4FEBA

Crystal structure of htt36q3h-ex1-x1-c2(beta)
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
402
structure length
402
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAMATLEKLMKAFESLKSFQQQQQQQHQHQHQQQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Beta conformation of polyglutamine track revealed by a crystal structure of Huntingtin N-terminal region with insertion of three histidine residues.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Escherichia coli o157:h7
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Huntingtin
total genus 124
structure length 402
sequence length 402
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4febA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4febA02
3M3LA 3OO7A 2UVHA 3TTRA 3FVOA 1MY0A 1EZ9A 2ONRA 4GIZA 3CR9A 2XXQA 1O63A 4NF8A 1N0TA 2ANJA 3RN8A 4EXKA 5AA4A 3C33A 3IB2A 3PD9A 5JEIA 4HS7A 4H5FA 4G68B 2F5XA 2OBGA 5A5XA 2X7QA 5I2NA 4OYVA 4P0GA 4IGTA 4GWOA 2XD3A 4QHQA 4Q30B 3VXBA 2H25A 3C31A 4NF5A 4P11A 1N76A 3HN0A 1QKBA 2NXOA 1UTHA 1MM6A 2HXWA 3MZBA 3HV1A 3BFUA 1GV8A 4U4SA 5L9MA 3OENA 2VOZA 4ND9A 1QW0A 5ISUA 5H8QB 2PVUA 2E1SA 3FJ7A 2NOOA 1M5EA 4ZEIA 4Z7EA 4EXLA 1DPEA 3KGCA 3KJTA 3PUVE 1A54A 1SW1A 2ZMBA 1DPPA 1MS7A 2O69A 4R72A 3O29A 1BTJA 3IB0A 1B2HA 3B7DA 4KQPA 1POTA 2OZZA 2Y7IA 4FEBA 4NWDA 4LQ5A 5M2VA 2PX1A 3TKDA 2HFBA 3FJMA 5EYFA 1NKXA 1TT1A 3E3KA 2A5TA 1MRPA 4U4XA 3RT6B 4R9GA 3FXRA 3IK6B 4NE4A 1B4ZA 4I8CA 3PU5A 4ELRA 4IO6A 4FAJA 1LBCA 2D5WA 2YPNA 4WXJA 1XVYA 2B3FA 4UA8A 4MFIA 1US5A 3N6UA 1R9LA 4ZEKA 2D21A 1EZOA 3B6WA 1LAHE 2PT2A 3H03A 1LFIA 5FHNA 2F7AA 4P0IA 5EHSA 2OCUA 1EU8A 1MY3A 3HPIA 3QYTA 2Z23A 3UA8A 3UK4A 2OWSA 1ZJLA 4FECA 3KOSA 1NH8A 3K6WA 4ZDMA 5KDTB 3H3GA 3K1NA 1WODA 5AE4A 4JWXA 1B6HA 1US4A 1RYOA 1Y3PA 2H99A 4F22A 4X1DA 4F31B 3RY3A 4JBZA 4OWDA 4NMYA 3QIMA 1XVXA 5FHMA 2ALUA 4MLVA 4E0XA 4U21A 2DQVA 2V84A 3TODA 1F9BA 4EQBA 3EHUA 5AA2D 3MP1A 2DSFA 2DWHA 4RJZA 1S50A 5CMMA 2DE3A 1WVJA 2RF1A 4JXIA 4YKJA 4R6HA 