4IQLA

Crystal structure of porphyromonas gingivalis enoyl-acp reductase ii (fabk) with cofactors nadph and fmn
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
313
structure length
312
Chain Sequence
MNRICELLGIEHPIISGGMVWCSGWKLASAVSNGGLGLIGAGSMHPDNLEHHIRSCKAATDKPFGVNVPLLYPEMDKIMEIIMREHVPVVVTSAGSPKVWTAKLKAAGSKVIHVVSSATFARKSEAAGVDAIVAEGFEAGGHNGREETTTLCLIPEVVDAVNIPVVAAGGIASGRAVAAALALGADAVQVGTRFALSEESSAHEDFKAHCRRSVEGDTMLSLKAVSPTRLLKNKFYQDVFAAEQRGASVEELRELLGRGRAKQGIFEGDLHEGELEIGQAVSQISHAETVAEIMVDLVDGYKRSLAGMPTEI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural characterization of Porphyromonas gingivalis enoyl-ACP reductase II (FabK).
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Porphyromonas gingivalis
molecule keywords Enoyl-(Acyl-carrier-protein) reductase II
total genus 110
structure length 312
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.1.9: Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH).
pdb deposition date 2013-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03060 NMO Nitronate monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4iqlA00
1I2PA 3LCWA 3MJYA 1H51A 1OFBA 3C2FA 3M7WA 5AHNA 4K38A 2DZWA 3OIXA 4KFOA 1J2WA 3QZEA 5EBUA 3MHFA 5H2ZA 5BMXA 3FOKA 2OCZA 1HTIA 2B7NA 1ZHAA 4Z0SA 1GJPA 1PIIA 4GFSA 1W0MA 2YPIA 3G3MA 1TPC1 1TTQA 3HMJG 1V7YA 3RU6A 2W79A 4FNSA 3SZ8A 4LOCA 4JDBA 4BI5A 3G8RA 3H54A 3QPZA 1I45A 1KA9F 4UR7A 3HG4A 3I7QA 1BKSA 1R46A 3W9ZA 1ML1A 1UJPA 4DF0A 2DZPA 1BTMA 4UTHA 2W0UA 1O5XA 2DP3A 3P8IA 4TMBA 3SFKA 4AWTA 2CLIA 1KV8A 3DHDA 1EB3A 3C2EA 3GR8A 2QCDB 3L5LA 4QSHA 1U5JA 1TTJA 4LWWA 2ABAA 5LGZA 3PBUA 4O4VA 3O05A 2RKXA 4AEOA 2ZRWA 1VYPX 4JYDA 2B7PA 5C2XA 1VR6A 1SW7A 3LCIA 5K4XA 1OG0A 1UASA 1XBXA 3MP3A 1A53A 1F76A 1OABA 3UWZA 1PHWA 2ZQ0A 3L5MA 4XBSA 4TIMA 4WY0A 3G18A 3LXBA 1Q6QA 1SW3A 1T0OA 4RXFA 1OF6A 4WXZA 4JTSA 2A6LA 4FB7A 5D2VA 2WSYA 4YWIA 3CPRA 3H55A 5C55A 1DQXA 1H7OA 1JQXA 4O8RA 1GEQA 3QJAA 3LBMA 5HR6A 2Y62A 4LTSA 2NX9A 3HB9A 3QYQA 2EHHA 4MY8A 3LDVA 2C18A 4DO5A 3W75A 1FBAA 3EXTA 3V1PA 2WJZA 1K3UA 4PFMA 1QOQA 2C13A 4N2YA 1SFJA 2VENA 4Y90A 2P1FA 2ATSA 