4J8FA

Crystal structure of a fusion protein containing the nbd of hsp70 and the middle domain of hip
Total Genus 183
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
183
sequence length
551
structure length
551
Chain Sequence
FMAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGLESDLEIDNEGVIEADTDAPQEMGDENAEITEAMMDEANEKKGAAIDALNDGELQKAIDLFTDAIKLNPRLAILYAKRASVFVKLQKPNAAIRDCDRAIEINPDSAQPYKWRGKAHRLLGHWEEAARDLALACKLDYDEDASAMLREVQPRAQKIAEHRRKYERKREE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and function of Hip, an attenuator of the Hsp70 chaperone cycle.
pubmed doi rcsb
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B, Hsc70-interacting protein
total genus 183
structure length 551
sequence length 551
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.25.40.10 Mainly Alpha Alpha Horseshoe Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat 4j8fA04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4j8fA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4j8fA01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4j8fA03
5CCLA 2E1YA 2P9KB 3H1VX 3JXUA 4J0UA 3D2FA 3UQ3A 3VTXA 2XGSA 3IUCA 5KPTA 4BT8A 2PAVA 2L6JA 4H7XA 2P9NB 2VYPA 3CJAA 3ENHA 3IMXA 4IJNA 2FSKA 4M7XA 3VEWA 4BR7A 2KCKA 4JHDA 4BRHA 3MDQA 4WNGA 1U6ZA 3LYAA 4H0TB 4A2BA 4AM6A 5FZSA 3CK7A 4GCOA 4O6FA 4HOSA 3UKUA 4CZJA 2P9PB 2QM1A 4FWOA 1W3BA 2VYIA 4HOTA 4G24A 3A5LC 4HTLA 1XC3A 1NGGA 3GW4A 2CGLA 2HF3A 3TGOA 3VEOA 5BN8A 4XH5A 2LSVA 3Q49B 3TG4A 2D1KA 5EX3A 4JA9A 1GLFO 4U0SA 2GEMA 2GWJA 3EKSA 3ID8A 3LDOA 2XCCA 1OUVA 4Y6CA 2IIRA 3OHRA 5EVZA 4I6MB 3O8MA 1Y64A 5LCWC 2ASPA 1KLXA 1IG8A 3FZMA 1NGDA 1MWMA 3M3ZA 2Q97A 3O6WA 3L0QA 4DB3A 2D0PA 1KAZA 4BRFA 4I2ZA 1IJJA 5ELZA 2Y4UA 3LY9A 3AS4A 1X9JA 1FCHA 1GLLO 3AAQA 5KPZA 3ESKA 1YA0A 2V7ZA 4H0OA 1J6ZA 3CVLA 5EOYA 2HYZA 4CZLA 5BREA 2QWOA 1NGFA 3MEKA 3GG4A 2V5FA 1DEJA 1NM1A 3GBTA 3ZX0A 5BRDA 2ZWHA 5AQMA 4GPKA 1HKCA 1T6DA 5AZIA 3HI0A 4CDRA 2YI1A 5AR0A 2XGMA 2FXUA 2P9UA 3R6MA 5M72A 2KHOA 5G05J 4WQ5C 5FPDA 3UB5A 3BEXA 2AVPA 2OOEA 1G99A 