1GTKA 2NUVA 3T93B 1AOVA 4NF8B 4R2FA 1QVSA 2QL3A 1M5CA 3EHSA 2UVIA 5AA4B 1IQ7A 2XXIA 3KBRA 5CM6A 4MLQA 1NL5A 3MC2A 3IO4A 3TELA 1AIVA 1QKAA 3Q28A 4ESXA 4X1BA 3GZGA 1I69A 4NF6B 4YKIA 1VSOA 2DE4A 4Z0IA 3PPNA 4G2ZA 4ZE8A 3IOWA 3PMXA 4G8MA 4U22A 1LAFE 1BLFA 4F3BA 2ZNTA 4FJPA 3LSXA 1O64A 1PB8A 3CG1A 4JWYA 3IJXB 2QS1A 3SEYA 2F6PA 3FJGA 5H8NA 3LSFB 2PYYA 3E4RA 2F7CA 2REGA 3EQ1A 5TU0A 1SD3A 1WDNA 1B0LA 2VGQA 4H65A 5KCJB 2XD2A 3UORA 3VE1B 1FTMA 4RNSA 1DMBA 2I0BA 1IXIA 4G8NA 2O1MA 3OELA 2LAOA 1FQAA 1A55A 2W7YA 3Q25A 3IR1A 3OXNA 1USYE 1B3HA 3C9HA 2ONKE 2ZNUA 5DT6A 4H0WA 4G68A 3V8XB 4JSDA 1IXCA 1MY4A 2OJTA 2I0CA 1Y3QA 3WAFA 4OVJA 3K2DA 4PE5B 2F34A 4IO7A 5IKBA 1QJMA 4LONB 4DXBA 3DP8A 4HCYA 5EHMA 2Y7PA 1DSNA 4PQJA 1MQHA 2A5SA 3EHTA 3TMGA 5L8DA 1LBBA 4RPOA 4ISUA 2O84X 2UVGA 4N13A 1XOCA 1L5TA 4OEUA 3UP9A 1I6BA 5FTIA 1B32A 3OSQA 1QUKA 1R6ZA 2DOJA 3CRBA 4FE8A 4IO4A 2Y7KA 4X9TA 1D4NA 2Q2CA 1MPDA 1ZLQA 4OENA 2I58A 5F1QA 4NWCA 4DCXA 1HSEA 4XKRA 3DP4A 3C36A 3T9HB 4G68C 3H7MA 3Q27A 3FV1A 2ZYOA 1A8EA 2F6GA 3R26A 1H76A 3TTMA 1LCTA 1MQDA 3MZ1A 3VVDA 3SEWA 4H6DA 1B3FA 4KYSA 5BUUA 2P2AA 1GGGA 3MBPA 3MPKA 4RA1A 2FNCA 2QSXA 1M5FA 3FVNA 1H45A 3K0VA 4KYDA 2RC8A 3QSLA 5DVIA 2DWAA 3OO8A 1MQGA 1LCFA 3SKPA 1FW0A 1NNFA 1AH5A 3D4GA 3U72A 1JEVA 3FXQA 3I6VA 2F8DA 5I59A 1TFDA 1B40A 2O1LA 2B3BA 5L9SA 3TDJA 3LSWA 2NWJA 1URGA 4LZ5A 5FTHA 3PMWA 3UN6A 4F1YA 1OLAA 5KDTA 4FIMA 1LFHA 5H8NB 1DTZA 1MPCA 5DVFA 2CMOA 3CFZA 4OFOA 2DWJA 2QJEA 4OETA 2ZXTA 2XXXA 3IJOB 2FYIA 1YTVA 5F7VA 4KD5A 4KHZE 2DWIA 4YKPA 4R73A 3MWBA 2RC9A 1H43A 2OK2A 1N84A 4RK9A 3PPPA 2ONSA 4AB5A 3RLFE 5H8HA 2HEUA 2XX7A 3V89B 4HW8A 1PDAA 1FTOA 4OMBA 4R2BA 3MJNA 2Z8FA 4C1UA 4KI0E 2V3UA 1I6AA 2UYFA 4LQ2A 1S9TA 3C32A 1HSJA 5ELVA 1A40A 1BP5A 2PBWA 2UVJA 1P99A 1B1HA 2GFEA 5CC2A 4BLAA 2F7BA 1A8FA 3K6VA 2IEEA 3PMVA 2RCAA 3K4UA 4NF6A 5BWJA 2DE2A 3KZGA 4GD5A 1FTLA 1SW2A 3HHGA 4RXLA 2BJJX 1D9YA 3QAXA 4L17A 1B7UA 2QS4A 3T9VA 1TWYA 1YCJA 2R9JA 2NVUB 5DEXA 4U2RA 4F2QA 4KPTA 2R71A 