4FIMA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with celecoxib acid at 1.80 a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with celecoxib acid at 1.80 A Resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 117
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fimA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fimA02
5ELVA 1B40A 2VP1A 4MBPA 1PB9A 1OVTA 3KJTA 2V3QA 2PYYA 4O3CA 5EHMA 4R9FA 1B1HA 1QUIA 3FXQA 1UQWA 1EU8A 2G29A 3EF7A 4ZE8A 3TCFA 3PUXE 3C4MA 3IB1A 4QFNA 1NMUA 3TUSA 1MQGA 4H0WA 4DE8A 2GHAA 1ANFA 3KFMA 2ZYKA 5AA4B 3M3LA 2PBWA 2B3BA 3S4UA 1BIYA 4G77A 3TZAA 3SETA 1Y9UA 3V89B 1NFTA 3V5AA 4OZ9A 3CG1A 2VGQA 5HM4B 1BP5A 1LCTA 5TP9B 4EUOA 3MVZA 2XXQA 2XXPA 4F31B 5CC2A 2WKYA 3MW0A 3ZSFA 2XD2A 5TU0A 3A3CA 5ICTA 1QJMA 4RJZA 1SW5A 2E0SA 4X1BA 3UIFA 5I84A 1QUKA 4F19A 2ESNA 3QK6A 5LOMA 2ONKE 4GL0A 1NH7A 3U72A 1P1UA 4EF2A 4FJPA 5BUUA 1A54A 1QKBA 5CMKA 3PUWE 4YKPA 3K1PA 1J1NA 2Y7RA 1HSJA 3FUZA 5L9MA 3FD3A 3QUJA 1DTGA 1JETA 1POTA 3EHSA 4KYSA 3SKPA 1B3GA 3Q26A 1MXXA 2GRVA 3ZKLA 4RK2A 3LC8A 4F1UA 1NH8A 2A5TB 1RYOA 5L9OA 4KYDA 1BKAA 1LB9A 5ICQA 2XXYA 1SYHA 3H7MA 3B6QA 1LCFA 4ONYA 2I58A 4C0RA 1B3FA 4F39A 4N13A 5CM6A 3G3HA 5BWJA 3FVGA 4IGRA 3OXNA 1A55A 2I4BA 5K2XA 5A5XA 4GL8A 2RC7A 3KGCA 2DWAA 4QRZA 3HSTA 4JB7A 2UVHA 5KDTB 3RUMA 4U4XA 3W9WA 4LZ7A 2Z22A 5AA1A 4YB7A 3K01A 5HPQA 2HAUA 1IXIA 1R6ZA 3KG2A 2XHDA 3IJOB 2NVUB 2UYFA 3TTKA 1SI1A 1SBPA 2XX7A 3H4ZA 4ESWA 5KCJB 3DM0A 2I48A 4F1VA 3U93A 1MY1A 3THIA 3FXRA 4EXKA 2HFBA 4KFQA 1IUDA 1EZOA 5I59B 2F6GA 3K00A 3KSXA 1A7LA 4P0IA 3O9PA 1EH3A 2ZNUA 3IJXB 4MLQA 2QSXA 1B4ZA 4IO7A 5IKBA 4R2FA 4FEDA 4PFUA 4NF6B 3PPRA 3KSJA 2V93A 1B4HA 4QSEA 3MP1A 2O7UA 3DP6A 5I56B 3OO6A 5H8NA 4ZS9A 3TCGA 1OQGA 4RPNA 4HCWA 3ECRA 4JBZA 1WVJA 3ODBA 2ONSA 2OLBA 4IO4A 2LAOA 2OK2A 4BDRA 3K6VA 1QKAA 4H5FA 4I8CA 4L17A 3QYTA 4Z0IA 4H6DA 2V3TA 5B70A 3Q25A 1B6HA 3CVGA 4BDOA 3K1NA 1QULA 2DP8A 3UP9A 3VLWA 5I57B 1SQYA 2V3UA 1A8FA 2F7AA 4K3FA 2IEEA 4WEPA 1XOCA 4LUBA 1MPBA 2DVZA 1YPNA 3PD9A 3VE1B 4GOTA 4ZEIA 2YJPA 1H43A 2V84A 5DYHA 4GIZA 1S9TA 3JYRA 3MJNA 3L6HA 3SEVA 1EZPA 4IB2A 