4CZIA

C. crescentus mreb, single filament, empty
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
326
structure length
316
Chain Sequence
ISNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGSGNPKVIVCVPSTAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELASDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
source organism Caulobacter vibrioides
total genus 99
structure length 316
sequence length 326
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cziA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cziA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4cziA03
3O1BA 1LCUA 4H03B 4QS8A 5FPNA 1BA0A 2IVPA 3LDPA 4IXCA 2GTDA 2A6AA 3CHWA 3CJBA 3L6QA 3VEWA 2P9SB 4I6MA 4CZLA 5LJVA 3UKUA 3WQUA 4HTLA 4O8KA 1ATSA 1YVNA 1KAYA 5FPMA 4B9QA 4BR9A 4CBXA 2YJFA 1SZ2A 3SJHA 1NGCA 4XH1A 4DB3A 1U2VB 3FR0A 1SQKA 4WQ4C 1RFQA 4H5WA 2YJEA 3ULEA 3L4IA 3DXKA 3IFRA 4FPBA 3O08A 4FO0A 2P9LB 2QWQA 1NM1A 3HI0A 1MWMA 3RSEB 1ATRA 1BU6O 2QWRA 3SMPA 4ISFA 1GLAG 1IJJA 1Q18A 4IJAA 2P9IA 2FSJA 2CH5A 2QW9A 5KPZA 5AQZA 2HF4A 3VGLA 3VEOA 3QFPA 3ZETA 3CJ7A 1BUPA 2F9TA 4A2AA 4CD1A 3GBTA 2ASOA 1MDUB 3FZHA 1YAGA 2A42A 5F1XA 4B1WB 4BVOA 5AZJA 3WXKA 2E88A 3CQXA 2Q97A 4BR2A 4FWMA 2QWLA 2P9UA 2P9NA 4BROA 1P8ZA 4BRKA 5F0XA 1S22A 3O4WA 1HPMA 3VF2A 4BRLA 3ZX3A 1GLBG 3VGKA 1T44A 4QS9A 5E26A 3FE1A 4B1UB 3IMXA 3WT0A 3A5NC 3AARA 3CQYA 4IZ9A 4BG8A 4MLEA 4DHYA 1JCGA 4CZGA 3H3OB 5LY3A 3HBTA 4CJ7A 1X9JA 4JD2A 3MCPA 3SK3A 1ZXOA 3U9ZA 3MN9A 2V7ZA 3CERA 2ASMA 3M6GA 4FWQA 2E20A 3JS6A 2E2QA 1ESVA 4BRDA 4J8FA 4BRFA 2ZF5O 1NWKA 3QICA 4CZHA 3C7NB 4DCHA 2QWMA 5AQKA 2OANA 3LM2A 3VEZA 4H0OA 3I33A 1HLUA 1BG3A 3HZ6A 4H5TA 5AZIB 3VF6A 2E1ZA 1KAZA 2Q1NA 2V51B 3FZLA 5E84A 2QM1A 4M7YA 1K8KB 5EVZA 3I8BA 3H1VX 1HKGA 2A40A 2FSKA 5I9EB 1X3MA 3WXJA 1NMDA 4NB4A 3KVGA 5KPRA 3TU5A 2D0OA 1CZAN 3GOIA 5ELZA 1NGFA 1NLVA 3VEYA 3O1WA 3EZWA 3D7EO 3U9DA 2P9PA 4JHDA 4H5RA 4FOIA 3VGMA 3EL2A 3ZEUB 4H0TB 3WXLA 1E4GT 4I6MB 2Q0RA 3UKUB 4BQZA 1ATNA 4BGAA 4GNIA 3O8MA 3D2FA 3ZX2A 2FF6A 2A5XA 1NBWA 