1VQ5 N;  5J2Q A;  3U9D A;  2O8C B;  1V4S A;  4CFD A;  4I6M B;  3KTQ A;  2O8F A;  1E4F T;  3KJV A;  3G25 A;  1BL3 A;  3B6O A;  4LF7 K;  4K41 A;  3J8A A;  4CF1 A;  4BAC A;  1JXB A;  4DQP A;  3KHY A;  1O1W A;  3DWL A;  4KHN A;  2IGI A;  4C8L A;  4EP5 A;  2NZT A;  2OYQ A;  3IG1 A;  3VER A;  3AAR A;  4CJR A;  5LL6 Z;  4DUZ K;  4TSX A;  4KI4 A;  3VGK A;  4YDU A;  3A5N C;  1HNW K;  3R8E A;  3H45 C;  5KPZ A;  3AO4 A;  3LAL A;  4A62 A;  1VSL A;  1X1P A;  2F4V K;  5AQR A;  3BY5 A;  4B9T A;  1NK4 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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