4DM2A

Contribution of disulfide bond toward thermostability in hyperthermostable endocellulase
Total Genus 147
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
147
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
QTPTGIYYEVRGDTIYMINVTSGEETPIHLFGVNWFGFETCNHVVHGLWKRNWEDMLLQIKSLGFNAIRLPFCTESVKPGTQPIGIDYSKNPDLRGLDSLQIMEKIIKKAGDLGIFVLLDYHRIGCTHIEPLWYTEDFSEEDFINTWIEVAKRFGKYWNVIGADLKNEPHSVTSPPAAYTDGTGATWGMGNPATDWNLAAERIGKAILKVAPHWLIFVEGTQFTNPKTDSSYKWGYNAWWGGNLMAVKDYPVNLPKNKLVYSPHVYGPDVYNQPYFGPAKGFPDNLPDIWYHHFGYVKLELGYSVVIGEFGGKYGHGGDPRDVIWQNKLVDWMIENKFCDFFYWSWNPDSGDTGGILQDDWTTIWEDKYNNLKRLMD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords 458aa long hypothetical endo-1,4-beta-glucanase
publication title Contribution of disulfide bond toward thermostability in hyperthermostable endocellulase
rcsb
source organism Pyrococcus horikoshii
total genus 147
structure length 377
sequence length 377
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2012-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dm2A00
1XSIA 2XTKA 3CBWA 3IANA 1C7SA 3VUPA 1AQMA 2B31A 1XH0A 1HKKA 4HMDA 3VMNA 8CGTA 1E4MM 1E70M 3IJ7A 4IPLA 2WMJA 4OZOA 2V3GA 4MJ2A 5LA1A 4OIFA 1KBBA 5BROA 1KGXA 1NOFA 2W66A 2ZUWA 1WP6A 3K1DA 1JZ7A 4TTGA 1B9ZA 1EHAA 3AI0A 3VIGA 3ZT6A 2YA2A 1LQ0A 2WK2A 1XCXA 1OD0A 3OGRA 4D6CA 4D6DA 4E8CA 4F9DA 3SIMA 2W61A 4WF7A 1UH2A 4B9ZA 3N12A 4UOZA 1QNQA 3WY1A 1UD2A 2VMFA 2WBGA 2XHYA 2J7FA 4PMRA 4PMYA 3T08A 1OINA 4E4PA 1KR0A 3AICA 1ZJAA 3EMZA 1HJXA 4DM1A 4J3VA 1JF5A 1CWYA 5A6MA 3KE0A 1C91A 4L4OA 3WENA 2CBJA 2D20A 1LL4A 4NRSA 1R87A 1KXHA 2CNCA 3NSMA 3BMWA 1BLIA 3WFZA 1W9DM 4MNJA 3PBGA 2WMFA 4H8UA 4DWSC 4XZBA 1W1TA 3WUEA 4Q7NA 3CUGA 3OLDA 3ECQA 4M24A 2VZTA 1IZJA 1ISZA 5BRPA 2GDUA 3HU7A 2BVTA 5BXRA 3VIKA 1UD6A 2WVVB 2YL9A 2WMHA 4W8BA 4PSPA 3UR7A 1JGIA 4LYPA 3CUJA 5A6LA 3GXDA 1OBAA 3SCRA 3WL1A 3RILA 3NSNA 1H09A 3W29A 1MVYA 3IJ9A 4ZXOA 3AZRA 1V0LA 1UR4A 2ZIDA 3WMCA 3POCA 2W91A 2WW5A 3W81A 1EIBA 4JCLA 4PTXA 4AW7A 1VEOA 4FMVA 1D2KA 3VD7A 2D0HA 2WNWA 5AY7A 4F66A 1H11A 2DDXA 1JZ4A 4CD4A 3CMGA 4JZ5A 1C3FA 1EO5A 2J7BA 