4MO5A 4WQ5C 1S3XA 4BRPA 3AAQA 4CZMA 2BTFA 3GE1A 3HTVA 3DXKB 3WUHA 2FXUA 4BR4A 1HKBA 1T6DA 4BC2A 2P9KA 3MK6A 4BVPA 5KQ8A 2E2PA 1BWFO 2IVNA 4QS7A 4ISGA 3JXUA 3H3NO 3WEEB 1KXPA 4XH5A 1NGIA 2E2NA 3BEXA 4BRNA 3HSCA 2P9IB 5JLFA 3VPZA 4XEIA 4BREA 4FPAA 4BC5A 3CJ9A 1MA9B 3ZX0A 1NGEA 1NGGA 3QBXA 4RTFD 5EX5A 3ZETB 1DGKN 3EO3A 3GG4A 3CI5A 5AQPA 5BR9A 2I7PA 3M1FA 4H0YB 1GLFO 2P9SA 2FF3B 4BRIA 1NGAA 2PBDA 2V7YA 2E2OA 5AZJB 4EIAA 4CBUA 4FWOA 3W0LA 4F9OA 1TUYA 2P9NB 2FSNA 4RCHA 3OHRA 1U2VA 3A5OC 4BR7A 3QFUA 3A0IX 5ADXA 4IJNA 4FWNA 3BP8A 5BRHA 4BRGA 5TKYA 2AA4A 1DKGD 3QBWA 4PKIA 5AQHA 2AP1A 5AQVA 1EQYA 4K43A 5F2RA 4ISEA 3RSEA 4Z94A 1QQNA 1QZ5A 3BF3A 2CGJA 4K42A 2QXLA 3R8EA 4FWKA 3ENOA 4JD2B 4BR5A 4K41A 2PAVA 5LJWA 3DXMB 2Q2RA 2YHYA 3C0BA 1J6ZA 2ZWHA 1TYQA 4BRMA 3FZKA 3ATUA 3EN9A 3VENA 4FOEA 3L0QA 5AQNA 1WOQA 4PKHA 3VEVA 2HMPA 2YI1A 3ID8A 3AY9A 4FWSA 1LOTB 3A5LC 5AQQA 3D2EA 5AR0A 4PL7A 3LDLA 1ZBSA 3A8YA 5ADXH 2W40A 1V4SA 1XQSC 4RWTA 4O5FA 3VETA 4XH4A 3BUZB 4FL9A 1WUAA 3QMLA 2V52B 3BF1A 3VEXA 4IO8A 4CZKA 4BG9A 2GWKA 3UKRB 5BRDA 3R6MA 5B8HA 4BRHA 1D4XA 3MDQA 4B1VA 5KQDA 4JN4A 4EAHD 2GUPA 2QWPA 4JHDB 4BRQA 3CIPA 3F9MA 4H0VB 1Y64A 2ZGYA 2EWSA 1OKJA 1C0FA 3A5MC 1NGHA 2Q0UA 1X3NA 2YHWA 1HX1A 3U4LA 2QWNA 4JNEA 5AQRA 1SAZA 1QHAA 4H5NA 2NRHA 4MO4A 2D1KA 3CETA 1Z05A 3D2FB 2ITMA 4PL8A 3C7NA 1XC3A 3MN5A 3DAWA 2NZTA 5AQXA 2HF3A 3ENHA 2FLOA 1BOTO 1NGBA 4A2BA 3MMVA 3QB0A 2D4WA 3CJAA 3GL1A 4BGBA 5EOYA 1BO5O 1Z6RA 3LDQA 5BN8A 4B1XB 3KHYA 1IG8A 4CZIA 1BA1A 2VCPA 3ULEB 4L3QA 1GLCG 2D0PA 1G99A 5JMVA 1RGIA 5EXWA 2CGKA 5KPTA 2CGLA 4CI6A 2A41A 4FWRA 5AQIA 4NO7A 1H1VA 5AQYA 4H0PA 3O80A 5BREA 1JCEA 2KHOA 5AQSA 2WUSA 4IWVA 4AM7A 4B1ZA 3ZEUA 4EFHA 5CE3A 5AQMA 1E4FT 5BPNA 2BUPA 4BR0A 3O6WA 3W3DA 3KZBA 1NGJA 3B8AX 3IUCA 3O5BA 4FWLA 4CBWA 1QZ6A 5AQOA 3UB5A 3J8AA 4H0XB 3VF4A 5AQLA 1V4TA 3CJCA 2E8AA 2H3GX 3FFKB 2DPNA 1QQMA 2P9UB 5AQFA 3M3ZA 2QWOA 4BC4A 4C23A 2CH6A 4FWPA 4LC9B 3G25A 4JAXA 3QDKA 5BRFA 2GEMA 2GELA 3WEEA 4BRAA 2P9LA 1GLEG 3FZFA 4Y0WA 3LDOA 5AFUA 3DWLA 3WQTA 