4K43 | Genus

Total Genus 114

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	114
sequence length	370
structure length	360
Chain Sequence	TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structural and biochemical studies of actin in complex with synthetic macrolide tail analogues. pubmed doi rcsb
molecule tags	Contractile protein
molecule keywords	Actin, alpha skeletal muscle
total genus	114
structure length	360
sequence length	370
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2013-04-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00022	Actin	Actin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	4k43A01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	4k43A02
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	4k43A03

4QS9A 5AR0A 1TUUA 4CZHA 2GELA 1QQNA 3AY9A 4WYBA 4H0YB 1GLFO 3MN7A 4FO0A 4C23A 4B1WB 3BP8A 1NBWA 2BUPA 5EX5A 4CD1A 4EAHD 4BRNA 3QDKA 4A62A 4E1JA 2P9UA 3FZLA 4JNEA 3C7NA 4GNIA 3EZWA 4BC5A 5I9EB 1HPMA 1J6ZA 1G99A 1MDUB 2ZWHA 3KVGA 1ZC6A 3KHYA 4B1VA 1WUAA 2HF4A 3H1VX 3UB5A 1C0GA 1GLLO 2W41A 3HZ6A 3VEOA 3ZX0A 1NGJA 5KPZA 3J8AA 1QQMA 2Q97A 3RSEA 1ATSA 3GBTA 3VOVA 4FWKA 4DB3A 2IVOA 4LC9B 1NGAA 4BR0A 1KAZA 4B1ZA 1GLBG 3A8YA 4BVOA 1SQKA 3I33A 2V51B 3TPQA 3AAPA 2A41A 5BR9A 4BR7A 2FSNA 4BC4A 2Q31A 4YDUA 3VETA 2YHWA 3LDNA 1GLJO 4IJNA 4F9OA 1GLAG 3D2EB 4BG9A 3VGLA 2IIRA 2FF6A 3CJBA 2CH6A 1TYQA 1IJJA 2HF3A 2P9PA 1T44A 1SZ2A 3ZX3A 3VEYA 5AQQA 2E88A 3MCPA 3DJCA 1KAXA 5AQTA 3F9MA 4IWVA 5AQXA 4ISFA 5JLFA 4JHDB 3CJAA 1NGBA 4MO4A 4CZJA 1ESVA 3HBTA 3GE1A 4H0OA 5AQPA 3TU5A 4M63C 4FWRA 4XH5A 3WXKA 1T6CA 4M7YA 4BG8A 4BR9A 5BREA 5E26A 4AM7A 5BRFA 3CHWA 3VEZA 3L4IA 3LL3A 2Q0RA 5KQDA 1E4GT 3GG4A 4H0PA 4CZGA 3AARA 5FPNA 5BPLA 5AZIB 1DKGD 2A3ZA 1C0FA 4IJAA 1CZAN 1QZ6A 1ATRA 3D2FB 5CE3A 1NGCA 2GTDA 4MO5A 5EVZA 1Z05A 5JICA 2H3GX 2P9LB 2AA4A 5AQRA 3WT0A 1RDWX 