4G4HA

100k x-ray diffraction study of carboplatin binding to hewl in dmso media after 13 months of crystal storage
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Room-temperature X-ray diffraction studies of cisplatin and carboplatin binding to His15 of HEWL after prolonged chemical exposure.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4g4hA00
1CJ7A 4C3WA 1JITA 3W6DA 1LJKA 2VB1A 1JHLA 4MSTA 3WW6A 5B05A 1GPQC 1GF4A 2LZTA 3A67Y 4HPIA 1UACY 1IWZA 2DQCY 1HSXA 4GCBA 3RNXA 4YF2A 4HJVA 4LT1A 5LA5A 2HEDA 2ZYPA 2AUBA 1V7TA 1GDXA 1C08C 4PRUA 1UUZC 2LYOA 1XEJA 4CFPA 1YKYX 1LHHA 1F10A 1AZFA 1ZMYL 1IR8A 4I0CA 3W3EA 4ETBA 1GBOA 5A3ZA 1LHKA 1YAMA 2FBBA 5L3IA 3TMXA 4PJ2C 3AGIA 4NIJA 1TAYA 5APFA 1NQIA 4GN5C 4XJDA 1LZRA 4ZIXA 3TXGA 2HEFA 1LHJA 3G3AB 4NWEA 1IP6A 1QDTA 2HECA 4QEQA 5E9RA 2LYZA 3MGWA 1DPXA 1GE1A 2NWDX 5APEA 1QSAA 3B72A 5I54A 153LA 1UIEA 1GFAA 1XGUC 4OWAA 5B1GA 1JTTL 4NSHA 4M6DA 4NGJA 5K7OA 1LZCA 1ZV5L 4P2EA 2DQHY 207LA 3LN2A 3RT5X 1G7HC 1RI8B 3WUMA 2YVBA 5F9XA 4Z3MA 1LSFA 4Z41A 5KXKA 5DL9A 1B7QA 1OUDA 5KXWA 2BQBA 3P64A 1BWIA 2A7FA 1AKIA 2F4GA 2W1MA 1IP3A 2D6BA 2F30A 1J1PY 3B0KA 1LJNA 4N0JA 2ZQ4A 4TX7A 8LYZA 5APCA 4BAPA 5KXOA 1B2KA 194LA 3W6FA 4DWXA 1PZYA 1VDSA 5L3HA 1WVUA 1DZBX 1LZ6A 4OWCA 2BQHA 1LTMA 1LSAA 3TXEA 5M1YA 1KXWA 1XEIA 3QE8A 4NWHA 4WG7A 1LSZA 5AMYA 2I6ZA 1LYYA 1LHIA 1SQ2L 5DN4A 1DXJA 2HU3A 1GFJA 4L41A 1HMLA 3HFMY 1QTEA 3A6CY 1YAQA 5B1FA 3TXHA 3W6CA 4RW1A 4PGJB 2ZNWY 3IWRA 4ETAA 1EQEA 4XYYA 1LZAA 2DQDY 1LSPA 3AW6A 1B9OA 4NGZA 4IJ4A 4NHIA 5KXNA 1JUGA 1UIAA 2BQEA 3B6LA 3FE0A 3LYZA 1HFXA 4G4CA 5LVIA 4DD0A 1LYOA 2BPUA 1GBSA 1D0KA 2LZ2A 1IOTA 4ETEA 1CKDA 5KKIA 1LHLA 1JWRA 4NG1A 1DI4A 1QUTA 4N1CC 1GB8A 1FDLY 4J0LA 1IOSA 1TEWA 2IFFY 1QSWA 5LVKA 1GE4A 4OW1A 4ANRA 2DBTA 2D4KA 5LAGA 1TCYA 5I4YA 4WM6A 3K3TA 3EMSA 5LXWA 1GFEA 3EO5A 3CSQA 1IORA 2HEEA 1HEWA 1YKZX 2MEDA 3AJNA 1WQPA 4LT2A 1NWGA 1IP1A 3SP3A 1JEFA 1LJGA 1BB5A 4XJFA 4B4IA 4WO6A 5C6JA 3IJVA 4H94A 1LYSA 1HMKA 5HLLA 2BQCA 1GB5A 1GB7A 5F9UA 5II3A 4W96A 4AGAA 5F81A 4H9HA 1EQ5A 4U3XB 