5I79A 4FLSA 2J8GA 3VM7A 1KBKA 2D24A 3AXXA 3RO8A 3A4WA 1V02A 2WC3A 3WNLA 2XJ7A 4OKDA 2XFRA 3AHXA 7CGTA 2FHBA 1G1YA 3CHFA 3CHEA 3CZJA 1E6RA 4H04A 3TTOA 4UQAA 1W1PA 2G41A 3VIHA 1LWJA 1UWTA 5E70A 4BQ2A 3GDBA 1VEMA 1XSKA 1E4NA 2BHYA 1DWIM 5E09A 1FH7A 4K68A 4BA0A 4P7OA 1FFRA 1U33A 1E4LA 2G4FA 4L4PA 5C70A 3POHA 2BS9A 5EFDA 1E5JA 1QNRA 4CD8A 2Y4SA 2JEPA 4ACZB 4CGTA 3VX0A 1JDDA 4H8HA 1TVNA 4AD1A 1WZLA 3SUTA 4UFMA 2OWCA 1IT0A 3T0DA 4GQRA 4M80A 2ZXDA 2WZIA 4EAMA 3QHOA 1QI3A 4QDMA 3OB8A 1NWUA 1US2A 3SEPA 3TOPA 1DHKA 3WDJA 1BFNA 4MB5A 1W9PA 2ZUVA 4PMZA 3I3EA 1E0XA 1A3HA 2XVLA 3BLPX 1MWOA 1JDAA 1CLXA 1V3KA 2J7DA 1VBUA 3PZOA 1QOXA 3E1F1 3OGSA 1DP0A 1VAHA 4C7GA 1UZ4A 3MSGA 4J3XA 1JYNA 3AMCA 5EMYA 1V0NA 5I2UA 1K9FA 4MADA 1HL8A 3SCPA 5A1AA 1M7XA 1DWGM 3UG5A 2CBIA 3PHAA 2VRJA 2V5CA 3AMGA 4M29A 4NSBA 2QPUA 4AD5A 1B3ZA 4GKLA 4UFIA 4UFJA 2ZXBA 1KXVA 3W27A 2WYSA 2PBGA 5IFTA 2WSPA 4RE2A 1XH1A 3ZOAA 1CPUA 1XD1A 4CCCA 1U30A 1GZJA 3NJ3A 5E9AA 3SUWA 1W3HA 2WXDM 1JNEA 4JKLA 3GNRA 1TFVA 3RDKA 4IPNB 5KZ6A 2DT1A 4MB4A 2CPUA 2UWFA 3BAXA 3RM8A 3ARQA 4ZXLA 1HT6A 2PC8A 4UQDA 2QMKA 2UY4A 1J0KA 1GQKA 1ZBKA 2XFYA 3WBEA 2EPOA 1WO2A 3PZNA 1WDPA 3K4DA 5CPTA 3CHDA 3QGVA 4V28A 5DFAA 4E2OA 4CN4A 2GDVA 2VX7A 4PUEA 1F4HA 3VM5A 4CN1A 3VGEA 2D3LA 3SCQA 4C7DA 4ZE5A 1E40A 5FL0A 2EXOA 3L4WA 5D9NA 1CENA 1CTNA 1V0KA 1CLVA 5M03A 2E9BA 5CZKA 4N42A 2QPSA 2WB5A 4D6IA 1V0MA 2VX5A 1IZKA 3WEZA 1GQIA 3ARXA 4LXFA 2FGLA 2ZUSA 4PMXA 1LL7A 1L8NA 2ZX9A 3BXWA 3WDPP 4X9YA 4CU6A 3AIRA 1R86A 2BXZA 5I77A 5FL1A 5FKYA 2GSJA 3LMYA 1TA3B 2WZEA 4PEEA 4UFHA 2J4GA 1UUQA 1RH9A 2YLLA 2DGAA 1HVXA 3PZTA 4H7VA 3KL5A 3SCUA 2OYMA 1ISVA 3GNPA 4AEFA 1EDQA 1BPLB 1J11A 2E40A 3OLGA 1BYDA 1E6ZA 2CIPA 5BYWA 3DECA 1WAWA 2CITA 1PX4A 2RGLA 1F4AA 4B3LA 2WLZA 2RGMA 4TX8A 3T2QA 2Y8KA 3TONA 3VGDA 4H41A 5CSUA 1V3HA 2VO5A 3WUGA 3W38A 3PZIA 1C93A 1CXLA 3AJ7A 1BVZA 2QMJA 1CXHA 1DWHM 3AMDA 1ZB5A 4OJYA 4UR9A 2FH8A 3BAJA 3AS1A 3VMOA 1CNVA 1E1EA 2DPEA 1W9BM 1M53A 3BSGA 1PPIA 4XB3A 4J27A 4FLOA 2ZWYA 1XH2A 4U5IA 2CXGA 5FD0A 1W9UA 1PIFA 2DQXA 1WZKA 4YHGA 1FH9A 3WF4A 3EMCA 1BHGA 1CEOA 3IAPA 3VD4A 4PYSA 4Z2HA 