4G77A

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with tolfenamic acid at 1.98 a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with tolfenamic acid at 1.98 A Resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 117
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g77A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g77A02
3N6TA 3JV9A 3KFMA 3N6UA 3DP4A 3B6QA 4M1VA 2Z8EA 4R2BA 5HBCA 3MVZA 4JDFA 5JTYA 3HN0A 3EN3A 2XXIA 1MRPA 4OFLA 2ZXTA 4THIA 4ZEBA 2XX9A 4X9TA 5FHNA 3ILUB 3V8XB 3M8UA 3TAJA 1Y1ZA 2PYYA 4U1OA 3C31A 1A55A 2O1LA 5TPAB 2XXRA 3MQ9A 1WDNA 2YLNA 5CMBA 4DCXA 4JBZA 3A09A 5AA4B 3IORA 3LSFB 1MG1A 1A54A 3GBBA 4G68B 3KBRA 1B2HA 4YAHX 3U93A 1BP5A 3K2DA 4HTGA 3H6VA 3K0VA 2AIXA 3MVWA 3DLNA 3D4CA 4IGTA 2AYSA 2GH9A 4QFKA 4HS7A 4RK9A 3RTFB 4IO4A 3FJMA 1T0KA 5DEXB 3EF7A 3V89B 1PBPA 2NWJA 4ZEDA 1LFGA 3DP6A 3HPIA 1FTOA 3CFLA 5CMCA 1OIBA 4C0RA 5FHOA 4BLAA 4L17A 2THIA 1FW0A 3IK6B 4NTLA 5H8NA 5LOMA 5H8FA 2PX1A 2H5YA 3Q28A 3U92A 5BWJA 2Q89A 4KYDA 2OCUA 3U8QA 2UVGA 2ZNSA 1B3GA 1QKBA 1YCJA 4GF8A 3LSLA 1UTHB 4O3AA 4OENA 3TMGA 1SI1A 1LSTA 1RKMA 4PFYA 3PPOA 4EXKA 2UYEA 4KCDA 4PFWA 4KPTA 4DCYA 3K6WA 3SEWA 3MAMA 4LZ8A 4RPOA 3IR1A 3VVEA 1B4ZA 4F1UA 2QS3A 3PUXE 1B7UA 3IJXB 3BBRA 4LATA 4OWDA 3Q29A 4MBPA 2REJA 5BUUA 1B0LA 1N3WA 2I3WA 1ZBMA 1JW4A 4POWA 3M3KA 1POY1 3E3KA 3RN8A 2RKMA 5KDTA 4AB6A 2OJTA 1LFHA 1M5CA 4X1BA 3R7XA 4ELQA 4I1DA 2DE2A 4YB6A 4DE8A 1N7XA 3H6WA 1N04A 4U23A 3LSWA 3VDFA 4OMBA 3CIJA 4N13A 2V84A 1FTLA 2DE4A 3K1PA 3TCFA 3BFTA 2I3VA 4TQUQ 2Q2CA 5FHMA 4F1VA 4MH5A 2X7QA 3E13X 2I0BA 1JEVA 2F35A 5ISUA 1N76A 1B7ZA 2BJJX 4LUBA 2I48A 2F7CA 2ZYKA 1AMFA 3MPLA 1Y3PA 3THIA 2ONSA 3KN3A 4ZE9A 3H06B 4E0WA 3OOAA 3FGSA 3VXCA 5AA3A 1ZJLA 1P1QA 3Q27A 4M4GA 4KCCA 3TZAA 3MVYA 4OQOA 4WEPA 4N6PA 5I56A 2HAVA 1D3KA 5CBSA 2O69A 1H43A 3FXUA 2RCBA 3GXAA 4ZE8A 3KOTA 3MVXA 2Z8FA 3QK6A 1FQAA 4EXLA 4FJPA 1H3DA 3QAXA 2I6EA 2PBWA 1URDA 3TODA 1QUJA 3DP8A 3OO9A 4Q30B 3PD9A 1USYH 2B65A 1ZKBA 1A8EA 3MW0A 3T9UA 1BIYA 1NNKA 2HFBA 3U94A 2HAUA 3LSXA 1FQCA 3OMBA 3OENA 4GXSB 3WAFA 1B4HA 3A3CA 3PPRA 3KN7A 3OEKA 3OELA 1LFIA 1ANFA 