4FATA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Functional analysis of a novel positive allosteric modulator of AMPA receptors derived from a structure-based drug design strategy.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 91
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fatA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fatA02
1ZU0A 1NNPA 2Q89A 2P2AA 1Y1MA 1ZJLA 4ZS9A 1B6HA 4NF8A 3PGFA 1US4A 4HS7A 4IGTA 3UORA 1RYXA 2Y7WA 3S4UA 3ECRA 5TPAB 3SEYA 4R73A 4YKPA 2VD2A 1N7WA 5KDTA 4JSDA 5B70A 4H0WA 3HPIA 5JK4A 2QMWA 4EQ9A 2D21A 5JEIA 1FQBA 2ZYNA 4FE8A 4X1DA 5TP9B 3LSXA 3N94A 1EZPA 3JYRA 3VLUA 3LSFB 2F97A 3KFMA 1LAFE 4OEUA 1FW0A 2CMOA 4XKRA 1Y3QA 5L8DA 4E0XA 4X9TA 4ISUA 4LZ5A 4ELOA 3OO7A 2I0BA 5K2YA 2VGQA 2DSFA 3SEVA 2HEUA 3QUJA 3PMWA 1MPBA 3G3JA 4FEDA 4FATA 5AA3A 4N6PA 3OSQA 5ICQA 1URSA 2VHAA 4LQ2A 3TCHA 4DIGA 1MQDA 2H5YA 2G29A 3K6VA 2H98A 1POTA 5AE4A 3PUXE 1M5DA 2DE2A 2QMXA 3LSLA 4OYVA 3TTLA 1QKBA 1QUJA 3P7IA 4BDRA 3F11A 1Y4CA 1XS5A 3KEIA 1P99A 4QFPA 1Y9UA 2A5TA 1O64A 1DOTA 1H45A 2I3WA 1DPPA 3K00A 4BDQA 3SEXA 3W9WA 1EZOA 3KZGA 5FTIA 2ZNUA 4YB6A 4OQOA 2RCBA 3G3HA 4U1ZA 4R9GA 4YKIA 3CVGA 3U94A 2OBGA 3KGCA 2O6AA 3ZSFA 3ODBA 3H6VA 3N6TA 4QHQA 4K3FA 2VD3A 3MAMA 1FQFA 2ZYKA 3TZAA 5HBCA 4EQ7A 1USYH 3IOVA 3H06B 1IXIA 3OOAA 3PPNA 4ZEKA 3FV2A 4DXBA 3PUVE 1OMPA 2B3BA 3U8QA 1US5A 1ZTYA 3HSTA 1KWHA 2AL4A 4EF1A 2I48A 4NE4A 2DWIA 2D3IA 1D9VA 1MY4A 3V89B 2ANJA 4FORA 1NL5A 1LB8A 2REGA 4GL8A 1LCFA 2KLFA 4G4PA 5J1DA 3QSLA 3TDJA 3MJNA 2ZMBA 4LZ8A 3U92A 3QYTA 1H76A 4HTGA 1QW0A 4U4XA 4NF6B 3KN3A 2ONRA 3KJTA 1XC1A 3R7XA 5I57B 1IXHA 5FHNA 3CFXA 3UGWA 3KN8A 3TCFA 3CIJA 3S9NC 1FTJA 4U23A 1FTLA 3ILTB 