4MB1A 3EYPA 2QHAA 2PBOA 1UD3A 1CXKA 4J7RA 3BGAA 1C90A 3VD3A 1E6SM 1W3KA 1EH9A 4W7UA 3OLEA 5M5DA 4TUFA 5D4YA 2VZVA 1ODZA 4R5EA 3GBEA 5BXTA 4D6EA 3ZMRA 4J3UA 1QHOA 3QHMA 1V3LA 1EA9C 3WH6A 3LPPA 4UFKA 2BY3A 1PJ9A 2YDSA 1UKQA 3L2MA 5DEZA 5BWFA 3MV11 1CYGA 4KRTA 1LF1A 2A3AA 4GIAA 1JYWA 2VC9A 3QOMA 2XGBA 2YL8A 4D6GA 3VNYA 1B3WA 2W4XA 3MV01 3AXIA 2ZUTA 4HZ8A 1Q6CA 4U5KA 1UKOA 2TAAA 1TMQA 3VGGA 2PWDA 3VX1A 1V3MA 3CIVA 2XUCA 3K4AA 4FLRA 3GH4A 1W32A 1KQYA 2X0YA 1FHLA 2VURA 1HKIA 1ZBCA 3M6DA 2DEPA 3BCFA 5CXPA 3O2LA 1FH8A 2W67A 3GYCA 3AROA 4D72A 3WBAA 5JBEA 2OYKA 4W86A 4GI6A 4QLKA 3N18A 3VOCA 4GINA 2XGIA 2J7GA 3WQWA 3CO4A 3IAQA 5FOOA 5A2BA 1K9DA 5A8NA 4ACYA 2J25A 3MO4A 1JFXA 2GJXA 1TVPA 2O9OA 4P7RA 3UEQA 3IK2A 3RPMA 3WF1A 2Y8VA 4PTVA 3W24A 3WD0A 2JEQA 3WDHA 2EEXA 4NRRA 1GJUA 2NW0A 2E3ZA 1OSEA 2AMGA 3SCSA 4CKQA 1EGZA 1KCLA 2YOCA 1CXFA 3NCOA 1OWQA 3W0KA 4UQBA 4GXPA 4UNIA 2EPLX 3ARYA 3CUFA 4PRWA 2JALA 3DHPA 4EK7A 4H2CA 4Z2KA 3VD9A 3WQ8A 3FNDA 3PZ9A 1NWTA 1UWQA 4DWSA 3MS8A 1UQYA 3W4RA 1AMYA 1O6IA 2VOTA 1MQPA 2CETA 1TCMA 3W37A 1CBGA 3FN9A 3U7VA 2XM1A 1ISWA 2IXUA 3AIQA 1OGSA 1XYFA 2DSKA 1VJZA 3CMJA 3L4YA 1CDGA 4NF7A 1X1NA 1KWGA 3ZT5A 5IHRA 4EKJA 3ZSSA 1HX0A 1CXEA 2DH2A 3I3DA 3OA5A 1PZ3A 2W5FA 3VGFA 4QP0A 3N13A 1U2YA 2NSXA 1PX3A 3N9KA 3IJ8A 1UD8A 5E6ZA 1TR1A 1KR1A 1NM9A 4V27A 1HJQA 1Q4NX 1MW1A 1QI2A 1HJVA 1XHGA 3T2PA 1JYVA 2XYLA 1ITCA 1CGTA 4B16A 1B0IA 4DUWA 4CCEA 4CVUA 3VDHA 1R8LA 4OUEA 2D23A 3GXMA 3TTSA 1WB0A 4LPCA 4IUGA 4PMQA 1C8XA 2EBNA 4DM2A 3N1AA 1UR8A 4AZCA 1HP5A 1UHVA 3S2CA 1ODUA 3THCA 2A3BA 2VCAA 4PBGA 2BNJA 2VQUA 1JI2A 4UFLA 2XVKA 1JZ6A 1JIBA 2E9LA 4YN5A 1GHSA 4PMUA 5A3HA 1PEZA 1WCGA 2ZXAA 2VX6A 3MMDA 2JIWA 2VCBA 3L4VA 1H0IA 4PTMA 1JXJA 1E71M 1W91A 3APGA 3PTMA 3AMKA 4JCMA 4MDPA 5JBFA 4KRUA 5I5RA 3GXIA 4W89A 3A4XA 4CU7A 4MJ4A 1PZ2A 4UCFA 1VFMA 1AQHA 1B3VA 3G6LA 1GVIA 3WDIA 3VPLA 1G01A 2ZUMA 2DSWA 2JF6A 1ZU8A 1EDGA 2X05A 5ABHA 1YHTA 1OGBA 4FK9A 2ZWZA 4JFUA 1K6AA 2XSBA 1UYQA 4DWSD 3WF2A 3HJEA 3PTKA 4UQEA 2J47A 2XWEA 3CPUA 4Z2GA 1JAEA 2WSKA 1J0HA 2BV9A 1HN1A 3LPFA 3BAYA 1EQPA 2PF0A 5F7UA 3WH9A 1K9TA 2IXVA 2XSAA 