4LVQA

Crystal structure of the m. tuberculosis phosphate binding protein psts3
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
319
structure length
319
Chain Sequence
TLKASGSTAQANAMTRFVNVFEQACPGQTLNYTANGSGAGISEFNGNQTDFGGSDVPLSKDEAAAAQRRCGSPAWNLPVVFGPIAVTYNLNSVSSLNLDGPTLAKIFNGSITQWNNPAIQALNRDFTLPGERIHVVFRSDESGTTDNFQRYLQAASNGAWGKGAGKSFQGGVGEGARGNDGTSAAAKNTPGSITYNEWSFAQAQHLTMANIVTSAGGDPVAITIDSVGQTIAGATISGVGNDLVLDTDSFYRPKRPGSYPIVLATYEIVCSKYPDSQVGTAVKAFLQSTIGAGQSGLGDNGYIPIPDEFKSRLSTAVNA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of the Mycobacterium tuberculosis phosphate binding protein PstS3.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords Phosphate-binding protein PstS 3
total genus 96
structure length 319
sequence length 319
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF12849 PBP_like_2 PBP superfamily domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lvqA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lvqA02
4G68B 3RPWA 4KYEA 2XXXA 5HBCA 3A3CA 4EXLA 4BDMA 3K6XA 4HS7A 4OESA 4PE5B 1H45A 3TTMA 1MXZA 1JVXA 1RKMA 2RKMA 3WAFA 1FQAA 3IOUA 1MH3A 1UTBA 4LATA 4Q5TA 4YKIA 3O2AA 1B0LA 4KPTA 3G3KA 2B65A 2O1MA 4OENA 3PPRA 1Y3NA 1XHYA 4HCYA 2DXYA 4OETA 5LOMA 2ZNTA 5I58A 1PB7A 1LLSA 5B70A 1B05A 3OMBA 1QUKA 5DVJA 1ZMGA 2DYXA 1O63A 3RN8A 2DWJA 3S4UA 5AA4B 4X1BA 1B7ZA 3JYRA 2W7YA 3ILTB 2VD3A 1B7HA 4GOTA 2O84X 2H98A 3SKPA 1AMFA 1B5IA 3B6QA 1IEJA 5H8HB 1FTLA 3VVDA 3G7WA 3RT6B 2H99A 2XX7A 3MBPA 2B3FA 1B4HA 2QS3A 2F6GA 3U92A 1MQHA 3MWBA 4KQPA 1LFIA 3GBAA 1TT1A 1I6AA 3OSQA 3TZAA 4P0IA 2REJA 2QS1A 5FHNA 1MM7A 2V3TA 4WXJA 2QMWA 4KFQA 3TAJA 2I3VA 1UTBB 1XS5A 4I62A 4H5GA 3KOSA 4RPOA 1IUDA 4WEDA 1NFTA 3FVOA 3PUYE 5DEXA 3CFXA 4TQUQ 4PP0A 5I58B 4HW8A 1MXXA 1P1QA 1Z7ME 2YPNA 4R72A 2Y7WA 4YICA 3HV1A 3OO9A 1IXCA 