3TEPA 2F34A 3C31A 4YKKA 3FUZA 4F3PA 1WVJA 3KG2A 1LCTA 4GF8A 5BWJA 5CI5A 1D3KA 2QS2A 3C9HA 5I56B 3LR1A 3O66A 2HZLA 4O3CA 4PFUA 2RF1A 5ISUA 2R9JA 1GGGA 3RUMA 1DSNA 3O6HA 4FAJA 5CBSA 5AA4A 1MM7A 4DXUA 1MDQA 2THIA 4F19A 4EUOA 3Q27A 2DS9A 3OO6A 3B6QA 3B6TA 5I59B 3BFTA 1WDNA 1S50A 2V3UA 3IO4A 5CMCA 1B51A 1QUKA 4OTEA 3AXFA 1A54A 1M5CA 3TQWA 3ONMA 4YAHX 1MQGA 3JZJA 3IO6A 4UA8A 1B40A 4G2ZA 5I2KB 3E4RA 3TQLA 1TFDA 4PFTA 4AB6A 1ZKBA 1P1NA 3MVYA 1MY3A 3FXRA 3M3KA 4ZDMA 1UIUA 4ECFA 1B9JA 3K6XA 2O84X 1URGA 2HAUA 3IJXB 3TELA 4XKNA 4IO6A 3U1OA 3C35A 1O7TA 2WKYA 1N76A 3K6UA 3C36A 3PUZE 3WAFA 3PUWE 4C0RA 4NWCA 4RY1A 5EYFA 1UTBB 1XT8A 1R6ZA 3DP4A 5CC2A 1N04A 3O28A 2XXYA 1NNTA 4KYDA 4NF4A 5CMBA 1SVXB 3EHUA 1Y20A 4XKQA 3T93B 1FTMA 2DVZA 2Q88A 4YICA 4R6HA 4PQJA 3RPWA 4F3BA 2GH9A 4BDLA 5ITPA 3H6WA 3UA8A 3T9HB 1B3FA 1HSEA 4RYAA 3USDA 1II5A 4EQBA 1IXGA 1H3DA 3THIA 1AL3A 2F8DA 2XD2A 3RNNA 4QRZA 4LQ5A 2Y7KA 3S9LC 3EHTA 1QULA 3DLNA 3T9VA 4JWXA 3RT8A 1BKAA 3PPQA 1N0TA 4BDOA 4MLVA 2ALUA 1IUDA 3TFLA 4R9FA 3UN6A 1MY0A 4XTCQ 3T9XB 1NNFA 4Z7EA 4KCCA 2F6GA 4G68A 4LZ7A 1JEVA 2F36A 4U21A 3HCQA 3FJ7A 3EF7A 4GQOA 3M3LA 2ONSA 1MXWA 3MQ9A 1DMBA 4O3AA 1FCKA 3O6IA 1A99A 4YB5A 2E0SA 2O7IA 3VVFA 4RXLA 3LBSA 3HV1A 1SW5A 5BUUA 3FVGA 4KCDA 5H8FB 4EXLA 4GXSB 1SQYA 3MVZA 1O63A 5I2NA 1VFEA 3C32A 4ND9A 2PMSA 3T96B 3VV5A 4F1VA 5ICTA 4YMBA 5H8HA 2F7AA 2XD3A 1FQCA 4WKMA 3VFJA 4DXCA 3IOUA 4WEPA 2A5SA 5H8QA 1Y4TA 5DEXA 3BBRA 3MW0A 4OERA 1YCJA 3VXBA 5IAIA 3R26A 2ZNSA 1UQWA 4P0IA 3TUSA 1PBQA 4OMBA 1B7ZA 3K1MA 2Q2AA 1NH7A 4U22A 1MQIA 4AQ4A 3RTFB 1NNKA 4ELQA 5CRYA 2GRVA 3FASA 3H3GA 3U93A 3TYHA 5AA2D 3B6WA 3TTNA 1MRPA 2QS1A 3N26A 2XXPA 3MWBA 1PB8A 5I58B 5KZTA 4JSOA 