4CZFA

C. crescentus mreb, single filament, adp
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
337
structure length
329
Chain Sequence
ISNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGSGNPKVIVCVPSGATAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELASDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEHPKWMKGVLEST
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
source organism Caulobacter vibrioides
total genus 105
structure length 329
sequence length 337
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4czfA03
4BR5A 5ADXH 3P4IA 3U9ZA 2D1KA 4ISEA 4LC9B 3GDQA 4WQ5C 3VEZA 4PL7A 3H1QA 4ISFA 2P9UA 1Y64A 2E88A 3FR0A 4KBOA 1DGKN 3VOVA 4DHYA 4DQ8A 1DKGD 4AM7A 4EHTA 3VERA 1ZXOA 1NGJA 2CGLA 5LJWA 2P9IB 3LL3A 5AQRA 3WQTA 4BRPA 4YDUA 3VGKA 3WXIA 4M7XA 3QBXA 1NGDA 5ELZA 4MO4A 5EVZA 3G25A 3ZX3A 2CGJA 1GLBG 1HPMA 4JD2B 1HX1A 1D4XA 5AQMA 2ASMA 4A62A 1TYQB 2E2NA 1MDUB 4QS9A 3WEEA 4AM6A 3O4WA 1QQNA 4ISGA 3GG4A 5KQ8A 3IMXA 1YUWA 2GEMA 2P9NA 1NGCA 3EZWA 4EFHA 4MLHA 4JHDA 1NWKA 3M3ZA 3DWLA 1RGIA 2A42A 3VF6A 1TUYA 4CD1A 3FGUA 3LDOA 2GWKA 3UKRB 5E84A 1Z05A 3HM8A 4CZEA 3UKUB 1X9JA 5AQFA 4FOIA 1HKGA 5AZJB 1NM1A 5BRFA 2QWLA 1NGAA 2W40A 1Z6RA 3RSEA 2CGKA 2FXUA 4H0TB 4FWLA 4BRCA 2P9UB 4I6MB 2F9WA 2YHWA 4EHUA 4A2BA 4BG8A 3DXMA 5CE3A 4WQ5A 3UB5A 1YXQA 2IVPA 2V7YA 1V4SA 3VETA 1NGFA 2QWQA 3OHRA 1T44A 2ZGZA 4H0OA 1KAZA 4Z94A 4RCHA 2Q0RA 3QB0A 3VEVA 4GNIA 3ATUA 5FPDA 1J6ZA 4IJNA 3HBTA 2BTFA 1ATSA 2VWBA 3BUZB 2PBDA 3MN9A 4WQ4C 4H03B 3WEEB 4BROA 3L4IA 1HJOA 3ENHA 5AQKA 1BDGA 5FPEA 5E26A 4BRQA 2YHXA 1GLFO 2P9NB 2P9LA 1NMDA 5AQGA 1NGBA 4JHDB 5AQSA 4NO7A 1NGGA 4H5RA 1RFQA 4H0VB 3WUHA 5BPNA 4PKIA 2YHYA 4GY2B 4NB4A 4K43A 3CIPA 4O5FA 4PL8A 1ATRA 4K25A 1BU6O 1T6DA 5JICA 1OKJA 1WOQA 4BR9A 3VGLA 3HSCA 1HUXA 3JS6A 4QS7A 1BA0A 1RDWX 1H1VA 3HI0A 5TKYA 3RSEB 3WT0A 1YAGA 3MDQA 4RTFD 3FZKA 3R8EA 4CBWA 2ASOA 1YVNA 2AA4A 2D4WA 2BUPA 3VF2A 5AQLA 3U8XA 1BO5O 4CZJA 3O6WA 4RWTA 2QWPA 2E1ZA 4CZFA 4H0PA 4PKHA 1XUPO 2P9KA 2YI1A 3VESA 