4IQLA

Crystal structure of porphyromonas gingivalis enoyl-acp reductase ii (fabk) with cofactors nadph and fmn
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
313
structure length
312
Chain Sequence
MNRICELLGIEHPIISGGMVWCSGWKLASAVSNGGLGLIGAGSMHPDNLEHHIRSCKAATDKPFGVNVPLLYPEMDKIMEIIMREHVPVVVTSAGSPKVWTAKLKAAGSKVIHVVSSATFARKSEAAGVDAIVAEGFEAGGHNGREETTTLCLIPEVVDAVNIPVVAAGGIASGRAVAAALALGADAVQVGTRFALSEESSAHEDFKAHCRRSVEGDTMLSLKAVSPTRLLKNKFYQDVFAAEQRGASVEELRELLGRGRAKQGIFEGDLHEGELEIGQAVSQISHAETVAEIMVDLVDGYKRSLAGMPTEI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural characterization of Porphyromonas gingivalis enoyl-ACP reductase II (FabK).
pubmed doi rcsb
molecule keywords Enoyl-(Acyl-carrier-protein) reductase II
molecule tags Oxidoreductase
source organism Porphyromonas gingivalis
total genus 110
structure length 312
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.1.9: Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH).
pdb deposition date 2013-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03060 NMO Nitronate monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4iqlA00
3L2IA 4DEFA 5LNUA 2E6AA 1S5TA 1ZY9A 3G8RA 4ZQPA 3PBUA 2CWNA 4IMGA 4UTLA 4RXFA 4JYEA 3TQKA 3KVJA 1TQXA 1SPQA 3MJYA 4MYXA 1PE1A 2OMAA 5LZLA 3W9ZA 3NQEA 1A5SA 3LHTA 2NWSA 3Q2DA 3T78A 4Z0JA 5DCEA 4M6PA 3HG3A 2YFNA 4IXHA 5F1UA 3WJWA 2AQWA 4H4IA 4FNRA 4A29A 1TMHA 3DBPA 1O94A 2QCDA 3P5ZA 2F84A 3GK0A 3L5AA 1SZEA 5FF2A 1DJNA 5LNVA 5LNSA 4HKPA 4GUIA 5HJLA 1WAUA 3RNDA 1OFRA 3NVTA 3YPIA 3NPVA 5D30A 2VFIA 3G1VA 1SW0A 5FF4A 1F05A 4BFAA 3KVKA 3CT7A 1NFBA 3UXAA 2C15A 3MYPA 2WNNA 1SO3A 2C19A 4LVGA 4LWWA 1XCFA 3P8JA 1NSJA 4LC6A 2A2IA 3MI6A 2NXIA 3LRLA 3IGSA 4OU1A 4Y90A 4IMDA 1F74A 1S5WA 2YDAA 3EWBX 3KRSA 4UFLA 3PC0A 4AMAA 1TV8A 4MFEA 3G1XA 5AN7A 4R34A 4ZL1A 2ISWA 3LCXA 1D3HA 4BK9A 4LRTA 4Z1DA 4CLMA 4UR8A 4RV8A 4DF1A 4M19A 4KKXA 3T55A 3ABSA 4NXKA 