4L17A

Glua2-l483y-a665c ligand-binding domain in complex with the antagonist dnqx
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKICVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A conformational intermediate in glutamate receptor activation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 77
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence C, E, G
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-06-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4l17A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4l17A02
2QMXA 5ICTA 5FHNA 2ZNSA 4HTGA 4KD5A 4EF1A 4H5GA 3ZKLA 3CG3A 3T22A 2REGA 4EQBA 5JEIA 1IITA 1HSJA 1QW0A 1ZKBA 3H6TA 2THIA 4NEDA 1B3LA 3VE1B 4YMAA 3GZGA 4PFUA 3V5AA 2NXOA 4KQPA 2QPQA 1N3XA 3C36A 1NMUA 4YKJA 3TTNA 4LQ2A 3OEMA 3HO7A 5ELVA 1MM7A 1XVYA 2G93A 3TYHA 3PUXE 4M4GA 4GFRA 3OEKA 4RPNA 1P1QA 2CZLA 3EHTA 1B58A 3ZS6A 4ZEKA 1Y4TA 3IO6A 1SYHA 4GXSB 1D3KA 2ESNA 2ZYNA 4OFLA 5AA2D 4KCDA 1ZBMA 2HAUA 4JDFA 4ZEIA 3K1NA 4WEDA 2I0BA 4TOZA 3TAJA 1LLSA 2PT1A 4IO2A 4F18A 2XXYA 3A3UA 5DVJA 4QRZA 1SI1A 4FE8A 4EDPA 1WDNA 1B7ZA 2R71A 3PMWA 3CG1A 1PB9A 3EF7A 2HZKA 3U92A 1B40A 3C4MA 5H8FB 4QSDA 4IO4A 1WODA 3C9HA 1FQFA 2F35A 1URSA 3DP4A 3PU5A 1OIBA 3HHGA 4R73A 1TXFA 3H7MA 4MLVA 1TT1A 3SEXA 2Q8JA 4G8HA 2M8CA 1DOTA 1AMFA 1B1HA 1IXGA 2F7AA 5BUUA 5H8FA 4ZE9A 4GWOA 3M3KA 2QL3A 3CRBA 3L6HA 2O7IA 2OJTA 3C34A 2VD2A 1MDQA 3RLFE 4GRKA 2XXUA 3M8UA 3PGFA 2QS3A 4POWA 4NE4A 3FVKA 2XXWA 4HCWA 3LC8A 1N7WA 4ZE8A 3K01A 2XD3A 3CVGA 3GXAA 1B1XA 2GH9A 3A09A 3IR1A 1N7XA 4YICA 2YJPA 3MZBA 4I62A 4JB7A 4WKMA 1I6QA 1N0TA 1PB7A 2Z23A 3FD3A 2GRVA 3QUFA 4Z7EA 5FHMA 3FUZA 1MY2A 3PD8A 1Y3QA 4OZ9A 3EHUA 2I0CA 3IB0A 2OCUA 4N6PA 4QFPA 1URDA 4GVOA 4BDLA 