4DDAA 1LKSA 1UIDA 4RDSA 1JKBA 1IR7A 1B7OA 2DQFC 3AZ7A 3E3DA 5I4XA 2HU1A 4RLMA 3RW8A 4ZEEA 1BB4A 5B07A 1LZSA 1OUAA 1IX0A 2BQOA 5C6LA 3TXBA 4GN4A 3N9CA 3A94A 2CJLA 4H9BA 3A91A 1NF5A 4G4HA 1LPIA 1J1OY 1WTMA 1GB2A 2MEAA 2WARA 2D4IA 4LYOA 3WPLA 2YBNA 132LA 2W1XA 5IDDA 1LMOA 4TWSA 1KXXA 4GCDA 4MR1A 1B7RA 1XGRC 1O23A 4J7VA 5LYMA 3OK0A 1DI3A 2ZWBA 3CB7A 1LZEA 1JKDA 4WLDA 3CT0A 1JSEA 3WUAA 2BQLA 5EBHA 4LZTA 4J1AA 1REYA 3WL2A 1XFPL 4M4OA 3TXDA 2MEBA 4PPOA 2C8PA 4R0FA 5ILCA 3OJPA 1FKVA 2DQAA 2Q0MX 3LYMA 4H9CA 1GB0A 4XN6A 4DYGA 1DPWA 1CJ6A 4DD3A 4RLNA 4XJHA 4OWEA 1F6RA 1KIRC 4KT3A 5FDJA 1HC0A 1C7PA 1VATA 2Z12A 2CGIA 2ZNXY 1V7SA 1LJ4A 1IP7A 3A8ZA 1JKCA 4H90A 1GFUA 5T3FA 208LA 4HPEA 1UA6Y 1HEPA 4NGOA 2H5ZA 2MEIA 4LYTA 4YOPA 4KXIA 1B5YA 1I1ZA 1T3PA 2DQIY 2B5ZA 2DQGY 4FDYA 1IY3A 4H9IA 1E8LA 3TXJA 1GEZA 1IC5Y 2HEBA 3A95A 4ET8A 5KXXA 5DLAA 2XBRA 1LSMA 3CT1A 3WYHA 1LCNA 1VDQA 4QGZA 4IASA 4OWHA 3LYTA 1IO5A 1B0DA 5KJ9A 1GWDA 4FJRA 3B0IA 4NHPA 4Z98A 5D5FA 1KXYA 2G4QA 4WL6A 5LVJA 1D6PA 1LMAA 2BLXA 2BQKA 1F6SA 4HTKA 4LFPA 3IJUA 3WH1A 1A2YC 1LKRA 1GFGA 4MCKA 1LMPA 2FBDA 3A3QA 4BADA 3LHMA 1JIYA 2W1LA 2DQEY 1UIBA 4NGLA 1JISA 5LIOA 4WM4A 3WVYA 1IOQA 4WO9A 1OP9B 1DI5A 1RCMA 4R6CA 4WM3A 5D5CA 2MEFA 4PRQA 5IELA 1G7IC 3ZVQB 4DD2A 4QY9A 1MELL 4CJ2A 2CDSA 1CJ9A 2G4NA 2Z39A 4WLXA 4WG1A 4H9EA 1W08A 3WULA 3BKHA 4N9RA 1FN5A 1ALCA 2BQIA 2Z37A 2ZIJA 1YAPA 4GLVA 3A93A 1LZYA 1D9UA 1LOZA 1OUGA 3QY4A 1LZ9A 4NGVA 1LJ3A 2I26L 3M18B 2EKSC 4NSIA 1LZ1A 3HBHA 4HTQA 4XJIA 2YBIA 5KXYA 5KXLA 1GFTA 5HMVA 3WU7A 4I8SA 5DM9A 4GLAA 1OQMA 2I25L 4HV1A 5KXSA 3RU5A 5ILFA 1LSNA 1XGTC 1QDRA 4NHSA 4DD9A 3GXRA 4GCCA 2DKVA 1OUBA 2GV0A 4NG8A 2EIZC 3CSZA 4WM5A 3TXFA 1I20A 4NSGA 5I5QA 2Z2FA 1GF0A 1LJEA 2ZYCA 5FHWA 7LYZA 3D3DA 1HSWA 1LZ4A 4TSCA 3ULRA 1YKXX 1JSFA 1BHZA 4UWNA 2G4PA 4HV2A 4AXTA 5B59A 4ETCA 1A4VA 133LA 1DQJC 1NBYC 3A34A 1LZNA 4WM1A 2Z38A 4NHTA 1UCOA 2Y8PA 1F0WA 4B1AA 1B5WA 1REXA 2ZIKA 3WXUA 5LAFA 3P65A 1W6ZA 4W94A 1LAAA 4NHQA 3LYOA 3F6ZA 3WU9A 1LYZA 1LZ5A 1HENA 3TXKA 5J7CA 1EQ4A 2XTHA 3J6KA 1FBIX 