4F3PA

Crystal structure of a glutamine-binding periplasmic protein from burkholderia pseudomallei in complex with glutamine
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
226
structure length
223
Chain Sequence
KELVVGTDTSFMPFEFKQGDKYVGFDLDLWAEIAKGAGWTYKIQPMDFAGLIPALQTQNIDVALSGMTIKEERRKAIDFSDPYYDSGLAAMVQANNTTIKSIDDLNGKVIAAKTGTATIDWIKAHLKPKEIRQFPNIDQAYLALEAGRVDAAMHDTPNVLFFVNNEGKGRVKVAGAPVSGDKYGIGFPKGSPLVAKVNAELARMKADGRYAKIYKKWFGSEPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a Glutamine-binding periplasmic protein from Burkholderia pseudomallei in complex with glutamine
rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Burkholderia pseudomallei
molecule keywords Glutamine-binding periplasmic protein
total genus 78
structure length 223
sequence length 226
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f3pA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f3pA02
3MAMA 3MZBA 4LA9A 1J1NA 1QUJA 2HZLA 5M2VA 3PUYE 4HS7A 3TTMA 1GVCA 3KJTA 4OFOA 3IOVA 4KHZE 4X9TA 1P1OA 3PMVA 4ZEBA 1JW4A 1LAXA 4IO6A 3SETA 3PPOA 4P0IA 4ELPA 1CE2A 4GRKA 4IY6A 3IB2A 3CG3A 4XIGQ 3O97A 2WKYA 5HPQA 1R6ZA 1A40A 3BFTA 4GLIA 3RUMA 2RCBA 2REJA 4OETA 3K6WA 3VVFA 5EHSA 3T66A 3QIMA 4PP0A 1RYOA 2QS2A 1ZIUA 1ELJA 2VD2A 3SERA 1YCJA 2OWTA 3LSLA 4R2FA 4R6YA 4EQ7A 3TTKA 3N6UA 2R71A 3AXFA 3W15C 1M5FA 4UACA 2P2AA 3GBBA 3K6XA 4QFKA 2UVJA 5B70A 1OMPA 2GH9A 4JSDA 1DTZA 5H8FB 4M1VA 3RN8A 3FGSA 4UA8A 5CMMA 1B5IA 2UVIA 4BDQA 1Q1KA 2DP8A 4F2QA 2I3VA 2FYIA 4R9GA 4FEBA 3ZS6A 4BDNA 2PX1A 2F97A 3K4UA 4F1YA 3MVXA 1H44A 3PMWA 4LUBA 2ESNA 4F31B 3PUVE 2F34A 1S50A 5JK4A 3QXMA 5I58B 4RA1A 1EZPA 1FW0A 1MQDA 5F7VA 3CFZA 4OESA 2ZNTA 3R26A 3S9LC 3ZKKA 2AYSA 1H3DA 5ITOA 3KN8A 2O6AA 1SD3A 1P99A 4G68C 4FIMA 3A3UA 1II5A 4XXUA 3KZGA 4BDMA 5I59B 4XKRA 5K2XA 