1ELJA 4GXAA 4O3BA 2Z8EA 4Q5TA 3V83A 4THIA 3E9XA 3EHSA 1USYE 3VXCA 3H6UA 1LGBC 3FJMA 4R74A 2VP1A 1J1NA 1SW2A 4JB7A 5F1QA 5KCJA 3SEWA 4LUBA 1M5BA 4OENA 4IY5A 1T0KA 3O97A 3IB1A 3FJGA 1ANFA 1B5HA 1R9LA 4Q30B 4NMYA 4XIGQ 4F3GA 4JBZA 1MXXA 3DP8A 4R2FA 3FVNA 5FTHA 3K0VA 1B2HA 3PUYE 5FHOA 3U72A 4GVOA 1SYHA 4ELRA 1CE2A 1GR2A 1QKAA 3IAZA 1I6QA 1A40A 1UTHA 1A55A 3IJOB 4H5FA 3OEMA 3EPEA 4JDFA 3RTWB 5ITOA 4ESXA 2YPNA 3QUFA 1N7XA 3OXNA 3IOTA 1FTOA 1SYIA 1N84A 2M8CA 2H99A 3K1PA 4GIZA 2ONKE 1DTZA 2UYEA 4MFIA 1QJMA 2RCAA 1LAXA 3PMXA 2F7CA 4JWOA 2B65A 2XXWA 4KYEA 2DQVA 1SI1A 3DELB 3CFZA 4NF5A 2O69A 3BFUA 4QSEA 2XX9A 3UK4A 3B7DA 1I69A 3TTMA 1FQAA 1JVYA 2GHBA 4KYSA 4JWYA 1MXYA 3HO7A 2OWSA 4G68C 2XX7A 4M1VA 1FQEA 4GL0A 1JEUA 4FEBA 1P1OA 3N5LA 3H6TA 5LOMA 4R6YA 4HCYA 3SEUA 2O51A 1QUIA 1JQFA 1SW4A 3ILUB 4H8IA 2Y84A 4F3SA 2I6EA 2I49A 2QJEA 4X48A 4DCYA 2XXXA 5TP9A 4UACA 3R6UA 2XXRA 4IO2A 4LA9A 1B3GA 5H8NA 4KPTA 2XXIA 4H1XA 4KFQA 5L9MA 2REJA 2V3TA 1B0HA 2Q9TA 5M2VA 1XOCA 2H9BA 2O1LA 1BLFA 5DVJA 2ZYMA 3ZKLA 4N07A 1LFHA 2ZYOA 3MPKA 5CMKA 1POY1 1PB7A 1MQJA 1OQHA 3S9EA 3K6WA 3G3IA 1MXUA 3PPOA 4AB5A 2V3QA 4U2RA 2UVJA 5EHSA 3MC2A 4RPNA 3C33A 4QFOA 5CMMA 2Q8JA 1A8EA 4G8HA 1FTKA 1M5FA 1P1UA 5H8HB 4GOTA 5AA2A 3ZS6A 1VFDA 3I6VA 2RC8A 4KR5A 3OO9A 2OJTA 1ZBMA 3QXMA 1N3WA 1MQHA 5H8QB 4NF8B 3K1NA 4H6DA 4NEDA 4RA1A 4GLIA 3RLFE 1P1QA 4C1TA 3IL1B 3OENA 4P0GA 1BIYA 2OLBA 4F39A 3HN0A 3FXQA 1NMUA 5KDTB 2DE3A 3A09A 3D4CA 4I62A 4TLMB 1TFAA 1OLAA 4Q0CA 4H65A 3V5AA 2LAOA 4C1UA 1B58A 3KOTA 3IORA 2QL3A 3T9UA 4IY6A 4QFNA 3FVOA 3GXAA 2P1SA 2XXTA 1IIWA 1JNFA 3Q26A 1AH5A 1MM6A 1MXVA 2FA7A 2AIXA 2DWHA 1D9YA 4RK9A 4OFLA 3K4UA 3OEKA 3EQ1A 3QIMA 2XXHA 1BTJA 1B32A 