The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
246
|
sequence length |
727
|
structure length |
724
|
Chain Sequence |
DFNETALLLAFKQNSVKSDPNNVLGNWKYEGSCSWRGVSCSDDGRIVGLDLRNSGLTGTLNLVNLTALPNLQNLYLQGNYFSSGGDSSGSDCYLQVLDLSSNSISDYSMVDYVFSKCSNLVSVNISNNKLVGKLGFAPSSLQSLTTVDLSYNILSDKIPESFISDFPASLKYLDLTHNNLSGDFSDLSFGICGNLTFFSLSQNNLSGDKFPITLPNCKFLETLNISRNNLAGKIPNGEYWGSFQNLKQLSLAHNRLSGEIPPELSLLCKTLVILDLSGNTFSGELPSQFTACVWLQNLNLGNNYLSGDFLNTVVSKITGITYLYVAYNNISGSVPISLTNCSNLRVLDLSSNGFTGNVPSGFCSLQSSPVLEKILIANNYLSGTVPMELGKCKSLKTIDLSFNELTGPIPKEIWMLPNLSDLVMWANNLTGTIPEGVCVKGGNLETLILNNNLLTGSIPESISRCTNMIWISLSSNRLTGKIPSGIGNLSKLAILQLGNNSLSGNVPRQLGNCKSLIWLDLNSNNLTGDLPGELASQAGLVMPGSVSGKQFAFVRNEGGTDCRGAGGLVEFEGIRAERLERLPMVHSCPATRIYSGMTMYTFSANGSMIYFDISYNAVSGFIPPGYGNMGYLQVLNLGHNRITGTIPDSFGGLKAIGVLDLSHNNLQGYLPGSLGSLSFLSDLDVSNNNLTGPIPFGGQLTTFPVSRYANNSGLCGVPLRPCGS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural basis for differential recognition of brassinolide by its receptors
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Arabidopsis thaliana
|
| molecule keywords |
Serine/threonine-protein kinase BRI1-like 1
|
| total genus |
246
|
| structure length |
724
|
| sequence length |
727
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase. |
| pdb deposition date | 2013-01-31 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF08263 | LRRNT_2 | Leucine rich repeat N-terminal domain |
| A | PF13516 | LRR_6 | Leucine Rich repeat |
| A | PF13855 | LRR_8 | Leucine rich repeat |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Dna Ligase; domain 1 | Dna Ligase; domain 1 | ||
| Alpha Beta | Alpha-Beta Horseshoe | Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix) | Ribonuclease Inhibitor |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3TSR E; 1WWL A; 2JE0 A; 3RFJ A; 1XEC A; 4L3A A; 1DFJ I; 4OQT A; 5AWA A; 4Z64 C; 2WQV A; 2WQU A; 1H6T A; 3RFE A; 5GS2 B; 4R0A A; 4R6A A; 1W8A A; 4GLP A; 4Z61 C; 4XSQ A; 5IJC A; 4XOS A; 1XCD A; 3ULA A; 4PKI G; 2OMT A; 5AWB A; 3UL9 A; 2OMX A; 2Z82 A; 3W3G A; 1U0N D; 4FMZ A; 1A4Y A; 4ECO A; 3RGZ A; 3E2J A; 1FT8 A; 1K5D C; 2ID5 A; 1G9U A; 2O6S A; 4LXS A; 3E6J A; 3ZYJ A; 3CIG A; 1OTO A; 4I6J B; 4CC4 C; 4U09 A; 4Z79 A; 2Z81 A; 