3B0OA 1WQQA 1GFKA 4HTNA 2MEHA 5KXTA 4LYBA 2H9KA 3TMWA 134LA 4TTDA 1PS5A 3WPJA 1IWYA 2Z18A 4J1BA 1C46A 1C10A 1LMQA 1GDWA 1ZVYB 3P4ZA 1UIFA 4NGWA 1YQVY 1B7PA 3WU8A 3W6AA 3G3BB 4UWUA 1GEVA 5I4WA 1G7JC 1GF3A 1KIQC 1IWVA 1TBYA 2FYCA 4LGKA 4DT3A 2YBLA 4H91A 1I56A 5B06A 1P2CC 1NMMA 1YL1X 3A96A 3TMUA 1GE3A 1JPOA 2Z19A 4N1EI 2BQDA 1BQLY 1JKAA 4XJGA 4II8A 1GF9A 4BAFA 5KXMA 1B5VA 1GAZA 1IWXA 4GCFA 1LSDA 1GBZA 5KXPA 4LYCA 2RSCA 1BWHA 4LFXA 1NHEA 5KXZA 1IOCA 4B0DA 4B4JA 1HF4A 1GBWA 1FLYA 4ETDA 1OUJA 1FLUA 1CKCA 4KL7A 4YEOA 1LZGA 3WW5A 3WVXA 2Z2EA 1AT5A 4B4EA 5A3EA 1UIHA 1YIKA 3RZ4A 1GFRA 1MLCE 1IP4A 4UWVA 3T36A 4WM2A 1GF5A 1IP2A 4H8XA 3WPKA 1OUEA 5KY1A 4EMNA 4D9ZA 5C6IA 4XJBA 1VDPA 2H9JA 2YBJA 5APDA 3N9EA 1CJ8A 1GF7A 1JJ0A 2YBMA 4NGIA 4E3UA 3W6EA 1DKKA 3VWOA 4OOTA 1LSEA 2BQNA 3N9AA 1JJ1A 1B5UA 1LJHA 4BS7A 1GXXA 1OUFA 1HHLA 5LA8A 5HNLA 4ET9A 1FKQA 2HTXA 1QQYA 4IATA 3QNGA 1WQRA 2HUBA 2FYDA 1SLYA 1HEQA 1C43A 1UBZA 2C8OA 4ML7A 2MEGA 5FEKA 2LHMA 5IHGA 2X0AA 1LJFA 1LMNA 3A92A 135LA 1HNLA 3AB6A 4XENA 3AYQA 1KIPC 1YANA 2D91A 3WMKA 1AM7A 4KPMA 1YILA 1GHLA 1LMCA 3AZ5A 3FI7A 4H1PA 4H8ZA 6LYZA 5LINA 1CNSA 1REZA 1D0MA 4CGEA 2LYMA 1LSYA 3W6BA 1DKJA 2F2NA 193LA 5F16A 1HEOA 4H9AA 1GAYA 2ZQ3A 5KKJA 1J1XY 1BVXA 1YAOA 4GN3A 4Z46A 2BQJA 1LZDA 1GF6A 1G7MC 5HMJA 1LJJA 5LYTA 4YEMA 1GXV2 1GBXA 1AT6A 1LHMA 2YSSC 2D4JA 1FLQA 2YDGA 1INUA 1IR9A 1GD6A 1GFVA 1FLWA 154LA 4LYZA 1B7LA 1LZBA 4H93A 3P68A 1B7SA 3TMVA 1XSFA 1GF8A 5JENB 1QTKA 4WOAA 3EBAB 1WQOA 1BVKC 5FELA 1IIZA 3TXIA 4ZFPA 1IC4Y 3D9AC 1TDYA 4WLYA 5HQ1A 4GCEA 5LVGA 4LT3A 1HEMA 5F14A 1LMTA 1RJCB 1YL0X 1HFZA 1OUHA 3AZ4A 1RE2A 4G4BA 5L9JA 4DD7A 4A7DA 3A3RX 4H9FA 4XADA 1IEEA 1VDTA 5FSTA 1JTOL 3AW7A 1VAUA 2BQAA 4X3BA 1NBZC 4QDNA 1ZVHL 4G49A 4HSFA 1BB7A 3LZ2A 4LT0A 4C5FA 1NDMC 4DD1A 2PC2A 1NDGC 1QUSA 2BQFA 1LSGA 1H87A 1JTPL 4NGKA 1UICA 2XJWA 1GE0A 2BQMA 4H92A 1B5XA 3A6BY 4NEBA 2CWIA 1B5ZA 3HBEX 5KXRA 5LVHA 4TUNA 1IP5A 1GB3A 1WQNA 5HNCA 1IVMA 4WL7A 4NGYA 1B7MA 2F4AA 1LSCA 1LZTA 3WXTA 2BAAA 4PHIA 5I53A 1D6QA 6LYTA 4CHXA 4CFOA 2A7DA 3AGGG 