2G93A 4R72A 2XXRA 1FTLA 5H8NA 3MJNA 5DVFA 5H8FA 5TP9B 3RLFE 3QAXA 1OIBA 2RINA 5I84A 3TAJA 4IGTA 4HCYA 2DYXA 4XKNA 1R9LA 3N26A 3KSXA 5TU0A 2M8CA 3SESA 3TKDA 4XKPA 1SVXB 3SDFA 3IOTA 2ZYMA 2I0BA 1SW5A 5I58A 4F39A 2ZYOA 3B7DA 2RCAA 4IB2A 3T9XB 4ISUA 3O28A 1B52A 3JV9A 1LFGA 1OQGA 5I59A 5AA2B 3LUYA 4NWCA 4R6HA 3FATA 2UYEA 4R6KA 4R73A 5TP9A 3H6UA 3TCFA 3E13X 5TPAB 5I57B 2AL5A 1JVXA 2XXTA 3OSRA 1FTKA 3U1OA 3MVYA 2OWSA 3VFJA 3KEIA 1SI0A 2B3FA 2NUVA 3OELA 3KFMA 3U72A 2H9BA 2I4CA 2YLNA 1B7HA 4TQUQ 5B7DA 1Y3QA 3IB0A 3QUJA 4JWOA 3PMXA 3KBRA 3LSXA 5IAIA 2OJTA 5JEIA 1H45A 1PBPA 4MBPA 3VV5A 4RK2A 3G7WA 3K6UA 3VE1B 3MVWA 3FV1A 4ZDMA 1ZMGA 3UP9A 3K01A 5I2NB 1RYXA 1BP5A 1Y1MA 3KGCA 1VFEA 3K1MA 2Q2CA 2CZLA 3IOWA 3IR1A 2F35A 4DE8A 3MZ9A 1OQHA 1QVSA 2UYFA 5TPAA 2F6PA 4FJPA 1MXUA 4F3BA 5CBSA 4H67A 4I62A 4FATA 3PPPA 5AA1A 3PD9A 1IITA 4OEVA 3OMBA 4DXCA 1LAHE 4U23A 5FTIA 4YU0A 5AE4A 1S7YA 5CI5A 1EZ9A 2XHDA 1O63A 2QMWA 3C32A 2THIA 2NXOA 4KCDA 2VOZA 4F3PA 2A5SA 3VVEA 3FVOA 3WAFA 3W9WA 3VLUA 1Y4TA 4OFJA 4KI0E 4O3CA 1LAGE 4KFQA 3IO6A 1ZJLA 3RTFB 5L8DA 1M5CA 4Q8RA 3L6GA 2I0CA 4ZE8A 2DWJA 3T9UA 1SI1A 1Y3PA 3KN3A 4ELRA 3SKPA 3O6IA 4OVJA 3Q27A 4H0WA 3K02A 4Z7EA 2PBWA 3HHFA 2Q8JA 4E0XA 1FQAA 1MQJA 2OK2A 3FZVA 2NWJA 1NNFA 1B3FA 3OEMA 4PE5B 3RNNA 2KLFA 4GXAA 2HAUA 2XD3A 2XX9A 3IK6B 3FVNA 4I8CA 4M4GA 3SEXA 4EQBA 3IO4A 2OLBA 4WEDA 4YAHX 1FCKA 4FECA 1IXCA 5CMBA 3OO6A 4ZS9A 4TOZA 4FAJA 4GXSB 3TEPA 4ZEKA 1XHYA 3MP1A 5CM6A 1GR2A 2Y7RA 3E4RA 1N04A 3C4MA 1QULA 4DZ1A 2O84X 2Y7IA 4GF8A 4U4SA 4R2BA 3IX1A 4JWXA 3K1PA 1MM7A 1BLFA 1B51A 2Z8DA 2D5WA 2Z8FA 3CRBA 2Q9TA 4NF4B 2ANJA 4I1DA 5J1DA 2HCAA 4GWOA 1WVJA 1YAEA 4OERA 2VP1A 3O6HA 3G3FA 3C31A 2DE2A 1B2HA 4P0GA 3VLWA 1MPCA 4I9DA 2PT1A 1MQGA 1B7ZA 1LB9A 3C35A 1US5A 1SW1A 4PETA 1Y1ZA 4EQ9A 4EUOA 4NF8B 1B0HA 3UK4A 