The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
39
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sequence length |
130
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structure length |
130
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Chain Sequence |
SWQTYVDDHLLCEIEGNHLSSAAILGQDGSVWAQSSNFPQFKPEEITAIMNDFAEPGSLAPTGLYLGGTKYMVIQGEPGTVIRGKKGPGGVTIKKTNQALIIGIYDEPMTPGQCNMIVEKLGDYLIDTGL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Allergen
|
| molecule keywords |
Profilin
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| publication title |
Crystal Structure of Peanut ( Arachis hypogaea ) Allergen Ara h 5.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Arachis hypogaea
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| total genus |
39
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| structure length |
130
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| sequence length |
130
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-04-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2E8J A; 2ZL1 B; 2HZ5 A; 1SKO A; 1Y4O A; 5FDS A; 3LGO A; 2V8F A; 4FUW A; 4D60 A; 2ZL1 A; 3T1R A; 1FIK A; 3CPT B; 3KYE A; 4X1M A; 5EM1 A; 1CJF A; 2JKF A; 3T12 B; 3T1S A; 1PNE A; 3NUL A; 5EVE A; 2PRF A; 1K0K A; 5FEG A; 1VEU A; 3CPT A; 2BTF P; 1J3W A; 4X25 A; 2B95 A; 1PRQ A; 3L9K A; 1HLU P; 3D9Y A; 3MSH A; 1AWI A; 2VK3 A; 3UB5 P; 3MS6 A; 1A0K A; 3L7H A; 3DAV A; 1VET B; 3T1X A; 1CF0 A; 1PFL A; 2PAV P; 1G5U A; 1VET A; 1SZV A; 1FIL A; 2PBD P; 3NEC A; 3U4L P; 3LEQ A; 4FTX A; 2JKG A; 1D1J A; 2V8C A; 3CHW P; 4QWO A; 3T1Q B; 1CQA A; 4X1L A; 1F2K A; 1Z09 A; 5FEF A; 5EV0 A; 1VEU B; 1YPR A; 1SKO B; 2ACG A; 5EM0 A; 4ESP A; 1ACF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3P98 A; 4C3Q A; 4LFU A; 4P85 A; 3UB8 A; 3HLE A; 5E2F A; 2G2U A; 4RVA A; 1K56 D; 2KX6 A; 1OT6 A; 2PU4 A; 3GVB A; 3RJU A; 1IKI A; 4II7 A; 4HY8 A; 3HJK A; 4GHI B; 2J3W A; 3MFX A; 1PWG A; 3MJQ A; 4CLC A; 3NDE A; 5I5L A; 4DKI A; 3DTE A; 3BQ8 A; 4NXF A; 2ZQ9 A; 3PHY A; 3T4K A; 5EVI D; 4KUO A; 2PBY A; 3OBF A; 3IF5 A; 4GJ4 A; 1GHM A; 5FQI A; 3DTI A; 5TJJ A; 3CLO A; 3NOT C; 2EA9 A; 2H0T A; 3OPL A; 3NC8 A; 4HI4 A; 4DE0 A; 1ERQ A; 3IXH A; 1VET B; 2Y4A A; 5IU1 A; 3EWK A; 2WGV A; 3GEC A; 3HJI A; 2Z2M B; 3FWL A; 3IBJ A; 1G5U A; 1BSG A; 1ERO A; 