4G2ZA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with mefenamic acid at 1.90 a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Mefenamic acid at 1.90 A Resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 117
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g2zA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g2zA02
3FV1A 3TCHA 1LSTA 1ATGA 4O3AA 1P99A 2GHBA 3N94A 5DTBA 1FTOA 4JXIA 4I9DA 4HW8A 2O7IA 2QS3A 1XVXA 4JDFA 4KD5A 4R73A 1R1NA 3K1MA 5L8DA 1A8FA 4U4SA 1PC3A 3JZJA 4HTGA 1A99A 1TWYA 2XX7A 1JVXA 4PP0A 5FTIA 4ECFA 3ECRA 3MBPA 4PETA 5I57B 1OMPA 2I0BA 3K00A 2ONRA 1TT1A 4ISUA 3Q26A 4KYEA 1UIUA 1OIBA 2RCBA 3FXRA 1IITA 2VGQA 1QKAA 5AA2A 3BKIB 4QHQA 3F11A 2OZZA 3EHTA 3TZAA 1B7HA 2OWTA 4C1UA 3H6TA 3KJ7A 2H4IA 3SEXA 2HAVA 1LAFE 3QK6A 5TP9A 3MJNA 1XS5A 5FHNA 3U92A 1TFAA 2O1MA 4RYAA 3RTWB 1SBPA 2DE4A 1GVCA 4I8CA 4NEDA 4M4GA 4F29A 3IB0A 2QMWA 4U22A 1N3XA 4U23A 4NF8A 4R2BA 3O29A 1H43A 5JTYB 3O6GA 1B0HA 4RPNA 1MQHA 2H99A 3O28A 5AA3A 4OEUA 1Y3PA 3B6TA 3IAZA 5I84A 4DE8A 4KYDA 1SD3A 3IOWA 3UGWA 3KOSA 2G29A 1P1OA 2QJEA 3C33A 4EUOA 3O6IA 2HFBA 4DCYA 3T66A 2A5TA 3OEKA 1I6QA 4ZEKA 3PGFA 3TUSA 1FTJA 3M3KA 1FQEA 3EN3A 3MQ9A 1DMBA 1YPNA 2THIA 4GFRA 2P2AA 4EF2A 4JB7A 4G2ZA 1D9YA 4EXKA 1ZKBA 1UIVA 2V3TA 1XT8A 3JYRA 3V5AA 3W15C 1O64A 4F1YA 4FAJA 3QYTA 2DWHA 2FYIA 3K6XA 2RC9A 1EZ9A 5I57A 2XXWA 4U1OA 1MH3A 2X7PA 3C32A 1GTKA 4JWYA 1DSNA 5I58A 3T9UA 1MM6A 4X1BA 4YMAA 2CMOA 1BLFA 3O97A 3W9VA 4LZ5A 3MC2A 5F7VA 3PMWA 1VFDA 1BIYA 3KZGA 4R9GA 3RN8A 3E9XA 4RXLA 3EQ1A 4YB5A 3H06B 3PMXA 4FEBA 4K3FA 2IEEA 1US4A 4O3BA 4YICA 4P0IA 3G3FA 2Q2AA 3A09A 1MXVA 4XIGQ 4C0RA 5BWJA 4POWA 2HQ0A 2QS4A 2I4CA 4DXCA 1I69A 2PVUA 4MH5A 4F3GA 4XKQA 1A7LA 2AL4A 2ZNTA 3SEVA 1VFEA 3IX1A 4DIGA 1JQFA 4H65A 1QULA 2AL5A 1MM7A 1URSA 1PBPA 4F2QA 2PYYA 3IB2A 3MZ9A 5KDTB 3DP4A 1QJMA 3RGYA 1Y3NA 3TKDA 1GV8A 4ZE8A 4UACA 3MUQA 2R6GE 4R75A 3Q27A 3FIRA 3P7IA 4IO3A 1SW2A 5DYHA 3EHUA 1RYOA 2CZLA 5I59A 3MZBA 3MVZA 1IXCA 3KN8A 2WKYA 3SDFA 4AB5A 4PFUA 2XXPA 2O6AA 2RCAA 2DSFA 2HZLA 4QSDA 1NKXA 1QUKA 5ICTA 5ITPA 4F18A 3KSXA 5K2YA 4QFKA 4YKKA 5TU0A 3U8QA 