4GUHA 4M7SA 4M5PA 4YXGA 1OJXA 1K8ZA 1YPIA 2JBMA 5F1VA 1X1OA 1KFJA 2ZRZA 4JTUA 3NL5A 4UFIA 3I6RA 2KZHA 4NJJA 5IBXA 5KMYA 5I3HA 3QZEA 4YLWA 3M7WA 1TRIA 5FI8A 3TJLA 4LVDA 5G4EA 1G7VA 1OX4B 1TSIA 3RLVA 4OQVA 2NUWA 2RFGA 3EWZA 3NQAA 3TXVA 4FHAA 1UJPA 3EWWA 3G1HA 5CZ0A 4HPXA 4WOZA 1W8SA 3GNDA 4IOTA 1OK6A 5C54A 3I7SA 3NPWA 1VH7A 1RQBA 1VGAA 4UTTC 5G1TA 2ZZ5A 3BV4A 3C8FA 2ZFAA 1TV5A 3NQ8A 1V7YA 3NQGA 5BMXA 3NL6A 2EGZA 3W7JA 4WXYA 3HGOA 4HPJA 4U4MA 5G1YA 1C9DA 4N4PA 2P0OA 5FEXA 3W72A 5LHEA 4K39A 3EX6A 2Y70A 3W74A 4Y8FA 2DU2A 3OG3A 4LT9A 4MZYA 3ZFHA 2XN1A 2OJPA 1I2OA 4HNNA 3M16A 4AWTA 1H61A 4MY9A 1FXQA 5HULA 3LTYA 1TPC1 3UWVA 1P5BA 1GOXA 3KHJA 2Q3RA 3IGXA 1RV8A 1JCLA 1H60A 1EP3A 2DZSA 2QCLA 1TB3A 3Q94A 4X2RA 5BMWA 4EOUA 1EEPA 1KBJA 3EKLA 3NAVA 1ZJIA 4KWVA 4O10A 1JRCA 3FJ6A 3GDLA 4FEZA 3DHFA 4CNNA 5LNWA 1KW1A 3CTLA 2BX7A 2RKXA 2V2DA 4UTTA 1QWGA 3BVJA 3LCWA 4S2CA 3GYEA 1N55A 2B4GA 1TQJA 1TREA 4HHPA 4DELA 3W1LA 3B4UA 3LXCA 5D2XA 2E5DA 4J9JA 3B03A 4N6EA 2ISSA 3NA8A 4S2BA 4BF9A 3U8GA 3PUEA 1H5YA 1MO0A 3DENA 3RK8A 4HNTA 3NGJA 3KFTA 2WSYA 5G2IA 3U2OA 4MPQA 1R2SA 1LCOA 3MBFA 4O15A 3E9AA 1B4KA 4BWLC 1WXJA 1GQNA 5AHMA 4NNCA 1B57A 4UC5A 1P1XA 4PEKA 4E2BA 2CZ5A 3LBCA 3EXSA 4RR4A 4LUIA 3TU9A 4MUZA 4UXDA 7TIMA 2YX0A 4JTLA 4LTSA 3MHUA 1EP2A 1I2RA 1GVSA 3E12A 3O1NA 2YYTA 2V8ZA 2FDSA 4Z1CA 1LDCA 1EUNA 2GVLA 1Y0EA 3HGRA 1IF2A 1UB3A 1H50A 4BI6A 5HWJA 3THAA 3W84A 3N9RA 4FX7A 1ME9A 3MP3A 3R8RA 1FWNA 2GOUA 4ZQNA 4X3ZA 1SUXA 1VYSX 4NZFA 1MEWA 2NV1A 1AMKA 3KOFA 3PSVA 4PL2A 1FCUA 1QO5A 2PRLA 3LRKA 2W79A 4UMAA 1JCJA 4AEOA 2E77A 4OGZA 4NJKA 2DJXA 4S1FA 4GUJA 1WYIA 2I14A 5DN1A 2Z6IA 3LI0A 3GXPA 3Q58A 4G1KA 1GT8A 1B4EA 1WQ5A 2JK2A 2C14A 1T96A 1GZGA 2A6LA 4BWLA 2J88A 1HG3A 3TH6A 3HQ1A 5AFDA 4Y96A 4A21A 4XQ6A 2E1DA 4EVZA 2XFWA 3TIMA 4H6KA 2R8WA 3VE9A 1W3IA 4ORMA 1S5VA 4AAJA 1XXXA 1R30A 3D0CA 3LLDA 4MJMA 3TV8A 4XKYA 4P2VA 2NWRA 4RCXA 3GDKA 4DO4A 2WOQA 4JD4A 