4H03B

Crystal structure of nad+-ia-actin complex
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
370
structure length
357
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin/structural protein
source organism Clostridium perfringens
molecule keywords Iota toxin component Ia
total genus 122
structure length 357
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h03B01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h03B02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h03B03
1BA1A 1NGHA 2UYTA 4FWSA 5AQRA 3DXKA 4B1VA 5AQYA 4WQ5C 4B9QA 1DEJA 5JMVA 1K8KA 4H5RA 2ASMA 3R6MA 4RCHA 5B8HA 3MK6A 3ENHA 4BRAA 3BEXA 1OKJA 1GLEG 2P9SB 5AQWA 3L0QA 2P9KA 3A8YA 1EQYA 5AQTA 3UKUB 5EXWA 4BRHA 2HF4A 4M7YA 3WEEB 5AQIA 3MMVA 1XC3A 4ISGA 2HMPA 2P9LB 2QWQA 4FOEA 2FXUA 4BGAA 4HWIA 2QWNA 3HM8A 1RGIA 3ID8A 2E2PA 3UE5A 2P9UA 1HKCA 3LDLA 3ZETB 3MN5A 2J4RA 2P9PA 3SK3A 3ZEUB 2A40A 4JAXA 4FWRA 4BRFA 3EKSA 3MN7A 4BC5A 2A3ZA 1YXQA 2BUPA 5AQSA 4FWLA 4PL8A 3I8BA 3FLCO 4BRLA 3ULEB 3IUCA 2E1YA 4CZJA 5EY4A 3WQUA 3WQTA 3IMXA 2P9KB 2HF3A 2QXLA 4EHTA 3KZBA 4IJNA 4DB3A 1GLFO 2YHYA 5LJVA 3H3OB 3FZFA 1Y64A 2FSJA 3B8AX 4CI6A 1KAYA 1U6ZA 5KPZA 4WYBA 1T6CA 5JLHA 1GLCG 2ASPA 3QFPA 3M1FA 4A62A 3I33A 2A5XA 4IZ9A 3VEZA 4BRQA 4BRCA 2KHOA 4H0YB 3DXMA 1Z6RA 2I7PA 4FWMA 2P9UB 4BC3A 3GG4A 5JLFA 1QQMA 3KHYA 2BTFA 4K25A 4JNEA 3H3NO 3DJCA 1DKGD 4K42A 5BRDA 1BDGA 5AQNA 3AARA 1GLAG 2V51B 2YHWA 3SJHA 3FGUA 1XQSC 3VEVA 3BP8A 4CBWA 3L6QA 3FZKA 4MO4A 3LL3A 4IXCA 2QWPA 1ZBSA 2NZTA 4BROA 3A5OC 4H5TA 3CI5A 4CD3A 4NO7A 3CJAA 3UKUA 1MA9B 2Q1NA 3A5LC 2GWJA 3O4WA 2EWSA 2D0PA 5AZJB 2GELA 3VF4A 1BG3A 3AY9A 1HKGA 2W40A 3GDQA 3H45C 3WXJA 2QWOA 4IJAA 1HX1A 5CE3A 1BOTO 3JS6A 3A5MC 3C7NB 5BREA 1HPMA 5AQOA 4BQLA 3LDPA 4H5WA 5EX5A 2E2NA 3FZLA 3ZETA 5AQHA 3EL2A 2P9NA 2FSKA 3AAQA 1C0GA 