4HVJA

Crystal structure of a putative uncharacterized protein from mycobacterium tuberculosis in complex with amp
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
160
structure length
156
Chain Sequence
SMVRYFYDTEFIEDGHTIELISIGVVAEDGREYYAVSTEFDPERAGSWVRTHVLPKLPPPASQLWRSRQQIRLDLEEFLRIDGTDSIELWAWVGAYDHVALCQLWGPMTALPPTVPRFTRELRQLWEDRGCPRMPPVHDALVDARDQLRRFRLITS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Unknown function
molecule keywords Putative uncharacterized protein
publication title Mycobacterium tuberculosis Rv2179c Protein Establishes a New Exoribonuclease Family with Broad Phylogenetic Distribution.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 52
structure length 156
sequence length 160
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4hvjA00
1FKOA 1RBRA 4CGJA 2XO7A 4DS5A 3WNGA 1Q9XA 1TVRA 3RMAA 3LP3A 4CGIA 1S6PA 2YHAA 4CESA 4CFDA 3DRPA 3MEGA 4DLGA 4ZTJA 1B9DA 2GUIA 2G8VA 3RWUA 3LDSA 1T8EA 1NOZA 5CYMA 1S9GA 3VQEA 3V4IA 4ELVA 3UIQA 5EU7A 1NK5A 1HYSA 1LWFA 4CEQA 1KVBA 3AO3A 4O0IA 3SUPA 1BIUA 2YNFA 4E7JA 4M3RA 1EP4A 1ZYQA 4O0JA 4DSKA 4B9NA 4BDZA 3ZSXA 4CJTA 4I2PA 3KK3A 3SQ2A 3SI6A 4I2QA 4DF8A 2Z1IA 4F2SA 1CLQA 3VQ8A 3V9WA 4DU4A 5HP1A 2OYQA 2KFNA 2ITGA 3QEPA 4B9TA 4FW2A 4MQ3A 3KD1E 4F4KA 3JSMA 3ZSVA 4F2RA 4PQUA 4RW6A 4DSJA 1JL2A 3L3VA 3B6OA 4FM1A 3CM5A 2FBTA 3E01A 3ZSQA 3VA0A 2IC3A 4LSLA 1IKYA 4PA1A 3M8RA 5KI6A 3QO9A 1LAVA 4NYFA 4E89A 4HVJA 2OZMA 4OPJA 3K5LA 3H08A 4FZXC 1S1XA 4FVMA 4BWMA 4C8NA 1BI4A 2HW3A 1ASVA 2EHGA 3LPUA 5HROA 1NJWA 3HO1A 3ZSOA 3L8BA 5FRNA 4DFJA 4CGDA 2A1RA 3AO1A 4AHCA 4AHSA 3TAQA 3CM6A 2YHBA 3DLHA 2Z1JA 3O3GA 2VWJA 1VRUA 4FLUA 3MXIA 1C1CA 3K58A 3LP2A 3O3FA 3SPYA 3O3HA 2G8IA 2D5RA 1TV6A 3ITHA 4CJSA 2PYJA 4J2AA 4Q0BA 3T1AA 1HPZA 3QEIA 1ZBIA 