4G49A

Room temperature x-ray diffraction of cisplatin binding to hewl in aqueous media after 15 months of crystal storage
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Room-temperature X-ray diffraction studies of cisplatin and carboplatin binding to His15 of HEWL after prolonged chemical exposure.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4g49A00
2YBLA 5KXXA 2A7FA 1F6SA 3AGIA 4N9RA 1W08A 4HPIA 4XJGA 2HTXA 1LYSA 4H1PA 1HF4A 4RW1A 1AZFA 1JTPL 4PRUA 4HV1A 3W6AA 4NSJA 2ZQ4A 3A8ZA 3TXHA 4LYZA 5IHGA 1GWDA 1SQ2L 1YAPA 3P64A 4LYBA 5F9XA 1H87A 1HSXA 1LZRA 1IR7A 1LSEA 3BKHA 2D6BA 1HFYA 4HJVA 3N9AA 1IIZA 1HNLA 1ZVYB 2AUBA 1B5XA 1GB0A 1GB5A 2D4JA 1JSEA 2DQDY 4H9FA 1LMCA 1YAMA 3G3BB 5M1YA 5HMJA 1OUIA 4N5RA 4BS7A 1LMAA 3LYTA 1HEOA 2BQLA 4BAPA 4RLNA 1GF5A 3WPJA 4HP0A 1LSBA 1GF6A 1YQVY 1HERA 1REMA 2B5ZA 1LHIA 2CDSA 3RW8A 1UIGA 3TXIA 3LYZA 1IC7Y 2G4NA 6LYZA 3A96A 4C3WA 4G4HA 4NSGA 5FEKA 4ETBA 5FDJA 4GCFA 2HEEA 4HTNA 2BQIA 2Z18A 2EKSC 4NG8A 3VWOA 1MELL 1OQMA 1PS5A 2GV0A 4U3XB 3W3EA 1EL1A 2DQIY 4ML7A 1FKQA 5C6IA 4NIJA 1JITA 1LKSA 1MLCE 1VATA 5APEA 1IWYA 1UC0A 1LHLA 4EMNA 4QY9A 5KXPA 1YROA 2X0AA 4WLXA 1IVMA 2WARA 4ET8A 2H9JA 2Q0MX 1REZA 5B1FA 1GF3A 4XADA 5FELA 4NHSA 1GE2A 9LYZA 4HV2A 2YVBA 4C5FA 1OUHA 4TX7A 5I4YA 1BGIA 1CKCA 3A94A 4RW2A 2BQKA 3D9AC 1LZDA 1GFHA 3B0OA 1AT6A 1G7LC 4XJDA 4DC4A 3TXEA 5A3EA 5LVHA 1F0WA 1NF5A 2W1YA 207LA 4XJIA 1LZYA 4WMGA 5I5QA 1UIBA 3SP3A 4NGYA 4H92A 1LSCA 1B7NA 4CJ2A 3OK0A 1TCYA 1YKZX 4H8YA 4QDNA 1BVXA 2BAAA 1WTMA 2BQJA 4YENA 3AB6A 2DQGY 1GPQC 1B5UA 2EQLA 1GB2A 4XJHA 4GN3A 4NHIA 5D5CA 4IATA 3EBAB 4H9EA 5D5FA 4WLYA 1IP5A 1UIAA 1LSNA 5FHWA 1CKFA 2BQBA 3P68A 4B4JA 1LTMA 1LZ5A 1I56A 1LJGA 5LYZA 5KXTA 1OP9B 4NSHA 3AW7A 1E8LA 4M4OA 5KKJA 1J1PY 1LHMA 2HECA 3AZ6A 2YBJA 1HEPA 3TXFA 4ZEEA 1IWVA 4YOPA 3W6FA 1UIEA 1RFPA 