4G8NA

Crystal structure of the kainate receptor gluk3 ligand-binding domain in complex with the agonist g8m
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
TNRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Pharmacological and structural characterization of conformationally restricted (S)-glutamate analogues at ionotropic glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein/agonist
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
total genus 83
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8nA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8nA02
3CFXA 1GVCA 5EYFA 4HW8A 2ALUA 1BLFA 3VFJA 3H6WA 1YAEA 4KYSA 4RK2A 1P1UA 4Q8RA 2QPQA 2HCAA 4YKKA 2XXQA 3BKIB 3OO6A 5CBRA 2HEUA 1SW5A 1FTJA 2XXPA 1JEVA 2XXRA 4AB6A 2YLNA 1QKBA 4WXJA 3S4UA 3IJOB 3Q25A 3SEUA 3O9PA 3MP6A 4F1UA 4ZEDA 5ELVA 1M5BA 1MXUA 3KG2A 3U8QA 3E9XA 3S9MC 4DCYA 4E0XA 3TEPA 1N7XA 1QKAA 3IORA 4FEDA 5H8NA 1ATGA 5L8DA 1P1OA 3C35A 1Y20A 3GZGA 3DLNA 4QFNA 3WAEA 3M3FA 1H45A 1D9VA 3I3VA 1BIYA 1SW4A 2YPNA 3W15C 3M8UA 1PB7A 2OJTA 5DEXA 3SEXA 4ZEKA 3ZS6A 5CC2A 1B7ZA 3O66A 1BP5A 1HSJA 1URSA 2HQ0A 3ONMA 4O3AA 1N3XA 1JVYA 1FQAA 2VOZA 2XXWA 4R74A 4NWCA 4DDDA 4JBZA 2H4IA 1Y3QA 2O1LA 4NTLA 1LAFE 3JYRA 1ZLQA 4I8CA 3OELA 4F3BA 4IB2A 1IUDA 4OEUA 4LZ8A 5FHMA 3B6WA 1ZU0A 3MAMA 3R7XA 1ZKBA 3H7MA 4KD5A 2XHDA 4XXUA 3IJXB 1LBBA 3TFLA 1B05A 1II5A 4ONYA 2P0SA 4GF8A 4LZ5A 3LSFB 3OO9A 4NF5A 1B4ZA 1EU8A 3TYHA 3GBBA 2DXYA 3I6VA 2G93A 1QUIA 4FECA 4BDRA 4DXBA 5H8HA 2PMSA 4R2FA 1MM7A 2F8DA 4OXVA 2GH9A 2XXTA 2HZKA 3K4UA 3L6HA 2DYXA 4FAJA 1A8EA 1USYE 3E4RA 3PMVA 2YJPA 2F6GA 4GLIA 4X1BA 2XD2A 2OK2A 4KCDA 4G68C 3FXUA 1NNPA 2NXOA 3O6GA 3CFLA 4H65A 3QK6A 3SEWA 4R6YA 1B46A 2QMWA 1AH5A 5TPAA 1A55A 4F1VA 