1OLAA 1YTVA 4RJZA 1I6QA 3S9MC 4JSOA 3TMGA 3MP6A 4OWDA 1MXVA 3Q29A 1B7UA 1JW1A 2QS4A 3G3HA 5I2KA 1CB6A 1B5JA 4MH5A 3HHGA 5DTBA 3DELB 5ITPA 4GD5A 2DOJA 3QYTA 4EXLA 3CFXA 5DEXB 1OLCA 5EYFA 2QMXA 3V8XB 1SQYA 2F5XA 3H03A 4ZE9A 5DVJA 1FTMA 4U1ZA 3Q28A 2CMOA 1SW2A 3OO9A 4NF8A 1QKAA 4FE8A 5KZTA 1B5HA 2P0SA 4RY1A 2Y7KA 2Q89A 3QUFA 2GHAA 4P11A 5AA4B 4QSCA 3KOTA 3GLBA 3FV2A 5BWJA 3KOSA 4Q5TA 4LZ7A 1MY4A 2Z22A 2GRVA 3SEWA 1LB8A 3LBSA 1LFHA 1MQIA 3RTWB 3G3KA 4G8NA 1D4NA 4KYDA 5CRYA 2V25A 2LAOA 4EXKA 4DDDA 2YJPA 3M3KA 3R7XA 4ZEIA 2F6GA 3OXNA 3RGYA 1MH3A 1XVYA 5H8HB 5FHNA 2O69A 5H8SA 3TPAA 3MPLA 1OVBA 2IA4A 1UTBB 5DEXA 4F19A 1SW4A 1IXGA 3TQLA 3FJGA 3RT6B 4YKKA 1XT8A 3I3VA 4YKIA 4G8MA 1HSJA 3D4CA 1OVTA 1FQBA 4RK9A 3MWBA 1B3HA 4MLVA 4H8JA 3EPEA 1NNKA 3FASA 5LOMA 2I6EA 4X1DA 2OCUA 2H4IA 1AL3A 1N76A 3PD8A 3VDFA 3BBRA 5DVIA 3O9PA 4NF5B 1N0TA 4N13A 1PDAA 1B0LA 2OBGA 3DM0A 3FXQA 3PPNA 3T93B 2QS1A 4QF9A 2ONSA 4OXVA 5H8HA 1DPPA 2Z8EA 4RXLA 3CI8A 2W7YA 1UTBA 1N3WA 4KCCA 5H8QB 3ZKLA 1FQDA 4OQOA 3K6VA 3TFLA 1DSNA 3TTLA 1FQEA 1MY2A 3TUSA 1P1WA 4C1UA 1B05A 2F7BA 2GHBA 1R9QA 3V83A 1B6HA 1B9JA 2A5TB 5EHMA 1ATGA 1FTJA 1MPDA 2VD3A 4NE4A 1PBQA 4F29A 3CIJA 1PB8A 4QFOA 5ELVA 4Q30B 1P1UA 3ILUB 3UORA 1JETA 5FTHA 2B3BA 4DCYA 3LC8A 1LFIA 1MY1A 3USDA 3E9XA 3ODBA 3LSWA 4NF5A 4R74A 2H99A 4X48A 2Y7WA 3B6WA 2DE4A 1H43A 3N6TA 2DWHA 4RPOA 1GV8A 4OENA 4DXUA 1H76A 4BDLA 1UQWA 3IAZA 3PPQA 4G2ZA 2FA7A 1NNTA 3H3GA 3MBPA 1O7TA 1URSA 3IB1A 3EF7A 1POTA 1MH4A 2VGQA 1PB7A 4LVQA 1M5EA 2A5TA 3C33A 3T22A 2DE3A 3K0VA 1FQFA 4FEDA 5AA2A 3FUZA 3MVZA 3OOAA 1JQFA 1TT1A 3H6TA 2I49A 5IKBA 4N6PA 1DMBA 1Q35A 5I57A 3OO8A 2F78A 4NEDA 4F3SA 1KWHA 4HW8A 4F1VA 1GGGA 3TDJA 3HN0A 1MDQA 2H25A 4BDOA 5KCJB 2D3IA 4R75A 3Q25A 5I56B 1ZBMA 2DQVA 3M8UA 1UTHB 1Y4CA 3D4GA 5CMCA 1LGBC 1XC1A 1POY1 