4DITA

Crystal structure of gsk3beta in complex with a imidazopyridine inhibitor
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
353
structure length
328
Chain Sequence
SKVTTVVATPGQGPDRPQEVSYTDTKVIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKVLQDKRFKNRELQIMRKLDHCNIVRLRYFFYSSDEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHSFGICHRDIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPNVSYYRAPELIFGATDYTSSIDVWSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIREMWTKVFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRDPNVKLPNGRDTPALFNFTTQELSSNPPLATILIPPHARIQAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of GSK3beta in complex with a Imidazolopyridine inhibitor
rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glycogen synthase kinase-3 beta
total genus 90
structure length 328
sequence length 353
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-01-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ditA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ditA01
5CNNA 4YHJA 3S3IA 3HV3A 3AC2A 2ONLA 3P0MA 4FT9A 4EZ7A 1KSWA 1VR2A 3GCVA 3UPXA 3GCSA 1R1WA 3TNWA 3QZGA 3PSDA 3ZEPA 3QQKA 2XK9A 5AUXA 4BCKA 4BWXA 3DFCB 3QCXA 4MNFA 2YIXA 3ORZA 5J1WA 3DBCA 4YZBA 1U46A 1SNXA 2PVYA 4PL5A 4XYFA 3BI6A 5CANA 4H3BA 3SLSA 4E6QA 2YJRA 2ZAZA 2W1IA 2UW0A 3MGYA 2XNNA 5I9ZA 3MVLA 3R73A 2ZM1A 4UZHA 1NVQA 4AA5A 5FTOA 3V04A 2IO6A 3KU2A 2XIKA 3TV4A 3F5XA 4EI4A 5IZFA 3FMEA 3LZBA 4YHTA 4D55A 5CVHA 3PJ3A 3FLQA 1FGIA 2ZMDA 3EKKA 3ENHA 2X2LA 3ACJA 3EQGA 5TR6A 3VULA 3C4ZA 3IGOA 5J95A 4YJNA 1UU7A 5IQEA 4Y46A 5DRDA 5JT2A 3ZONA 4WUAA 4EBWA 4F63A 3QU0A 3E8DA 2I6LA 4R5SA 4W4WA 3SDJA 5LVMA 5AV0A 4BDFA 2GFSA 2XMYA 3TNPC 2R3KA 2WEIA 3U4UA 1VJYA 3G2FA 4BBEA 4ZLZA 5AAEA 4BC6A 3QGYA 4YPDA 5FLFA 2FA2A 5A4CA 1M14A 5KKRC 4I20A 5CWZA 1Y8GA 4EZ3A 1A48A 4N4SA 4EH2A 2HENA 1OPLA 4F7SA 4V0GB 4F7LA 5A54A 3ZO2A 3G0FA 4FSRA 2UZBA 3R63A 3F69A 3IG7A 3COKA 4W8EA 5CYIA 1L8TA 4OGRA 4FI1A 4JQ7A 4QYEA 4MF1A 3ZMMA 1BMKA 4LMNA 4QPAA 2BKKA 3COHA 3D5VA 2BRBA 4LFIA 2BROA 2C6KA 2WMQA 3KA0A 3SXSA 1U5RA 3WYXA 3FPMA 