1LAXA 4PETA 4F29A 4RA1A 1ANFA 1MY3A 1PBPA 4YMBA 4DDDA 2ZNUA 3O6IA 5I2NA 1FW0A 5AA2D 5K2YA 3OO6A 1B7UA 2HAUA 4R6YA 4MH5A 3Q28A 1OIBA 1SYHA 4N6PA 2DWAA 3LSWA 5CBRA 1UQWA 2YLNA 4RPNA 3OOAA 5ITOA 1MXUA 3VXCA 2PT2A 5I2KA 4F19A 3V83A 1B3FA 1B2HA 2THIA 5EHMA 2DXRA 1JQFA 4KD5A 1Y4TA 4GL8A 4POXA 2Z23A 3SEYA 1FQDA 3W9WA 5M2VA 1D9YA 3CFZA 3KZGA 1N7XA 3IJXB 3UIFA 4ELQA 2XXIA 3W9VA 3DLNA 1B4ZA 1GTKA 3JV9A 1JEVA 4NF5A 3HHGA 4IY5A 4ZS9A 2HAVA 4ELRA 1H3DA 2XXUA 2XXYA 5TPAA 5I2NB 1JETA 1MH4A 5AA2A 3LSXA 1ATGA 3MPKA 3TUSA 1IXIA 1NKXA 3EF7A 3MZ9A 2DVZA 4MLVA 1RYXA 2KLFA 4G2ZA 1LGBC 4OMBA 5FTHA 4NF8A 3FXQA 1J1NA 5I2KB 1QULA 4F3PA 2D5WA 1TFAA 2I6EA 1PBQA 3QXMA 2O1LA 1A8FA 4DXCA 1AL3A 1ZIUA 3CG1A 1US5A 3AXFA 3M3KA 3Q27A 3H4ZA 2QS2A 2Y7PA 3V89B 1OQGA 1QKBA 2F5XA 3CFLA 3TCFA 1M5CA 3O29A 3IOWA 1JEUA 2ALUA 3TTNA 1JW4A 3RT8A 2GFEA 4U4XA 1VR5A 1N04A 4KYSA 3EPEA 4I9DA 1OQHA 1UIUA 3GBBA 4NF5B 1H43A 3T9HB 3LBSA 4C0RA 4GVOA 1USYH 1L5TA 4R73A 3GZGA 3O9PA 5F1QA 3IORA 1P1WA 1LB8A 5TPAB 3G3JA 4X48A 3Q29A 2NUVA 5AA2B 3O6GA 2X26A 4YB5A 3TTLA 2X7QA 4HCWA 1HSEA 3I3VA 3RTWB 2DE2A 4FJPA 1DTZA 4NF8B 3TCHA 1XT8A 2FA7A 4WEPA 1OVTA 4LA9A 2RC8A 3UORA 5FHOA 4ECFA 1EH3A 4IY6A 4XKPA 4JWYA 3V5AA 1MPCA 3VXBA 4BLAA 1B0HA 1LCFA 4RY1A 3IL1B 1FQBA 2PT1A 1FTKA 1H44A 1MPDA 1IXGA 1Y1MA 2A5SA 2PMSA 1IITA 1B6HA 2Q2CA 4DLDA 1DPEA 4QHQA 3FIRA 3K2DA 2OCUA 3KJTA 1SW2A 1LCTA 3K6UA 4ZDMA 2IA4A 3TQLA 3CVGA 4RK9A 4F3BA 3M8UA 2DWIA 4F2QA 2O51A 1IIWA 1WDNA 4ZE9A 3A09A 2ZXTA 2ZYNA 3C31A 2FNCA 1ELJA 2I4CA 1II5A 2OWSA 2QSXA 3MZ1A 4F3SA 3UK4A 4OEVA 5H8NA 2ONKE 2F7CA 4I8CA 5J1DA 1B3HA 3PPNA 2NVUB 1PC3A 5EHSA 3EHUA 3IOVA 4JB7A 3KOTA 2ZYKA 3KGCA 1NL5A 4R9GA 2XXPA 2F97A 5FHMA 4LONB 5AA3A 4AB6A 2A5TB 3CI8A 4G8MA 3IJOB 3QK6A 3M3LA 4GWOA 2DSFA 4RK2A 1QKAA 3QUFA 3H6WA 4MFIA 2I0BA 4JSOA 1ZLQA 4LUBA 2NOOA 