1BG3A 2E20A 4CZEA 2A40A 4BRMA 3LM9A 2D4WA 2A6AA 3EL2A 4BROA 3H46O 3JS6A 3BEXA 3O8MA 2P9NB 2V52B 4BR4A 4FWMA 3EKUA 5EOYA 1HKGA 2YCHA 3KZBA 4Z94A 1BO5O 4JHDA 4H0XB 2UYTA 3ID8A 1NMDA 4J8FA 4GY2B 3A5OC 3CQYA 4H03B 4DHYA 2YI1A 3P4IA 2FF3B 2YJFA 2A5XA 3BF3A 3LM2A 5AQLA 3ZETB 4BRCA 3BUZB 2Q0UA 3UKRA 3WQUA 1YXQA 4BRHA 3LDLA 3QICA 5AQOA 3O5BA 2PBDA 1R59O 1NGDA 5TKYA 4A2BA 4JN4A 3DXKB 3CJCA 4BRIA 3VF4A 1MA9B 3SLCA 3U8XA 3WXIA 4I6MA 2E1YA 2E2QA 4O8KA 5BN8A 1BA1A 1BA0A 2IVNA 3VGMA 1BWFO 4Y0WA 3FZMA 1NM1A 4PKHA 4QS8A 3A5MC 5AFUA 1KXPA 3FFKB 3VEWA 5AQYA 2I7PA 3VPZA 3VENA 4RTFD 3GL1A 4BGAA 5JLHA 2ZF5O 4BREA 1YUWA 3DXMB 3ATVA 1JCEA 1JCGA 3U9ZA 3SMSA 1P8ZA 3WXLA 3UKUB 2CGJA 5JMVA 2QWNA 3WXJA 3ULEB 1U2VB 2HMPA 4FWSA 2V7YA 1K8KA 3H3OB 4K43A 2Q1NA 5AQKA 3LDOA 3CQXA 5BN9A 3GOIA 4CI6A 1BU6O 2CGKA 5AQUA 5LY3A 3FLCO 4H5VA 4XEIA 3ATUA 2VCPA 3M6GA 5LJVA 3LDPA 3VEXA 2WUSA 3W0LA 1E4FT 4BR2A 4NO7A 3DXKA 2NRHA 3CJ9A 2YJEA 3WEEB 4EHTA 3EKSA 2ZGZA 2CGLA 4CJ7A 1QZ5A 2E2PA 1TUYA 1Y64A 3CERA 2VWBA 4XH4A 3U4LA 4H5RA 3S41A 2Q36A 5F1XA 3WUHA 1Z6RA 5AQHA 5KQ8A 2OANA 4BGBA 1OKJA 3QBXA 5BRHA 4B1YB 3IUCA 4FWLA 1HKBA 3MN6A 4BRPA 1NGIA 1RFQA 2E2NA 3GDQA 3IFRA 4FWPA 3ULEA 4BRGA 4DCHA 2PAVA 3H45C 3CJ1A 3L6QA 4EFHA 2QWQA 2FSKA 4FL9A 1HKCA 1T6DA 3QB0A 1GLCG 2P9KB 3JXUA 3CI5A 4WQ5C 4BRQA 1S22A 1S3XA 1IG8A 1KAYA 5FPDA 2A42A 3O4WA 1DEJA 3R6MA 1MWKA 4BQZA 4K41A 2V7ZA 3D2EA 4EHUA 2FLOA 5ADXH 2AP1A 2HOEA 1LOTB 1ATNA 2P9IB 3FE1A 3QFUA 2YHXA 3HSCA 1RGIA 5AQIA 4EIAA 2W40A 5AQWA 1EQYA 4DQ8A 2DPNA 4FWOA 2QWPA 1BUPA 3SK3A 2P9UB 4BRAA 4BRKA 3C7NB 4MLHA 5B8HA 3QMLA 5AFUH 5LJWA 4QS7A 3OHRA 4A2AA 3O08A 4CZLA 4ISEA 4RCHA 4B9QA 3H6EA 1MWMA 2F9WA 3I8BA 2ASOA 2NLXA 5ELZA 5AQNA 1X3NA 3RSEB 1SAZA 2EWSA 5ADXA 2IVPA 4BRDA 1LCUA 2E1ZA 2QWMA 3MK6A 3ENHA 5AZIA 4CZMA 3FZKA 3ZEUB 1HX1A 4CZIA 4H5NA 3MMVA 3M3ZA 4WQ5A 4IXCA 2QWRA 3AAQA 1JCFA 3D2FA 4BRLA 