4HIBA

Crystal structure of human orotidine 5'-monophosphate decarboxylase complexed with cmp-n4-oh
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase
publication title Novel cytidine-based orotidine-5'-monophosphate decarboxylase inhibitors with an unusual twist.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 95
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2012-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4hibA00
1SZFA 2YSWA 5HQEA 3BO9A 3OIXA 3WJWA 2CZ5A 1EP3A 4DF1A 2I9EA 2CLFA 1DV7A 4K8EA 1FCBA 2DZVA 1KLYA 4G1KA 2NV2A 4QNWA 4UFIA 1ZJIA 2CW6A 1KV8A 3HPSA 1ZALA 3G1YA 4JS3A 2Q3OA 1R47A 4N9CA 3O1NA 5LZLA 1KA9F 4EWND 4UTTC 5DLCA 2DZPA 4POCA 3BW2A 1MEIA 2PRLA 2DZUA 4Y90A 1K8YA 3NPXA 5FEZA 3U6WA 4C1KA 1OHLA 3U8GA 2ZTJA 3W7EA 1TCDA 5BOOA 4MY9A 4JY8A 4KFPA 3CIXA 2Y89A 4IMCA 4RXGA 3ABRA 1PCKA 4AHOA 5LNVA 3L5MA 3T40A 3TSDA 1THFD 1L9WA 3A9IA 1LRTA 1P0NA 1LZOA 3Q58A 1OJXA 3P7YA 5G2HA 1KFCA 3P8JA 3W74A 1OFPA 5G5IA 1O60A 1JQXA 4MZ8A 1DORA 2C3ZA 1JCXA 4LC8A 1OFOA 4WQ6A 2CLMA 4CCDA 5KSWA 4S1FA 2VENA 1ZY9A 2NX9A 1TREA 4FF7A 5F4XA 2BZNA 2V0TA 1EB3A 1KM5A 3PBWA 1VQTA 3A23A 1UJPA 1LOLA 3B0VC 4P2VA 1YXYA 1KM6A 3HQ1A 5D09A 2E6DA 3LXBA 3WJYA 5KTLA 1KFLA 1Q6RA 4A29A 2A7RA 3P81A 4O12A 4FIRA 3C2FA 1TQJA 1JR1A 2GPTA 2C1HA 1TSIA 3UD6A 3QF0A 3MUXA 4MIMA 1YPIA 2ABAA 3FKKA 1AL7A 4GUFA 1FUYA 3HGJA 3CU2A 4BK9A 4LTSA 4NJGA 2CZEA 2B7PA 3O6DA 3B05A 3PR2A 4CCEA 2NZLA 5FEXA 3GDRA 4M6VA 3RMJA 1OFQA 2WNNA 2Y7EA 5LKYA 3BK0A 4JYFA 4DELA 1OX6A 2ZZ4A 3WK3A 2CU0A 3QH2A 4TU1A 2YW4A 3GDKA 1H1YA 3N2MA 3NL2A 3LM7A 3LV6A 3O16A 4KWVA 3TSBA 2QJHA 3UWWA 5K2ZA 4FNUA 2ISWA 3DBPA 2P0OA 4K7YA 3LHZA 5F4WA 5DCEA 3DFTA 1NEYA 2A7PA 3HF3A 2DORA 1H7WA 3S1WA 1OYCA 1TO3A 1YLVA 3CPRA 4UMBA 1SZNA 1JULA 1QPRA 1F5ZA 2H8XA 5D33A 3SSJA 4DQWA 5CZJA 1QDSA 4R33A 1QMLA 4UR7A 5G2WA 2DJLA 2VOMA 5DCDA 1WYIA 3H53A 2R94A 3N19B 2ZRUA 3B4UA 1BEUA 1FWSA 1M7PA 1WBHA 1W5OA 5CZTA 3TAOA 3NO5A 1WOBA 3G1XA 