4R2FA 3G3GA 2F97A 4KYEA 2QJEA 5I59B 3FVGA 4OEVA 2I49A 2DSFA 1O63A 3RY3A 2I3WA 2XXTA 3TZAA 5I84A 2DOJA 1YPNA 1VSOA 2OWSA 2DS9A 2QS4A 2VOZA 1JW4A 2PMSA 2XX7A 4LP2B 4G8NA 3R7XA 3O66A 3PV0E 2DXRA 4XTCQ 1QULA 2QMWA 4ZECA 3MC2A 4GL0A 5I59A 2RKMA 4P0IA 1HSEA 3C35A 3K6UA 4ZDMA 3T96B 4XIGQ 1P1OA 3S9LC 1M5DA 2REJA 1Z7ME 2NUVA 1FTOA 1LCFA 3T9UA 3H3GA 3KOSA 5KDTB 2O1MA 1M5BA 2RC7A 2FA7A 1FTMA 1IXHA 1FTKA 2RC9A 1MPDA 4DE8A 1GVCA 2XXVA 1MRPA 3FXRA 3OO7A 3CI8A 4FORA 3G3IA 4O3CA 3KEIA 3MVYA 2DQVA 3K6XA 1Y4CA 3PMVA 5B7DA 4TLLB 4RA1A 3S2VA 2XXQA 5KDTA 4Q8RA 1OMPA 3B6QA 1NL5A 1SW2A 2XX8A 4H1XA 1UTHB 2D5WA 3ODBA 3MZ9A 2AL4A 4BDMA 4QF9A 1Y3PA 4C0RA 1JETA 5H8HB 5HBCA 5F1QA 2QS2A 4DDDA 1BKAA 3N6TA 1NNTA 1POY1 1Q1KA 3ZSFA 5CMMA 3U8QA 2F78A 1QUIA 4AQ4A 1NH8A 1JW5A 1LFHA 2Y7PA 1N04A 3EHSA 4YAHX 4LUBA 1B2HA 4IO5A 2O68A 1JW1A 4LONB 1UTHA 1UTBB 1MXUA 4POXA 3R6UA 5H8HA 4XKNA 1HSLA 3PUVE 4RPOA 1QVSA 1MXYA 3OO8A 4NF6B 3FV1A 5DEXB 4ZEDA 2ZYOA 3LR1A 3IAZA 3FV2A 1A8FA 3FJ7A 2PT2A 2DXYA 1ZLQA 2GFEA 4F2OA 2XXXA 4EUOA 3TUSA 3UIFA 1IQ7A 4R72A 3TCGA 1TFDA 2HEUA 4LATA 4OENA 5F7VA 1MQHA 1JVYA 4ESXA 1Y1ZA 2YPNA 4F31B 1TWYA 1LFGA 2ONSA 2A5SA 5DYHA 1UTBA 3RGYA 3V89B 4E0XA 1R9QA 1EU8A 4ELPA 1FQAA 1H45A 4PP0A 4NF6A 4OXVA 3QXMA 1D9YA 5DEXA 1P1WA 1ZIUA 4KI0E 2XHDA 4ISUA 3O6HA 3OSQA 5JK4A 4PETA 2QS1A 3MP1A 3T93B 2ZYKA 3N5LA 4LZ7A 3Q27A 1ZMGA 1EZ9A 1A7LA 4IO3A 3C31A 4QFNA 3UORA 4R74A 2O7UA 4OFJA 4X1DA 4FEBA 2XXHA 2X26A 1JEVA 3IORA 2I4BA 2XXRA 2RCBA 4MBPA 4U23A 3USDA 2OLBA 4MFIA 4OHNA 1SW1A 1MY3A 2ZNTA 5B70A 5FHOA 1ZTYA 2DVZA 2F8DA 4U4SA 1L5TA 2O84X 1NKXA 4NTLA 5K2XA 2Y7RA 3I3VA 5CM6A 5DTBA 3K6WA 1SD3A 1O7TA 4QSCA 1I69A 4F1YA 2B65A 2VD3A 1JVXA 1LB8A 3PUWE 1QKBA 4ELRA 1P99A 1MY1A 1IUDA 3IO4A 