3KSXA 4G77A 4DE8A 4ZEFA 1H44A 4OFOA 2FNCA 4MH5A 2NWJA 2HFBA 4KHZE 3I5OA 2UYFA 4PP0A 4NF6A 1D4NA 5CM6A 3CG3A 2H4IA 1Y1ZA 4F2OA 2RINA 4F31B 1Z7ME 4I1DA 1JETA 5I57A 2DXRA 2ZXTA 5KCJB 1H43A 2YLNA 3H4ZA 2O7UA 1XVYA 1NFTA 4POXA 4QF9A 1Y3NA 2A5TB 4MLQA 4IO7A 1S9TA 5EHMA 2Z23A 3MBPA 3RGYA 4U4SA 5I56A 1JW1A 4OHNA 3RY3A 3L6HA 4ESWA 1JW4A 3KSJA 2Y7PA 1CB6A 1OIBA 1GV8A 3QK6A 4ZE8A 1PEBA 3I3VA 4EDPA 4G8MA 1XVXA 4OVJA 2UXAA 3E3KA 3CI8A 3MZ1A 4R72A 1GVCA 3Q25A 1SDXA 4QFKA 3RQTA 5TU0A 4EXKA 4F1UA 1MPDA 5B7DA 2DVCA 5I59A 1VSOA 1DTGA 1I6AA 4G8NA 3A3UA 2AYSA 1MH4A 3PMVA 3PD8A 5A5XA 4L17A 4POWA 2FYIA 4M4GA 1SD3A 3VVEA 1OVBA 4WXJA 1S7YA 1SBPA 1YAEA 2DP8A 3OD7A 3CSBA 4NF5B 3KN7A 3GLBA 4YKJA 3MZBA 3LSWA 2Q2CA 3C4MA 1XHYA 2Y7RA 3H03A 3G3KA 2XX8A 5AA1A 2Z22A 1DPEA 1R1NA 3ZKKA 1AOVA 4ONYA 5L9SA 4QFLA 1A7LA 3FZVA 3IOWA 3W15C 2R71A 1LFGA 1UTBA 2HAVA 4FECA 4R6KA 4BLAA 2D5WA 5H8SA 1PC3A 1WODA 1PDAA 4F1YA 1B46A 1MY2A 3UP9A 3G7WA 3HHGA 5F7VA 1OQGA 4DCXA 4TQUQ 3LC8A 4EF2A 3MVXA 1A8FA 2CZLA 2XXUA 4F18A 5H8NB 5FHMA 2V25A 5AA4B 4IB2A 4TOZA 4HCWA 2F78A 1B0LA 4IGRA 5CBRA 5JTYA 2R6GE 4LP2B 1B5IA 3SESA 2Z8DA 4KQPA 1B5JA 2W7YA 4OESA 2DOJA 2XXQA 4YZZA 4X1BA 2I4BA 2PYYA 1MY1A 4RK2A 3S9MC 3VE1B 1SI0A 2DWAA 2F35A 2HXWA 1ZMGA 2QS3A 3FXUA 1B1HA 4H8JA 3DP6A 5AA2B 3VLVA 2QRYA 2PVUA 1MXZA 4YU0A 4LATA 1URDA 1EZ9A 4RJZA 3L6GA 3MP1A 1LAGE 3TMGA 2I58A 4Q8RA 3E13X 2V93A 3TPAA 3H7MA 4JXIA 3MPLA 3SERA 1MPCA 1IXCA 3JV9A 2PT2A 1VE4A 3G3FA 2E1SA 1MDP1 1B4HA 3DM0A 1PB9A 3K01A 2F5XA 5DT6A 1LBBA 3CFLA 3FATA 2ZNTA 5DVFA 4ZZEA 5H8FA 1Q35A 4GD5A 4NTLA 4NF4B 3OELA 3VDFA 3PPPA 2QSXA 2ESNA 4XXUA 1TWYA 1P1WA 1LLSA 4I8CA 1HSJA 4F29A 1LFIA 1FQDA 1RYOA 3FD3A 3SKPA 3WAEA 2G93A 