3CI5A 4E1JA 4FWMA 3A0IX 4FO0A 2HMPA 1KXPA 4FWKA 3TU5A 4DCHA 5AQNA 2QWMA 3S41A 2GELA 5AQJA 1Q18A 3WXLA 3F9MA 5AQXA 1NGIA 1TUUA 4BRNA 1GLEG 1C0FA 2Q2RA 2VCPA 2Q97A 5BPLA 1LOTB 1BWFO 2ZWHA 4K41A 1C0GA 3MMVA 4BR4A 4CZKA 2P9LB 4XH1A 4XEIA 3DJCA 2I7NA 4K42A 3FZHA 1NBWA 3AY9A 4BC2A 2Q1NA 4CZLA 1X3NA 2YJEA 4FWSA 1KAYA 3MN6A 4BGBA 2A41A 1T6CA 4JAXA 1ZBSA 3H3NO 3W0LA 4BQZA 2P9PA 5BRHA 4L3QA 5KQDA 3ENOA 5BR9A 3LM2A 4MLEA 1QZ5A 3D2EA 4M7YA 4B1XB 3BP8A 3H6EA 1GLLO 1ESVA 3CJ7A 4BRFA 3A5OC 3VEOA 4BC3A 5JLHA 4B9QA 2J4RA 4IXCA 3HTVA 4O8KA 1SQKA 3O5BA 4H0XB 3IUCA 3MN7A 3CETA 3TPQA 1NLVA 2CH5A 2D0OA 2YJFA 2P9KB 3D2FA 2HF4A 4CI6A 3SMSA 5BPMA 3BEXA 5B8HA 3AAPA 3M1FA 1X3MA 4IO8A 2ZGYA 2E8AA 3L0QA 3CERA 5JMVA 3EKUA 5KPRA 2GUPA 3MCPA 3QFUA 4J8FA 4FWPA 3CQYA 4BG9A 5AQPA 5KPZA 2NZTA 4JN4A 2YCHA 3U9DA 1P8ZA 3SMPA 4BRDA 4BQLA 3CJ1A 4BRAA 3C0BA 2I7PA 1IJJA 2IVNA 3GOIA 5BN8A 4BC5A 1JCFA 4IJAA 3KHYA 4H5WA 4CD3A 4FWOA 3ULEA 3QDKA 2P9PB 4JD2A 2F9TA 3A5LC 3H1VX 4EIAA 3DXKA 1NGEA 3D2EB 2HOEA 5FPNA 3O08A 1E4FT 2P9SA 2CH6A 3SK3A 1MA9B 3A8YA 5AQUA 4H5NA 2EWSA 5LY3A 5F2RA 5F0XA 5AFUA 4EAHD 3GBTA 3W3DA 1HKBA 2QXLA 3CJBA 4FWQA 3ZEUA 2V7ZA 4BR0A 3BF3A 1S22A 2Q31A 3A5NC 3D2FB 3LDPA 4A61A 3QFPA 3HZ6A 4BRLA 2ITMA 3FZLA 3DXMB 4IWVA 1GLJO 4FPAA 3UKRA 4CZGA 3CHWA 1JCEA 5AQYA 2H3GX 4BRIA 2E20A 1KAXA 5AQQA 3MN5A 3I33A 5AR0A 4JNEA 5BREA 2UYTA 3UKUA 3VENA 3H46O 4FWRA 1GLAG 2FF3B 4MO5A 3IFRA 2QWRA 3QMLA 1XQSC 3H3OB 3JXUA 3GL1A 2FLOA 1K8KA 1G99A 2VYPA 4H5VA 3H45C 3WXJA 1MWKA 2FSKA 3AARA 3U4LA 2GWJA 2ASPA 3EN9A 4I6MA 3WQUA 4B1YB 5JLFA 1BOTO 2A40A 2HF3A 3C7NA 2A5XA 5EY4A 5AQHA 1S3XA 2QW9A 1XC3A 2E2PA 3QBWA 4WQ4A 4FL9A 2IVOA 5AQWA 2IIRA 4BC4A 4IZ9A 3ULEB 3CQXA 1QHAA 1JCGA 4CZIA 5AQVA 4B1ZA 2E1YA 3GE1A 1BG3A 1ATNA 4QS8A 3DXKB 2AP1A 5AQZA 2GTDA 2P9SB 4H0YB 3BF1A 1E4GT 3O8MA 3SJHA 4BGAA 5AZIA 3I8BA 2W41A 4FWNA 1V4TA 2V51B 3LM9A 5AFUH 3IDHA 3ZX0A 3D7EO 2WUSA 3CJ9A 4FPBA 4BR2A 3ZETA 4CZHA 3ZEUB 3R9PA 2Q36A 4F9OA 4PKGA 4XH5A 4BR7A 4FOEA 2QWOA 1SZ2A 1QQOA 2A6AA 1MWMA 3VEXA 