4G9ZA

Lassa nucleoprotein with dsrna reveals novel mechanism for immune suppression
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
213
structure length
205
Chain Sequence
AMDHVEFGLTYSQLMTLKDAMLQLDPNAKTWMDIEGRPEDPVEIALYQPSSGCYIHFFREPTDLKQFKQDAKYSHGIDVTDLFATQPGLTSAVIDALPRNMVITCQGSDDIRKLLESQGRKDIKLIDIALSKTDSRKYENAVWDQYKDLCHMHTGVVVEEITPHCALMDCIMFDAAVSGGLNTSVLRAVLPRDMVFRTSTPRVVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Viral protein/rna
molecule keywords RNA (5'-R(P*GP*CP*CP*C)-3')
publication title Structures of Arenaviral Nucleoproteins with Triphosphate dsRNA Reveal a Unique Mechanism of Immune Suppression.
pubmed doi rcsb
source organism Lassa virus
total genus 55
structure length 205
sequence length 213
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.410 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4g9zA01
4G9ZA 3Q7BA 3MX5A 4GV6A 4GV9A 4GVEA 3MX2A 4GV3A 3MWTA 3Q7CA 4FVUA 3R3LA 3MWPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5J2MA 3WXMB 2OPRA 4DR6K 2UUBK 3PX6A 5C2FA 1K73O 3KJVA 2FSNA 5IT9O 3JYTA 2HHUA 2IVOA 3HSTB 3UE5A 5DK5A 3MK6A 2O8BB 3QMLA 1NGAA 4O0IA 4LFBK 4CEBA 1KAYA 3HPHA 1KRPA 1C1AA 2IOCA 4DTRA 3ULDA 4DQ8A 1IBLK 3MECA 4JK9A 1R59O 1E4FT 5BREA 3LZIA 1NGBA 3CCSN 4MLHA 4FLXA 2P9PA 3O4QA 1IBMK 2XY5A 4B9UA 3DLRA 3AVCA 2A5XA 2UUAK 2NRWA 3I0RA 1NJWA 5AFUH 1Q9XA 4OLAA 4BACA 1BDGA 4BE0A 4K42A 3ZETA 4FLUA 3O3GA 1T03A 4OO1J 3OYFA 1EKEA 1RT5A 2OPSA 1C0UA 1YT3A 4OPKA 3DJCA 4E7IA 3PUFA 3A5OC 5AQLA 1N33K 1RDWX 3KD5E 3MCPA 5GADP 1WUAA 3NH1A 4L8RB 4YHHK 5C0YA 2WBNA 4CF0A 1NGHA 5CY4A 3K5OA 2GBZA 3DXKB 2E20A 3GE1A 3U3GA 4NYNA 2KKZA 3SYZA 2FBYA 3Q7BA 4Z4GA 4B1XB 2V7ZA 4BWMA 4CJ4A 4OPHA 1VQKN 1JKHA 2VG7A 2Y1JA 3U3YA 4FWRA 3M3ZA 3VEVA 1S6QA 1X9JA 3FLCO 3NBPA 