The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
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sequence length |
88
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structure length |
88
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Chain Sequence |
PITKEEKQKVIQEFARFPGDTGSTEVQVALLTLRINRLSEHLKVHKKDHHSHRGLLMMVGQRRRLLRYLQREDPERYRALIEKLGIRG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Ribosome/antibiotic
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| molecule keywords |
16S rRNA
|
| publication title |
A structural basis for streptomycin-induced misreading of the genetic code.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
28
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| structure length |
88
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| sequence length |
88
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| O | PF00312 | Ribosomal_S15 | Ribosomal protein S15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | S15/NS1, RNA-binding |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4LF9 O; 1KUQ A; 5IWA O; 1N33 O; 4DV2 O; 1XMQ O; 4OPH A; 4JI6 O; 3SDL A; 4X65 O; 4DR5 O; 5A2Q N; 3J80 N; 4DV7 O; 1IBL O; 1NS1 A; 5BY1 A; 4B3T O; 4DUZ O; 3R66 A; 1FKA O; 2UUC O; 4JV5 O; 4AQY O; 4DV1 O; 2UXD O; 4JI5 O; 4X66 O; 4DV4 O; 4NXM O; 4B3M O; 2UUA O; 1XNQ O; 1YZB A; 2F4V O; 4DR4 O; 2HHH O; 4DV3 O; 1HNW O; 3F5T A; 2E5L O; 4GKK O; 1R1B A; 3M8A A; 5H5N A; 2JRI A; 1N36 O; 2DJV A; 4NXN O; 4LF6 O; 1J5E O; 1XNR O; 4LF8 O; 4K0K O; 1D2D A; 1R6T A; 1HNZ O; 1N34 O; 4DR7 O; 4LF4 O; 5FLX N; 4LF5 O; 4JI3 O; 3RT3 C; 4OX9 O; 4JI1 O; 2ZM6 O; 2Z0A A; 3T1H O; 4JI7 O; 4LF7 O; 2DOS A; 4DR2 O; 3OTO O; 4JI0 O; 4DV5 O; 4DV0 O; 4LFB O; 2VQF O; 2ZKO A; 1IBM O; 4JI4 O; 3O65 A; 1FJG O; 5BR8 O; 1IBK O; 1XMO O; 1A32 A; 5BXZ A; 1XEQ A; 4OPA A; 2UXC O; 4B3R O; 2N74 A; 1AIL A; 5IT9 N; 4B3S O; 1N32 O; 5LL6 Y; 2FKX A; 1FYJ A; 1I94 O; 4KHP O; 2UXB O; 4DR3 O; 1HNX O; 2UU9 O; 4JI2 O; 4YY3 O; 3T1Y O; 1G1X B; 4DR1 O; 3JAM N; 4DV6 O; 3J81 N; 2AGA A; 4LFA O; 1X59 A; 2UUB O; 3J7A