4I7LA

T4 lysozyme l99a/m102h with phenol bound
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
176
structure length
176
Chain Sequence
IPTTENLYFQGSMNIFEMLRIDEGLRLKIYKDCEGYYTIGIGHLLTKSPDLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINHVFQMGVTGVAGFTNVLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQCPDRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title The impact of introducing a histidine into an apolar cavity site on docking and ligand recognition.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 66
structure length 176
sequence length 176
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4i7lA00
1L38A 1G0KA 197LA 1C64A 138LA 201LA 1L28A 1QSBA 1L32A 1LI3A 190LA 1D3FA 1QS5A 3LZMA 1L74A 1C65A 140LA 1ZURA 3DMXA 144LA 1CU2A 171LA 3NY8A 186LA 196LA 148LE 1CUPA 1QSQA 1I6SA 1OV5A 4EXMA 3SBAA 1C6GA 170LA 3F8VA 3SB6A 3HT9A 1JTMA 1L69A 1SX7A 3DN0A 1QS9A 205LA 1L76A 3L64A 4GRVA 1L67A 1LWGA 4W51A 3HT8A 151LA 1P46A 3C8QA 1D3JA 4PJZA 215LA 4YX7C 2QB0B 262LA 2B6ZA 4W58A 2B70A 1C6JA 1ZWNA 249LA 1L95A 2OU0X 1P36A 1QTVA 1SSYA 4W56A 125LA 3PBLA 122LA 3CDRA 1OWZA 1L44A 3F9LA 189LA 1KW5A 1WTHA 174LA 1CV4A 1T6HA 1C6AA 4ARQB 1L89A 1LWKA 4W52A 4EPFA 3SB8A 4I7RA 1T8GA 188LA 1L64A 1DYCA 1L22A 1L60A 3QAKA 1QT5A 1QUOA 1QTCA 4EKPA 1QUHA 2F47A 1L59A 3HT7A 1LW9A 1DYEA 2QARC 143LA 3C80A 1L58A 2F32A 1L49A 1JQUA 3GUOA 1L88A 1LYHA 4W53A 141LA 1DYFA 3DMZA 1CV5A 1G0MA 156LA 1OV7A 1L70A 3OE6A 1B6IA 1L19A 255LA 237LA 4DJHA 110LA 245LA 1L42A 2B6WA 119LA 3C8RA 2LCBA 1L92A 4ARQA 1L24A 1L55A 4OO9A 128LA 1PQOA 139LA 191LA 3SBBC 2RBNA 1PQMA 129LA 199LA 1CV0A 1L17A 3HH4A 3HWLA 3RUNA 4EPIA 103LA 1L77A 1G0JA 3GULA 2LZMA 1ZYTA 1L03A 1KNIA 1C6EA 1L82A 2OU9A 242LA 1L85A 1L48A 236LA 3C81A 1LI2A 3C7WA 2RBSA 1QT6A 1L94A 1L63A 1L73A 1L18A 1PQDA 113LA 192LA 1L35A 1OVKA 1SX2A 3DN4A 214LA 1QTZA 1C6FA 150LA 1L13A 234LA 3EMLA 1L84A 239LA 3G3XA 4ARJA 1C6KA 2RB0X 3CDQA 1CU5A 231LA 2OE4X 2B72A 1L23A 4AQNA 1L20A 1QT4A 3GUPA 1D9WA 2OU8A 3CDOA 2NTHA 3GUJA 1L90A 1NHBA 4W57A 1L14A 2HUMA 4EKQA 1TLAA 1L57A 1L96A 1LLHA 112LA 3HDFA 210LA 1DYGA 2B6TA 4EJ4A 1SWYA 1L05A 223LA 1C6LA 1L54A 3CDVA 1L97A 176LA 3HTBA 155LA 1KY0A 3D4SA 1PQKA 