4CURA

Crystal structure of human baz2b in complex with fragment-3 n09555
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal Structure of Human Baz2B in Complex with Fragment-3 N09553
rcsb
molecule keywords BROMODOMAIN ADJACENT TO ZINC FINGER DOMAIN PROTEIN 2B
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4curA00
3O37A 5HQ6A 2L5EA 4PCEA 4O70A 5JI8A 5EPSA 4TQNA 3P1DA 4QC3A 2DVVA 4IORA 4HXSA 3U5KA 5FFYA 4YBMA 5ETDA 3O33A 4C66A 5CUCA 2G4AA 5D25A 5D3LA 3ONIA 2YDWA 4TT4A 5LJ1A 5HLSA 5K29A 5CQ3A 4NR5A 4UYEA 4NYWA 5EPBA 5CRMA 4YYNA 4YABA 5CQAA 3U5PA 4QSQA 5HJCA 3JVJA 2L84A 4QZSA 5L8UA 4QSSA 2I8NA 5HQ5A 4HBWA 5F63A 5BT4A 5L97A 5A83A 4LDFA 4Q0NA 3U5OA 3UVXA 3MXFA 3U5JA 3UV2A 5ENGA 2I7KA 5KTWA 3RCWA 5E3GA 4MEOA 5EA1A 5FE7A 2WP2A 5H1UA 3U5MA 3DAIA 3DWYA 5CP5A 5DYCA 4J3IA 5IGMA 2N9GA 4MR4A 5E0RA 4NRCA 2YQDA 4LZ2A 4ZC9A 5EICA 3QZVA 4YYDA 5A5OA 4PCIA 4YBTA 2RI7A 5DX4A 4ZW1A 5KTXA 4O78A 5LKUA 5IGLA 3MQMA 4OGJA 2DWWA 5CQ8A 5AMFA 5F3AA 3UVYA 4TT6A 4TYLA 4YAXA 4LC2A 4NRAA 4A9NA 5C85A 4NS5A 5LKTA 4YC9A 5II1A 2KTBB 2R0SA 4ALHA 4HBYA 3LXJA 3LJWA 1JSPB 4QEVA 4BJXA 5D7XA 4QB3A 5LVRA 4NR6A 5I80A 4IR6A 5DW1A 2OO1A 3HMHA 4UIUA 4CLBA 5EWHA 5E9VA 5DKDA 5DW2A 2DVRA 4FLPA 4TTEA 3HMEA 4YYGA 4NUCA 5E9MA 4ALGA 4KV1A 4E96A 5FE8A 5FH8A 4F3IA 5ENCA 5EGUA 5G4RA 4UIWA 5KHMA 5KTUA 2E7OA 5DKCA 4UYHA 4LYIA 3TLPA 2RNYA 5FH6A 5LKXA 5CQTA 4O75A 4IR4A 4Q0OA 3G0JA 4KCXA 4CFKA 3P5OA 5BT5A 3ZYUA 5A5RA 4QUTA 4YY6A 2L85A 4XUBA 3S91A 3MB3A 4UIZA 4NXJA 5HM0A 4WIVA 4XYAA 4O7EA 4MEPA 5HRVA 4QBMA 5EISA 1X0JA 2WP1A 5IIDA 3P1CA 5HFRA 5A82A 3Q2FA 2DVSA 4AKNA 5EI4A 4PKLA 5CPEA 2D82A 4LYWA 5EV9A 4QY4A 5KU3A 5I1QA 5L98A 5L8TA 3JVKA 2DATA 5IG6A 5EU1A 3SVGA 5TCMA 5EWWA 5C87A 4O71A 4O76A 5F2PA 3AADA 5FE9A 5CQ7A 4PTBA 4TU6A 