4CUSA

Crystal structure of human baz2b in complex with fragment-4 n09496
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords BROMODOMAIN ADJACENT TO ZINC FINGER DOMAIN PROTEIN 2B
publication title Crystal Structure of Human Baz2B in Complex with Fragment-4 N09496
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4cusA00
5ACYA 2WP2A 5A81A 4UIVA 5HQ6A 5K29A 2D9EA 5CY9A 5HRXA 5DFDA 4YK0A 4YH4A 5CTLA 2H60A 5DFCA 3TLPA 5HQ5A 4O77A 4QSVA 4LZRA 4UYDA 5FB1A 4TT2A 4TT6A 5EI4A 5LJ1A 5DW2A 3JVKA 4N4FA 5L96A 5E3DA 5KHMA 5DYUA 5E0RA 2YELA 5EU1A 5A5NA 3MQMA 3K2JA 4LRGA 5HELA 5D3NA 2E7OA 5CP5A 4MENA 4YATA 5F61A 4IR6A 4ALHA 4IOQA 4YBSA 4UIZA 5DKCA 5II2A 5D3PA 4C67A 3U5KA 4O78A 5BT3A 4LDFA 3QZVA 4IOOA 4YYNA 4QBMA 5IGNA 5CQ6A 5F62A 5J0DA 4DONA 4QSWA 3FKMX 5D3SA 3JVLA 5LKXA 2DVQA 4UYFB 1WUMA 4PCIA 4QYDA 5L8UA 5KO4A 2FSAA 4LR6A 5A5OA 2I7KA 4QSQA 5E9MA 3U5MA 5KTWA 2GRCA 5CUAA 4A9OA 1EQFA 2L84A 4QSSA 4N3WA 5I89A 5CUBA 4XY8A 5DY7A 5EVAA 4NUEA 5EQ1A 4NS5A 5D7XA 3MULA 3Q2EA 5EWVA 3P1CA 4QYLA 5FE9A 5CRMA 2NXBA 5E74A 2YDWA 4QNSA 2F6JA 3MXFA 4HXLA 4CUPA 5CGPA 3HMEA 5L8TA 5IBNA 4BW4A 3UVDA 4O71A 3UW9A 3P5OA 4YYHA 4NUDA 4LYWA 5A5QA 3S91A 5DYXA 4CL9A 4N4IA 5TCMA 4O72A 5FFYA 5LVQA 5IGKA 5A83A 4NR9A 3MB3A 4UIUA 5LKUA 2I8NA 4Z1QA 5F5ZA 5AD2A 4YC9A 4N4HA 4AKNA 5ETBA 5EWCA 2MJVB 4J0SA 4J3IA 3U5LA 4MEOA 4QSUA 5ENHA 3O33A 4ZW1A 5F1LA 5HENA 5F36A 5FE4A 1E6IA 4MR6A 4YH3A 5ENJA 1JM4B 4HXOA 4RVRA 4MEQA 3P1EA 5I83A 5CQ5A 4CFKA 4A9LA 5LUUA 5D3LA 5FG6A 5EP7A 5L97A 4Q0OA 5FG5A 2KTBB 4HXSA 5I88A 4MR3A 4NR4A 4TZ8A 2E7NA 5E7DA 5DYCA 3AQAA 3UVXA 5IGLA 5JWMA 4NXJA 3QZSA 4LZ2A 4O76A 5EM3A 5LVRA 5FE1A 5I40A 4NYVA 5HJCA 5A5RA 4HXKA 5F2PA 5EWHA 5HFRA 4LZSA 3ZYUA 4WHWA 4Y03A 5E9YA 4TTEA 3G0LA 4O74A 5FG4A 5II1A 4C66A 4YAXA 2RI7A 4HXMA 4QSPA 5E9VA 2RNWA 4LYIA 5H1TA 4KCXA 4MEPA 2R0VA 4QEUA 4E96A 5E9KA 5JI8A 1X0JA 5FE3A 4PTBA 1N72A 5CU8A 4MR5A 4Q0NA 4NQNA 4Z93A 5D24A 5C89A 4HBWA 