4D0TA

Galnac-t2 crystal soaked with udp-galnac, ea2 peptide and manganese
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
KVRWPDFNQEAYVGGTMVRSGQDPYARNKFNQVESDKLRMDRAIPDTRHDQCQRKQWRVDLPATSVVITFHNEARSALLRTVVSVLKKSPPHLIKEIILVDDYSNDPEDGALLGKIEKVRVLRNDRREGLMRSRVRGADAAQAKVLTFLDSHCECNEHWLEPLLERVAEDRTRVVSPIIDVINMDNFQYVGASADLKGGFDWNLVFKWDYMTPEQRRSRQGNPVAPIKTPMIAGGLFVMDKFYFEELGKYDMMMDVWGGENLEISFRVWQCGGSLEIIPCSRVGHVFRKQHPYTFPGGSGTVFARNTRRAAEVWMDEYKNFYYAAVPSARNVPYGNIQSRLELRKKLSCKPFKWYLENVYPELRVPDHQDIAFGALQQGTNCLDTLGHFADGVVGVYECHNAGGNQEWALTKEKSVKHMDLCLTVVDRAPGSLIKLQGCREDDSRQKWEQIEGNSKLRHVGSNLCLDSRTAKSGGLSVEVCGPALSQQWKFTLNLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords POLYPEPTIDE N-ACETYLGALACTOSAMINYLTRANSFERASE 2
publication title Substrate-Guided Front-Face Reaction Revealed by Combined Structural Snapshots and Metadynamics for the Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase 2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 167
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.4.1.41: Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase.
pdb deposition date 2014-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00535 Glycos_transf_2 Glycosyl transferase family 2
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4d0tA02
3.90.550.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A 4d0tA01
4FROA 3E25A 2YCMA 4G6JA 4KC1A 4B2WA 2FFUA 3BRGC 2A8UA 2FO1A 1W3AA 3AH2A 3KMVA 1H5RA 4HG6A 1TIEA 4FREA 1BASA 1R7UA 1W55A 3JTJA 5DUYA 3NBEA 1BFBA 1S0CA 4I8MA 1I52A 5C49A 3I0CA 4DENA 4MNDA 4EEGA 4EVWA 2ZQNA 3UD9A 3I0LA 4JKXB 5C3AA 1GWWA 1ZJ3A 1VGWA 2XOAA 4LO7B 2VS5A 2Y4LA 1N4KA 4IY8A 1V84A 3R2WA 1K4VA 1R80A 3V0MA 5C3DA 3WMVA 4J23B 3JUTA 5FNXA 4JP0A 1HJJA 5CMGX 3SXAA 4EE3A 5CMJA 