3TTMA 1LFHA 1IUDA 4G8HA 3QUFA 4AQ4A 4ZECA 4ZZEA 4XTCQ 5CRYA 4C1TA 1QUJA 1B7ZA 5CBRA 1NH7A 2OLBA 3HSTA 1FTMA 2DVZA 3BBRA 3UA8A 4BDRA 2Y7WA 5BUUA 2REGA 3GBAA 3MP8A 4YB6A 3Q28A 4GQOA 1HSEA 1I6AA 5J1DA 3QAXA 1MY1A 3VXCA 4ND9A 4TLLB 4QSCA 3TAJA 4ZEDA 4Q0CA 2UYFA 4N13A 3OO8A 3TELA 1OQHA 1FQDA 2AYSA 4BLAA 2X7QA 3VE1B 5AA2B 2ZYMA 3LUYA 5EHSA 3R7XA 3M3FA 2ONSA 4KR5A 1LCTA 2RC8A 1SQYA 4UA8A 3RLFE 4ZE9A 1XC1A 3JV9A 3C36A 1MH4A 1H3DA 5TP9B 1XVYA 5KCJA 1N84A 2I0CA 1P1NA 5DVFA 1PB8A 1PB9A 2I49A 4Q8RA 1R9LA 2GH9A 3U94A 1FTKA 4LP2B 3THIA 1Z7ME 5TPAA 3FZVA 3GBBA 4FIMA 3UP9A 2GFEA 2QMXA 4P11A 3K1PA 3DM0A 2DP8A 5H8NB 4DZ1A 2H25A 3PUXE 1XHYA 2ZXTA 3HHGA 4MLQA 4X1DA 3FVGA 1PB7A 3L6HA 5B70A 3CG3A 2DQVA 4AB6A 5I56B 5K2XA 1M5EA 3TODA 1BTJA 2A5TB 2F35A 2P0SA 1UTBB 3KG2A 3IR1A 4FECA 3U1OA 1SVXB 4BDOA 4OVJA 2UVHA 3W9WA 1IXIA 1ELJA 3GZGA 4ZEBA 1Y1ZA 4OMBA 4PQJA 4XKRA 2VD2A 2I58A 4RA1A 1A54A 4YU0A 3C34A 1O7TA 4F39A 2P1SA 2F34A 2XX9A 1YTVA 2OBGA 3VVEA 3SEYA 2Z8EA 3O66A 1URGA 3RTFB 3IJOB 1Q1KA 5I58B 4DCXA 1FW0A 4WEPA 1TXFA 4H6DA 1SYIA 4JSDA 4EQBA 4U4XA 3IB1A 4MLVA 1IEJA 1JEVA 3LC8A 1VE4A 1MXXA 3GXAA 3HO7A 3TDJA 3VVFA 3LSWA 1SI0A 1SDXA 5CMKA 3OO7A 4ZEIA 1SW1A 3FJ7A 4MBPA 1S7YA 2Y7KA 3PPNA 4R74A 5I2KB 1ZU0A 3IJXB 2ONKE 3PD9A 1AH5A 4ESWA 2ZYNA 3CSGA 2Q88A 4RK9A 1VSOA 2QPQA 3K01A 1B51A 1D3KA 5FHOA 3TMGA 1QKBA 4R72A 1AMFA 1YCJA 2O51A 3S2VA 5DVIA 5H8NA 5I59B 4F1VA 3CR9A 1BKAA 1KWHA 3IO4A 1IIWA 4IO5A 5I56A 4LQ2A 2KLFA 1J1NA 2B65A 2Q89A 1UTBA 1OLAA 4NMYA 4DXBA 1DTGA 4YZZA 1MDP1 3IK6B 3MWBA 2Q9TA 1LBCA 3T9HB 4EQ7A 1B5IA 1LB8A 4OESA 2NOOA 3VVDA 3TQWA 3UORA 2ABHA 1NNPA 4ELRA 1FTLA 1MXYA 4DDDA 2B3FA 2HZKA 1IZ1A 3V89B 4RJZA 4WKMA 2G93A 2HCAA 3RQTA 4NF4A 4ELOA 5HPQA 1DOTA 5HBCA 1B2HA 3QSLA 3Q25A 4OENA 3VDFA 3B6WA 4I1DA 3TEPA 2DVCA 2F8DA 4WEDA 3B7DA 4MFIA 4R6KA 3KJTA 3QIMA 2FNCA 1Y4CA 4OXVA 4OWDA 4DLDA 2VOZA 4F22A 3K4UA 3CVGA 3O6HA 5CMCA 2PBWA 2D3IA 4GIZA 2QS2A 4JSOA 1B46A 3BFTA 1LBBA 4I62A 5I2KA 1PEBA 3E4RA 2UVGA 3TTLA 1US5A 2XXUA 1R6ZA 3TCFA 4H67A 1NFTA 2XD3A 1ZIUA 5L9MA 2PX1A 3FASA 3OXNA 5DT6A 4EXLA 2ZNSA 2VHAA 3OO6A 4BDNA 1TFDA 2DE3A 3C9HA 