3AO4A 3T19A 4CFCA 1HNVA 5SWMA 2G8HA 2HHXA 2Z1GA 2Z1HA 3NGZA 3BDPA 4FJLA 1WSFA 4CJKA 3EY1A 3HPGA 3NFAA 4N5SA 1VSFA 1XHZA 2IDOA 5HRRA 4JLHA 1TK0A 4ICLA 3KTQA 3OYJA 1ZBFA 5KRTA 2QK9A 4KAZA 3AVBA 5HRNA 3LALA 3O4QA 1KSPA 4FLWA 3CQ8A 1QSYA 2B6AA 4F3TA 1BISA 1CXUA 2E4LA 3DYAA 3F9KA 4Y1CA 3RRHA 1BQMA 3ZT0A 3PO4A 1LW2A 3AVMA 4M3YA 5KGWA 1XC9A 3U6FA 1UAXA 2IS3A 3DOKA 1TAQA 5J2MA 4B9UA 2VG7A 4J2EA 4Z4FA 4N56A 4KPYA 1S9EA 3QIOA 4DG1A 1BIZA 4W5OA 4H4MA 3SV3A 3DLBA 1JKHA 1C0TA 5C42A 4CJRA 4DU3A 1NK7A 3ZSRA 2OA8A 3OYLA 4C8KA 3ASMA 4KHSA 4FK4A 4E19A 4M3ZA 3QEWA 1LWEA 4CJVA 3PV8A 1BL3A 2OPRA 4QAGA 1RTJA 4CF9A 1TAUA 3FFIA 3DM2A 3LANA 3EZ5A 2JGUA 4F3OA 1SKWA 3AVCA 3SNNA 4Q5VA 4KHWA 1S1TA 3THVA 1VSKA 2KQ2A 3VQPA 3ZT3A 3V81A 4KHNA 4AILC 4B9SA 1LWCA 1VSMA 1SUQA 3ZSZA 4RW4A 1BHLA 4AHVA 4DFMA 1U48A 3AVLA 5D3GA 3RRGA 4NCBA 4NCAA 5C24A 2HHQA 1J9AA 4W5QA 4OLAA 1NJYA 1NK4A 4AHRA 4DWIA 1TKTA 3K5MA 2BGGA 5JS1A 1D5AA 4CIEA 1XWLA 4KHUA 2OPPA 3SQ1A 3V1OA 3NGYA 3VQQA 3AA5X 4FW1A 2F96A 4O4GA 1REVA 4NCGA 5KTQA 1RDDA 1D9FA 1B9FA 1ZBUA 3SQ4A 3KLHA 1CZ9A 3AO2A 4CHOA 1DTQA 4RW7A 4LD0A 1C0UA 3AV9A 3OVNA 3SUQA 4RW8A 3RR7A 3NHGA 3QINA 4BDYA 3L3UA 1FXXA 1WSJA 2YKMA 2DFEA 3DLKA 3VQBA 4DF4A 3V1RA 1YTAA 3LP1A 4HHTA 2Y1JA 1J5OA 2IAJA 4B9LA 3CG7A 5HRSA 3VA3A 1JLBA 4WE1A 1KLNA 4I9QA 4CF1A 1B92A 4C8MA 3L2UA 1F21A 5FROA 1CXQA 2FBVA 3NE6A 4HUEA 3SJJA 1NK6A 4KTQA 4Z4GA 3MEDA 2ETJA 4CFBA 3L2WA 2ZQBA 1RT2A 1GOCA 4AH9A 4CFAA 4Z4HA 1KVCA 1ITGA 1RT7A 2XY6A 1YVUA 4IKFA 4DSEA 1X9WA 2E6MA 4IFVA 1QE1A 3MXJA 3CFRA 3TARA 5CZ1A 3NAEA 3NBPA 3OS2A 3OYBA 3QERA 1UA1A 1QTMA 4KHQA 3WNHA 3KJVA 1QS4A 3TAPA 4M3TA 3LAMA 3RMDA 3S9HA 3ZT4A 1NKEA 4ZTFA 4UQGA 1QQCA 3ISNC 4CEZA 3I0RA 4DQSA 5J1EA 5HLFA 1S1VA 3O4NA 1VSLA 3SUNA 1EKEA 4J2BA 3LWLA 3LPTA 2RKIA 3M8QA 