4GY2B 1LCUA 3VERA 3FFKB 5AQXA 3GBTA 5AQZA 3VETA 1LOTB 3SMPA 1BWFO 2GEMA 5AQLA 2PBDA 5I9EB 4Z94A 3LDQA 3GOIA 2Q0RA 4AM7A 2NLXA 3ULEA 2GUPA 3QFUA 3MN6A 3U4LA 3BUZB 4FWNA 2F9TA 2GTDA 2ZGYA 1ATRA 2QW9A 4CD1A 4RWTA 4M7XA 2A41A 2ZGZA 2V52B 3CJ9A 1KXPA 4FSVA 2W41A 5BR9A 4PKGA 5F0XA 4BRPA 4BR5A 1H1VA 4CZHA 4BR4A 1RDWX 3C0BA 3ATUA 1BUPA 5ADXA 1R59O 5BRHA 2WUSA 3CJBA 1YVNA 3EZWA 1DGKN 2CH5A 4K41A 3A0IX 1NLVA 2P9NB 4BR7A 3ZX0A 5BRFA 4BREA 1P8ZA 2CGKA 4BRGA 1CZAN 4IWVA 4QS8A 2QWMA 2V7YA 2YJFA 4MO5A 4RTFD 3KVGA 4BQZA 4L3QA 3M6GA 3O8MA 4FL9A 3BF3A 3O08A 1U2VA 3GE1A 1GLLO 1QZ5A 4MLHA 4BRDA 4DQ8A 1KAXA 3UKRB 4CZMA 3VENA 5ADXH 1MDUB 3VEYA 1NGGA 3WUHA 5AQVA 1BU6O 2FSNA 4FPBA 5AZJA 2HOEA 3VF6A 3EKUA 1NGFA 1ATSA 4F9OA 4EFHA 4BVPA 2GWKA 3VF2A 1ATNA 2E1ZA 2VWBA 3CIPA 1QQOA 1MWMA 1NGEA 4B1ZA 4BR9A 2DPNA 5BPMA 1HJOA 3RSEB 3C7NA 1E4GT 4YDUC 1SAZA 5AQFA 1QQNA 4BGBA 4EHUA 5ELZA 3ATVA 1NM1A 1S3XA 1BA0A 3J8AA 2FF6A 4WQ4A 3F9MA 3MDQA 3SLCA 3VEOA 1S22A 1T44A 3FZHA 3OHRA 5FPNA 3CQYA 4BRMA 1GLBG 2YCHA 2NRHA 4H0TB 3HBTA 4XH4A 1YUWA 2IVOA 2VYPA 3IDHA 4H5VA 1NGBA 1U2VB 1WUAA 2E88A 3A5NC 4ISFA 3U8XA 2PAVA 1JCEA 4I6MB 2CGJA 2D1KA 4FOIA 2OANA 1J6ZA 4JHDB 5AQKA 4CZFA 1HUXA 2I7NA 3CERA 3D2FA 3EO3A 3VEWA 2QWLA 4CZKA 3JXUA 3UB5A 3HSCA 4XH1A 5LJWA 3HTVA 4BG8A 2AA4A 4CBXA 1NGIA 3CQXA 3VESA 1NGAA 3QMLA 4H5NA 5AQMA 4BC4A 3G25A 4H03B 1TUUA 2A42A 5F1XA 2ZWHA 4H0VB 4JN4A 2FLOA 2H3GX 2Q31A 3QBWA 4ISEA 4A2AA 1X3MA 5EVZA 2AP1A 3CETA 5FPMA 2E8AA 3R8EA 5KQ8A 1KAZA 4BG9A 1IG8A 4HTLA 4JD2B 3P4IA 2P9IB 3ZX2A 3QBXA 4O5FA 3LDOA 3SMSA 2Q2RA 3UKRA 4B1XB 1SZ2A 2E2OA 3D2FB 2A6AA 2E2QA 5AR0A 3BF1A 3MN9A 5TKYA 3CJCA 5AQPA 1JCFA 2QM1A 3LDNA 5KQDA 2Q36A 1E4FT 2Q0UA 5BN8A 1Z05A 3RSEA 4BR0A 2ITMA 1MWKA 4PKHA 4BC2A 5BN9A 2FF3B 4GNIA 4FWOA 4H0PA 3D2EA 5FPDA 5LY3A 4A2BA 3TPQA 4M63C 3H46O 3QB0A 4CJ7A 