4RJZA 4X1DA 3W15C 4GXAA 1EH3A 4BDNA 1R9QA 3QUJA 5H8HB 3QYTA 1UTBA 5KDTB 4U4SA 4OETA 4H5FA 3KJTA 4ELRA 2DXRA 2F97A 2QSXA 4PE5B 2R6GE 4JSDA 4GL8A 3R6UA 3O6HA 1P99A 3IOUA 4H0WA 3PUWE 3K1MA 3C33A 4KI0E 1MQHA 4EQBA 4R9FA 4JWXA 4F3GA 4KR5A 2QMXA 3H3GA 1UIVA 3S4UA 1FCKA 2HZLA 3IOVA 3FJ7A 4OEUA 4ELPA 3TKDA 3K1NA 3O97A 3HSTA 1M5DA 3Q25A 2ZYMA 3ONMA 3RUMA 1CE2A 3VFJA 3TDJA 4P0IA 4F3PA 4LVQA 4OFOA 4DZ1A 2G29A 3C32A 4R74A 3PU5A 3UORA 1NH8A 2DVZA 2XXTA 3OD7A 4QF9A 5I56B 4G8MA 3OO8A 3TTMA 4QRZA 5I59A 1XC1A 5L8DA 1XS5A 3T96B 4DDDA 2QL3A 4F19A 4F1YA 3C4MA 2CMOA 2H4IA 1TT1A 3OEMA 3HHGA 3EHSA 3CR9A 1FQDA 2REGA 1O64A 4OESA 4OTEA 2X26A 2F6PA 4MLQA 1YAEA 4OYVA 2AL5A 3PV0E 3DM0A 1I69A 1JETA 2DE3A 5TP9A 3SESA 2DP8A 1MXWA 3SEXA 1B1XA 2UXAA 1Y3QA 1Q35A 2F6GA 1P1UA 1AIVA 3MBPA 3SERA 1FTMA 3OSRA 3PMWA 3QUFA 3UA8A 2HZKA 5I84A 3O29A 4X48A 4RPNA 4XIGQ 1B32A 1LAXA 2VOZA 3KSJA 1JEUA 1ZIUA 1KWHA 1LLSA 4GIZA 1UTBB 1N0TA 4GRKA 1VFEA 5CBRA 4HCYA 4LQ2A 3F11A 3K6XA 3FASA 3V5AA 3TYHA 2I4BA 3UGWA 1SW1A 1IXCA 4DIGA 2XD2A 3QXMA 1ELJA 1IITA 1Y4TA 1Z7ME 4BDOA 4JSOA 4ONYA 5ICQA 3TFLA 2GHBA 4XTCQ 3IOTA 3HHFA 1LBCA 3E4RA 4IO2A 5L9OA 4R75A 4DXUA 1B5JA 1ZLQA 2F8DA 1JW5A 5AA2D 3OSQA 5I57A 4KFQA 3EHUA 1HSJA 3UK4A 4G8HA 3ZKKA 3IAZA 1UIUA 4U2RA 4NMYA 3CI8A 4F3SA 4P11A 2XXXA 3C34A 3VLWA 4OERA 3LUYA 2I4CA 2RC8A 1D4NA 4Q8RA 2DQVA 4EUOA 1B6HA 1LAFE 3MZBA 1B5HA 4F22A 1MM7A 3L6HA 3FATA 3FZVA 1DTZA 1LB8A 4WKMA 4JWOA 3PPQA 1FQBA 2OLBA 4C1UA 3QIMA 2KLFA 1S9TA 4YU0A 2QJEA 3MP8A 5FTIA 4R6HA 4Z0IA 2I49A 1OMPA 1MPCA 3SKPA 4Z7EA 3JYRA 2D5WA 3TCHA 2D21A 5AA2A 1SVXB 4R6YA 3OXNA 3PUZE 1B40A 4GL0A 3T9VA 1SBPA 4ECFA 1OLAA 3IO6A 3SDFA 2Y7KA 2UVJA 1GVCA 4K3FA 4R2FA 3GZGA 4YB7A 4C1TA 4RXLA 3MP6A 2FYIA 3TELA 3IX1A 1M5BA 3G3FA 1URGA 2B3FA 3VXBA 3CFXA 1GV8A 4JWYA 3E9XA 4GOTA 1NFTA 1PDAA 4YMAA 3CG3A 1GGGA 4F3BA 4WEDA 4YMBA 1Q1KA 5JTYB 5CMMA 1BTJA 5KZTA 2P2AA 4OXVA 4IY5A 1YPNA 1SQYA 2Y84A 2P1SA 4OHNA 1OLCA 2PVUA 4RNSA 1R6ZA 1OQHA 1NKXA 2AL4A 3ZKLA 2F36A 1LCTA 2XXYA 5I57B 1MQIA 1OQGA 1Y20A 3RY3A 4NF8A 2ONRA 3MC2A 4TLMB 2R71A 2UVIA 2PT1A 3H4ZA 3K6VA 4POXA 3G7WA 1Y3NA 2R9JA 3PPPA 