4QSEA 4X9TA 3AXFA 3MP6A 2ZXTA 3KJ7A 1MXXA 2O1LA 2RINA 3I5OA 3TPAA 1SI0A 3PPRA 4JXIA 3VLVA 4YKKA 2FYIA 3B6TA 3D4CA 2AIXA 3PPOA 2Z8FA 2P2AA 5IKBA 3O6GA 4DCXA 5I57B 1CE2A 2O6AA 4I8CA 3KN8A 3U1OA 3SEUA 1MH3A 3ILTB 3JZJA 2B3FA 1MQGA 4LVQA 1MQDA 2DE3A 4KYDA 4QFOA 2ANJA 2Y7WA 3QUJA 3G7WA 2PBWA 4PFYA 4IB2A 5I58B 4F22A 4Q30B 3MJNA 3OSRA 4F2QA 4YKIA 1DTGA 3THIA 3LSFB 1A55A 2OK2A 5I57A 3K2DA 1AOVA 5AE4A 3O97A 4JWOA 3T9HB 1N76A 4F3PA 3PPPA 3BKIB 1A40A 3KSXA 1MY4A 1MM6A 2D3IA 3CFLA 1MXWA 4F1VA 4E0WA 2DP8A 4PE5B 1OLAA 3LSLA 5I58A 1RKMA 1B7HA 2NWJA 4GF8A 4RK9A 3LBSA 4OWDA 1ATGA 3DLNA 2UYEA 1B9JA 4OVJA 2H4IA 5DVFA 2O69A 2I6EA 1N3WA 4F19A 1B32A 3SEVA 1D9VA 1PBPA 2V3QA 2RCAA 1A8EA 4MH5A 2I3VA 3MBPA 1QKAA 5CBSA 1H76A 1POTA 2Z8DA 4ELQA 3QIMA 5J1DA 4LA9A 4NMYA 1SW5A 4IY5A 1IEJA 1UIVA 1XVXA 3G3KA 2HAVA 2F6GA 2V93A 1Z7NE 5BWJA 1XT8A 3G3HA 1GGGA 3W15C 4RXLA 1ELJA 5TU0A 3ILUB 2HZLA 2F7BA 3HV1A 3TTKA 4GIZA 2DE2A 3U93A 4UACA 3N6UA 4R2BA 3A3CA 1DPEA 4ZZAA 3VXBA 4H5FA 3EPEA 1LCTA 4H6DA 4NWCA 2E1SA 2AYSA 4NWDA 3SETA 2FNCA 5AA4B 2ONKE 4R75A 4G8MA 2I58A 3BBRA 1B3HA 4XKRA 4I9DA 3H6UA 2G29A 4KFQA 4MF3A 1B05A 5CMCA 5I56B 1MPCA 1PBQA 4M1VA 1B3GA 1PB8A 4H65A 3VLUA 2A5TB 3KBRA 4GD5A 4IGRA 4JBZA 2XX9A 3K6VA 3KZGA 5CRYA 4FECA 3MW0A 3RT6B 3MZ1A 2WKYA 5I2KB 1EZOA 1SQYA 4EXKA 3MPKA 4EXLA 3K02A 3D4GA 5AA4A 5FTIA 3EQ1A 4F3SA 3MVXA 1ZU0A 2ZMBA 5TPAB 1NFTA 4IGTA 1B7UA 5AA3A 5I56A 2DWAA 3WAEA 2I4CA 3SEWA 2A5TA 4IO6A 4OEUA 3C32A 1IIWA 2H99A 5I2KA 1OQGA 4MLQA 3IK6B 3VVFA 3SERA 2VP1A 2V84A 3VFJA 3FVNA 5ITOA 2Y7IA 3U72A 5H8QB 3I6VA 1NNPA 3RTFB 3LSWA 4EQ7A 3MWBA 3IB2A 2H9BA 5TPAA 4OMBA 3JYRA 1AIVA 4X1BA 1LAXA 4TLMB 5AA1A 3MQ9A 3OO6A 2DVCA 3KGCA 4H8JA 2H98A 3CSGA 1I6AA 4RNSA 1H3DA 3IOWA 2F6PA 4U22A 