3UPWA 4DPPA 3EX1A 5AOUA 1LRTA 4N4QA 3VI2A 3VKJA 1R46A 1P4CA 4EWND 3W1MA 2ZRWA 4KFNA 4IX0A 2ATMA 1F76A 3UXDA 1O60A 4LS1A 4O1AA 1VR6A 4QSHA 5HUPA 3VFLA 4AF0A 3DHDA 3DFNA 3G24A 1H63A 4XUGA 3CIXA 1YTDA 3KRUA 3UY8A 3PVFA 2I1OA 1OK4A 2QJGA 3W3OA 2QJHA 1JVNA 3N19B 3M5ZA 2V5LA 3MYOA 2ZTJA 5EKYA 5AC7A 1C8VA 5CZTA 4WUIA 2DZPA 1LBMA 4I9AA 4NNAA 1W3TA 4TU1A 4AVFA 2Q8ZA 3P84A 8TIMA 5D09A 1D9EA 5DBTA 2FTPA 2CU0A 4JDYA 4CQ9A 1H7NA 1GTEA 1M7PA 1LZOA 2V81A 1L2UA 2ZZ2A 5KITA 4FNTA 3W1XA 3WK2A 1QPRA 3M1ZA 2RH9A 3TFXA 2CLKA 3MI2A 3N3MA 4ADSA 3CEPA 4O4VA 3UPBA 4FO4A 5CPNA 4I7UA 2QUUA 4QQ3A 1OFBA 3I7RA 5HINA 1QMLA 4K8HA 4PCFA 1FUYA 2B7NA 1OFPA 1KA9F 1VZWA 3UZ5A 3QC3A 1VLIA 3G1AA 1Q6OA 3NQ2A 3OBKA 4JX5A 2Q8LA 3EEGA 1QNVA 3CPRA 1SO4A 4UMBA 2F7FA 3G1YA 2DZXA 3GIYA 3WFAA 5E1QA 2CZFA 5DY2A 5K3VA 1O4UA 1XL9A 1EP1A 3UNDA 2V9DA 5HR7A 3M47A 1YDNA 2OX1A 1QPNA 3W6YA 4O54A 3TR2A 4KFOA 1RVGA 4QISA 2HMCA 1BWKA 5DCBA 2H6RA 2QUTA 4O1DA 2LLEA 1A53A 3NG3A 3LV5A 1ONRA 5D2VA 1N7KA 5CGQA 3W7CA 5CKSA 4DBEA 3TMQA 4HNVA 2BXVA 3BLIA 2TSYA 1XI3A 5BOOA 1SSDA 2CZEA 1QDSA 3EB2A 3F4NA 4KWWA 4N6FA 2PURA 3WJXA 1MZHA 4FXSA 4GFSA 1ICSA 1KV8A 2Q3OA 4ZMGA 3UY7A 3QYQA 4NUWA 4UTWC 2ZA1A 4LV9A 3HIJA 5CPMA 2VXNA 1QR7A 3BG5A 1WA3A 3EX4A 3HPXA 2HTMA 3L65A 4D2JA 4C1KA 5L6UA 1L6YA 1Q6LA 2ABBA 2Z2UA 1KLZA 1J5TA 2A4AA 1H51A 3M44A 3LTSA 1TCDA 3F1QA 4O13A 1H7OA 1WBHA 3GXNA 1HFBA 4CCDA 3EKZA 1XBVA 2VFFA 4N2YA 3A21A 3ELFA 3KVLA 4K38A 3NEVA 1QOPA 1FWTA 3PUOA 5DBUA 2DORA 1HO4A 2H8ZA 4HSOA 4TX9A 1PIIA 4L4MA 3DFSA 3W1PA 3W7PA 4A2RA 1PV8A 3DGRA 2VFHA 2ZZ4A 3GR8A 1B9BA 3NQ6A 2CLMA 3CWOX 3HPSA 3FKRA 1I2QA 1TTIA 3QSRA 4NJGA 4NNBA 2VEPA 1FDZA 4N9EA 3W75A 4UMCA 3P62A 1A5BA 4DQWA 3R13A 3P8IA 4K36A 3FLUA 2X1SA 1G6CA 1MEHA 3W7LA 5F2MA 3MHFA 2ZA3A 3E96A 4ZVJA 2WKJA 2A0NA 2E6FA 3TSMA 5I3JA 4FB7A 3I65A 2B7QA 1QOQA 3OEXA 2QCCA 1W5NA 3M0ZA 3TCEA 2X16A 3O63A 3R12A 3N9SA 1EB3A 3TC7A 5TBOA 2Y89A 3RLUA 1LP6A 