2RJ1A 5C1LA 1W57A 4I1EA 3UJ4A 3SX3A 1FV3A 4HO4A 2RJ6A 5CQMX 1WT3A 3SXBA 2RJ8A 3U0XA 4I4QA 1CE7B 2VFZA 5C4EA 1GX4A 3I2XA 3D5NA 3N9WA 1G1LA 4LW6A 1HCEA 3CA5A 4ASJA 4AN7B 5D61A 1DFCA 2NTDA 2WGZA 4FCUA 3FJBA 2WAWA 1FRWA 3DJ4A 3O49A 4ISRA 4AYJA 4AC3A 4DDZA 3ST8A 3TZTA 4GP3A 4X37A 5AJOA 3BCVA 2Q9XA 1F31A 1TP0A 1TFMB 4USOA 2ZU8A 2ET2A 5I1BA 5HS2A 3FJHA 2RIYA 3K8DA 4JAWA 2K4AB 3PKQA 5B2HA 2PX7A 1ABRB 2VXRA 3VEQA 2YQHA 3FJEA 2APCA 5C4FA 1A8DA 5F90A 1JVGA 4FRPA 3U2VA 3RMWA 1FMMS 1OQLB 3WO3A 3IM7A 3WO2A 2OEFA 1ZI1A 5FU8A 3OBTA 3V0QA 1PUMB 2DS0A 5FZZA 5FZYA 3WMUA 3ZF8A 1NKHB 4Y7GA 2J3PA 1PWAA 4I4UA 2F2FC 4ISQA 3IOIA 1YP3A 3V0NA 2D20A 4DCKC 3RTJB 1S4PA 3FOQA 1Z90A 1VH1A 3GUEA 4Y63A 3SX5A 2YQSA 2NZ9A 4ZDQA 5BXSA 2MZBA 1AFCA 5CMFX 4Y62A 1GGPB 4Y7TA 3CKJA 4BMAA 3CRIA 3UDAA 1H7FA 3V0PA 4FRMA 3H6RB 1PZYB 1Q04A 3NBCA 1LZ0A 4QBVA 3OH2A 5EJ1A 4ZA3B 1JTCA 3U2XA 3N7KA 5JMCA 3SNVA 1BARA 1R8OA 3I0KA 4XFUA 2DRZA 4CVHA 2FFVA 1H5TA 2BO4A 1GX0A 3HALA 3CKNA 4Y7FA 3BADA 2WEEA 2Y9XE 2HWAA 1UPSA 2WBCA 3S8JA 1DFQA 3V0BA 1OMZA 4FGFA 4I4RA 2WVKA 3D8VA 4QD2C 3O44A 1H7EA 3Q7UA 4G87A 3MPPG 2OEGA 2Y4MA 4ZLBB 5BQUA 4G9MA 4KNXA 1S0DA 1MP4A 4D0ZA 3BB2A 1MP5A 5C3BA 1H4DA 2FYDB 1JT3A 3BA7A 5BP5A 1O7QA 1H5SB 3BRFA 5IDSA 2CU2A 3CU0A 2NM1A 2MIBA 3TC2A 2MLLB 4FRDA 1G95A 4DE7A 3P6IA 1HWPB 4J2YA 1LZJA 1HIBA 1JY0A 1DZCA 4ARWA 2WVMA 3AKHA 3A21A 5CMIA 3VSFA 2RJ4A 1HWOB 2FGFA 4EFQA 4EEOA 3V0AB 1DZDA 3CRGA 1H5SD 1NHEB 3FJCA 4QKRA 4Y64A 2E3DA 1JT5A 2VXTI 1NWGB 1ZHJA 4M2AA 3OGGA 2P73A 4LO1A 2W0VA 3FJ9A 4AN6A 3VWCA 2D23A 2KI6B 1JV1A 1JV3A 1WD3A 3PKPA 5DZUA 4EB2B 2QYIB 4EKXB 3IOJA 3T7OA 1PZTA 1IILA 3BAOA 4M2BA 3OH4A 3RSBA 2VUAA 1LL2A 4J2SA 1S0GA 1TTUA 3UJ0A 2FYCB 1DIWA 5CQLX 5DDVA 3PHZA 1WBAA 1P63A 1JT7A 3FJJA 2OI6A 3O5WB 4FRQA 3CKVA 3POLA 1DJSB 1G9AA 5EC5A 1VGUA 