3BKIB 3D4GA 3K4UA 2RF1A 4DXCA 1IIWA 1NNFA 4G4PA 2I58A 5I2NA 4LONB 5J1DA 3O2AA 3MUQA 1QW0A 2V3TA 2RINA 1B58A 4RK2A 5HPQA 3EQ1A 4ZS9A 4F31B 1FTKA 1B5IA 4H65A 1POTA 4JXIA 3O6GA 4NF6A 3MP1A 5H8QA 1A8FA 5B70A 2V25A 1QKAA 5H8NB 1IXIA 2QS4A 1EZ9A 5H8FB 3RLFE 4U4XA 1JVXA 5HM4B 3IL1B 1IXHA 1PEBA 1MQDA 1MXVA 4YKKA 1B3FA 3HO7A 4Q0CA 1WVJA 3USDA 3O9PA 2PMSA 3T93B 4PFUA 5DVIA 1QUIA 3CSGA 2YPNA 2HEUA 3KEIA 4PFTA 3VVFA 4FAJA 3RTWB 3TTRA 4IO7A 4BDQA 2O1MA 4AQ4A 2DSFA 4R72A 4ZECA 4YKPA 2XX8A 2OWTA 4I8CA 3H03A 2XX7A 1LAGE 1UQWA 3KOSA 4GQOA 1QUKA 1RYXA 4YZZA 4E0XA 4YICA 1H76A 1AOVA 3GBAA 1DOTA 3TTKA 1DPPA 1AH5A 1B3EA 2X7PA 3ZS6A 2A5SA 3TQWA 5ITOA 2DS9A 3AXFA 1URSA 5AE4A 1GTKA 5KCJA 1LGBC 4ISUA 2DWAA 4ZZEA 4OVJA 3ILTB 3KZGA 4KQPA 1NMUA 5I2KA 1LCFA 5CC2A 2VGQA 1CB6A 3H6UA 1WODA 3A3UA 5L9SA 1Y4CA 5JEIA 4EF1A 5F7VA 4NF8B 2WKYA 4G2ZA 3K01A 4NF4A 4KHZE 5L9MA 1MQGA 3HCQA 1PB9A 1MDP1 2OBGA 4JB7A 2F7AA 2GHAA 3K02A 2DWJA 1B52A 3VLVA 1N3XA 1IZ1A 1J1NA 4F18A 5DYHA 5I2NB 2F78A 5H8SA 3RT8A 3QSLA 1H44A 4P0GA 5EYFA 4I62A 2A5TA 4N07A 2XXHA 5AA4A 4NF6B 3N94A 2NUVA 1B7HA 2QMWA 5DT6A 3VVDA 2VHAA 3H7MA 4GFRA 2NXOA 4QFOA 3CFZA 4LQ5A 1B05A 2B3BA 4QFPA 3GLBA 3B6TA 2OK2A 2QS1A 3FIRA 4QSDA 4RY1A 5DEXA 3S9LC 1AL3A 3MWBA 4XKPA 4DLDA 2O84X 2DWHA 4MLVA 3M3LA 3L6GA 4FECA 4QFLA 3V83A 3FUZA 3N5LA 2Z8DA 1DSNA 4UA8A 1MQJA 3VE1B 2DYXA 1D9VA 4ZEIA 3ECRA 3RGYA 1MM6A 2ABHA 4PP0A 1B9JA 1TFAA 5DVFA 4NE4A 3RNNA 2HQ0A 2UVHA 1B0HA 2ONKE 5F1QA 1SYIA 1MPBA 1B46A 5CMKA 1UTHA 2ZNTA 1YTVA 3O66A 3U1OA 3KSXA 4U1ZA 1D9YA 1MY0A 2NOOA 4XKQA 2H25A 4ZZAA 4LZ5A 3TCGA 4QSCA 5I58A 1Y1MA 1M5EA 3VV5A 3FVKA 4H5GA 2ANJA 3S9MC 2Q8JA 3N26A 3IB0A 2FA7A 3CG1A 4NF4B 1QJMA 4YKIA 5AA1A 5IKBA 3MZ1A 3OO6A 1EZOA 3TEPA 2E0SA 4NWDA 4BDMA 2RC7A 3TUSA 4YB5A 1RYOA 1B1HA 4O3CA 3RQTA 4H8JA 2ZYNA 2A5TB 2XXUA 3IB2A 1XOCA 5I59B 1IUDA 1EZPA 3IJOB 1OVTA 2O51A 1MXZA 3CSBA 3FVOA 1MY3A 4GVOA 2ESNA 1FQEA 3G3IA 4FATA 1LB9A 4LA9A 5K2YA 4ZEFA 3PUYE 2CZLA 3JZJA 4G8NA 2ALUA 2IA4A 4EF2A 1H45A 1EU8A 4GLIA 4ESXA 3LC8A 1PB7A 2Y7IA 2M8CA 2XHDA 5TP9B 1QULA 4IO6A 4HCWA 1IEJA 2ZYOA 4F29A 1HSEA 2F5XA 4F2QA 3G3HA 3H6TA 3G3GA 