3R1QA 5C03A 4QNAA 5JN2A 2CNUA 3D15A 4JR7A 3HUBA 5CAQA 4NH1A 4FBXA 1NVRA 2VTRA 3KXXA 2X2MA 3RNYA 5AM6A 1TVOA 4CSVA 3GB2A 2UV2A 3C4FA 2R4BA 2G2HA 2R2PA 3E3PA 3HRCA 3DAJA 4YZMA 4N0SA 4O86A 4U45A 3ACKA 3CTQA 2VRXA 4LRKA 3O7LD 2OH0E 2OXXA 4CLIA 3RNIA 2B9FA 3RCJA 2PVKA 4YGAA 3R7EA 3MI9A 1GOLA 4LGHA 4IM3A 2FVDA 2ITOA 1WBTA 3BYVA 4X7QA 5M4UA 5JMSA 2J2IB 4ZJIA 2WAJA 3DOGA 2FSTX 3O7LB 2NRYA 2O64A 2ESMA 2PZ5A 2YM6A 3OTUA 4IZAA 5AUVA 3SAYA 4ACMA 4BWKA 3ZLXA 2V5QA 2PE1A 2QVSE 4X0MA 3PXZA 4PP7A 4JIAA 4F08A 4AUAA 4XJ0A 4JG6A 4BN1A 5ANEA 5B7VA 4C59A 1WBWA 1W84A 1FGKA 4GU6A 3FHIA 3K5VA 4YZDA 4M69B 3AGMA 5AM7A 2J51A 1O6YA 2Y6OA 4C4IA 4AW0A 2UZDA 3JVSA 2IVTA 3THBA 4WRSA 2JITA 2Z60A 3KFAA 3R7GA 3FI3A 4ALWA 2B53A 2NRUA 3JVRA 4LGDA 2QOLA 3FKLA 3PJ2A 3ITZA 1ZMWA 3OXZA 4TTHB 4BI2A 3GNIB 3BE2A 3EH9A 3GOPA 4FEQA 4ACGA 3A2CA 1U59A 2ZV2A 4FKRA 3EL7A 4GYIA 4ID7A 4I93A 3WF7A 4AWIA 3PIXA 1XBAA 1AD5A 2PMIA 3RZFA 3T9TA 4B0GA 3OFMA 5DG5A 4ZTMA 5I9WA 4ANQA 2XJ1A 2GQGA 3LJ1A 4K11A 3E8CA 1H08A 2WTVA 4KWPA 4ALVA 4AP7A 1OIUA 4ZXTA 2BUJA 3PPJA 5DEWA 5EYMA 2CLXA 3CY3A 4U97A 2C5OA 4I1ZA 2JIUA 3DA6A 1OGUA 4G9CA 4I5PA 2YHVA 3D4QA 4EOPA 5IQBA 2BDJA 5E8XA 2HW6A 2CGXA 3NYVA 3TN8A 1BUHA 3KMMA 3POOA 2VWWA 2O2UA 1YRPA 1SM2A 3R1NA 4FV4A 4IX6A 4XH6A 3SA0A 4AGWA 3DXPA 2UW9A 4RJ4A 1GIIA 2VTLA 3AGLA 4PNIA 2EVAA 5AP4A 2HYYA 4TYGA 1H24A 4ACDA 3FEGA 5DI1A 3ZBFA 5H8BA 4EJ7A 4XP0A 3TZ8A 2JAMA 2I40A 3DPKA 3KXHA 4FTUA 4IZYA 2YABA 2ZDUA 4L01A 2I1MA 3GT8A 4KRCA 5DR9A 2GDOA 4NCTC 5FQDC 4EOOA 4EKLA 5A9UA 2GHLA 5M06A 3V5PA 4JL9A 3BHTA 4EH7A 3RZBA 4YNEA 4J99A 4F64A 4PMPA 3RPOA 5EI8A 4AW2A 5C1QB 3HL7A 4O0VA 3UIBA 2W06A 4R1YA 1XJDA 2ITQA 3CTHA 5JQ8A 5L3AA 4IANA 1XO2B 4YC8A 3OWJA 2J9MA 2BRNA 4PDSA 2RFSA 4I0SA 3Q32A 1KV1A 4IEBA 5HEZA 5E1SA 4CTCA 5DR2A 2VTJA 5EW3A 5J87A 4UB7A 4RZVA 5CZIA 3C4EA 5B0XA 3R6XA 3QX4A 4C02A 1L3RE 1YOMA 2F2CB 2R3RA 3NDMA 5F95A 4F1MA 4D2WA 3TIYA 4L00A 3EN4A 4RBLA 3P7CA 4RG0A 5D1JA 2RFNA 4MXZA 2A1AB 2XA4A 3BLHA 4AA4A 4PL4A 4RFYA 3VUKA 3HV6A 4C4JA 4C36A 4DG2E 2C5XA 4PY1A 3OS3A 1CM8A 3QTRA 2X6DA 2CGWA 3UVQA 5EQEA 4D1XA 3L1SA 4BCNA 3NMUF 2NNWB 