5F1HA 2OUOA 5E9YA 5FE4A 4QSVA 4OUFA 4Z1QA 3U5LA 5HFQA 5C4QA 4NQMA 5F1LA 3AQAA 4A9JA 5E7DA 2R0VA 3UVWA 4O74A 4N4IA 3MB4A 5D3JA 3UV4A 5ENJA 3LQJA 3QZSA 4CURA 4CUQA 3MUKA 5D3SA 4TS8A 4YYKA 4HXRA 5COIA 4NYVA 4BW2A 4CUSA 5AD3A 5FE6A 4UIYA 5HEMA 2NXBA 4QC1A 3UV5A 5DFBA 5ENEA 3JVMA 3JVLA 5E9IA 5LKZA 5IGKA 5DYXA 2F6NA 5EQ1A 5II2A 4GPJA 5I86A 4O7AA 4QEWA 4NRBA 2DKWA 5HRXA 5CQ5A 5DFDA 2YELA 4HXPA 3O35A 4N4GA 3IU6A 4HBVA 4LR6A 5F62A 5EP7A 4BW4A 5FE5A 4PY6A 3P1EA 4LZSA 5C89A 3SVFA 5FB0A 2YEKA 5A5SA 5FDZA 5EVAA 5I40A 2R0YA 3QZTA 4A9KA 5ENBA 5EK9A 5CUBA 5IGNA 5EWVA 5DLZA 3NXBA 5KO4A 2GRCA 4CUPA 4A9MA 5F25A 5L96A 4QR3A 4IR3A 4DONA 4YYIA 5FBXA 4A9IA 5CU8A 4C67A 4NR7A 4YYHA 2DVQA 5FFWA 5FG5A 3MULA 4HXOA 5TB6A 1WUGA 4YATA 2YEMA 5ETBA 4HBXA 5J0DA 4HXMA 4QSPA 1WUMA 5HCLA 5FFVA 4LZRA 5DFCA 4NR9A 4Z93A 5DKHA 5A5NA 3SVHA 5CUAA 4N4FA 5L99A 3S92A 3K2JA 5A7CA 5CTLA 4A9OA 4CUUA 4UYFB 4OGIA 5D3RA 5CUEA 5G4SA 4QSXA 4O7BA 3I3JA 5E73A 5FG6A 4HXNA 4YY4A 5A85A 5BT3A 4MR6A 5LVQA 4UIXA 4UITA 5CS8A 4IOQA 4TZ2A 4CUTA 4UYFA 4A9FA 4MR5A 5HQ7A 4YYMA 2YW5A 5EM3A 4O7CA 4Y03A 3D7CA 3O34A 5E9KA 4MEQA 3P1FA 5D0CA 2LSPB 5FH7A 4WHUA 4XUAA 4LRGA 5CFWA 5IBNA 4O77A 1JM4B 4J0RA 3U5NA 4QEUA 1ZS5A 4J0SA 4N3WA 5AMEA 5F5ZA 4QNSA 4UYGA 5C8GA 4J1PA 5D24A 5LJ2A 2RNWA 5H85A 5FE1A 4LYSA 4NR4A 5FG4A 4QYLA 4X2IA 5FE3A 3O36A 2E7NA 5HRWA 1N72A 5CGPA 4O72A 4BW3A 5I7YA 2FSAA 4RVRA 5F60A 4TZ8A 3LQIA 5E74A 4QSRA 5A81A 4XY9A 4KV4A 2RNXA 4NUEA 4UIVA 4WHWA 2RS9B 4A9LA 4YYJA 5I89A 1EQFA 3UW9A 4ZQLA 4HXKA 5EWCA 5CY9A 5A5QA 4XY8A 2MJVB 4MENA 4YH4A 5ACYA 4YBSA 5C7NA 5EWDA 4O7FA 4YH3A 3UVDA 4Z6IA 4IOOA 3FKMX 4UYDA 4Z1SA 4QSUA 5CQ6A 5D3NA 5DYAA 2RFJA 4QR5A 4YK0A 5FE0A 5LJ0A 5HELA 5D3TA 4QR4A 4CL9A 3HMFA 5I83A 5ENHA 4HXLA 5CUGA 4TT2A 4QSTA 5A5PA 1F68A 