3IT9 A; 4YNR A; 3LIF A; 1XJ4 A; 4P6Z M; 1LT0 A; 2QZ6 A; 3HL9 A; 3A3I A; 1ESU A; 5AQ7 A; 2P04 A; 3NY4 A; 4ZJ2 A; 1GA0 A; 2HDR A; 3MQ0 A; 1F2K A; 5C5K A; 3E0Y A; 2WGW A; 2XFS A; 4OPY A; 5CTN A; 4QY5 A; 4ETX A; 4YOF A; 4ESP A; 4DMZ A; 1BLH A; 3HUM A; 1P97 A; 2Y2N A; 3BWL A; 1H8M A; 3PR6 A; 1SKO A; 2FFF B; 2KOI A; 4BJP A; 1FCO A; 2GNX A; 2JKT M; 4N9L A; 2HDQ A; 5FDS A; 5M1A A; 3UE0 A; 4MCW A; 4PKY A; 1JWZ A; 2ZC5 B; 1OJG A; 3MF0 A; 5DF7 A; 3BFC A; 5KSH A; 4X1M A; 3MZE A; 4KZ6 A; 1IEM A; 1NZO A; 3PBS A; 3T12 B; 3VP2 A; 1PNE A; 3UB6 A; 4O0P A; 5E2G A; 5HPI A; 4HQA A; 5GLB A; 1MWU A; 3C7U A; 1J3W A; 4S2L A; 1STZ A; 2B95 A; 2IWB A; 3G2Y A; 3QP2 A; 5M19 A; 4O7D A; 4R38 A; 4U3T A; 4LRX C; 1NY0 A; 2I9V A; 3CG5 A; 1L0D A; 3VSL A; 1N9O A; 5FAO A; 5GLC A; 3H7W A; 5KSC A; 2EX2 A; 3K3D A; 1GCE A; 3Q7V A; 3R7W B; 3V50 A; 1NYM A; 5FSR A; 4E3O A; 3UPP A; 1IYS A; 1G6A A; 1YQS A; 2HP9 A; 4FH4 A; 3IH9 A; 3A3J A; 3HLC A; 1JVJ A; 3HLG A; 4NK3 A; 3BLM A; 4B4X A; 4X69 A; 4UA6 A; 5HWW A; 4PM6 A; 3A3E A; 2L0W A; 2WKH A; 4Y0U A; 2X71 A; 2V1A A; 1XGI A; 2CMN A; 5CED A; 1H5X A; 1Z6F A; 4RX2 A; 2EXA A; 1W8Y A; 4Y5F A; 4HP9 A; 5DKK A; 3DBA A; 4BEN A; 5F82 A; 3E4P A; 2Y2K A; 4EQI A; 4WEJ A; 1XFN A; 3H82 A; 3MMH A; 2A24 B; 5FA7 A; 3SOI A; 1E3U D; 4D2O A; 1U60 A; 5EVI A; 2PD7 A; 4PM8 A; 3IHB A; 2JCH A; 3KSH A; 4HOI A; 3IWO A; 3HLW A; 1YLP A; 3UE1 A; 3CUE C; 2UV0 E; 5EVE A; 1GHI A; 4I39 A; 4GCZ A; 3CZD A; 1PRQ A; 2W27 A; 3TG9 A; 5AQB A; 4OQG A; 4XUZ A; 5HAP A; 2HV1 A; 2QMI A; 3UB5 P; 3MS6 A; 3MXQ A; 2VZW A; 1A0K A; 3P7N A; 2Y79 A; 3ZG5 A; 3K3C A; 3F1N B; 1BLC A; 2Y2Q A; 5G18 A; 4Q0I A; 3DTK A; 3CUE A; 4Y0O A; 4FCF A; 3HLD A; 4F3L A; 4S2P A; 1VB6 A; 3N8L A; 4HEF A; 4EET B; 5FQQ A; 4L9G A; 2M7U A; 4XXR A; 4NKP A; 1XA1 A; 3V5M A; 4E3K A; 2FH5 A; 3N4I A; 3O88 A; 4MBK A; 5HAR A; 5IHV A; 4MBH A; 3BY8 A; 3UN7 A; 4H8R A; 4N1H A; 2Y2L A; 1LSW A; 3ISG A; 3P01 A; 4JGQ A; 4GN2 A; 2ZM8 A; 3PBO A; 3VMA A; 3VFF A; 3EGD C; 2XLN A; 3LCE A; 3CI6 A; 1S1Y A; 1SHV A; 4CLC B; 4UAA A; 2C6W B; 1T19 A; 2C5W B; 4QD4 A; 4UEY A; 3BY9 A; 4KZ8 A; 4BBV A; 3C8C A; 4Z9Q A; 1TEM A; 4DJ3 A; 1ONH A; 4ZAM A; 3BLS A; 4NXE A; 3C4O A; 5IS1 A; 1FIK A; 4G3K A; 2XRN A; 3VFH A; 2P08 A; 1FR1 A; 1KDW A; 1K6R A; 3LR5 A; 4LCM A; 2H10 A; 1E25 A; 3ZG7 B; 2VGL S; 1FOF A; 1SDE A; 2D02 A; 3O3V A; 1H8Y A; 5AVF A; 