1WQPA 4P2EA 4W96A 5F16A 5HNLA 5L3IA 1HC0A 1JUGA 1ZVHL 1WQOA 4DWXA 4H90A 5KXWA 3LYMA 2F4GA 4NWEA 1C45A 1V7TA 2BQAA 4LFXA 3OJPA 4QGZA 5IDDA 4NGZA 1B5ZA 3RT5X 5I54A 1LJHA 3B6LA 2FYCA 2XJWA 2Z12A 4ETEA 4NGKA 1NHEA 1QTEA 1RJCB 1C10A 1LSPA 1YIKA 2XBSA 1C08C 1GBWA 8LYZA 5HMVA 1B7LA 4H8ZA 2BQFA 4CFPA 4QEQA 1IWWA 4HJZA 2MEHA 1DPXA 1B7QA 1B9OA 3LZTA 4KPMA 4O34A 1XEKA 1GE0A 5HLLA 3RZ4A 1INUA 1IP2A 1D6QA 4MSTA 2FBDA 2ZNWY 3A91A 1GE4A 1UA6Y 2BQCA 4EOFA 5HQ1A 2LYOA 5L9JA 1IOTA 5C6JA 1LMNA 1UIFA 3WUNA 5ILFA 1LMOA 1NBYC 2Z38A 1UACY 4XJBA 4XYYA 1W6ZA 4NGIA 2BQNA 3GXKA 4M6DA 4MCKA 4GCBA 4FJRA 4WLDA 4GCEA 1HENA 4PRQA 5LAGA 1IP1A 1XFPL 4WM6A 1LZ1A 5L3HA 1JJ0A 4AGAA 2DBTA 3WPKA 1XGRC 1IOSA 3CSRA 1VDSA 4WM1A 5KXSA 4LYOA 3WL2A 1RCMA 1REYA 1GAZA 1FN5A 1UUZC 4B1AA 1GFEA 1TDYA 4LT1A 4DT3A 153LA 1LSZA 3A6BY 2A7DA 2HEBA 4B4IA 1LZCA 3N9CA 3T36A 1HEWA 3A6CY 3FI7A 3P66A 3G3AB 4RDSA 1WQRA 3W6DA 3P65A 3WU8A 4NGJA 4UWNA 2MEFA 1JKBA 2CGIA 3AJNA 5LVJA 4DD0A 4IJ4A 1IP4A 4XENA 2XBRA 1GFGA 3RNXA 1JTTL 1B7RA 3LZ2A 5KXNA 1QDRA 4TSCA 4R6CA 2YBMA 1UCOA 2CJLA 1UIDA 4PJ2C 1JISA 1EQ5A 4ETDA 4OW1A 4WOAA 4LT2A 3TMXA 1C43A 3WVXA 4LGKA 1IORA 1WVUA 1IP6A 1OUGA 3WPLA 3TXDA 1HFXA 1KXXA 1YL0X 4HPEA 1XGQC 3AYQA 5APCA 1C7PA 5KXLA 3FE0A 3CT5A 5LINA 1B7SA 1B5YA 4LZTA 3P4ZA 3CT1A 1JJ3A 2IHLA 4HTKA 4LYCA 4WO9A 133LA 1GFRA 1QUSA 2EIZC 3WW5A 3M3UA 5APDA 5APFA 1LZ6A 4Z46A 2BQDA 1OUDA 4WL6A 4N8ZA 5I53A 1WQQA 2DQEY 1XSFA 2LZTA 1DZBX 4YF2A 1LCNA 1LJ3A 4YM8A 1CJ9A 1LMTA 1VFBC 4LT0A 3J6KA 2HU3A 132LA 5KXZA 5LVKA 4WM2A 3WXUA 1AM7A 194LA 1J1XY 2I6ZA 4H91A 3W6BA 154LA 3ATOA 1YAQA 1LHJA 4OWBA 5DN4A 2W1LA 1NQIA 2BQHA 1TBYA 1LJEA 1DKJA 4OWAA 4LYTA 1IY3A 3AW6A 4YEOA 7LYZA 3A92A 1I1ZA 1IWZA 3WU7A 3TMVA 4G4CA 1QTKA 5KXYA 4DYGA 3WUAA 1B0DA 5HNCA 5C6LA 5DM9A 1DI5A 4TSBA 4H8XA 5LVGA 1NDGC 3A93A 4OWHA 5KJ9A 5KXMA 1IR9A 