4D73A

X-ray structure of a peroxiredoxin
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
180
structure length
171
Chain Sequence
IKENDLIPNVKVMIDVRNMNPNDFTSIDTHELFNNKKILLISMPGAFTPTSTKMIPGYEEEYDYFIKENNFDDIYCITNNDIYVLKSWFKSMDIKKIKYISDGNSSFTDSMNMLVDKSNFFMGMRPWRFVAIVENNILVKMFQEKDKQHNIQTDPYDISTVNNVKEFLKNN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 1-CYS PEROXIREDOXIN
publication title Plasmodium Falciparum Antioxidant Protein Reveals a Novel Mechanism for Balancing Turnover and Inactivation of Peroxiredoxins
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 61
structure length 171
sequence length 180
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4d73A00
1V40A 1H4OA 5H5SA 3P8WA 3Q18A 2L4CA 4LLRA 1YEXA 2VL9A 4XTSA 4RI7A 2B5YA 2LTKA 4IP1A 4IHUA 1T1VA 5IOXA 5CNWA 3TJFA 1KEBA 3GFKA 5DALA 3MAKA 1K3YA 4FIWA 1ZGNA 1PN9A 3CSHA 2JL4A 3BOAA 1Z5YE 1XWAA 3LXZA 2CV4A 4WF4A 2XBIA 1B48A 1TU7A 3P2AA 4HEA2 3R2QA 1OC9A 3TCOA 2RM5A 1TW9A 2CVBA 4EXJA 3GSTA 3GKNA 3D0ZA 1XW9A 1XWGA 2NBSA 2P5QA 3IAS2 1MDJA 4DVCA 1OC3A 4K2DA 1A24A 3TB2A 3TUEA 2I3YA 4CDOA 3FK8A 3I43A 3F4RA 4Q5NA 1GH2A 1U88A 2OA7A 4GXZA 1MDIA 1MD4A 2LJKA 3VLNA 4N10A 1T3BA 3MNGA 3O76A 1GLPA 2M72A 1THXA 3LG6A 4KB3A 4GLTA 3WGEA 5DALB 4I2TA 4HDEA 3HKRA 3C1RA 3FR6A 4QQ7A 2FLSA 2PWJA 4XHMA 3I9V2 3QAWA 3UOMA 2I1UA 3KTLA 5HQPA 3FZ5A 4NPBA 4XRDA 2FD3A 3PR8A 3SBCA 1BAYA 2TRCP 3IK9A 4ZBDA 3ZVJA 3BBYA 16GSA 1GL8A 3CXGA 3GNJA 3HDCA 1NSWA 1BQ7A 4ECCA 18GSA 2WZ9A 2GDRA 5ECKB 1ON4A 4ZIJA 1QUWA 1ZOFA 4F82A 1YDKA 5CO3A 4KNDA 2AB6A 1WWJA 3TRPA 2H8LA 4XS4A 3ZRDA 4JR6A 2E2GA 4IQ1A 1BX9A 5AIXA 1TI3A 1WJKA 1EOGA 1M2DA 3VWUA 3LYPA 2EIOA 3TKSC 2WRTA 