1LW0A 3F2KA 1SQKA 3KD1E 3LPUA 4Z0UA 3FR0A 1WNSA 2NUBA 3LDNA 4QS9A 4DV6K 3D2EB 1K8KA 1S1WA 3CETA 4JK7A 1S9EA 3O9TA 4M7XA 1JCFA 5AQQA 4JKDA 4H0OA 3VQPA 4GMJB 4DG1A 1V4SA 3EE9A 4DU1A 4RW6A 1T8EA 2PYJA 2ZE2A 3AO3A 1XMOK 4FVUA 5M1NA 2VWJA 4LC9B 3AVKA 1NMDA 1BG3A 2HB5A 3AV9A 4GV3A 3AVAA 1UOCA 4B3TK 3OYMA 2HBJA 1RT3A 3S3NA 4DTJA 5CZ1A 3WXIA 4CF8A 2P5GA 3MXJA 1C0GA 1EETA 3ZSWA 3P4IA 4FJLA 4NYFA 4GVEA 4Y0WA 5C2DA 4IDKA 1QSLA 1KD1O 4DFKA 3KIOA 5D3GA 5HBMA 2E2QA 3ENOA 3TAFA 4BDZA 1M1KO 1QVGM 1UWBA 4X65K 3NMUA 1T44A 3SQ2A 4U7BA 1RT4A 4DQPA 4BC5A 4A62A 1CZBA 1NOZA 3A5MC 2QWPA 3LWLA 1NLVA 3ITHA 5AQPA 4CJLA 3RVCA 1BUPA 1HJRA 4RW4A 5FRNA 1HMVA 2KQ2A 5EVZA 3KVGA 1D9DA 4DS4A 3A5NC 3WXJA 3CQXA 1DGKN 3EEQA 3QETA 4GV6A 4IXCA 2YHYA 2VQEK 1RT7A 2D0PA 3TAMA 1JCGA 4CZMA 4KPYA 3V4IA 1GLCG 3P31A 4ISGA 3W0LA 1FXXA 3AVLA 2DFFA 4M3ZA 5HRSA 4CZJA 3O5BA 1DTQA 4BWJA 4FWNA 1HRHA 1VSHA 4CGFA 4NLBA 4LFCK 1U45A 4IJNA 2NZTA 4DCHA 4AHSA 4O55A 3MAQA 1NOYA 1L3TA 1TKTA 3OBYA 4OX9K 3NF6A 4YOTA 4M41A 5FPNA 4JKGA 4K8XA 3DYAA 2OZSA 3S9HA 2W6LA 3CI5A 2QXFA 4FL9A 1LAWA 4J2AA 3VF4A 2QK9A 1GLEG 1OKJA 1W7AA 5KQ8A 3O3HA 2KFNA 4E7HA 3LDOA 3NHGA 4F2SA 5C15A 4J2BA 2EWSA 3SV4A 1JL2A 4DS5A 2FLOA 2BTFA 3BF3A 3L4IA 4CF1A 2CGLA 3SV3A 3VGLA 3LP0A 1YVUA 3BY5A 3O1BA 4B3OA 1YTUA 1TUUA 3NVKA 4ID5A 1BISA 2HHHK 1QVFM 3GL1A 3OTOK 3CC4N 4DR3K 3D0PA 3O3FA 4DSEA 3KKRA 4DSFA 1UA0A 3PX4A 4E7KA 2G8IA 3ZX3A 3GOIA 4M45A 4E7JA 4FWQA 3ZSZA 4CHQA 2G8HA 1EWQA 1QS4A 3ZEUB 3KLFA 3RMAA 4FK4A 2HMIA 4KH4A 2O8DB 4EHTA 1V4TA 4DSKA 1SS6A 1NGJA 1J9AA 1U04A 2GWKA 3I8DA 1LAVA 3WNGA 2HHSA 1H1VA 3DOKA 3SZ2A 2ITMA 2Z1GA 4CE9A 5FPMA 5LY3A 1U2VA 4CZHA 1VRTA 4LF8K 1RTIA 4O44A 4HVJA 2E1YA 1NKBA 3CC2N 1QTMA 3BZCA 4Q0BA 1BQNA 5AQRA 4H5WA 3DMJA 4DFJA 4CD1A 1T3VA 1ZBFA 1K8AO 3F5TA 4PL7A 