1P2LA 3DKEX 4W55A 4I7OA 1L41A 158LA 3SB5A 261LA 3FI5A 198LA 1P37A 1QUGA 3GUNA 1C6BA 2RBQA 1DYAA 1SWZA 224LA 2B75A 1C6TA 206LA 1CX6A 1OVJA 185LA 1P64A 1L62A 246LA 173LA 3SB9A 1L65A 1L87A 1KW7A 4GBRB 1QUDA 1L09A 226LA 3G3VA 1D2WA 251LA 3UONA 1L0JA 3C83A 4I7JA 1DYDA 1L45A 2HULA 1L52A 160LA 1C6IA 1L46A 157LA 152LA 1C61A 1T97A 4LDOA 4YXCA 3C82A 159LA 1L72A 181LA 1KS3A 1L36A 225LA 1L80A 1C6DA 163LA 1L40A 120LA 2OTYX 1LGWA 4I7QA 4EKSA 126LA 4LDEA 168LA 230LA 1D3MA 3HTFA 3GUIA 3DMVA 182LA 1G0GA 1LYFA 1OVHA 3CDTA 1C69A 1CU6A 1LPYA 3DN6A 1L51A 1L34A 2RB1X 1C60A 2Z6BA 183LA 3DN8A 3HUKA 238LA 1L29A 2O7AA 1LYJA 2A4TA 2B6YA 2OE9X 145LA 1L43A 1QT7A 247LA 2OTZX 115LA 1C63A 4W59A 1L98A 114LA 219LA 1P5CA 3NYAA 102LA 1L25A 2OE7X 3DN2A 1QTBA 1D3NA 1PQIA 3HTDA 3NY9A 1L21A 1CTWA 142LA 1KY1A 1C6CA 149LA 1L91A 1P3NA 2Q9DA 1CV6A 1G0LA 1L75A 2B6XA 1L50A 2CUUA 1L61A 259LA 1L39A 1LI6A 2OEAX 3C8SA 1L37A 1QT8A 4YXAC 2RAZX 3SN6R 2NTGA 2RB2X 2HUKA 3HUAA 252LA 1JTNA 1L53A 1G07A 1L07A 1C6NA 244LA 1LGXA 3HH3A 241LA 1L99A 1P7SA 1PQJA 4ARMB 235LA 1CU3A 2Q9EA 177LA 1L15A 3HT6A 254LA 3JR6A 1L47A 4DAJA 1QTDA 3PDSA 221LA 217LA 3VW7A 187LA 2IGCA 1LYGA 4LDLA 233LA 220LA 3HUQA 4I7KA 250LA 195LA 104LA 1C62A 1CUQA 161LA 147LA 2F2QA 1L06A 1L10A 218LA 240LA 228LA 1L12A 6LZMA 2O79A 1L71A 3HTGA 130LA 1G1WA 1L00A 257LA 1K28A 4I7LA 4ARLA 1L83A 2O4WA 1C6MA 146LA 211LA 2RAYX 1CX7A 4ARMA 213LA 2B73A 4E97A 4EKRA 3SB7A 1XEPA 1L02A 4W54A 111LA 1DYBA 4I7SA 1LYEA 2RBPA 3L2XA 1C67A 1L68A 1L86A 1P56A 107LA 4ZPUA 175LA 1L16A 1L31A 3K2RA 4K5YA 200LA 222LA 164LA 1XJTA 3FADA 1LGUA 2L78A 1L0KA 3HH5A 1L27A 3DNAA 1G06A 227LA 1L56A 3V2WA 3GUMA 1G0QA 2ANXA 123LA 2RBOA 2B74A 2B7XA 1CV3A 1C66A 1QT3A 1CU0A 1EPYA 1L04A 1L08A 212LA 1L01A 4I7TA 4I7PA 256LA 4LZMA 3OE9A 167LA 3C7YA 127LA 229LA 1C6HA 1LYDA 1OWYA 1T8AA 1SSWA 209LA 1C68A 1CV1A 1L66A 1C6QA 166LA 2LC9A 1QTHA 1L11A 3GUKA 1CVKA 4IAPA 184LA 1L33A 3V2YA 3G3WA 260LA 1G0PA 216LA 1L81A 1P6YA 3HDEA 1OYUA 2RBRA 3OE8A 1T8FA 1C6PA 1L93A 1L26A 3HU8A 3HU9A 180LA 169LA 108LA 3C7ZA 165LA 3RZEA 5I14A 3OE0A 4ARPA 2RH1A 7LZMA 178LA 1D2YA 2ANVA 4PK0A 162LA 1LYIA 248LA 137LA 1P2RA 232LA 3DN3A 243LA 172LA 5LZMA 3FA0A 131LA 3ODUA 1L30A 109LA 