4Z1BA 1WOAA 2GVGA 3P8IA 2E68A 4JX6A 1FDZA 3HOJA 5FF0A 1I2PA 3BW3A 1G4SA 3C0JA 3PUOA 2ZRWA 3W1AA 4TR9A 3KVLA 3CB8A 5FF2A 2J88A 2H90A 4WOQA 1H51A 3A5VA 3ABQA 2YXGA 4DO4A 3NXFA 2YR1A 3EX3A 4UCGA 4RCXA 3LBCA 1JCYA 2Z6JA 3NM1A 4AH7A 4LUJA 3KRSA 1HO4A 1FXQA 4UNKA 4ADUA 3O6YX 4XBKA 3TR2A 3G1AA 3MBDA 1VPXA 4WY0F 3NQGA 5L9FA 5KMYA 2TPSA 2H3DA 4ORMA 5BMWA 1NF0A 3S9YA 4UFMA 2QR6A 3SIZA 6ALDA 2VFHA 3G8EA 1AW2A 1SFLA 3PB2A 1DQWA 1IXPA 2ZA3A 4IPJA 4HNVA 4QAIA 2JGYA 3B0PA 3CQ0A 4KFOA 1W37A 4LRTA 3DI1A 1G4EA 3W2LA 2NXIA 3NQCA 4ICNA 4RX0A 2OT0A 3F1QA 3G0UA 3N9SA 3INPA 5AHIA 3W1QA 3NQVA 4PA8A 2NX1A 5G4EA 4ZZ9A 4LOCA 3UWUA 4EVZA 3IGUA 3BG3A 3M16A 4EF8A 4I7WA 1YTDA 3G1VA 5CSSA 4TIMA 5AHFA 3I7QA 1PL9A 1SZGA 1VGAA 2V2DA 1A5CA 1SW3A 1X7FA 3NNTA 2DZSA 1R30A 5HWJA 2ZA1A 4JEQA 1QCWA 1RQEA 1XDMA 3LX9A 5D2VA 3KVJA 2NV1A 3IVUA 5EYWA 1TPWA 4QNEA 2C13A 4DF0A 2A85A 5AHMA 4LS1A 1EP2A 3T7VA 5HMSA 1VCVA 4EF9A 1OFDA 2EPHA 3W88A 1HFBA 1V5XA 1GQNA 2FFCA 3TQKA 4RKAA 3W07A 1XCFA 1QO5A 3HGOA 3U2OA 3WK0A 5J5DA 3QC3A 3EWBX 3TH6A 3B0UX 1F7BA 3PBVA 2OT1A 2V30A 3NPVA 1GG1A 3LHVA 5E0KA 3I6RA 1TPH1 5LNSA 4NXSA 3NQAA 4M6QA 1HTIA 1OYAA 3TSMA 4O15A 1RVGA 3LHUA 4NZFA 3RLUA 3EEGA 4UTJA 3BG9A 1PE1A 1K03A 1B9BA 1L2UA 1UASA 3M41A 4DF2A 2QJIA 1K3UA 2C18A 4RJEA 3WFAA 4UR8A 4O13A 1QPQA 3W7LA 1PV8A 4OWGA 5DN1A 2EAWA 3TFCA 1IF2A 2C19A 4HSOA 3A5FA 5G1TA 4N6FA 2C0AA 5A5WA 5K4XA 3C2OA 3P74A 2H8ZA 4FHAA 3ZWTA 1TPC1 4HSNA 1X1OA 2ZYFA 3LCFA 4M6PA 1GZGA 1GPWA 2NUWA 5HNRA 2Y63A 4LVFA 2R14A 3FOKA 4HNUA 1OYBA 2DU2A 1CX9A 2GVLA 1I2NA 1OF6A 3NQMA 3TW7A 3MI2A 1NVMA 1GG0A 5HR6A 3SJ3A 2OCZA 3KXQA 1KFBA 5K9DA 4YCPA 4JXCA 3G1SA 4HN4A 1N8FA 4Y9AA 2O7SA 4H4IA 1F6PA 4ADTA 2R91A 4A2SA 2OZ0A 4K38A 5MHBA 4ZVJA 1FWRA 1TPVA 4FNPA 3BGJA 4IUOA 4N2YA 3QJAA 4GJ1A 4LVGA 4QIUA 3E96A 4RZ4A 1E51A 3C8FA 2GQ9A 3H54A 2CLLA 2FTPA 3N9RA 3CWNA 2Y61A 1SW0A 2AGKA 4DO6A 3EX4A 3C2VA 5D2WA 3QMRA 2OX1A 3W1TA 3USBA 3KAOA 3GDLA 3W2JA 2E09A 1XI3A 2ISSA 