2P1P B; 2Z7X B; 3OJA A; 1Z7X W; 3G3A A; 3C6O B; 4CNC A; 1XKU A; 4R6F A; 4J0M A; 4C2A B; 1O6S A; 4CC4 A; 4LI1 A; 4V2D A; 4AW4 A; 5IYX C; 3WPG A; 1DS9 A; 5B0N A; 2P1N B; 3PMH G; 4KNG A; 5B0T A; 1K5G C; 3P72 A; 2AST B; 3M18 A; 4Z94 G; 4MN8 B; 2Q4G W; 1OZN A; 2RA8 A; 1O6V A; 3O6N A; 4ARR A; 3C6P B; 4FS7 A; 3WPE A; 4EZG A; 3W3N A; 5GMG A; 4XGO A; 4QBZ A; 3GOZ A; 2IFG A; 3C6N B; 4QC0 A; 1OOK G; 1O6T A; 4H09 A; 4Q3G A; 3WPD A; 1M10 B; 3VQ2 A; 3RW6 A; 4R58 A; 3G39 A; 5B4P A; 3A79 B; 2BNH A; 4P91 A; 5D3I A; 1FS2 A; 3CIY A; 3KJ4 A; 4LXR A; 2Z64 A; 4WYK A; 4RCA B; 3O53 A; 2Z62 A; 1XWD C; 3UL7 A; 3G04 C; 4V2E A; 4KXF B; 2UZY A; 2P1Q B; 4Y61 B; 4KT1 A; 4R09 A; 4RCW A; 4ECN A; 4G8A A; 3RJ0 A; 3E4G A; 1PGV A; 2OMV A; 2XOT A; 1FO1 A; 4PEQ B; 3M19 A; 3OJA B; 4R5C A; 3W3L A; 3ZYO A; 3SB4 A; 4ARN A; 4R5D A; 5GMH A; 5AWC A; 4Q3I A; 2Z65 A; 4NKH A; 1JL5 A; 4UFR A; 3OGK B; 1M0Z A; 1H6U A; 3WPI A; 1GWB A; 2OMU A; 4AY9 X; 1IO0 A; 2WQX A; 4FD0 A; 3UL8 A; 3RIZ A; 4R6J A; 3ZYN A; 1YRG A; 3OGL B; 2A0Z A; 4LI2 A; 3FXI A; 4PER A; 1LTX A; 4BSS A; 2R9U A; 2JQD A; 5AZ5 A; 4LSC A; 5CMN A; 4R6G A; 4TZH A; 4U7L A; 4BV4 R; 2UZX A; 3WPC A; 1XEU A; 4RWT C; 2OMW A; 2FT3 A; 1P9A G; 4IM6 A; 1OTN A; 2RR6 A; 3RW7 A; 2V70 A; 2P1O B; 5CMP A; 1KOO A; 2WQW A; 3WPH A; 2OMZ A; 4FCG A; 4P8S A; 4YEB B; 4J4L A; 2OMY A; 1P8T A; 3BZ5 A; 2ASS B; 5LFN A; 4C2B B; 4FDW A; 4B8C D; 4QXE A; 4CP6 A; 3CVR A; 4GT6 A; 3UN9 A; 3WPB A; 5A5C A; 2BEX A; 4K17 A; 4Z8G A; 3W3M A; 1FQV A; 4PSJ A; 4FHO A; 2O6R A; 5GQR K; 5IJD A; 3W3J A; 4LSA A; 3WN4 A; 3DZE A; 3VQ1 A; 4M7E C; 3JB9 j; 4L3F A; 1A9N A; 4MQW X; 4CNM A; 4R08 A; 4V2C A; 4U08 A; 4M7E A; 5HZL B; 3G06 A; 3ULU A; 4Q62 A; 1DCE A; 3RGX A; 1KOH A; 1OGQ A; 1M9L A; 4PQ8 A; 5HDH A; 1D0B A; 2V9T B; 4U06 A; 4R07 A; 2Z7X A; 3RFS A; 5FTT B; 3W3K A; 3E3Z A; 4WP6 A; 1OTM A; 4CIL A; 4LSX C; 2Z66 A; 3ULV A; 1ZIW A; 1SQ0 B; 3ZYI A; 4BSU A; 5GMF A; 4NKG A; 1QYY A; 2V9S A; 2WFH A; 5IJB A; 4BSR A; 3OGM B; 4LSX A; 5AWD A; 2ELL A; 3REZ A; 3WPF A; 1P8V A; 2P1M B; 2Z63 A; 5GS0 A; 1M9S A; 2CA6 A; 3G3B A; 2Y5Q A; 2XWT C; 4HQ1 A; 2JE1 A; 2O6Q A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3RFJ A; 4L3A A; 1GSA A; 1S0O A; 2R84 A; 4A2B A; 2HHH H; 4GLP A; 2ZDH A; 4XOS A; 4ECW A; 1XCD A; 3ULA