The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
45
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sequence length |
110
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structure length |
110
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Chain Sequence |
MVNWAAVVDDFYQELFKAHPEYQNKFGFKGVALGSLKGNAAYKTQAGKTVDYINAAIGGSADAAGLASRHKGRNVGSAEFHNAKACLAKACSAHGAPDLGWAIDDILSHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Neural hemoglobin
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| publication title |
Carbonmonoxy structure of His100Trp Cerebratulus lacteus mini-hemoglobin
rcsb |
| source organism |
Cerebratulus lacteus
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| total genus |
45
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| structure length |
110
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| sequence length |
110
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-05-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1IWH A; 1XZ7 B; 1MYT A; 1SPG B; 2NRL A; 3PI2 A; 4MQG A; 1QSI A; 3LB1 A; 4F6G A; 4ROL A; 3PT8 A; 2ZSY A; 3A5B A; 1CH4 A; 2ZLT A; 1IBE A; 2D5Z B; 4MQI A; 1EWA A; 4FWX A; 1Y0T A; 2GKN A; 1IT3 A; 1KD2 A; 4N7P A; 1DM1 A; 1Y45 B; 5ILE A; 3KMF A; 5ILP A; 5EUI A; 1MBI A; 2D5X B; 2LH6 A; 2PEG B; 1CBM A; 3MYM A; 5SW7 B; 4KJT A; 4ZVA A; 2H35 A; 1DLY A; 3UHD A; 3K9Z A; 3DUT B; 2G14 A; 2FRI X; 2MGH A; 2NRM A; 2XKH A; 1HCO B; 1XZ5 B; 5EV5 A; 3GLN A; 1YHE A; 2CMM A; 3WCP B; 1Y7D B; 1LFL A; 3KUO A; 1Y09 A; 4NI1 B; 2DHB B; 4HBI A; 3VRG B; 1YIE B; 3VHB A; 1LFQ B; 1A4F B; 4PQ6 A; 4KN3 A; 3HEP A; 1Y01 B; 2ZFO B; 1A0U B; 3WCV A; 1CP0 A; 2VYW A; 4MPM A; 3IC2 B; 3ONZ A; 1Y4V B; 1Y4B B; 1Y8W B; 1CH2 A; 2V1E A; 1O1P B; 1YH9 A; 1DXT B; 1HGC A; 1FDH A; 2D60 B; 1MLU A; 4F68 A; 1CMY A; 1WMU B; 1HLM A; 1GCV B; 1SPE A; 3D4X B; 1MLQ A; 1LA6 A; 1BZ6 A; 101M A; 1HDA B; 1LJW A; 3ODQ B; 1YFF B; 2HBC B; 5HY8 B; 1J3F A; 4FC3 B; 1NQP B; 2G0Z A; 1BZZ B; 1V4U B; 1U7S A; 1HV4 B; 3PI9 B; 1BAB A; 1FAW A; 1A6K A; 3R5I B; 1G0B A; 2V1F A; 1GBU B; 2ZFO C; 2OH8 A; 1T1N A; 1JF4 A; 2ZLV B; 1BZ1 B; 3M3A A; 1BUW B; 3P5Q B; 2HHD A; 3ZHW A; 2ZT3 A; 1CH1 A; 3FS4 B; 1YCB A; 3G4Q A; 3BCQ B; 5E29 A; 1Y0W B; 3NML A; 1GLI B; 3ZH0 A; 1HBI A; 4G1V A; 2QLS B; 5ILR A; 2H8F A; 2R50 A; 1Y5F B; 5E6E B; 2YRS A; 3HC9 