4GBRB

N-terminal t4 lysozyme fusion facilitates crystallization of a g protein coupled receptor
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
NIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title N-terminal t4 lysozyme fusion facilitates crystallization of a g protein coupled receptor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein/hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor
total genus 50
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4gbrB00
103LA 180LA 4I7RA 2RAYX 1P6YA 1L08A 1ZURA 2OU9A 1P2LA 3V2YA 1KS3A 147LA 3RZEA 113LA 1ZWNA 1L15A 252LA 115LA 1L30A 3EMLA 2RH1A 2IGCA 1QUDA 3HTGA 143LA 1L86A 1L92A 232LA 1C6AA 102LA 104LA 217LA 2F32A 212LA 4I7MA 131LA 182LA 1CX6A 4LDOA 3GUPA 128LA 160LA 1C6TA 1CUQA 151LA 3SBAA 1C6QA 3HUAA 1SX2A 3DN8A 1L0JA 172LA 4K5YA 1OV7A 1CTWA 164LA 3SN6R 1L61A 1LYEA 1C6NA 1QTZA 1C6PA 140LA 259LA 1L23A 1L79A 1JQUA 2F47A 1L20A 4DAJA 238LA 2NTGA 3C80A 1QSQA 1L13A 1LI3A 3DMVA 1LYHA 3SB9A 248LA 3NYAA 4LDLA 4IAPA 5I14A 257LA 3HDEA 1OVHA 1SSWA 1L0KA 1L06A 6LZMA 1P64A 1L01A 4EKQA 1L91A 214LA 233LA 230LA 3C82A 170LA 184LA 247LA 107LA 1DYGA 1JTMA 4I7OA 1L16A 3FA0A 4EKSA 240LA 2OE7X 1C66A 4PK0A 4ARMB 141LA 3OE6A 1PQJA 1T8GA 163LA 1L89A 256LA 4S0WA 234LA 3C7WA 224LA 1L27A 4W56A 2LCBA 2O79A 146LA 3C7YA 3HT6A 3HTBA 1L05A 4ARQB 246LA 2OTZX 142LA 1CV4A 1OWZA 2OU0X 3C8QA 2B72A 1P2RA 3HU8A 1D2WA 2ANXA 4AQNA 1L73A 3SBBC 2Z6BA 3L64A 1QUOA 3GUOA 5LZMA 1L58A 1G0PA 4OO9A 1OVKA 1L75A 4E97A 1L53A 4LDEA 139LA 4W53A 1C6KA 3NY8A 1PQMA 181LA 2RBNA 150LA 3DMXA 1I6SA 1QSBA 1KW5A 1C64A 123LA 149LA 1L36A 2LZMA 2B75A 4W58A 1L67A 1L95A 235LA 2O4WA 229LA 3HWLA 2B74A 4ZPUA 1L28A 4I7QA 1CU0A 1L46A 1L02A 3DN3A 1XEPA 1P37A 4GRVA 1OV5A 4ARLA 1L48A 1LYFA 189LA 4EXMA 3HUKA 4W52A 4EKPA 2HUKA 3C83A 1C6MA 1G0GA 1L68A 1L64A 3VW7A 1LYGA 1L74A 3QAKA 4W57A 4YX7C 1L10A 1KY1A 1L63A 210LA 2F2QA 1PQIA 1L85A 4W54A 1L14A 1L88A 1L72A 