5I56B 2Z8EA 4ZECA 3DM0A 1XT8A 3QXMA 3FVGA 3G3IA 2HCAA 3USDA 3FATA 5KCJA 4QFPA 4LP2B 3M3FA 4OTEA 2HZLA 4F1VA 2HAVA 2ABHA 3K00A 1Y1ZA 4ZEDA 4LA9A 1N04A 2XX9A 5H8FB 4OEVA 1FQCA 3PUXE 3OEMA 3K02A 1KWHA 1MH4A 1PC3A 3L6GA 4BDQA 3IOVA 3M8UA 3MVXA 5I58B 1SW5A 4N07A 2AIXA 5JTYB 1VFDA 4GXAA 2I48A 2O68A 5K2XA 2V3QA 1T0KA 4H5GA 3PUWE 1B0HA 5TP9B 4KCCA 4H1XA 2ZNSA 1ZBMA 1M5DA 3KN7A 2O7IA 3H6WA 3VLVA 2H5YA 3AXFA 5I59B 3T66A 4QSDA 3V5AA 2Q2AA 2ZYKA 3W9WA 1LGBC 4TLMB 4EQ7A 1SI0A 3N5LA 1LAGE 3O6HA 1SI1A 4QSEA 3I5OA 1DOTA 1N7XA 5B7DA 2HZKA 1AMFA 4F19A 5ICQA 3H6TA 3MVWA 4YMBA 5AA3A 3H6VA 4KCDA 4ZEFA 4LZ7A 3ODBA 2ZYMA 1LLSA 2XX8A 3GLBA 3ZS6A 4O3CA 3U92A 4GL0A 3KEIA 3MVYA 5H8HB 3QK6A 1B5IA 1B3LA 4DZ1A 1MY2A 1URSA 1Y4TA 4OESA 4GFRA 3MPLA 4QFNA 4FEDA 1USYH 1FQFA 3CFLA 3RNNA 1MQJA 5HM4B 2D3IA 4N6PA 2QMWA 3W9VA 3K01A 1RYXA 4KR5A 4GQOA 4BDNA 3G3HA 2YJPA 3EF7A 4FORA 1N3WA 2PT1A 2AYSA 1Q1KA 1MXZA 2E0SA 3CFXA 3FD3A 1JNFA 3MQ9A 4QSCA 1B3EA 4OXVA 3T9UA 3LBSA 1YPNA 1QULA 3CG3A 3H4ZA 2GHBA 4WEPA 5DEXB 1H44A 4YICA 4K3FA 2V3TA 3IO6A 4R6KA 3VFJA 4EUOA 3KJ7A 5I2KA 3FUZA 3CI8A 2Z22A 2M8CA 3RTFB 1OVBA 2THIA 4C1TA 1A7LA 1J1NA 1SW4A 4GXSB 1P1NA 4ZS9A 1OIBA 3Q26A 1HSLA 2KLFA 1JQFA 3IX1A 1NNTA 1PBQA 2I3WA 4DLDA 3OO6A 2UXAA 1H3DA 1JW4A 3L6HA 3S9EA 1B5JA 3TTKA 2F97A 2GRVA 3BFTA 3A09A 4R9FA 3R7XA 5I56A 2F35A 2I49A 2PMSA 3JZJA 4ZZEA 2XXTA 1P1UA 1GVCA 3T22A 2CZLA 1Z7ME 1ZMGA 1IITA 1O7TA 1JVXA 3H06B 1OVTA 1EH3A 3OMBA 4I62A 1B05A 3OSRA 5FHOA 3CSBA 1IIWA 5H8FA 3O9PA 2AL5A 4IY5A 4X48A 1POY1 3TPAA 1SQYA 2XXVA 2VP1A 3TUSA 2IA4A 5I57B 5I58A 1UQWA 4MH5A 5JTYA 1CB6A 1IXHA 2F36A 4THIA 2VD3A 4NTLA 1S7YA 4AQ4A 1OMPA 2G93A 3N26A 4R75A 1D3KA 2XXRA 5TP9A 2F78A 1LAXA 1MXYA 3MP8A 2Y84A 2H4IA 1MXWA 4M1VA 4OHNA 1LB8A 1AL3A 2REJA 3B6QA 4POXA 2DXRA 2DYXA 1MDP1 4G77A 1LB9A 1UTBA 1IEJA 2RC7A 4WEDA 1SYHA 3IB1A 4NF4B 1FQEA 3PGFA 4GL8A 1BKAA 3U8QA 3G3FA 1NH7A 4U23A 4LUBA 1LFGA 2HAUA 4YKKA 3ECRA 1P1QA 4I1DA 2QRYA 4YB6A 3MUQA 4PFTA 1B5HA 5TPAA 4U1OA 4YMAA 