4IR5A 4Z6HA 5CQ4A 5FE2A 4N4HA 5H1TA 2E3KA 3LQHA 5D26A 4BW1A 5EPRA 4QYDA 5DBMA 5H1VA 5I29A 5F61A 2YYNA 5AD2A 5ENFA 3Q2EA 5DLXA 4YADA 5CZGA 5E9LA 4A9HA 3G0LA 1E6IA 5D3HA 4NYXA 5I88A 5JWMA 2H60A 5E3DA 4TU4A 5LUUA 2D9EA 2OSSA 2F6JA 5DY7A 4QUUA 5FB1A 5HENA 4CFLA 4NUDA 4NQNA 5CRZA 5D3PA 3IU5A 2RO1A 4QSWA 5CUDA 4NR8A 2R10A 5I7XA 5ENIA 4PS5A 3GG3A 4BHWA 4A9EA 5DYUA 4MR3A 5F36A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O37A 5HQ6A 2L5EA 4PCEA 4O70A 5JI8A 5EPSA 4TQNA 3P1DA 4QC3A 2DVVA 4IORA 4HXSA 3U5KA 5FFYA 4YBMA 5ETDA 3O33A 4C66A 5CUCA 2G4AA 5D25A 5D3LA 3ONIA 2YDWA 4TT4A 5LJ1A 5HLSA 5K29A 5CQ3A 4NR5A 4UYEA 4NYWA 5EPBA 5CRMA 4YYNA 4YABA 5CQAA 3U5PA 4QSQA 3VKGA 5HJCA 3JVJA 2L84A 4QZSA 5L8UA 4QSSA 2I8NA 5HQ5A 4HBWA 5F63A 5BT4A 5L97A 5A83A 4LDFA 4Q0NA 3U5OA 3UVXA 3MXFA 3U5JA 3UV2A 5ENGA 2I7KA 5KTWA 3RCWA 5E3GA 4MEOA 5EA1A 5FE7A 2WP2A 5H1UA 3U5MA 3DAIA 3DWYA 5CP5A 5DYCA 4J3IA 5IGMA 2N9GA 4MR4A 5E0RA 4NRCA 2YQDA 4LZ2A 4ZC9A 5EICA 3QZVA 4YYDA 5A5OA 4PCIA 4YBTA 2RI7A 5DX4A 4ZW1A 5KTXA 4O78A 5LKUA 5IGLA 3MQMA 4OGJA 2DWWA 5CQ8A 5AMFA 5F3AA 3UVYA 4TT6A 4TYLA 4YAXA 4LC2A 4NRAA 4A9NA 5C85A 4NS5A 5LKTA 4YC9A 5II1A 2KTBB 2R0SA 4ALHA 4HBYA 3LXJA 3LJWA 1JSPB 4QEVA 4BJXA 5D7XA 4QB3A 5LVRA 4NR6A 5I80A 4IR6A 5DW1A 2OO1A 3HMHA 4UIUA 4CLBA 5EWHA 5E9VA 5DKDA 5DW2A 2DVRA 4FLPA 4TTEA 3HMEA 4YYGA 4NUCA 5E9MA 4ALGA 4KV1A 4E96A 5FE8A 5FH8A 4F3IA 5ENCA 5EGUA 5G4RA 4UIWA 5KHMA 5KTUA 2E7OA 5DKCA 4UYHA 4LYIA 3TLPA 2RNYA 5FH6A 5LKXA 5CQTA 4O75A 4IR4A 4Q0OA 3G0JA 4KCXA 4CFKA 3P5OA 5BT5A 3ERRA 3ZYUA 5A5RA 4QUTA 4YY6A 2L85A 4XUBA 3S91A 3MB3A 4UIZA 4NXJA 5HM0A 4WIVA 4XYAA 4O7EA 4MEPA 5HRVA 4QBMA 5EISA 1X0JA 2WP1A 5IIDA 3P1CA 5HFRA 5A82A 3Q2FA 2DVSA 4AKNA 5EI4A 4PKLA 5CPEA 2D82A 4LYWA 5EV9A 4QY4A 5KU3A 5I1QA 5L98A 