3R9PA 1V4TA 1GLDG 2D4WA 1JCGA 2IIRA 5AFUA 3ENOA 5AQUA 1QZ6A 3WXLA 1NGCA 4EIAA 3QDKA 4WQ5A 4XEIA 4WQ4C 3WXIA 3H1QA 3QICA 4NB4A 4I6MA 1HLUA 4KBOA 1NGDA 3HZ6A 4JHDA 4E1JA 5KPRA 1NGJA 2ZF5O 4B1UB 3CJ7A 1YAGA 3CJ1A 3DWLA 2YHXA 3DXKB 2V7ZA 5E26A 1K8KB 1X9JA 4AM6A 1ZXOA 3CHWA 3WT0A 3ZX3A 3DAWA 5AFUH 1ZC6A 1TYQA 4H0OA 1TUYA 3D2EB 1RFQA 1NBWA 3WXKA 5AQJA 3O80A 1ESVA 5E84A 2CGLA 5JICA 2QWRA 3FR0A 3L4IA 4EAHD 4MLEA 5BPNA 1XUPO 4H0XB 3FE1A 4BR2A 1G99A 4BVOA 4PL7A 4A61A 4BRIA 4JD2A 5AZIA 2P9IA 3VGLA 1IJJA 3O5BA 4FO0A 3W3DA 4FWKA 3VGKA 2D0OA 2P9PB 4B1WB 1BO5O 1WOQA 5F2RA 2CH6A 5AQGA 3TU5A 5FPEA 2E20A 3O6WA 3MCPA 4K43A 3VEXA 4B1YB 3O1WA 2YI1A 3H6EA 3LM9A 2YJEA 4BRKA 4CZLA 1HKBA 3IFRA 1T6DA 4QS7A 4IO8A 4CBUA 3U9DA 4FWPA 1TYQB 3VPZA 1NWKA 3EN9A 3LM2A 4QS9A 2P9SA 4J8FA 4FWQA 3VGMA 4BRNA 2VCPA 1V4SA 4DCHA 3FZMA 4FPAA 4DHYA 4YDUA 3W0LA 2F9WA 1Q18A 3WEEA 1GLJO 4XH5A 4Y0WA 4O8KA 3VOVA 4LC9B 3S41A 2ASOA 3HI0A 2P9LA 3D7EO 5EOYA 4C23A 5KPTA 5AQQA 3U9ZA 4CZEA 5AZIB 1X3NA 3DXMB 4PKIA 2IVNA 2Q97A 3H1VX 1D4XA 1C0FA 3M3ZA 1NMDA 3AAPA 2IVPA 4CZGA 3ZEUA 1QHAA 5BPLA 1SQKA 3O1BA 3GL1A 4CZIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NGHA 1Q81O 2UYTA 4DR4K 3ZCMA 5HRNA 1DEJA 1ZYQA 2WBNA 4H5RA 2QTDA 2FBVA 1NK7A 3R6MA 1NMNA 3SYZA 4BRAA 2IS3A 3E1YA 5JVHL 2UU9K 3OYIA 1NJYA 5AQWA 2P9KA 1KFDA 4Z4IA 5EXWA 5JS2A 1IBMK 1NJZA 4H4MA 4M7YA 3WEEB 4AHCA 1VHXA 3OY9A 2C1IA 2HMPA 4FOEA 2FXUA 4BGAA 3HM8A 3LP1A 4JKBA 2G8FA 1VQ6N 3AVJA 1HKCA 1WSJA 4B9SA 2ITGA 3OYEA 4FZYA 1O13A 3SK3A 3ZEUB 2A40A 3ZT4A 4W5TA 4FWRA 4CW7B 4NXMK 4EP4A 3EKSA 3MN7A 3O4QA 4CGHA 1CXUA 2A3ZA 1YXQA 1TKDA 3N4PA 3QNOA 4OKEA 1DLOA 4DTUA 3HP6A 3K5NA 3ULEB 4KTWA 3BGRA 2HHHK 2NRRA 1RT5A 5FRMA 2P9KB 4LF5K 5M1PA 4DFJA 4DB3A 1GLFO 2YHYA 4DS4A 1HNZK 3FZFA 1Y64A 3B8AX 1KAYA 1U6ZA 1WAJA 2KQ2A 4W5OA 3OA9A 3IRXA 