3NCIA 4LY7A 3A2FA 4KI6A 1W0HA 4HUFA 4ID5A 3WNFA 2HHVA 3NF6A 3K5NA 4B08A 4ELUA 2HVIA 3VQ4A 1U45A 3DI6A 2BE2A 2HB5A 4C8OA 1S1UA 4CGHA 4FLXA 3IAYA 1MU2A 4FYDA 4HUGA 1U4BA 1SL0A 3HL8A 3KKRA 1VSHA 4W5TA 4RG8A 3HJFA 1TK8A 4KTZA 1Q8IA 1R0AA 4FJIA 1WLJA 1EETA 1WAJA 2G8FA 1S6QA 4E0DA 4MFBA 3DLGA 5I3UA 2PY5A 4ID1A 4KB0A 4DQQA 1SL1A 5J2QA 3OYMA 3L2QA 2QXFA 4HCBA 2VG5A 1U04A 2KTQA 2NUBA 3P5JA 3HVRA 3U3YA 2KFZA 4CHPA 4M3XA 1KFSA 4CJ5A 1SKRA 5T7BA 4IBNA 2XY8A 3QEXA 1RT3A 1IH7A 4JS5A 1UA0A 2HHSA 1KRPA 4DQRA 1J53A 3AA2A 4E7HA 4DQPA 3TAEA 5CZ2A 1A5VA 4DTUA 3PX0A 3CFOA 1DLOA 3AO5A 3HSTB 4CEBA 2HNZA 4CJEA 4DLEA 1U49A 1D8YA 3V9UA 4EZ6A 2KZZA 4KHYA 4JS4A 3CYMA 1VSEA 3SYZA 3PO5A 4CJPA 4DQIA 2R7YA 3KD5E 1UOCA 3HPOA 1N6QA 4LH4A 1SV5A 3C6TA 4CHQA 3QNNA 1EXQA 1KLMA 2I5JA 2RF2A 4FLYA 3S3OA 4B9MA 1RBTA 3KK1A 4G1QA 1BI4B 3AVFA 4Y1DA 4DFKA 5E41A 1TKDA 4QCLA 1VSJA 1JXBA 1TKXA 2Y1IA 3OY9A 2G8KA 1J54A 3MEEA 1L3UA 5FDLA 2D0AA 3TAMA 3TAFA 1O1WA 4KRFA 3G10A 2KZMA 3M8SA 4FJHA 2P5GA 2DFFA 5C25A 5JS2A 3ALYA 3HPHA 4Z4IA 1NK0A 3BGRA 1Q9YA 1VSIA 4W5NA 3IS9A 4GW6A 2YKNA 1BCOA 3V9SA 2G8WA 4BE0A 3K57A 5K14A 4CJLA 3TI0A 5CYQA 3HVTA 3HK2A 3RTVA 4HCCA 1HQEA 3S3MA 3KK2A 2GBZA 3B6PA 4M42A 1CZBA 3DMJA 4OKJA 3OYCA 4DS4A 1JXEA 1LW0A 3V9ZA 4CJFA 4CCHA 1QSSA 4OPKA 3HP9A 4FJ5A 4CJUA 4E1MA 1C6VA 4DSIA 4L8RB 3F73A 3VQ5A 4XIUA 3VQ9A 1W9HA 4DMNA 1I3AA 3PY8A 2VWKA 4FZZA 1S5JA 1RT6A 4CK2A 4LH5A 3TANA 4PWDA 4CF0A 3AVIA 4CK1A 2F8TA 1JLCA 2YV0X 3DRRA 3HP6A 4FJGA 1IKVA 2HHWA 3KIOA 1IO2A 3SZ2A 3OYDA 2PZSA 2XY7A 3KKSA 1GOBA 3DLRA 4CGFA 2W42A 3OYIA 1C0MA 4CEEA 2YNHA 3K5OA 2ZD1A 5KGXA 3MXMA 1NK9A 3K59A 2X6NA 5I42A 4OLBA 4DSFA 2RN2A 3L2VA 4FJNA 4O55A 4H8KA 4N47A 3U3GA 4CJQA 1WSGA 3G0ZA 1SL2A 3L2RA 4M41A 1IKXA 5J2PA 3QEVA 4TSXA 3SUOA 2X74A 2HNDA 2OPQA 