4DDCA 2MECA 3ATNA 3ZEKA 5FCPA 1N4FA 2DQJY 1JJ3A 1IWWA 1GBYA 1C45A 4G9SA 4OOOA 1LSBA 2W1YA 3KAMA 1HFYA 4YM8A 1LZ8A 1T6VL 4WMGA 3ZVQA 4HJYA 3CSRA 3CT5A 4YENA 1RFPA 2BQGA 4NFVA 2MEEA 3T6UA 4N8ZA 1OUIA 1IWUA 1CKGA 1GFHA 3J4GA 1B7NA 1UC0A 1H6MA 1BWJA 1XGPC 4EOFA 1VFBC 1IWTA 1VEDA 1D0LA 1BB6A 1EL1A 3P66A 4RW2A 2BLYA 1QIOA 1XGQC 1HERA 4DDBA 4NY5A 4TSBA 2XBSA 5E4PA 3BKVA 4DC4A 2HEAA 1IC7Y 1YROA 2YBHA 3AGHA 1CKFA 4WLTA 5DN5A 1WVVA 1WTNA 2ZILA 1UIGA 1CKHA 2N5ZA 1LJIA 9LYZA 1BB3A 1HELA 4H8YA 3LZTA 4N5RA 4HJZA 5LYZA 3WUNA 1G7LC 1NKHA 3CQLA 4LYMA 3EXDA 1IY4A 1OUCA 1BGIA 1WQMA 1Z55A 2EPEA 3GXKA 1REMA 4OWBA 3HBDA 4O34A 1GB9A 4B49A 3M3UA 1GE2A 4NSJA 3AZ6A 2IHLA 1XEKA 3A90A 1GB6A 2EQLA 3ATOA 4HP0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4C3WA 5KXMA 3W6DA 5B05A 2VB1A 1UACY 4YF2A 2AUBA 1L75A 110LA 4ZPUA 4I0CA 4ETBA 5A3ZA 2FBBA 1OVJA 3AGIA 232LA 5APFA 1NQIA 4ZIXA 2HEFA 3G3AB 4NWEA 4QEQA 2OTYX 152LA 1DPXA 1GE1A 1QSAA 153LA 1XGUC 254LA 1L71A 1JTTL 1LYGA 207LA 3LN2A 4EJ4A 1L58A 4Z3MA 1B7QA 2OU0X 1OUDA 3CDOA 1L57A 1L42A 3B0KA 3C8SA 2O79A 1L0JA 4TX7A 1L85A 194LA 1C65A 4DWXA 1CV1A 1PZYA 166LA 1LSAA 1XEIA 4NWHA 2RB0X 1L37A 3EMLA 3HFMY 1QTEA 1YAQA 5B1FA 4PGJB 4ETAA 3AW6A 1LSPA 1B9OA 4NHIA 4IAPA 1L06A 3LYZA 4EPIA 5LVIA 1LLHA 3RUNA 1GBSA 5I14A 178LA 206LA 4NG1A 1GB8A 2DBTA 1L65A 1GFEA 3EO5A 3GULA 3G3WA 2MEDA 4W57A 243LA 1C6FA 1BB5A 1LYSA 127LA 5II3A 4W96A 1EQ5A 1TLAA 1L13A 4RDSA 251LA 1JKBA 1B7OA 5B07A 1L00A 1L03A 2BQOA 3N9CA 3A94A 225LA 3A91A 4G4HA 1LPIA 4EKPA 2D4IA 4LYOA 2YBNA 5IDDA 1LMOA 4ARPA 1L74A 1B7RA 4W56A 1DI3A 4W59A 1LZEA 1JSEA 3WUAA 5EBHA 241LA 1D3FA 1C63A 3TXDA 4PPOA 1JTMA 4R0FA 1QTVA 4H9CA 4DYGA 3DN3A 1L77A 4RLNA 5FDJA 3GUKA 2ZNXY 1GFUA 2RBQA 1HEPA 4NGOA 2H5ZA 249LA 3A95A 3SN6R 1L70A 5KXXA 2XBRA 3WYHA 1L83A 4IASA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1CJ7 A;  4C3W A;  1JIT A;  3W6D A;  1LJK A;  2VB1 A;  1JHL A;  4MST A;  3WW6 A;  5B05 A;  1GPQ C;  1GF4 A;  2LZT A;  3A67 Y;  4HPI A;  1UAC Y;  1IWZ A;  2DQC Y;  1HSX A;  4GCB A;  3RNX A;  