1MQDA 3PU5A 2B3BA 4ONYA 3B7DA 4BDLA 4LQ5A 3PD9A 1Q1KA 2LAOA 3B6TA 2Z8FA 3IB1A 4R6HA 3KFMA 5ELVA 3U1OA 4Z7EA 3S9NC 4AB5A 3LSLA 2V93A 4LQ2A 2XXTA 4QFKA 3T9XB 3PMWA 3LSFB 4GQOA 4EUOA 2Y84A 3PMXA 3F11A 2XD3A 2XXHA 2H25A 4LZ8A 3S2VA 5AA1A 2O6AA 2R71A 3A3UA 1SQYA 4FIMA 5I56A 2VOZA 3E13X 4KI0E 1OVBA 1Z7NE 5H8NB 3TEPA 5FTIA 5KCJA 4X1DA 2F34A 4R6KA 2F78A 4GF8A 2CMOA 4F22A 2RCAA 1XC1A 2DVCA 2DOJA 4GRKA 4H67A 2UVGA 3E9XA 3Q26A 2QS4A 4LP2B 3M3FA 4FATA 4GXSB 2V3QA 4EQ7A 4QFPA 1VSOA 4OVJA 2VP1A 2Q9TA 3Q25A 4U23A 2I0CA 5CBSA 5EYFA 4JDFA 1SBPA 1LB9A 1NNTA 3VLWA 3I5OA 4FEDA 1YCJA 5CI5A 5CM6A 4IO5A 3FD3A 4PFWA 1B51A 3IO4A 2OWTA 1FQEA 3K4UA 4IB2A 3MZBA 1FTMA 3RLFE 1P1OA 3K6WA 3U93A 1YAEA 3C33A 4TLLB 1H76A 5DVIA 1MY0A 1USYE 2RINA 3BBRA 3UN6A 3H7MA 4MF3A 3KEIA 4KCDA 4E0WA 4R9FA 2QMXA 3ZKKA 5L9OA 1GV8A 3SETA 5I56B 2I4BA 5TP9A 4O3BA 2XXQA 2AL4A 5KCJB 3OEKA 2E0SA 3RY3A 4DIGA 1VE4A 3T93B 2REGA 1MPBA 3N26A 3MQ9A 3N6UA 3OD7A 3EQ1A 2Y7KA 4QSEA 4EF1A 2H5YA 2HZLA 1XVYA 2X7PA 3T22A 2HCAA 4RYAA 3W15C 3PUXE 2XX9A 2HZKA 3DP6A 4C1TA 1N84A 5I57A 3PUZE 2UVJA 1SD3A 1SW4A 1IQ7A 4QRZA 3E3KA 1VFEA 1PB8A 3N6TA 4OFLA 4XKQA 2GRVA 2PBWA 3R6UA 2RC7A 3SERA 2Q88A 1MY1A 5CMMA 3JZJA 3PD8A 1MRPA 1B40A 5TP9B 3MP1A 2V25A 1POY1 3OEMA 3G3IA 4ZZEA 5K2XA 2GH9A 2ZYMA 3VVEA 3O28A 1D4NA 3KN7A 3QUJA 5HPQA 1YPNA 4FE8A 4NEDA 3FATA 2O7UA 2NWJA 1XOCA 1QJMA 2XD2A 3CR9A 2UVHA 4NTLA 4THIA 3RGYA 5CMCA 2ZNSA 3SESA 4WKMA 3I6VA 5ICTA 4IGTA 3LR1A 5CMKA 2OK2A 3MUQA 4N13A 4XIGQ 3K1NA 2I49A 4POWA 5JEIA 3CG3A 1LSTA 3C36A 2I58A 4ZEDA 3VFJA 3DP4A 3PPOA 3TTKA 3P7IA 4RNSA 1I6QA 2ZMBA 4OWDA 4NF4B 4GL0A 5I57B 3PPQA 3FVNA 4H1XA 4LZ7A 2H4IA 3DM0A 4YB6A 4YU0A 4U1OA 3MPLA 3UA8A 2O68A 2G93A 4ZECA 1M5BA 4U22A 5ISUA 1A8EA 3KN3A 4BDNA 3ZSFA 5CMBA 5BWJA 3B6WA 1BTJA 3C9HA 3O6HA 4JWXA 3MJNA 1MY2A 2QJEA 2IEEA 3HCQA 