2PYYA 1ANFA 3O9PA 1FQCA 3RPWA 4RK2A 3F11A 1B51A 3IB1A 3CFXA 1Y9UA 4DZ1A 3G3FA 4FEDA 4ELOA 5H8QA 1XOCA 4DXBA 4ND9A 1VR5A 1EH3A 4G2ZA 1OVTA 2IEEA 2Z8EA 1OLCA 3MPLA 5TP9B 4JWYA 3HN0A 4ZS9A 1OVBA 3R26A 4DIGA 1R9LA 4KPTA 3QSLA 4R9GA 3IX1A 4JSDA 1T0KA 3H6VA 4N07A 4RYAA 2KLFA 2OBGA 5HM4B 3M3LA 3ZKKA 4F3BA 2GHBA 2X7PA 1M5EA 1UIUA 2I48A 1LAGE 1B6HA 1DSNA 5TP9A 3V8XB 3IJOB 3IOTA 4YKPA 2Y7KA 3VVEA 4U21A 1D4NA 2ZYMA 4IO7A 3IOUA 4WEPA 3HPIA 3O29A 4K3FA 1N84A 1FTJA 2GHAA 3K1PA 1LAHE 4BLAA 5AA2B 1BIYA 3VXCA 1SBPA 3QAXA 2HFBA 3TTRA 4U1ZA 3TDJA 3KN7A 3E4RA 4KHZE 4L17A 4HS7A 4NF8B 1NNKA 4F1UA 3S9EA 3KG2A 3HCQA 2VHAA 4G68B 3M3FA 1B4ZA 1M5FA 4ZEFA 1Y1MA 3TFLA 1Y3NA 2XXPA 3DP8A 4O3AA 3UP9A 1Y20A 3H4ZA 5CMKA 1AH5A 5AA2A 4KR5A 2QRYA 5ISUA 3T9XB 3ONMA 3TTMA 1BP5A 5L8DA 1B5HA 1Q35A 4H8IA 4NF8A 5DVIA 3GLBA 3RTWB 1R6ZA 1SDXA 3MVWA 4G68A 1LBBA 3OMBA 3RN8A 2H5YA 3ECRA 3OOAA 3H03A 4UA8A 2DWHA 1YAEA 3FVOA 1IXCA 4WXJA 3DM0A 2NOOA 3K4UA 4NF5B 2D21A 1SYIA 1VFEA 2Z22A 5JTYB 1I6BA 3OENA 1MPBA 2ALUA 1II5A 3W9WA 1DMBA 4H67A 4XXUA 1RYXA 3TODA 1M5CA 1ZJLA 2R6GE 1VE4A 4QHQA 2V3UA 2OWTA 1AL3A 3O28A 4BDOA 3L6GA 3K00A 3TTLA 2DWIA 1XC1A 4XKQA 3Q28A 1CB6A 4NF5A 5L9SA 5JTYA 3TCFA 1B3FA 2UVIA 5A5XB 4G77A 3E9XA 1B46A 2P1SA 3U94A 2DE4A 5M2VA 1FCKA 1B5IA 1US5A 4BDRA 3B6WA 2DWJA 3DELB 2HCAA 2Q2CA 2F36A 3FXUA 2B3BA 2O51A 1JEUA 2R9JA 3PMXA 2F7CA 5K2YA 2AL5A 1DPPA 4H0WA 2RC8A 1SVXB 3IL1B 4BDNA 3SEYA 5A5XA 3S9MC 3RT8A 5FTHA 2XXIA 4OTEA 1NH7A 2BJJX 4NF4B 1IZ1A 1MXZA 4HCYA 3FZVA 4DXCA 1KWHA 4EQ9A 1JNFA 3N94A 2RF1A 4PQJA 1YCJA 1MQIA 3VV5A 2UVJA 3HHFA 3UA8A 3E13X 3LUYA 1URGA 1S7YA 5LOMA 4P0GA 5IAIA 1DTZA 4U2RA 4C1TA 4ZZEA 4NF4A 5H8SA 3CSBA 4THIA 5EYFA 3T66A 1GR2A 1LAFE 4I1DA 4QFKA 3PUZE 4X48A 4TQUQ 