3IU5A 4BW2A 5EISA 5BT4A 4ZQLA 4O75A 5ENBA 5AD3A 3DAIA 5EGUA 5CQ4A 3U5NA 4XY9A 1JSPB 5I29A 5DW1A 5ETDA 2LSPB 3AADA 4ZC9A 5IGMA 4NQMA 5FE0A 3QZTA 3MB4A 5D3TA 5D3JA 5H1UA 2N9GA 5A82A 4A9IA 5AMFA 5FH8A 4IR4A 4TS8A 4YYMA 5G4RA 4J0RA 4NR5A 4QC1A 3G0JA 4Z1SA 5F60A 5EPBA 4YBTA 4WIVA 5FE8A 2DVVA 4PY6A 5I1QA 5ENGA 4FLPA 5ENEA 4J1PA 5CQ8A 2RNYA 3JVMA 5DFBA 5C87A 2F6NA 2YEMA 2D82A 4QSRA 5A85A 5ENFA 5IIDA 4BW3A 4N4GA 4ALGA 4UIWA 3MUKA 3HMFA 5EPSA 3UV4A 2YW5A 4CLBA 4HBYA 2L5EA 5CQ7A 4GPJA 4YYIA 4HXNA 4OGJA 5CRZA 4A9FA 4UIYA 5TB6A 5I86A 3UV2A 2RO1A 4QEVA 5EWDA 4QUTA 3Q2FA 5KTXA 4CUUA 4QR4A 3SVFA 2YYNA 5KU3A 4UYEA 5AMEA 4XUBA 5CUEA 3LQHA 2R10A 4HXPA 2G4AA 4CUQA 4YYDA 5FE5A 5I7YA 5CPEA 3UVWA 5E9IA 5FFVA 4TU4A 5D3HA 5KTUA 2DKWA 4QUUA 5A7CA 5A5PA 2DVRA 5E3GA 5FE7A 4O70A 4IORA 4UIXA 4TYLA 3O34A 5CZGA 1WUGA 2R0YA 4UYHA 4NRCA 4A9MA 4PS5A 5CUCA 4TT4A 4XUAA 4YYGA 3D7CA 5CQAA 5BT5A 4CUTA 4NRBA 5DX4A 4YY4A 5HLSA 4IR5A 5F25A 3SVGA 5C4QA 4O7CA 4BHWA 5FBXA 5HFQA 4YY6A 4A9HA 5HM0A 3U5JA 2DWWA 5CQ3A 4NR6A 4TZ2A 3I3JA 4BW1A 2RFJA 4HXRA 3DWYA 5L98A 5HQ7A 4NYWA 3U5OA 4A9NA 3LQIA 3LJWA 2OO1A 4O7AA 4TQNA 5H1VA 5LJ2A 5COIA 3UV5A 5C85A 4BJXA 2R0SA 4CURA 4PCEA 4QEWA 4PKLA 5EK9A 5H85A 4QSXA 4CUSA 3O37A 5CQTA 2WP1A 5LKTA 1F68A 5ENIA 5C7NA 4UYFA 5EWWA 5DLXA 2YQDA 3O35A 4QZSA 4NUCA 4WHUA 3ONIA 4MR4A 5HRVA 5DYAA 5C8GA 3GG3A 4YABA 5FE2A 3IU6A 4NYXA 3O36A 4XYAA 5I7XA 4X2IA 5D3RA 4QSTA 5FB0A 4Z6IA 5HRWA 5I80A 4HBVA 4QR3A 4O7BA 3LXJA 4NR8A 4UITA 4OUFA 4O7FA 3P1DA 3RCWA 5F3AA 5LKZA 5FDZA 4UYGA 3LQJA 5D25A 4A9KA 4QC3A 2OUOA 5D26A 5EPRA 4LC2A 5ENCA 2L85A 5DKHA 5DBMA 4YBMA 5EA1A 4OGIA 5F1HA 3S92A 4LYSA 4YYJA 4NR7A 4Z6HA 4O7EA 2RNXA 5LJ0A 5E9LA 2YEKA 5F63A 2DATA 5HCLA 5CS8A 2RS9B 4A9EA 4KV4A 3NXBA 5FH6A 3JVJA 4QR5A 3U5PA 5DLZA 2E3KA 5G4SA 5A5SA 5HEMA 5IG6A 4YYKA 1ZS5A 5CFWA 3P1FA 5EV9A 5D0CA 3SVHA 4HBXA 5CUGA 4F3IA 3HMHA 4KV1A 5CUDA 3UVYA 2OSSA 5E73A 5FE6A 4IR3A 4CFLA 4YADA 5EICA 4NRAA 