3OOAA 3K1PA 5KZTA 1Y9UA 2Q89A 3V83A 2AL4A 3G3GA 4KYEA 3IOTA 5I2KB 5CBSA 4ZEBA 5HBCA 3KSJA 1MH3A 2V93A 2RKMA 1PB7A 3KFMA 4F29A 4Q8RA 3O2AA 1I6QA 2QS3A 4LVQA 3FASA 4ELPA 2DVCA 4JSOA 4RY1A 5CMCA 3FXUA 3FGSA 1MXXA 1UIUA 4EQ9A 1MXVA 5CMKA 5K2YA 4IY6A 3HSTA 5IAIA 4F2OA 4R6YA 1SYIA 1MY1A 2QMXA 1ZTYA 3MAMA 3PUZE 3UGWA 1NNKA 3Q29A 4BDRA 1II5A 2ESNA 4JB7A 2QS2A 1JETA 1PEBA 2ZYNA 4YU0A 3S4UA 1N7WA 4PP0A 1D9VA 1Y4CA 3O6GA 4PFWA 1Y20A 3ILUB 3DLNA 3TCHA 3MW0A 3K6UA 1ZU0A 2RINA 1B9JA 5DYHA 2H9BA 3S9MC 2VHAA 4I9DA 3TCFA 1SBPA 1VFEA 3O66A 4PETA 4LZ8A 3P7IA 2I6EA 4C0RA 3GBAA 3RPWA 3FVKA 3I3VA 4XIGQ 5B70A 5AA1A 1UIVA 3E13X 4NEDA 3KN3A 3SDFA 4BDOA 4QFKA 3HHFA 4RYAA 2UYEA 4GRKA 1ZIUA 5ICTA 1B7HA 3N94A 3SEVA 3KG2A 3RTWB 3GXAA 1URDA 3MP6A 1Z7NE 1LSTA 1FQDA 3CSGA 4DE8A 1DTGA 3TQWA 3SETA 3DELB 4OFLA 4QF9A 3C35A 3THIA 3S2VA 3RGYA 1Y3NA 4GLIA 4HCWA 1SVXB 1VR5A 3RUMA 1JEUA 2I4CA 1UTBB 2P1SA 4ESWA 3F11A 3MVZA 1IXGA 3FZVA 3GBBA 5AA2B 3R6UA 1TXFA 4F18A 3EPEA 4RK2A 3ZKKA 2HQ0A 1B51A 4F3PA 3ILTB 1FCKA 5TPAB 5LOMA 1QUJA 4Q0CA 5I57A 5ITPA 3IAZA 3C34A 3IORA 3T96B 5CI5A 1B7ZA 4F3SA 1GR2A 1MQIA 1NNPA 3K6XA 1P1WA 3KSXA 3TFLA 3LC8A 2O7UA 1FQBA 3QUFA 3PV0E 1JW5A 1QUIA 2DVZA 4ZZAA 3FIRA 1XC1A 3KN8A 3ZKLA 2I3VA 2Z8DA 5H8SA 2RCBA 5L9OA 4NF4A 3U93A 4RPNA 5A5XB 3JYRA 5DTBA 5I2NB 3PPOA 5I84A 4OQOA 1BIYA 3E9XA 2R6GE 1OQGA 4QFOA 4NF5B 2XHDA 2X26A 2Q9TA 1B52A 1M5BA 1UTHB 3TYHA 1VE4A 4LATA 4BDLA 1Q35A 2G29A 4H8JA 3DP6A 3VLUA 3IOUA 2VD2A 2H98A 1ATGA 3S9LC 2XXYA 4U1ZA 5J1DA 3VVFA 4GF8A 1MPBA 3VDFA 4XKPA 3VV5A 2DXYA 4ELOA 3HO7A 1EZPA 4H8IA 2X7PA 3KOTA 3OD7A 3D4CA 3FV2A 3MZ9A 3B6TA 4F3GA 1B3GA 3O6IA 2OWTA 3G3KA 4M4GA 2GH9A 4EDPA 4R74A 3IL1B 4IB2A 1CE2A 1R1NA 3M3KA 3U94A 2V25A 3TTNA 3EN3A 4DCYA 4EF2A 1MDQA 1ELJA 1TFAA 1YAEA 3TTLA 4G8HA 3VLWA 1ANFA 5CBRA 1MXUA 3ONMA 4QRZA 2A5TB 1NFTA 3RT8A 3OO9A 3U1OA 1OQHA 4YAHX 3CVGA 4XKNA 1R9QA 1JVYA 1FTKA 1PBPA 3PD8A 3O28A 4F39A 4MF3A 4YB7A 4TQUQ 3PUYE 1FTJA 1IZ1A 3SERA 2WKYA 3QUJA 1A99A 3TZAA 3LUYA 1B46A 