4ER4E

High-resolution x-ray analyses of renin inhibitor-aspartic proteinase complexes
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
publication title High resolution X-ray analyses of renin inhibitor-aspartic proteinase complexes.
pubmed doi rcsb
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 65
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1991-01-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4er4E02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4er4E01
5P28A 1HTGA 3BUHA 5P5IA 4J0ZA 5DR3A 3CMSA 2JJJA 5P6VA 2XYEA 1BBSA 3K5GA 5P5XA 1A9MA 5P2UA 3FNUA 2P3CA 3L5FA 5P1EA 1NPWA 3TPPA 1FMUA 4F76A 3K4VC 5ISKA 1CPIA 5P4RA 5P1VA 3FX5A 3S45A 3O9EA 4Y5EA 3PWWA 3QPJA 4PHVA 5IE1A 2QHCA 4GJ9A 4GJAA 3ECGA 1META 3FKTA 2RKFA 4YOBA 3NDTA 3VSWA 3INFA 1SGZA 4Y50A 4UPJA 4YBFA 3NU4A 4GJDA 2J9JA 3HDKA 3URJA 2F3EA 1FKNA 5BWYA 1GVWA 3N3IA 5COKA 1FFIC 2QI3A 3EM6A 3BUFA 4DJUA 2BPVA 5OZ2A 5P5RA 3QRVA 1LEEA 4Z2ZA 4Y5CA 3IVHA 3OADA 5P4PA 4X2LA 2AIDA 3SLZA 3SA9A 4LXKA 1F7AA 3O9IA 1SBGA 2O4KA 4B70A 3S7LA 3D20A 3INDA 3ZKQA 2B60A 5P03A 3OUCA 5P8RA 4DJVA 1NPVA 4IVTA 2P3BB 1B6PA 5P5ZA 5P5PA 4J1HA 5P40A 2BPXA 2IRZA 5P8IA 4FS4A 5P7AA 5AH9A 1K6TA 4I0JA 1QBUA 5P7XA 2I0AA 2ZHSA 1Z1RA 5P3KA 1OHRA 2QD6A 1UH8A 5AH7A 5DPZA 5OYTA 3OXWA 2P83A 1AJVA 5KR0A 4HDBA 3PVKA 1MT7A 4I0GA 3L5BA 2OHMA 5OZYA 5P0UA 3ZKIA 2QCIA 4AMTA 5P0XA 3O99A 3LIQA 4B05A 2HAHA 5P35A 3EL5A 5OZHA 4R92A 1EC2A 1MT8A 5HE5A 3SKFA 2XFJA 1EAGA 3NU3A 4RVXA 4CPQA 3HBOA 2NNPA 2BPWA 5EZZA 1GVVA 3SO9A 5P2DA 5OYUA 4DPIA 6APRE 4OBJA 5P1FA 5P30A 5P17A 4CPXA 2ZJNA 5P0BA 2A4FA 4OBFA 4KUPA 5CLMA 5P2TA 4D85A 3OWNA 2NXLA 4GB2A 3T3CA 2WEBA 4FRIA 5IS4A 3VYFA 4YD7A 3CKRA 2XYFA 4B1CA 3LIXA 5P1NA 5DQCA 5P5GA 4ZIPA 4OBZB 1HVLA 4U8WA 5P8TA 5UPJA 1D4SA 5P4HA 2QZKA 