3VF6A 3IDHA 4CBUA 4H5WA 1NWKA 2P9LA 2E8AA 3M1FA 3R9PA 3O80A 4K42A 1QQOA 2QXLA 3H3NO 5AQMA 4BQLA 2NZTA 5KPRA 2P9IA 2P9NA 1TYQB 2GWKA 1X9JA 2P9PB 3CIPA 4CZFA 4O5FA 1WOQA 4PKGA 1NGEA 3MN5A 5BPNA 4AM6A 4CZKA 5AQVA 5KPTA 3FGUA 4FPAA 4WQ4C 1XC3A 1YAGA 4PL8A 3UE5A 3ZETA 2E2OA 3FZHA 2QM1A 4K25A 4IO8A 2GWJA 1DGKN 2J4RA 2GUPA 3MDQA 5FPEA 1NGGA 5F2RA 2D0PA 4HTLA 1ZBSA 4ISGA 3QFPA 2D0OA 4MLEA 3WQTA 4PL7A 1ZXOA 3ZEUA 4PKIA 2QWLA 4JAXA 2F9TA 3VGKA 1NGHA 4M7XA 2YHYA 4H5TA 1BDGA 4BR5A 3FR0A 4BC3A 3VERA 1HJOA 4BRFA 4JD2B 4FOEA 5AZJB 2QWOA 2BTFA 4BVPA 1HUXA 2ASMA 3DWLA 1X3MA 3L0QA 3DXMA 4BC2A 3SJHA 2ZGYA 2P9SB 3SMPA 2KHOA 3DAWA 2Q2RA 4B1XB 3UKUA 1U6ZA 2FSJA 1H1VA 2GEMA 3A5LC 1U2VA 2ASPA 3CETA 4FOIA 4A61A 4WQ4A 5AQZA 5E84A 4B1UB 4FWQA 4FWNA 5F0XA 3G25A 2ITMA 3O1BA 3UKRB 1XUPO 2CH5A 3QBWA 3VESA 3VF2A 3R8EA 3LDQA 3MN9A 5FPMA 3VEVA 1D4XA 3D7EO 4XH1A 4CD3A 4RWTA 2QW9A 3BF1A 3C0BA 4I6MB 3U9DA 3WEEA 5EY4A 3IMXA 1GLEG 1HLUA 3ZX2A 5AQSA 1V4SA 5BPMA 4NB4A 4JD2A 1NLVA 5AZJA 2VYPA 3HI0A 3HM8A 5AQJA 1Q18A 3H1QA 4KBOA 5BRDA 3CJ7A 3W3DA 4L3QA 1BOTO 3O1WA 2P9SA 4FSVA 4H0TB 1QHAA 1XQSC 5AQGA 3B8AX 4FPBA 1YVNA 5EXWA 2D1KA 5AQFA 4CBXA 3FZFA 3O6WA 4H0VB 3HTVA 3EO3A 1GLDG 1K8KB 2P9KA 1NGFA 3A5NC 2FXUA 3A0IX 2I7NA 4CBWA 1V4TA 4IZ9A 4HWIA 3ENOA 3EN9A 4YDUC
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1NJYA 4YY3K 1MU2A 1Q9XA 4FJXA 3BY5A 4CEEA 1SKWA 3CMAN 1GLFO 3HL8A 4OGEA 4X65K 4E7KA 2ZJPL 3VQAA 1EETA 5CR4A 4E1JA 1BQMA 4JNEA 3DYAA 4W5NA 5I9EB 3ITHA 1OH5A 4B9VA 1WSHA 1S1XA 2OZMA 1XMOK 3J7AP 3H1VX 5HRPA 1NK6A 5M1PA 3HZ6A 4O8UA 5CY4A 3T1YK 1REVA 1K73O 5KRSA 2OTLN 3O3GA 3GBTA 4CGFA 2XRIA 2IVOA 3MWTA 4BR0A 3L2VA 3DOLA 4U7BA 3AAPA 4DF8A 2A41A 2YV0X 4JI5K 3SAHA 3HJFA 2YHBA 3VETA 3ISNC 3KLIA 4J2AA 1GLAG 3SUOA 1HYSA 3VGLA 1FXXA 1SZ2A 4M41A 1IV0A 3V1RA 3MCPA 1KAXA 1WSJA 3F9MA 2HNYA 4ISFA 4JEPA 1GOBA 4JHDB 1NGBA 3THWB 1RT7A 