1TYQB 4M63C 3WXIA 1JCFA 1YXQA 3MN6A 3EKSA 2A3ZA 1TUUA 1BDGA 2W41A 3ATVA 4AM6A 4HWIA 1KAXA 3CJ1A 5EY4A 3P4IA 3D2EB 3TPQA 4BQLA 4YDUA 5JICA 3S41A 3UE5A 4CZJA 5FPDA 2ASPA 2YHXA 2NLXA 2E1YA 1YUWA 3FZMA 2HOEA 4EHUA 1ZC6A 2J4RA 5AFUH 3LL3A 4EHTA 3SMSA 2VWBA 4M7XA 1GLDG 2Q36A 3H6EA 3SLCA 1T6CA 2IIRA 3LDNA 4MLHA 3R9PA 3DXMA 2Q31A 3H46O 1GLLO 5JLHA 4BC3A 1HUXA 1R59O 4WQ5A 1QQOA 2P9PB 3HM8A 3GDQA 2F9WA 4H5VA 3VERA 5AQJA 4K25A 3DJCA 5AQTA 3IDHA 3FLCO 3FGUA 4DQ8A 4WQ4A 4A62A 2ZGZA 3H1QA 4WYBA 2I7NA 4B1YB 3AAPA 5AQUA 3H45C 1U6ZA 3U8XA 3LM9A 4YDUC 4CZFA 1C0GA 1NGDA 5AZIA 4E1JA 2GWJA 4KBOA 3EKUA 5AQGA 2VYPA 5AQWA 2P9KB 4A61A 1DEJA 3VOVA 3UKRA 1K8KA 1HJOA 4GY2B 2IVOA 4CD3A 5BPMA 1RDWX 4FSVA 5BN9A 4BRCA 2UYTA 1XUPO 3MN7A 4PKGA 4CZEA 3VESA 5BPLA 5FPEA 1GLJO 1HKCA 2YCHA 1MWKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MCAB 3DLKA 4DV5K 4E89A 1VQNN 2A6AA 3KLEA 3L6QA 4CZLA 4I6MA 2QKBA 3ZLJA 3UKUA 1ATSA 5FPMA 1REVA 2YJFA 4CIFA 3IAYA 1NGCA 3FR0A 4WQ4C 1RFQA 2ETJA 3DXKA 4KV8A 1S1XA 4YY3K 5I42A 3ALYA 1BU6O 3AVFA 1W2BM 1WBBA 5CYQA 3G71N 3LAKA 3MAQA 2CH5A 1NNEA 1NK4A 5LL6Z 4OPKA 1BI4B 3ZETA 1KVCA 4FW1A 1C1CA 1MDUB 4CFAA 3FZHA 1YAGA 4DLEA 2A42A 5F1XA 4PUOA 1TK5A 4BR2A 4FWMA 2PYJA 2D0BA 3A2FA 4BRKA 3VF2A 4AQYK 1HPMA 3ASMA 2HMIA 4BRLA 4HUEA 3ZX3A 1CZBA 1GLBG 3AGKA 4FZZA 3FE1A 1HPZA 1VSDA 4E1NA 4DTSA 3A5NC 4DHYA 4CF1A 4BG8A 4MLEA 1JCGA 1LW2A 3H3OB 5HRSA 4BECA 4KAZA 4CF2A 4FJJA 1ZXOA 4CFDA 3PX6A 1BIUA 2V7ZA 3DOKA 3TSUA 4A59A 4CK3A 1A5WA 4CEDA 4DQRA 4FK4A 2E2QA 4J8FA 4BRFA 1NJZA 1KLNA 1NWKA 1C1BA 2PZSA 4CZHA 3OYAA 3VEZA 3OVNA 4XIUA 3OJUA 1RBSA 4DV6K 1JL1A 4JI5K 3TSQA 1KAZA 4XJXA 1U45A 1VQ4N 2O8DB 3S9HA 1JLAA 2UUAK 2A40A 1S1UA 4CHZA 4NB4A 3L2UA 5KPRA 3SJJA 1SKWA 3SUPA 1NJYA 4LF5K 1NLVA 3EZWA 4CHPA 2FC0A 5FROA 2Y1IA 3F5TA 3MEGA 4FOIA 1WSHA 4CJKA 3VA0A 1YHQN 2NRTA 5FRNA 3PUFA 5M1FA 1LV5A 3O8MA 1FKPA 4C8OA 1CXUA 4IFYA 3U3YA 1L5UA 2D0CA 4WQ5C 1S3XA 3DLLL 4B3OA 3D0PA 4U67L 3OYGA 2BTFA 4BR4A 1HKBA 1T6DA 4B9TA 1CZ9A 2DFFA 3ZT2A 4ISGA 3JXUA 3H3NO 3ENBA 