4CEAA 3QIPA 4DTPA 3RR8A 4CIFA 3KLGA 2X6SA 2OPSA 2XY5A 1RBSA 1GOAA 4O5BA 4EZ9A 1TKZA 1TL1A 4NYNA 1Z26A 4CF8A 1WSHA 3S3NA 1RDBA 1RT1A 4BDPA 3LP0A 3AA4A 2BANA 1KCFA 4BWJA 4FJMA 4IG0A 2XHBA 4CEOA 3DOLA 4FLVA 3RMBA 4EP4A 1L3TA 1YT3A 4KO0A 3HT3A 4CHZA 1X9SA 3I8DA 1WSEA 1HYVA 3V9XA 3VQ7A 2E6LA 4KFBA 4W5RA 4O44A 4YNQA 1WN7A 1TGOA 1L3SA 1HMVA 1RBVA 1X1PA 3VQ6A 3NH1A 3MAQA 2P5OA 1VSDA 3HM9A 4M3UA 4BE1A 3ZT1A 2IGIA 2XRIA 3TWHA 4M3WA 3AA3A 1FK9A 3AVKA 2LSNA 1JLAA 2O4IA 2YNGA 4CEDA 5HBMA 2YNIA 4KI4A 4FK2A 2Q3SA 4CJWA 4CK3A 3C6UA 4OKKA 4OJRA 3MECA 3WNEA 4FK0A 3EYZA 3DRSA 3IRXA 1LV5A 2DTUA 1S1WA 4CE9A 3LZJA 4CIGA 3PX4A 2DFHA 4B8AB 3TR8A 4KB1A 3ZCMA 4FM2A 1VRTA 1WSIA 4CEFA 3NDKA 4KV8A 4JRQA 2QKKA 4DTNA 3SCXA 1IKWA 1BGXT 3ZT2A 1ASWA 4GMJB 3OYGA 1RTDA 1NK8A 1U47A 4DTXA 2BDPA 3ULDA 1HQUA 1LAWA 1C1BA 1BCMA 1KVAA 1Z25A 3VQCA 4B3OA 3CFPA 3M8PA 1RILA 4CJ3A 3HXMA 4F8RA 2FC0A 4H4OA 4R5PA 3OS0A 4FXDA 3SPZA 1D9DA 2HHTA 2VG6A 1HRHA 3OJSA 4B9VA 3NGIA 3LZIA 3D45A 2RPIA 4CHYA 4RW9A 4FCYA 1A5XA 3OYEA 4FLZA 4AHTA 4DTSA 2GV9A 1QHTA 4LSNA 4FJJA 3TABA 4E3SA 4E7KA 4DTJA 4FJ7A 1RCHA 1RDAA 4ELTA 2D0BA 4FJ8A 3NF7A 2F8SA 2HMIA 3V6DA 1ZBHA 1TL3A 5SZTA 3C94A 4E7LA 4AHUA 4K8XA 4E7IA 4FJ9A 4YFUA 1C1AA 1JLEA 3HYFA 1IG9A 4Z4EA 2ZE2A 3OYNA 4DTMA 4PY5A 1BQNA 3TAGA 2IOCA 3ZSWA 3OJUA 1RDCA 4FZYA 4FLTA 3DLEA 4OKEA 1VK0A 1HJRA 4KKOA 4M45A 3LWMA 3QETA 3AVNA 5FRMA 1HYZA 2B4JA 1FKPA 5KRSA 4CJ4A 3VQDA 4HTUA 5DMRA 2EX3A 4CERA 3KLFA 2QKBA 3IG1A 3C95A 3I0SA 2HHUA 1XHXA 4EP5A 1XI1A 2O4GA 1G15A 2FBXA 3OYFA 3V1QA 1RTHA 4B8CA 4FJXA 4N76A 3PUFA 3QLHA 3SQ0A 1JLQA 4OGEA 1NKBA 3D0PA 3NF9A 4GVMA 4CHNA 2JLEA 1YTUA 1JL1A 4I9LA 4QOZB 1RTIA 3OYAA 5J2NA 2P1JA 1I39A 4FJKA 1L3VA 4IG3A 1QSLA 2ATQA 1RT4A 1Y97A 3NH2A 3KLEA 3OS1A 3P1GA 4Z4CA 2WONA 1L5UA 2AJQA 