4ESWA 3P7IA 4YB6A 1EZPA 4LZ5A 4OQOA 4XKPA 1LFIA 1LSTA 4JSOA 1SW4A 5CMBA 4YU0A 1PC3A 2HQ0A 2UVHA 3JV9A 1QJMA 3KOTA 4F3GA 3TEPA 4QFLA 1B0LA 3H6WA 4KCCA 3MP8A 3TMGA 3E3KA 4ZEBA 4ECFA 2Q2AA 2LAOA 2VGQA 4R6HA 3OXNA 3VVDA 1RYOA 1LBCA 3FJGA 3PUYE 1MQJA 1MXVA 3FGSA 4AB6A 1FQEA 4Q5TA 4R9FA 3KJTA 1QUKA 1B4HA 2Q89A 4G68C 4OFOA 3W9VA 4GL8A 1B3EA 4YB5A 1USYE 3IJXB 3T9VA 1IXIA 5H8NB 1A99A 4G4PA 2V25A 5ITPA 4GOTA 1P1NA 4IY6A 2Q9TA 2YLNA 1MH4A 3TQWA 3RUMA 3PD9A 4GQOA 4DLDA 4Z0IA 5L9OA 4OERA 3PPQA 4AB5A 2UVGA 3SKPA 2UYFA 2OZZA 5ICQA 2F34A 4DCYA 3FXQA 4RY1A 2UXAA 1FQBA 1B52A 3CFZA 3QK6A 5L9MA 4DXUA 1B0HA 3Q26A 3VLWA 3S4UA 4KYSA 3RQTA 5H8NA 4R6KA 3KN3A 5HPQA 3DP6A 3TQLA 1US4A 1XS5A 4PFWA 3OO9A 3GBAA 3SDFA 2P0SA 3TCHA 2DYXA 3FJMA 3CR9A 5EHSA 2HXWA 2V3TA 1PEBA 2ZNUA 1LGBC 3V83A 4LQ5A 4OYVA 4OESA 1MG1A 1JQFA 5CC2A 3QYTA 3KSJA 3MUQA 4F39A 3Q29A 4U4XA 1USYH 2Y84A 2PX1A 2Q88A 4N13A 3UN6A 1MDP1 4BDQA 1F9BA 1UQWA 3UK4A 5KZTA 5EHMA 4R6YA 3H06B 1BLFA 4U1OA 4GLIA 2QSXA 1P1UA 4LZ8A 4FIMA 5KCJB 5DT6A 1O64A 3C33A 3IOVA 3FATA 3EN3A 1OQHA 4FATA 2F5XA 2CMOA 3PPNA 3Q25A 1TFAA 1MS7A 1J1NA 3FIRA 4JWXA 4FAJA 4F29A 3B7DA 1WVJA 4OETA 3N26A 4YMBA 1PDAA 3BFTA 1B5JA 1FTLA 3BFUA 1YTVA 1FW0A 4O3BA 2NVUB 5I2NB 1XHYA 3CIJA 4EF2A 4ONYA 3VDFA 3LSXA 2ABHA 3K1MA 2H25A 5KCJA 3MVZA 3SESA 3UGWA 3HSTA 3G3JA 3K0VA 1LB9A 1FQDA 5CI5A 3KFMA 3OD7A 3FASA 3O2AA 1A54A 1BTJA 4YB7A 1H44A 3RNNA 1S9TA 3OELA 4P11A 3O6IA 1QUJA 3GBBA 1MY0A 3TELA 2E0SA 3MAMA 1R1NA 4HW8A 1GTKA 1NNFA 4PFTA 5CBRA 4RJZA 5I2NA 4Q0CA 4GXAA 2PVUA 3S9NC 4C1UA 1S50A 1VFDA 3WAFA 1H43A 2IA4A 4YZZA 3TKDA 1GV8A 2ONRA 2X7QA 2W7YA 2XD2A 4FJPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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