1USYH 4EXLA 2QMWA 3TFLA 5B7DA 2I0BA 3VLUA 4GXSB 4XKQA 3OEMA 5I2KA 3H03A 3HN0A 1ZKBA 1FQCA 2HAVA 4F3PA 2PT1A 2QS2A 5I2NA 1MDQA 2DVCA 2NWJA 2I49A 1ZBMA 4DXBA 1DTZA 2D5WA 3L6GA 3E13X 3EN3A 1UTHA 4R2BA 4IY6A 1NNFA 2QS3A 4KCDA 2VD3A 1NKXA 5H8SA 1ZLQA 4G68C 1US5A 4OHNA 3DP4A 3K02A 4M4GA 2RINA 2RC9A 3M8UA 2REGA 4G8MA 2YLNA 1P1OA 4OESA 4C1UA 4H5GA 1A40A 1B51A 2OCUA 4TLMB 1YAEA 1MY4A 1Z7ME 3C34A 3F11A 3HCQA 1NNPA 1B58A 3N26A 1Y1ZA 1MXWA 3MBPA 4KR5A 5AA2D 3SEXA 1R9LA 3S9LC 3M3KA 1SD3A 2PX1A 4PQJA 5KZTA 3UGWA 2DSFA 1B5IA 4GVOA 2XXHA 3SERA 4KPTA 1NNTA 4H8JA 1IITA 1A8EA 4NF4A 3FJ7A 3FVNA 4U21A 3FVOA 4G4PA 3TPAA 1RYXA 3QUFA 4U1ZA 3WAFA 4DCXA 5H8FA 2P0SA 5TPAA 1MPCA 1UTBA 3OELA 5EHSA 1N76A 4NMYA 3FZVA 4QF9A 3IX1A 1MDP1 3PPNA 3TELA 3P7IA 1IIWA 3EHUA 4Z7EA 4ESXA 3FV2A 3VFJA 4YMBA 2DYXA 4F29A 2OZZA 5DEXA 4DXCA 4QFKA 3UK4A 3VVFA 1I6AA 4NF8A 5ITPA 2GFEA 3SEUA 1LAFE 3ZKKA 3OMBA 3K6UA 4ISUA 1B3LA 2DWIA 4TLLB 3IOWA 2XXUA 3A09A 4R75A 2R9JA 2GH9A 1XS5A 1ZTYA 1N3WA 1S50A 2ZMBA 3TAJA 1XC1A 2KLFA 2DXRA 1N04A 3IOUA 4FEBA 4I1DA 1D9YA 3FJMA 3PUVE 3S9NC 5CMBA 3QAXA 5AA4A 1MXZA 4MLVA 5DVIA 3G3FA 3N6UA 3RNNA 1QW0A 4R6YA 1TFDA 1IEJA 1FQAA 2H5YA 2HCAA 5CRYA 3C9HA 1FTMA 1FQDA 3DELB 1JW1A 2O6AA 2F35A 1MH3A 2QRYA 3Q27A 4YU0A 3TEPA 5TP9A 1AMFA 1URSA 1MQJA 3UA8A 4IY5A 4IO6A 4YKKA 2VHAA 3TTRA 4OVJA 1FTJA 4POWA 4KYEA 1MXUA 5EYFA 5H8HB 3CSBA 1XHYA 3S9EA 4P11A 4OXVA 3RTFB 4ZEKA 3T96B 1DPPA 1F9BA 4N07A 2THIA 2RKMA 1MQHA 4LVQA 4JSOA 3C36A 4EQ9A 2X7PA 1Q35A 2F7CA 4NTLA 4G68B 3MP8A 3OEKA 2Y7IA 1P1NA 3K6XA 1B5JA 4F22A 1JNFA 1LBBA 4ZDMA 2I3VA 4YB5A 4F18A 1POY1 4H8IA 2HZLA 4XTCQ 1R1NA 1B46A 4NF5B 2A5TA 4OYVA 1I69A 5JEIA 4MH5A 1JEUA 2XXVA 3VDFA 1DOTA 2O1MA 4R73A 4U4SA 3N5LA 1IXHA 3H06B 3RLFE 3OO8A 4LQ2A 4ELOA 1LB8A 3CR9A 3PMWA 2ONRA 2H4IA 4RY1A 1ZIUA 4M1VA 5AA2A 3MP6A 5KDTA 3QIMA 4X9TA 4YKJA 5FTHA 3FASA 2DE3A 4DCYA 2NXOA 2RCBA 3R7XA 1WDNA 3MVWA 1B52A 1JVYA 4OFLA 1SYIA 1AIVA 2DOJA 5H8QB 3RQTA 3IORA 4E0XA 5L9SA 3CFXA 5KCJA 3T22A 1LFHA 3RT8A 1JW5A 2CMOA 3H6WA 4OENA 1S7YA 1VFEA 1B0LA 3PD8A 5I59A 4FE8A 2DQVA 3PPQA 5CI5A 4GRKA 4LP2B 1LSTA 3N6TA 1MXVA 1N0TA 5F1QA 