3GL5A 2H71A 4EF0A 2X8HA 4FH8A 2VM1A 3OR5A 4TXOA 2DIYA 4ML6A 1DSBA 3HJPA 5CP1A 2B5XA 1EWXA 1W4VA 1UVZA 1SL1B 1GWCA 2LJAA 2A2SA 1O8WA 1U6TA 2JACA 3VI5A 1WPIA 1Z6MA 4G9HA 4OCEA 2M46A 1Q4JA 17GSA 1GRXA 2R2JA 2E7PA 1K0MA 4JR4A 4NXIA 4KDXA 1T4ZA 4XS4B 4PUFC 2GZYA 2WDUA 4MZCA 1V98A 4G2EA 3HYPA 4IS0A 4MABA 5J41A 4L0UA 1Z6NA 3DWVA 2PMTA 4IBPA 4OO4A 4EDYA 2HZEA 3US3A 4K0NA 2HLSA 2I4AA 2OBIA 2VM2A 4TXOB 2BTOT 1EEJA 4IP6A 4MP4A 1VF2A 2BMXA 2GZZA 2OADA 1U3AA 5G5FA 1JHBA 1XW6A 2R5GA 4GF0A 3C73A 1GULA 3KH9A 4TKYA 4ECJA 4BVYA 3GV1A 2VCWA 1TI1A 3CTFA 3CRUA 1ERWA 3TJKA 3WGXA 2Z9SA 5GZZB 4TRXA 3VWXA 1SL0B 4CW9A 2LRTA 4JEDA 1JZDA 1HQOA 1V58A 4V1Ag 3UBLA 2LRNA 2KLXA 3IOSA 3CTGA 4XIHA 22GSA 2LUSA 2YZUA 4OWYA 1OVNA 2YV7A 4MF6A 4F0CA 4MPGA 2WJUA 1ZL9A 5HR2A 3LORA 2AYTA 2H70A 4JRRA 2GS3A 5CRHA 2PGTA 4V2MA 4O32A 4WF5A 5F8BA 5G1KA 5AISA 4ZL7A 3CSJA 3QCPA 1QK8A 1H75A 2OACA 2MBSA 3HVVA 1AQWA 5CREA 1GLQA 1F3BA 1THOA 5DJMA 1VGLA 1XWKA 3UL3A 2FGXA 5FHIA 5JCGA 3WD6A 1HNAA 4GQFA 4YQMA 1OAZA 1YQ1A 1FW1A 5IMFA 2TRXA 3WYWA 2K9FA 3VPTA 2MMOA 2H1DA 2LS5A 3H79A 1UC7A 3UEMA 4LL1B 2O8VB 1GTUA 2XHFA 1SK0A 2JZTA 1UA5A 3IPZA 1YF1A 1PQNA 3W8SA 5GAPD 4BL7A 4V1Ap 3CMIA 4LMWA 4K8MA 1V57A 3ZMLA 3RAZA 1AUCA 2K8SA 2VD1A 3TKQA 4K7NA 4KE3A 4HQZA 2FY6A 4YAVA 1J08A 1TXXA 3RBTA 5B8AA 1JFUA 1M2BA 2JSZA 3FKFA 5G1LA 2V1MA 3E9JB 1S3DA 1PD21 5D9XA 12GSA 4EDZA 1X9WB 2VCXA 9GSSA 1B9XC 1YKCA 4JE1A 2GQLA 4EVMA 2F8AA 3DEXA 4X1UA 5HR3A 2IL3A 3DYRA 1OC8A 4KDYA 1IYHA 3GKXA 1HNBA 3TOTA 5J9BA 5IPHA 1VRSD 2H0GA 4N0ZA 3IR4A 4K7IA 1FB6A 2JZSA 4CHSA 5GAND 19GSA 2RUEA 2YWMA 3TDGA 3VFIA 2IMKA 3IBHA 1LBKA 5EL8A 2CX4A 3ZMKA 5ECIB 6GSXA 1W89A 1C72A 4MJCA 3ZIVA 3APQA 2VL2C 