3L0GA 3C56A 4R53A 1I4NA 1O5KA 5CGQA 3UWQA 4N9BA 3L67A 1A50A 2E6FA 3W7NA 2E77A 2YYTA 3DFOA 3C8FA 1X1OA 1AW5A 3W2NA 1VHCA 2J9XA 1AL8A 5J5RA 2GVLA 3S0CA 3PBWA 3RLVA 1OK6A 2G96A 4DBEA 1DBTA 4UFIA 3OHIA 3PM6A 3JRKA 4RX0A 1OJXA 4NU7A 3EKZA 3C61A 3MUXA 2JGYA 1YYAA 1O94A 3PULA 3IGSA 2B4GA 5DELA 1MSSA 4E2DA 4DF1A 1TRDA 3DHFA 1TV7A 4X3ZA 3UNDA 4MLRA 2NUWA 3P5ZA 5U4NA 4DQWA 3L65A 1KM4A 3LI1A 1WA3A 5D03A 3LCXA 1TTPA 2A6NA 4JDYA 4FIQA 4Y6GA 3BW2A 3KVKA 1H7PA 3DAQA 3L68A 1K02A 3W7GA 3RFAA 3E02A 1FCQA 1VC4A 1DQWA 1OYBA 3TK7A 1J5TA 3TW7A 2CZEA 2CWNA 2CZFA 3MP4A 3G1VA 2JKEA 3W83A 4O12A 3GVGA 1M6JA 5CPNA 2A21A 1E51A 3TQVA 1WBJA 5F1UA 1SO6A 4XZ9A 2VEKA 1X6UA 2ZA2A 3D0CA 3G1DA 4PA8A 1IXPA 1NEYA 2RDWA 3CEPA 3HJZA 3QQ0A 2X16A 4NX0A 4Q33A 4WOQA 4ML9A 5A5WA 2TYSA 5G2HA 1B4KA 2ZZ2A 2QAFA 4RZ5A 3R8RA 4UFMA 2NWSA 4QAIA 1AW2A 2X1RA 1EP3A 3W7HA 4O17A 2Y61A 4UFHA 4O1BA 4HIBA 4DO6A 4JICA 3TUUA 4N9EA 2JKAA 1RQHA 2YZRA 3L0KA 4UTTA 1QPNA 2NXGA 4XQ6A 5F2MA 4LW7A 2V5LA 4OBTA 2OX1A 1SO5A 5CZTA 4O28A 3I7SA 1RD5A 5IBXA 4OGZA 1SQ7A 4IPJA 4HKPA 1MO0A 2ZCGA 4HT3A 4OQVA 1PHQA 3C52A 3ZS4A 1W31A 1LLZA 2P0OA 5F2GA 4X22A 1KM0A 2FPVA 1LBLA 2VOMA 4MY1A 1GOXA 2QUTA 5D2WA 2WNQA 5HMSA 1SZNA 1FWRA 1ZCOA 3UQNA 2QCHA 1K03A 2C1HA 1WBHA 3EX2A 3PF3A 4O0KA 1DV7A 4A29A 2QUUA 3M5YA 4UCGA 4A3UA 4O16A 2JBMA 3LCLA 3TXVA 5HR7A 3TCEA 3M5VA 1B9BA 4GUFA 4NJHA 1VCVA 4LVGA 4NNCA 3GX9A 3CTLA 3A5VA 4RCXA 3STGA 2BTMA 2EAWA 3NO5A 5IBXC 1ME9A 4JTHA 1H7WA 4BI7A 5KSWA 3LB0A 1K7XA 1FQ0A 1GG0A 4UTUA 1UUOA 4MYAA 4JTTA 2GVJA 4JTLA 5EPDA 1BWLA 3DI0A 2VXNA 3QMSA 4LUJA 4LVDA 2BXVA 5D33A 1R2TA 3B06A 3VFLA 3W6YA 3TFCA 1KM2A 4ORIA 5AHIA 3T7VA 1WAUA 1VS1A 4LV9A 2EF9A 4LU0A 1FCVA 3INPA 2E1DA 4IQLA 3P62A 3L21A 2OT1A 1GT8A 5HWJA 3EKLA 3GK0A 1PL9A 3FKRA 2F84A 2F7FA 3S5YA 1QR7A 1TPUA 2TMDA 3MI6A 1AMKA 4GWEA 2A4AA 1XL9A 4PH6A 4U4MA 5G2IA 2HTMA 1THFD 3IIZA 3ZR4A 5DBTA 1J4EA 2FPTA 1FCBA 4FNRA 3BO9A 3N34A 2JKPA 3KVJA 4MVAA 5C6MA 1RVGA 4Z1DA 4DXVA 8TIMA 1L2UA 3TR2A 3N9RA 3T55A 1KM1A 4NX5A 4NXSA 2QCEA 3P60A 4NJKA 1YDOA 4EOUA 1TREA 1KFLA 5DXXA 3DFTA 5U7SA 4CCEA 2ZZ4A 4JGDA 1EWEA 1JUBA 1QNVA 4NQ1A 1OYAA 3EXSA 