5LMUK 2X6NA 3IAYA 4MO5A 3LZJA 4GY2B 4Z4IA 3R6MA 5T7BA 3I55N 3TARA 5AQFA 1T6CA 3QBWA 2IAJA 2P9IA 3VPZA 3CF5L 3LM9A 5FDLA 4CF9A 3VGMA 5GIPA 4QS8A 1L3UA 1JCEA 1FJGK 3OY9A 1IG8A 1G15A 3HOTA 4FJKA 4GKJK 3SJJA 2YKNA 4GKKK 1FW6A 5AQIA 3UB5A 1NGGA 3D2FA 3MX2A 4FWMA 3NAEA 5CR4A 3PV8A 3OYIA 1TK0A 2AJQA 5C10A 4CESA 2E2NA 3C95A 3L8BA 1TV6A 2YNFA 1HNWK 2VCPA 2O8BA 3PX0A 3IMXA 1EQYA 3ID6A 4F4KA 1W0HA 2HMPA 3C6TA 3VF2A 4A57A 4EP5A 1R0AA 4BR2A 4M3YA 2P1JA 3QB0A 1JLCA 3SJHA 4BRAA 4UY8O 1VSKA 5AQXA 1FKPA 3SAGA 4FOIA 3CXCM 2QWMA 2OZMA 3C7NA 2BE2A 3NH2A 4IOXA 3DAWA 3O6WA 4B3SK 4ICLA 4CD3A 3QIOA 2HBMA 3LPTA 4CEOA 4DQIA 2QXLA 1YJ9N 3CM5A 2HHVA 1L3VA 2VGMA 1NK6A 3NF7A 1ZBUA 4QS7A 3MXIA 1IV0A 4DQSA 3KLEA 1X3NA 1Y64A 4GNIA 1S1TA 5HRRA 4NXNK 4KHNA 4DTOA 2YV0X 3E01A 4CEAA 2VGNA 3DXKA 1NK0A 4L3QA 3CJ7A 1FK9A 2Q36A 4OGEA 4DR7K 4FYDA 3EO3A 3HSCA 4CFCA 3AO5A 3B8AX 4LF6K 4N56A 3MWTA 4KBOA 2Q2RA 1CXQA 2KZMA 4CK3A 4B3MK 1JLBA 2DY4A 2HSTA 5GAHP 4N5SA 3W3DA 4DTNA 1C0FA 3D45A 1TK5A 3CJ1A 1RDBA 1HNVA 2VWKA 3BGRA 2DFHA 3CJAA 3H3OB 1I3AA 4DV4K 1XC3A 3AGRA 2GX9A 5BN9A 3OBWA 4JLHA 4M3UA 2XY8A 3R9PA 3L2VA 1O13A 3A8YA 3KK1A 3VQ7A 1N34K 3HJFA 4FWLA 4CJPA 1HYVA 3WXKA 1KXPA 4FJXA 1Q9YA 2E8AA 1JJ2M 4YOWA 2JWLA 3O4WA 4OKJA 2XHBA 3L6QA 2B4JA 3AY9A 4BROA 3CCMN 1BL3A 1ITGA 1BU6O 4CFBA 5CZ2A 3P38A 3ZX2A 3EKSA 3K5LA 2BUPA 3O9UA 1GLJO 4DV1K 1CLQA 2YNHA 4TSXA 4E1JA 4UQGA 3T19A 3HRGA 4H0TB 3HPGA 3EY1A 4FJGA 3I0SA 4LF4K 3MN5A 4QAGA 1SZ2A 1U4BA 1N36K 3NE6A 5SZTA 4KV8A 3G71N 1VQON 5AQHA 3HM9A 3LP1A 2RE2A 4JRQA 3U4LA 1GLAG 4BRGA 1WBBA 3HK2A 4YDUA 2P9UB 2D4WA 3OYNA 4JEPA 3HXMA 2HHXA 2YHWA 4MLEA 3VA3A 2O8FB 4CJRA 1N32K 3V9SA 4FWSA 3HVTA 4CIGA 4DWIA 3C94A 4HTUA 4YORA 4ZTJA 3C65A 1ZBIA 2A42A 4MDAA 5F0XA 3S3OA 4LF5K 4MQ3A 3HVRA 2JGUA 4K8ZA 4B08A 