2HNYA 3AVGA 3P83D 4J2DA 2D0CA 4CGGA 4FM0A 3JYTA 2G8UA 1JLFA 4N41A 1RNHA 3VN5A 3PX6A 2DY4A 2OZSA 2P51A 5HRPA 3OYHA 1ASUA 4IDKA 1RBUA 1NKCA 1N5YA 4CF2A 3QNOA 1UWBA 3NH0A 1T03A 1NOYA 4C8LA 3K2PA 3LAKA 3NF8A 3T3FA 1NJXA 1HNIA 4DU1A 4DTOA 1A5WA 1TK5A 3SV4A 3AVHA 1WNSA 1DTTA 4ZHRA 2B5JA 5CY4A 1T05A 4Z0UA 1SKSA 1JLGA 5DK5A 4CECA 1RT5A 1ZBLA 4DFPA 3QESA 3RMCA 1K6YA 2KW4A 1X9MA 3OYKA 1KFDA 1NJZA 1EX4A 4KREA 4E1NA 4OGCA 4JRPA 1WAFA 4IFYA 3VQAA 2A1SA 4OVLA 2HVHA 4I7FA 1KTQA 4PUOA 4KTWA 2WOMA 3KLIA 4DTRA 2X78A 3AVJA 4BE2A 3AVAA 4BACA 1T7PA 4K8ZA 2PYLA 4DSLA 2FBYA 3ZSYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WXLA 4DS5A 1TVRA 3LP3A 4JD2B 3VTHA 4ZTJA 3DRPA 3MEGA 1V4SA 1B9DA 1Q81O 2G8VA 1T8EA 1NOZA 3E66A 3V4IA 1WBDA 2QWRA 1HYSA 3MCAB 1LWFA 4JKFA 2YNFA 4A5BA 1N32K 3E9LA 4O0JA 4DUYK 3ZSXA 4CJTA 3SI6A 4I2QA 4DF8A 4DV1K 2QWMA 4WFNL 3F2KA 3WT0A 5KQ8A 2AP1A 2HBMA 3JSMA 4BRPA 2HBKA 4RW6A 4DSJA 3C7NA 4FM1A 2QA4N 4DHYA 1IKYA 4PA1A 4PKHA 3WXJA 3QO9A 2NRXA 4IO8A 4OPJA 3IMXA 2QEXN 4BWMA 1ASVA 2P9UB 1BA0A 5EOYA 3FLCO 4BGBA 3AAQA 4CGDA 3B8AX 3DLHA 3E9OA 3O3GA 2VWJA 4FLUA 1DEJA 3AAPA 3K9JA 3O3FA 4ISEA 1TV6A 1NGFA 1HPZA 3T1AA 3AO4A 3TTFA 2HHXA 3GE1A 4FJLA 3NGZA 3PIOL 2H3GX 3EN9A 3NFAA 2RE2A 3MWTA 4N5SA 2UXBK 1XC3A 3OYJA 4KAZA 3AVBA 3CQ8A 2B6AA 4F3TA 1BISA 1CXUA 2E4LA 3DYAA 1GLFO 3CJ1A 3ZT0A 5AQFA 3LM9A 5AZIB 3DOKA 5J2MA 4JKCA 1H1VA 4J2EA 3EKUA 4N56A 4WF9L 4KPYA 4DG1A 1FW6A 4K25A 3THXB 2OA8A 4C8KA 4KHSA 3QFPA 5EVZA 1LWEA 4CJVA 3PV8A 4B3SK 4CF9A 3KHYA 2ITMA 3VGKA 3FFIA 4H0VB 4YHHK 2NZTA 5AQSA 4YOVA 3AGKA 3ZT3A 1U6ZA 1LCUA 1LWCA 2E20A 4M3YA 4AHVA 3RRGA 3OHRA 1J9AA 2WBNA 4OLAA 1HKGA 4AHRA 2BGGA 3K5MA 4O8KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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