258LA 3DN1A 4I7MA 1G1VA 4S0WA 1L79A 4DKLA 3HH6A 118LA 253LA 4I7NA 1XJUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L38A 5KXYA 1IORA 1C64A 4P2EA 1CJ8A 1L32A 3RNXA 1QS5A 3AGIA 2FYCA 3ZVQA 140LA 1DI5A 144LA 1CU2A 4ETEA 186LA 3AZ6A 1GE1A 1DZBX 1QSQA 5KXOA 2ZYPA 4QY9A 4LYMA 3SB6A 3HT9A 3WW6A 1JTMA 1SX7A 1LSNA 2BQOA 1XGQC 4GRVA 1IWYA 1LZ5A 151LA 4J7VA 5FCPA 3C8QA 1D3JA 1C6JA 1ZWNA 2ZIJA 5F9UA 1FLYA 1HHLA 4LYZA 3W6EA 5KXZA 4BAFA 3MGWA 189LA 1YAOA 4OWEA 1CV4A 4GCCA 1T6HA 2W1XA 1GF9A 4QDNA 4W52A 1C43A 1GFHA 4WLYA 4YENA 1DYCA 3QAKA 1OUFA 1QUOA 1JITA 1LZAA 1QUHA 2ZWBA 4EKPA 4OW1A 1LW9A 1NBZC 2HTXA 4O34A 4RW2A 1L49A 1L88A 1LYHA 2BQFA 2ZNXY 3W6AA 3OE6A 2YDGA 255LA 2LYMA 2B6WA 1YAPA 2LCBA 3C8RA 2WARA 1L24A 1YILA 128LA 139LA 1UBZA 1BWHA 1CKHA 4H91A 1L17A 3HH4A 1LSBA 3RUNA 103LA 1L77A 2LZMA 2DQFC 4XJFA 5KXSA 1LSZA 3C81A 1QT6A 1L94A 2Q0MX 1GHLA 1L63A 1UUZC 1PQDA 3B0KA 3AZ5A 4XJDA 3DN4A 5ILCA 2MEGA 1DI3A 4ARJA 3G3XA 1L84A 4YF2A 4U3XB 231LA 1L23A 5DLAA 1D9WA 1YKYX 2OU8A 4NG8A 2BQIA 1GB0A 1NHBA 5AMYA 1RE2A 3A95A 2HUMA 1L96A 4J1AA 1DQJC 1LMAA 4DD2A 1YROA 3WYHA 1DYGA 1GDWA 1MELL 223LA 4ZEEA 1W6ZA 4N8ZA 176LA 3HTBA 1P2LA 1AKIA 3N9CA 1LSGA 3FI5A 1V7TA 198LA 1C6BA 3RU5A 2D4KA 153LA 1B5UA 1YKXX 4HP0A 5LVHA 1BVXA 1CX6A 1HC0A 3AW6A 4XADA 5F81A 1P64A 1IO5A 246LA 173LA 1L65A 1KW7A 4GBRB 1QUDA 226LA 3G3VA 4LFXA 2Z2EA 4C5FA 4DDBA 2HULA 1C6IA 1L46A 157LA 1T97A 4LDOA 1BGIA 4DD3A 4TSBA 159LA 2Z2FA 3GXKA 4HV1A 4UWUA 4EKSA 1LGWA 5DN5A 3G3AB 4WM6A 1INUA 1G0GA 1GB7A 1GFEA 1PZYA 1CU6A 3WXTA 1L34A 1IOSA 3DN8A 2I6ZA 3HUKA 1B7MA 1L43A 1B0DA 2MEHA 1C63A 1HEMA 1L98A 2W1LA 102LA 3HBEX 4XN6A 1JUGA 1HSXA 1WTNA 4DD9A 142LA 1HNLA 1C6CA 149LA 1L91A 1P3NA 5FSTA 3ULRA 1D9UA 1L39A 1QT8A 4WG7A 2RAZX 2NTGA 2CJLA 1JTNA 135LA 4ETAA 1MLCE 4ARMB 4NGLA 1GWDA 4DAJA 3WMKA 1LZGA 2BPUA 3WU7A 3HUQA 1FN5A 104LA 1C46A 161LA 1OUHA 1NHEA 2DQJY 4OWBA 5EBHA 2O79A 257LA 3WPKA 1QTEA 1K28A 3TXKA 4ARLA 4OWHA 4CJ2A 2B73A 2YBNA 4WLDA 3SB7A 1VAUA 1B2KA 4CFPA 3W6CA 4YEMA 1CNSA 1LZCA 4NGIA 2RBPA 1L86A 1UIHA 1LYOA 3TXDA 3TXGA 1KXWA 1FKVA 200LA 3CSRA 1XJTA 2FBBA 1LYSA 1LZEA 3DNAA 5LVGA 4DQJA 3V2WA 3GUMA 3CT1A 1G0QA 2Z38A 4XJIA 5HQ1A 1BB5A 1C66A 1CU0A 1GE4A 1HELA 1GFAA 