4AM9A 1WAO1 1KXPA 3EN9A 3R9PA 4BR9A 5AZJA 5KJMA 4BR0A 2CGKA 4IWVA 5AQVA 4H7YA 2CH6A 2P9KA 3VESA 5FT9A 2J9QA 1RDWX 4CGWA 2P9NA 3LCAA 4BGBA 4GZ3A 4JAXA 1NA0A 3R9AB 1JCGA 1GLEG 3R8EA 5KJNA 3WQTA 5KJKA 4DCHA 2A40A 4YDUA 3SZ7A 4U07A 2OANA 3H1QA 3J8AA 4WQ4A 5AQRA 2QXLA 2P9PA 5G04C 1XUPO 1DKGD 2P9LB 4EIAA 3HSCA 4J8FA 5AQZA 3CV0A 5BW8C 1T6CA 2JLBA 4AY6A 2NLXA 3VF4A 5KPRA 4U04A 4IJAA 1Y8MA 3FWVA 3A5MC 2BUPA 2Q2RA 2GTDA 3ZX3A 1C0GA 3HM8A 4L3QA 4I6MA 4DHYA 4UI9J 4CZEA 2NC9A 3MKRA 2FF6A 2YHXA 3FFKB 3WT0A 3Q47B 2QWLA 4CZKA 5BR9A 3ASDA 4BR4A 4HOUA 2BUGA 1BOTO 5EY4A 3VENA 3KS2A 3BEEA 1NZNA 4CBUA 3N71A 2YHWA 5BT1A 2ZF5O 5E26A 3WXKA 3RSEB 3VEYA 4CZHA 5TKYA 5BPNA 2KC7A 3MN5A 2LNIA 3QFPA 3UKRB 3QKYA 3VERA 3RU0A 3M6GA 1NGBA 4BC2A 3P4IA 5E84A 2P58C 3QWVA 4GA1A 1LCUA 4G1TA 3SF4A 4JD2A 4O5FA 1HUXA 5FPNA 3DXMB 1P5QA 2P9IB 2GW1A 4K42A 4BRPA 3O48A 2FSJA 1NGAA 2C0LA 3QDKA 1ZXOA 3GOIA 1GLDG 3D2EB 1TUUA 2R5SA 4PKHA 1V4SA 4PKGA 1YAGA 3GZ1A 2V7YA 4FWQA 1RFQA 3VEZA 3FP3A 3Q5MA 2FSNA 1JCFA 2WUSA 3L4IA 1GLAG 1YUWA 3DJCA 5AQTA 3U9ZA 5JICA 4J8DA 4J8EA 3ZEUB 3BF1A 3ULEB 4MLEA 2UY1B 1BWFO 1A17A 2Q7FA 1HKGA 2Q36A 3LDNA 4WNFA 4U0ZA 2C0MA 2E2PA 1SAZA 5ARFA 3A0IX 5FZQA 3LDQA 4QS8A 5HI7A 4A62A 3S7BA 2Q31A 4JN4A 3ZPJA 4EHTA 2P9LA 4N3CA 4H0PA 5CCMA 1DGKN 5AYWD 4G26A 2E20A 3S7JA 2E2QA 2PZIA 3Q4AB 1BU6O 3ZGQA 4FWPA 3VGLA 5A6CA 1XQSC 3CKCA 3VPZA 2A3ZA 2ONDA 5EKQD 4AM7A 4GYWA 2ASOA 1OKJA 3TPQA 5AQPA 2FF3B 3H45C 4FWSA 4FWMA 4K25A 2VGXB 4XI0A 2LSUA 4GA2A 2E1ZA 3H46O 4QS9A 3C7NB 4BQLA 4FOEA 3QOUA 3AY9A 4F3VA 1X3NA 3QWWA 1HX1A 3MMVA 4UQZA 3KVGA 5FJYA 4H5WA 4JL0A 3CJ9A 5LJVA 4CGVA 3RSEA 5EX0A 1X3MA 5AQIA 5FZRA 4CJ7A 1KT0A 4WQ5A 2XGOA 2PBDA 5AQJA 4H0YB 1H1VA 1NMDA 2WPVA 2VCPA 3G25A 3UKRA 5FPEA 3K9IA 2CGJA 1Z05A 3CJCA 4RWTA 4U0UA 3LY7A 4BTBA 1HKBA 4GYYA 3O80A 5EX5A 3U9DA 4BRNA 1ELRA 3MA5A 2W41A 2IFUA 4FWKA 1QZ6A 3DXMA 3H3OB 3S7FA 5BRHA 4N5CA 1GLBG 2P9IA 5AQNA 4FPAA 4NO7A 4BRIA 2PL2A 3RIBA 2QWMA 3CVPA 4BQZA 1WOQA 2E2EA 3VGMA 3LPZA 3ASGA 3CVNA 3D2EA 2VQ2A 5AFUH 3OXGA 3QFUA 5EXWA 4BREA 1S3XA 5AQGA 3ZETB 