4BRLA 3DLKA 3MWPA 1YHQN 3VQ5A 1D4XA 2NLXA 1A5WA 4H5RA 4JI8K 4RCHA 3IKMA 4FJHA 1KC8O 3THWA 1EX4A 1KLMA 3M1FA 4FJNA 4OPJA 4YFUA 2UXCK 2PFUA 2D5RA 3WT0A 3K5NA 2D0AA 4DV2K 3VESA 2NRVA 1LOTB 1X9WA 4K25A 3IG1A 3FFKB 4CF2A 1BCOA 1UA1A 3FZMA 5I9EB 4BVOA 1QHAA 4DTXA 5C42A 3SPYA 1VQ4N 2NNWA 1GOBA 3FZKA 3SUQA 5AQSA 4IOAL 1BI4B 5KPRA 3CCVN 3M6GA 1A5VA 4G9ZA 2A1SA 3ZSVA 2YJFA 4KHYA 4AHVA 4ELTA 3VQ4A 4RTFD 4B3RK 1QSSA 1VK0A 4KHQA 3LANA 5HP1A 3OYEA 2Z1IA 4BVPA 1GLDG 1TKDA 4U67L 4RW7A 1RILA 3MN9A 4B1WB 4FLWA 3KWGA 4B9MA 1Z25A 2HVIA 4LSNA 1VQMN 1XNQK 4BDPA 3NF8A 2UXDK 3SMPA 2F7TA 2E2PA 4XH1A 2HF4A 4DV5K 2RPIA 3VOVA 4CJ5A 5GAGP 4DUZK 4E1NA 1E4GT 1LWCA 3GBTA 2ASMA 2O8DA 4C1NI 3VQAA 4K41A 3FZFA 4H0XB 4JHDB 4JRPA 1YUWA 4LH5A 5BPNA 1KVAA 2CH5A 3CJCA 4W5TA 4E89A 2ZM6K 2ZWHA 5HROA 2W6KA 3V9ZA 1BHLA 3ASMA 3TAPA 3E9OA 3MEGA 2YNIA 4B1UB 4OPAA 5BRHA 1TAQA 4JI4K 5J2QA 3TTDA 3FZLA 4JI5K 4M63C 1YXQA 4C8KA 1WAJA 1Y97A 5LMNK 5KPTA 4CEEA 3GG4A 5AQVA 1HYZA 4NCGA 1VQ8N 1RBTA 4IBNA 1JL1A 3J7YP 2P5OA 3C6HA 4ZTFA 3VF6A 4OGCA 3RMBA 3DLGA 3ZX0A 4EZ6A 4FZXC 4AH9A 4B9TA 4BGBA 3MEDA 3OYGA 4Z94A 4FW2A 3TTCA 1YTAA 3NGZA 4AQYK 4A5BA 3ZLJA 4FO0A 3CPWM 5E26A 3NGYA 1NU0A 5KPZA 2XY6A 2YHAA 2VWBA 3NFAA 4J2DA 3M8RA 1NGDA 3KK3A 5DM6L 1HX1A 2P9LB 4DF8A 4I7FA 4LF7K 1KAXA 2DTUA 4CGDA 4WFAL 3CCRN 5I3UA 4JKCA 3SAFA 3EZ5A 3G4SN 3QEIA 3BF1A 3WQUA 4F2RA 3QEXA 4JD2B 3HOSA 1U6ZA 5AR0A 2QEXN 2Q1NA 1FKOA 3VEXA 3SBTA 3BDPA 4OVLA 3HI0A 4RW8A 4CZIA 4H4MA 3L2UA 3G10A 1OH8A 2F4VK 3SBGA 1XMQK 3TSPA 1BWFO 3U9ZA 2P9NB 3UKRB 4DHYA 5AQGA 3L2QA 2HVHA 5JLHA 3VQ9A 4JS5A 4KTWA 3T1YK 3JS6A 1HPZA 4K43A 2DFEA 3FFIA 4BC3A 2RKIA 3VETA 4E0DA 5C24A 3AA3A 4CJWA 2I7NA 3VQBA 5DM7L 1NJIO 3VN5A 3WUHA 1JLGA 4WFNL 3HT3A 3SQ0A 5C25A 4DSJA 5F1XA 1IJJA 3CJ9A 5AQWA 3V81A 3J81O 1QQNA 