1AVAA 2WC7A 4P8XA 1VJSA 1BG4A 5JIWA 3GH7A 3SUUA 3W25A 3WF3A 2DSZA 4JKKA 5A2AA 5BRQA 1HJWA 3FW6A 1FFQA 5CQ1A 4AZHA 2X09A 3WH8A 4F8XA 1H1NA 3A6OA 2VZOA 3UETA 5LA2A 3GM8A 1M03A 2J62A 5HXMA 1UWUA 1H4PA 3F5LA 4W84A 3K8MA 3UG4A 1GORA 2DT0A 4JHZA 1B3XA 3J7HA 2Z1SA 4GO9A 4A4AA 4ZE4A 5DT7A 3UR8A 4F79A 3K46A 2VVNA 4AC1X 4M81A 4WKFA 5A6BA 3PZUA 1TZ7A 1ISXA 4WKHA 2VCCA 1J0ZA 1QNSA 3ZR5A 5CG0A 4URIA 4CN6A 1HJSA 3AQUA 4AMCA 4S3KA 1OT2A 4P8UA 1JZ3A 1E0VA 3WNNA 2CBVA 1AQ0A 2QLYA 1B30A 2F8QA 2W63A 4KH2A 3NDZA 3VGHA 4HA1A 5HPCA 2PWFA 1Q6EA 4AWEA 1I1WA 3OZOA 1GHRA 1K9EA 1OIMA 2FH6A 1UA7A 1NARA 1E3XA 4EANA 2J8FA 1XYZA 1QHZA 4U3AA 3VU2A 1J18A 2Z1KA 3WD4A 3S6TA 1D7FA 3KWXA 3NDYA 4MDOA 4TVCA 1ESWA 4XZWA 1MW0A 4HMEA 4D6FA 5DT5A 5FCZA 3CZEA 1C8YA 2A3HA 3WQVA 4MNMA 4KGJA 1VB9A 1H49A 5A2CA 1W3JA 4HOZA 2X2YA 3VIOA 1E55A 3M7SA 1BYCA 1UOKA 4W8LA 1XD0A 1QBAA 4OOUA 3AIWA 1JZ2A 1M01A 3WUFA 2XWDA 4CD6A 2NT0A 4CU8A 1J0JA 4PSRA 2YA0A 1OIFA 5D9OA 2VNCA 3F5KA 2E0PA 1GVYA 2YLAA 2Y2WA 3NIYA 2E9MA 4PCSA 1EDTA 3GXFA 3AYSA 1VFFA 4S3JA 2BVDA 5I23A 4JAWA 1RD6A 3BH4A 3RJYA 4JFWA 3U5UA 2DT3A 2CBUA 2GJXB 3CZGA 3MSDA 2WMKA 3PZQA 3AOFA 4PMNA 4AIUA 1Y7VA 3B9AA 3LPOA 4A3YA 3TP4A 2BHZA 1QI0A 1N82A 1BTCA 1V6VA 3AIVA 1LL6A 4J28A 4NI3A 2YKKA 3FY1A 1WZMA 3I3BA 1UR0A 5A6AA 1HKJA 3OZPA 1ZL1A 3PTQA 4LQ1A 2Q8XA 3MU7A 3W53A 1M04A 3A47A 4HTYA 2ZUUA 3FXYA 2WHMA 1JZ8A 2A3CA 1KGUA 2WVUA 2J7CA 3TTQA 3W82A 2NT1A 1JFHA 2VRKA 4Q22A 4DWSB 2OWWA 1JAKA 2CERA 1VIWA 1NH6A 3KL0A 1LWHA 5CGTA 1CECA 2OYLA 1GOWA 4ZFMA 1E6QM 1C8QA 1MXDA 1PAMA 3AHZA 1OT1A 1P6WA 3VIPA 2PWGA 3B8SA 2F2HA 4ZEPA 1CIUA 1HXJA 1LJYA 1E6XM 1KCKA 4QCFA 5DF0A 3MKKA 4JL1A 2PB1A 2WCSA 3G6MA 3WELA 1ZJBA 3II1A 1HL9A 4UQCA 2EPKX 3TA9A 5CGMA 1CGXA 3VIJA 1KQZA 1W3LA 1UD5A 3VVGA 1R85A 3ZQ9A 1UG6A 4M56A 3ZJ8A 4AISA 2BFGA 1J12A 3RMEA 1UD4A 4R27A 5AYBA 2WZHA 4U2ZA 2JIEA 4QCEA 2ZICA 1EQCA 1A47A 2V38A 5HPOA 3FAWA 1V6XA 3HMCA 4WSJA 1CZ1A 1V6UA 5BCAA 4JIEA 1VEPA 5A8MA 4D6HA 5A95A 2ZOXA 2X8RA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1XSI A;  2XTK A;  3CBW A;  3IAN A;  1C7S A;  3VUP A;  1AQM A;  2B31 A;  1XH0 A;  1HKK