1BDLA 4H3IA 1BWBA 3QVIA 5P69A 2CENA 3NWQA 5P66A 5P0YA 1K6VA 4J0VA 3JW2A 4WTUA 4Y4TA 4YA8A 1LYAB 2I0DA 5P79A 4A6CA 5P3HA 3SPKA 1MTBA 2NMZA 4L7HA 2ZHVA 3O9HA 3NXNA 1E80E 4Y5NA 5P0NA 4R95A 4DQHA 1KJ4A 1EBZA 1ER8E 4Y3PA 3UDKA 5JODA 4Y4DA 3NXEA 3KM4A 4FRSA 1LYWB 5P3AA 3VV6A 3OK9A 2WECA 4Y47A 3WSJA 4Y4WA 2PMAA 3DK1A 1PPME 5OZWA 5P74A 4F75A 1XE5A 2P4JA 5P3UA 3PI0A 5P2MA 1W5YA 2NMYA 4APRE 1PPKE 5P4OA 2R43A 1MRXA 5P6XA 2FDPA 3S85A 1LF2A 4Y5PA 4YD3A 5OYSA 3OUBA 4AZYA 1FQ5A 4U7VA 1RQ9A 3KDCA 4DJWA 2O4SA 1XS7D 3EC0A 1IDBA 3SABA 5P60A 4LC7A 1D4JA 5IVSA 1FMBA 1ENTE 3GGUA 1D4HA 5P2EA 3LHGA 3NU5A 3OXXA 5KR2A 5P1RA 5P6KA 3CKPA 2VIZA 5OZ6A 5P06A 4EQJA 2HS2A 1FFFC 3LITA 5P5QA 5P3QA 2PSUA 4Y5MA 2VNMA 2OHKA 1SGUA 5P8MA 4ZSPA 3OAGB 1BILA 5P2SA 5P4DA 5P1TA 3SA3A 4Y3LA 4ZSMA 3IGBA 5HVPA 2BBBA 1MT9A 5EZXA 2P3BA 5P0MA 5P55A 3S43B 3RSVA 3EKQA 3KFRA 3NWXA 5P0KA 1G0VA 3I2LA 5DQ2A 3NUJA 4Y4BA 1ZJ7A 4I0IA 3UDNA 5P1KA 4QJ8A 2VIYA 1ZSFA 4CP7A 5P86A 2G26A 5P3VA 4BELA 5KOQA 6UPJA 5P6CA 4APEA 1WBMA 1HVSA 5ENKA 2HC0A 2QI0A 3ZKGA 3EL9A 1M4HA 5DR0A 3PLLA 1KJFA 2ZJLA 4GIDA 5P34A 1ODXA 5P2RA 5P4TA 5HU0A 1B6JA 2NNKA 3LNKA 4DJOA 5P1HA 4DJQA 3ZKNA 4Y4UA 4LXAA 4CKUA 1T6EX 1PPLE 3ZKMA 1W6IA 3VLBA 5P65A 3T7QA 5P4GA 5P0TA 3D91A 4QJAA 4Y3XA 1E82E 4Z50A 4JOOA 5P25A 3KDBA 1MPPA 1UH9A 5APRE 4Y3NA 2AVMA 5P7TA 1A8KA 4CPWA 5P1BA 1LZQA 2QMDA 4I1CA 2G24A 5P50A 3UDQA 5P1IA 3OTSA 5P48A 4RGHA 2G27A 2HPFA 5P0IA 1HPXA 5P43A 5P6LA 4HEGA 3ZPTA 5OZBA 3R0WA 4B0QA 5P09A 1W50A 1HXBA 2PH8A 2PSGA 5P61A 4NKKA 3SM2A 3KFSA 5P6IA 3HAUA 1FB7A 5DR8A 2I4WA 4ER1E 1LYWA 4H1EA 4DI2A 3OHHA 5P2OA 5P7JA 2ZJIA 5P7SA 4BFBA 5P36A 2WF1A 3MSJA 2PH6A 1E81E 5HCTA 3O9CA 4YCYA 4ZPFA 2VJ9A 4FSLA 3UTLA 3FSMA 4YBIA 2AZ8A 5P6PA 3L5EA 2AOJA 4CPUA 2QNPA 4XX4A 4H3FA 5P0GA 5P3DA 3OGPA 5P1LA 5P5CA 