5JK4A 4E0WA 2Q8JA 5H8QA 1JW1A 4XXUA 5DVJA 4O3BA 4EF1A 1IUDA 1MM7A 4OZ9A 4JWOA 1P1OA 4XKQA 2Q88A 2B65A 4GVOA 4UACA 5CRYA 4BDMA 4FATA 4XTCQ 1Y1MA 2DS9A 3SEUA 3BBRA 4AB6A 2GHAA 4ECFA 3K1MA 3SEXA 4G4PA 1RKMA 2XXPA 4OERA 3T9XB 2YLNA 2Y7WA 4POWA 4WKMA 3PPRA 2P0SA 4IO2A 1N3XA 1ZKBA 4Q5TA 3WAEA 3LR1A 3CIJA 3OEKA 4HTGA 4ONYA 3UIFA 2OLBA 4PFYA 3H6UA 4QFLA 4TLLB 2QPQA 2DP8A 5ITOA 1B58A 2O51A 3HCQA 3VVEA 1XS5A 3TCGA 3TQLA 3G7WA 4F1UA 4H67A 4TOZA 4KFQA 5CMBA 5AA2A 4OFJA 2FA7A 2I4BA 4JDFA 3C4MA 2XXHA 4IO5A 5HPQA 3W15C 4GOTA 3VXCA 3G3JA 1MG1A 3LSLA 4YZZA 3SESA 1PB9A 4DXUA 1SDXA 4ZE9A 4IGRA 2Y7RA 4DIGA 1NMUA 1OLCA 3PPQA 3O97A 3S9NC 1XHYA 3ZSFA 4DXCA 2XXWA 4DDDA 3BKIB 3A3UA 4IO3A 2O6AA 3TAJA 3JV9A 1B4HA 4MBPA 4O3AA 3RQTA 4ELQA 1B1XA 2XXUA 3TEPA 3N6TA 3A3CA 4YB5A 4PFUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3M3LA 3OO7A 2P3VA 2XA5A 2UVHA 3TTRA 3FVOA 1MY0A 1EZ9A 2ONRA 1JP4A 4GIZA 3CR9A 2XXQA 4HE1A 1O63A 4NF8A 1N0TA 5IZZA 2ANJA 4PCDA 3RN8A 4EXKA 5AA4A 3C33A 3IB2A 3PD9A 5JEIA 2XWVA 4HS7A 4H5FA 4G68B 2F5XA 2OBGA 5A5XA 2X7QA 5I2NA 4OYVA 4P0GA 4IGTA 4GWOA 2XD3A 4QHQA 4Q30B 3VXBA 2H25A 3C31A 4NF5A 4P11A 1N76A 3HN0A 1QKBA 2NXOA 1UTHA 1MM6A 2HXWA 3MZBA 3HV1A 3BFUA 1GV8A 4U4SA 5L9MA 3OENA 2VOZA 4ND9A 5EQAA 1QW0A 5ISUA 5H8QB 2PVUA 2E1SA 3FJ7A 2NOOA 1M5EA 4ZEIA 4Z7EA 1KA0A 4EXLA 1DPEA 1NV5A 3KGCA 3KJTA 3PUVE 1A54A 1SW1A 2ZMBA 1DPPA 4GBVA 1MS7A 4MCOA 1LBVA 2O69A 4R72A 5I3SA 3O29A 1BTJA 3IB0A 1B2HA 3B7DA 4N91A 4KQPA 1POTA 2OZZA 2Y7IA 2WYKA 3BIHA 4FEBA 4NWDA 4LQ5A 4GWSA 5M2VA 2PX1A 3TKDA 2HFBA 3FJMA 5EYFA 2CZKA 1NKXA 1TT1A 3E3KA 2A5TA 4JVDA 4O7MA 1MRPA 1K9YA 4U4XA 3RT6B 4R9GA 3FXRA 3IK6B 4NE4A 1B4ZA 4I8CA 5IZ3A 3PU5A 4ELRA 4IO6A 4FAJA 1LBCA 4OVQA 2D5WA 2YPNA 4WXJA 1XVYA 2B3FA 4UA8A 4MFIA 4MJOA 1US5A 3N6UA 2V4CA 1R9LA 4ZEKA 2D21A 1EZOA 1NUWA 3B6WA 1LAHE 3EKIA 4OVTA 2PT2A 3H03A 1FPEA 1LFIA 5FHNA 2F7AA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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