2RCAA 3EHTA 1SI0A 2V93A 3RPWA 2VP1A 4GD5A 3PD8A 1B51A 2DWIA 1MPDA 2ZMBA 4Q5TA 3TQLA 1P1OA 3B7DA 3FV2A 4WXJA 3SEYA 4LZ7A 3MZ9A 2YJPA 3K00A 2O6AA 3HV1A 3G3JA 1R9LA 3ODBA 2O7UA 2Y7WA 3UP9A 1MH4A 3KN8A 5I58B 1GR2A 2H9BA 4TLLB 2O7IA 2FNCA 3BFUA 3PMXA 1JW1A 5M2VA 4ZEKA 3C35A 5CI5A 1PC3A 5CRYA 4U22A 4HW8A 1DTGA 4IO5A 3TTNA 1SYHA 1I6AA 5H8HA 1II5A 2IEEA 3SEVA 4R6KA 3KG2A 3LBSA 4GWOA 3K6UA 2G93A 4QSEA 1S50A 4G77A 2DXYA 4RA1A 2ZNUA 4DXBA 4ESWA 5TU0A 3WAEA 4H67A 4MF3A 2VD2A 1LAHE 3RT6B 3UIFA 2RC9A 4I9DA 4KYSA 5ITPA 4BDRA 1SW4A 2Z23A 1USYE 4F39A 4LP2B 3FVNA 1BLFA 3MPKA 1ZTYA 3C36A 3FD3A 2HXWA 4OEVA 2PT2A 3ZSFA 4OFJA 3Q26A 1JVYA 4RYAA 1MDQA 4IB2A 1SW2A 1MS7A 1NNPA 1B3LA 4KD5A 3I5OA 3KGCA 4U21A 4EQ9A 5AA2B 2O68A 4FE8A 3P7IA 2GFEA 2OWSA 4H1XA 4YKJA 3MJNA 3IOWA 1I6QA 1VFDA 3KJ7A 1XHYA 2H99A 1M5FA 1PB8A 1IXGA 2Y7PA 1XT8A 3T66A 1LBBA 3VLUA 3M3FA 3IB1A 1FTJA 1MXXA 4IO3A 2V3QA 1F9BA 5K2XA 1US5A 1MY1A 2HCAA 1MXYA 4PQJA 1R1NA 1IQ7A 3PPNA 4NF5A 2F34A 3S9NC 1FQFA 5B7DA 1Y9UA 3T9HB 1JQFA 3G3KA 4BDLA 4TOZA 1HSLA 1NH7A 4G68C 3SETA 3W9VA 1VE4A 3FJGA 3O28A 5A5XA 2QS2A 4KYEA 3I3VA 1TWYA 1QVSA 1ATGA 3FV1A 2W7YA 3W9WA 3LR1A 1N7WA 1DPEA 1XVXA 1S7YA 3CVGA 1TXFA 3TPAA 4OZ9A 2LAOA 3S2VA 4FEDA 2QRYA 1MXUA 5EHSA 2I0CA 2F7BA 1P1WA 3U72A 2VD3A 5JK4A 1MY4A 2GRVA 4PETA 2XXQA 1OVBA 4H8IA 4XKNA 1O63A 3PUVE 2OZZA 4R73A 1NNTA 1TFDA 3FVGA 1MH3A 3OO7A 4EDPA 5CM6A 1A7LA 3B6WA 5TPAA 2Q2AA 4QHQA 3PMVA 1N84A 1A40A 5IAIA 1US4A 5EHMA 3IO4A 3I6VA 2Y7RA 4O3BA 4XKRA 3EPEA 5H8QB 5ELVA 4G68A 4QFNA 3T9XB 2UYFA 1XVYA 4IY6A 2H98A 1JNFA 3PGFA 1A99A 3CRBA 5DVJA 5ICTA 2XXWA 1O7TA 2QPQA 3T22A 3FXRA 3DELB 1BKAA 1I6BA 3R26A 1SW5A 4IGRA 1ZU0A 3S9EA 4ND9A 1L5TA 3SEUA 1DMBA 3O6IA 3C9HA 2NVUB 3TTLA 4ELOA 3UN6A 4MFIA 1Z7NE 1MY2A 4FIMA 2DOJA 5FTHA 4NF5B 2E1SA 4XXUA 1SD3A 1VR5A 1ZMGA 2D3IA 4F2OA 1P1NA 2Q9TA 4FEBA 2Q88A 2XXVA 1B3HA 2V3UA 5DTBA 2XXPA 2P0SA 4R9GA 1SDXA 4ZDMA 4EQ7A 2DVCA 1VSOA 3FXQA 5KCJB 5A5XB 4FORA 4AB5A 2Z22A 1NL5A 4UACA 4NWCA 2XD3A 5I2KB 4NEDA 4H6DA 1PBQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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