1TKTA 4FVMA 4CZJA 3HBTA 4I7FA 5AQPA 3MAQA 3QEWA 2OYQA 1C0TA 4BR9A 5BREA 2XY5A 5E26A 4FZYA 4IBNA 2Q0RA 1E4GT 2IDOA 3GG4A 4OPAA 1OH6A 3ZSQA 5FPNA 1FKOA 3NAEA 3DRSA 2A3ZA 1BQNA 1TV6A 3D45A 4DS4A 3D2FB 2X78A 3EE8A 5CE3A 4JKGA 4FJ9A 5HBMA 4OPJA 4MO5A 3ZT1A 3LP2A 1VSEA 2E20A 2A40A 1N32K 3LM9A 2A6AA 3O4QA 3NE6A 4IEEA 3O8MA 3SI6A 4BE1A 2KKZA 2VWJA 3TR8A 3DM2A 4IOCL 5H1SQ 3KZBA 2YCHA 4Z94A 5M1NA 4LH4A 1YTUA 4F3TA 1S1UA 4OLBA 1VQ7N 2EHGA 3F73A 3SJJA 4DKWA 4H03B 2A5XA 3CXCM 4DV5K 2Q0UA 3SCXA 1Z25A 3C94A 1JLQA 3B6PA 5AQOA 3ZLJA 5E41A 2F7TA 2PBDA 1R59O 4KH4A 1HNXK 4JN4A 3K9KA 2NRRA 3CFOA 3NF8A 3NF7A 4O5BA 4LF5K 3KK7A 3U8XA 4DSFA 1LWCA 1BWFO 4DTXA 1RDCA 4Y0WA 1VAZA 4FJJA 3OYLA 4IFVA 3A5MC 4FJLA 1VQ6N 2XY7A 1RTHA 4KHYA 2PZSA 1TKDA 1YHQN 3GL1A 5I42A 3MX2A 3HK2A 4JV5K 4FLXA 3T19A 3OTOK 3OJSA 3AVBA 4KTWA 3TANA 5JMVA 2HB5A 1IH7A 4E7JA 3H3OB 5AQKA 3VMFB 2G8FA 3DLGA 4FK4A 3ASMA 4F4KA 3HYFA 1IBLK 2PY5A 4JI3K 2CGKA 5LY3A 4H5VA 1T03A 4J2EA 1JL1A 2VCPA 4V19S 3VEXA 4KHUA 3W0LA 4CJWA 2G8UA 3OYEA 4BR2A 3TAPA 3T69A 3DXKA 3CC2N 1YIJN 2E6MA 4JI4K 2RE2A 4EHTA 5J2PA 3QESA 4DSLA 3EKSA 3P38A 4EZ6A 3VA0A 3E66A 4N76A 4JYAK 1QZ5A 1TUYA 1Y64A 3CERA 3QETA 4H5RA 2F96A 4E7IA 2UXCK 3VQDA 1LWEA 4YOUA 3TAMA 4BGBA 5JVGL 2E5LK 3QBXA 3ZT4A 5HRNA 4ELTA 4B1YB 1YI2N 3RTVA 1HKBA 3MN6A 3TTFA 1NGIA 3GDQA 1M90O 1VHXA 3SQ2A 3CCQN 3D6RA 3H45C 1D9DA 3HP9A 4FL9A 2BH1A 1W9HA 2P9KB 4LFCK 3CI5A 1NKEA 4NXNK 3OYCA 4OVLA 4FXDA 4ELVA 5FPDA 4WE1A 3QEPA 2FLOA 4AHVA 1EP4A 3VTHA 3P1GA 3OYFA 1VQNN 1LOTB 3SV4A 1ATNA 3FE1A 4Z0UA 4FLVA 3HSCA 5C10A 1VK0A 4YORA 2W40A 5M1FA 1EQYA 4DQ8A 1VSJA 1Q81O 2DPNA 2RKIA 1WSEA 3K5OA 4BRKA 3C7NB 4MLHA 3THWA 3RMBA 4LF4K 5K14A 4QS7A 1NKCA 4OKKA 2I5JA 4DF4A 3CCEN 3H6EA 3I8BA 3LZIA 5ELZA 1X3NA 1CLQA 4CJSA 4DTUA 2Z1GA 1BIUA 4DMNA 2E6LA 4H4OA 4IG3A 2O4IA 2UXDK 4CZMA 3ZEUB 2O4GA 3CC4N 5GIOA 4IXCA 2QWRA 3AAQA 2GBZA 3D2FA 4LSLA 