3R3LA 4A62A 3D0PA 2A5XA 4FW2A 4BRQA 4BY9C 4DV4K 1SKSA 3TTFA 2I7PA 3PX0A 4F2SA 4IEIA 4FJ9A 3LANA 3U3GA 4CF0A 5JVGL 2PY5A 4K42A 4DSIA 3KK7A 2V51B 2YHWA 2XHBA 4LF7K 3QLHA 3L6QA 3SQ1A 3FZKA 4IXCA 3EE9A 3S5TA 1NKEA 4A5BA 3LAKA 5HRRA 4BROA 4M41A 3ZSXA 1IKWA 2ATQA 1ASUA 1W7AA 5AZJB 4F4KA 3G10A 2W40A 1HX1A 2OCEA 1VSLA 5CE3A 3TR8A 1SS6A 3A5MC 3O9RA 4DFKA 5GAHP 2E2NA 5HROA 1U45A 3ZETA 3EL2A 4CJ5A 2FSKA 1VRUA 4GY2B 1EX4A 3KK3A 5AQZA 1KSPA 2GEMA 5AQLA 4NLCA 3VQ5A 4Z94A 3KJVA 3VQ4A 3LDQA 4OPKA 4BE2A 4BDYA 2GUPA 5C10A 4E1NA 3OYAA 3F73A 4DQRA 2ZGYA 3PX6A 3NH1A 3V4IA 1F21A 3NH2A 4M7XA 3MXJA 4DTXA 2P5OA 2XY7A 4DQSA 4FSVA 4JI8K 3OJSA 2W41A 3LZIA 1Q9XA 4PKGA 4FYDA 3I0SA 1RDWX 4NLBA 5C2DA 3AVAA 3ATUA 3U3YA 1SV5A 5BRHA 2WUSA 1DGKN 1S6PA 4PWDA 4DUZK 1UOCA 1TL1A 3NAEA 3ZX0A 4CJPA 4W5RA 1P8ZA 1NK6A 4HTUA 4DTJA 4RTFD 3KVGA 4BQZA 4A59A 3T7ZA 3SPYA 3AVFA 1TK5A 4FL9A 1SL1A 4V19S 5GINA 4ID5A 4E1MA 2YKMA 3BF3A 4BWMA 3RTVA 1U2VA 3V1QA 3ZYYX 4DQ8A 1KAXA 3UKRB 4DTPA 3TAGA 1VSJA 3WUHA 5AQVA 4DV7K 1BU6O 4KREA 3TAQA 4FLZA 2ZJQL 2HOEA 2BDPA 1NGFA 1ATSA 4DQQA 4KH6A 3CFOA 1ATNA 4U67L 2XO7A 3G4SN 4E7JA 3CIPA 3KKSA 4DTRA 4BR9A 1NGEA 1HJOA 1NU0A 3RSEB 1WSHA 4CHPA 4YDUC 5AQFA 2HHTA 4RW6A 3ATVA 5M1QA 2FF6A 3AVGA 4IOCL 3F9MA 1KLNA 4DKWA 1T44A 3FZHA 1Q82O 3AVBA 5CZ2A 4BRMA 2YCHA 4H0TB 3O3HA 4JRQA 2VGMA 2IVOA 4MDBA 5C25A 3IDHA 2W6KA 1RDBA 2YNHA 3NF9A 1U2VB 4KKOA 1WUAA 4DR1K 3Q7BA 1K9MO 3HYFA 1J6ZA 4CJTA 3HRGA 1Z25A 1HUXA 3UB5A 5JENA 4DR6K 3PIOL 4FJ5A 3L2WA 3E66A 3MEDA 1R0AA 4EZ6A 3LALA 3ZSZA 4B8CA 4H5NA 1RILA 4YOUA 5AQMA 1LWEA 2E4LA 2QKKA 4BECA 3N4QA 4ID1A 5F1XA 4KTQA 2Q31A 4RW7A 3HPGA 4CFAA 5FPMA 2E8AA 1VQ9N 4JK7A 1S72N 3L2QA 2P9IB 3QBXA 4JKCA 3LDOA 4AH9A 4CEAA 4GW6A 2D0CA 4B1XB 1A5WA 2E2OA 4CF1A 3HPOA 3NBPA 3BF1A 4N47A 2XY8A 2OPSA 2QM1A 3TTDA 5KQDA 2Q36A 4OGCA 2Q0UA 1VQLN 