5FFWA 2DVSA 5DKDA 5FH7A 5L99A 4TU6A 4A9JA 4QB3A 4QY4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ACYA 2WP2A 5A81A 4UIVA 5HQ6A 5K29A 2D9EA 5CY9A 5HRXA 5DFDA 4YK0A 4YH4A 5CTLA 2H60A 5DFCA 3TLPA 5HQ5A 4O77A 4QSVA 4LZRA 4UYDA 5FB1A 4TT2A 4TT6A 5EI4A 5LJ1A 3D1BA 5DW2A 3JVKA 4N4FA 5L96A 5E3DA 5KHMA 5DYUA 5E0RA 2YELA 5EU1A 5A5NA 3MQMA 3K2JA 4LRGA 5HELA 5D3NA 2E7OA 5CP5A 4MENA 4YATA 5F61A 4IR6A 4ALHA 4IOQA 4YBSA 4UIZA 5DKCA 5II2A 5D3PA 4C67A 3U5KA 4O78A 5BT3A 4LDFA 3QZVA 4IOOA 4YYNA 4QBMA 5IGNA 5CQ6A 5F62A 5J0DA 4DONA 4QSWA 3FKMX 5D3SA 3JVLA 5LKXA 2DVQA 4UYFB 1WUMA 4PCIA 4QYDA 5L8UA 5KO4A 3ERRA 2FSAA 4LR6A 5A5OA 2I7KA 4QSQA 5E9MA 3U5MA 5KTWA 2GRCA 5CUAA 4A9OA 3D1DA 1EQFA 2L84A 4QSSA 4N3WA 5I89A 5CUBA 4XY8A 5DY7A 5EVAA 4NUEA 5EQ1A 4NS5A 3MULA 3Q2EA 5D7XA 5EWVA 3P1CA 4QYLA 5FE9A 5CRMA 2NXBA 5E74A 2YDWA 4AKGA 4QNSA 2F6JA 3MXFA 4HXLA 4CUPA 5CGPA 3HMEA 5L8TA 5IBNA 4BW4A 3UVDA 4O71A 3UW9A 3P5OA 3VKGA 4YYHA 4NUDA 4LYWA 5A5QA 3S91A 5DYXA 4CL9A 4N4IA 5TCMA 4O72A 5FFYA 5LVQA 5IGKA 5A83A 4NR9A 3MB3A 4UIUA 5LKUA 2I8NA 4Z1QA 5F5ZA 5AD2A 4YC9A 4N4HA 4AKNA 5ETBA 5EWCA 2MJVB 4J0SA 4J3IA 3U5LA 4MEOA 4QSUA 5ENHA 3O33A 4ZW1A 5F1LA 5HENA 5F36A 5FE4A 1E6IA 4MR6A 4YH3A 5ENJA 1JM4B 4HXOA 4RVRA 4MEQA 3P1EA 5I83A 5CQ5A 4CFKA 4A9LA 5LUUA 5D3LA 5FG6A 5EP7A 5L97A 4Q0OA 5FG5A 2KTBB 4HXSA 5I88A 4MR3A 4NR4A 4TZ8A 2E7NA 5E7DA 5DYCA 3AQAA 3UVXA 5IGLA 5JWMA 4NXJA 3QZSA 4LZ2A 4O76A 5EM3A 5LVRA 5FE1A 5I40A 4NYVA 5HJCA 5A5RA 4HXKA 5F2PA 5EWHA 5HFRA 4LZSA 3ZYUA 4WHWA 4Y03A 5E9YA 4TTEA 3G0LA 4O74A 5FG4A 5II1A 4C66A 4YAXA 2RI7A 4HXMA 4QSPA 5E9VA 2RNWA 4LYIA 5H1TA 4KCXA 4MEPA 2R0VA 4QEUA 4E96A 5E9KA 5JI8A 1X0JA 5FE3A 4PTBA 1N72A 5CU8A 4MR5A 4Q0NA 4NQNA 4Z93A 5D24A 5C89A 4HBWA 3IU5A 4BW2A 5EISA 5BT4A 4AKHA 4ZQLA 4O75A 5ENBA 5AD3A 3DAIA 5EGUA 5CQ4A 3U5NA 4XY9A 1JSPB 5I29A 5DW1A 5ETDA 2LSPB 3AADA 4ZC9A 5IGMA 4NQMA 5FE0A 3QZTA 3MB4A 5D3TA 5D3JA 5H1UA 2N9GA 5A82A 4A9IA 5AMFA 5FH8A 