2ZZ6A 1N55A 2ZTKA 4GUGA 3TMQA 1W31A 2QCMA 2A2IA 2QCGA 3MHGA 2B0MA 3NVTA 1FCVA 4Y96A 3W7JA 1K7EA 2QCCA 3IIXA 1G4PA 3GNDA 3O8AA 2BX7A 3IGXA 3PM6A 4X2RA 1KTCA 2BTMA 4LV4A 2E6AA 4CQ8A 1RD5A 3W6YA 2VFGA 4PEKA 3MYOA 4IX2A 1U5JA 1KBIA 1EWEA 2BXVA 3EWUA 1KLZA 1OFBA 2E6FA 3EWWA 3QSRA 5I3IA 1KBJA 2ZRXA 1YADA 2H3BA 3GXNA 2OJPA 3HG3A 2Y62A 3L65A 1DVJA 1A50A 1EA0A 1XBVA 2YGYA 4R53A 4I9AA 2PRHA 4S2CA 3W2NA 5CPNA 3L0KA 4RZ6A 5LNWA 3N3MA 4JTSA 2NX3A 2XN2A 3LBMA 4XTIA 4GNJA 1I45A 3TNOA 1XUUA 4JTTA 3TV8A 4EOUA 1SU5A 3LXCA 3W7QA 5DBUA 1F6KA 2GUUA 1EIXA 2ISVA 4NT0A 5D04C 3NEVA 4O14A 3LXAA 5AFDA 2ZCGA 3C52A 3W7KA 4Z1AA 1YTEA 3P80A 1PHQA 1W0MA 4A3UA 3P67A 4TMBA 4NNCA 3SR7A 3S5ZA 4FNSA 2NWSA 4BI5A 3LOTA 2FPYA 4RZ5A 3T78A 1IIHA 3E02A 1CW2A 4AMAA 1I4NA 4AWTA 3THQA 3QMSA 1Q45A 4ZQMA 3W7MA 4DBDA 5HWNA 1FY6A 3UXDA 4NNBA 4BI7A 4UNLA 1LRNA 4NUWA 4CQ9A 3S8HA 3SGZA 5D2YA 3ATZA 4I7VA 1I2OA 4AHQA 3B03A 4PL2A 4J9JA 3QQ0A 2A6NA 8TIMA 3LI0A 1EPXA 1GVSA 1O95A 3I7SA 3RNDA 1TPUA 1FDJA 1UCWA 3CEPA 1OVDA 1Q6QA 1KTBA 3LDVA 2WKJA 3P5ZA 5G1YA 5G2IA 1QWGA 2A4AA 1ZAJA 3DKJA 3TJLA 3RK8A 2QF7A 4GUJA 4WXZA 3DI0A 1TIMA 1VS1A 3IVTA 1IIGA 1LRQA 3TDFA 3F4WA 2ZRVA 2VFIA 2Y7FA 5D30A 2QKFA 4R34A 3UNDA 3PWAA 3W3OA 5LHFA 1JUBA 4ZMGA 4UTUA 3FA5A 3N14A 3WK2A 1D9EA 3CWOX 3LB0A 3IIPA 1XUZA 4HPXA 4HNTA 4X3ZA 5CZSA 4YWIA 2Z0IA 1QPOA 4B5NA 5KZMA 1B3OA 3IEBA 3QM3A 4LUIA 1LCOA 1GVFA 1RQHA 1FX6A 3O07A 1I8JA 4TO8A 5IBXC 1H7NA 4MZYA 1ZAIA 1DOSA 4ML9A 3T44A 4UTTA 5LGZA 4O4VA 1LBMA 1YDOA 3AO0A 2V5BA 2QCLA 4QQ3A 3TK7A 4ZQRA 1GTEA 1QNVA 1A5SA 3QMTA 3W7RA 1EWDA 4BF9A 3RU6A 1C8VA 2A1YA 4NVTA 3W7PA 1J2WA 3I68A 3STFA 1QPNA 4Z1DA 5CPLA 3WJZA 3F4NA 2ZZ5A 1WA3A 1GT8A 4BR1A 4HHPA 3OEXA 3R89A 1OK6A 2FLIA 2PE4A 1EUAA 5HUPA 5GVJA 4R7JA 3ANYA 2CLIA 3DFNA 3L21A 1TTPA 3W1XA 5G4WA 1KFJA 3QEZA 3YPIA 1H50A 2WSRA 2ABBA 3W2UA 1EUNA 5D2TA 1H5YA 4HIBA 4LRSA 4AWSA 1VZWA 3OG3A 1Q6OA 4NJKA 1BTMA 3M0ZA 4LVBA 1M5WA 3W75A 1M6JA 4O16A 3FJ6A 1RZMA 4NU7A 