1BB3A 2YSSC 4AXTA 3OE9A 2A7FA 1GF8A 4R6CA 1T8AA 1OWYA 3WU9A 1CV1A 3HBHA 1I20A 4G49A 2Z18A 2YBHA 2BQDA 4H94A 1LSMA 2ZIKA 3J4GA 2HU3A 3V2YA 4TSCA 3TXHA 4NEBA 1G0PA 133LA 2ZQ3A 1OYUA 1T8FA 4H8XA 1C6PA 1LYYA 3WXUA 169LA 1B9OA 3RZEA 4GCBA 7LZMA 178LA 162LA 3TXIA 4NHIA 243LA 2CDSA 4BS7A 3FA0A 109LA 2DQIY 4YM8A 3DN1A 5E4PA 3TXFA 5FHWA 5B05A 4S0WA 1B5VA 3A90A 4PPOA 5HLLA 3CQLA 1XJUA 4G4BA 4LZTA 1G0KA 197LA 1VATA 2IFFY 4LFPA 1L28A 1LI3A 190LA 1L74A 1D6PA 1ZURA 4WM1A 3LHMA 171LA 3NY8A 1D0MA 4EXMA 2PC2A 5LA8A 3SBAA 3F8VA 3WPJA 1IP7A 5LYMA 4HTKA 3WH1A 1LSAA 1XGUC 1LWGA 3HT8A 1P46A 1LSYA 262LA 2B70A 1GAYA 4G4CA 1P36A 1VDPA 2EPEA 6LYTA 5A3EA 1LJFA 1D0KA 1IC7Y 4EPFA 3SB8A 3AZ4A 4WOAA 188LA 5KXWA 2HEFA 2RSCA 3FI7A 2F47A 3HT7A 5APCA 4H9CA 1W08A 4NGWA 4WO9A 3C80A 1LHMA 2F32A 1JQUA 3GUOA 4W53A 4KT3A 3QNGA 1OV7A 156LA 3BKVA 1JHLA 5J7CA 4IJ4A 4DJHA 4ARQA 3QE8A 5KXXA 1L55A 4OO9A 4XJBA 1PQOA 2RBNA 1PQMA 1A4VA 1J1XY 4EPIA 4NY5A 3GULA 1G0JA 3A92A 3N9EA 3LN2A 1ZYTA 1KNIA 242LA 1L48A 1NDMC 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1L38 A;  5KXY A;  1IOR A;  1C64 A;  4P2E A;  1CJ8 A;  1L32 A;  3RNX A;  1QS5 A;  3AGI A;  2FYC A;  3ZVQ A;  140L A;  1DI5 A;  144L A;  1CU2 A;  4ETE A;  186L A;  3AZ6 A;  1GE1 A;  1DZB X;  1QSQ A;  5KXO A;  2ZYP A;  4QY9 A;  4LYM A;  3SB6 A;  3HT9 A;  3WW6 A;  1JTM A;  1SX7 A;  1LSN A;  2BQO A;  1XGQ C;  4GRV A;  1IWY A;  1LZ5 A;  151L A;  4J7V A;  5FCP A;  3C8Q A;  1D3J A;  1C6J A;  1ZWN A;  2ZIJ A;  5F9U A;  1FLY A;  1HHL A;  4LYZ A;  3W6E A;  5KXZ A;  4BAF A;  3MGW A;  189L A;  1YAO A;  4OWE A;  1CV4 A;  4GCC A;  1T6H A;  2W1X A;  1GF9 A;  4QDN A;  4W52 A;  1C43 A;  1GFH A;  4WLY A;  4YEN A;  1DYC A;  3QAK A;  1OUF A;  1QUO A;  1JIT A;  1LZA A;  1QUH A;  2ZWB A;  4EKP A;  4OW1 A;  1LW9 A;  1NBZ C;  2HTX A;  4O34 A;  4RW2 A;  1L49 A;  1L88 A;  1LYH A;  2BQF A;  2ZNX Y;  3W6A A;  3OE6 A;  2YDG A;  255L A;  2LYM A;  2B6W A;  1YAP A;  2LCB A;  3C8R A;  2WAR A;  1L24 A;  1YIL A;  128L A;  139L A;  1UBZ A;  1BWH A;  1CKH A;  4H91 A;  1L17 A;  3HH4 A;  1LSB A;  3RUN A;  103L A;  1L77 A;  2LZM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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