5F05A 2FWHA 4RQXA 3UJ1A 3GX0A 14GSA 2WGRA 1AQVA 4YQVA 4ZB9A 4J2FA 4LL4B 5IPGA 4ID0A 3IK7A 5D9WA 3ZL5A 1TTZA 2B1KA 2IN3A 3F4SA 1V2AA 2R37A 3KP8A 3KH7A 1EGRA 3Q6OA 4GWRA 4DSRA 4DEJA 3FY7A 1KBNA 1E6BA 1R7HA 4MH2A 5IMZA 2ON7A 1A2MA 1XCCA 5ECSA 4KCEA 3LGCA 4EUYA 4EC0A 2WB9A 2FA8A 3V1WA 2GT6A 4F9ZA 2GVPA 4PQIA 4YAPA 5J5NA 2FWEA 2DLXA 3W8JA 4Q5RA 2HRNA 3UVHA 4I97A 2IMFA 2HFDA 3E3EA 4Z7XA 4KDUA 4MF5A 2VCTA 1LU4A 1FG4A 1VF3A 1QQ2A 4MCUA 4OO5A 4OMVA 2P0GA 4PNGA 3LSZA 2C0DA 1AAZA 1GSDA 4PQ1A 3GA4A 2IPAA 2F51A 2GSSA 4IW9A 2O89A 3ME7A 3F8UA 1USBA 1GNWA 2HXKA 4ECBA 3QFBC 1G6YA 1R5PA 3H1NA 1Y6EA 5C04A 1TRUA 5B8BA 4OCFA 2L5LA 3P90A 4MJEA 3HZ8A 6GSVA 3WT1A 1Z7RA 1O73A 3EWLA 5ECOB 4MPFA 4OFTA 3M8NA 4K1FA 3BD2A 5J4UA 4WBRD 3FRCA 1EEMA 4O5RA 4I2UA 1BG5A 2J9HA 1B4PA 2VD0A 1NHOA 3IA1A 3JCML 3DXBA 3IE3A 3F6DA 3H4KA 1TP9A 1WOUA 3FHKA 1K3LA 1AC1A 3VWVA 2YJ7A 1PKZA 2MYGA 4EL1A 3QOUA 3KM6A 3TOUA 2C80A 4BPYA 1T7PB 1JLWA 4KAEA 1K0DA 5ELGA 1FHEA 2KP1A 2DJ3A 1I9DA 3TJJA 4AF2A 4F0BA 2LKUA 1O85A 3KCMA 1J0FA 4PUAA 2HSHA 2C8UA 1R5AA 4TW5A 3RPNA 4IN0A 1K3OA 5A5KA 3HCZA 2C3QA 1CQHA 1OC9B 2LEGA 4ZXGA 4Q5FA 2YOIA 1TRSA 5B6NA 3EU3A 4MJBA 1FO5A 3L9UA 3I6AA 3J7Yk 1O8XA 3EMPA 1O7UA 1GP1A 2FNOA 4RUVA 1SK2A 1QFNA 1EOHA 1O6JA 3HY2A 1K0OA 2H74A 1WIKA 5DCGA 2C3TA 1M9BA 1YKAA 3GURA 3D6IA 3U6VA 1N8JA 2YWOA 2YWIA 3UBKA 3GTUA 1TDIA 4TVEA 2H6XA 1JZRA 1EGOA 1BEDA 1U3IA 3GRXA 4NHZA 1YZXA 3F3QA 4O92A 4WEYA 4ML1A 4DSSA 2A2RA 2VLUA 4OFNA 3KZQA 4PNFA 1X9MB 2MBTA 5LCZA 4V2LA 1ST9A 4XCSA 1Z3EA 1DE1A 3LJRA 6GSYA 2V6OA 3WT2A 1M2AA 4PGTA 3TKRA 3DVWA 2FA4A 1GNEA 1XFLA 2PUKC 4K6XA 5IMVA 3BCIA 1M0UA 4L5LA 3QAGA 4QL7A 1U87A 5FWGA 3ISOA 4MF7A 4WETA 4MZWA 