3HDFA 1LI6A 1DYBA 2RBRA 152LA 4W55A 262LA 1KW7A 1C6LA 220LA 1QUHA 3G3VA 2HULA 1C67A 108LA 251LA 126LA 4EJ4A 186LA 177LA 2QARC 3HU9A 1L52A 1G07A 4I7PA 1L25A 1L44A 3RUNA 4EKRA 4GBRB 1SWYA 2RB0X 231LA 211LA 250LA 4I7KA 215LA 3OE8A 4YXAC 145LA 120LA 1CVKA 2B6YA 1SSYA 1LLHA 7LZMA 3C8SA 1L93A 1P7SA 260LA 1LWGA 1LYDA 1P3NA 161LA 3GUKA 3GUNA 1L33A 4LZMA 118LA 137LA 2ANVA 196LA 2OTYX 1L76A 1L35A 226LA 1C61A 3CDQA 3SB8A 2RBQA 1QT8A 3FADA 1WTHA 241LA 165LA 1K28A 1C6JA 1C6HA 197LA 2L78A 2NTHA 239LA 156LA 1G1VA 1D9WA 4YXCA 1L96A 255LA 158LA 1L17A 1D3NA 1L84A 4ARMA 4I7TA 1C6DA 4PJZA 1L90A 110LA 205LA 219LA 253LA 1NHBA 4ARJA 3OE0A 1L41A 1L99A 245LA 1L42A 3ODUA 138LA 4DJHA 190LA 1L39A 125LA 1L09A 3OE9A 1L45A 3C8RA 4ARPA 1G0JA 2B6TA 157LA 1L66A 1QTHA 112LA 2RBOA 1L98A 1CV6A 1QTDA 2B70A 168LA 2B6ZA 213LA 1LWKA 175LA 1KY0A 3HT7A 3G3WA 242LA 155LA 1T8FA 2RBSA 1L77A 2RBPA 3SB5A 1L21A 1L37A 122LA 1QS9A 2QB0B 1QTVA 218LA 3DMZA 3FI5A 3HH6A 3K2RA 1L12A 1L32A 1P36A 195LA 1C6EA 2LC9A 1L71A 1L83A 1T97A 3C81A 2OU8A 1B6IA 2OE9X 188LA 3L2XA 1L31A 1PQDA 119LA 1CX7A 3CDRA 3PBLA 3HT9A 1C63A 2RB1X 3GUMA 3PDSA 1L82A 2B7XA 1LPYA 114LA 1G1WA 1L22A 2B73A 3HUQA 1PQOA 1C68A 1L50A 3HH5A 3DNAA 206LA 1L51A 1XJUA 254LA 1L47A 2RB2X 3GULA 1L97A 199LA 3NY9A 1L94A 1P5CA 176LA 4I7LA 3GUJA 1L81A 1C6GA 3LZMA 2Q9EA 4I7NA 130LA 1DYDA 1L04A 3DN0A 4I7JA 1L38A 129LA 201LA 1QT3A 185LA 227LA 173LA 144LA 223LA 1XJTA 1QTCA 3CDVA 1LYJA 261LA 191LA 244LA 1P56A 3F9LA 1L40A 1QT4A 209LA 1L49A 1QT6A 1C6IA 1L65A 249LA 3V2WA 1CV5A 225LA 1L03A 3UONA 3DN2A 4ARQA 3DKEX 1C6BA 1L24A 3DN6A 3HTFA 183LA 127LA 1L57A 2OEAX 3D4SA 4DKLA 1C65A 2O7AA 1D3JA 1L26A 3CDOA 1QS5A 187LA 1D2YA 1CU6A 1L29A 1L69A 3C7ZA 1CU3A 1EPYA 237LA 1C6FA 2OE4X 4I7SA 1DYCA 1SX7A 2HUMA 1L07A 169LA 222LA 258LA 4EPIA 1L54A 1C62A 1L87A 4W59A 1L18A 1CV0A 1L55A 3HH3A 243LA 1PQKA 2B6XA 1L80A 236LA 192LA 3SB7A 1CUPA 2B6WA 1DYAA 3DN1A 228LA 1SWZA 2RAZX 1LI2A 3CDTA 