4HTLA 1NGHA 5LJVA 3AAQA 4CZMA 3O1BA 1SAZA 3VF4A 5BRDA 4BVPA 1U2VA 3FLCO 2E2QA 1R59O 1K8KB 3A5MC 5BN9A 3VEWA 4FSVA 3M6GA 3LDNA 5ADXA 4HWIA 4YDUC 3QICA 2ZF5O 3C7NB 3LDQA 1ZC6A 4CJ7A 5FPMA 1LCUA 3EKSA 1BUPA 3MK6A 1U6ZA 2P9IA 2FSJA 4BRKA 3KVGA 2QWNA 3VEYA 1BA1A 3ATVA 3LDLA 3SLCA 4A2AA 2KHOA 2OANA 2E2OA 4B1VA 3EL2A 1CZAN 4BREA 5EX5A 5AQTA 2V52B 4H5TA 4DB3A 1GLCG 4BRHA 5AZIB 3FZFA 1TYQA 3KZBA 2Q0UA 1IG8A 2NRHA 3L6QA 4BVOA 3ZETB 4M63C 5AQIA 2D0PA 1EQYA 4BRGA 4C23A 3FE1A 4B1UB 3DAWA 3FFKB 3O1WA 5EXWA 4CBXA 5I9EB 3O80A 5F1XA 3CJAA 3ID8A 4WYBA 3VGMA 4CBUA 4BRMA 2PAVA 3B8AX 5EOYA 1WUAA 3UE5A 1HKCA 2DPNA 3EO3A 3WXKA 4XH4A 2NLXA 1QZ6A 2A3ZA 4Y0WA 4B1WB 5AQOA 2FSNA 2QM1A 3ZX2A 2FF6A 3FZMA 3VPZA 1DEJA 3J8AA 1GLDG 3R6MA 1QQMA 1U2VB 3CJCA 5AZJA 1HLUA 5KPTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HK2A 2ZJPL 4BR5A 2YV0X 4YOWA 4MDAA 1BIZA 1KQSM 1REVA 3PSIA 1QS4A 4ISFA 4RW8A 3G4SN 3FR0A 3VTHA 4CFAA 4DUYK 4FYDA 4I9LA 4CK3A 2CGLA 4DR4K 3VQ7A 3LL3A 4O44A 3VTIA 5AQRA 4CHPA 4HCBA 2RE2A 4YDUA 3V6DA 1VSEA 3VQPA 3WNEA 3K5OA 3HXMA 1E3MA 4DF4A 3KIOA 3J80O 4ELUA 1CLQA 3LZJA 3G25A 2CGJA 4J2DA 1ZBIA 3EEQA 1TAUA 1U4BA 2RKIA 1D4XA 4W5TA 4DG1A 3LP0A 1TYQB 2E2NA 4DFMA 4AM6A 3O4WA 5JS2A 1BQMA 1RTHA 3GG4A 1IBLK 1VQKN 1GOAA 1YUWA 2GEMA 3EZWA 1W97L 4EP4A 1Z25A 3DWLA 1XNQK 3BZKA 4XIUA 5E84A 2O8CB 3MWTA 2HNYA 1B92A 4CZEA 3OYAA 5C12A 1NMNA 3VA0A 5AQFA 5BRFA 2QWLA 3TAPA 2W40A 1LWEA 4LSLA 4RW4A 2W42A 4ZTFA 4O8UA 4CF9A 4I6MB 5DK5A 1VQ7N 2GX9A 2C1GA 2OPSA 1HJRA 4FJHA 1S6QA 2BH1A 3A2FA 1CZBA 3AO4A 4FZYA 3THYB 3I56N 3E1YA 3CCVN 3THWB 3VETA 1NGFA 3I0SA 3P39A 3PX6A 3HPGA 1YITN 4M42A 1KAZA 5BR8K 4HHTA 5FPDA 3VQ4A 3AV9A 3V9SA 1ATSA 3AVGA 4H03B 5C10A 4KH4A 3TSPA 3OYBA 1HJOA 5FPEA 2BE2A 5E26A 1YIJN 3MXMA 3TTFA 4KHNA 4JI7K 3SCXA 4JI0K 5DM7L 4GVEA 2D0AA 4PUOA 4E7LA 3CCMN 2ETJA 5BPNA 1NK5A 2YHYA 2XY8A 4NB4A 4NYNA 5HROA 1Q81O 2W6KA 1NK8A 4Z4IA 4FM0A 1T6DA 3ZYYX 3OW2M 1OKJA 1FK9A 4NYFA 2WFBA 4YORA 3I0RA 2OTLN 3KKSA 1NK7A 4AHVA 3OYDA 3HI0A 3FFIA 4DFPA 3RSEB 3WT0A 