4IKHA 3IRAA 2AJQB 5D9VA 4XS6A 1AIUA 2CA8A 4EO3A 4LA1A 4KA0A 2CAQA 4AJ8A 8GSSA 3GTUB 1M9AA 2VL2A 1TJDA 1T4YA 1A23A 1RK4A 2NVLA 3BJ5A 5IMAA 1XVWA 2DJ1A 2FUG2 1B4QA 1CQGA 5D93A 2E0QA 6GSUA 3FZ4A 2GQKA 2DJ2A 2HZFA 2REMA 2EIQA 3NZNA 2V41A 5ID2A 2A4VA 3QPMA 2YANA 4KW6A 1SL2B 1SJZA 3GX8A 5DBQA 2B1LA 3DGQA 1FAAA 1F37A 3FEUA 1ERTA 4TR3A 3VURA 3AY8A 3ERWA 2XBQA 4O7HA 2QKEA 1S3CA 1PSQA 2VOCA 4POBA 5AIVA 3LYKA 1O81A 4J57E 3HZ4A 3H93A 1Z9HA 4BA7A 1AXDA 3F63A 1UN2A 1HNCA 3ZZXA 3UMAA 3EU4A 4IVFA 2HZEB 2YV9A 4N11A 3DRNA 4ZB8A 5DAKA 4NMUA 7GSSA 1XVQA 5IO2A 2GSRA 1GUHA 3LQ7A 2RUFA 3CRTA 4X0XA 5JCUA 3PH9A 5F0GA 3IDVA 1FVJA 2OKAA 1S3AA 2H1BA 5F06A 4E8HA 5ID2B 1QGVA 2JSYA 1DUGA 2VLTA 3L0HA 1ZMAA 4KCAA 2YN1A 2VCVA 1K0NA 3FW2A 1URMA 4WKWA 3RHBA 2DIZA 3DD3A 2YZHA 5ELAA 3U5RE 4E8EA 4D73A 1DE2A 2ES7A 2GSTA 4ILFA 1R4WA 1F2EA 5INYA 3MDKA 5G2ZA 1GSSA 2HSYA 3IC4A 2PBJA 1XBSA 3M1GA 2VIMA 4JZQA 2PU9C 3D5JA 2FWFA 3NIVA 6GSWA 3GH9A 4TR0A 1A0RP 4MJAA 3C71A 1A8LA 2PVOC 1GTAA 1EP7A 4G10A 2GSQA 3VI7A 2DJKA 1TK0B 2OE1A 4WR5A 1K0CA 5HFGA 4PX1A 4KUNA 5D8IA 4I8BA 2VLVA 1X5CA 5ABRA 3F0IA 3GYKA 3TJGA 3GKKA 5J3RA 4LMVA 3QAVA 4HJMA 3L78A 2G2QA 4NV5A 1RW1A 2H30A 4ZL9A 3KTBA 2WFCA 3TGZA 3A2VA 3DKSA 1SYXA 4JBBA 2AHEA 1PL1A 2LQQA 3QD9A 5G31A 3L9VA 1M7TA 2BJXA 5ECLB 3UAPA 5AN1A 4AJ7A 1AW9A 2V2GA 4EKZA 1PX7A 4ZL8A 3TJBA 1GSUA 2C0EA 4EE0A 2DBCA 3HHVA 1E2YA 5C00A 3TRQA 5CRWA 2IWTA 3O6TA 3HXSA 3CYNA 6GSTA 1PX6A 3EMXA 3UVTA 1MDKA 2RM6A 2H6ZA 2IMDA 2ALBA 2MMZA 4ACSA 2V32A 1X5EA 4ZB6A 4IELA 1ZYEA 2X64A 4HUAA 1ZYQB 4AJ6A 2F3MA 3ZIJA 2VUPA 1TK8B 2HRFA 1GUMA 2D2ZA 2H01A 1XOBA 1PKWA 1SU9A 1ABAA 4TXVA 2N5FA 1XZOA 4H86A 3S9FA 3UIWA 2XC2A 1PRXA 1SKWB 1X0RA 