1LMQA 1BB6A 3AZ5A 1B7OA 4NGOA 4WO6A 5DL9A 5E9RA 3TXGA 4HSFA 4N0JA 3WYHA 1YKXX 1GFVA 2HU1A 2PC2A 3EXDA 4A7DA 4NGVA 1BB3A 4L41A 1LJIA 1NWGA 1D6PA 2BQMA 4NGLA 1LJFA 5T3FA 1IEEA 4J1BA 4GCCA 4DDAA 1VAUA 4CFOA 1GBSA 1O23A 1YKYX 3ZVQA 1AT5A 1F6RA 2D4IA 3LN2A 3B0KA 4PGJB 3LHMA 5LYMA 2ZILA 1LJJA 1ALCA 1GF7A 4J0LA 2HEAA 1D0KA 1OUBA 2BLXA 2DQHY 2DQCY 4B4EA 4DD3A 5K7OA 1JHLA 1XGPC 1IY4A 1RE2A 1GAYA 4LFPA 1BVKC 1OUAA 3WUMA 1LSFA 4ZIXA 1LZTA 1LJKA 1JTOL 1LZ8A 2RSCA 5AMYA 3CSZA 4I0CA 4ET9A 5KXOA 1IOCA 5ILCA 1GBXA 2YBNA 4H93A 2MEEA 4Z3MA 3WXTA 3TMWA 4OWEA 1VDTA 1GBZA 1GB7A 1GF4A 3QY4A 3B0IA 1B7MA 1GXV2 4NWHA 1BB7A 1XEIA 2I26L 4WG1A 1UIHA 2Z2FA 3AZ4A 4DD2A 1LPIA 1GFAA 1KIQC 3AGGG 4GLVA 4NHPA 4OWCA 3W6CA 2F30A 1LYOA 3F6ZA 4H9HA 1HMKA 4PPOA 3RU5A 4TTDA 4IASA 2FYDA 5FCPA 1UICA 4B0DA 2DQJY 1GE3A 1CNSA 1ZV5L 1LSYA 2D91A 2DQAA 6LYTA 5LA5A 1GF8A 1OUFA 1IP7A 1GB9A 4NHTA 3A90A 1B2KA 4N1CC 1T6VL 4ZFPA 4NHQA 1AKIA 1IWXA 2BQOA 1GF0A 3WMKA 3A3RX 1IWUA 5B59A 3K3TA 1GHLA 3IJUA 1BWIA 1B7PA 4R0FA 1F10A 1HSWA 1YAOA 193LA 4NFVA 5F9UA 3WVYA 1IR8A 1G7HC 1DKKA 1G7MC 1I20A 4WM3A 4WL7A 1LSDA 2ZYPA 1JIYA 4I8SA 4XJFA 5F81A 4MR1A 1LZGA 1HEMA 3BKVA 4BADA 5I4XA 3A67Y 1KIPC 1JKDA 2I25L 1NMMA 2G4PA 3MGWA 5KXRA 5LIOA 1IO5A 4DD9A 2DKVA 2LHMA 3HBEX 2LYMA 1WTNA 4G9SA 1KIRC 3HBHA 5LAFA 1VEDA 3CB7A 3ZVQB 5JENB 1IC4Y 1P2CC 2DQFC 4OOTA 1FBIX 1OUJA 4KT3A 2ZNXY 1GBOA 1JWRA 3QE8A 4LYMA 1GD6A 1FLQA 2XTHA 3CQLA 3CT0A 1BWHA 4ETCA 1HEQA 4HTQA 3ULRA 4ETAA 1BHZA 3IJVA 1LSMA 1LZ4A 1IOQA 135LA 2BQEA 1D9UA 1GFTA 4N1EI 4B49A 4DD7A 1GDXA 1CJ6A 5KKIA 3W6EA 1BB5A 1PZYA 2Y8PA 5LXWA 1JKCA 4TUNA 1JPOA 1LOZA 1HMLA 2C8OA 1CKGA 5EBHA 3ZEKA 1FLWA 1H6MA 1LKRA 3TXKA 3WULA 2MEAA 3QNGA 1FLYA 2MECA 2H9KA 2Z2EA 3TMUA 3TXJA 1T3PA 3AGHA 1GE1A 1XGTC 1XEJA 1LSAA 3M18B 4WM4A 4G4BA 2C8PA 1GFJA 4W94A 1DPWA 2VB1A 2N5ZA 4H9IA 