4X22A 1NEYA 2EHHA 2A7RA 4CQ8A 2DZVA 1RQEA 3G8EA 4FIQA 5A5WA 3S9YA 1P0NA 1TIMA 1XFBA 3LCGA 4LS2A 3MBDA 4JTFA 3M5XA 3RFAA 4DBDA 3QMSA 2Z1BA 2CLOA 2QCMA 1TPWA 2R14A 5F2IA 3LHVA 1NF0A 3V75A 3TFCA 3R5EA 2ZZ3A 3BARA 4WXZA 4QNWA 3CWNA 3DAQA 5FEWA 1AG1O 4E0CA 1TRDA 4IX2A 4HSNA 1H7PA 4CNPA 1XDMA 4NJHA 3W7GA 4WY0B 1LOSA 1OFOA 2RHGA 3CLMA 3OVQA 2YCEA 1TJRA 1KFKA 1O5KA 2A7NA 4O1BA 1AL7A 3IRDA 2ATSA 3G3DA 3HJZA 4Y9AA 2R94A 1K7EA 4P61A 1CX9A 1H7RA 1F5ZA 3LI1A 3STGA 3R2GA 1GVQA 3C61A 2QDHA 5AYXA 1TYGA 3HG2A 4PFMA 1OX4A 3A5FA 3W86A 4UTIA 2Y7DA 1UBSA 4N9BA 3RMJA 5FESA 1EIXA 4ALDA 2C6QA 1X8FA 1E51A 1ZAHA 5KTLA 2VENA 1JCXA 2GPTA 1KFEA 3W23A 1YDVA 2E5BA 3TE9A 2H90A 2EF9A 4JIPA 2YW4A 4XBSA 1UUMA 2V5BA 3B05A 1I2NA 1XKYA 1EUAA 4RK8A 4O17A 2J27A 4K37A 2JGYA 1W56A 3W07A 1VJIA 4K8EA 4YCPA 5BW6A 5D05A 4JY9A 4U28A 1ME7A 3TUUA 1MSSA 3UWZA 3ZS4A 1ZAJA 4DF2A 5F2GA 3VNDA 4PTNA 3T44A 2H8XA 2W0UA 1PHQA 3W7EA 4JTKA 3DU0A 3O6YX 4QITA 1EWDA 2WJZA 3M41A 3LDVA 3SR7A 1VCGA 3MW7A 3C52A 2Y62A 1K7XA 4AHQA 1T99A 2QUVA 4FX8A 3OIXA 5CSSA 4AB4A 3UD6A 5G2HA 1JCNA 4LOCA 1QPQA 1ZHAA 2JGQA 3SZ8A 3OVRA 1G7UA 4LUJA 1DQWA 2DZTA 2BWGA 4UFHA 3FIGA 2QCEA 3C6CA 3GVGA 5C6MA 4O14A 3MHGA 4UTUA 3H54A 4A2SA 1F6PA 3UWYA 1SZGA 3CHVA 3P61A 2EKCA 1HO1A 3IEBA 4Q4KA 5T26A 3G1FA 4OV4A 3QEZA 4XTDA 2E09A 1TTPA 1DQXA 4O28A 1UCWA 3BW3A 5K7JA 3LBMA 3FJLA 5HNRA 5TQLA 3R89A 3LCHA 1LTDA 1LBLA 3TA6A 1Z48A 3O16A 3L66A 4HNUA 3EXRA 4AWUA 4MZ1A 3OHIA 1JCMP 3C2VA 4FNPA 1OABA 1GJPA 2ALDA 2WQPA 1TPEA 4K6AA 5LNRA 1SFLA 2DJLA 3PS7A 1AK5A 5KZDA 1YTEA 3TJXA 2ZRXA 3C0JA 2ZZ7A 4OT7A 3S1XA 1EWEA 3AO0A 3ABQA 4O50A 5FF0A 4JR5A 3BPWA 4X9SA 3L9CA 3E49A 3GDMA 4AWSA 5G2WA 3BG9A 3M5VA 3LGEA 1IIHA 3O06A 5LHFA 5I3GA 4PC8A 3DKLA 2YSWA 3CB8A 3LHWA 2GVGA 4MOZA 1I45A 3UQNA 2VEMA 3SGUA 3KAOA 1KFLA 2GQ9A 4JXCA 2J9YA 1JRBA 3QM3A 4MY1A 4CNOA 3PBVA 3B0PA 3TQVA 4ZQRA 1VHCA 1WOAA 3TC6A 2BLEA 4Z0SA 4GWEA 2C18A 4IMFA 4Q32A 2FPVA 