A; 3QZ7 A; 4PKI G; 2QK4 A; 3HXL A; 2CZG A; 5JQW A; 3UL9 A; 2OMX A; 2Z82 A; 3BQ1 A; 2C35 B; 4DV2 H; 3E2J A; 2ID5 A; 1G9U A; 3Q8R B; 1KJQ A; 2O6S A; 4LXS A; 2FPP B; 4QIW A; 2UXC H; 3CIG A; 3EPI A; 1K83 A; 1OTO A; 3RV4 A; 5IYD G; 4IRD A; 3M9M B; 3HOZ G; 4RNN A; 1Z7X W; 4R6F A; 4C2A B; 1TWG A; 5KFM A; 4LI1 A; 4AW4 A; 5IYX C; 2XIG A; 3PMH G; 4Q44 A; 4DR1 H; 3L2P A; 5F9N A; 4J9L A; 4XYM B; 2JA6 A; 2YZG A; 2YS6 A; 4CC6 A; 3C6P B; 4YHH H; 3MR2 A; 2UVR A; 4ECY A; 4YR0 A; 3RAX A; 5C3E G; 4YBZ B; 3HOV G; 4Q0Y A; 4DL3 A; 4EZG A; 2E5L H; 4X64 H; 4QBZ A; 4IWX A; 3T5J A; 1J5E H; 3GOZ A; 2IFG A; 1EZ1 A; 1O6T A; 2CW7 A; 4O3Q A; 4MTD A; 3WO0 A; 2W6O A; 3K5H A; 4JUZ A; 4R58 A; 3OTO H; 4A2A A; 4ED6 A; 1I7N A; 4DUY H; 2BNH A; 5D3I A; 3N8D A; 5C4X G; 4O3P A; 2Z64 A; 5GON F; 1N48 A; 4BY1 G; 1W96 A; 5KFG A; 2VQF H; 3H4B A; 3GTL A; 4EEY A; 3HOW G; 2W7O A; 1XWD C; 2YS7 A; 4R09 A; 1L2Z A; 4RZR A; 5KFJ A; 5KFO A; 5DG9 A; 1TWH A; 2JEI A; 4TQR A; 2C2D A; 4UCR A; 4I7H A; 5KFP A; 2FPG B; 5LA6 F; 3Q8P B; 1KJ8 A; 5KFB A; 3JRX A; 4ARN A; 4R5D A; 5GMH A; 4J9O A; 3PW5 A; 4NZT M; 4I4T F; 2WAQ A; 4Q3I A; 1DGS A; 4JI3 H; 3G8C A; 3T1H H; 4IZO A; 3PR4 A; 4NKH A; 4ME6 A; 4UFR A; 4TUY F; 2V58 A; 4DV1 H; 5A2Q W; 2VR1 A; 2JEJ A; 3KXY T; 2W9B A; 2OMU A; 4A3C G; 1TA8 A; 5T14 A; 3N44 B; 2J9G A; 4TQS A; 3F8N A; 5KFT A; 4XYL B; 4QWD A; 2WTF A; 1UC9 A; 4LI2 A; 3FXI A; 4TV9 F; 3FKI A; 2KSW A; 4HR7 A; 5AZ5 A; 4LSC A; 4J9Q A; 4JI7 H; 4R6G A; 3T5K A; 4YJ2 F; 5KG0 A; 4TZH A; 3DF7 A; 3EYY A; 3ETJ A; 2YRX A; 2BQ3 A; 1RK5 A; 4FM9 A; 3G6X A; 4ED2 A; 2FLL A; 5KFF A; 3PZP A; 2ATL A; 2YCH A; 4YAK B; 4MAM A; 4JV2 A; 4L1K A; 3KHG A; 3M9O B; 4IM6 A; 5IYC G; 2Q2T A; 1Y1W A; 1OTN A; 5L1K A; 1AUX A; 3RW7 A; 3UQ8 A; 2V70 A; 1WSC A; 1TWF A; 3RTX A; 2WYO A; 1KOO A; 1V4Y A; 3M4I A; 3WPH A; 4DL5 A; 3TQT A; 4YR2 A; 1KJJ A; 4O3R A; 1M0W A; 4B3S H; 4CC5 A; 3QZ8 A; 3GTP A; 1B04 A; 5A5C A; 2BEX A; 4K17 A; 3W3M A; 2V59 A; 4FHO A; 4HQ6 A; 4LSA A; 5C8Y F; 2W6M A; 3JAM W; 2UXD H; 5KT4 A; 2R7L A; 3GTK A; 1JDB B; 3JB9 j; 4L3F A; 5FD5 A; 5LP6 F; 2W8L A; 3FMA A; 4C5C A; 2W9B B; 4MQW X; 4CNM A; 2ZM6 H; 5LMN H; 2IP4 A; 5L1L A; 3BQ2 A; 5K2M A; 3QFF A; 5BR8 H; 5IYZ F; 3RGX A; 1JKJ B; 1M9L A; 5KT2 A; 2BQR A; 2BQU A; 4B3R H; 2GPS A; 2W6Q A; 4U06 