A; 1HBH A; 4PQC A; 1Y31 A; 1S5X A; 2ZSX A; 3EDB A; 1UFP A; 1YEN B; 2V1I A; 2HBD A; 3R0G A; 1LTW A; 1HJT A; 2R1H B; 3PEL B; 1HGA B; 1J40 B; 1A00 A; 3AT6 B; 4N7O B; 3O89 A; 2DC3 A; 4NXA A; 1Y7G A; 3MOU A; 3DHT B; 1Y4Q A; 1LFY A; 1Y0D B; 3S66 A; 1ECO A; 1UVX A; 1JWN A; 2R4X A; 2B7H B; 1A3N B; 1Y35 B; 3G4W A; 3QM7 A; 1RVW A; 1HBS B; 2OHB A; 2M6Z B; 2LH3 A; 3A59 A; 1YE2 B; 1W92 A; 3G52 A; 4MAX A; 3GQR B; 4MQH A; 3QM6 A; 5F0B A; 112M A; 1JPB A; 1BBB A; 2GL3 A; 4ODC B; 3D1A B; 1MNK A; 2ZSP A; 2C0K A; 1N9I A; 4M4A B; 3CY5 B; 2ZLW B; 1Y22 B; 1TU9 A; 4G51 A; 2O58 X; 4NI0 A; 4O1T A; 4ROM B; 3IXF A; 2R80 B; 1OUU B; 2W6W A; 2ZS1 D; 2W6V A; 1LFV A; 2AA1 B; 2G3H A; 1O1K B; 1QI8 A; 2MHB B; 2R4W A; 1Z8U B; 1HBR A; 2DXM B; 3UHR A; 3TM9 A; 4OOD A; 3OVU C; 1OBM A; 3CIU A; 1A01 B; 4NK1 A; 2MYB A; 1YDZ B; 2Z6T A; 5EQM A; 1X9F D; 1ECD A; 4UIQ A; 2HBF B; 1GBV B; 3A0G A; 5KER B; 1YEO B; 3TLD A; 1XYE B; 1MWB A; 1NWN A; 1NEJ A; 3UGY A; 1CLS A; 2RI4 B; 1XQ5 B; 4AVE A; 1SDL A; 3UHG A; 1C7C B; 2RAO B; 2W72 B; 1OR4 A; 1S0H A; 5CNF A; 1MBA A; 3SZK B; 3ORD A; 5HU6 B; 1LH7 A; 1DWT A; 4TWV A; 1Y85 B; 1K1K B; 2SPO A; 1NPF A; 1IT2 A; 4L2M A; 2GRF A; 1J3Y B; 3W4U A; 1J7W B; 1UVY A; 4NK2 A; 4MQJ B; 4UZV A; 2SPM A; 4JYQ A; 1QPW A; 3WTG A; 1MLL A; 5IKS A; 3UHQ A; 3NL7 A; 3M3B A; 2Z6N B; 1UIW A; 3KUN A; 1RQA A; 3B75 B; 3S65 B; 2GKM A; 1Y4F A; 1MLO A; 1Y0C A; 3BJ1 A; 1UFJ A; 1Y2Z A; 6HBW B; 3WCU D; 3DR9 A; 1G0A B; 3EU1 B; 1OJ6 A; 1S56 A; 4B4Y A; 2G0R A; 1S69 A; 5E83 A; 1CPW A; 1LFT B; 2H8D A; 1MNI A; 1HDB B; 1ECN A; 4U8U D; 1ABY A; 3QJD A; 4H2L B; 3V2V A; 1A3O B; 1MTJ A; 2HBS A; 1PBX A; 2MYC A; 4ZVB A; 3MKB B; 1JP6 A; 4F69 A; 1QXD B; 3PT7 B; 1N9X A; 1O1I A; 2QFK A; 3M38 A; 1YHU D; 1XZU A; 2ZS1 B; 1MNH A; 4ESA B; 1DXC A; 1S5Y A; 4PQB A; 1M9P B; 3M39 A; 2GNW A; 1X9F B; 4HRR A; 1UMO A; 2HZ2 A; 3UHZ A; 3HEO A; 3G53 A; 3QM5 A; 1TES A; 4N7N A; 3UHN A; 4BJA A; 1LH3 A; 3OO4 A; 5CND A; 2MYE A; 1HGB A; 2D2M A; 1MKO B; 2R4Z A; 1J41 B; 3DHR A; 4F6B A; 2BKM A; 1DXV A; 1CQX A; 4XS0 A; 1Y8I A; 5CMV A; 1ABW A; 4YU4 B; 3G46 A; 2ZS1 C; 1XZ2 B; 5CN4 A; 3QJC B; 1JP9 A; 1Y4R A; 3WCT A; 3ZJP A; 2LH2 A; 1CH5 A; 1YG5 A; 1M6M A; 1MOD A; 1YOG A; 3LR9 A; 1X9F C; 1DXU A; 2KSC A; 6HBI A; 3HHB B; 1O1M B; 1RPS B; 2IG3 A; 106M A; 1J7Y A; 4MU5 A; 2LH1 A; 2BNL A; 2MGA A; 3BJ3 B; 3WCU B; 2DN1 B; 