4Z7EA 3TQLA 1H45A 2LAOA 4GXAA 3K2DA 5KCJB 4KYSA 3RY3A 3G3IA 2ZYOA 5H8FA 5IAIA 4RNSA 1B3LA 4OETA 3OOAA 3AXFA 2F7CA 2ZMBA 1OVTA 1B40A 3B6QA 1Y3QA 3G3JA 3BFUA 3HV1A 2XXYA 1MXZA 5TPAB 2NXOA 3PMVA 1M5DA 3MVYA 2UVJA 3R26A 3USDA 1LFIA 2RC7A 3KBRA 2X26A 3RNNA 4OEVA 3ZKLA 2XX8A 1LCFA 4PE5B 3MP1A 5B7DA 3UK4A 1LB9A 3MPKA 3EPEA 4IO7A 3KN3A 5DVJA 2Y7RA 4WXJA 3TTRA 3PPPA 2QS1A 3CSBA 4FE8A 5H8QA 1D4NA 1A8EA 1EU8A 3MVWA 3TFLA 3PU5A 3PPOA 2R9JA 2DWAA 3PUZE 1JVYA 4EQ9A 2Y7IA 3E3KA 1MQGA 4NF5B 4HCYA 2DXRA 3D4GA 4G68A 1B1XA 1HSLA 2E1SA 2VP1A 1HSJA 1QUIA 5JK4A 1O63A 1Q35A 3LSLA 3FJGA 1OVBA 4GD5A 1SYHA 4ZZAA 3PUYE 3ZS6A 3CI8A 3S9MC 3LBSA 5AA1A 1XOCA 2ANJA 1IXHA 4ESXA 3RPWA 3IO6A 5AE4A 1B05A 1NMUA 1N04A 1WODA 4POXA 3FD3A 4KPTA 1WVJA 1B52A 1P1WA 4YAHX 4OYVA 3FXUA 1SW4A 4JWOA 2OK2A 3KN7A 3N6UA 4OHNA 1SW5A 5ISUA 3C4MA 1PBQA 1MXWA 3K6WA 2H9BA 4KCCA 1NL5A 3FVNA 5M2VA 2GHAA 3H03A 3OD7A 1S9TA 1AL3A 1YAEA 1B9JA 1M5BA 3CFXA 3MAMA 1B1HA 2M8CA 3MW0A 2RINA 2I6EA 1OLCA 5LOMA 2OJTA 5F1QA 1B0LA 1Y9UA 3EHSA 3FXQA 3WAFA 2H5YA 4YKPA 4F31B 3G3HA 4N07A 4YKIA 3VFJA 3MP6A 1MY0A 4GWOA 2NVUB 1B32A 4FATA 1R9QA 2IA4A 2D5WA 4TOZA 1USYE 1JETA 2HEUA 2VD3A 3H6UA 2QSXA 4LONB 1F9BA 2DYXA 1ZLQA 3I5OA 4LQ5A 4YMBA 4OTEA 3SEWA 3CIJA 4LUBA 3PD8A 1WDNA 2F6GA 3QXMA 3V83A 2FA7A 5CI5A 3L6GA 5H8HA 2I48A 1EZOA 2XXXA 2XD2A 4YB7A 3GLBA 1JEUA 3KSJA 4F3PA 3T22A 4MF3A 4NF5A 1FQBA 5ITOA 1NNKA 3K0VA 1A40A 4LVQA 5CBSA 1B3FA 1AIVA 4OERA 3T96B 4U21A 2ZNUA 1QVSA 3TTKA 3WAEA 3DP6A 4G8MA 4QFNA 1Y1MA 1POTA 3CFZA 3CFLA 4NF4B 4F19A 3S9EA 3C31A 3ILUB 2XXQA 4RPOA 2XHDA 1LFGA 4ELPA 3SETA 2H98A 4XXUA 4X9TA 3SERA 1URDA 2ZYKA 3I6VA 1MQJA 3MZ1A 1Y20A 2DXYA 4X48A 1BP5A 3H6WA 4F3SA 2HXWA 1Y4TA 4N6PA 3HHFA 4OQOA 3FV2A 4H8JA 2Z8FA 4NWDA 3OELA 3OENA 1SI1A 2UXAA 3K6VA 1QW0A 1EH3A 1N76A 1B3EA 1MQDA 2A5SA 1FQCA 4GL8A 3R6UA 2O1LA 4L17A 3HCQA 1Z7NE 4U2RA 5ELVA 2PMSA 4TLMB 3IOVA 4KI0E 4NWCA 5KZTA 1LLSA 1IXGA 4QF9A 3RUMA 4QFPA 2PT2A 1DPEA 2NWJA 2I4BA 2YJPA 1MXUA 1N7WA 4R2FA 1N3WA 1H76A 4IO2A 3KEIA 2RKMA 4NTLA 4FEDA 3DP8A 1UTHB 5FTHA 4IO4A 4QSEA 3ZSFA 2V3QA 1PDAA 1JNFA 5H8FB 4Q5TA 3UIFA 3VLUA 1MY2A 