5KXKA 4GN4A 5A3ZA 3A95A 4XN6A 2EPEA 4PHIA 4TWSA 2BLYA 3LYOA 1DXJA 1LHKA 1LHHA 1QIOA 1JKAA 1WVVA 3IWRA 4GN5C 4NSIA 4ANRA 1GEVA 3CSQA 1C46A 2ZIKA 1QUTA 3B72A 4Z98A 1HHLA 1OUEA 1ZMYL 1BB4A 4AXTA 1CKDA 4GCDA 1LZ9A 3GXRA 1UBZA 2LZ2A 2YSSC 5F14A 1KXYA 4NEBA 3D3DA 1LYZA 1TAYA 4G49A 4NY5A 4WG7A 1GF9A 5FSTA 1A4VA 1GDWA 1LAAA 3T6UA 4BAFA 1CJ7A 2W1XA 2LYZA 4WM5A 3WU9A 1XGUC 2ZYCA 2H5ZA 5B1GA 5J7CA 1Z55A 1CJ8A 1J1OY 2YDGA 1GXXA 1QQYA 3A3QA 2D4KA 4FDYA 4H9BA 2HEFA 1N4FA 1TEWA 1BQLY 1JSFA 1GFKA 3N9EA 2MEDA 1DQJC 1G7JC 2Z37A 1NBZC 4CGEA 1GBYA 1GB3A 1KXWA 1LMPA 3HFMY 3A34A 3TXBA 2BQGA 2Z19A 4Z41A 1LJ4A 1HELA 1LZAA 1LYYA 3WW6A 1GFUA 1LJNA 1OUCA 1FKVA 1LSGA 1D0LA 4X3BA 1SLYA 5DN5A 1GB6A 1QDTA 2CWIA 1YANA 4LT3A 5IELA 2HEDA 2MEGA 1DI4A 3EMSA 5B07A 1EQ4A 4DDCA 2ZIJA 1IWTA 1GEZA 4KL7A 2G4QA 4NG1A 1EQEA 1V7SA 2W1MA 5DLAA 4KXIA 3E3DA 5I4WA 1IX0A 1JJ1A 4J1AA 2IFFY 2F2NA 1GB8A 4DDBA 5II3A 5KY1A 1DI3A 2HUBA 4D9ZA 5E4PA 5LVIA 1RI8B 2YBHA 3EO5A 5B06A 1B5VA 1NDMC 2NWDX 2ZQ3A 1LZSA 1IC5Y 134LA 1REXA 3KAMA 2MEBA 1G7IC 1QSWA 2YBIA 4H9AA 1LZEA 4GLAA 4OOOA 4UWVA 3J4GA 1VDQA 4H94A 1A2YC 1LZBA 1LZNA 4CHXA 4NGWA 3ATNA 5LA8A 3HBDA 4YEMA 1QSAA 2ZWBA 2BPUA 3WH1A 1WQMA 1YL1X 4H9CA 4RLMA 4WLTA 1YILA 2FBBA 1JEFA 4HJYA 1D0MA 4UWUA 1BWJA 2Z39A 4II8A 4J7VA 1B5WA 4DD1A 4E3UA 1NKHA 1FDLY 5B05A 1HFZA 1FLUA 1WQNA 1VDPA 1IP3A 2MEIA 2F4AA 5LYTA 1CKHA 208LA 3AZ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YBLA 3AGIA 4HPIA 1PQKA 1HF4A 4LDEA 1CTWA 1AZFA 4PRUA 1L55A 238LA 2ZQ4A 3A8ZA 1SQ2L 231LA 1HSXA 1LSEA 3BKHA 3N9AA 1IIZA 1B5XA 1GB5A 1IVMA 1JSEA 2DQDY 4GRVA 4N5RA 3LYTA 3WPJA 4EKRA 4HP0A 3CDTA 1LHIA 3LYZA 236LA 1IC7Y 2G4NA 1L15A 1CUPA 3LZMA 4C3WA 2BQIA 209LA 4NG8A 2ANXA 3W3EA 3D4SA 4ML7A 1FKQA 1MLCE 1VATA 5APEA 1UC0A 4EMNA 1YROA 1QTZA 4WLXA 2WARA 1L28A 4NHSA 1C67A 4C5FA 4TX7A 5I4YA 1L89A 