178LA 4W51A 3HTDA 3HH4A 1L34A 1LGUA 1T6HA 200LA 3G3XA 1QT5A 1QT7A 1ZYTA 1L43A 1CV1A 1C6CA 198LA 174LA 1DYFA 3SB6A 1G06A 221LA 1G0QA 1L19A 1D3MA 1CU5A 1G0KA 1P46A 1D3FA 1TLAA 1LYIA 1CU2A 1JTNA 1DYEA 159LA 1L70A 1L62A 1OYUA 1LGWA 2A4TA 2CUUA 1L56A 216LA 1LW9A 3DN4A 3GUIA 1L11A 1CV3A 171LA 1L00A 166LA 109LA 148LE 167LA 1G0MA 1OVJA 1C60A 162LA 2Q9DA 111LA 1C69A 1KNIA 1OWYA 4EPFA 1QUGA 1G0LA 3HT8A 1T8AA 1QTBA 3JR6A 1L60A 3F8VA 1LGXA 1L59A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4A7DA 4HTQA 1IX0A 1ZURA 5LAFA 2OU9A 3A93A 1QSAA 1KS3A 1LJGA 147LA 4DT3A 252LA 3LYZA 3WVXA 1LJJA 1HMLA 1L92A 232LA 3TMVA 102LA 104LA 217LA 4YENA 128LA 1B7QA 1G7LC 3HUAA 1SX2A 1F0WA 4DDBA 4B1AA 5I4YA 172LA 4GCBA 4K5YA 1OV7A 4NFVA 2D4KA 4WLXA 1JKBA 3FE0A 140LA 2DQAA 1LJHA 3C80A 1LYHA 4MCKA 2D4IA 5I14A 257LA 1LSGA 1L01A 4D9ZA 4Z3MA 3WU9A 4CGEA 1LMNA 230LA 170LA 184LA 4I7OA 2DQGY 3LYMA 1B5VA 1AM7A 3LZ2A 1UIHA 4PK0A 4S0WA 2EPEA 3C7WA 1WQOA 1BWHA 4W56A 1DI3A 2LCBA 3TXBA 4GCDA 4ARQB 1IY4A 1CV4A 4OOOA 5FELA 5APEA 1BHZA 1LHJA 1GD6A 2LYOA 1B5ZA 4GCEA 4OO9A 5HLLA 139LA 3CT5A 1REXA 150LA 3DMXA 1F6RA 1I6SA 1KW5A 123LA 1L36A 1L67A 1CJ6A 235LA 1JISA 1GB8A 1DI5A 1L28A 4ZIXA 1OUGA 3LN2A 1VDTA 1L02A 2F4GA 1IWVA 189LA 4EXMA 1GFEA 3HUKA 3WU7A 4W52A 4QEQA 3C83A 5HQ1A 1XEIA 2YVBA 4W57A 2Z18A 4ETDA 1L63A 1NMMA 2A7FA 4W54A 5KXRA 1J1OY 1DYBA 1LI6A 1NDMC 2RBRA 3HBHA 2DQDY 4PPOA 1BB4A 1WVUA 262LA 1C6LA 2F2NA 1DPXA 2HTXA 4H90A 1LZEA 1A2YC 5F16A 4WMGA 3MGWA 1IWUA 2MEIA 4NGWA 4B0DA 1L44A 3RUNA 4DDAA 3AJNA 2RB0X 211LA 3B72A 4I7KA 3RZ4A 1XGRC 3TXFA 1D6PA 4YXAC 1GF5A 1CVKA 1P7SA 260LA 1LYDA 1IOSA 1GBZA 1P3NA 3W6AA 1YAOA 1B7OA 4NSHA 3W6CA 4IJ4A 3W6EA 5LYZA 1L35A 2XJWA 3P68A 1QDTA 2RBQA 3ZVQA 241LA 4NSIA 4DD9A 197LA 1GBYA 156LA 1TAYA 1QIOA 1D9WA 1HF4A 1HMKA 1BB5A 1L96A 1L17A 1D3NA 4OOTA 1PS5A 1C6DA 4I7TA 4ARMA 205LA 4M6DA 253LA 3EBAB 1IWYA 245LA 3ODUA 1AT6A 138LA 4DJHA 125LA 2W1MA 3OE9A 1L45A 3C8RA 