2X8GA 2V6KA 2HI7A 2I81A 4FYBA 2H19A 5KN2A 4IQAA 2LRCA 2N5BA 3GKMA 4TOPA 3D22A 2IFQA 1VF4A 1WP0A 4HI7A 5IOWA 3DMLA 2QGVA 5D73A 1SD8A 3LXTA 1SD9A 3A2WA 2L6DA 1A8YA 1TRWA 1ACVA 5ECPB 2H72A 3L4NA 3CSIA 4YH2A 4HZ2A 1X9SB 2X8CA 3EINA 1PA3A 4IGJA 3FR9A 5ECRB 1VF1A 3EYTA 3Q19A 4Q5QA 2IJYA 4K9ZA 5D96A 2R3XA 2E2MA 2M80A 1V9WA 2YJHA 3K8NA 4MA9A 3BCKA 2H76A 4MH3A 1ERVA 1WRYA 2B7JA 2K8VA 2QC7A 1XOAA 2VCZA 5COHA 3D4TA 1Z7PA 2YNXA 11GSA 3M9KA 10GSA 2HYXA 2IFQB 5EPFA 1NW2A 3EC3A 1G7EA 2GLRA 1EV9A 4G19A 3ZTLA 2N5AA 5HR1A 2F9SA 2NDOA 5DCHA 3ZITA 3QR6A 1Y25A 3G7IA 4BWSA 2OE3A 3ZFBA 5G5EA 1PGTA 3ZFLA 3F4TA 2XPEA 4MK3A 5CYYA 3VK9A 1M99A 3F3RA 3EVIA 2GT5A 5A4WA 3TKSE 3N5OA 3GMFA 3D4MA 1ML6A 5DDLA 2CAIA 2WCIA 1OE7A 5KEJA 3SWLA 2ZNMA 2HT9A 3H8QA 1A2JA 2YP6A 5LNKe 1TU8A 3EURA 2O85A 3MWHA 1F9MA 3N9JA 3P7XA 4IJ3A 2J23A 3FZ9A 2B3SA 2R6KA 4BVXA 4WR4A 1A2LA 1EV4A 2PERA 4WBJA 1R26A 2AV4A 3M9JA 2FWGA 1F3AA 4GTUA 3WGDA 2L6CA 4N30A 5G30A 3I69A 3ME8A 1B8XA 1EP8A 2TIRA 1JZWA 3NOFA 3A5WA 1GTIA 2ON5A 1J9BA 5ECHB 1WMJA 4POMA 4GSSA 5ECMB 3VWWA 4RI6A 5B6MA 5KN0A 4L5OA 5F07A 3KMNA 1KNGA 4KSOA 4GQCA 2OE0A 5IMCA 3G7YA 3HVSA 2GGTA 3C1SA 5D9TA 4ECIA 3HVXA 1JZOA 4MZBA 4NHWA 4ISDA 1EZKA 2C3NA 1A0FA 2WULA 5J9CA 1FB0A 1AQXA 1WE0A 1TKDB 1IYIA 2GZPA 2VCQA 2ZCTA 2C0GA 1FOVA 4MDCA 4KSMA 1GSYA 2L59A 5DQSA 2L5OA 4ZBAA 3APSA 3RDWA 2B5EA 4IJIA 6GSSA 2AAWA 2CZ3A 2H75A 4JU5A 5EVOA 3G9BA 2EC4A 1OYJA 4HU7A 4PURA 3EE2A 1TOFA 2CX3A 3IAM2 3ZREA 1RQMA 2LQOA 3GHAA 2VO4A 3FZAA 4TR4A 3ED3A 4GCIA 2B6MA 1QXHA 2EIRA 2K6VA 4KH7A 1B9YC 1BYEA 2JZRA 4F03A 1SENA 2VAFA 5HFKA 5FT3A 2LNTA 5EY6A 4K0GA 4DSSB 1TRVA 5ECNB 4FYUA 4OD7A 1HD2A 2L57A 1OE8A 4WXTA 3HJOA 2CVKA 