1PQIA 110LA 3B0OA 1XJUA 1AT6A 4XJDA 207LA 2RBPA 1LZYA 4IAPA 4WMGA 4NGYA 4CJ2A 1YKZX 1CX7A 4DQJA 4H8YA 1BVXA 1L73A 1WTMA 2BQJA 1GPQC 3HTGA 4XJHA 1L37A 1IP5A 1UIAA 225LA 1L10A 1CKFA 2LC9A 218LA 198LA 1LZ5A 5LYZA 5KXTA 3AW7A 3C82A 1HEPA 2L78A 4YOPA 1UIEA 4P2EA 5F16A 235LA 1HC0A 156LA 1WQOA 4DWXA 5KXWA 2RAZX 3LYMA 2A4TA 4LFXA 4QGZA 4YXAC 2FYCA 1L83A 1NHEA 1YIKA 2HUKA 1C6JA 1C69A 4LDLA 3ODUA 1D6QA 4MSTA 1GE4A 4EOFA 1G0MA 1UIFA 1L99A 1LMOA 1NBYC 120LA 2Z38A 1UACY 4XJBA 108LA 1HENA 1IP1A 192LA 1XFPL 1LZ1A 4AGAA 1IOSA 4LYOA 3DN8A 3FADA 1KW7A 4LT1A 1LSZA 3A6BY 161LA 1L49A 3N9CA 1L31A 1L75A 1C6AA 3P65A 183LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2YBL A;  5KXX A;  2A7F A;  1F6S A;  3AGI A;  4N9R A;  1W08 A;  4HPI A;  4XJG A;  2HTX A;  1LYS A;  4H1P A;  1HF4 A;  4RW1 A;  1AZF A;  1JTP L;  4PRU A;  4HV1 A;  3W6A A;  4NSJ A;  2ZQ4 A;  3A8Z A;  3TXH A;  4LYZ A;  5IHG A;  1GWD A;  1SQ2 L;  1YAP A;  3P64 A;  4LYB A;  5F9X A;  1H87 A;  1HSX A;  1LZR A;  1IR7 A;  1LSE A;  3BKH A;  2D6B A;  1HFY A;  4HJV A;  3N9A A;  1IIZ A;  1HNL A;  1ZVY B;  2AUB A;  1B5X A;  1GB0 A;  1GB5 A;  2D4J A;  1JSE A;  2DQD Y;  4H9F A;  1LMC A;  1YAM A;  3G3B B;  5M1Y A;  5HMJ A;  1OUI A;  4N5R A;  4BS7 A;  1LMA A;  3LYT A;  1HEO A;  2BQL A;  4BAP A;  4RLN A;  1GF5 A;  3WPJ A;  4HP0 A;  1LSB A;  1GF6 A;  1YQV Y;  1HER A;  1REM A;  2B5Z A;  1LHI A;  2CDS A;  3RW8 A;  1UIG A;  3TXI A;  3LYZ A;  1IC7 Y;  2G4N A;  6LYZ A;  3A96 A;  4C3W A;  4G4H A;  4NSG A;  5FEK A;  4ETB A;  5FDJ A;  4GCF A;  2HEE A;  4HTN A;  2BQI A;  2Z18 A;  2EKS C;  4NG8 A;  3VWO A;  1MEL L;  1OQM A;  1PS5 A;  2GV0 A;  4U3X B;  3W3E A;  1EL1 A;  2DQI Y;  4ML7 A;  1FKQ A;  5C6I A;  4NIJ A;  1JIT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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