3DDQA 3LFCA 3OVVA 4W4VA 4LGGA 3WF9A 5ANJA 2OKRA 3ZLSA 3BX5A 2BIYA 4X2GA 2CNVA 1E9HA 4Y83A 2HWPA 4XV9A 3E7OA 4ZTSA 1Q5KA 4ANOA 2CN5A 4G6OA 4QP6A 2XYUA 5C01A 1MRVA 2VWVA 4EHGA 3M42A 4GMYA 2J0MB 3ZRMA 3E62A 3LFAA 2VO3A 5L4QA 4F0FA 3FXXA 3L9PA 1RJBA 3ZS5A 4YUQA 2RKUA 4QMWA 4CLJA 5E8WA 4P90A 1PJKA 4II5A 5A6OA 2QR7A 4A9SA 4B4LA 5HLPA 2XKDA 5C4LA 2PWLA 3FI2A 3LE6A 2OGVA 4LOQA 3FZTA 5L2TA 1PXKA 2FB8A 3O2MA 5BMSA 3QQGA 3BYSA 2WTDA 5CQWA 4MYGA 2WNTA 4FKJA 3QQFA 3RAIA 4C37A 3GU4A 5CF4A 5AIRA 4DEIA 2HZIA 1OL2A 2C0TA 4BIEA 1H01A 4HCVA 3RHXA 4CQEA 5ITAA 3EYGA 3OY3A 2X39A 4KBAA 4FIFA 2QR8A 4X2JA 4UX9A 2J0JA 2G2FA 3TTJA 4BCPA 3UE4A 4A9UA 1YDRE 3VW6A 3FZPA 3R7OA 4USEA 4A4OA 2PE2A 3MH2A 4FSZA 4GUBA 2QODA 2ITNA 4JNWA 1J1BA 1R39A 3LFQA 3FMKA 4O6EA 3NUSA 4IVCA 5EW9A 3PZEA 5BNJA 5EQYA 4J53A 4M0ZA 5FBOA 1B6CB 4RIXB 4FYOA 3HRBA 4G3CA 1PHKA 5IH4A 2UW4A 4AGCA 2A19B 4L8MA 2GMXA 1V1KA 1SVEA 2C5VA 3VVHA 4RWIA 2R0UA 3BBTB 4KINA 4G9RA 3A8WA 2RFDA 4MXCA 3ZSGA 4YTCA 3KRJA 3CQUA 4E5AX 4XG7A 3PA3A 3LQ3A 4YO4A 4HPUE 3R0TA 1J1CA 1P4OA 2O8YA 3PLSA 1YOLA 2ETKA 1XH9A 3DAEA 3E87A 3ALOA 3MH3A 4FZAB 5F1ZA 5I9YA 3M2WA 3R21A 5H8GA 1PXJA 3TJCA 4O6LA 2BCJA 3IQ7A 3O8UA 4D0WA 2PSQA 2ONLC 4ZY4A 2CMWA 1DM2A 5KZIA 1OIYA 2QNJA 3ODYX 4EQMA 4D1SA 2H8HA 1IR3A 3D9VA 3TIZA 3LHJA 4G3DA 4FA2A 4CFMA 1BLXA 2CLQA 4NM3A 5AP0A 2XNBA 4FT7A 1WBVA 2UVZA 3ROYA 3VQHA 4NFMA 4LL5A 3EIDA 1O6KA 3COMA 2EB2A 4D2VA 2NP8A 2Q0BA 5EQPA 2OICA 4GIHA 4XHKB 2VTIA 3KRLA 2C4GA 3CE3A 5AV4A 4FK6A 5G1XA 4D9TA 4H1JA 3P9JA 2WOUA 2WELA 3FI4A 3PXFA 4E5BA 2CKPA 5CVFA 2ZV8A 4RPVA 5FTQA 4JDHA 2FSMX 2JIVA 4FOBA 3T3UA 4F7JA 4FR4A 4IB1A 4I41A 5C8MA 1JBPE 5IA2A 5J1VA 3KQ7A 4O7LA 2PZRA 5IQDA 2QC6A 1GZOA 2C0IA 3GCQA 4USFA 5C26A 4E6AA 3GFEA 1UU8A 2R3QA 4NYEA 1Q62A 4E73A 3BLRA 4CG8A 2OJGA 1XR1A 2ZV7A 4GT5A 3WOWA 3U6HA 2R5TA 4PPCA 5E8ZA 4WOVA 5K5NA 5IQIA 4KIKA 4JX3A 2JBOA 3PTGA 4ZTNA 4C3RA 4C3PA 3SGCA 4ZMEA 3VBWA 3LCDA 5M57A 3UZTA 3UDBA 4FZ6A 1GZKA 5HKMA 2YM7A 5KMNA 4WBBB 4L46A 5EYDA 1OKWA 3FZSA 4ARKA 5IPJA 2BDFA 3QZFA 5EHOA 1W7HA 4GK4A 5L2QA 3UG1A 4DFZE 4UMQA 4C4HA 3OC1A 1UKHA 2QO2A 4OBOA 