2F34A 1JQFA 1FQFA 4QSDA 3S9MC 1SVXB 2NOOA 4YB6A 1LFGA 4U22A 2QS4A 4NF6A 5I58B 4BDMA 3T93B 4RPOA 5I56A 2Q88A 1ZJLA 3FXUA 2ZYNA 1LAXA 4IO2A 3SEYA 1P99A 3C31A 1TXFA 3RPWA 1JVXA 3O6HA 3CRBA 3HV1A 5DT6A 2F5XA 2ZYMA 5JTYB 4DZ1A 3RTWB 3IO6A 5I57A 1MXYA 4OEUA 3B6TA 1WODA 1HSEA 1MRPA 5ITOA 2UVJA 1A99A 3V8XB 4G2ZA 3BBRA 3IB0A 3Q28A 3G3IA 1SW4A 4UA8A 4KQPA 1N7XA 2Z8DA 3MVYA 3HPIA 1MQIA 4GQOA 3H6VA 2AIXA 3K4UA 1OLCA 4F3BA 3BFUA 2PT2A 3USDA 1GTKA 4R9GA 1MY3A 1B7HA 3OO7A 2RCAA 4IO5A 3DLNA 4AB6A 3V83A 3MUQA 4EDPA 3O97A 1DPEA 1XT8A 3UN6A 3MC2A 1N3XA 4XXUA 4KI0E 3H3GA 1M5CA 1ELJA 1PDAA 5AA3A 3VVEA 3D4CA 5CMCA 3ILTB 4N6PA 3EHTA 2O69A 3TQLA 3FGSA 3IL1B 1B3HA 2OBGA 4NE4A 3JZJA 2XX9A 1M5DA 3QXMA 3T9HB 1I6QA 1OMPA 3PMVA 5FHOA 4F2OA 4ZZEA 3PV0E 2H25A 3JV9A 2UYEA 4PE5B 2YPNA 4ZZAA 3U94A 3FJGA 4HCYA 1LBCA 3LBSA 4DIGA 3H6TA 3LUYA 4UACA 1SW2A 1N7WA 1LAHE 2REJA 1GVCA 3VXBA 2G93A 3TCHA 3KN7A 3TKDA 2UVGA 4NWCA 2VD2A 1SI0A 4GWOA 1I6BA 4TOZA 1GR2A 4PFYA 4JWOA 3O29A 2XXIA 1MS7A 2Z23A 3IOVA 1QUJA 1Y1MA 3HO7A 1RKMA 3PMXA 4C1TA 1B5HA 1VR5A 1O64A 5K2YA 1Y4CA 3RN8A 1UIVA 2QS1A 1T0KA 2UVIA 4JWXA 5HBCA 3KJ7A 3M3FA 3CFLA 3HHFA 5ISUA 4U1OA 4ND9A 1B7UA 1XVYA 2ZNTA 5FTIA 4OQOA 1FTLA 1N84A 4WEDA 1GV8A 4H65A 2O84X 4LONB 3EPEA 3B6WA 3R26A 1PBQA 5FHNA 3MZBA 4THIA 4FORA 2Y84A 4NWDA 5J1DA 2FYIA 5L8DA 3PU5A 2AYSA 1ZMGA 3G3JA 4R6KA 2O1LA 4DXUA 3U8QA 1VE4A 4OERA 2B65A 4O3AA 4R74A 2H9BA 2PMSA 3TDJA 1OLAA 1JEVA 1CB6A 1MY2A 3LR1A 1XVXA 1H45A 1NL5A 4FECA 1B0HA 3C32A 3I5OA 2XXTA 3RGYA 4GD5A 4H67A 1B2HA 4Q0CA 4RK9A 2D21A 3KZGA 2H99A 3K0VA 1FCKA 2I6EA 3LSWA 1DMBA 3S2VA 2ZYOA 4EQ7A 3BFTA 1ZU0A 3KOTA 1MPDA 4GLIA 3K6WA 4YZZA 3LSXA 4XIGQ 3GLBA 5AE4A 3LSLA 4ZEFA 2P2AA 1PB7A 3PPOA 2O68A 3SESA 4OTEA 4YAHX 1OQHA 1BTJA 4G8HA 4DDDA 4BDQA 3CI8A 1URGA 3G3KA 2F78A 3TQWA 3FV1A 3T9UA 2DWHA 1GGGA 2H98A 1URDA 2DWJA 3GZGA 4HS7A 4F2QA 2QPQA 1H3DA 1YCJA 5CMMA 2UXAA 1D3KA 1NNKA 5H8HA 1LAGE 3O66A 2HQ0A 4WKMA 3CFZA 1Y4TA 3C33A 2XD3A 4ELQA 1IXCA 3UORA 4OETA 3R6UA 1B32A 3C35A 4G68A 3SEWA 1B7ZA 3AXFA 2I4CA 3IB2A 3IOTA 4OFOA 2F6PA 3I6VA 4QFOA 1Y3QA 2D3IA 4NF5A 3KN3A 1US4A 2Q9TA 3GBBA 