3CQYA 3KZBA 3ZEUA 2I7PA 3ULEA 2UY1A 3ULQA 4B1YB 4HOQA 4CI6A 2AA4A 3MN6A 4A61A 1MDUB 4YVQC 2V52B 1NA3A 3LM9A 5AQXA 5F1XA 4BTAA 1BA0A 1IYGA 3QWPA 4FWRA 4BROA 5C1DA 3SK3A 3WXLA 1U2VB 1QHAA 2F9WA 4ME2A 3VOVA 4ABNA 3H6EA 1MWKA 5F2RA 1NGJA 2A5XA 2E8AA 4B1VA 1NBWA 3GE1A 2QW9A 3QBXA 4M63C 2VSNA 3FLCO 4M7YA 4GZ5A 3VEXA 4BG9A 4CZGA 2CH5A 3O4WA 3NF1A 5D0QD 4IN3B 1BG3A 1QQOA 2YHYA 3UUXA 2HOEA 3WQUA 4DQ8A 1HH8A 3ASHA 2VGXA 4GY2B 2FI7A 4H5TA 3SJHA 3C7NA 5KQDA 1V4TA 4EHUA 4Y6WA 2QWPA 4RCHA 4E1JA 4ISGA 4W9RA 3EL2A 3FR0A 4HWIA 4WYBA 3HBTA 5ADXH 3GDQA 4N2QA 2YCHA 4FO0A 3MCPA 2YJEA 1E4GT 1ZBSA 3PE3A 4AY5A 1GLCG 2E2OA 3AARA 3CJBA 2XEVA 3CJ1A 4CD3A 5AQFA 4NQ0A 2IF4A 4H5NA 1K8KB 4B94A 2IVPA 1HLUA 3RJVA 3EDTB 1HJOA 3VETA 3KD7A 4EQFA 2C2LA 3CK9A 1ATSA 3LDPA 4B9QA 2VGYA 4PL8A 3PDNA 4CD1A 4HORA 3Q15A 4BT9A 5A7DB 5LCWJ 4CZMA 3CVQA 1RGIA 1SQKA 4BRQA 3WXIA 3MV2B 1QZ5A 2FBNA 5BRFA 4GZ6A 4PKIA 3AS8A 4NRHB 2IVNA 3F9MA 2PQNA 2I6HA 3QBWA 4K41A 5AQKA 5JLHA 4BRDA 2QWQA 3GL1A 3ZETA 4BRAA 3AAPA 5KQ8A 4IZ9A 3O08A 2KCLA 2F9TA 1NWKA 4BRMA 2V51B 3A5NC 4B1XB 4G25A 4I17A 2WQHA 4O8KA 4KBQA 1D4XA 2BTFA 3LDLA 1ESVA 3IFRA 4JA7A 1BDGA 4UI9K 1NGHA 2GUPA 2UYTA 2E2NA 2W40A 3BP8A 1NGIA 3H3NO 5G05C 3VF2A 1BUPA 4BG8A 1QQNA 4UQYA 2DBAA 4I9EA 3W3DA 4A2AA 3FZHA 3MV3B 1U2VA 2H3GX 4FOIA 3D7EO 2MHKA 3URZA 4G2VA 4MO5A 4WNDA 4XH4A 3VGKA 2HO1A 2VSYA 4IXCA 1B89A 3LKUA 2IVOA 4RTFD 5I9EB 4CBXA 4BRGA 3FGUA 3DAWA 4Y0WA 2GELA 4Z94A 4WUYA 1ZU2A 1CZAN 4XI9A 5ARGA 4F9OA 4BGAA 5D0OD 2FEZA 3HTVA 4EAHD 2GWKA 2EWSA 4H03B 3E4BA 3A5OC 5DBKA 2D0OA 2UWJG 3SLCA 4BC4A 2J4RA 1YVNA 4CBWA 4MLHA 4UI9C 5G04J 2KCVA 3IEGA 3CIPA 5F0XA 4KYOB 4CZIA 4IO8A 5BNWA 3S41A 3AS5A 1K8KA 4C23A 4BVPA 3QDNA 1HXIA 1NLVA 4LC9B 3DWLA 5BPMA 2P9SB 2NRHA 3CKBA 3RKVA 4FWLA 3FZFA 1MA9B 2A42A 1BO5O 5CHEE 1TYQB 3FZLA 4B1WB 5AQSA 4I2WA 4JNEA 4BC5A 4BRKA 2E88A 4H0VB 2FF4A 3U3WA 1LOTB 4WNEA 3CEQA 2I7NA 1T44A 4XEIA 3ATUA 3QMLA 3PE4A 1C0FA 4XH1A 3CJ7A 3DXKB 5LY3A 3UE5A 2Y4TA 3ZX2A 3LM2A 1HPMA 3WEEB 4GCNA 3TG5A 3VTYA 4BRCA 4XIFA 5JJ6A 3ZHEB 3O1BA 3WXJA 3A8YA 4QS7A 