2R91A 5TIMA 2H3DA 3S1WA 5CZJA 3CM4A 1IXQA 3ABRA 3ELFA 2NX3A 1VHNA 1F73A 2VFIA 4LS2A 5K4ZA 5CZ0A 4AHPA 3W2KA 2ISWA 4DEFA 2A0NA 3VKJA 4PEKA 1FX6A 4UNKA 1KFJA 3THQA 4IXHA 4XKYB 3OBKA 3RF9A 4UTLA 3NL2A 3NPWA 2NV1A 3NEVA 1JR1A 2ATMA 4YLWA 4ZMGA 1FDYA 1IGSA 3LV6A 3WJXA 2GVGA 3L5AA 1QPQA 2XFWA 3HPZA 2ZRVA 1F2JA 4DF2A 4JTJA 1OK4A 5KZDA 5BW6A 4AVFA 3QW3A 4ONVA 2E6YA 3TXZA 3TV8A 5J5DA 1GVQA 1H7RA 1DL3A 1P4CA 1EP1A 2QCLA 3UYCA 4Y8FA 4OV4A 5CKSA 3W1XA 1KBJA 2Y7EA 4XBKA 3TH6A 3W73A 4OE7A 3CIWA 5D32A 2CZDA 1JVNA 4IMGA 1ZFJA 3FIGA 2H3BA 3GKAA 3UWUA 4FHAA 3IRDA 1KFBA 3R89A 4IGHA 2QUVA 5FEWA 5EYWA 3KVMA 1D9EA 4OU1A 1QMLA 1OX6A 4AWUA 3LRKA 3CLMA 2YXGA 3WJWA 1VPXA 2Q3RA 3GXTA 7TIMA 2X1UA 4AXKA 1H60A 3A21A 2GQ9A 4RLIA 3DH7A 5DY2A 2EPHA 3AO0A 2R8WA 4LS0A 1KBIA 2C3ZA 2G97A 1ZAIA 1A5CA 3CWOX 1AL7A 2CLLA 4HNTA 5CZSA 3W1LA 2HSAA 1PCKA 2OJPA 4NNAA 1XBZA 2B7QA 1KFCA 1H50A 3W72A 2R94A 3IGUA 1R2RA 1EX5A 1FWSA 3EWXA 3O6DA 3RMJA 1K7EA 3FKKA 3SIZA 3S5ZA 3NGJA 2FJKA 5CPLA 2PRHA 1W5QA 3SGUA 3LM7A 3O8AA 4JN6A 3TMQA 2ISVA 3HOJA 2QAPA 4MFEA 3O6YX 1KTNA 3HPXA 3W2MA 2ZRYA 2E6DA 3BLEA 4LT9A 4PTNA 4JTEA 3L0NA 3W1AA 4C1LA 3BG9A 3PUDA 2P10A 2DZXA 3AJXA 3QEZA 3BLIA 2CLFA 4NJGA 2VC6A 4X9SA 1SW0A 1NSJA 3MP5A 3ABSA 3W7RA 3PUEA 2NWRA 1AW1A 2DJXA 4AMAA 2QR6A 4UC5A 3W07A 1H62A 3KAOA 1O95A 1IIGA 3LERA 3R13A 2FFCA 3TQ0A 3DI1A 5FEZA 2QKFA 3W7DA 3N2XA 3KHJA 4I7WA 3ZWSA 1DJNA 5F4WA 1RZMA 2I1OA 1GVOA 1YTKA 4FNQA 1G7VA 4EF8A 1G4TA 2WQPA 3NAVA 2CLOA 3I68A 1XBYA 2VFGA 3LTYA 1HUVA 1OVDA 4BI6A 2WV8A 3ZWTA 4JY9A 5FEXA 2DJLA 5E0KA 1RV8A 4UTWA 4YL2A 5F2LA 5ABTA 2KZHA 3NG3A 3NQFA 3Q58A 5F4SA 3PG8A 3E49A 3A22A 3E96A 2C6QA 1UCWA 4A2RA 2ZYFA 2QCDA 3E12A 3W2LA 1F6PA 3M43A 3W7QA 2OZ0A 4YCPA 3HGSA 1TQJA 4WX2A 5K9DA 4QITA 4ORMA 3NNTA 5AFDA 3M16A 3VE9A 3NQ2A 3FS2A 3TFXA 4H6KA 4UTKA 1BWKA 4ADUA 1A5AA 1W8SA 4PC8A 5CSSA 1FXPA 3BK0A 1G4SA 3Q94A 1KV5A 2QDGA 2O7QA 2PRMA 3UXAA 4A2SA 5HUOA 4HPXA 3P80A 3H53A 4JIPA 4UTWC 3VE7A 4Z1CA 4M5PA 2QCNA 1V5XA 1IXOA 1OFEA 3LCFA 4WUIA 4UUIA 4HPJA 3GYEA 3F4NA 4Y96A 3GZ3A 4PL2A 2DORA 3E9AA 4IPIA 3PB0A 4O11A 1ICSA 3WJSA 3YPIA 3C2VA 3W7PA 1W5NA 1XKYA 