A;  4HMD A;  3VMN A;  8CGT A;  1E4M M;  1E70 M;  3IJ7 A;  4IPL A;  2WMJ A;  4OZO A;  2V3G A;  4MJ2 A;  5LA1 A;  4OIF A;  1KBB A;  5BRO A;  1KGX A;  1NOF A;  2W66 A;  2ZUW A;  1WP6 A;  3K1D A;  1JZ7 A;  4TTG A;  1B9Z A;  1EHA A;  3AI0 A;  3VIG A;  3ZT6 A;  2YA2 A;  1LQ0 A;  2WK2 A;  1XCX A;  1OD0 A;  3OGR A;  4D6C A;  4D6D A;  4E8C A;  4F9D A;  3SIM A;  2W61 A;  4WF7 A;  1UH2 A;  4B9Z A;  3N12 A;  4UOZ A;  1QNQ A;  3WY1 A;  1UD2 A;  2VMF A;  2WBG A;  2XHY A;  2J7F A;  4PMR A;  4PMY A;  3T08 A;  1OIN A;  4E4P A;  1KR0 A;  3AIC A;  1ZJA A;  3EMZ A;  1HJX A;  4DM1 A;  4J3V A;  1JF5 A;  1CWY A;  5A6M A;  3KE0 A;  1C91 A;  4L4O A;  3WEN A;  2CBJ A;  2D20 A;  1LL4 A;  4NRS A;  1R87 A;  1KXH A;  2CNC A;  3NSM A;  3BMW A;  1BLI A;  3WFZ A;  1W9D M;  4MNJ A;  3PBG A;  2WMF A;  4H8U A;  4DWS C;  4XZB A;  1W1T A;  3WUE A;  4Q7N A;  3CUG A;  3OLD A;  3ECQ A;  4M24 A;  2VZT A;  1IZJ A;  1ISZ A;  5BRP A;  2GDU A;  3HU7 A;  2BVT A;  5BXR A;  3VIK A;  1UD6 A;  2WVV B;  2YL9 A;  2WMH A;  4W8B A;  4PSP A;  3UR7 A;  1JGI A;  4LYP A;  3CUJ A;  5A6L A;  3GXD A;  1OBA A;  3SCR A;  3WL1 A;  3RIL A;  3NSN A;  1H09 A;  3W29 A;  1MVY A;  3IJ9 A;  4ZXO A;  3AZR A;  1V0L A;  1UR4 A;  2ZID A;  3WMC A;  3POC A;  2W91 A;  2WW5 A;  3W81 A;  1EIB A;  4JCL A;  4PTX A;  4AW7 A;  1VEO A;  4FMV A;  1D2K A;  3VD7 A;  2D0H A;  2WNW A;  5AY7 A;  4F66 A;  1H11 A;  2DDX A;  1JZ4 A;  4CD4 A;  3CMG A;  4JZ5 A;  1C3F A;  1EO5 A;  2J7B A;  5I79 A;  4FLS A;  2J8G A;  3VM7 A;  1KBK A;  2D24 A;  3AXX A;  3RO8 A;  3A4W A;  1V02 A;  2WC3 A;  3WNL A;  2XJ7 A;  4OKD A;  2XFR A;  3AHX A;  7CGT A;  2FHB A;  1G1Y A;  3CHF A;  3CHE A;  3CZJ A;  1E6R A;  4H04 A;  3TTO A;  4UQA A;  1W1P A;  2G41 A;  3VIH A;  1LWJ A;  1UWT A;  5E70 A;  4BQ2 A;  3GDB A;  1VEM A;  1XSK A;  1E4N A;  2BHY A;  1DWI M;  5E09 A;  1FH7 A;  4K68 A;  4BA0 A;  4P7O A;  1FFR A;  1U33 A;  1E4L A;  2G4F A;  4L4P A;  5C70 A;  3POH A;  2BS9 A;  5EFD A;  1E5J A;  1QNR A;  4CD8 A;  2Y4S A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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