1TK0A 4FK2A 1MWKA 4I2QA 3QIPA 3D2EA 3ULDA 1JLBA 3LPTA 1D5AA 5GIPA 3TPQA 4M63C 1L3VA 4CGGA 5BR8K 4DV1K 2D4WA 2HBKA 3O4NA 5AFUA 1NGCA 4FM1A 3QDKA 4XEIA 3OVNA 4K0KK 1CZBA 3QICA 4I6MA 4KBOA 4NYNA 1NGDA 4DR2K 3HZ6A 3KLIA 3HVTA 4JHDA 4C8NA 4YHHK 4CE9A 3SUOA 5KPRA 2ZF5O 3CJ7A 3CC4N 1J9AA 1S9EA 3SJJA 4QCLA 1X9JA 4JI7K 4F3TA 4NYFA 3DAWA 5AFUH 1ZC6A 3AA4A 3D2EB 2IGIA 1RFQA 4WCEL 1X9SA 1HRHA 2E5LK 1JXEA 4M3TA 3VQAA 4KHUA 5JICA 3FR0A 2Z1GA 1XUPO 3VQ8A 1G99A 4PL7A 1C0UA 2PZSA 1JJ2M 5AZIA 1S1TA 3VGLA 3K5LA 4FO0A 3VQ6A 4C1NI 3BDPA 3VGKA 4IKFA 1WOQA 1YITN 5FPEA 3J81O 3J7YP 4W5NA 1QHTA 5CHIA 5KRSA 3VEXA 1BCOA 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3DXMA 1Z6RA 2P9UB 3LP3A 3SPZA 2BTFA 1WSEA 4WFAL 2HBJA 3CCSN 1BDGA 3EE8A 4CJVA 5HRPA 3AARA 1O1WA 3OJUA 1NKBA 4B9MA 3F5TA 1VQPN 2NZTA 3R1XA 3CC7N 5D3GA 4EZ9A 4BACA 4XJXA 4CEZA 1BIZA 4CFBA 2Q1NA 2GWJA 1IKYA 5FLXO 2D0PA 2GELA 1VQ5N 2RPIA 4DMNA 3AVIA 1RDUA 1HKGA 4Z0UA 3SAFA 4HHTA 2QWOA 3KTQA 2NRTA 1SL2A 3IS9A 1G15A 3O9UA 3PSIA 1S1VA 3AVCA 3PX4A 4C8OA 5BREA 1HPMA 3LDPA 3E9OA 5AQHA 2P9NA 1XWLA 1C0GA 3PV8A 2IDOA 1LCUA 1B9DA 5AQXA 3GBTA 1BWFO 4LFAK 4DSFA 3KWIA 4Y1CA 4DR3K 2PBDA 1RTHA 3MEEA 3IKMA 4CHYA 3GOIA 3AO3A 3AVLA 3ULEA 4FLXA 3U4LA 2F9TA 2GTDA 1J53A 4X66K 2GV9A 4RWTA 3VMFB 3MX5A 2V52B 1RT4A 3CJ9A 3PIPL 2YHBA 4LSNA 5F0XA 2A1RA 1N6QA 2X74A 4I9LA 1RTDA 2G8WA 1UA1A 2KW4A 4FM2A 3AA2A 4DLGA 1L3TA 1T7PA 5ADXA 1R59O 1OH5A 3S3MA 4JI6K 3A0IX 3QINA 2P9NB 1JLFA 4FJHA 2CGKA 1CZAN 1LW0A 4IWVA 2QWMA 2V7YA 2YJFA 1HNIA 1KCFA 1EWQA 3O8MA 2OA8A 1VSIA 4FK4A 4I7FA 3O08A 1A5XA 2HBLA 1Y97A 4MLHA 2P1JA 2HHSA 2W00A 4DSLA 5ADXH 4O55A 2IAJA 1ZBLA 1N8RO 5GADP 5C24A 4YOVA 5J1EA 5AZJA 3VF6A 3O3GA 3EKUA 1QVFM 3AVKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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