3OPP A; 5CGS A; 3G6O A; 1HLU P; 4R70 A; 4ZDX A; 3H9W A; 2VK3 A; 3EEA A; 4MEZ A; 5FQ9 A; 4EBP A; 3D3O A; 4QPR A; 1F5M A; 3RXX A; 4RA7 A; 1ALQ A; 1YT4 A; 3VP1 A; 2PR5 A; 4OH0 A; 3T4T A; 2R9W A; 3LR4 A; 1YKD A; 2OOL A; 2W3H A; 2VX8 A; 1CI9 A; 4CLC D; 1UGU A; 1EI5 A; 1OPX A; 1LI9 A; 2ZM2 A; 4P0M A; 1RCJ A; 4R23 A; 4LEN A; 2MJ6 A; 3KYQ A; 2JKG A; 2EXB A; 2WGW B; 5FAQ A; 2OWJ A; 4MBF A; 3T1Q B; 4QWO A; 3EOI A; 5FI6 A; 3VP4 A; 4OLG A; 2QYB A; 2V20 A; 1SKO B; 1E3U A; 3UNW A; 1OME A; 5TR7 A; 2PDR A; 2WUQ A; 4QU3 A; 2IWC A; 2ZMV A; 3ZNT A; 1X0O A; 4S2K A; 4GLQ A; 4BD0 A; 1NLY A; 5FI7 A; 5DF9 A; 1PW8 A; 1MWR A; 1CEG A; 1OTI A; 2W3G A; 5F1G A; 3A0R A; 4QB8 A; 5GHZ A; 2JKR M; 1T1B A; 3LYX A; 3Q07 A; 3S7P A; 3GMW A; 1NWZ A; 2RCX A; 1YLT A; 5EOO A; 1MWS A; 3EEH A; 1LL9 A; 4I3I A; 1K4E A; 4HP4 A; 1ODV A; 2E8I A; 3V39 A; 1PI4 A; 3Q7V B; 2Y2M A; 2GJ3 A; 3BEC A; 1G6O A; 2WZZ A; 1T18 A; 4L9F A; 3OCN A; 3E2L A; 3RXW A; 3FKW A; 3ZG8 B; 4LV2 A; 2G2W A; 4HES A; 3NHQ A; 4HIA A; 3E2K A; 4WUJ A; 4DF6 A; 4FTX A; 5G4Z A; 4X68 A; 4JF4 A; 2P9V A; 1NRF A; 4KZB A; 2VEA A; 2OAQ 1; 4DXB A; 5E2H A; 3H82 B; 2H28 A; 4HHD A; 1YLW A; 2XD1 A; 2B02 A; 4NXB A; 5AJG A; 5F5Y A; 2Z2L B; 4JXG A; 3PYP A; 4XT2 A; 4U0X A; 4HBT A; 5F83 A; 2CC1 A; 3MZD A; 4R3J A; 1GHP A; 4S2O A; 4R4R A; 1ZKJ A; 1IYQ A; 3U2A A; 5F68 A; 3KO6 A; 1OTD A; 5EM1 A; 5A93 A; 3TE8 A; 4ZBE A; 3GRJ A; 4DRT A; 1OTB A; 2VA0 A; 4MLL A; 5EEC A; 3SH9 A; 4KZ5 A; 2ZOH A; 2ZM0 A; 1W7F A; 3UME A; 3GDI A; 3OC2 A; 2ZQA A; 2A49 A; 1SCW A; 3DAV A; 4UA7 A; 2EFX A; 3QP8 A; 1TDL A; 2INW A; 3V3R A; 4F3L B; 4Q0J A; 1YLJ A; 2PU2 A; 2HF6 A; 1JNU A; 3FV7 A; 3IX3 A; 2L1M A; 4P6Z S; 3VOY A; 4I5S A; 5CHU A; 2IA2 A; 2JE5 A; 1GSW A; 1MY8 A; 4CJN A; 4E04 A; 1V9Y A; 5CXW A; 4JXW A; 2J8Y A; 3WS5 A; 5HL1 A; 1XP4 A; 2Q9N A; 3WS4 A; 2J80 A; 1D06 A; 2AVX A; 4WBG A; 2X02 A; 4PMA A; 1IFQ A; 5FEF A; 5FAP A; 4PM7 A; 1VEU B; 3LO7 A; 1N9N A; 1M6K A; 1G28 A; 4KZA A; 1K54 C; 4HH3 A; 2YKH A; 4KG2 A; 5FAS A; 2XH9 A; 2V2F F; 4EQ1 A; 3DWK A; 2WZX A; 5F1F A; 1NLZ A; 1OJ5 A; 3WRZ A; 1CI8 A; 4GOG A; 1PI5 A; 3UY6 A; 4ARZ A; 3LIE A; 5DKL A; 3ZG0 A; 4KEN B; 2EFU A; 1LI0 A; 3T1S A; 4DE1 A; 3FPV A; 3GR2 A; 1ONG A; 3BYD A; 1K6S A; 1W79 A; 2B5R A; 1KOU A; 2BTF P; 3B42 A; 2XD5 A; 1ES4 A; 1K54 A; 2VV6 A; 1MPL A; 3KYZ A; 4OKP A; 3D9Y A; 4KQD A; 1ZTU A; 5GLD