4KXKB 5AQQA 5BN9A 1ZBPA 2Q1NA 5AQWA 3CHWA 2YQ8A 4PL7A 4APOA 4ISEA 4JD2B 2ZGYA 3EKUA 3CK8A 3ATVA 3LL3A 3FFLA 5KJLA 3MN9A 3HYMB 2D4WA 5AFUA 3GYZA 1QQMA 3CERA 5JMVA 3QB0A 3OXLA 2A41A 2A6AA 1QZ2A 4RG6A 4BC3A 3TAXA 2KATA 4N2SA 1NGEA 3WUHA 3SMPA 5AQOA 1TUYA 2VWBA 4I9CA 3VEVA 1TJCA 2HR2A 1QQEA 1EQYA 5FPMA 4I1AA 3ASFA 2PQRA 5DIZA 4JHRA 2HMPA 4B1ZA 3L6QA 3FZKA 1ATNA 3EZWA 1WUAA 3U4LA 3D2FB 1KAYA 5JJTA 3M1FA 3TU5A 1XNFA 2NZTA 4K43A 3LY8A 4N3BA 3BF3A 1NGCA 4H5VA 5AQUA 4BR5A 4N39A 2AP1A 3JYSA 3KAEA 4BRLA 3C0BA 4JHDB 5LJWA 3IDHA 2QFCA 4BWRA 3U8XA 2YHCA 4CZFA 3MN7A 2P9SA 1KT1A 5BPLA 3UKUB 3B8AX 1E96B 1YXQA 1TYQA 1BA1A 4BVOA 3GZ2A 4GA0A 4BR2A 4H0XB 1Q18A 3ENOA 3CQXA 1ZC6A 5AQYA 4FPBA 5ADXA 1P8ZA 4YNDA 3DXKA 4H5RA 1E4FT 4NB4A 5AQLA 1JCEA 4UQXA 3KHYA 4MO4A 4KBOA 4GYOA 2ASMA 2Q0RA 5B8HA 1HZ4A 3CI5A 3WEEA 1ATRA 1IHGA 5HQ8A 2YJFA 2DPNA 4FL9A 3ZN3A 1SZ2A 3OXFA 3ZHEA 3QICA 2ZGZA 4WQ4C 4YDUC 5AQHA 2XPIA 3CETA 4AIFA 3EO3A 3O5BA 4G23A 4A1SA 3ZFWA 2FO7A 4N3AA 5FTPA 3UPVA 1Z6RA 4FSVA 5JLFA 5CE3A 3SMSA 4RG9A 3S7DA 4EFHA 3MK6A 2HF4A 4FWNA 3U4TA 1GLJO 5JJ7A 3I8BA 3O1WA 4ISFA 2QWRA 3FE1A 2Q0UA 3HZ6A 1R59O 1KAXA 5AZIB 2XCBA 3RO2A 3JS6A 1PC2A 2ITMA 1ELWA 4LEUA 2P9UB 3W0LA 3RO3A 4B1UB 3I33A 1S22A 3BUZB 4GNIA 2FLOA 5AZJB 3VF6A 2QWNA 3WXXA 1WM5A 4YVOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FHEA 2H6IA 3JXUA 3IUCA 3VTXA 1HYZA 2FBVA 2OA8A 4HUGA 2DY4A 1QHTA 4IJNA 2VYPA 3CJAA 5KTQA 3G2VA 1IG9A 3SBGA 1OXJA 3OBWA 4BR7A 4HRNA 3UTMA 4BRHA 4ATGA 3U3GA 2BDPA 1SL2A 3EU5A 2Q3SA 4CJUA 3LJNA 2P9PB 2QM1A 4KZCA 3EE8A 2VYIA 3E1YA 4G24A 5JS2A 2CGLA 3LP2A 3KD1E 1DTTA 5GIPA 4M3XA 4XH5A 2LSVA 3TG4A 3R3LA 1ITGA 1GLFO 4U0SA 3FUMA 3EIJA 5EVZA 2XY8A 4I6MB 3O8MA 2Y1LE 5EN5D 5LCWC 1KLXA 2ASPA 4E85A 1JPLA 3M3ZA 4DV5K 1U4BA 3DEOA 4LG6A 3DSWA 3O6WA 4ANXA 3L0QA 1KAZA 1XI1A 2DFEA 3NMUA 3KWGA 4NCBA 3E34A 1K3ZD 2XRZA 5EU7A 1FCHA 2P9NG 1A5WA 3AAQA 3ESKA 2V7ZA 4H0OA 4Z68A 4BWJA 3RRGA 1LW2A 1JXBA 4B9LA 2A1RA 3CVLA 5EOYA 4A5BA 5BREA 3CFRA 1VQ7N 1NGFA 4UUCA 3I3NA 3FTUA 1DEJA 4GVEA 5HROA 4N76A 3CVWA 4IOXA 4UWKA 