2HXWA 2XX7A 3JZJA 3VXBA 5BUUA 1A54A 4G4PA 4JWYA 1MXWA 4F3GA 3RY3A 2Q88A 1ZTYA 5I2NA 1IXHA 2VHAA 1LCFA 5JTYB 1XS5A 4GL8A 2DWAA 4H1XA 4YKJA 4DCXA 2Y84A 3G3IA 4LATA 1I6AA 2XXXA 3TODA 3H6WA 1MY3A 1WDNA 1N7XA 5KCJA 4H65A 1S9TA 3ILTB 4C0RA 5I56A 1AH5A 3K1NA 2O68A 1UTHA 1Z7ME 2DXRA 2ZXTA 1B3LA 4JDFA 4QSEA 1DPEA 3MP8A 4IGRA 4EDPA 1ZKBA 3O2AA 2H98A 3HO7A 4MF3A 2DWIA 1IXIA 1DOTA 1Y3NA 5DT6A 2F8DA 3MQ9A 4LZ5A 3EQ1A 3C36A 4QHQA 4ELOA 1F9BA 3TZAA 3T9VA 4QSDA 4ZEDA 2P1SA 4KPTA 4FORA 4Q0CA 1NH7A 5AA3A 4PFTA 1NH8A 3RT8A 1B1XA 3QSLA 3EHUA 1URGA 3Q26A 4ESWA 3VXCA 3OEKA 4GL0A 3VVDA 3QK6A 4YB5A 2I58A 1SDXA 2ZNSA 3TTRA 2E0SA 1SYHA 4U22A 2O7IA 1VSOA 4NMYA 1FTOA 3OD7A 3S9NC 1MPBA 3G3GA 4WKMA 4EF1A 3CFLA 4DXBA 1EZOA 2AIXA 1M5DA 1A8FA 2XXVA 5HBCA 3FJMA 4RNSA 1VE4A 3P7IA 4RPNA 1TWYA 4H6DA 4KQPA 3HV1A 1B32A 3S9EA 4DIGA 1B1HA 5ISUA 4YB6A 3U8QA 3U94A 4X1BA 1NNPA 3PUZE 1PB9A 3O6GA 3FJ7A 2RF1A 1NKXA 4NF4A 1Y20A 3C9HA 2XXUA 1AMFA 2G29A 1RKMA 2ABHA 3CSBA 1A55A 3PV0E 3EHSA 4YMBA 4H5GA 3LR1A 3OENA 3FIRA 2UXAA 4E0WA 2REGA 2XXHA 4IO3A 2DVZA 4OMBA 5L9SA 2QRYA 1P1NA 3TCHA 2HZKA 2PYYA 3IJOB 4IO5A 2Q2AA 1MXZA 4POWA 3O29A 3PUXE 4WXJA 5H8NB 4U4XA 1N84A 1MS7A 4TLLB 3MPKA 3TYHA 3H4ZA 3ONMA 4HCWA 1HSEA 2ZYKA 4PFWA 2DSFA 3T9HB 1IEJA 4NTLA 1FQCA 3MZ1A 1AIVA 3V5AA 2DS9A 3HCQA 3CG1A 4LONB 4IO4A 4R9FA 3IL1B 3N94A 4F18A 1IZ1A 1M5BA 1TXFA 2X7PA 3A09A 4MLQA 3GXAA 1D9VA 3VLVA 4NF6B 5ICQA 4OFLA 3U92A 1B58A 2OZZA 1YPNA 3G3JA 4XTCQ 3OSQA 5F1QA 5AA4A 3FXUA 4OEUA 2AL4A 5CMKA 4ZEFA 1B3EA 1T0KA 4GQOA 1IIWA 2ALUA 3JYRA 1NL5A 4H5FA 1B3GA 3BFUA 5AA2D 5FHOA 4OZ9A 3FXRA 3GBAA 3DP4A 1I6BA 4YB7A 1EH3A 1MY0A 5L9OA 1QJMA 1NMUA 3KG2A 2HAVA 1JW5A 1BIYA 1QUKA 3N5LA 4THIA 4ECFA 1B4HA 2H5YA 3IJXB 3CR9A 2D21A 2X26A 1US4A 1JEUA 1B40A 1GTKA 2QL3A 5KDTB 4NWDA 3F11A 4O3AA 4H8IA 3L6HA 