1SBPA 4KPTA 2O1MA 1RYOA 2PBWA 3A09A 1IXHA 4RPOA 1ELJA 4WKMA 3PUZE 4F3SA 2QSXA 2H25A 3EQ1A 1FTKA 2Q88A 2OBGA 3E13X 4N6PA 4MBPA 4E0WA 3T9UA 3T9XB 5H8QB 3UA8A 4BDLA 1Q1KA 4OVJA 1B3HA 3U93A 5EHMA 2UYEA 1EZOA 5CMCA 2V25A 1Y4TA 1MXYA 4LZ7A 3TTLA 1MG1A 4PP0A 4NE4A 3FJ7A 4TQUQ 3MZBA 3A3CA 3JV9A 1SW2A 4GOTA 2THIA 4GWOA 1M5DA 4IO3A 3H6UA 2F34A 1DTGA 3OO8A 1ZTYA 4G4PA 2O7UA 1JQFA 3ZSFA 3QIMA 4JSOA 4QSCA 1DTZA 2FA7A 3DP4A 3I5OA 5I56A 1OVBA 2DWAA 3CRBA 3UIFA 1NNFA 3PPOA 1B5JA 2ZYKA 2RF1A 1QUJA 3EHTA 4IGRA 1EH3A 2DE4A 2HAUA 5H8FB 2UVJA 3K6XA 2HAVA 4R9GA 2RINA 3UP9A 2NVUB 4QSDA 1D4NA 1S9TA 2F97A 4Q5TA 1PBPA 3RY3A 3BFTA 4OEVA 1J1NA 2ABHA 4YKPA 4XKNA 3K02A 1P1WA 1LCFA 3OD7A 4U1ZA 3SDFA 4R6KA 4TOZA 4BDQA 2DE3A 3KOSA 3C34A 4F18A 1WDNA 1B5HA 4OWDA 4DIGA 3FVOA 3G3GA 3B7DA 3LBSA 2LAOA 2AL4A 4EF1A 5CMKA 4NF6A 4GQOA 1USYH 4GRKA 1SD3A 2QS3A 1HSLA 2DP8A 1IXCA 4TLMB 2E0SA 3QUFA 5H8SA 2F36A 4THIA 3PUYE 2O68A 3C4MA 3TCGA 2VD2A 4C0RA 1B2HA 4U23A 5DT6A 1URDA 2IEEA 5CMMA 3UORA 4KR5A 1AOVA 4ZEBA 1AL3A 4MLQA 2GFEA 4X1DA 3KJTA 2R6GE 1NNKA 1B40A 4EQBA 4F29A 3RNNA 3TTKA 2I0BA 1SQYA 2ZMBA 4GFRA 1MPBA 3OSRA 1OIBA 3K1NA 5KDTA 3A3UA 4LONB 4WEPA 3QYTA 2ZYOA 1CB6A 5H8NB 4HCWA 2E1SA 2B65A 4O3CA 4R75A 1URGA 2A5SA 3LR1A 1US5A 4UA8A 1B5IA 3PPQA 5DEXB 2F7AA 3QXMA 3IOUA 4M4GA 4PQJA 5HM4B 4N13A 1LCTA 2PT1A 1XOCA 5ISUA 2AYSA 3RQTA 1H3DA 3RLFE 2I48A 2QMXA 4F19A 1B32A 1MY4A 5AA2A 3IK6B 4EXKA 3TKDA 1LAGE 3Q27A 3C33A 2H99A 3IO6A 1B3EA 5J1DA 4POXA 4R73A 4YAHX 4OZ9A 5CBSA 4EXLA 3CI8A 1Y3PA 1L5TA 1N04A 1XVYA 1JETA 2DSFA 3PPPA 4NF5B 1QW0A 1B52A 1AMFA 1OLCA 3EF7A 4XIGQ 2OZZA 5ICTA 2VGQA 5H8HB 4OETA 3ILTB 4H8JA 4H0WA 1EZ9A 4Z7EA 4F3PA 1M5FA 2Q2AA 2IA4A 3T22A 4YB6A 2RC9A 4DXUA 2NWJA 1LB8A 3IO4A 4RA1A 2F78A 