4AI6A 5L8TA 3JVKA 2DATA 5IG6A 5EU1A 3SVGA 5TCMA 5EWWA 5C87A 4O71A 4O76A 5F2PA 3AADA 5FE9A 5CQ7A 4PTBA 4TU6A 5F1HA 2OUOA 5E9YA 5FE4A 4QSVA 1ZKRA 4OUFA 4Z1QA 3U5LA 5HFQA 5C4QA 4NQMA 5F1LA 3AQAA 4A9JA 5E7DA 2R0VA 3UVWA 4O74A 4N4IA 3MB4A 5D3JA 3UV4A 5ENJA 3LQJA 3QZSA 4CURA 4CUQA 3MUKA 5D3SA 4TS8A 4YYKA 4HXRA 5COIA 4NYVA 4BW2A 4CUSA 3D1DA 5AD3A 5FE6A 4UIYA 5HEMA 2NXBA 4QC1A 3UV5A 5DFBA 5ENEA 3JVMA 3JVLA 5E9IA 5LKZA 5IGKA 5DYXA 2F6NA 5EQ1A 5II2A 4GPJA 5I86A 4O7AA 4QEWA 4NRBA 2DKWA 5HRXA 5CQ5A 5DFDA 2YELA 4HXPA 3O35A 4N4GA 3IU6A 4HBVA 4LR6A 5F62A 5EP7A 4BW4A 5FE5A 4PY6A 3P1EA 4LZSA 5C89A 3SVFA 5FB0A 2YEKA 5A5SA 5FDZA 5EVAA 5I40A 2R0YA 3QZTA 4A9KA 5ENBA 5EK9A 5CUBA 5IGNA 5EWVA 5DLZA 3NXBA 5KO4A 2GRCA 4CUPA 4A9MA 5F25A 5L96A 4QR3A 4IR3A 4DONA 4YYIA 5FBXA 4A9IA 5CU8A 4C67A 4NR7A 4YYHA 2DVQA 5FFWA 5FG5A 3MULA 4HXOA 5TB6A 1WUGA 4YATA 2YEMA 5ETBA 4HBXA 5J0DA 4HXMA 4QSPA 1WUMA 5HCLA 5FFVA 4LZRA 5DFCA 4NR9A 4Z93A 5DKHA 5A5NA 3SVHA 5CUAA 4N4FA 5L99A 3S92A 3K2JA 5A7CA 5CTLA 4A9OA 4CUUA 4UYFB 4OGIA 5D3RA 5CUEA 5G4SA 4QSXA 4O7BA 3I3JA 5E73A 5FG6A 4HXNA 4YY4A 5A85A 5BT3A 4MR6A 5LVQA 3VKHA 4UIXA 4UITA 5CS8A 4IOQA 4TZ2A 4CUTA 4UYFA 4A9FA 4MR5A 5HQ7A 4YYMA 2YW5A 5EM3A 4O7CA 4Y03A 3D7CA 3O34A 5E9KA 4MEQA 3P1FA 5D0CA 2LSPB 5FH7A 4WHUA 4AKGA 4XUAA 4LRGA 5CFWA 5IBNA 4O77A 1JM4B 4J0RA 3U5NA 4QEUA 1ZS5A 4J0SA 4N3WA 5AMEA 5F5ZA 1PUOA 4QNSA 4UYGA 5C8GA 4J1PA 5D24A 5LJ2A 2RNWA 5H85A 5FE1A 4LYSA 4NR4A 5FG4A 4QYLA 4X2IA 5FE3A 3O36A 2E7NA 5HRWA 1N72A 5CGPA 4O72A 4BW3A 5I7YA 2FSAA 4RVRA 5F60A 4TZ8A 3LQIA 5E74A 4QSRA 5A81A 4XY9A 4KV4A 2RNXA 4NUEA 4UIVA 4WHWA 2RS9B 4A9LA 4YYJA 5I89A 1EQFA 3UW9A 4AKHA 4ZQLA 4HXKA 5EWCA 5CY9A 4AKIA 5A5QA 4XY8A 2MJVB 4MENA 4YH4A 5ACYA 4YBSA 5C7NA 5EWDA 4O7FA 4YH3A 3UVDA 4Z6IA 4IOOA 