5AQJA 2P9KB 4WCEL 1VSLA 4K0KK 2Q97A 3K9KA 3K58A 5KGXA 1N6QA 2KW4A 5ELZA 3CFRA 1VQ9N 1Z26A 4JKEA 4AM6A 3RMCA 4BDYA 5HRNA 1Q7YO 3H46O 3H45C 4AHRA 3NH0A 3OJUA 3HP6A 4IDHA 1NK8A 1NGIA 1ZBHA 5EY4A 4DQRA 4BR9A 3PLAA 4CK2A 3DRSA 1RBSA 4J2EA 4PUOA 4KKOA 2F8TA 1XWLA 2O4IA 2E4LA 3OYAA 1EXQA 1NBWA 4A5AA 3LDLA 4B8AB 3PSFA 3TABA 2W42A 3ZSRA 3BZKA 4O4GA 3P1GA 4I9LA 3VTHA 2OA8A 2FBTA 1IKXA 4CJVA 4Z4FA 4DQQA 4YOYA 4KO0A 3THVA 3VQEA 3AA5X 4NCBA 2HHTA 2YNGA 3VERA 2D1KA 2IVPA 5F2RA 3KLIA 3QNOA 4M3RA 2G8UA 1RTJA 4FJIA 4R5PA 1VQ6N 4FM2A 1DKGD 4AILC 1RT6A 4V19S 3KKSA 1Z6RA 2I5JA 3OA9A 3BUZB 4JKFA 1HPMA 1X3MA 1RBUA 1C1BA 3CYMA 4DV7K 3K5MA 1TUYA 2DPNA 4F3TA 3WXLA 5LJVA 4FJ8A 3HZ6A 4FWKA 3M8QA 1MWKA 3MN6A 2ZF5O 3V9WA 3O9RA 4IG3A 1XQSC 3H3NO 3ZT2A 3LWMA 1JLFA 4PKGA 1W2BM 1IO2A 4I2PA 3Q7CA 4CBWA 3H08A 3MXMA 4KHPK 3K59A 1C1CA 3QNNA 1U49A 4DTSA 1WB9A 3FGUA 3NGIA 4FVMA 5M1OA 3CCUN 4KREA 2YCHA 2P9UA 1YVNA 3VEYA 3A2FA 3ZSYA 4WQ4A 2O8FA 3TTFA 3RRHA 1BCMA 3ZETB 3CHWA 4FLTA 1E3MA 4C8OA 4O8UA 2HW3A 3O1WA 2P9SB 3LAKA 4DMNA 1IBKK 5IWAK 1LW2A 5C12A 4O5FA 5BR9A 1P90A 4CI6A 2IIRA 2QWRA 2GTDA 4DTMA 4A2AA 5J2PA 1S6PA 4H0YB 3WNHA 3OYJA 2BDPA 2OPPA 1NGCA 3E9LA 3CFOA 2WTUA 2YKMA 5AQMA 1OVQA 3IRXA 1JLEA 2PZSA 4WFBL 5BPLA 2EX3A 3T3FA 5HLFA 1BI4A 4O0JA 3R1XA 4IKFA 4AHUA 4BR5A 1GOCA 3ENHA 4F9OA 1VQPN 3TU5A 4DR4K 2PAVA 5BPMA 1M90O 2KFZA 3QEPA 1EP4A 1LCUA 2JLEA 3HBTA 3TWHA 4BRDA 1KVCA 2UXBK 2Z1HA 1KFDA 4FWOA 1KFSA 3HL8A 3JXUA 4IFYA 3H6EA 2O8EB 3IDHA 1TGOA 4C1NK 1YJWN 2IDOA 5BRFA 3AA4A 4IO8A 1DLOA 4O8KA 3KLGA 2WFBA 2I7PA 1NK9A 4M3XA 3K9JA 3PO5A 1NNEA 1TYQB 1QQMA 3SQ4A 2CH6A 2HNDA 2OPQA 4CECA 5EU7A 1HR0K 2E5LK 1ZYQA 4DU4A 2QTDA 1BQMA 3OW2M 1ASVA 3AO4A 3WNEA 5M1FA 3RMDA 4YDUC 3SUPA 5FLXO 4FW1A 3OYLA 4BE2A 4BRMA 4KHWA 3D7EO 3VEWA 1SL1A 