4R2BA 2CMOA 1P99A 1GGGA 3TZAA 3BBRA 3VE1B 1H44A 3THIA 3PUWE 1ZJLA 4MH5A 3D4CA 1FQBA 3EN3A 1LFHA 5LOMA 5FTIA 5TPAB 4DCXA 3LC8A 1MDQA 1YPNA 5AA1A 2FNCA 4F1YA 5EHSA 4DLDA 1OQHA 2REGA 4YZZA 2Y7WA 3AXFA 3IOTA 2B3FA 4ISUA 1NH8A 3K1PA 1CE2A 1XS5A 1WVJA 1DMBA 2AL5A 4OYVA 2XD3A 3HCQA 4C1TA 3M3KA 4GL8A 3O97A 1B4HA 4P11A 1DPEA 2X7QA 3CVGA 3TDJA 1MPCA 5FHNA 1A8FA 3VLUA 3V89B 1SVXB 1JW1A 3W9WA 3UGWA 1R9QA 1MQHA 2RCAA 3CFZA 3MPKA 1LAHE 2PX1A 3FUZA 3O2AA 1TWYA 2DQVA 4U2RA 1P1QA 3U92A 1LFGA 1BKAA 2GHAA 3ZKKA 3T9HB 5CI5A 2I58A 3FIRA 2O7IA 5I57A 2WKYA 3TELA 1UIVA 3KN7A 1F9BA 3VV5A 1FCKA 3PPNA 4KQPA 1Y1MA 3TMGA 5I56B 3V83A 1TFAA 4TLLB 5JTYA 4OESA 3IL1B 3CG1A 4RJZA 2UVHA 2A5TA 3MP8A 3TCFA 3MC2A 1FQDA 1NH7A 3JZJA 1RKMA 1MRPA 3RTFB 5ITOA 2RCBA 3EPEA 3D4GA 3H6VA 3RT6B 1YTVA 3L6GA 4U4XA 5F7VA 4OQOA 3PUVE 1LB9A 4OHNA 2XX8A 2I4BA 2I49A 5CRYA 2QS1A 4YKIA 3GLBA 4DZ1A 4FEBA 1N3WA 4RK9A 2V3TA 3MVZA 1A7LA 3K6VA 3FATA 4JB7A 4Q30B 4YMBA 3MJNA 1MPDA 4HCYA 5L9MA 3C36A 1ZIUA 1MY3A 4G68A 1UTBA 4G8HA 2P2AA 2DE2A 4NEDA 3SETA 4NF6B 2I0CA 4I9DA 4PFWA 4PFTA 2ZXTA 2O69A 2DWJA 4EF2A 4ZE8A 3FJMA 4FIMA 5DVIA 1DOTA 5I84A 3OENA 1SI1A 3RN8A 4F31B 2VD3A 4LATA 1XHYA 3S9NC 1IZ1A 3KSJA 4ZECA 4NF4A 5DVFA 5A5XA 3MPLA 3KOTA 3VDFA 1LSTA 1AIVA 1LAXA 4KYEA 3MZ1A 3KN3A 4RXLA 2Q9TA 2XXYA 4PFYA 4YICA 3GXAA 3H06B 4ZE9A 4JWYA 3R26A 1MS7A 5FHOA 3OMBA 1PDAA 4ND9A 1VSOA 3QSLA 3G3JA 4U1OA 3IOVA 3B6QA 2AIXA 2V3UA 3USDA 1IIWA 5F1QA 1QULA 3TTRA 1UQWA 4LQ5A 5KDTB 3MVXA 2Q2CA 4KFQA 5JK4A 3VLWA 1OVTA 3Q26A 2XXHA 3PU5A 2RC7A 3QAXA 3T9VA 3FZVA 3MVWA 2D21A 2PVUA 3QUJA 3G3KA 5I59A 4ELQA 4LQ2A 5I2NA 4OMBA 4X9TA 5AE4A 2I3VA 2Z23A 3HHGA 4ELPA 1Q35A 1TT1A 3IB0A 1B1HA 3U1OA 4ECFA 1QVSA 1Y9UA 3KEIA 4ESWA 5AA2B 1VR5A 4GIZA 4WEDA 