2MGB A; 3G4V A; 3UBV A; 1YEV B; 3UHE A; 5CN5 A; 1DKE B; 1G09 A; 1Y5J B; 3WFT A; 1HBB B; 4U8U B; 2HHB B; 1LUE A; 1YMC A; 4N8T B; 1DTM A; 5AZR A; 2PGH A; 1C7B B; 2D2N A; 5F2A A; 1Y4G A; 1SHR B; 1XY0 B; 4HRT A; 5HLU A; 1VXD A; 1A0Z A; 1BIJ A; 4MQG B; 3GDJ A; 2NSS A; 1O1N A; 2ZLU B; 1IBE B; 4MQI B; 2QMB A; 2HHE A; 2GTL D; 2MGE A; 4MQK B; 4MQC A; 1ITH A; 1BJE A; 3D1K B; 3QQQ A; 5EUI B; 3GOU A; 1XCH A; 1Y7Z B; 1LH6 A; 1JEB B; 3UBC A; 4F4O B; 5ILM A; 3WCU C; 4SDH A; 5JDO D; 3GYS A; 1YGF A; 1V4X A; 2MGJ A; 3UHT A; 3BA2 A; 3HYU A; 2FRK X; 3GQP B; 3FH9 A; 3WCW A; 4U8U C; 3NMM B; 5JGG B; 1IRD B; 1Y7C B; 3HXN A; 1XZ7 A; 2XKI A; 2BLJ M; 1MBC A; 2QRW A; 2ZT1 A; 1QXE B; 1Y0A B; 4MBA A; 1YHU C; 2MGG A; 1JW8 A; 1AJG A; 1B86 B; 1JL7 A; 3PI1 A; 1HAC B; 1MBO A; 5CHR A; 2D5X A; 3VRE B; 4HHB B; 3ZOL A; 4X0L B; 4KMW A; 2PEG A; 2ZT2 A; 5SW7 A; 1J7S B; 2Z6S A; 1O16 A; 3AQ9 A; 1CH3 A; 5CNC A; 1LA6 B; 3LQD B; 3UHI A; 3AG0 A; 1XZV B; 1LJW B; 1L2K A; 2V1K A; 1VWT B; 1AJH A; 4C44 A; 1HCO A; 1XZ5 A; 3WCP A; 1RSE A; 3ZJR A; 2DHB A; 5KDQ B; 2QFN A; 4C0N A; 3UGZ A; 3VRG A; 1YIE A; 3D7O B; 1EMY A; 1LFQ A; 1G0B B; 1A4F A; 4IT8 A; 2ZFO A; 1A0U A; 1T1N B; 1SI4 B; 3IC2 A; 3ZJM A; 1Y4V A; 1HBG A; 1Y4B A; 1Y8W A; 3G4R A; 1YMA A; 1QSH A; 1DXT A; 1CG8 A; 4M4B B; 3VRF A; 2D60 A; 3QJB B; 2BWH A; 2GTL B; 5E29 B; 1WMU A; 3MVC A; 3HRW B; 2QSS B; 1SDK B; 1GCV A; 3D4X A; 3QJE B; 2YRS B; 1MWD A; 1F63 A; 1HBH B; 5AB8 A; 1Y31 B; 1S5X B; 2W31 A; 3WFX A; 1YCA A; 3ODQ A; 2HBD B; 1YFF A; 4GZG A; 2HBC A; 1MLM A; 3ARL A; 5HY8 A; 1MYJ A; 1ABS A; 4FC3 A; 4O2G A; 2ZFB A; 1NQP A; 1BZZ A; 1Y4P B; 1DWS A; 1JL6 A; 1V4U A; 2QU0 A; 3WR1 B; 1LFY B; 1A9W A; 1Y83 B; 3G4U A; 1HHO A; 1HDS B; 1O1L B; 1OUT B; 1GJN A; 1NPG A; 1V4W B; 3AQ5 A; 3UHK A; 1LH1 A; 1BZ1 A; 5D1V A; 1BUW A; 3P5Q A; 4VHB A; 4YU3 B; 3FS4 A; 1CH7 A; 2GTL C; 1MOC A; 3BCQ A; 1Y0W A; 3UH7 A; 1MLS A; 1WVP A; 1NS9 B; 1K0Y B; 1GDL A; 1Y5F A; 1BBB B; 5E6E A; 1MGN A; 1G9V B; 2LHB A; 107M A; 1YEN A; 5JDO C; 1NWI A; 3QZX A; 2R1H A; 3PEL A; 1HGA A; 1J40 A; 2GRZ A; 3S1I A; 2BW9 M; 3AT6 A; 1HBA A; 4L7Y B; 2DN2 A; 1UX9 A; 1MYM A; 4F6F A; 3WFU A; 2AUO A; 1MOA A; 2W6V B; 3PIA B; 1CH9 A; 2VLY A; 1GCW B; 1HBR B; 1F5O A; 1MLG A; 4JAC A; 1COH A; 2B7H A; 5HLX A; 1Y35 A; 2O5M X; 4FWY A; 1HBS A; 2GNV A; 2M6Z A; 3OO5 A; 3PI4 A; 1YOH A; 5EE4 D; 1YE2 