4EE4A 1G9DA 4QALA 3FWWA 1II4A 5D63A 1AF9A 4I6IA 5BXRA 1PUUB 5BXTA 1INIA 2Y7AA 3E26A 4G3SA 5CQOA 4E1KA 3SXEA 3W9TA 4X3AA 2V0IA 1OMXA 3CRHA 3R4UA 2I5KA 3V0LA 4LO8B 2I7BA 2KKIA 2ZU7A 3O4DA 1TWEA 3FJKA 4ZFWB 1SS9A 3JRRA 1O0RA 4ZBVB 1FZWA 1WT0A 2FYAA 5G00A 3F1RA 1H4CA 5FTVA 4XFTA 2Z48A 1S0BA 1IT0A 3EE5A 1FN0A 4IRQA 1BFCA 3DK5A 1JQZA 4Z8SB 1ZI4A 5F8WA 1FR9A 2QH5A 4P02A 1SR4A 5AJNA 1S0LA 3AJ5A 2AM5A 1FQ9A 3AZWA 2M49A 1AVXB 1HCDA 3I0JA 4TLPA 2P39A 1I1EA 3V0OA 3BAVA 2E4MA 2HWMA 2FY7A 3USQA 4I3NA 1O7OA 4G3QA 1HM9A 1IHKA 4IZEA 4LO7C 4XWIA 2YUGA 2RJ0A 3CQAA 3I0FA 4KPZA 4EEAA 5C38A 1TOOA 1I1BA 3Q7WA 3DUVA 4EEEB 3LW6A 4P00A 1ZJ0A 1TW1A 4FCEA 3CAHA 3N7JA 2PGYA 1ISVA 4LO0A 3WINA 4OWKA 1QWJA 1FG5N 2AE7A 1PC8B 2RSTA 3AKFA 3I0IX 4YS8A 1XYFA 4Q9GA 2D43A 3CKOA 2VSEA 4BQHA 5C4BA 1ON6A 1DQGA 2VSHA 3OH3A 1OQMB 4GAFA 4P6AA 3RTIB 1FXOA 2W0WA 1S0EA 1RMLA 2JCKA 4JISA 4JRAA 1VZUA 1ZI5A 1ISXA 8I1BA 1FO9A 1R7VA 3D7WB 1ZJOA 1ISYA 1EYRA 4JKQA 1JLYA 1NZKA 3Q7YA 6I1BA 1HJLA 1TWMA 4Y9XA 31BIA 21BIA 4ZKTB 1H7HA 4LO3C 3PG0A 1YF8B 5JLVA 1GWVA 1QGQA 3SXGA 4B4GA 1G23A 4L41C 3T7NA 5FNWA 4HR6C 2LIQA 3HL3A 3ZXDA 2QKXA 2UUSA 1VCLA 1LL0A 3V90A 4AAWA 2LIEA 1G82A 3FGMA 1H7QA 1BLDA 3I0HA 2NVHA 4K6RA 1FGGA 1ILR1 1R7TA 4QC4A 2O1GA 4G3PA 3OKRA 1T9FA 1YTOA 4D48A 4J2XA 4KEJA 4HA2A 3FJDA 3ILAA 5I1FA 4HJJA 2D44A 4B2XA 4QBCA 4D0TA 2FYBA 2O1HA 1E5KA 1SZ6B 3IOHA 3HOMA 3IM5A 2K43A 4IONA 2ZR1B 3USRA 4Y7UA 3P6JA 1ZDGA 1ZJ1A 2VXLA 1H5TB 5C8RA 1G8OA 2X60A 2NYYA 3V0BB 3U0YA 1AVAC 4OWLA 1R81A 1JLXA 3ZLKA 1FGXA 4IRPA 3F62B 1WSZA 2X2TA 3AJ6A 1HM8A 4B4MA 2AFGA 4I1BA 5FUHA 1QQKA 5DSSB 3ZC8A 1ZJ2A 4LO3A 1MD6A 2P72A 4KC2A 3V8ZA 2D0JA 1G0RA 4HO6A 2GGQA 1H5SC 3D98A 4R7PA 2AESA 1VICA 3VT2A 4A7ZA 4LO2C 1ZI3A 2AGDA 4I4SA 5BXCA 1CVSA 3RMYA 4GAIA 4MYBA 3U2UA 1JYKA 5DDTA 5FZUA 