3PMXA 3TPAA 2M8CA 1M5CA 3H03A 3FGSA 1B3GA 4AB5A 1NL5A 2QL3A 1B3LA 5CM6A 3K6WA 2HXWA 2Y7KA 1EZPA 4K3FA 2O6AA 4NMYA 1SI0A 1NKXA 2V3QA 3CSBA 2ZNTA 4BLAA 2X7PA 2GRVA 1MQIA 5IAIA 4F3GA 3TTMA 3MZ9A 2VHAA 1Y4CA 2DVZA 4IO6A 3C31A 1I6QA 2QRYA 4BDOA 4YU0A 3G3IA 2OWTA 3SEVA 3W9VA 2Z22A 5ICQA 1I6AA 4NWDA 1B7HA 3VVDA 4JDFA 4H5FA 3S9EA 1O7TA 2DWHA 2XXXA 4F22A 4EUOA 1B0LA 4KYDA 4FE8A 4HTGA 3G7WA 3P7IA 2VP1A 3EHUA 5DTBA 2I4CA 2Z8EA 1B3FA 3M3LA 4ESXA 2F7CA 4PFUA 4OERA 3O6HA 1TFDA 5IKBA 4G77A 1UTHA 2XXIA 5I58A 4XKPA 4H67A 4QFOA 3F11A 3C9HA 1BTJA 3PV0E 1XT8A 4KHZE 2QS2A 4EQ7A 1MY2A 4ZEFA 3MW0A 3FVGA 2H98A 5I2KA 4G8MA 2R9JA 1LGBC 4FJPA 1I6BA 1B6HA 4H6DA 2PYYA 2OWSA 2V84A 3B6TA 5AA4A 4G8NA 3O6IA 1MDP1 4I1DA 5B7DA 5K2XA 1LBCA 3V8XB 5B70A 3CR9A 1TXFA 1FTOA 3E3KA 4OTEA 2I3WA 5I57B 1LFIA 1N84A 2KLFA 4OENA 1PB8A 3ODBA 3MBPA 3T66A 4C1UA 1HSEA 1R6ZA 4GD5A 3H3GA 3C32A 3RTWB 2P1SA 1MXVA 4IY5A 4NF8A 4M1VA 1B1XA 4DE8A 4LUBA 5JTYB 3IR1A 1D9YA 5L9SA 2A5TB 5BUUA 4IO7A 1N0TA 5AA2D 4H1XA 3FD3A 1B0HA 3IX1A 3N94A 1XC1A 3DP8A 1FTMA 5DVJA 2GHBA 2G29A 3GBAA 4ZZAA 1QUKA 1GR2A 2HZLA 4GXAA 1O64A 2ANJA 1M5EA 1FQFA 4R9FA 1KWHA 3OSQA 1MY1A 2I6EA 3S2VA 5ITPA 2ZNSA 4LVQA 2DXRA 3CG3A 5KCJA 5K2YA 4RPNA 5DYHA 1PC3A 3U72A 2Y7RA 3K0VA 3T93B 4U22A 3K1MA 3LUYA 4YMAA 1MXZA 1UIUA 4G68B 3VLVA 1UTBB 1SYHA 1B51A 1DPPA 1IQ7A 3WAFA 3T96B 1R9LA 4LP2B 1RYXA 4JSDA 4H8IA 1PB9A 3FJGA 3K00A 1JNFA 3N5LA 3DM0A 3U94A 2XX7A 4ELOA 3FASA 4QFKA 3MWBA 3IB2A 3N26A 4NF4B 5A5XB 2H5YA 1N76A 4ZDMA 1SW1A 3HPIA 5HBCA 1Y1ZA 3FVKA 4BDNA 2CZLA 1LLSA 2BJJX 3VXCA 3DELB 4FATA 2D3IA 2ONSA 2ONRA 2Y7PA 1B58A 3OEKA 2F7BA 3HSTA 1SDXA 1MM6A 3R6UA 1IXGA 3LSWA 4IO4A 1FQCA 1MH4A 3ILUB 4MF3A 1SYIA 4X48A 2Y7IA 1P1NA 1GTKA 3IB1A 2DS9A 4U21A 3PGFA 4RYAA 