A; 2ZSQ A; 2G11 A; 3D17 B; 3GQR A; 2HBG A; 3GQG A; 3QM8 A; 3HF4 B; 4ODC A; 3D1A A; 1NS6 B; 5C6E B; 2HBE B; 4M4A A; 1SDL B; 2EB8 A; 3CY5 A; 3AQ6 A; 1H97 A; 1Y22 A; 3WFW A; 1NIH A; 1VXA A; 1V07 A; 1VXE A; 1AJ9 B; 3NG6 B; 1Y46 B; 3LHB A; 4ROM A; 2HZ1 A; 1FCS A; 2R80 A; 1OUU A; 1X46 A; 2OIF A; 1YEQ A; 1XXT A; 1A6M A; 2AA1 A; 3ZJO A; 1O1K A; 2DXM A; 1X3K A; 3LB3 A; 1MTK A; 1F65 A; 3E5I A; 1V75 B; 1YVQ B; 3NL7 B; 1MLJ A; 1UIW B; 2XKG A; 1OR6 A; 4IRO B; 2HBF A; 4KMV A; 1Y4F B; 5KER A; 1YEO A; 2LH7 A; 1DUO A; 2ZS0 D; 2ZST A; 3MJU B; 2RI4 A; 1GZX B; 1XQ5 A; 3UHH A; 2RAO A; 3MN0 A; 1LFZ B; 1MOB A; 102M A; 3SZK A; 1KR7 A; 2VLZ A; 3NFE B; 1JY7 B; 1BZ0 B; 3ZJQ A; 5CNG A; 1MYH A; 5EOH A; 4NS2 A; 1PBX B; 1Y85 A; 1J3Y A; 1MYF A; 2SPL A; 1CO9 A; 2W72 C; 1LH2 A; 1LHS A; 1G08 B; 109M A; 2O5O X; 1J7W A; 1VRE A; 2MGD A; 2OLP A; 3PI8 B; 1GVH A; 4MQJ A; 1GDJ A; 1V5H A; 1MBD A; 2Z6N A; 1DO1 A; 3B75 A; 3S65 A; 1LHT A; 1YZI B; 1Y5K A; 1FSX B; 6HBW A; 4HRR B; 1C7D A; 1MYZ A; 3EU1 A; 1R1X A; 3AQ7 A; 2OH9 A; 1O1J B; 2WTH A; 2ZLX A; 2AUP A; 4N7N B; 1DUK A; 3H58 A; 4PNJ A; 1LFT A; 3BJ2 B; 3WCW D; 4H2L A; 1A3O A; 1FHJ B; 1AZI A; 2QSP B; 2EVK A; 2NX0 A; 3UH3 A; 3E4N A; 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4N8T A; 3UHY A; 2H35 B; 1C7B A; 1MTI A; 1J52 A; 5EU2 A; 1SHR A; 2W6Y A; 1XY0 A; 2O5L X; 1GDK A; 1YHE B; 2ZLU A; 1YHU A; 5AZQ A; 2D6C A; 1LFL B; 3GKV A; 1Y09 B; 4MQK A; 2V1G A; 2SPN A; 3D1K A; 3U3E A; 1SPG A; 1M6C A; 1Y7Z A; 1JEB A; 2VRY A; 4F4O A; 4WJG A; 1NZ4 A; 2D5Z A; 3WCV B; 3ONZ B; 1Y45 A; 5CN8 A; 1YH9 B; 3KMF C; 1HGC B; 2BMM A; 3GQP A; 3WCW C; 3S48 C; 3NMM A; 1BZP A; 1B0B A; 4WCH D; 1CMY B; 1VXH A; 1CQ2 A; 3RGK A; 5JGG A; 1IRD A; 1Y7C A; 3HEN A; 1NZ2 A; 1MYG A; 3DUT A; 2MGC A; 2MGI A; 1HRM A; 1MLH A; 3OZW A; 1QXE A; 1Y0A A; 2MGK A; 1Y7D A; 1B86 A; 4NI1 A; 1HAC A; 3OZU A; 3ZJS A; 3VAU A; 1QSH B; 1OFJ A; 3VRE A; 1BAB B; 1FAW B; 1CG8 B; 3LR7 A; 4HHB A; 3VRF B; 4X0L A; 3WCV C; 1IRC A; 104M A; 1J7S A; 1O1P A; 1YOI A; 3LQD A; 2HHD B; 1XZV A; 4MXL A; 2VEE A; 1VWT A; 3TM3 A; 3UHX A; 1EBC A; 1A6N A; 3A5G A; 2H8F B; 2Z8A A; 4O4Z A; 2ZFB B; 5KDQ A; 5B85 A; 5M3S A; 4F6J A; 2NSR A; 1MDN A; 3D7O A; 1JZM A; 2QU0 B; 1HDA A; 3MBA A; 1HHO B; 2ZSN A; 4DC7 A; 2G10 A; 3E5O A; 1A00 B; 1SI4 A; 1HSY A; 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