4MLQA 4OYVA 1LAFE 3HSTA 1DPPA 1FCKA 2DE3A 1NH7A 5L8DA 4F1VA 3KSXA 3S9EA 2Y7RA 3T9UA 4ESXA 3K02A 4GXAA 1PB9A 1HSJA 1MM6A 4I1DA 4GIZA 1ZJLA 3K0VA 1BP5A 3OELA 1B3GA 2AIXA 5I59A 1Q35A 1CB6A 3MVZA 2A5TA 4OZ9A 2CZLA 3K6VA 1JNFA 4KCCA 3FASA 3IOTA 4M4GA 1R6ZA 1EZ9A 4DCYA 3EHSA 4XTCQ 2HFBA 4ELOA 1PDAA 4H6DA 3FXUA 1B46A 1FTJA 4QFOA 1Y3QA 1ZBMA 3SEVA 5HM4B 4BDRA 1N0TA 4R2BA 3FZVA 3KBRA 2XHDA 1AIVA 1B3EA 4YKKA 3MP8A 2H9BA 4ZEBA 4F39A 3OENA 2HEUA 1QUJA 4IO3A 4E0XA 3VVFA 4F1YA 1MG1A 2RF1A 4ZE8A 1D9VA 4Q8RA 3SEUA 4ZEKA 4U4SA 3PPPA 3MVWA 3IO6A 3RNNA 4R74A 3IK6B 4OTEA 1SI1A 1QW0A 1S50A 4EQBA 1S9TA 1NNPA 2QPQA 4U1ZA 1SYIA 1JVYA 5DT6A 3H3GA 3K1PA 5I59B 4EDPA 5H8FA 4JBZA 1AH5A 1O7TA 3VLUA 5L9SA 2OJTA 2D3IA 1N76A 4QSCA 1XVXA 1Y9UA 2XXRA 3LUYA 4ESWA 3G3GA 5H8SA 3HHFA 5L9MA 2R6GE 3TELA 1QUIA 1B52A 3BKIB 1R9LA 1TFDA 4Z0IA 5JK4A 2ONSA 1WODA 4ELPA 2ESNA 3UGWA 3R26A 3TODA 3RQTA 2ONRA 3ECRA 3PUWE 4IGRA 3TTRA 2I3WA 4NF6A 1YTVA 3QSLA 1BIYA 1ZKBA 3FGSA 1LFHA 1GR2A 3K00A 4BDOA 4KHZE 4NE4A 3QIMA 4C1UA 4YKPA 3CRBA 3T96B 1A7LA 2RC9A 4UACA 4XKRA 3EHTA 4G8NA 1EU8A 3V8XB 1VFDA 2AYSA 3ONMA 4FORA 1DSNA 1MY4A 5H8FB 3G3HA 4GFRA 4OQOA 4GLIA 3ZKLA 4YAHX 1RYOA 2D21A 1OLAA 3FUZA 4QSDA 3H6TA 5ICQA 3C35A 5DVFA 4PFTA 4TLMB 3G3FA 3IX1A 1MXWA 3FVKA 2XX8A 3SEWA 3UP9A 3MAMA 4H0WA 1FTOA 1GGGA 1QVSA 3C32A 3OO7A 4IO6A 3TDJA 2VHAA 2YJPA 1N3WA 4F2OA 1HSLA 4EQ9A 5H8QA 3T9VA 4P0GA 4NF6B 3TFLA 1MQJA 5BUUA 2Q8JA 3H03A 4YZZA 2FYIA 1Y1ZA 3U72A 3RTFB 1B32A 2F7AA 3EN3A 3TPAA 2VD2A 2F7BA 3OO8A 3C34A 4ZEFA 3N5LA 1Y4CA 1FQCA 3CSBA 3VE1B 4AQ4A 4U21A 1GVCA 4XXUA 1O64A 5CC2A 2M8CA 4N07A 5IKBA 2Z8DA 1A54A 3GXAA 2RCBA 2Z22A 3FV2A 2DWHA 3IB0A 2F35A 4G77A 3O97A 1OLCA 1D3KA 4U2RA 3H6UA 4NWDA 3TCGA 5KDTA 1NNKA 4NWCA 4YKJA 4G4PA 1UTHA 2Q2AA 4P11A 4YMAA 2F36A 1SI0A 1MQIA 4X9TA 4OHNA 4ISUA 1BLFA 3HPIA 