5P8PA 4Y5BA 4DQFA 4NJVA 1EC1A 2Q54A 2ZHRA 5P89A 5P0JA 3UDMA 4AA9A 4Y38A 3QI1A 3D1XA 3EBZA 5P2BA 1BAIA 3DOXA 8HVPA 5P3TA 5P56A 5P4AA 1KJGA 2FNTA 1HTRB 5P24A 1DPJA 1NPAA 3TL9A 4Y56A 3TOGA 5OYQA 4GJ8A 2G21A 5P7IA 3DCKA 3BHEA 2Q55A 3K5CA 4NPTA 4FLGA 2QMPA 4RZ1A 3PWRA 3D3TA 5OZGA 3LZUA 1HVHA 1EPNE 2V0ZC 1HPSA 4B1DA 5P76A 4J0PA 1EEDP 1BV9A 3FV3A 3LINA 2ZGAA 5P4LA 5IVRA 3EL4A 3OGQA 3Q5HA 3QBFA 2V00A 3OU1A 2AOGA 5P7VA 3K1WA 5P82A 4Y3DA 3Q6YA 1BDQA 4A6BA 1XL2A 2BKSA 4L6BA 1ODYA 4TVGA 5AHCA 5P6NA 3B80A 3GI6A 2AOIA 5P8EA 2B8VA 3T11A 1HPVA 5P2NA 2VS2A 2AVQA 2V10C 2PQZA 5OYYA 1EPPE 5P2FA 5P70A 4HZTA 1CMSA 3FNSA 4ZSRA 1Z8CA 2OHRA 4LAPA 5P07A 5P20A 3KFNA 2BPYA 2F3KA 2BB9A 5P3XA 2R8NA 5P31A 4Y41A 4Y3YA 5P0AA 4E43A 5P46A 2PWCA 5P4XA 4PZWA 1SH9A 5OZ4A 5P4SA 5OYXA 1KZKA 3SM1A 2ZYEA 4OBGA 2VIJA 5OZQA 2MIPA 4J1EA 5P1JA 4FE6A 5P23A 4FAEA 5ENMA 3OY4A 5P57A 1T6GA 1FQ8A 5P6OA 1QBRA 5P6YA 2IS0A 3D1YA 2HB3A 1YTHA 1YT9A 4MC1A 2AZBA 3M9FA 3HVPA 2BJUA 2IKUA 5E5JA 3GGAA 2WL0A 5P53A 4EJLA 1HEGE 2HB2A 3DCRA 1FQ7A 4LBTA 5P0QA 2B8LA 3QP0A 5P2CA 3U6AA 1MTRA 5P0OA 1LYBA 1IIQA 1CZIE 1D4LA 1A94A 5P7GA 2JYSA 5T4SA 3BGCA 5P5TA 3EXOA 1APVE 5OZ3A 5P8SA 1NH0A 5DGUA 5P3YA 2RSPA 4RVIA 3ZKSA 5F01A 1KJHA 5P7FA 5P75A 4OC6A 5P0LA 3F9QA 2O4PA 3L5DA 2I1AA 4DUSA 1B6LA 2VNNA 3QN8A 1ZLFA 5P84A 3QBHA 3TPLA 3KFPA 1YTIA 4QLHA 1GVXA 1EPOE 3PJ6A 5P6GA 5OZRA 3LZYA 3KT5A 5P8GA 1W5VA 5P6RA 1W5XA 3ER5E 5DR7A 4Y3JA 1G6LA 5CONA 3CYWA 5P7CA 3OUDA 5P67A 4DJXA 5P6WA 2ER6E 4QJ9A 1HSHA 3OOTA 5P4YA 2FIVA 3SA6A 4RROA 1SP5A 1APWE 2QI1A 4L1AB 5P29A 3UF3A 4B72A 2B42A 2G1RA 1B11A 2NR6A 3URIA 3DJKA 5P3LA 1FLHA 2I4DA 5OZZA 1N49A 3K4VA 1HWRA 5P2IA 4J55A 2R3WA 1G35A 3TTPA 2IDWA 3PI5A 1PSOE 2QI7A 3CKTA 1BXOA 5P2LA 5P3OA 3VF3A 4Y5KA 3NLSA 2IGYA 3TKWA 5P7WA 2WF4A 1EPRE 5COOA 