U; 4A5U B; 4LFC O; 2VQE O; 5LMN O; 4JI8 O; 4GKJ O; 4JYA O; 4DR6 O; 5LMU O; 4YHH O; 1HR0 O; 2LW7 A; 4X62 O; 4DUY O; 1AB3 A; 1DK1 A; 4X64 O; 1F7Y A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3A0H Z; 1ENV A; 3BEH A; 4PA7 A; 3SPH A; 3MD0 A; 4TV9 B; 1OZ0 A; 2GHY A; 1KYO F; 1WN7 A; 5LA6 B; 3ZMU A; 4UCU A; 2PF4 E; 3JAR A; 3LUT B; 4WCE V; 5BY1 A; 3T4D A; 1N0J A; 5E1A C; 4WFF A; 4JI7 B; 3T1H B; 3FB6 C; 3WB2 A; 1XL4 A; 2JJ2 G; 4ZI7 B; 5IYD O; 5L3F A; 2F4V O; 4MVQ A; 3DGE A; 3ZBH A; 2CTR A; 4WFG A; 3LNM B; 2DJV A; 3H1I H; 2OWO A; 4B7E A; 4PDR A; 1JA8 A; 3HKD B; 4K0K O; 1KU9 A; 1AI7 A; 3A2F A; 1BQZ A; 4LF5 O; 2DQ0 A; 4JI3 O; 3ZHT A; 1SC5 B; 3JAT B; 4UVC A; 4WBN A; 1XEQ A; 1BZK A; 3A0R A; 1QLE B; 3BA8 A; 3NXS A; 3E35 A; 4F6R B; 2YI8 A; 4DRX B; 1K33 A; 1Y74 A; 1IXM A; 2FYU H; 3IAY A; 5EC2 C; 5FPO A; 3TXQ A; 5JH7 A; 4DR3 O; 1YF2 A; 4JI2 O; 5L3C A; 2EBO A; 3ABT A; 3W7S A; 4J7Z A; 3ZN0 A; 1KEC A; 1B3Q A; 2Q0O C; 4UCS A; 2A79 B; 2UUA B; 1XNQ B; 3JAL A; 2LW7 A; 4R7C A; 3HB3 B; 4DXW A; 2WLK A; 1Y4M A; 2W0F C; 3UKM A; 1F7Y A; 1WB8 A; 3CRR A; 3ETE A; 3I56 V; 4HAM A; 1KBH A; 1N34 B; 3UT5 A; 2EJR A; 3CC2 V; 2XAJ A; 4GZR B; 3L75 H; 2UXD O; 4F6E A; 2P6J A; 3U10 A; 4YJ3 A; 3P32 A; 1D5A A; 1ZWI C; 3B40 A; 3ASO B; 2BOC C; 1NTK H; 1HNW O; 2X7R B; 1MZE A; 1JX9 A; 1OJH A; 1M57 B; 4LF6 O; 3CJH A; 1NH2 D; 3ZRW A; 1FXH A; 1XOU A; 3AG4 B; 4LBE C; 4RQE A; 4QPK A; 5CA0 A; 1TUE B; 5FLX N; 4DR6 B; 1T5E A; 1W0J G; 4MVU A; 4D7T A; 2CE4 A; 3RYC B; 2GUZ B; 4X64 B; 2ZKO A; 3W7T A; 2JGD B; 1HWY A; 2LP7 A; 3ABM B; 3SYA A; 3OUS A; 3ETQ A; 1E79 G; 2WLL A; 2OT5 A; 1QLN A; 1DLB A; 4X88 A; 1BHB A; 5H6Q A; 1Y6X A; 1I94 O; 3E8G A; 4YY3 O; 2QKA A; 1M56 B; 1XUQ A; 3L9D A; 4I0X A; 4O4J B; 5KUK A; 3J81 N; 4RAI A; 4KUM A; 4I4T B; 1K97 A; 2P5O A; 3UM7 A; 5L3D A; 3TGU H; 4U3F H; 1URF A; 4XDK A; 5K1P A; 1NZ6 A; 1SQV H; 2YC0 A; 4O4L A; 4IGG A; 2QE7 G; 4BWA A; 2YSU B; 3PJS K; 5J2T B; 3BVO A; 3SYO A; 4DW1 A; 3OGI B; 2QJ1 A; 2R70 A; 1J5E B; 3DC6 A; 4HNA A; 4PA6 A; 1XL6 A; 1MSD A; 1BCC H; 4TV9 A; 1U97 A; 3CWB H; 4AI8 A; 3ASN C; 4R50 A; 1JQ0 A; 4B3T O; 4DUZ O; 3FB8 C; 3E22 B; 2WLJ A; 4CS2 A; 3CCR V; 3OTO B; 4AQY O; 1YEW A; 2EIM C; 1FJG B; 4FZ0 A; 1H2L A; 2Y69 B; 1JOY A; 2OIE A; 4ZI7 A; 2JDI G; 5LP6 B; 2HHH O; 5LGU A; 1QU7 A; 4NTW A; 1R1B A; 1FFX A; 2ZNJ A; 1H2G A; 1N36 O; 1MMM A; 1V54 B; 5KAF Z; 3K03 A; 1GN2 A; 2YIB D; 2IJK A; 1RP3 B; 4ZOL A; 1EFR G; 1M9N A; 3VQV A; 3TCU A; 5EBL C; 5CMU A; 2MK3 A; 2YXH A; 5FNV B; 1EZV H; 4UUJ C; 1M1K W; 5IY5 C; 5IJ0 B; 2XTA A; 1US6 A; 1KP3 A; 5BR8 O; 2EIJ B; 4Q6G A; 3CCM V; 4OPA A; 5LXT A; 3M99 B; 2LFS A; 5JVD A; 2Y48 A; 1VQ7 V; 2CTP A; 1Z5W A; 4H44 B; 5EZY A; 2RMK B; 1SQP H; 3Q4H B; 1K8A W; 2XND G; 3OFN G; 5E79 Z; 4FFB A; 5CBF A; 1KKD A; 1YJ9 V; 2UUB O; 1HP8 A; 1YJW V; 3GVM A; 2ITD C; 5KMG A; 2V1D A; 1SKV A; 4EB6 B; 3N2K A; 4NXM B; 4GKJ O; 4B3M B; 3JAS A; 2HKO A; 3FYI B; 1S0V A; 3RYF A; 5GW7 A; 1R73 A; 2YIB A; 2UXX A; 2VWK A; 1OCC C; 3UO2 A; 1VQ5 V; 2WWW A; 4GX5 A; 5HFL A; 1S5J A; 5JCO A; 1BL8 A; 1Q81 W; 1IBL O; 1HNZ B; 3QVN A; 2ZQM A; 2DWE C; 4FMT A; 4NTY A; 3H1H H; 1VF6 A; 1D5N A; 2ZM6 B; 5LYJ B; 2RCV A; 3L71 H; 2P4K A; 4LFB B; 4DW0 A; 4ZIB A; 5BZB A; 4FM2 A; 4I9Q A; 3CHX A; 1GTO A; 1SZX A; 2Q67 A; 3ABK C; 2P22 C; 5GTH Z; 4B3S B; 1M4U A; 2E5L O; 1N32 B; 3QO7 A; 4H13 B; 3AG2 C; 2Y4U A; 3SYQ A; 1QNM A; 1N0N A; 1IVS A; 2IU3 A; 1Y67 A; 3JAK B; 3K0G A; 3HKC B; 3OGC C; 4YHH B; 4GCZ A; 4DR2 O; 2LGQ A; 4DV5 O; 2F95 B; 2VQF O; 3SPI A; 2Y0I A; 1XMO O; 2YS8 A; 4JYC A; 2EIK C; 4UB6 Z; 2A3Q A; 4E4E A; 5KHI A; 2CGO A; 1TVK B; 3CCE V; 3ZX6 A; 1K3E A; 3VBB A; 3K0D A; 1NKD A; 3CCU V; 4KHP O; 2QTS A; 4GYC B; 2ITC C; 4L8J A; 3K5O A; 3GB7 C; 3FAV B; 4LFC O; 3SGI A; 3H01 A; 3ZED A; 1SZT A; 1QHT A; 1F4N A; 1R3L C; 4R8C A; 1XHZ A; 3KG2 A; 2O57 A; 3RVY A; 4AHC A; 3KKY A; 5CBH A; 1S5L Z; 4MT8 A; 2ZE7 A; 4LF9 O; 1LUV A; 2Z3Y A; 1Z5V A; 2QM7 A; 4UV8 A; 4LF8 B; 3HKE B; 2AW9 A; 4CH5 A; 4LNU B; 3QG5 A; 1NJI W; 1S5H C; 4LF4 B; 1K4D C; 4IHJ B; 3F5W C; 5LGN A; 3RW0 A; 2X6C A; 1ZL8 A; 3CYO A; 3T1C A; 1E1Q G; 3DSQ A; 3MHS C; 4X66 O; 2OCC B; 4DV4 O; 3G6E V; 3CEI A; 3OR6 C; 3OT7 A; 4NYK A; 3FX7 A; 1WP8 A; 1NTZ H; 2XAF A; 1VMG A; 5LOV A; 2AZ2 A; 3JD0 A; 4F4L A; 3SJB C; 3OW2 U; 3H1K H; 4TV8 B; 2Y4T A; 3E8F A; 4QIW F; 1VQ8 V; 4JAS A; 2ZNI A; 2HR3 A; 3DC5 A; 1YIT V; 4EKW A; 2Z0A A; 4X62 B; 4MTO A; 3TK1 A; 1WAZ A; 1JVM A; 1QLE C; 1PL0 A; 4PV1 B; 4XBF A; 5TIS Z; 5IJ0 A; 3EXA A; 4B3R O; 5KUM A; 1SQB H; 4UVB A; 4O2B B; 4X20 B; 2JJ1 G; 1WA8 B; 2WAM A; 3E86 A; 3QTC A; 4FK5 C; 4FLZ A; 1G1X B; 3RYH B; 4X1Y A; 4J7J A; 3Q4H A; 4JAA A; 3BPZ A; 4JTC B; 3GWK C; 2L6L A; 5LMN O; 3I55 V; 2ADP A; 5LGT A; 2IBZ H; 1N4C A; 3THO A; 2WA4 A; 5JCO C; 1K73 W; 5B1A C; 3JSL A; 4DYL A; 1RM1 C; 2JK5 C; 4GX2 A; 3MDS A; 4XDJ A; 1VF6 C; 5BMV B; 2A0L A; 3VQW A; 1KUQ A; 1MSW D; 4Q20 A; 4DV7 O; 3CC7 V; 4N21 A; 1LR1 A; 3T4Z A; 4OX9 B; 2LFR A; 5JQG A; 2UUC O; 4IT5 A; 2P06 A; 2L35 A; 4JI5 O; 4DV0 B; 4GKJ B; 2IM9 A; 3ASO C; 5DM6 V; 2P67 A; 3MAQ A; 1Q8I A; 2Q8V A; 1M57 C; 1YZB A; 5B3S B; 2IJI A; 2XAQ A; 5KHK A; 3R65 A; 2C2A A; 2E76 B; 3AG4 C; 3N27 A; 2CH7 A; 4BR6 A; 4MS2 A; 3ABL C; 4HZ3 A; 1HNX B; 1OCZ B; 3T1Y B; 4D7S A; 5KA5 A; 4B7K A; 4QJF B; 1G6U A; 3LNN A; 4LFA B; 2XUM A; 1V55 B; 3CCJ V; 4FLW A; 4JYA B; 1QCE A; 4X1K B; 2YEV B; 2ZD9 A; 4TUY B; 4JI1 O; 2EIL C; 1KB9 F; 3UQ8 A; 4YIP A; 3ABM C; 5EK0 A; 1GM7 A; 3B77 A; 2KQX A; 1FXK A; 2BE3 A; 5EIB D; 4RO2 A; 4BIU A; 1XRE A; 4I5S A; 4WFH A; 2P90 A; 2UXB O; 3L72 H; 1VQN V; 5LBQ A; 1Q5O A; 3JAM N; 1Z2G A; 3B8N A; 4PD4 F; 3CCL V; 5KX5 B; 3J7A U; 3X2Q B; 5IJ9 A; 3I5D A; 3QF7 A; 5LMU O; 4RUE A; 2XT9 A; 4QGP A; 5LHH A; 4JZ2 A; 4DR2 B; 2PTM A; 3F7V C; 5KHG A; 2F43 G; 2AHZ A; 1NR7 A; 1B6Q A; 1H2N A; 3ABU A; 4LP8 A; 1B04 A; 3SJA C; 4X1I A; 4X65 O; 4TSF G; 3FD9 A; 2ZXW B; 1ROP A; 2DWD C; 2ZCE A; 2IU0 A; 3CRA A; 5ITZ B; 3K59 A; 1EM1 A; 3ZHQ A; 1W2B U; 1Y76 B; 4LNU A; 3WB1 A; 2Y69 C; 2JEU A; 3TET A; 5D5P A; 1OCO B; 3APQ A; 4IHJ A; 1ARO P; 4E2L A; 1AP6 A; 4JI0 B; 4DV1 O; 5LP6 C; 1K9M W; 4JV5 O; 4OGQ B; 3NR7 A; 4JI4 B; 3CCS V; 1VAR A; 2ARH A; 2DQ3 A; 1V54 C; 2Q7G A; 2H3O A; 3K9S A; 1KD1 W; 3C90 A; 1P84 F; 2QM4 A; 2WLI B; 1CXZ B; 3JAW B; 2V4D A; 4CH3 A; 1I5X A; 5EYP B; 2H8P C; 4NXN O; 1W0K G; 4WF9 V; 4O2A A; 1R6T A; 1WLE A; 