3U8QA 3QAXA 2P0SA 1TWYA 4NF4A 4R75A 4UA8A 1A99A 5H8QB 2NXOA 4OFJA 1F9BA 2I48A 3FJMA 3PV0E 1LBCA 1MDP1 1NMUA 1MDQA 4GD5A 4LVQA 2HQ0A 3E4RA 4L17A 3BFTA 1AOVA 3CIJA 1B58A 5DTBA 4M1VA 4H65A 1URDA 3U94A 5KZTA 4ND9A 5TU0A 3FXRA 3IR1A 3BFUA 5A5XA 3N94A 5DEXB 3C4MA 1KWHA 4LZ5A 3FJGA 3D4CA 4FAJA 3SEXA 1B1HA 1MQGA 2O69A 1IXHA 3VDFA 5AE4A 1I6BA 3THIA 1POTA 1I69A 3ZS6A 2AL5A 1M5FA 5KDTB 1SDXA 4G68C 1EZPA 4F31B 2P1SA 1S7YA 1UTHB 4QFNA 2DE4A 4DE8A 4JXIA 1A55A 5JTYA 1MS7A 1B1XA 3QYTA 1NH8A 4O3CA 2F8DA 3T66A 2WKYA 1LFGA 1JW1A 2DQVA 1A40A 1ZU0A 2V84A 2F6PA 3D4GA 4R2FA 4ZZAA 4TOZA 5IAIA 4RXLA 3S9LC 2Q89A 3PUVE 1URGA 2PYYA 3O66A 1ZTYA 2PVUA 3CSGA 2ZYOA 4BDQA 1SVXB 2UYEA 1CE2A 3LC8A 2UVIA 2O7IA 2GHBA 5A5XB 1P99A 1B9JA 3PMVA 1UIVA 3GLBA 2QL3A 3VV5A 4EXKA 3FJ7A 1B3LA 2Z8EA 3IB2A 3ILUB 4O3AA 1OMPA 1JW5A 3PGFA 2ABHA 4H8JA 1MXVA 3L6HA 3TYHA 4XKNA 4KR5A 4IO4A 4Q0CA 1MXYA 2ANJA 5JTYB 3MP6A 3H6VA 2VGQA 1Y3PA 3HO7A 4NMYA 4ZEIA 2PX1A 1LAHE 4DZ1A 1EZOA 3RUMA 2R9JA 4RJZA 3DP8A 2DS9A 1DOTA 1B5JA 4KYDA 4IO2A 3S9MC 3MC2A 2UXAA 3MW0A 3VLVA 5ITPA 4PFYA 4EF2A 1DTGA 3FVGA 4DXBA 3KN8A 2E1SA 4JSDA 1N3XA 1FQFA 4K3FA 1PEBA 5DYHA 4Q30B 1SW5A 1Y20A 1LBBA 2G29A 2P2AA 3TQWA 1B5HA 5F7VA 4G68A 2BJJX 4JWOA 3K01A 4G8HA 1NNFA 2QRYA 1TXFA 2Y7IA 1US4A 4QF9A 3ODBA 3TMGA 1WVJA 1M5EA 4IO7A 3OXNA 3L6GA 3MVXA 3K1MA 4H5FA 2XXWA 2GHAA 3TKDA 4F18A 1T0KA 4H8IA 3IAZA 2OZZA 1M5DA 1SW1A 4OXVA 1P1UA 2OLBA 4QFLA 3KG2A 4F3GA 3H06B 3R7XA 1URSA 2DP8A 3WAEA 3HN0A 4FECA 4OERA 5B7DA 3KJ7A 4F1UA 4HTGA 3SDFA 4DXUA 4YB7A 5I84A 1N7WA 2OBGA 2XXVA 3MVYA 5AA4A 1R9QA 4PQJA 1IZ1A 5CRYA 1R1NA 4FEBA 3FV1A 4MBPA 4OEUA 3DELB 3USDA 4PFUA 1LAGE 3KSJA 2V3UA 2UYFA 1BKAA 5H8HA 2HXWA 1P1NA 4OFOA 1DMBA 3OSRA 4DCXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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