2QI8A 2HXQA 5TO8A 4K33A 3L8XA 3K5UA 4RIYB 4UY9A 4EYJA 3JYAA 3UIMA 2H96A 3CR0A 3LFSA 4XUFA 2YCSA 4Y5HA 4AZTA 4CD0A 3KN5A 4O0RA 2WQMA 3WZEA 5AP7A 4DGMA 3PJ1A 5HI2A 1QL6A 3UMWA 4AS0A 4RWJA 4EKKA 2EXMA 2ZYBA 3F82A 1HOWA 2BRMA 3HYHA 3MB7A 4GIIA 2Z2WA 3R22A 5FUTA 3OTVA 4ZTLA 2HZ0A 2VNWA 3VNTA 2WTCA 1FQ1B 2E9PA 3GQIA 4MXAA 4ENXA 5A4EA 5A4LA 2GPHA 3RCDA 2E2BA 4UMTA 4GW8A 2W5BA 2XKCA 2W1FA 2CGVA 1K3AA 3PSCA 4L7SA 2JKOA 3U9CA 3UGCA 4S34A 4IC7A 1AGWA 2V22A 1ZOHA 2H9VA 3ANRA 4AGDA 5HNIX 2J50A 2GHGA 3F3UA 4FMQA 5CU0A 3AD4A 2R3FA 2VGOA 3FJQE 3KXMA 4IM2A 3G6HA 3QKLA 4XMOA 5IQFA 1KE8A 3NUUA 4ZTRA 2GNLA 2YM3A 2UZUE 3BE9A 2OZOA 1R0PA 4GK2A 3RINA 4I24A 4BCGA 3ZM9A 1OIRA 3BKBA 4FGRA 1KE9A 5HNGA 2OJIA 4MEDA 1YW2A 2WU7A 3KCKA 3MPTA 1JVPP 4FIEA 4IAIA 3WIKA 5KMIA 3A7GA 4Y72A 3OXIA 3EHAA 3O50A 1YVJA 4CXAA 2W05A 3FC2A 2OG8A 5LOHA 3HECA 1FVRA 3SG8A 5IA3A 4P2KA 3KREA 4O0WA 3OW3A 4EH4A 3W8QA 5TT7A 3QD3A 1QPJA 4ZEGA 2QHMA 3OY1A 3LCSA 3N9XA 3I81A 3Q53A 4I4EA 4V01A 3U87A 3U54A 2W5HA 3RPSA 2KULA 2C68A 3BCEA 4F9CA 1VZOA 2PL0A 5HLWA 1YXXA 4I22A 5DT3A 2O63A 3PWDA 2JKMA 4OT6A 3VO3A 3SRVA 2CKQA 3FUPA 3BGPA 1Q4LA 3Q4UA 3VUDA 3BWJA 2WKMA 3CEKA 5J5SA 4I4FA 5HU9A 3SW7A 4FG8A 2IPXA 2YLFA 2F7ZE 3WILA 2WMRA 3DXNA 5T6KA 3LFBA 5AP1A 2WPAA 4WBOA 4J71A 2PMOX 2XK7A 1XWSA 3KRRA 3M11A 2VO7A 2G15A 2WGJA 1ZMVA 2ZMCA 3MSSA 4OT5A 3BU5A 3EQRA 4HGSA 5M08A 3F2NA 4NTTA 2VWIA 2XK3A 2R3OA 5ACKA 2JKKA 4I5CA 1XHAA 4C0TA 1QPDA 3IOKA 3UIXA 3SW4A 3W2CA 5AR5A 5E8YA 1A06A 3EQDA 3PVWA 2X6EA 5AV2A 1GAGA 4DG0E 3H0ZA 3CGFA 3KF4A 2OZAA 1OB3A 3TEIA 4IH8A 5AA9A 3TT0A 2C6MA 3WI6A 4CFFA 3UPZA 3ORPA 3AOXA 4KAOA 3NAXA 4HYIA 3A7FA 2JDSA 2NO3A 3FQEA 3WZUA 4X3FA 3CD8A 4Z3VA 4DLJA 4JBOA 5J9LA 4LOPA 4O7YA 3FY2A 2PMLX 4FX3A 5B2LA 2RGPA 2ITXA 2PVNA 1YOJA 2XRUA 3ORMA 4QRCA 5B2KA 4BCQA 4QP9A 4F70A 1QPEA 2UVXA 3QRKA 3PLAE 2C6IA 4DYMA 4DEHA 2P55A 5AR8A 5IH5A 1SMHA 5H8EA 4WD5A 1TQMA 1ZOEA 5AP3A 4YTIA 3RK9A 5CEIA 3NGAA 4EUTA 3F7ZA 3PVBA 3D94A 3UVRA 4FT0A 2VTAA 3CSVA 1PXLA 3TKIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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