2EHGA 5CE3A 2ZJRL 5JMVA 4KTZA 4NB4A 1WSHA 4CZGA 4CEFA 4DV0K 4PA1A 3JAMO 3HTVA 4M7YA 1VSMA 4KFBA 3OYDA 2YI1A 3DI6A 4ELVA 4XH5A 4DLEA 4IOCL 3RR7A 1U48A 4CW7B 4CHNA 4JI0K 3C0BA 1SKSA 3AO2A 3QICA 5AJ3K 4CIFA 4KRFA 3C6UA 3P39A 3EKUA 4CJKA 3DWLA 4HUEA 5AZJB 4FJ9A 4QOZB 4CZLA 3FZHA 3T1HK 4MO4A 2IS3A 4I9QA 3QDKA 5GINA 1XI1A 3D2EA 5EX5A 5GIOA 5KQDA 3DOLA 3P83D 3WNFA 2V51B 2RN2A 4BREA 4Y1CA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4G9Z A;  3Q7B A;  3MX5 A;  4GV6 A;  4GV9 A;  4GVE A;  3MX2 A;  4GV3 A;  3MWT A;  3Q7C A;  4FVU A;  3R3L A;  3MWP A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 5J2M A;  3WXM B;  2OPR A;  4DR6 K;  2UUB K;  3PX6 A;  5C2F A;  1K73 O;  3KJV A;  2FSN A;  5IT9 O;  3JYT A;  2HHU A;  2IVO A;  3HST B;  3UE5 A;  5DK5 A;  3MK6 A;  2O8B B;  3QML A;  1NGA A;  4O0I A;  4LFB K;  4CEB A;  1KAY A;  3HPH A;  1KRP A;  1C1A A;  2IOC A;  4DTR A;  3ULD A;  4DQ8 A;  1IBL K;  3MEC A;  4JK9 A;  1R59 O;  1E4F T;  5BRE A;  3LZI A;  1NGB A;  3CCS N;  4MLH A;  4FLX A;  2P9P A;  3O4Q A;  1IBM K;  2XY5 A;  4B9U A;  3DLR A;  3AVC A;  2A5X A;  2UUA K;  2NRW A;  3I0R A;  1NJW A;  5AFU H;  1Q9X A;  4OLA A;  4BAC A;  1BDG A;  4BE0 A;  4K42 A;  3ZET A;  4FLU A;  3O3G A;  1T03 A;  4OO1 J;  3OYF A;  1EKE A;  1RT5 A;  2OPS A;  1C0U A;  1YT3 A;  4OPK A;  3DJC A;  4E7I A;  3PUF A;  3A5O C;  5AQL A;  1N33 K;  1RDW X;  3KD5 E;  3MCP A;  5GAD P;  1WUA A;  3NH1 A;  4L8R B;  4YHH K;  5C0Y A;  2WBN A;  4CF0 A;  1NGH A;  5CY4 A;  3K5O A;  2GBZ A;  3DXK B;  2E20 A;  3GE1 A;  3U3G A;  4NYN A;  2KKZ A;  3SYZ A;  2FBY A;  3Q7B A;  4Z4G A;  4B1X B;  2V7Z A;  4BWM A;  4CJ4 A;  4OPH A;  1VQK N;  1JKH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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