A; 4R07 A; 2FK3 A; 2UUA H; 3VMM A; 4IRC A; 1XMO H; 5KG5 A; 4JI4 H; 1OTM A; 1RYR A; 2FPI B; 4ECT A; 4LSX C; 4IR1 A; 3ULV A; 2DZD A; 5EOY A; 3PN1 A; 3WO1 A; 4NLG A; 5EDW A; 5GMF A; 4RAZ A; 1QYY A; 3K5I A; 2WFH A; 4EBC A; 5IJB A; 1R9T A; 4LSX A; 1BNC A; 4XZ3 B; 3HOU G; 4IWY A; 3REZ A; 3WPF A; 3L4J A; 4ED7 A; 4K0K H; 2R8J A; 4A3J G; 5GS0 A; 4EBE A; 1Y1V G; 1IBL H; 3G3B A; 2JEG A; 2XWT C; 1S03 G; 5D8D A; 4JI6 H; 4Q43 A; 4ED0 A; 3LML A; 2O6Q A; 4RUC A; 3MWD A; 3TSR E; 4O3S A; 1Y14 B; 3N40 P; 5IP7 G; 4ECZ A; 1JXL A; 4O4L F; 5AWA A; 4Z64 C; 3TII A; 2YZM A; 2WQU A; 1H6T A; 3BQ0 A; 5GS2 B; 1W8A A; 2VUM A; 5KFK A; 4I50 F; 2ASL A; 2R8K A; 1ULZ A; 5CA1 F; 2DLN A; 4DV5 H; 3GQC A; 1DV1 A; 4FBT A; 2C00 A; 4FMZ A; 1A4Y A; 4ECO A; 3WNZ A; 1FKA H; 4HYK A; 2GPW A; 3E6J A; 2YYA A; 4CC4 C; 4U09 A; 1K1Q A; 3C0F B; 2JA5 G; 4LFA H; 4A3M G; 5JH7 F; 4LF6 H; 4C5B A; 3OJA A; 3G3A A; 3GIQ A; 3C6O B; 4X62 H; 2JA7 G; 4J0M A; 1O6S A; 4ED8 A; 4CC4 A; 1KEE A; 1DS9 A; 2UVW A; 5B0T A; 2UUB H; 1K5G C; 2PBZ A; 2AST B; 3RV3 A; 3VPC A; 4Z94 G; 1N56 A; 1B6S A; 3KAK A; 1JLL B; 2R8H A; 3R23 A; 2DIK A; 4O3N A; 4LF7 H; 3R5X A; 4A3K G; 1Z2P X; 2E2I A; 4EGJ A; 3C6N B; 4QC0 A; 1OOK G; 5LXT F; 4H09 A; 1GO3 E; 4Q3G A; 1M10 B; 3MR5 A; 3G39 A; 3RB6 A; 5C44 G; 5KG6 A; 3OHB A; 4A3B G; 4LXR A; 4FBU A; 1MZB A; 2FB9 A; 3ETH A; 1N36 H; 2C22 A; 2PMZ E; 1V51 A; 4WYK A; 5L1I A; 2GLT A; 5F9L A; 2UZY A; 3H20 A; 4J9P A; 5JVL A; 3MR6 A; 5JUM A; 3RJ0 A; 3E4G A; 5CB4 F; 3KTM A; 1P8L A; 2YZN A; 4IRK A; 3OJA B; 1OWT A; 3U9S A; 3PW2 A; 4R5C A; 3ZYO A; 3W3L A; 3R5F A; 2JA6 G; 2E2H A; 4MV7 A; 4QWA A; 2VPS A; 3IG0 A; 1GSH A; 3RB3 A; 5FPR A; 4JV5 H; 1JL5 A; 4O2A F; 3OGK B; 1M0Z A; 2IBK A; 1H6U A; 5DQI A; 4JI2 H; 4DV0 H; 2RDI A; 2W7P A; 4F4Y A; 4A3I G; 4OX9 H; 1GWB A; 2VA2 A; 3I12 A; 2OWO A; 3GTM A; 3M9N B; 2YRW A; 3T5L A; 1WCM G; 1YRG A; 5KT6 A; 2W6Z A; 4QWC A; 2A0Z A; 4ZHQ F; 2IA6 A; 1FVI A; 2UU9 H; 4JI8 H; 4EYH B; 5CAE B; 4KHP H; 3R5H A; 4PER A; 1GSO A; 2R7Z A; 4LF9 H; 4ECQ A; 3GTJ A; 1S9F A; 2F4V H; 4LFC H; 5C5J A; 4IAJ A; 4U7L A; 3GV8 B; 2UZX A; 4LF5 H; 5FPO A; 4ECV A; 1A9X A; 3N6X A; 4A3F G; 2FT3 A; 1CS0 A; 5KFV A; 2XCA A; 2I87 A; 3OSP A; 4E4T A; 2RR6 A; 3MFH A; 4BY7 G; 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