4YF2 A;  4HJV A;  4LT1 A;  5LA5 A;  2HED A;  2ZYP A;  2AUB A;  1V7T A;  1GDX A;  1C08 C;  4PRU A;  1UUZ C;  2LYO A;  1XEJ A;  4CFP A;  1YKY X;  1LHH A;  1F10 A;  1AZF A;  1ZMY L;  1IR8 A;  4I0C A;  3W3E A;  4ETB A;  1GBO A;  5A3Z A;  1LHK A;  1YAM A;  2FBB A;  5L3I A;  3TMX A;  4PJ2 C;  3AGI A;  4NIJ A;  1TAY A;  5APF A;  1NQI A;  4GN5 C;  4XJD A;  1LZR A;  4ZIX A;  3TXG A;  2HEF A;  1LHJ A;  3G3A B;  4NWE A;  1IP6 A;  1QDT A;  2HEC A;  4QEQ A;  5E9R A;  2LYZ A;  3MGW A;  1DPX A;  1GE1 A;  2NWD X;  5APE A;  1QSA A;  3B72 A;  5I54 A;  153L A;  1UIE A;  1GFA A;  1XGU C;  4OWA A;  5B1G A;  1JTT L;  4NSH A;  4M6D A;  4NGJ A;  5K7O A;  1LZC A;  1ZV5 L;  4P2E A;  2DQH Y;  207L A;  3LN2 A;  3RT5 X;  1G7H C;  1RI8 B;  3WUM A;  2YVB A;  5F9X A;  4Z3M A;  1LSF A;  4Z41 A;  5KXK A;  5DL9 A;  1B7Q A;  1OUD A;  5KXW A; 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 1GE0 A;  2BQM A;  4H92 A;  1B5X A;  3A6B Y;  4NEB A;  2CWI A;  1B5Z A;  3HBE X;  5KXR A;  5LVH A;  4TUN A;  1IP5 A;  1GB3 A;  1WQN A;  5HNC A;  1IVM A;  4WL7 A;  4NGY A;  1B7M A;  2F4A A;  1LSC A;  1LZT A;  3WXT A;  2BAA A;  4PHI A;  5I53 A;  1D6Q A;  6LYT A;  4CHX A;  4CFO A;  2A7D A;  3AGG G;  4DDC A;  2MEC A;  3ATN A;  3ZEK A;  5FCP A;  1N4F A;  2DQJ Y;  1JJ3 A;  1IWW A;  1GBY A;  1C45 A;  4G9S A;  4OOO A;  1LSB A;  2W1Y A;  3KAM A;  1HFY A;  4YM8 A;  1LZ8 A;  1T6V L;  4WMG A;  3ZVQ A;  4HJY A;  3CSR A;  3CT5 A;  4YEN A;  1RFP A;  2BQG A;  4NFV A;  2MEE A;  3T6U A;  4N8Z A;  1OUI A;  1IWU A;  1CKG A;  1GFH A;  3J4G A;  1B7N A;  1UC0 A;  1H6M A;  1BWJ A;  1XGP C;  4EOF A;  1VFB C;  1IWT A;  1VED A;  1D0L A;  1BB6 A;  1EL1 A;  3P66 A;  4RW2 A;  2BLY A;  1QIO A;  1XGQ C;  1HER A;  4DDB A;  4NY5 A;  4TSB A;  2XBS A;  5E4P A;  3BKV A;  4DC4 A;  2HEA A;  1IC7 Y;  1YRO A;  2YBH A;  3AGH A;  1CKF A;  4WLT A;  5DN5 A;  1WVV A;  1WTN A;  2ZIL A;  1UIG A;  1CKH A;  2N5Z A;  1LJI A;  9LYZ A;  1BB3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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