3IOUA 3M8UA 4F1UA 2Q8JA 1DTZA 5IKBA 4ONYA 3SEUA 2DWIA 4OFOA 1EZPA 4U1ZA 1JW1A 4NF6B 1II5A 4H0WA 4EDPA 4H8IA 4GRKA 3OSQA 5CM6A 5CC2A 3OMBA 2V3UA 3U93A 4KHZE 1CB6A 3FJMA 3Q29A 1H44A 3OO9A 2V93A 5I2NB 4G68C 1I6BA 4KQPA 1POY1 1DPPA 3OEMA 3VLVA 4ZS9A 2F36A 3V8XB 3EF7A 3PPQA 3H7MA 3E13X 2HAUA 1LAXA 2DOJA 4IGTA 5H8QB 3K02A 3H6VA 2F97A 2YLNA 2E0SA 3PPRA 4H5GA 1B4HA 3FATA 5AA4B 1NNTA 3I3VA 2DE2A 1P1UA 1A55A 3CRBA 4M1VA 3VLWA 1MDQA 1D9VA 4G77A 3VXBA 1B4ZA 2XXTA 2B3BA 3A3CA 3MPLA 4G68B 2XXVA 4IY6A 3UN6A 3LR1A 5DEXB 3ONMA 3H4ZA 4NE4A 1NH8A 3IOTA 2BJJX 4LZ8A 3FVOA 4ZEFA 2F78A 2Q2CA 3FGSA 4H1XA 4PFWA 3RT8A 4JWXA 4Q30B 4XKNA 3PUVE 1NNFA 4BDQA 4FJPA 4IO6A 4YKJA 1T0KA 4OFJA 2ESNA 1B58A 1B5JA 4G8NA 2F6PA 2XXIA 2XXHA 3KOTA 3FVKA 4GVOA 3RT6B 2OWSA 5AA2D 1UTHA 4HCWA 4IY5A 3S4UA 3SESA 5JTYA 3H3GA 4IGRA 2Z23A 2O69A 2OCUA 3ZKKA 5HM4B 1MY4A 5CMBA 4GXSB 2Y7PA 3C35A 2Z22A 1ZTYA 1ZJLA 4PFTA 4DXUA 2F7BA 4NF6A 3N6TA 4PFYA 2V84A 3M3LA 4BDLA 4OZ9A 3KGCA 2NUVA 5I2NA 3TPAA 1LGBC 3LSXA 1FCKA 1RKMA 2F7AA 5EYFA 4LZ7A 1B6HA 4TQUQ 3DELB 2O7UA 3LSFB 2I3WA 3D4CA 3N5LA 1MRPA 3A3UA 1MPDA 4KCDA 4RK2A 3HPIA 2O84X 3G3GA 3HN0A 1GGGA 4ZDMA 2DS9A 5H8HB 2GRVA 2ALUA 1MS7A 1ZMGA 3ILTB 1JW4A 1B3GA 5AA4A 5JEIA 5A5XB 3DLNA 4LATA 1MPBA 2YPNA 4GLIA 4XKPA 4H5FA 2O68A 4FORA 3OSRA 3S9NC 4EF1A 5DEXA 1OQGA 4E0WA 1CE2A 4RY1A 3FUZA 2UVIA 3K6UA 2UYEA 5L9SA 4O3CA 1P1QA 3T93B 3U72A 4F2OA 4R9FA 3QUJA 3T9XB 5CMMA 2DWJA 2I3VA 3IL1B 3SKPA 4QFOA 2REJA 1MG1A 3IORA 1M5FA 5FHMA 1MY3A 4GL0A 1ZBMA 3O9PA 3S9LC 3MVXA 2PT1A 4R6HA 1FQFA 2QRYA 2W7YA 2D21A 4GF8A 5KDTA 4KFQA 1LAHE 4THIA 1IQ7A 1UQWA 3PV0E 4QRZA 1B3HA 1MPCA 4F3BA 4R6YA 4JBZA 4G4PA 2XXRA 3G3KA 4LA9A 4P0GA 3T9VA 3TCGA 2AIXA 1B5HA 4OFLA 3K1NA 1LAGE 4E0XA 1FQAA 3VV5A 1USYH 1VR5A 4BDMA 1RYXA 1AOVA 1GR2A 4NF8B 2QL3A 3CG1A 1ANFA 4GOTA 4HS7A 4QFLA 4ELQA 2F5XA 2Y84A 3N26A 1N0TA 1L5TA 3O2AA 2V25A 3TTNA 3TYHA 2RF1A 5H8SA 5EHMA 1JW5A 5ICQA 3PUWE 1M5CA 1S50A 5A5XA 2R71A 3KFMA 1B7UA 1N7XA 4IB2A 3G7WA 1MQIA 5L9OA 3ODBA 2Z8DA 4Z0IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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