4H9FA 4EOFA 4LFPA 1LAAA 3WPLA 1QTHA 4IATA 2EQLA 2RBOA 1KIQC 3A94A 168LA 213LA 3WMKA 175LA 1KY0A 1EQ5A 3HT7A 3G3WA 1NDGC 3SB5A 1L21A 1L37A 2QB0B 4XJIA 4HSFA 1XEKA 1FLYA 1JIYA 1LZ9A 195LA 2LC9A 4U3XB 4QY9A 3BKHA 3W6DA 5APCA 5KXMA 3CDRA 3PBLA 2BQKA 3GUMA 4ETEA 1G1WA 1TCYA 1QTKA 3HH5A 1IWZA 1JTTL 3D9AC 206LA 1IY3A 1L47A 2LZ2A 1HEWA 3NY9A 1L94A 2ZWBA 1LSCA 5A3ZA 3WL2A 1LZDA 3GUJA 3ATOA 1CJ7A 1DYDA 4YOPA 1L04A 4I7JA 173LA 1QUSA 1RJCB 4W96A 2MEAA 1XJTA 4NSJA 244LA 2PC2A 1OQMA 1G7HC 3T36A 1L49A 2ZIKA 1JTOL 1GE4A 2FBBA 3TMUA 5LVKA 1CV5A 4I8SA 3P66A 1B7NA 2G4NA 5ILCA 3EO5A 1C7PA 4LYMA 1QSWA 1C6BA 183LA 1JSFA 4H93A 2O7AA 1D3JA 4RW1A 4WM1A 1CU6A 1DQJC 3A6CY 1LSMA 1LJEA 1DYCA 4BS7A 3CT0A 169LA 1LJ4A 1GAZA 1Z55A 1LJNA 4WLDA 4W59A 243LA 1PQKA 1JWRA 2B6XA 1L80A 1UBZA 4NY5A 1OUIA 3SB7A 2B6WA 1DYAA 3DN1A 1IR7A 3CDTA 178LA 4W51A 200LA 4IASA 1ZYTA 4N8ZA 1CV1A 1C6CA 4WL6A 4RDSA 1CU5A 1GB9A 3WPKA 1HEMA 5C6LA 4OWAA 2I26L 1LSAA 3QE8A 159LA 1L70A 1L62A 1ZVYB 3DN4A 2A4TA 2CUUA 1L56A 4Z98A 2RSCA 1L11A 2CGIA 2BQOA 1G0MA 109LA 5DM9A 1NBYC 1JKDA 5LYTA 1C60A 162LA 4GN4A 5B1GA 4HTKA 1QUGA 1IC5Y 3P4ZA 4DQ5A 3B0IA 103LA 180LA 3IJVA 4NGIA 3WXTA 2RAYX 1P6YA 1LCNA 2HEAA 4OW1A 3RZEA 1GPQC 2YBNA 2I6ZA 4TSCA 1G7JC 1QUDA 143LA 1L86A 4LYCA 5LYMA 2MECA 2F32A 3EXDA 212LA 2FYCA 1GEZA 182LA 4NG1A 3GUPA 160LA 2BQIA 1C6QA 1UIFA 3SP3A 2BQNA 3DN8A 1YL0X 1L0JA 4G4BA 3A96A 3TXDA 1BB7A 2F47A 5EBHA 238LA 2BQLA 3SB9A 1BVKC 1SSWA 1XGTC 3EMSA 4EKQA 1L91A 1LYZA 4RW2A 214LA 3C82A 4XJGA 107LA 1DYGA 5K7OA 5L9JA 2C8PA 5DLAA 1PQJA 3TXEA 224LA 194LA 4YEMA 6LYTA 193LA 1LYOA 1RE2A 1C43A 4LGKA 246LA 1REZA 2D4JA 2OTZX 142LA 3HU8A 4AQNA 3SBBC 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3CSRA 1L71A 1LMCA 3C81A 2CJLA 1L31A 3T6UA 5FSTA 119LA 1CX7A 1C63A 2RB1X 1LZ4A 1DPWA 1L82A 1F10A 4PHIA 1GB0A 1C68A 1L50A 2BQFA 2Z12A 4O34A 4QGZA 1XJUA 2ZILA 1GF6A 5B59A 135LA 1LHKA 1RI8B 1L97A 5LINA 199LA 1D0KA 4CFPA 1P5CA 5KXLA 