5CMBA 2O51A 1JW4A 2QJEA 1S50A 3TUSA 1FW0A 2FYIA 1H43A 1POY1 4GL0A 5I59B 4KI0E 1O63A 1MY0A 1I69A 5I2NB 3G3HA 3H4ZA 4YB5A 1FQEA 1Y3NA 3O29A 4RNSA 1ANFA 1PEBA 5KZTA 3Q28A 1IXIA 1VFEA 1S7YA 4PETA 1A99A 3SERA 4ZZEA 4R6HA 5M2VA 4RY1A 2Q89A 2B3BA 3SKPA 3KSXA 4ELRA 4H5GA 1MQDA 2PT2A 3OXNA 3CIJA 3TQWA 2HFBA 1B7UA 3PMWA 3IOWA 1IEJA 1OMPA 3RGYA 4QFLA 4EQ9A 3KJ7A 3N6TA 2UXAA 4ZEIA 3TTNA 4MLVA 5AA3A 5JEIA 4QRZA 4POWA 1Z7NE 2V93A 2NUVA 2O84X 4XTCQ 3HO7A 1R1NA 5L9OA 3TQLA 4U4SA 2RC8A 1N7WA 3UN6A 3TCHA 3CSGA 3KN8A 3KGCA 4G2ZA 4PE5B 4EDPA 1Z7ME 1MH3A 2OCUA 3MUQA 3MP1A 4QF9A 3MQ9A 2Z8FA 1ZBMA 1A54A 2REJA 2UVIA 3IAZA 1UTHB 1WODA 5I58B 3G3FA 1MXWA 4MFIA 4O3BA 3VVEA 4L17A 2RKMA 1POTA 3UK4A 1XVXA 2H9BA 3N6UA 3RT8A 1H76A 1B9JA 3FV2A 2DWIA 5I2KB 1OQGA 1D3KA 3SESA 3VVFA 4P0IA 4QFPA 2F6PA 5TP9B 1MQGA 3DP6A 2Y84A 2R71A 3K01A 5AA4B 2ZNUA 3Q29A 2OLBA 2D5WA 4UACA 3FVNA 1US4A 3V5AA 3HN0A 3BFUA 1PBQA 4I62A 4FORA 5H8QA 4F2OA 1GV8A 2ESNA 4HS7A 3HV1A 3RUMA 3O28A 4NF8B 3FXQA 4QHQA 2UYFA 2ONKE 1VE4A 4KCCA 2DOJA 5TU0A 3MVYA 4ZS9A 1A40A 3SEYA 4BDMA 1NMUA 3PPRA 4N07A 3OO7A 2F5XA 2XX9A 4Z0IA 2XXUA 3PD8A 1OLAA 1MQJA 4JXIA 2W7YA 1T0KA 3KBRA 3FV1A 3H6TA 1JVXA 3OEMA 5BWJA 1IITA 5KCJB 4QSEA 3FXRA 3HHFA 2DVCA 3OOAA 5FTHA 3VXBA 1ZMGA 5H8FA 3PUXE 2Q8JA 1MXXA 3PD9A 2F35A 3ZKLA 4XKRA 3LSXA 4YB7A 4GVOA 3LSLA 4YKJA 4JWXA 1JW5A 2ZYMA 4Q0CA 4R72A 4DXCA 4IO5A 4IGTA 3ECRA 1FTLA 4XKQA 4IY6A 5TP9A 1DSNA 3K2DA 4GXSB 4AQ4A 4P0GA 4OFJA 3TODA 1YCJA 3S9LC 3K6UA 3RPWA 3KFMA 5HPQA 1VFDA 2X26A 4IO2A 1NFTA 4OFLA 3TAJA 1NNTA 1QJMA 2QS4A 2Z8DA 4JWOA 4LA9A 2XXVA 3KZGA 2ZYNA 4OFOA 4F2QA 4F39A 2UVGA 3EHSA 2NOOA 1JEUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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