A; 1W63 M; 3L7H A; 3FKV A; 4IED A; 2GX5 A; 4LPZ A; 1DJC A; 2O9B A; 3SH8 A; 3OCL A; 4CLC E; 2XFT A; 5DF8 A; 4WZ5 C; 4WN5 A; 4UQI M; 2Z6C A; 5HWV A; 5CGW A; 3NOU C; 4Y17 A; 2OLV A; 3MBZ A; 5HAQ A; 5CRF A; 3PBN A; 2ZD8 A; 5HDD A; 3U4L P; 5HPF A; 4F94 A; 4CQH A; 4FH2 A; 2J9O A; 2V8C A; 3OPH A; 4S2I A; 4EBL A; 3PTE A; 4R0Q A; 4X1L A; 3GSG A; 2W0N A; 3MQQ A; 4NET A; 2O9C A; 3HLF A; 2NUT C; 3RTY A; 1Y28 A; 4DDY A; 5EM0 A; 3C4P A; 4WZ5 A; 4Q8I A; 4EW7 A; 2W1T A; 3UB7 A; 2OAP 1; 1PZO A; 4K0W A; 3M2K A; 1YMX A; 3IXB A; 3BRM A; 2XDM A; 3HBR A; 4UHU A; 1I5Q A; 3ZGA B; 4ZJ3 A; 2ZL1 A; 2ZC3 B; 3E4O A; 3ZFZ A; 2K2N A; 4HBU A; 4ME4 A; 4AFI A; 1ERM A; 4DDS A; 5TFQ A; 5IT5 A; 2R78 A; 3LR3 A; 4PAU A; 3S4X A; 1H8Z A; 1L2S A; 4MN5 A; 3IXG A; 3ITB A; 1AWI A; 2P74 A; 2G7U A; 4G3V A; 3TJZ C; 5L10 A; 3VOZ A; 4PPR A; 4WYY A; 4OON A; 2FZ0 A; 5J4E A; 3UMD A; 1CK3 A; 1XJ3 A; 3BJN A; 2LB5 A; 3ZNY A; 3AGE A; 3EQV A; 3PBQ A; 2ZMF A; 5TGF A; 3E4Q A; 2P9V B; 3B47 A; 1XKZ A; 1YAX A; 3C7V A; 2ZC7 A; 2R9X A; 2BLS A; 1QME A; 2J7V A; 4QY6 A; 2Y2O A; 5F6A A; 1W63 Q; 3MQO A; 4RX3 A; 5AQ9 A; 4DJ2 A; 2Y2G A; 2V1Z A; 3NI9 A; 2XGN A; 1F98 A; 3Q82 A; 5BOH A; 2ZC4 B; 5EV0 A; 2Y2P A; 1MC0 A; 4GS9 A; 3Q81 A; 4XT2 B; 3GV9 A; 4EU0 A; 1VM1 A; 3A3D A; 4KQR A; 4I3A A; 3IXD A; 2Y8H A; 2HZ5 A; 4PM5 A; 3BFE A; 5EPH A; 4OQH A; 3Q7Z A; 4B9O A; 5AQA A; 4A5R A; 3VE3 A; 5FL3 A; 3EQU A; 4LV0 A; 1KE3 A; 1S66 L; 1LHY A; 2IWD A; 2K31 A; 3D72 A; 4I3J A; 4R3B A; 4EEP A; 2ZLY A; 2PRF A; 3W4P A; 1PZP A; 1VEU A; 3FYZ A; 3MXS A; 3ZYT A; 3G2Z A; 3HVF A; 1K57 C; 4S2J A; 4R3A A; 4OPR A; 1G68 A; 3G34 A; 1WE4 A; 3NDG A; 1XPB A; 2JKT I; 3DTM A; 5KZH A; 1XFQ A; 1JWV A; 2EWW A; 1PW1 A; 4EV4 A; 1IYP A; 1W8Q A; 4HJ3 A; 4BL3 A; 3C2W A; 3T4Q A; 3EGX C; 4M3K A; 4BBU A; 1XJ6 A; 4P6B A; 2PAV P; 1WA9 A; 3CJM A; 4P87 A; 5DFX A; 3DWZ A; 2EX6 A; 2Q9M A; 3QP6 A; 2Z6D A; 3LEZ A; 4E3M A; 2WAF A; 5EVL A; 3G35 A; 1TS6 A; 5J3W A; 1FIL A; 4K08 A; 1K57 A; 3NBL A; 5E2E A; 3LEQ A; 2D01 A; 4GDN A; 2LB9 A; 3K2N A; 2OV5 A; 3WS2 A; 1K25 A; 2YKF A; 5G4Y A; 2W3F A; 4N9K A; 5E43 A; 5HDC A; 4PHT A; 1OTE A; 1MXO A; 1IEL A; 3IF6 C; 4BMW A; 4Y3I A; 1E4D A; 5MC7 A; 2JN7 A; 3TRC A; 3W8K A; 1P9W A; 4HNB A; 5A91 A; 1DJA A; 4ARZ B; 4OOY A; 1P0Z A; 5L8M A; 4CPK A; 4N1X A; 2XA7 M; 4OOM A; 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