5IDDA 4RLNA 4NHIA 1C6GA 2Q9EA 1XFPL 4I7NA 3OJPA 3A34A 3DN0A 201LA 129LA 1KXXA 1QT3A 4OWCA 3W6FA 4LT0A 227LA 223LA 5LVIA 5E4PA 1QTCA 5KXKA 1QT6A 1C6IA 1L65A 4LT2A 1WQMA 1PZYA 1L03A 1OUHA 1TEWA 4WG7A 4TSBA 2YBMA 2MEDA 1UACY 3HTFA 2CDSA 1YIKA 4N0JA 5LVJA 3CDOA 187LA 4TUNA 1NKHA 1EPYA 237LA 4I7SA 8LYZA 1D0LA 2DQIY 3TXHA 222LA 1UIDA 4ZFPA 4J0LA 5L3IA 1B7LA 1L18A 4WM3A 1W08A 1ZVHL 9LYZA 1KIPC 1OUDA 2D91A 4C5FA 192LA 5KXNA 4H9BA 5C6JA 1CUPA 5HMVA 3WYHA 4WO9A 1SWZA 4J1AA 1GFUA 1QT5A 2BLXA 4NGYA 1DYFA 3ZVQB 1G0QA 1GFTA 5D5CA 2FYDA 1G0KA 4WL7A 1W6ZA 2BQCA 1JTNA 2YDGA 4ARMB 216LA 1LW9A 3GUIA 1IP1A 1CV3A 4E3UA 1JHLA 1C69A 4EPFA 2XQOA 1GF4A 4Z41A 4FJRA 4AXTA 1LHMA 1LSDA 4NSGA 4UWUA 1GDXA 4I7RA 4H91A 1L08A 4DWXA 1P2LA 1HEQA 3V2YA 5HNLA 113LA 115LA 1GE1A 2RH1A 4PRUA 2CWIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4A7D A;  4HTQ A;  1IX0 A;  1ZUR A;  5LAF A;  2OU9 A;  3A93 A;  1QSA A;  1KS3 A;  1LJG A;  147L A;  4DT3 A;  252L A;  3LYZ A;  3WVX A;  1LJJ A;  1HML A;  1L92 A;  232L A;  3TMV A;  102L A;  104L A;  217L A;  4YEN A;  128L A;  1B7Q A;  1G7L C;  3HUA A;  1SX2 A;  1F0W A;  4DDB A;  4B1A A;  5I4Y A;  172L A;  4GCB A;  4K5Y A;  1OV7 A;  4NFV A;  2D4K A;  4WLX A;  1JKB A;  3FE0 A;  140L A;  2DQA A;  1LJH A;  3C80 A;  1LYH A;  4MCK A;  2D4I A;  5I14 A;  257L A;  1LSG A;  1L01 A;  4D9Z A;  4Z3M A;  3WU9 A;  4CGE A;  1LMN A;  230L A;  170L A;  184L A;  4I7O A;  2DQG Y;  3LYM A;  1B5V A;  1AM7 A;  3LZ2 A;  1UIH A;  4PK0 A;  4S0W A;  2EPE A;  3C7W A;  1WQO A;  1BWH A;  4W56 A;  1DI3 A;  2LCB A;  3TXB A;  4GCD A;  4ARQ B;  1IY4 A;  1CV4 A;  4OOO A;  5FEL A;  5APE A;  1BHZ A;  1LHJ A;  1GD6 A;  2LYO A;  1B5Z A;  4GCE A;  4OO9 A;  5HLL A;  139L A;  3CT5 A;  1REX A;  150L A;  3DMX A;  1F6R A;  1I6S A;  1KW5 A;  123L A;  1L36 A;  1L67 A;  1CJ6 A;  235L A;  1JIS A;  1GB8 A;  1DI5 A;  1L28 A;  4ZIX A;  1OUG A; 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