4IR4A 4TS8A 4YYMA 5G4RA 4J0RA 4NR5A 4QC1A 3G0JA 4Z1SA 5F60A 5EPBA 4YBTA 4WIVA 5FE8A 2DVVA 4PY6A 5I1QA 5ENGA 4FLPA 5ENEA 4J1PA 5CQ8A 2RNYA 3JVMA 5DFBA 5C87A 2F6NA 2YEMA 2D82A 4QSRA 5A85A 5ENFA 5IIDA 4BW3A 4N4GA 4ALGA 4UIWA 3MUKA 3HMFA 5EPSA 3UV4A 2YW5A 4CLBA 4HBYA 2L5EA 5CQ7A 4GPJA 4YYIA 4HXNA 4OGJA 5CRZA 4A9FA 4UIYA 5TB6A 5I86A 3UV2A 2RO1A 4QEVA 5EWDA 4QUTA 2EJNA 3Q2FA 5KTXA 4CUUA 4QR4A 3SVFA 2YYNA 5KU3A 4UYEA 5AMEA 4XUBA 4AKIA 5CUEA 3LQHA 2R10A 4HXPA 2G4AA 4CUQA 4YYDA 5FE5A 5I7YA 5CPEA 3UVWA 5E9IA 5FFVA 4TU4A 5D3HA 5KTUA 2DKWA 4QUUA 5A7CA 5A5PA 2DVRA 5E3GA 5FE7A 4O70A 4IORA 4UIXA 4TYLA 3O34A 5CZGA 1WUGA 2R0YA 4UYHA 4NRCA 4A9MA 4PS5A 5CUCA 4TT4A 4XUAA 4YYGA 3D7CA 5CQAA 5BT5A 4CUTA 4NRBA 5DX4A 1ZKRA 4YY4A 5HLSA 4IR5A 5F25A 3SVGA 5C4QA 4O7CA 4AI6A 4BHWA 5FBXA 5HFQA 4YY6A 4A9HA 5HM0A 3U5JA 2DWWA 5CQ3A 4NR6A 4TZ2A 3I3JA 4BW1A 2RFJA 4HXRA 3DWYA 5L98A 5HQ7A 4NYWA 3U5OA 4A9NA 3LQIA 3LJWA 2OO1A 4O7AA 4TQNA 5H1VA 5LJ2A 5COIA 3UV5A 5C85A 4BJXA 2R0SA 4CURA 4PCEA 4QEWA 4PKLA 5EK9A 5H85A 4QSXA 4CUSA 3O37A 5CQTA 2WP1A 5LKTA 1F68A 5ENIA 5C7NA 4UYFA 5EWWA 5DLXA 2YQDA 3O35A 4QZSA 4NUCA 4WHUA 3ONIA 4MR4A 5HRVA 5DYAA 5C8GA 3GG3A 4YABA 5FE2A 3IU6A 4NYXA 3O36A 4XYAA 5I7XA 4X2IA 5D3RA 4QSTA 5FB0A 4Z6IA 5HRWA 5I80A 4HBVA 4QR3A 4O7BA 3LXJA 4NR8A 4UITA 4OUFA 4O7FA 3P1DA 3RCWA 5F3AA 5LKZA 5FDZA 4UYGA 3LQJA 5D25A 4A9KA 4QC3A 2OUOA 5D26A 5EPRA 3VKHA 4LC2A 5ENCA 2L85A 5DKHA 5DBMA 4YBMA 5EA1A 4OGIA 5F1HA 3S92A 4LYSA 4YYJA 4NR7A 4Z6HA 4O7EA 2RNXA 5LJ0A 5E9LA 2YEKA 5F63A 2DATA 5HCLA 5CS8A 2RS9B 4A9EA 4KV4A 3NXBA 5FH6A 3JVJA 4QR5A 3U5PA 5DLZA 2E3KA 5G4SA 1PUOA 5A5SA 5HEMA 5IG6A 4YYKA 1ZS5A 5CFWA 3P1FA 5EV9A 5D0CA 3SVHA 4HBXA 5CUGA 4F3IA 3HMHA 4KV1A 5CUDA 3UVYA 2OSSA 5E73A 5FE6A 4IR3A 4CFLA 4YADA 5EICA 4NRAA 5FFWA 2DVSA 5DKDA 5FH7A 5L99A 4TU6A 4A9JA 4QB3A 4QY4A
chains in the Genus database with same CATH topology
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