4CJBA 3E8LC 1V6WA 3SXCA 2F2FA 3POKA 1JT4A 1T4QA 1E0OA 1TZFA 2JCLA 2WRYA 1YROB 3NJ5A 4Y7VA 4P0KA 4HO8A 3U2TA 1BLAA 1XHBA 2Z86A 4H04A 2UX8A 1IRAX 1IIMA 3H6RA 1H7LA 3QVBA 4KPXA 1S4OA 4G6MA 3S8KA 1IINA 4HOCA 5IFYA 4ECMA 1BFGA 4J2KA 1BFFA 41BIA 2BEBA 1ZJPA 1W77A 2Y9GA 1V6UA 3LTQA 3CA0A 3FJIA 1EZIA 2ICYA 4D8HA 4OEGA 1K5UA 2QGIA 1FR8A 2YC3A 4I2SA 1G9CA 1TVYA 4DECA 4DEPA 1YP4A 4CJCA 2D22A 4OW4A 1IJTA 2RG9B 2VLCA 4M28A 4D11C 5E24E 3FJAA 1WVCA 4Z9WB 2IHOA 3BA4A 2ZU9A 1S0FA 4KEKA 4AYLA 2Y4KA 4HO5A 5C36A 3CGXA 5BVPI 1H3MA 4KQLA 1L2HA 3VSZA 3ZXGA 1YYNA 1IRPA 2X2SA 1FO8A 2YQCA 5CQNX 2Q3NB 1EYLA 4L4IA 2WVLA 4XFSA 2D24A 2NXVA 1G9BA 1KWSA 1AVWB 2X5SA 1TW5A 5IDTA 3BRDA 3V0AA 1O23B 1WD4A 2KI4A 4H9WA 1QG8A 1VGZA 1YXWA 4P0LA 4GBPA 2VS4A 2AM3A 3JUJA 4B42A 3PMEA 3ZC9A 1V83A 1QGSA 5C4DA 2BO7A 4YOLA 1H5RB 3R4SA 4FRHA 2KLLA 2I1BA 2XWNA 4UEGA 1Q1UA 1Z2VA 2XWLA 2AAIB 4KC4A 3NBDA 2P23A 2YQJA 1WT2A 3CA6A 4WBCA 3N7LA 2Y4JA 1RZOB 2GGOA 1INJA 2Q4JA 3RMVA 3OJMA 3I0EA 4FRAA 4OWJA 1HV9A 4G1RA 5JQQA 3FUQA 1LL3A 2VS3A 1BA7A 3HMYA 1WBCA 3BTAA 1ITBA 1XZ6A 1ZCVA 3I2AA 2AXMA 3CKQA 4D11A 2XWMA 3I29B 2VD4A 5GAQA 5DVHA 3TQDA 3Q7XA 2BO8A 1ZIZA 2IWTB 2ZQOA 3QR5A 3T8SA 2NP0A 1FOAA 1R7YA 2OI7A 1EPWA 1VH3A 2V0LA 2YC5A 4CJ8A 2BEAA 4GOYA 1ZCUA 2A8WA 1R7XA 2O1FA 1FV2A 1FMZA 2GO2A 4I0YA 1V6VA 4P0JA 4ZGRB 1V82A 2ICXA 5F8SA 2MC2A 3N7MA 5L6SA 3N0KA 2XMHA 4ZOTA 5C1HA 3OC9A 1D0HA 2RJ5A 2JCOA 3SPTA 3BAHA 1FWVA 2VU9A 1AXMA 3C9ZA 1QQLA 5FU0A 3PNNA 2VXMA 1NMMB 1V6XA 2X65A 4FRBA 3OGZA 2DRYA 3O4OA 3BX1C 4R6UB 4NANA 4B4BA 2RQ9A 2V0KA 1DLLA 2XMEA 4EEMA 2AH9A 3K1XA 4HO3A 4M4KA 4II0A 3ZX7A 1ZDFA 1G2VA 3Q80A 5EG6C 3O4CA 4OEEA 2L5XA 4KC3A 4NAKA 5EIYA 3BAQA 5BOWA 4X39A 1MC9A 1R8NA 3OJ2A 4I4XA 3NBNA 3OBRA 1H4EA 3OH1A 2Y9FA 1EV2A 2AECA 1HWNB 1YBIA 3IAGC 1DQOA 3ZGFA 1GQ9A 