4CJTA 2E2NA 1D9DA 3HSCA 1SL0A 5KRTA 4BREA 4XEIA 2DTUA 3ZX0A 1NGEA 1NGGA 1OH5A 1KQSM 3JYTA 4QCLA 3CI5A 1KVAA 4JKAA 1JLBA 3KWIA 3SBGA 1GLFO 4KH4A 1P90A 3NAEA 4E0DA 2FF3B 4PY5A 2PBDA 2E4LA 1VSHA 2HVIA 2V7YA 3L8BA 4CBUA 5C10A 4O4GA 3G4SN 1TUYA 2P9NB 1OVQA 3DRRA 5C42A 5JENA 3QFUA 2YNFA 2O8BB 3DLHA 3AO1A 5CZ2A 1RBUA 3HP9A 3T1AA 4BRGA 2AA4A 1HYSA 4FJHA 1W0HA 1RDBA 1EQYA 4K43A 3RSEA 4FJXA 4X66K 3BF3A 3HO1A 2VG5A 3NF6A 3T19A 3ENOA 4DR3K 2PAVA 2Q2RA 4C8MA 4K0KK 2ZWHA 4M3UA 1C0UA 3QESA 3VENA 1IKVA 3LAMA 3MXJA 4HHTA 4N5SA 1WOQA 2HMPA 5DK5A 3U3GA 4LH4A 5AR0A 4H8KA 3OYBA 4YFUA 3OS2A 5ADXH 4DR7K 4OVLA 3OY9A 2VG7A 4RWTA 4O5FA 3QNOA 3D45A 4B8CA 4XH4A 3BUZB 3V9UA 1TAQA 1TKXA 1NMNA 4IO8A 4BG9A 2KTQA 4F4KA 2GWKA 5BRDA 3K59A 1RT4A 1KD1O 3RMBA 3RWUA 1E3MA 1YTUA 3J81O 4BRQA 4NXNK 1XHXA 1I39A 2ZGYA 4DU1A 2EWSA 2O8FA 1C0FA 4E72A 4Y1DA 3CCEN 1HX1A 5AQRA 1Z25A 2A1RA 3QEXA 2ITMA 4OKKA 4CERA 1N33K 4HCBA 4KI4A 3LPUA 3S3MA 3ID6A 1NK8A 4Q5VA 4BGBA 1Z6RA 3LDQA 4B1XB 4B9SA 5A2QO 4FYDA 3CCJN 5I3UA 1Q8IA 2HVHA 1G99A 3V9XA 2CGKA 2CGLA 1U4BA 4DSKA 1JLCA 2UU9K 4NO7A 4H0PA 3OYHA 2UXCK 2YNHA 3ULDA 4JKGA 1EKEA 1EP4A 3HYFA 1CXQA 3NF7A 3O6WA 3SQ0A 3IUCA 3OJSA 3B6PA 4E7KA 3UB5A 3THVA 1VQ6N 4W5NA 1X9WA 1Q9XA 5AQLA 2X74A 1V4TA 3VQ5A 3P83D 2E8AA 4DR5K 4FCYA 3FFKB 4O5BA 3RRGA 3VMFB 4FWPA 4LC9B 4JAXA 3TTDA 3LZIA 2BGGA 4N56A 2FBXA 1TYQB 4DV7K 3VQ7A 3MN6A 3M5RA 3ATVA 1BDGA 3AVBA 3OYMA 1KAXA 3MECA 5HBMA 2G8UA 3SBTA 1UA1A 3SQ4A 3AA4A 2O4GA 4YDUA 4CGFA 3WNGA 4I2QA 2YHXA 4KB0A 3AA2A 4F2SA 2HHHK 1YUWA 1D5AA 2HOEA 3VQAA 4O44A 1ZC6A 4WCEL 3O3GA 4WE1A 1RDUA 2J4RA 3S3OA 1RDAA 1W9HA 3CPWM 3SMSA 2VWBA 1GLDG 2Q36A 3H6EA 1VQON 4JKBA 4KTZA 2Q31A 4Z4FA 3LP0A 1GLLO 3MEDA 4B9NA 3OBYA 1HUXA 2AJQA 5C12A 4HUFA 1RCHA 1TKZA 4BDPA 3SV4A 2F9WA 4H5VA 2YNGA 3C6HA 4K25A 3DJCA 3CCQN 1UWBA 1D8YA 1C6VA 4U7BA 1HNWK 2I7NA 1YJWN 1TL3A 3LWMA 5AQUA 3L2VA 2X6SA 4GKKK 1N6QA 3U8XA 3G0ZA 1VQ7N 3OYLA 3QINA 3EKUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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