1MM6A 1LLSA 2F97A 5A5XB 4POXA 1H76A 4E0WA 4BDNA 3KOSA 4R72A 1O7TA 3OO9A 3RT6B 2OJTA 4BDLA 3N94A 4JXIA 4WXJA 2Q2CA 3K1MA 4ZECA 1SDXA 4RXLA 2ALUA 5AA2B 1FTOA 3B7DA 1FTKA 3PGFA 3KBRA 1VFDA 2DS9A 4X1DA 4HW8A 1AL3A 3D4GA 3MAMA 2IA4A 3TMGA 4FATA 3FVKA 4O3BA 1FQEA 3TTNA 2Z8EA 5H8QA 1Q1KA 4YKIA 3VVDA 2FNCA 2B3FA 4EQBA 3W15C 3DP8A 3MZ1A 3RY3A 2I3WA 4Q30B 1PB8A 2QL3A 1VSOA 1Y20A 1M5FA 1ATGA 2Q8JA 3VV5A 2X26A 4RA1A 4P0GA 4LATA 3ILUB 4DLDA 3G7WA 4ZEBA 4MFIA 2AL4A 4U2RA 5CBSA 3E4RA 4BLAA 2O51A 4KD5A 2R71A 1MY0A 1TWYA 1H44A 3O28A 3ONMA 4ELPA 2A5SA 3CSGA 3IAZA 5I58A 1AOVA 5H8NB 1TT1A 4AQ4A 3OOAA 2VOZA 5DVJA 2ZXTA 4FAJA 4F3GA 1USYE 3IR1A 4GFRA 3FATA 4GXAA 1JW4A 3A3UA 3KEIA 4JDFA 1R9QA 4PETA 1O63A 5CBRA 3MQ9A 4JWYA 1M5EA 4Q5TA 5JTYA 4YICA 2F36A 1SW1A 2GHBA 3T66A 4FIMA 2PVUA 1IZ1A 4TQUQ 3E3KA 5IAIA 4EF1A 2HZKA 4JSDA 3Q29A 1IQ7A 4LQ5A 2Q89A 2FA7A 4H1XA 3W9VA 1P1QA 2HEUA 1CE2A 2P1SA 1FQBA 1MH4A 4NEDA 2QJEA 3H6UA 4RNSA 1KWHA 3QSLA 4F3SA 5I2KB 2R6GE 1PC3A 3T9VA 2ZNSA 2Y7KA 1M5BA 3OENA 1TFAA 2XX8A 2DE4A 2XXRA 4QFPA 1LGBC 4ZEDA 5I2NB 3IO4A 3TYHA 2NUVA 2M8CA 3U92A 3OSRA 1BLFA 1L5TA 3O2AA 4IO3A 3ZS6A 1DSNA 1OVBA 3T9XB 1AH5A 1UTHB 2Y7PA 3U1OA 4AB5A 1B1XA 4IGTA 5FHMA 2Q2AA 3O6IA 1MQDA 3MPKA 3CG3A 1B3EA 3PUZE 3EQ1A 4OEVA 4PFWA 4I9DA 3TODA 4LZ5A 1LFIA 3MWBA 1QVSA 2DXYA 1UIUA 3OSQA 4QFLA 4XKPA 2O7IA 4LZ8A 3KN8A 2Y7WA 4F1YA 4XKRA 4Q8RA 4LA9A 1Z7NE 4ECFA 3IK6B 3VLVA 2F7BA 4QHQA 1MM7A 1P1WA 4GF8A 1PBPA 3MZ9A 3VXCA 1B9JA 1IXGA 3TTMA 4PFTA 2X7QA 2E1SA 4PP0A 3G3GA 4NF4B 1Y3NA 2RC8A 4RYAA 2HXWA 2XXXA 2ABHA 5DTBA 5M2VA 4MF3A 1HSLA 3E9XA 2RF1A 5H8FB 4X48A 4OMBA 2V25A 5TPAB 2BJJX 2CZLA 1UTBB 2ANJA 5DVFA 3BKIB 3I3VA 2I0CA 1II5A 1Y3PA 4YMAA 3PUYE 4G8NA 2AL5A 1D9VA 5F7VA 2XXWA 3MPLA 3MVXA 2QMXA 3K2DA 4HTGA 4I62A 4OWDA 3SDFA 1FW0A 3TTLA 2OWTA 1PEBA 5JK4A 2Z8FA 4R6HA 3FIRA 1OIBA 1MG1A 4ELRA 3O6GA 4QSCA 1EZ9A 3GXAA 3PPPA 3GBAA 2F8DA 3WAEA 3OD7A 3HHGA 4KHZE 3CIJA 3LSFB 5DEXB 4OFJA 1B05A 2DE2A 2W7YA 1D4NA 1YTVA 4NF8B 4XKNA 4U23A 2OWSA 4ZE9A 4KCCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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