4NF6A 3W9VA 1EU8A 4HTGA 1D9YA 2X7QA 1D3KA 1LAFE 2XXYA 4U1OA 1MXXA 1BTJA 5FHMA 1R1NA 4O3BA 2GFEA 2V3QA 3ECRA 1A7LA 4G68B 2B65A 2IEEA 3LSFB 3PU5A 2F36A 3MC2A 3K00A 3FVGA 4AB5A 3IORA 4GOTA 1SBPA 2UVHA 2O7UA 2I3WA 3TTNA 4LZ8A 5ICTA 3MUQA 4ZZEA 1QW0A 2V93A 4XKQA 3EHTA 4G77A 2DVCA 5CC2A 4F22A 4POXA 3HSTA 3K2DA 1XOCA 3PUWE 5H8QA 2HQ0A 2QSXA 2XD2A 4LP2B 4ELQA 1L5TA 1I69A 2XXPA 1TFAA 3PPRA 5KDTA 3HPIA 3KJ7A 4QFNA 2I4BA 4GIZA 1O64A 4QRZA 1PC3A 3A3CA 4PFYA 3BKIB 1MG1A 4WEPA 2F7AA 3SEUA 1VR5A 3UIFA 1B46A 3MW0A 4YKPA 1ANFA 4F1UA 4LQ5A 4OTEA 4ZZAA 3T96B 2XXQA 3S4UA 2XX8A 1AOVA 3FD3A 4G68A 2FNCA 1ZLQA 5HM4B 1LSTA 2HFBA 1BKAA 1ZU0A 2R6GE 3TQWA 4ZECA 3U93A 2E1SA 4OHNA 1MQHA 4U2RA 4DLDA 3GZGA 4OYVA 5K2YA 4JB7A 2ZMBA 2O51A 4TLMB 3UGWA 5A5XB 4C1TA 3DLNA 1DTGA 3V89B 4QFLA 3S2VA 1NFTA 4BLAA 1IUDA 2F7CA 1TFDA 3TCGA 2DXYA 3PGFA 4JXIA 4ND9A 4EF2A 3R6UA 4BDRA 2QJEA 3UA8A 4IO2A 1MM6A 1WODA 2QS3A 2O1LA 2PMSA 4KR5A 4ESXA 3H6VA 1JEVA 1QUIA 3C34A 4GFRA 4RYAA 4AB6A 4PFUA 4F2OA 3RPWA 1VFDA 3O66A 5DYHA 2XXIA 3WAEA 3IOUA 1XVXA 4IO7A 2UVGA 3E3KA 1MDP1 4G8HA 3DP8A 3H06B 3I5OA 3CSGA 3KN7A 2Z23A 3RQTA 2V84A 1USYE 2RC7A 2ONRA 3SEYA 4KYSA 1USYH 1MXYA 1P1QA 2HEUA 4QFPA 4ONYA 3UN6A 2RC8A 4AQ4A 5A5XA 1LBBA 1URDA 1MRPA 4K3FA 2ONKE 1SYIA 4MFIA 1B4ZA 1Y9UA 1LBCA 2R9JA 2NOOA 3TELA 4KD5A 1PEBA 2BJJX 3I6VA 3B6TA 2O1MA 5JTYA 1UIVA 2XXWA 1N7WA 3H7MA 2QPQA 4IY5A 4YMAA 3M3LA 5L9MA 2ZNUA 2V3UA 3ZSFA 2I48A 3KSJA 2RC9A 4KYEA 5CBRA 2Y7PA 3DP6A 4Z0IA 4GVOA 1Z7NE 4N07A 3CVGA 1IQ7A 2PVUA 1UIUA 1JNFA 4PQJA 3SEVA 4LQ2A 4JBZA 1A99A 2PT2A 4YICA 4L17A 5I2KB 4U21A 2YPNA 3B6QA 1LLSA 1HSLA 3M3FA 3EN3A 2NVUB 3OO7A 1LCTA 3THIA 2ZYNA 2RKMA 4YZZA 1N3XA 1JVYA 2V3TA 3FVKA 1QKBA 1A8EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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