3FKMX 4UYDA 4Z1SA 4QSUA 5CQ6A 5D3NA 5DYAA 2RFJA 4QR5A 4YK0A 5FE0A 5LJ0A 5HELA 5D3TA 4QR4A 3D1BA 4CL9A 3HMFA 5I83A 5ENHA 4HXLA 5CUGA 4TT2A 4QSTA 5A5PA 1F68A 4IR5A 4Z6HA 5CQ4A 5FE2A 4N4HA 5H1TA 2E3KA 3LQHA 5D26A 4BW1A 5EPRA 4QYDA 5DBMA 5H1VA 5I29A 5F61A 2YYNA 5AD2A 5ENFA 3Q2EA 5DLXA 4YADA 5CZGA 5E9LA 4A9HA 3G0LA 1E6IA 5D3HA 4NYXA 5I88A 5JWMA 2H60A 5E3DA 4TU4A 5LUUA 2D9EA 2OSSA 2F6JA 5DY7A 4QUUA 5FB1A 5HENA 4CFLA 4NUDA 4NQNA 5CRZA 5D3PA 3IU5A 2RO1A 4QSWA 5CUDA 4NR8A 2R10A 5I7XA 5ENIA 4PS5A 3GG3A 4BHWA 4A9EA 5DYUA 2EJNA 4MR3A 5F36A
chains in the Genus database with same CATH topology
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 3O37 A;  5HQ6 A;  2L5E A;  4PCE A;  4O70 A;  5JI8 A;  5EPS A;  4TQN A;  3P1D A;  4QC3 A;  2DVV A;  4IOR A;  4HXS A;  3U5K A;  5FFY A;  4YBM A;  5ETD A;  3O33 A;  4C66 A;  5CUC A;  2G4A A;  5D25 A;  5D3L A;  3ONI A;  2YDW A;  4TT4 A;  5LJ1 A;  5HLS A;  5K29 A;  5CQ3 A;  4NR5 A;  4UYE A;  4NYW A;  5EPB A;  5CRM A;  4YYN A;  4YAB A;  5CQA A;  3U5P A;  4QSQ A;  5HJC A;  3JVJ A;  2L84 A;  4QZS A;  5L8U A;  4QSS A;  2I8N A;  5HQ5 A;  4HBW A;  5F63 A;  5BT4 A;  5L97 A;  5A83 A;  4LDF A;  4Q0N A;  3U5O A;  3UVX A;  3MXF A;  3U5J A;  3UV2 A;  5ENG A;  2I7K A;  5KTW A;  3RCW A;  5E3G A;  4MEO A;  5EA1 A;  5FE7 A;  2WP2 A;  5H1U A;  3U5M A;  3DAI A;  3DWY A;  5CP5 A;  5DYC A;  4J3I A;  5IGM A;  2N9G A;  4MR4 A;  5E0R A;  4NRC A;  2YQD A;  4LZ2 A;  4ZC9 A;  5EIC A;  3QZV A;  4YYD A;  5A5O A;  4PCI A;  4YBT A;  2RI7 A;  5DX4 A;  4ZW1 A;  5KTX A;  4O78 A;  5LKU A;  5IGL A;  3MQM A;  4OGJ A;  2DWW A;  5CQ8 A;  5AMF A;  5F3A A;  3UVY A;  4TT6 A;  4TYL A;  4YAX A;  4LC2 A;  4NRA A;  4A9N A;  5C85 A;  4NS5 A; 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