2H1GA 5HFIA 2NPBA 4K7OA 4HOJA 2MZCA 1YF0A 3KXOA 1K0AA 2LV3A 5IQYA 3FYGA 4I5QA 1SKSB 2LSTA 3F9UA 4NAXA 5KN3A 5IIZA 1GSQA 20GSA 4AGSA 2HE3A 1K0BA 3MSZA 1XW5A 5E59A 3IV4A 2CZ2A 3HD5A 3KJYA 2WS2A 4GSNA 2PN8A 5CRDA 4TN8A 4L8EA 4N0VA 4HS1A 1OKDA 4NWYA 2F8FA 1GUKA 2GTUA 1NHYA 5HR0A 5B7CA 4YQUA 4P3YB 3GUSA 2P31A 2C0FA 2FCHA 4POLA 1X5DA 2O87A 4X43A 2IIYA 2C4JA 1FVKA 1MTCA 1XWCA 2DMMA 3IHQA 4HZ4A 3GH6A 4PQHA 5CRGA 3QFAC 1YY7A 2RIIA 1ILOA 4FYCA 3APOA 2IMIA 4F2IA 3KGKA 5CAXA 1SK1A 3FR3A 3A3TA 3DVXA 4MLYA 2LNSA 2VL3A 3RHCA 1MD3A 1GSFA 2DJ0A 2XPDA 4ULXA 1KTEA 5DQYA 2G0FA 3HJMA 1GTBA 4TR1A 5ECQB 5DAKB 2RLIA 3RPPA 2KHPA 2PPTA 4GRFA 3CBUA 5JWOB 4GSTA 2X99A 1YEPA 3G7JA 2IMEA 3TKPA 13GSA 3QMXA 3PGTA 2B7KA 5E4WA 3LEFA 2DSAA 2H73A 5IMDA 5DJLA 3VPQA 3C8EA 2CQ9A 1T8EB 1SKRB 3A2XA 3Q74A 2DC5A 1XPVA 5H5QA 4NV2A 3DIEA 3L9SA 1SJ6A 5KN1A 4MMMA 3GN3A 2MMNA 2H1AA 2JU5A 5LD0A 3E0UA 3GL3A 4HJ2A 5H5RA 1PL2A 1SYRA 2CVDA 4D73B 1F6MC 2R4VA 1XXUA 2AUVA 1ERUA 2K18A 2FHEA 2YCDA 4TR1B 3M3MA 4L0WA 4HU9A 3KD0A 4XS1A 3KEBA 2I9HA 1Q98A 3F6FA 2JADA 2NTOA 3ZLPA 2YPMA 5DVBA 4BWQA 4KGIA 1SJIA 1I5GA 2KUCA 4J56E 3M0FA 2YWNA 3GSSA 4KX4A 3KP9A 2H0IA 5IM9A 1DBYA 2KP2A 3LWAA 5ENUA 5GSSA 1G0TA 4V2NA 3ZYWA 3J7Yb 2O7KA 4PXOA 4DSQA 1G6WA 2P5RA 3IXRA 2HNLA 4RQRA 2LJRA 2H6YA 4HQSA 2GQMA 1G7OA 3TRXA 1BJXA 5JWRB 2H0HA 3HA9A 2KOKA 1ZCPA 4QL9A 1YJ6A 4OFMA 2H66A 5A4VA 3W6GA 2QSIA 1XWBA 4FO5A 2PVQA 3TKSA 2ZUPA 3UARA 3D21A 2DJJA 5IO0A 2C1YA 2MMAA 2CT6A 1NM3A 3ZVJD 2OJLA 4ZBBA 1GSEA 1PMTA 1N2AA 3KIJA 4I6XA 3ERGA 5JWQB 5A4UA 1MEKA 1HYUA 3C7MA 1LJRA 5L71A 1TK5B 3GIXA 3LFLA 3QDNA 1JLVA 5GSTA 2DMLA 5AGYA 1XIYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite