4E7KA

Pfv integrase target capture complex (tcc-mn), freeze-trapped prior to strand transfer, at 3.0 a resolution
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
366
structure length
366
Chain Sequence
DAELDQLLQGHYIKGYPKQYTYFLEDGKVKVSRPEGVKIIPPQSDRQKIVLQAHNLAHTGREATLLKIANLYWWPNMRKDVVKQLGRCQQCLITNASNKASGPILRPDRPQKPFDKFFIDYIGPLPPSQGYLYVLVVVDGMTGFTWLYPTKAPSTSATVKSLNVLTSIAIPKVIHSDQGAAFTSSTFAEWAKERGIHLEFSTPYHPQSSGKVERKNSDIKRLLTKLLVGRPTKWYDLLPVVQLALNNTYSPVLKYTPHQLLFGIDSNTPFANQDTLDLTREEELSLLQEIRTSLYHPSTPPASSRSWSPVVGQLVQERVARPASLRPRWHKPSTVLKVLNPRTVVILDHLGNNRTVSIDNLKPTSH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Recombination/dna
molecule keywords Pro-Pol polyprotein
publication title 3'-Processing and strand transfer catalysed by retroviral integrase in crystallo.
pubmed doi rcsb
source organism Human spumaretrovirus
total genus 96
structure length 366
sequence length 366
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.7.49: RNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date 2012-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00665 rve Integrase core domain
A PF17921 Integrase_H2C2 Integrase zinc binding domain
A PF18103 SH3_11 Retroviral integrase C-terminal SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.2300 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 4e7kA04
1.10.340.70 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Endonuclease III; domain 1 Endonuclease III; domain 1 4e7kA01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 4e7kA02
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4e7kA03
4DSIA 1LAWA 4IG3A 3OJSA 4BACA 4QOZB 4II1A 4W5RA 1WAJA 1I39A 2KFNA 3M9QA 5SWMA 4M3TA 2HNZA 4ICLA 4CGHA 1SL1A 2OPSA 1ASUA 2ZD1A 3SQ2A 3VQ5A 2D0CA 2IG0A 4QW2A 1VK0A 3JSMA 2X4XA 2MWOA 3HT3A 2G8FA 4ELVA 4FJLA 4FZZA 4FLWA 4LSLA 4CEZA 4M42A 2X74A 4Z4EA 2R57A 1WJQA 3L3UA 1RT1A 3OYFA 2QKKA 4ID5A 1VSIA 3DRRA 4B8AB 4DTJA 4B9UA 1VRTA 1WSIA 1WSJA 4CJKA 5HRRA 4DU4A 4OLAA 4FCYA 2RPIA 1DLOA 2AJQA 1WAFA 1JLAA 1J9AA 1U45A 3OYBA 4YFUA 3RR7A 2EX3A 5KE2A 3LAKA 2O4XA 5KGXA 1NJYA 5CYQA 4B9TA 5HRPA 3L2WA 3DLRA 4FJ7A 1ASVA 4CGFA 2PY5A 1FXXA 2JZ2A 4B9VA 4OGCA 4HHTA 4BWMA 2BKDN 4BDYA 2Z1IA 1HYVA 3VQBA 3P83D 4CHZA 1RT3A 2FBTA 3OQ5A 4DTMA 3ZT4A 4FLZA 1QSYA 4EZ9A 3DLKA 3PUFA 3ITHA 5HLFA 1VSDA 2D0AA 3VA3A 4OVAA 1LV5A 4UQGA 1GOCA 4JRQA 1S6QA 4NZGA 2G8UA 1RTJA 1HYSA 4RG2A 1NKBA 4KHNA 3DMJA 4CIEA 3ZEHA 4CEDA 4E7KA 1VSHA 2A1RA 3V1QA 3AA4A 3V6DA 1IKXA 1CZ9A 1XHZA 1RT6A 4IFYA 1W9HA 2HQXA 4FK4A 2RJCA 4IUUA 1KHCA 4IG0A 5EU7A 1T05A 4CF2A 1LW0A 1SL2A 4FJGA 1Y97A 4WE1A 3OS0A 4C8OA 2OPRA 3KKSA 4FZYA 1RBUA 2G8HA 3ZT0A 4O55A 3S9HA 1RTIA 4NCBA 1A5VA 3MP8A 1JLFA 3QJ6A 3NTIA 1VRUA 2HB5A 1C0TA 3QEWA 1D5AA 3IG1A 1WNSA 4N76A 3SUPA 3MECA 2X6NA 5JS1A 2RN2A 1S6PA 1FK9A 3HL8A 1T7PA 1REVA 3A2FA 4KPYA 3AO1A 2VYTA 3KK1A 3KLGA 4IUPA 1RI0A 1EKEA 4KO0A 1IKWA 3ZSQA 4FW2A 4BWJA 2X6SA 3DM2A 3RRGA 4OGEA 3M8RA 3RWUA 3OYJA 1XC9A 3KLEA 1IG9A 3L3VA 4AILC 3H8ZA 4FJNA 4B9SA 4OKJA 4O44A 3PX0A 1NK8A 4B9NA 1T8EA 3NH2A 4BE2A 4IFVA 4CJ3A 3RTVA 3KKRA 3O3GA 3DB3A 4OVLA 5D6YA 3M8QA 2DTUA 4EP5A 1TKDA 4K8XA 4CGJA 1CXUA 1BI4B 4IUQA 4CJTA 1C1CA 1ASWA 4PUOA 4E0DA 4CF1A 4C5IA 4HUEA 2HVHA 1JL2A 4DQRA 1N27A 1B92A 4J2DA 1YTUA 2G8VA 2E5QA 4B08A 3QNOA 1X1PA 1WSHA 4B9LA 3NGZA 3OMGA 4FJXA 3WNFA 2HNYA 4CHPA 1LWEA 2XO7A 5FDLA 1LAVA 2M16A 1ZBLA 4DLGA 3OYEA 4M3ZA 3MAQA 3V81A 2OYQA 3TI0A 3NHGA 2YHAA 4FJKA 4ID1A 1IO2A 3VN5A 2W42A 3HXMA 1BHLA 2XY7A 2R5MA 1K6YA 2PQWA 1IH7A 2D5RA 4DTRA 5J2QA 2KW4A 4CHYA 4HTUA 4FXDA 2HMIA 2HHQA 4UC4A 2FHDA 3AVGA 4M3RA 4CESA 4DF8A 1D9FA 4BDZA 1NK4A 1KFSA 3HPHA 2RHZA 3NE6A 1CXQA 1I3AA 2BIVA 3K5OA 1TKZA 3OYLA 3OVNA 3DOKA 3PX6A 3LP0A 3AVJA 1C6VA 1VSLA 2X4WA 4FLYA 4KHSA 1LW2A 1CLQA 5HP1A 3K5NA 2E6LA 1JLBA 3S3MA 3KUFA 4IUTA 4A4HA 3WNGA 3OYNA 1JLQA 3ZT1A 3RRHA 2IC3A 4PY5A 3KK2A 1NJZA 4AHSA 1TK5A 4ELUA 2L89A 2E6MA 4DSLA 4CJ5A 3U6FA 3F70A 3I0SA 1HQUA 1EETA 4LSNA 3KLHA 1KFDA 2LRQA 1WJSA 4Z4IA 4E3SA 1U47A 4F2SA 5C24A 1VSJA 3G0ZA 3DRPA 4E1MA 2Y1JA 2HHXA 1WSFA 3DLHA 2OPPA 4E19A 4FJ8A 1U04A 3B6PA 4I2QA 1FKPA 4DSFA 3DLBA 1J53A 2BE2A 1EXQA 3QEXA 4KTZA 2GV9A 3ZT2A 3NDKA 1N6QA 3AVMA 4AHRA 2RHYA 4L59A 3NGYA 2XY5A 3AVHA 4KTWA 3HK2A 4W5QA 3DLEA 4OLBA 4KI4A 4FW1A 2RI5A 1C0MA 4OPKA 4X34A 4CF9A 3WNHA 3LYIA 1S5JA 1LWFA 3C6UA 5J1EA 3BDPA 3RMBA 3SQ1A 3CFOA 4I2PA 1ZBIA 3QESA 2VWJA 3KJVA 1OZ3A 5M9OA 2LSNA 3VQ4A 2P51A 3HVRA 3LPUA 3V9SA 1QS4A 3IS9A 2F96A 4IURA 3NFAA 3HYFA 4CJQA 3O3FA 4DFPA 2FBVA 4FJ9A 2OPQA 3THVA 3U3GA 4C8NA 3SPZA 4CK2A 4M45A 4DWIA 3AVAA 1ZBFA 4FJIA 1NKEA 4KAZA 5E41A 4E7IA 1XHXA 3ZSZA 3VQPA 3DI6A 3OA6A 2PYLA 3LDSA 5KE3A 2EFIA 3NGIA 1U48A 3HM9A 3NTHA 4DQSA 3JYTA 3LWLA 4PWDA 4FJ5A 1X9WA 3S6WA 1C1BA 1HPZA 3F73A 4N4IA 4DTUA 3MP6A 2Q3SA 3AVKA 3VQ8A 4RG8A 2P5GA 1JLGA 3L2VA 3NAEA 3VQ9A 5I42A 2PZSA 3MXJA 3UT1A 3SJJA 5CZ2A 3ZCMA 4KHUA 4CK1A 1EP4A 4CGDA 1VSMA 4E7HA 3GOXA 1RDCA 2VG6A 2F8TA 3RMCA 2GFUA 1BQMA 4AHUA 1W0HA 5KRSA 1SUQA 2GUIA 2QQRA 3AA3A 2RO0A 4HVJA 1TAQA 5DK5A 2DFEA 3P8HA 4J2AA 4FL6A 4H4OA 1S1TA 1RDAA 4DQIA 4C5GA 1RBVA 2DIGA 4CRIA 3RR8A 5KH6A 2RHIA 3F9KA 2G8KA 1BL3A 3META 3KD1E 4DTPA 2MWPA 3S3OA 3RMDA 3LANA 4Z02A 2RJEA 2ATQA 4O5BA 3TANA 4Z4FA 3PNWC 4Q5WA 2WACA 3AA2A 4CEAA 3CQ8A 1L3UA 2QXFA 2HHWA 3OS1A 1SSFA 3TARA 4CJSA 5C25A 2JLEA 4GMJB 3OYIA 4CJUA 3SQ4A 4ZTFA 3AO2A 4DTSA 4F2RA 4TSXA 3CYMA 4CK3A 3EYZA 5D6XA 2EKOA 1L5UA 1IKVA 4A4EA 4Y1CA 4CIFA 3TABA 1BISA 3KK3A 4KHWA 2PYJA 3MXIA 5HRSA 1QHTA 4KREA 4DU1A 2DIQA 4KB1A 4FLUA 3VQEA 1Q8IA 4B9WA 4CJEA 4DU3A 2RHXA 2E4LA 4CEOA 2VG5A 4RW7A 1TK8A 3QIIA 3UWNA 5KTQA 3OYDA 3B6OA 3FFIA 3P1GA 5T7BA 4H4MA 3LP2A 1HYZA 2P1JA 1ITGA 5FRMA 3C94A 1QQCA 4F8RA 2EQUA 1TL3A 3OYAA 3HPOA 3SD4A 3M8PA 2HW3A 2K3YA 2YRVA 1EX4A 1TV6A 3QIPA 3LP1A 2YNGA 4RW8A 4DQPA 3K57A 4HCCA 1QSSA 1YVUA 4J2EA 2KFZA 2RJFA 3LX7A 3SNNA 3FEOA 5HBMA 3TWHA 3E9FA 1RNHA 1UA1A 4K8ZA 3VQ6A 1NKCA 3EAEA 3C6TA 1VSFA 3OYKA 4JS4A 1GOAA 1B9FA 1CZBA 2B6AA 3MO8A 4FVMA 4Z0UA 3ASKA 5J2PA 3SPYA 4FLTA 4IUVA 2XRIA 4FJMA 2JGUA 2F5KA 4E89A 3PO4A 4EP4A 1T03A 3KTQA 3C4SA 3VQCA 2M0OA 4EZ6A 2Z1JA 4CEFA 3MEVA 1S9EA 4CFBA 1JLEA 1UAXA 4N41A 2G8WA 3L2QA 3NF9A 3DYAA 4DMNA 3PV8A 4L8RB 3HSTB 5J26A 1HNIA 3CM6A 1NK5A 2YNFA 3TAGA 4B9MA 5CIUA 4HCZA 1R0AA 4Z4GA 3VQ7A 4ZTJA 2K3XA 4FZXC 3TAEA 1TAUA 4FYDA 2RJDA 4ZHRA 3UIQA 1TL1A 4CGIA 3QIOA 3L2UA 3IRXA 5IAYA 4DTNA 4RW6A 3IAYA 4LH4A 4C8KA 2IOCA 5DMRA 4DSEA 1S1VA 3QBYA 3AO4A 1JXBA 3ZSYA 1NK6A 2DY4A 5J39A 4QVZA 2YNIA 4AHTA 1NJXA 3NF6A 2KQ2A 1S1XA 3DOLA 2M1HA 4CERA 3MXMA 3SV4A 3LAMA 1Q9XA 4C5HA 3FLGA 1SKRA 3T3FA 4M3UA 2HHTA 5I3UA 1NK7A 2NLUA 4GVMA 5HROA 3ISNC 1NK0A 3MEUA 1WSGA 4PQUA 3NF8A 2A1SA 1VSKA 1TK0A 5KCOA 3E9GA 4E7JA 5FRNA 2FBXA 3SUNA 3NH1A 4GW6A 2YKNA 2ITGA 3AVCA 2B4JA 2HHSA 3EZ5A 2OZSA 1SKWA 3I0RA 3TAMA 4NCAA 1OI1A 3L2RA 1RT5A 4YNQA 3M8SA 2LCCA 2RKIA 3QNNA 3NNQA 3PO5A 3NH0A 4HUGA 3HP9A 1RTHA 2YV0X 4J2BA 5IN1A 5KRTA 1QSLA 3K58A 4AHCA 3S3NA 1WLJA 4OJRA 3LPTA 1WSEA 1U49A 2XDPA 3CFRA 4R5PA 4CJWA 2KTQA 3D45A 2FC0A 1SV5A 1RBSA 2RF2A 4A4FA 2RI2A 4PL6A 1IKYA 2OA8A 4FM1A 2L8DA 1GOBA 3HO1A 5CZ1A 4Y1DA 3H6ZA 3ZT3A 3LWMA 3DLGA 4IBNA 1RT7A 1ZYQA 1HRHA 3T1AA 3K2PA 3DLMA 1J5OA 3MEDA 2IDOA 5J2MA 3AVNA 4IDKA 1O1WA 4MQ3A 3K5LA 1KRPA 4F3OA 4Z4HA 3VA0A 2EHGA 1WGSA 3P5JA 4FJHA 4CEBA 1A5XA 1X9SA 2E6NA 2LDMA 4N47A 3ZSXA 4N56A 4W5OA 3QLHA 3BGRA 3AA5X 2HHVA 2GFAA 4RW9A 1Q9YA 2O4IA 3QERA 2DAQA 4CJFA 4W5NA 2XY8A 3RMAA 4HUFA 1NJWA 4BD3A 2WONA 4OKKA 3O8VA 3OMCA 1WN7A 3OS2A 3OYCA 3ZSVA 4DSKA 2GF7A 4PLLA 4JRPA 1ZBUA 2P0KA 2ZQBA 1SL0A 1QTMA 4CJPA 3KD5E 1YT3A 4DTOA 1MU2A 1U4BA 1C1AA 1NK9A 4E1NA 2I5JA 3SYZA 5CYMA 2EQKA 3SQ0A 3AO3A 4DFKA 3TR8A 2ETJA 1C0UA 3LZJA 3OYHA 3Q1JA 3V9XA 4BE0A 3ASMA 4O0IA 4PLIA 3PY8A 4BE1A 3ME9A 3V9ZA 2X78A 1XNIA 4F4KA 1JKHA 4DLEA 1RBRA 1KLNA 1DTQA 4M3WA 3H08A 2YNHA 2BGGA 4FK0A 3SZ2A 2O4XB 1S1UA 2D9TA 4M41A 1S9GA 2IS3A 1TGOA 4CIGA 4C8LA 4QQGA 3VQDA 1G15A 1KSPA 4B9XA 1BIZA 1OYXA 4IKFA 4M3YA 2GBZA 4CGGA 4NS5A 3QKJA 3CM5A 3OB9A 1L3SA 4CJ4A 3U3YA 1BQNA 3AV9A 3LZIA 3PMTA 2O4GA 3ULDA 3T19A 2F8SA 4KHYA 2D0BA 1JXEA 2LTOA 4LY7A 4XIUA 2XK0A 1RT4A 4FM2A 3FC3A 4DFMA 4A4GA 3V1OA 4NCGA 5C42A 2FBYA 3O4NA 2B8AA 4N4GA 3V9WA 4HCBA 1RTDA 3SV3A 4QQ6A 1NOZA 5C0MA 4DTXA 5KGWA 4KHQA 2KZZA 2HHUA 3QEPA 5KI6A 3C95A 4H8KA 4FM0A 2B5JA 2DFHA 2P5OA 4KKOA 5K14A 2RI3A 4DQQA 1HNVA 4O4GA 2HNDA 2R5AA 1TKXA 1F21A 2JTFA 1Z25A 3AO5A 1H3ZA 3QETA 3LALA 1LWCA 1JL1A 2BDPA 1HQEA 1BIUA 4FU6A 1BCOA 3NF7A 4PA1A 4DFJA 4NYNA 2L3RA 4C5EA 1J54A 3HVTA 3PFSA 4KB0A 4I9QA 3OYMA 1HJRA 3OY9A 1HMVA 3SCXA 1BI4A 4CJVA 4RW4A 3CFPA 4Q5VA 3AVIA 3L8BA 1RDDA 3HJFA 4F3TA 4DF4A 4ELTA 2QK9A 1FKOA 4I7FA 4CFAA 3AVFA 2XY6A 4KI6A 5FROA 4AH9A 1RBTA 2NUBA 2X4YA 2YKMA 1G5VA 3I8DA 4CFCA 2WOMA 4B3OA 3OYGA 4CF8A 1L3VA 1OZ2A 3ZSWA 1KLMA 3K5MA 4LD0A 1A5WA 1RILA 1JLCA 3TAFA 3V4IA 3VQQA 3L42A 4CCHA 5CY4A 3LGLA 3V1RA 4KRFA 5J2NA 1UA0A 2RHUA 4DS4A 3P8DA 2BANA 2IAJA 3QO9A 4QAGA 1TVRA 3QEVA 4N4HA 3SUQA 3SUOA 1S1WA 2OZMA 3CG7A 4FJJA 3MEGA 1Z26A 3KIOA 4CJLA 4JLHA 2KZMA 4FK2A 4CE9A 2YHBA 3V9UA 1KVCA 1D9DA 2ZE2A 2VG7A 3TAPA 1XWLA 4CFDA 3FDRA 4B8CA 3NTKA 3CEYA 2LVMA 4DG1A 4G1QA 2HVIA 4CHQA 4Q0BA 4MFBA 2BUDA 1ZBHA 3TAQA 2QKBA 3KLIA 1YTAA 3D0PA 1X9MA 1UOCA 2Z1HA 5HRNA 3HPGA 3G10A 3EY1A 4NYFA 1BCMA 4OKEA 1WJRA 1TKTA 3PMIA 4FLVA 1DTTA 3AVBA 4W5TA 1VSEA 2Z1GA 3E01A 3MEEA 1XI1A 4CHOA 4KV8A 4KTQA 3ZSOA 4CEQA 1QE1A 3NBPA 3O4QA 2IGIA 1UWBA 3O3HA 4LD6A 3QEIA 3NCIA 4CHNA 1SKSA 3HP6A 4OPJA 2HQEA 4O0JA 4N5SA 3SI6A 2DFFA 5D6WA 3VQAA 4DS5A 2G3RA 2XHBA 4FLXA 2EQMA 4JS5A 1RT2A 4QQDA 5KCHA 2G8IA 3WNEA 3MEAA 1NOYA 1KTQA 1L3TA 3LLRA 3AVLA 1N5YA 5D3GA 2VWKA 4LH5A 2EQJA 4CJRA 4BDPA 2X35A 3KLFA 2Y1IA 1B9DA 1KVAA 3LP3A 3DB4A 3ALYA 1D8YA 4AHVA 5SZTA 4GY5A 4DSJA 4CECA 1RDBA 4I9LA 1BGXT 2QQSA 5C6SA 2CKKA 3DRSA 4CEEA 3MP1A 4KFBA 4C8MA 4M3XA 3QINA 3LH0A 1KCFA 4E7LA 2R58A 4CF0A 3MEWA 4Z4CA 4EDUA 1KVBA 3BDLA 1MHNA 3LGFA 5JS2A 4QCLA 3OJUA 1RCHA 3ZSRA 3K59A 3PX4A 2R7YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2G7HA 4NC7A 4ESRA 4DSIA 1RFQA 4B9QA 1YITQ 1AKHA 4YOYA 4II1A 3RMQA 1MW7A 2E2NA 1WAJA 2L7FP 4NQWA 1MMGA 1ZLKA 4ICLA 4CGHA 3TSUA 5BR8K 2HBLA 4Y91A 2DBMA 3WXJA 4ZN3A 2ROLA 2LBFA 3BZKA 2Y9YA 4BJTA 3SQ2A 2DVEA 2QQ8A 1X2MA 4QW2A 4J8FA 3BQYA 2MWOA 4C8QG 2OTJQ 5CO7A 2RREA 1Y7XA 2P9SB 5F2RA 3C0BA 4UNFA 2TCTA 4EQQA 5FU7B 4CEZA 1BB9A 3L3UA 1RT1A 3PT9A 1OULA 3LA3A 3VRZA 4DTJA 3MMYB 4I02A 2VT2A 1NEGA 1JO8A 3WE2A 4DU4A 1LFBA 4FCYA 1RGIA 1H0MA 3JCMP 2FNPA 1DLOA 3S16J 4EVVA 2R7TA 2E4HA 1JLAA 1J9AA 1U45A 3PSIA 2XF6A 1KZHA 4N0AA 2V1UA 1SFXA 3OW2S 2EBPA 3RR6A 2R7QA 2X85A 4GLKA 1TG0A 2LR8A 2CUJA 2QTDA 5KGXA 2DT7B 2J6OA 1NJYA 2XAFA 3M0RA 1DT9A 1LEBA 2IVNA 5HRPA 3G1LA 3DLRA 2HZTA 3G6ET 1VQ5T 4CGFA 3WODF 4ZYAA 4EPCA 1FN7A 1XUPO 2BKDN 1VQLT 4FWQA 3QUIA 1LVAA 3ELKA 1UJ8A 3OQ5A 1S8NA 2DILA 3V7SA 3KEQA 5LMUK 1HXDA 2MG4A 4FLZA 2AZSA 3K1PA 1OH8A 4MEXF 4XQ3A 1VSDA 3BY7A 2ZPHB 4JQFA 4OVAA 5FU6C 2LK2A 5K7ZA 3UATA 3J80O 3G6EI 1VQ5I 3DWLE 4UQGA 4JRQA 2H3EB 1ZXOA 1HW2A 1S6QA 2GXBA 3MKYB 1HYSA 2KBTA 1VQLI 3JCMg 3CXCP 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 3P5J A;  4FJH A;  4CEB A;  1A5X A;  1X9S A;  2E6N A;  2LDM A;  4N47 A;  3ZSX A;  4N56 A;  4W5O A;  3QLH A;  3BGR A;  3AA5 X;  2HHV A;  2GFA A;  4RW9 A;  1Q9Y A;  2O4I A;  3QER A;  2DAQ A;  4CJF A;  4W5N A;  2XY8 A;  3RMA A;  4HUF A;  1NJW A;  4BD3 A;  2WON A;  4OKK A;  3O8V A;  3OMC A;  1WN7 A;  3OS2 A;  3OYC A;  3ZSV A;  4DSK A;  2GF7 A;  4PLL A;  4JRP A;  1ZBU A;  2P0K A;  2ZQB A;  1SL0 A;  1QTM A;  4CJP A;  3KD5 E;  1YT3 A;  4DTO A;  1MU2 A;  1U4B A;  1C1A A;  1NK9 A;  4E1N A;  2I5J A;  3SYZ A;  5CYM A;  2EQK A;  3SQ0 A;  3AO3 A;  4DFK A;  3TR8 A;  2ETJ A;  1C0U A;  3LZJ A;  3OYH A;  3Q1J A;  3V9X A;  4BE0 A;  3ASM A;  4O0I A;  4PLI A;  3PY8 A;  4BE1 A;  3ME9 A;  3V9Z A;  2X78 A;  1XNI A;  4F4K A;  1JKH A;  4DLE A;  1RBR A;  1KLN A;  1DTQ A;  4M3W A;  3H08 A;  2YNH A;  2BGG A;  4FK0 A;  3SZ2 A;  2O4X B;  1S1U A;  2D9T A;  4M41 A;  1S9G A;  2IS3 A;  1TGO A;  4CIG A;  4C8L A;  4QQG A;  3VQD A;  1G15 A;  1KSP A;  4B9X A;  1BIZ A;  1OYX A;  4IKF A;  4M3Y A;  2GBZ A;  4CGG A;  4NS5 A;  3QKJ A;  3CM5 A;  3OB9 A;  1L3S A;  4CJ4 A;  3U3Y A;  1BQN A;  3AV9 A;  3LZI A;  3PMT A;  2O4G A;  3ULD A;  3T19 A;  2F8S A;  4KHY A;  2D0B A;  1JXE A;  2LTO A;  4LY7 A;  4XIU A;  2XK0 A;  1RT4 A;  4FM2 A;  3FC3 A;  4DFM A;  4A4G A;  3V1O A;  4NCG A;  5C42 A;  2FBY A;  3O4N A;  2B8A A;  4N4G A;  3V9W A;  4HCB A;  1RTD A;  3SV3 A;  4QQ6 A;  1NOZ A;  5C0M A;  4DTX A;  5KGW A;  4KHQ A;  2KZZ A;  2HHU A;  3QEP A;  5KI6 A;  3C95 A;  4H8K A;  4FM0 A;  2B5J A;  2DFH A;  2P5O A;  4KKO A;  5K14 A;  2RI3 A;  4DQQ A;  1HNV A;  4O4G A;  2HND A;  2R5A A;  1TKX A;  1F21 A;  2JTF A;  1Z25 A;  3AO5 A;  1H3Z A;  3QET A;  3LAL A;  1LWC A;  1JL1 A;  2BDP A;  1HQE A;  1BIU A;  4FU6 A;  1BCO A;  3NF7 A;  4PA1 A;  4DFJ A;  4NYN A;  2L3R A;  4C5E A;  1J54 A;  3HVT A;  3PFS A;  4KB0 A;  4I9Q A;  3OYM A;  1HJR A;  3OY9 A;  1HMV A;  3SCX A;  1BI4 A;  4CJV A;  4RW4 A;  3CFP A;  4Q5V A;  3AVI A;  3L8B A;  1RDD A;  3HJF A;  4F3T A;  4DF4 A;  4ELT A;  2QK9 A;  1FKO A;  4I7F A;  4CFA A;  3AVF A;  2XY6 A;  4KI6 A;  5FRO A;  4AH9 A;  1RBT A;  2NUB A;  2X4Y A;  2YKM A;  1G5V A;  3I8D A;  4CFC A;  2WOM A;  4B3O A;  3OYG A;  4CF8 A;  1L3V A;  1OZ2 A;  3ZSW A;  1KLM A;  3K5M A;  4LD0 A;  1A5W A;  1RIL A;  1JLC A;  3TAF A;  3V4I A;  3VQQ A;  3L42 A;  4CCH A;  5CY4 A;  3LGL A;  3V1R A;  4KRF A;  5J2N A;  1UA0 A;  2RHU A;  4DS4 A;  3P8D A;  2BAN A;  2IAJ A;  3QO9 A;  4QAG A;  1TVR A;  3QEV A;  4N4H A;  3SUQ A;  3SUO A;  1S1W A;  2OZM A;  3CG7 A;  4FJJ A;  3MEG A;  1Z26 A;  3KIO A;  4CJL A;  4JLH A;  2KZM A;  4FK2 A;  4CE9 A;  2YHB A;  3V9U A;  1KVC A;  1D9D A;  2ZE2 A;  2VG7 A;  3TAP A;  1XWL A;  4CFD A;  3FDR A;  4B8C A;  3NTK A;  3CEY A;  2LVM A;  4DG1 A;  4G1Q A;  2HVI A;  4CHQ A;  4Q0B A;  4MFB A;  2BUD A;  1ZBH A;  3TAQ A;  2QKB A;  3KLI A;  1YTA A;  3D0P A;  1X9M A;  1UOC A;  2Z1H A;  5HRN A;  3HPG A;  3G10 A;  3EY1 A;  4NYF A;  1BCM A;  4OKE A;  1WJR A;  1TKT A;  3PMI A;  4FLV A;  1DTT A;  3AVB A;  4W5T A;  1VSE A;  2Z1G A;  3E01 A;  3MEE A;  1XI1 A;  4CHO A;  4KV8 A;  4KTQ A;  3ZSO A;  4CEQ A;  1QE1 A;  3NBP A;  3O4Q A;  2IGI A;  1UWB A;  3O3H A;  4LD6 A;  3QEI A;  3NCI A;  4CHN A;  1SKS A;  3HP6 A;  4OPJ A;  2HQE A;  4O0J A;  4N5S A;  3SI6 A;  2DFF A;  5D6W A;  3VQA A;  4DS5 A;  2G3R A;  2XHB A;  4FLX A;  2EQM A;  4JS5 A;  1RT2 A;  4QQD A;  5KCH A;  2G8I A;  3WNE A;  3MEA A;  1NOY A;  1KTQ A;  1L3T A;  3LLR A;  3AVL A;  1N5Y A;  5D3G A;  2VWK A;  4LH5 A;  2EQJ A;  4CJR A;  4BDP A;  2X35 A;  3KLF A;  2Y1I A;  1B9D A;  1KVA A;  3LP3 A;  3DB4 A;  3ALY A;  1D8Y A;  4AHV A;  5SZT A;  4GY5 A;  4DSJ A;  4CEC A;  1RDB A;  4I9L A;  1BGX T;  2QQS A;  5C6S A;  2CKK A;  3DRS A;  4CEE A;  3MP1 A;  4KFB A;  4C8M A;  4M3X A;  3QIN A;  3LH0 A;  1KCF A;  4E7L A;  2R58 A;  4CF0 A;  3MEW A;  4Z4C A;  4EDU A;  1KVB A;  3BDL A;  1MHN A;  3LGF A;  5JS2 A;  4QCL A;  3OJU A;  1RCH A;  3ZSR A;  3K59 A;  3PX4 A;  2R7Y A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1VQ5 T;  4CGF A;  3WOD F;  4ZYA A;  4EPC A;  1FN7 A;  1XUP O;  2BKD N;  1VQL T;  4FWQ A;  3QUI A;  1LVA A;  3ELK A;  1UJ8 A;  3OQ5 A;  1S8N A;  2DIL A;  3V7S A;  3KEQ A;  5LMU K;  1HXD A;  2MG4 A;  4FLZ A;  2AZS A;  3K1P A;  1OH8 A;  4MEX F;  4XQ3 A;  1VSD A;  3BY7 A;  2ZPH B;  4JQF A;  4OVA A;  5FU6 C;  2LK2 A;  5K7Z A;  3UAT A;  3J80 O;  3G6E I;  1VQ5 I;  3DWL E;  4UQG A;  4JRQ A;  2H3E B;  1ZXO A;  1HW2 A;  1S6Q A;  2GXB A;  3MKY B;  1HYS A;  2KBT A;  1VQL I;  3JCM g;  3CXC P;  3JSC A;  3FK6 A;  3HM8 A;  2OF7 A;  3ZEH A;  1VTN C;  3B6A A;  3DBR B;  4BRH A;  4E7K A;  1WEI A;  5GAN 4;  3V1Q A;  2COY A;  2H8R A;  1MBK A;  2I2L A;  1JUM A;  1IW7 F;  1IKX A;  2VJI A;  4HX7 A;  4G12 A;  1OVY A;  1XHZ A;  1RT6 A;  5AR0 A;  1O7L A;  2R5Y A;  1FOK A;  4IUU A;  5BRH A;  1KHC A;  4IG0 A;  2DTI A;  1F4K A;  2PBD A;  5KYW B;  2WC2 A;  1SL2 A;  4PJO D;  1HST A;  4FWL A;  5GAD J;  1UTI A;  2O3F A;  1VIF A;  4C8O A;  1TS9 A;  1RBU A;  2G8H A;  5AZI A;  4B1R A;  3NMZ C;  1VQP A;  2DTR A;  1ZSG A;  2H1K A; 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 1KJW A;  4J6Y A;  1H89 C;  4CEC A;  4DSJ A;  2NAZ A;  3S32 A;  2L7Z A;  3CUQ C;  5C6S A;  1ENH A;  2L0A A;  2HDD A;  5AFU A;  1WA7 A;  4PII A;  1X1D A;  1AWW A;  3BCA A;  4E7L A;  5IYD J;  3RZO J;  3INZ A;  4CF0 A;  3CLQ A;  2E71 A;  2CWE A;  1KVB A;  2X6X A;  2FRH A;  3AL0 B;  2KE9 A;  1XTD A;  3VF6 A;  3OJU A;  3D2E B;  2IPQ X;  5BPL A;  2K5F A;  3EEQ A;  1Y07 A;  1UEB A;  1QP3 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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 4ZGJ B;  1WSI A;  1WSJ A;  4ZDO A;  4CJK A;  3LL7 A;  5HRR A;  1TH7 A;  2F5V A;  2HD0 A;  4DU4 A;  3G2B A;  3IAM 2;  4OLA A;  4FCY A;  3H9G A;  5CAI A;  3JCM P;  2RPI A;  1DLO A;  2AJQ A;  4NCA A;  2IS6 A;  3M1C A;  2R7T A;  1WAF A;  1JLA A;  1J9A A;  1U45 A;  4F93 B;  3PSI A;  3OYB A;  4LIV A;  2XF6 A;  4YFU A;  4N0A A;  1JRI A;  3OW2 S;  2WY8 Q;  2R7Q A;  2X85 A;  4IZZ A;  1DGR M;  4GLK A;  2EX3 A;  3RR7 A;  5KE2 A;  3LAK A;  2CUJ A;  3CME T;  2O4X A;  5KGX A;  2DT7 B;  1NJY A;  2JPS A;  5CYQ A;  4B9T A;  2VXD A;  5HRP A;  3L2W A;  5CPR B;  3V8L A;  4BUP A;  3DLR A;  4FJ7 A;  1ASV A;  4M75 G;  3G6E T;  1VQ5 T;  4CGF A;  2PY5 A;  1FXX A;  5A2Q E;  4ZYA A;  3QDR B;  2JZ2 A;  2V8K A;  4EPC A;  4B9V A;  1VZ0 A;  1Y96 A;  4OGC A;  1Q81 C;  4HHT A;  4BWM A;  2JSP A;  4CCL A;  3HOS A;  3K70 D;  2BKD N;  1VQL T;  5CVI A;  2LG4 A;  4XTV A;  4BDY A;  1ERD A;  2DXB A;  1HYV A;  2Z1I A;  3QUI A;  3VQB A;  3P83 D;  4CHZ A;  1V29 B;  1RT3 A;  2FBT A;  3OQ5 A;  4DTM A;  3V7S A;  3VDX A;  3DU6 A;  1HXD A; 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