1EPXA 1F2JA 1QO2A 5E0KA 1ALDA 1GYLA 3BW4A 4Z08A 3C2FA 5KSWA 5EL1A 4POCA 1LRQA 3LERA 5A8GA 1BKSA 2VFGA 2I9EA 5DELA 1GG0A 3EX3A 3NR0A 1H62A 5HWMA 3W87A 4MYAA 5LKYA 4YL2A 2DZUA 4UTMA 2E6DA 3S1WA 1PVNA 1QFEA 3W1UA 1W37A 4DO6A 2CW6A 1H1YA 4E2DA 2PE4A 4O1CA 2B7PA 1YXCA 3HG5A 5EMUA 5AHFA 1OFEA 1JUBA 4OE7A 4EF9A 4OWGA 5KZMA 1J4EA 4LW7A 3A24A 2DP3A 1GTHA 5AHEA 3W2KA 5U4NA 4RX0A 3LXBA 4XZ9A 5HUOA 4ML9A 3G1DA 3TKFA 4NT0A 2QR6A 4ADUA 4A3UA 1W54A 3KRZA 4NXSA 4WQ6A 5ABTA 3O07A 4HT3A 1GPWA 4AXKA 1A5CA 1U83A 4UNLA 3L0NA 2X1TA 5DCDA 3C2RA 4GJ1A 2IQTA 3MO7A 2J9ZA 3GB6A 1Q6QA 2YXGA 3QMTA 1FWWA 1QPOA 1ZCOA 5C55A 2H3BA 4NX0A 3THQA 2YYUA 3DI1A 1TPDA 1I2PA 3W22A 2NX3A 4RZ6A 4LU0A 2V30A 1L6WA 5DXYA 2Y6ZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3L2I A;  4DEF A;  3GHT A;  1NDZ A;  5XIM A;  1S5T A;  4NZC A;  4PUL A;  3MV0 1;  3PBU A;  3QFW A;  4LEF A;  3BL3 A;  2PSN A;  2GJX B;  3OQ8 A;  3LLX A;  1Q6G A;  1O5Q A;  3XIM A;  1TQX A;  3HN3 A;  1V8E A;  4DI9 A;  4JQ3 A;  1TE6 A;  4HN8 A;  4RPQ A;  3WH8 A;  3R0K A;  1A5S A;  2JF6 A;  2Y1H A;  1HJQ A;  2P88 A;  3Q2D A;  5DCE A;  3WLK X;  3IAP A;  2CBI A;  3HG3 A;  1P0D A;  4N7Q A;  1SFS A;  4P8X A;  3WJW A;  3H7U A;  2AQW A;  3DBP A;  3SCN A;  3ANU A;  2QCD A;  4IIS A;  1J2B A;  3GK0 A;  3L5A A;  1K9D A;  1TWD A;  1TR9 A;  5LNS A;  5BYW A;  1ZSX A;  4GX8 A;  2W61 A;  3MQT A;  1WAU A;  1OFR A;  3ZVH B;  3IJ7 A;  3YPI A;  2XVG A;  2VR2 A;  3G1V A;  4BFA A;  4CN1 A;  1NFB A;  1U30 A;  3UXA A;  3W6L A;  2C15 A;  5HOS A;  3MYP A;  3EA2 A;  1WXY A;  3T8Q A;  1SO3 A;  2REQ B;  4D72 A;  3P8J A;  1ZTV A;  1ISV A;  1WUE A;  1JG9 A;  2NXI A;  3JZE A;  2INE A;  3HZ3 A;  1GNX A;  3DDM A;  1V6X A;  2WZT A;  3G1X A;  3IUD A;  4ZL1 A;  1MNZ A;  3AC0 A;  3ARX A;  4PCS A;  4BK9 A;  4C6M A;  3PPG A;  3T55 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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