1NP7A 5JA4D 5AZIA 4N5QA 3T1AA 2YI1A 2YV0X 3NH0A 2XGMA 4Z4FA 1B9DA 5K14A 4DSKA 2AXVA 2O4IA 5G05J 5FPDA 1KXPA 4FJNA 2IAJA 4ANWA 3K5OA 5KJMA 2CGKA 1RDWX 3AVCA 3D9PA 4GZ3A 4DMNA 4N56A 4JAXA 3M5RA 3R9AB 1BIZA 3CSTA 1JCGA 1GLEG 3DSVA 3WQTA 1NJXA 3MGBA 3RVCA 3SZ7A 4FK0A 2OANA 2Z1JA 2FBXA 3J8AA 4I2QA 2E0IA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3I33 A;  1S22 A;  3BUZ B;  4GNI A;  2FLO A;  5AZJ B;  3VF6 A;  2QWN A;  3WXX A;  1WM5 A;  4YVO A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1EKE A;  3SUP A;  3SMS A;  1B92 A;  2FBY A;  4CEB A;  4U63 A;  3RRM B;  4I9Q A;  2P9L G;  3TAG A;  2PY5 A;  1Z26 A;  4J2A A;  4U8Y D;  5JJ7 A;  1R59 O;  5AZI B;  4LF8 K;  3RO2 A;  3PZ2 A;  1D5A A;  3O9Q A;  1ELW A;  4OKJ A;  3V1R A;  2V5Q C;  2WC9 A;  2AJA A;  1VQ8 N;  4NYN A;  4CJP A;  4GNI A;  4YOV A;  3TWS A;  2QWN A;  4H8K A;  1IH7 A;  1NI1 A;  2KC7 A;  4YVO A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 3FHE A;  3JXU A;  3IUC A;  3VTX A;  4IJN A;  2VYP A;  3CJA A;  3G2V A;  3SBG A;  3OBW A;  4BR7 A;  4BRH A;  4ATG A;  2P9P B;  2QM1 A;  3EE8 A;  4KZC A;  2VYI A;  3E1Y A;  4G24 A;  2CGL A;  5GIP A;  4XH5 A;  2LSV A;  3TG4 A;  3R3L A;  1GLF O;  4U0S A;  3FUM A;  3EIJ A;  5EVZ A;  4I6M B;  3O8M A;  5LCW C;  2ASP A;  1KLX A;  4E85 A;  1JPL A;  3M3Z A;  3O6W A;  4ANX A;  3L0Q A;  1KAZ A;  3NMU A;  3KWG A;  2XRZ A;  1FCH A;  3AAQ A;  3ESK A;  2V7Z A;  4H0O A;  3CVL A;  5EOY A;  4A5B A;  5BRE A;  1VQ7 N;  1NGF A;  3I3N A;  3FTU A;  1DEJ A;  4GVE A;  3CVW A;  4IOX A;  4UWK A;  1NP7 A;  5AZI A;  2YI1 A;  2XGM A;  2AXV A;  5G05 J;  5FPD A;  1KXP A;  4ANW A;  5KJM A;  2CGK A;  1RDW X;  3D9P A;  4GZ3 A;  4JAX A;  3M5R A;  3R9A B;  3CST A;  1JCG A;  1GLE G;  3WQT A;  3MGB A;  3RVC A;  3SZ7 A;  2OAN A;  3J8A A;  2E0I A;  4ILJ A;  2IJG X;  2P9P A;  3CVX A;  1XUP O;  2P9L B;  1DKG D;  2XPZ A;  5BW8 C;  4U04 A;  1VQL N;  3A5M C;  5HOO A;  2Y3A A;  2GTD A;  1C0G A;  4I6M A;  4CZE A;  5LOZ A;  4CZK A;  5M1F A; 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