3EWYA 3BG5A 2WSQA 4N9EA 5I3JA 1XDLA 4GUHA 3MP5A 4ZL1A 4CCCA 4U4MA 5DXYA 4TMCA 3UWQA 2B7NA 3NZRA 3GR8A 1U83A 3ZS4A 3KRUA 1XM3A 1SO6A 4Z1CA 3UZJA 4CNOA 4RV8A 1YYAA 2TSYA 4LS2A 3MWAA 3LCHA 3HMJG 3KFTA 3K30A 3W2MA 2RFGA 1XFBA 3S1XA 4IMDA 4ALDA 3SFKA 1DJNA 2G96A 3SGUA 3LV5A 5CSRA 1SO4A 4WZHA 3UWVA 5DY3A 1VYPX 3NPUA 5CKSA 2QDHA 3GKFA 2HMCA 2Q3RA 2V82A 4JDYA 2HSAA 1JCJA 4O17A 5KINA 2I1OA 2X16A 1RPXA 5AN7A 1VYRA 2C14A 1WV2A 3TKFA 1NF7A 4NJIA 2P10A 4QISA 4XZ9A 4CNPA 3FYPA 4WUIA 1TMHA 4FEZA 3G8RA 3DXIA 3NA8A 5K4ZA 2UV8G 4UTIA 3GVGA 2E5BA 3BLEA 3N2XA 3QSTA 3LCIA 4WOZA 5C6MA 3MJYA 3W2KA 3S1VA 1JVNA 4O52A 2GOUA 2VFEA 3QW4B 4Y6GA 1W5NA 4NQ1A 3MYPA 3W87A 3P5YA 5I3FA 4WX2A 2X1TA 3E49A 4DXVA 2GVJA 2QAPA 2E5CA 2CLEA 1K7XA 3VE7A 4OE7A 1N7KA 4O4WA 1YXDA 2DZTA 1QOQA 3QQ1A 5D02A 3LCXA 4M19A 1AW5A 4WD0A 5F2MA 3W76A 1OFRA 2PCQA 2O7QA 4XWUA 1OX4B 1ME8A 4JTHA 3EKZA 4KKXA 2G97A 4FNQA 5D37A 3NR0A 1UB3A 1H62A 4Z0SA 5LHEA 2VXNA 1TTJA 4M7TA 1IXNA 2ZA2A 4LNYA 5K9XA 1LP6A 5I3GA 1I2RA 1XL9A 2Y6ZA 4NNAA 2VEPA 4LVAA 2FB3A 3STEA 1DHPA 4UFHA 1LLZA 2NXHA 1WX0A 1JUKA 4IMGA 3D0CA 3G3MA 3B04A 4UTMA 2FPTA 1TQXA 3IV3A 1XBYA 3LHTA 4UFKA 5D03A 1OFAA 3BLIA 3NL3A 3HPXA 3R2GA 3W70A 1QO2A 3UXAA 4O1CA 3UWZA 2WJZA 3FFSA 2OMAA 4XQ6A 5BMXA 2EGZA 4O0KA 3O15A 4H3DA 3NYZA 2GQ8A 1Z42A 3NL5A 3STGA 3TMLA 5K9CA 5CGQA 4XKYB 3O6CA 3Q94A 1R46A 4JYDA 5BNKA 5HWMA 1BWLA 2YYTA 3HGSA 1PVNA 4OGZA 4RLIA 1TB3A 1Q6LA 1FWWA 1QR7A 4O8RA 4M5PA 3WK1A 4MFEA 3DGRA 4JTJA 4U28A 1FWNA 1ADOA 7TIMA 2YYUA 1O94A 1G6CA 1QOPA 5CPOA 3PG9A 3CLMA 5D38A 3VNDA 2A5HA 4RXFA 4BWLC 5EMUA 3CHVA 4AEOA 1PIIA 1GTHA 4JIPA 1KM3A 4LY8A 3DZ1A 4FXSA 1SR9A 1W54A 4K7VA 5H91A 1P4CA 3NGJA 4UUIA 4JX5A 2TYSA 2NWRA 3CTLA 4JDBA 4JYEA 3UPWA 1QFEA 3W72A 4Q32A 3KVMA 4MFDA 6TIMA 1DJQA 1VYSX 2Y88A 1Q3NA 4Y8FA 5H2ZA 2H6RA 5CZ0A 1R2TA 3DHDA 3MO7A 3HG2A 2YX0A 1FWTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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