4DTMA 3V9XA 1QVFM 4CBUA 5FLXO 1JLBA 4H5WA 3ZSZA 5IT9O 3OVNA 3HOSA 1RILA 3EZ5A 5HL7L 1VRTA 3HM9A 1BGXT 1B9FA 1I39A 3WNEA 2P9PB 4B3SK 4NCAA 4KHWA 5AQVA 3ZSXA 3FGUA 3OS0A 3DLLL 4LF9K 3DMJA 4FPAA 4RG8A 1XC3A 1YAGA 1R0AA 1W97L 1ZBFA 4CF9A 1FKPA 4KHPK 2QM1A 4IO9L 1DGKN 2J4RA 1NGGA 5F2RA 4HTLA 1JL2A 3KJVA 1U47A 3E9OA 4HUFA 3QFPA 2D0OA 1XNQK 1RBVA 3CPEA 3LAMA 3ZT3A 4Z4FA 2ATQA 2QWLA 2QEXN 2OPQA 1NGHA 4CIFA 3OA9A 4H5TA 2HBLA 4F8RA 1NJZA 3HP6A 1T8EA 3FR0A 4CF0A 4BRFA 4A59A 2LSNA 1RT1A 4KFBA 5J2NA 2QWOA 3CYGA 1X3MA 4BC2A 3CM6A 4ID5A 3SJHA 4DR3K 2VQFK 2P9SB 3AVIA 3AVCA 2Q2RA 3ZSRA 4LF6K 2QKBA 3OYBA 4DLGA 1N36K 4JK8A 1QVGM 4FOIA 1LV5A 2QKKA 3L2QA 3AGRA 2ZJQL 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1NNEA 3OYIA 4R79A 5SWMA 1WB9A 1ESVA 3CFRA 3CCSN 4FWRA 4XH5A 5FDLA 5JENA 1T6CA 4M7YA 3E9LA 3HT3A 4YOXA 3CHWA 3HPHA 3CG7A 3L4IA 3LL3A 4DR7K 1DTTA 4CZGA 4WF9L 5AZIB 1EO1A 3LWLA 1CZAN 1RBUA 1ATRA 4GV6A 3VQ5A 1VSLA 5EVZA 3DLKA 3ULDA 4Z4HA 2H3GX 5KTQA 2AA4A 3C6TA 4JKAA 4DLEA 3SAGA 3KLHA 3RRHA 2D4WA 2VWKA 4B9UA 3EL2A 4OX9K 4IG0A 2P9NB 1BL3A 2HMIA 4QOZB 3AVGA 4GMJB 4PQUA 1JXEA 3KD5E 1BO5O 1NMDA 1BCOA 2RHKA 2YI1A 1OVQA 4FJKA 2YJFA 1LW0A 3BZCA 4BRCA 5M1KA 3BUZB 3UKRA 3WQUA 5T7BA 4CFDA 1YXQA 3IRXA 4BRHA 4B9SA 3C6UA 4NXMK 1XHZA 1NGDA 3DXKB 3CJCA 3SLCA 4DR1K 4DWIA 1KVCA 2E1YA 3OYHA 2E2QA 4O8KA 4AILC 3MEDA 4FYDA 1BA1A 2F8SA 3VGMA 4DUYK 4PKHA 4KHQA 1KXPA 1KSPA 4WFAL 1P90A 4NLCA 1ASWA 1J5EK 3R3LA 4BGAA 5JLHA 2IGIA 3ATVA 4H4MA 1JCEA 1JCGA 4K8XA 3PX6A 4CJFA 2BDPA 3I8DA 3S3MA 3VQ6A 4C8NA 1U2VB 1XMQK 3NBPA 2OA8A 3V4IA 4BDPA 1K8KA 4K43A 1ASUA 1Q86O 4CI6A 2F8TA 4HCBA 2HHSA 4TSXA 4XEIA 3VQ8A 3C95A 1X9MA 1TAQA 2Z1IA 4KPYA 4I2PA 2NRHA 3CJ9A 4DSEA 3O9TA 3J7ZO 4BE2A 3LANA 3OYMA 2YHAA 1J5OA 1TK5A 1C1AA 2HHTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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