3BAUA 3FFZA 2HZ9A 2QN4A 5EJZA 1MC3A 1NQIB 3P53A 4FRLA 3CA1A 4QO3A 1KNMA 4A7KA 2R9KB 3SX8A 1G93A 3V8YA 5CMHA 5BQUC 4I7IA 1WT1A 1M2TB 3MALA 5F8YA 3F1CA 4F83A 3BRKX 5BP5C 1FXJA 4Y6NA 3BA5A 4I4PA 3HSMA 4IYBA 1S4NA 3O4BA 4IZXA 2JCJA 2RIZA 3FUOA 1FGAA 3HN1A 5HPZA 1ISZA 1JYLA 2K8RA 2WE9A 3AKGA 4X38A 3RMXA 4B3UA 4IHZA 4ZFYB 1MP3A 3NGWA 2V0JA 4LW3A 3V91A 4XKIA 1ZCYA 2OI5A 3CA3A 4L4HA 3QYDA 3AKIA 4EFRA 1QXMA 5BXPA 1H7GA 5FYEA 4LO1C 4JQ0A 4PC4A 4KRVA 2BFHA 1GQCA 2Y6PA 3VUOA 2I5EA 1K5VA 2VSIA 2AQZA 4FVVA 3SX7A 3OJVA 2FDBM 4Q91A 1W3FA 4GOVA 5EHAA 2KH2A 4OEFA 4JD0A 2VSAA 3UD8A 1ISWA 2Y9WC 3R3IA 1YP2A 3U2WA 1Z4SA 4NALA 1FWYA 4KNRA 3H6SE 2BO6A 3WA1A 1LZ7A 3WO4A 1RY7A 1J0SA 2F8XC 5AJPA 3K8EA 7I1BA 3ZGGA 4QD2B 3O4AA 4J18A 3AH4A 5FTSA 3HBWA 2GZBA 2X5ZA 1H7TA 2AM4A 1VZXA 4ZFUB 3AZVA 3CU1B 9ILBA 4I96A 1GA8A 1VPAA 1Q03A 2YESA 3OH0A 5C4CA 4JPZA 1NF5B 4F34A 4EE5A 1H5SA 1HWMB 4QKSA 1LZIA 1Z0HA 3FJ8A 4LO2A 3I0DA 4USPA 4A7YA 3CA4A 5J49A 4Q9PA 3B9UA 1R82A 4HCQA 4KXOA 3T7MA 3LLPA 3O3QA 4Y6UA 2RJ9A 1G9RA 5C47A 1ONKB 1SR4C 4I4VA 2HW9A 1EVTA 5L6VA 3RSJA 1VGTA 2E8BA 2Z87A 4G9NA 4KBBA 2P6WA 3AH1A 2E4MC 2Z49A 3OGFA 4KEIA 1RG8A 3UD7A 4CJMA 4HO9A 4I4OA 4HO2A 3JUKA 1IOBA 1PZZA 4I4YA 2PA4A 4I37A 1W3GA 3EF2A 3OAMA 1G3LA 2ERMA 1XG6A 2V0HA 3IIRA 4ENDA 4NAIA 2RIXA 4B5BA 1XZZA 2ESUA 3A07A 1LVWA 1HM0A 5CQPA 4LO0C 3WINC 1VM8A 2D7RA 2DPWA 3A22A 3F1YA 4HO0A 4GP0A 5D62A 3VT0A 5FV9A 1FWUA 4ASYA 3V79C 2PGVA 1HKNA 1ON8A 4IY9A 4OUJA 1AVUA 3O3PA 5C1GA 4IQPA 3H6QA 3VT1A 1JVDA 4KT7A 4EFPA 1VZTA 4FQWA 3SXDA 1M16A 5C48A 1G97A 2RITA 3Q4SA 2D7IA 3PUBA 3FJFA 3IM6A 1NUNA 2RJ7A 4C2SA 3KIAA 3I0GA 3ZLLA 2DREA 1ZCTA 3A23A 3BAGA 2D1ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FROA 3E25A 2YCMA 4G6JA 4KC1A 4B2WA 2FFUA 3BRGC 2A8UA 2FO1A 1W3AA 4O6NA 3AH2A 3KMVA 1H5RA 