3KMYA 1YTJA 3QAAA 4FRKA 1B6MA 1VIKA 4EXHA 5P7LA 5P8AA 2V11C 1HVJA 4PEPA 1HXWA 1TSQA 3UQPA 1K6PA 4FIVA 4Y4AA 1HEFE 5P80A 4ZSQA 4AUCA 2HIZA 3WB5A 5P6BA 3NDXA 1EC0A 3L3AA 5P2JA 3VV8A 5HDZA 5P8NA 3NUOA 1LF4A 3O9LA 5ER1E 4M8XA 4WY1A 3DV5A 4Y3HA 3MXEA 3OQFA 1RPIA 4FM7A 5KQFA 4OBKA 5B18A 3ZPSA 5E5KA 5P8LA 4CPSA 2QZWA 2ZJKA 3ZPUA 4I12A 5P6AA 3S7MA 2WEZA 3H0BA 1A30A 1PROA 1IVQA 5P44A 2IKOA 5P4QA 4Y3RA 5OZSA 4K8SA 4Y39A 5P5HA 3EL1A 5P3GA 2BKTA 5P3FA 4DV9A 1BIMA 1LS5A 5P7MA 4ZPEA 1SIVA 3Q4BA 4Y48A 3VYEA 4Y5AA 4HDPA 4FL8A 2IL2A 5P39A 3ST5A 4XX3A 1IDAA 5P3RA 5P4JA 2V12C 2VKMA 3UDRA 3AIDA 5P0WA 1FGCC 1F34A 1SMRA 4DPFA 4EWOA 4KE0A 4GMIA 1OEWA 2V16C 4J1KA 5HE7A 3EKXA 5P81A 5P02A 3NDWA 2QP8A 3D1ZA 1AAQA 1D4YA 3LIVA 5P41A 3TOHA 1W5WA 4I8WA 2QAKA 3UQRA 5OZNA 5P2QA 4YDFA 3K5DA 5P88A 4B77A 4K4QA 3R4BA 3EKPA 5P6EA 1LV1A 5P2VA 2IQGA 1FG8C 5P73A 5OZ9A 4NJTA 3PSGA 7UPJA 2AQUA 3I7EA 3NYGA 5P87A 4COEA 1EC3A 3R1GB 4ZE6A 2PWRA 5P7OA 4X7IA 3NSHA 5KOSA 4HLAA 1RNEA 5DR1A 2NXMA 2OHNA 5P6UA 5P1GA 1EBWA 2WEDA 1HIHA 2P3DA 1RV7A 2QHZA 4K9HA 2Q64A 6FIVA 3IXOA 4N00A 3KDDA 3MWSA 3BXSA 1C6ZA 1W51A 3GGVA 1YTGA 4Y54A 4TVHA 2XFKA 5AGZA 4RRSA 3WZ6A 3TPRA 4B78A 2ZHTA 2AVVA 5HD0A 3T7PA 5P5LA 5P78A 5C9BA 1J71A 1ZBGA 3A2OA 1M0BA 1SMEA 5P7HA 5HDUA 3WZ7A 5P5FA 4Z22A 5P6SA 4Y35A 4Y4GA 4YOAA 2AODA 3CYXA 4K4PA 3SA4A 3PM4A 4Q1YA 5P14A 4F74A 2QI5A 1HVRA 1MRWA 5P5OA 5P7UA 3VFBA 5P8BA 1BWAA 4J5JA 5P6HA 1HIIA 4FM8A 5KAOA 2FNSA 4MC9A 4EJ8A 2APRA 1YM4A 1QBTA 3KF0A 4Y5LA 5HU1A 2NXDA 4Y44A 5P0RA 4DJYA 3PHVA 3SQFA 1DP5A 4Y9WA 4Q1NA 4HE9A 1K1UA 3VLAA 1SDTA 9HVPA 2SAMA 2G1YA 4OBZA 3KMXA 3OUAA 5TOLA 5P3EA 5C9DA 2XFIA 4Z4XA 3PB5A 4BFDA 4FGXA 1AZ5A 3UDJA 1DMPA 2AOHA 5DQ1A 1HVKA 3EL0A 3VFAA 3ZLQA 5P1ZA 4CPRA 3PWMA 3O9GA 3VV7A 1LYAA 4GJ5A 3EKTA 3IA9A 4Q1XA 5P7RA 5P8KA 