4L4MA 2FPYA 1YLVA 3G8EA 5KTLA 1NVMA 1SUXA 3VI2A 2I9EA 3PUOA 1GTHA 3WK2A 2GUUA 1N55A 2A1YA 3NZRA 3OEXA 1FWTA 4R34A 1PVNA 1SSGA 4MYXA 1ZENA 3CQ0A 4GBUA 1VLIA 1YXDA 4NJJA 4S2CA 2PE4A 1JCXA 5LKYA 5LGXA 4CQ9A 3W7IA 4MZ1A 3N2MA 3GB6A 1HL2A 2CLHA 1D3HA 1K8ZA 1G4PA 3MBDA 2CLMA 4YXGA 1VYSX 5HUPA 4O10A 3O16A 3CC1A 5D09A 1NAL1 3S1VA 4GUJA 3W87A 5D2TA 4LS1A 3P81A 1KTCA 2FLIA 2YGYA 1VLWA 1XI3A 2ZBTA 4WY0F 5H91A 5L6UA 5CSRA 2OT0A 3LXCA 3U6WA 1B4EA 3B4UA 1EUNA 3M9YA 3W23A 3P61A 4LVFA 3BLFA 3G0SA 3HGRA 4NZFA 1LM1A 1SO3A 3KRUA 2V8ZA 1TPDA 2GQ8A 2DZSA 1VCGA 4UTJA 1C29A 4Z08A 1DJQA 1KFEA 4Z0JA 1GVRA 5LNVA 5D38A 5D04C 1OFDA 2YX0A 4UMCA 5DCDA 4LRSA 1S5TA 3G0UA 4MJZA 5T26A 3M6YA 3N3MA 3TE9A 4QISA 4AHQA 5AYYA 3NQVA 2V0TA 4IOTA 4JY8A 5AN7A 1Z44A 3QW4B 3EWYA 1VRDA 2Y88A 1KFKA 3P8JA 1LRQA 3T78A 3GAYA 4ADTA 5KMYA 4O14A 3UPBA 1X1ZA 2CU0A 1H1YA 4A22A 5SWUA 5KZMA 3UD6A 2WNZA 1FUYA 3PB2A 2C14A 2A7RA 4BWLA 1TV8A 3EWUA 4WJEA 4KFNA 3TSMA 1LRNA 4AF0B 1W3NA 1C8VA 1A5SA 3UZJA 1W5OA 1LDCA 1EP2A 1B3OA 2QJGA 3P67A 1M7PA 4RXGA 2VFEA 3HPSA 2AQWA 1VJIA 3NM1A 3NQAA 3UY8A 4CLMA 4O0ZA 5AHEA 4N9DA 4ALDA 1B57A 1PE1A 3UWWA 3EEGA 3LLDA 2PRLA 4BR1A 2ALDA 3M0ZA 4AHOA 2TRSA 1JCJA 2A2IA 4N6EA 3TJLA 2H90A 2BZNA 1JUEA 3FJLA 2YW4A 3GDRA 4MIMA 4AH7A 4UTTC 5D02A 5AYZA 3HQ1A 2FDSA 3FFSA 3CB8A 3GIYA 4DO4A 3EX6A 3THAA 4K36A 2TPSA 4JTUA 3WJYA 4OT7A 1LYXA 4LY8A 1MEIA 5LNWA 2J88A 3TSBA 3DBPA 1VH7A 5I3FA 4BWLC 2QEZA 3F03K 3UWVA 3STEA 3OG3A 2CZ5A 3PS7A 3CIXA 2NLIA 1LTDA 1ICQA 3LXAA 3IV3A 5LZLA 2YW3A 3QH2A 2FTPA 2ZRZA 3F1QA 1G6CA 4JYFA 3EB2A 1WV2A 2TSYA 4RZ6A 3KRSA 4E0CA 3C3NA 4IMFA 2Z1BA 5E93A 4CNOA 1I2NA 4P2VA 1AG1O 1LZOA 1W5PA 1XFBA 1QOPA 1TCDA 3G3DA 3L2IA 3E0IA 5AHMA 4K39A 4D2JA 2Y89A 3PSVA 1L9WA 1SO4A 2Q8LA 3FJ6A 4IUOA 4MFDA 3LGEA 1QDSA 3M47A 4H3DA 3LHUA 3NQGA 1SZGA 1OYCA 3W7MA 4C1KA 2J6XA 4BFAA 1MEHA 4RJEA 4OWGA 3MYPA 2ZA3A 3RK8A 3EX4A 2V82A 3A5FA 1Z48A 1R30A 5I3KA 3PY2A 3MWAA 4AB4A 4NUWA 3UZ5A 4LRTA 3TJXA 1GYLA 4XTIA 3STCA 5LNRA 3BGGA 3BV4A 5A8GA 4BF9A 3GDKA 3PG9A 4UFLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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