4HG6A 1TIEA 4FREA 1BASA 1R7UA 1W55A 3JTJA 5DUYA 3NBEA 1BFBA 1S0CA 4I8MA 1I52A 5C49A 3I0CA 4DENA 4MNDA 4EEGA 4EVWA 2ZQNA 3UD9A 3I0LA 4JKXB 5C3AA 1GWWA 1ZJ3A 1VGWA 2XOAA 4LO7B 2VS5A 2Y4LA 1N4KA 4IY8A 1V84A 3R2WA 1K4VA 1R80A 3V0MA 5C3DA 3WMVA 4J23B 3JUTA 5FNXA 4JP0A 1HJJA 5CMGX 3SXAA 4EE3A 5CMJA 2RJ1A 5C1LA 1W57A 4I1EA 3UJ4A 4UY4A 3SX3A 1FV3A 4HO4A 2RJ6A 5CQMX 1WT3A 3SXBA 2RJ8A 3U0XA 4I4QA 1CE7B 2VFZA 5C4EA 1GX4A 3I2XA 2VK9A 3D5NA 1G1LA 3N9WA 4LW6A 1HCEA 3CA5A 4ASJA 4AN7B 5D61A 1DFCA 2NTDA 2WGZA 4FCUA 3FJBA 2WAWA 1FRWA 3DJ4A 3O49A 4ISRA 4AYJA 4AC3A 4DDZA 3ST8A 3TZTA 4GP3A 4X37A 5AJOA 3BCVA 2Q9XA 1F31A 1TP0A 1TFMB 4USOA 2ZU8A 2ET2A 5I1BA 5HS2A 3FJHA 2RIYA 3K8DA 4JAWA 2K4AB 3PKQA 5B2HA 2PX7A 1ABRB 2VXRA 3VEQA 2YQHA 3FJEA 2APCA 5C4FA 1A8DA 5F90A 1JVGA 4FRPA 3U2VA 3RMWA 1FMMS 1OQLB 3WO3A 3IM7A 3WO2A 2OEFA 1ZI1A 5FU8A 3OBTA 3V0QA 1PUMB 2DS0A 5FZZA 5FZYA 3WMUA 3ZF8A 1NKHB 4Y7GA 2J3PA 1PWAA 4I4UA 2F2FC 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1PZZ A;  4I4Y A;  2PA4 A;  4I37 A;  1W3G A;  3EF2 A;  3OAM A;  1G3L A;  2ERM A;  1XG6 A;  2V0H A;  3IIR A;  4END A;  4NAI A;  2RIX A;  4B5B A;  1XZZ A;  2ESU A;  3A07 A;  1LVW A;  1HM0 A;  5CQP A;  4LO0 C;  3WIN C;  1VM8 A;  2D7R A;  2DPW A;  3A22 A;  3F1Y A;  4HO0 A;  4GP0 A;  5D62 A;  3VT0 A;  5FV9 A;  1FWU A;  4ASY A;  3V79 C;  2PGV A;  1HKN A;  1ON8 A;  4IY9 A;  4OUJ A;  1AVU A;  3O3P A;  5C1G A;  4IQP A;  3H6Q A;  3VT1 A;  1JVD A;  4KT7 A;  4EFP A;  1VZT A;  4FQW A;  3SXD A;  1M16 A;  5C48 A;  1G97 A;  2RIT A;  3Q4S A;  2D7I A;  3PUB A;  3FJF A;  3IM6 A;  1NUN A;  2RJ7 A;  4C2S A;  3KIA A;  3I0G A;  3ZLL A;  2DRE A;  1ZCT A;  3A23 A;  3BAG A;  2D1Z A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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