3MDQA 4AQYK 3R8EA 2O8DB 3E01A 3B6PA 1BO5O 3HOTA 2QWPA 4H0PA 1RDDA 3CCQN 4CEDA 1NOYA 4E1JA 1RT3A 1NKEA 1HYVA 4W5QA 4CJFA 2C1IA 4CCHA 1EO1A 2KW4A 1VQPN 2GELA 2KQ2A 1Q18A 4DTSA 1Y97A 5AQXA 4DFKA 4W5OA 1NGIA 4FM1A 4GW6A 4N47A 3CQ8A 2QA4N 4JK8A 2Q97A 5BPLA 3L2WA 1KC8O 1LOTB 4N56A 3AVKA 2I7NA 4DTJA 3CCEN 3VQDA 4BC2A 4YNQA 3DM2A 4OGCA 4CZLA 2FBTA 1X3NA 2YHBA 4FK0A 3THVA 2A41A 1ILYA 4CIEA 5FRMA 5C25A 4JAXA 2P9PA 4ICLA 4L3QA 3KKRA 4BE2A 4KH5A 4MLEA 1YJ9N 3D2EA 3OYHA 4B1XB 1RBRA 3H6EA 3ZSXA 2HHTA 3A5OC 4N76A 4L8RB 4BC3A 5JLHA 3P5JA 4JI4K 1HPZA 3PY8A 2ZD1A 3ZLJA 3MN7A 3TPQA 2Y1IA 3D2FA 3AVAA 4IKFA 4JI6K 2JWKA 4FVUA 4CJ5A 1SL2A 3AAPA 1X3MA 2ZGYA 3KLEA 1IO2A 1A5XA 3VQ6A 5JMVA 3EKUA 4FJ8A 4GMJB 1O13A 2VG5A 4BG9A 1K8AO 3NF7A 4CEAA 1TKTA 5KPZA 2NZTA 1BHLA 3K5MA 3BGRA 5GAEP 1VQON 3CM6A 1ZBUA 1IJJA 1UOCA 1HMVA 4DLEA 1HNZK 1XHXA 3CCLN 4LH5A 4CJPA 3RVCA 1EP4A 4A57A 2QEXN 2KZMA 3QDKA 4E1NA 4CF0A 3AVJA 3O9TA 4LF7K 1K73O 1EWRA 3H1VX 1FKPA 1E4FT 4QAGA 2CH6A 4CJKA 4KHPK 5FROA 2YNHA 2EWSA 5LY3A 5AFUA 3DLRA 4EAHD 1OVQA 4F2SA 1KVBA 3CC4N 3AGRA 4CGFA 2NRZA 3ZEUA 4KHUA 2B5JA 3CFRA 4BR0A 4F2RA 3ZT0A 3LDPA 3HZ6A 3SV4A 4BRLA 1YI2N 1C0MA 3DXMB 1GLJO 1S1UA 4GKJK 2W6LA 4CGHA 4O0JA 4BRIA 2UYTA 3VENA 4Q0BA 3THXB 2O8EB 4FWRA 1VAZA 2QWRA 4DMNA 4O55A 4WCEL 4Y1DA 4H5VA 4KFBA 1O1WA 4DS5A 3AARA 4I6MA 4DTNA 2A40A 3TR8A 2HF3A 4DS4A 3TAEA 5AQHA 1RNHA 2E2PA 3QBWA 1S1WA 4WQ4A 3HT3A 2IVOA 4CJ4A 2X6SA 2HBJA 1JCGA 4CZIA 5AQVA 4B1ZA 2OPRA 1N8RO 4CFCA 3C6AA 3MEGA 2NRXA 1BG3A 1ATNA 1XHZA 2AP1A 4CW7B 2ZJRL 4H0YB 2XO7A 1E4GT 2E6MA 3O8MA 4FWNA 3CMAN 3P31A 4CGDA 3V9UA 4DWIA 2WUSA 3ZETA 1LWCA 3R9PA 4NLCA 5IT9O 3KTQA 4PKGA 4BR7A 4JS5A 3QEIA 4FW2A 1SZ2A 1U45A 4E1MA 1S1XA 1KFSA 1LAWA 3SAGA 1Q9YA 4CZMA 5HOOA 1SAZA 3DLBA 2HVIA 3VQ8A 1K8KB 3A5MC 2YX6A 1SS6A 1SUQA 3ZT1A 1DTQA 3C6TA 1VHXA 2RN2A 4A59A 4CJTA 3ZT3A 3CC7N 2OZMA 1ZC6A 3ISNC 1RTDA 4MDBA 5FPMA 4DSLA 1LCUA 3EKSA 1BUPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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