4R75A 2B3FA 4ZEIA 3TTKA 3V8XB 3HHFA 3OMBA 3FIRA 1Q1KA 2HCAA 5DYHA 3CRBA 4I9DA 1VR5A 4NWDA 2DE4A 4IO4A 3T22A 1QVSA 5TPAA 4ZZAA 3SDFA 1B3LA 3O6GA 2BJJX 1B7UA 2DYXA 1IQ7A 5HPQA 1IZ1A 4OFJA 2P0SA 1M5EA 3IB0A 2RC7A 3CSGA 5IKBA 4ZEDA 3O29A 1JW5A 3W9VA 4RPOA 2GFEA 1AMFA 4G68B 1YPNA 1BP5A 5I58A 4R2BA 4DZ1A 2O1MA 1AIVA 1LBCA 4XKPA 3A3CA 4RNSA 4FIMA 4PFYA 3VLWA 3O9PA 2VOZA 3Q29A 1JVXA 4DLDA 4F22A 3PU5A 5I2NB 1PBPA 1I6BA 1TT1A 4PE5B 1OLCA 4Z0IA 2OCUA 3Q28A 3QAXA 4FJPA 2F6PA 4KI0E 2DXYA 5HM4B 3IR1A 2H25A 4H5GA 4DDDA 2YJPA 5A5XB 3LUYA 3FV1A 3S2VA 1Z7NE 4LVQA 1MG1A 3G3GA 4IO3A 3VVDA 3MVWA 5DEXB 3MP6A 4QSDA 1GTKA 4ZEBA 2Y7IA 3GBAA 1R9QA 4U1OA 5ELVA 2X26A 4MF3A 1B3EA 3MUQA 3K2DA 2XHDA 2X7QA 1LSTA 1NKXA 4OWDA 3FVKA 2QS4A 3OO8A 2DWJA 1EU8A 3MP8A 1ZLQA 2IEEA 1HSLA 3KOSA 4IO5A 3KBRA 1OVTA 4GRKA 1IEJA 3SETA 3IB2A 5L9OA 2UVHA 2GHAA 1F9BA 2X7PA 4MBPA 3TODA 3RT6B 4QSCA 1EH3A 2I3VA 4OZ9A 4OXVA 2V84A 3K02A 4BDNA 2HZKA 3FGSA 3UIFA 3O2AA 4WEDA 3M8UA 3TTRA 3TKDA 2OK2A 1B7HA 1N3XA 4YMAA 3D4GA 1RKMA 5K2XA 2UVGA 4KD5A 2IA4A 2XXVA 3PD9A 1UIVA 2OWTA 2NOOA 2OZZA 4GFRA 4GWOA 2NUVA 4P11A 1MH3A 4PETA 5JTYB 4ZECA 2F7BA 2I0CA 5DTBA 1TXFA 3BKIB 3IX1A 1ATGA 1NH8A 1B05A 1ZIUA 4E0WA 1B3HA 4OETA 3KJ7A 1B52A 3CR9A 1SW1A 2NVUB 3GBBA 3EN3A 4LONB 3IK6B 2O68A 2PX1A 3T66A 3TCGA 3C34A 1LB9A 3PPRA 3CG1A 4ZE9A 3N6UA 4H67A 1UTHB 2UVIA 3OSRA 1L5TA 3RN8A 2AL5A 5I84A 3TAJA 3M3FA 1MS7A 4YB7A 4F2QA 4PFWA 3PV0E 2NXOA 2HQ0A 2RC9A 2ABHA 1Y3PA 3MZ9A 1B4ZA 1YTVA 4OEVA 2Z8FA 1B1XA 2QPQA 2PBWA 1IITA 5DVIA 4TLLB 4ELPA 1LAHE 3GZGA 2RKMA 5I2KA 4BDMA 4HW8A 2I4CA 2PT1A 4N13A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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