1SA0 B; 3RGB A; 4TV8 A; 1F51 A; 2B9Z A; 3OE7 G; 1K4C C; 4LF7 O; 3JSN A; 2ZIO A; 3OMA B; 2HP8 A; 1F4M A; 2WLM A; 2B5U A; 4RWU A; 2XOK G; 4X66 B; 3DXR A; 4W4L A; 5IWA B; 5EC1 C; 4DV2 B; 5JJJ B; 3AK1 A; 1R3J C; 4FLY A; 2QSA A; 1S76 D; 1G8M A; 2F93 B; 1RSO B; 2XAG A; 3H1L H; 5CA3 A; 4X20 A; 2UU9 O; 2BCC H; 4NVP A; 1WJZ A; 3CC4 V; 1WPX A; 3CS5 A; 3CME V; 2JS5 A; 1EN4 A; 5J2U B; 4LWS A; 3U0Z A; 4HBN A; 1PNL A; 1P7G A; 4DV3 B; 4I9W A; 2ZIN A; 2X0L A; 3B09 A; 1VP7 A; 3W7U A; 4LH7 A; 4NR1 A; 4U3J A; 1N33 O; 1R3K C; 2KG7 A; 3KCY A; 3SDL A; 1Q43 A; 3WG7 C; 2PYJ A; 4EEQ A; 3FB5 C; 4UXN A; 3ZCC A; 2Q69 A; 5GON A; 2FL4 A; 4ZKI A; 3WU2 Z; 4IIJ B; 4BAY A; 4U7N A; 1PKX A; 2QM8 A; 2A06 H; 2UXC B; 5B1O A; 4MW8 A; 1XDC A; 2PUS A; 3E8H A; 4NKG B; 1MA1 A; 5LA6 A; 2FML A; 4UCV A; 4ZBM A; 1H8E G; 2LGW A; 1Q90 D; 2VQE B; 4JI8 B; 1FXK C; 4DR7 O; 1MZF A; 5C8Y B; 4KL1 A; 1HR0 B; 4X1K A; 1P4R A; 4TUY A; 1NBM G; 1J95 A; 2DE0 X; 1VQP V; 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3LSU A; 1BT8 A; 4FFK A; 1GAX A; 4U7O A; 1H2S B; 3ZRS A; 3RBZ A; 3QO5 A; 1AJP A; 2WSS G; 3JAR B; 2DYS C; 2AGA A; 3ZMT A; 2UXD B; 4CC6 A; 4CC5 A; 3RYC A; 5CBG A; 1YVW A; 1BSM A; 4LF7 B; 1DF4 A; 2GUZ A; 1WB7 A; 2JGD A; 5J2U A; 3ASN B; 3ML0 A; 1AB3 A; 1HNW B; 1N8R W; 2OTL V; 3CP1 A; 1MG1 A; 3BA9 A; 4LF6 B; 5CN0 A; 4MVM A; 2Q5Z A; 1JPX A; 2EIM B; 1L0N H; 3BHP A; 3TJT A; 4O4J A; 3MHH C; 3ZMZ A; 2IW5 A; 1I7F A; 4I4T A; 3D3Q A; 3G67 A; 2OYQ A; 4NB5 A; 5JWP A; 4H37 A; 2HEP A; 2UUA O; 1XNQ O; 4FLU A; 1BQ0 A; 1OCZ C; 1YIJ V; 4DR4 O; 4IIJ A; 5J2T A; 4WBN B; 2K1E A; 2QR4 A; 2HVK C; 1DGS A; 3A8T A; 4PDL A; 1I94 B; 4ABM A; 1SQG A; 4FLV A; 4YY3 B; 5IY5 B; 2W6J G; 2HG5 C; 1BHA A; 2HVJ C; 5IYC O; 2WLN A; 3ZMV A; 1N34 O; 3E22 A; 3STZ C; 3SPG A; 4JAV A; 3RT3 C; 4BIO A; 2HFE C; 2Q4P A; 3LDD A; 4JZG A; 5C8Y A; 3D36 C; 1AR5 A; 3JAL B; 3OEE G; 5LP6 A; 1A32 A; 3N2G B; 3JD4 A; 4CS3 A; 5LHI A; 1KQS U; 2R9I A; 3ZHV A; 2N74 A; 2IJJ A; 1H2K A; 2YI9 A; 1AIL A; 3U11 A; 2YXL A; 5LL6 Y; 2CDY A; 2LJ2 A; 4B3T B; 4DUZ B; 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