5SZ9A 1C6XA 3EKYA 5P1AA 1PSNA 5P71A 5PEPA 3UQWA 5P3IA 2FGUA 2OHSA 5P13A 3S2OA 2IEOA 2F8GA 5COPA 5BRYA 2JXRA 1K2BA 2G22A 4CPTA 1IVPA 3OADB 5P2WA 3IXJA 2HM1A 4JECA 5OZCA 4XKXA 4Y45A 3VYDA 3Q3TA 5P8VA 5P3JA 5P8OA 2QNQA 3SA5A 5DQ4A 1HVCA 4I0DA 5P7KA 3UFLA 1ME6A 2AVSA 4K4RA 3ER3E 3MXDA 3O9BA 4I10A 4HDFA 1ZSRA 4L7JA 5OZFA 5P7NA 1HSIA 2VA5A 5P7EA 3PSUA 4LL3A 2ZHUA 3QRMA 3TKGA 2IGXA 2UPJA 1C6YA 3IVIA 4DH6A 2I4QA 5P0FA 1EPME 5P2ZA 3KT2A 5OYZA 2J9KA 2OHLA 4HVPA 3GW5A 5P4IA 3TNEA 3RTHA 3DV1A 3HW1A 5P6FA 5P3BA 1IBQA 2ANLA 5P5DA 1TSUA 1A8GA 1HOSA 5P5BA 4ACUA 3LIYA 5AHAA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P28 A;  1HTG A;  3BUH A;  5P5I A;  4J0Z A;  5DR3 A;  3CMS A;  2JJJ A;  5P6V A;  2XYE A;  1BBS A;  3K5G A;  5P5X A;  1A9M A;  5P2U A;  3FNU A;  2P3C A;  3L5F A;  5P1E A;  1NPW A;  3TPP A;  1FMU A;  4F76 A;  3K4V C;  5ISK A;  1CPI A;  5P4R A;  5P1V A;  3FX5 A;  3S45 A;  3O9E A;  4Y5E A;  3PWW A;  3QPJ A;  4PHV A;  5IE1 A;  2QHC A;  4GJ9 A;  4GJA A;  3ECG A;  1MET A;  3FKT A;  2RKF A;  4YOB A;  3NDT A;  3VSW A;  3INF A;  1SGZ A;  4Y50 A;  4UPJ A;  4YBF A;  3NU4 A;  4GJD A;  2J9J A;  3HDK A;  3URJ A;  2F3E A;  1FKN A;  5BWY A;  1GVW A;  3N3I A;  5COK A;  1FFI C;  2QI3 A;  3EM6 A;  3BUF A;  4DJU A;  2BPV A;  5OZ2 A;  5P5R A;  3QRV A;  1LEE A;  4Z2Z A;  4Y5C A;  3IVH A;  3OAD A;  5P4P A;  4X2L A;  2AID A;  3SLZ A;  3SA9 A;  4LXK A;  1F7A A;  3O9I A;  1SBG A;  2O4K A;  4B70 A;  3S7L A;  3D20 A;  3IND A;  3ZKQ A;  2B60 A;  5P03 A;  3OUC A;  5P8R A;  4DJV A;  1NPV A;  4IVT A;  2P3B B;  1B6P A;  5P5Z A;  5P5P A;  4J1H A;  5P40 A;  2BPX A;  2IRZ A;  5P8I A;  4FS4 A;  5P7A A;  5AH9 A;  1K6T A;  4I0J A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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