4LZ5A

Crystal structures of glur2 ligand-binding-domain in complex with glutamate and positive allosteric modulators
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Discovery and Characterization of a Novel Dihydroisoxazole Class of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic acid (AMPA) Receptor Potentiators.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz5A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz5A02
1DTGA 3SERA 2HXWA 3SEVA 2Q2AA 3MQ9A 3T9HB 3IO6A 3K6XA 1GV8A 4I9DA 2X7PA 3O6HA 1GVCA 1XVYA 5AA3A 4MLVA 2O68A 1B3FA 2D3IA 3TCGA 4N13A 1DPPA 1OVTA 4OWDA 3V83A 3R7XA 5H8QA 3FD3A 2DE2A 4OZ9A 3F11A 3OSQA 3EQ1A 1FQCA 1N84A 3PD9A 2DSFA 1LAXA 4OEUA 2XD3A 2IA4A 4YU0A 3O9PA 3PUYE 4GVOA 2KLFA 4PQJA 3K6WA 1UIVA 2QJEA 5ICTA 2ZNSA 3UORA 1MQHA 4DLDA 4LQ5A 4F3BA 1GGGA 4E0WA 4KCDA 1A40A 4Q8RA 3PPRA 1JEUA 2UVGA 2I49A 5ICQA 1FQDA 1ZJLA 5KCJB 1ZKBA 5CI5A 3L6GA 5I57B 4G8MA 4FE8A 3OMBA 4LZ7A 4H65A 2XXVA 3EF7A 2F34A 3SEUA 4GRKA 2XD2A 4YKIA 4R9GA 4N6PA 3TCFA 2ZXTA 4H6DA 1FCKA 2OK2A 1P99A 4GXSB 2UYFA 3C4MA 4MH5A 3IX1A 1FW0A 3W15C 3OSRA 3G3HA 2F97A 2Y7KA 2I4CA 3N26A 4NMYA 2AL4A 1SI1A 4QHQA 2QMWA 1JNFA 4H8IA 2V93A 2OZZA 5AA2B 3ONMA 3QSLA 3N6UA 1O7TA 5J1DA 4R9FA 4AB6A 3JZJA 4ZZEA 1NNPA 1TWYA 2ZYKA 1EZ9A 1XS5A 1NNKA 4FECA 2XXTA 4IO6A 3HCQA 4YB7A 2OWTA 3B7DA 2QS1A 4G68B 1IQ7A 4X48A 1Y9UA 1B32A 3K1PA 1URDA 1B3HA 3KJTA 3G3IA 1MS7A 3K2DA 3DP4A 1P1QA 2VHAA 2QS2A 3MP8A 3HHFA 4DCXA 4LATA 2B3BA 2I3VA 3OO9A 1FTMA 1IXCA 1MQIA 1MXXA 3HPIA 5ITPA 5LOMA 3S9EA 4YB6A 1LB9A 5CMKA 4DXCA 1TXFA 3D4CA 2DYXA 3K02A 1R9LA 1SW1A 5KZTA 5DYHA 4HTGA 2Y84A 4ELOA 2H98A 4FEBA 3N5LA 3S9MC 3ILTB 3PUXE 5I2NA 4LA9A 4AB5A 3VLUA 4WKMA 3T9VA 2DS9A 1B05A 1JQFA 1GTKA 3KSXA 1N76A 4THIA 2E0SA 1N04A 3SEWA 3PPQA 2HAVA 2REGA 1VR5A 2NUVA 3PU5A 2XXWA 2F7BA 4PE5B 4ZEIA 3UN6A 3KOTA 3KSJA 3MVXA 2GHBA 3U92A 2P1SA 2A5TB 3JYRA 3PMWA 4H1XA 1MPCA 4KI0E 1QUIA 1QUKA 2FA7A 1B1XA 2GH9A 1FQBA 2XXIA 4GWOA 4O3CA 2RINA 5H8NB 4BDLA 1D9VA 3K0VA 1J1NA 2ZNUA 3MP6A 1MXVA 3RLFE 3S2VA 2Q88A 3FZVA 3TFLA 1RKMA 1PB8A 1FTLA 3KG2A 4P0GA 1LFHA 2UVIA 4NF5A 3A09A 1XT8A 3MP1A 4KQPA 1ZU0A 3QYTA 4WEDA 3PPPA 2ZYMA 5CMMA 1OQGA 2CZLA 4DCYA 4H5GA 4KHZE 3CG3A 3LBSA 3T9UA 1US5A 2QS3A 3C33A 1CE2A 4L17A 4XXUA 2E1SA 3KN3A 3THIA 2RC7A 4OFLA 3FVNA 2VP1A 3RPWA 5CMBA 5IKBA 1PEBA 3OXNA 4NF8B 1B5IA 3DP6A 4BDOA 2Y7WA 3FVGA 4M4GA 5JEIA 2I48A 3H06B 3U72A 1IIWA 1NH8A 3H7MA 3IB0A 5K2YA 4JSOA 4R6KA 4F31B 4ZEBA 4KFQA 3C36A 2VD2A 3SEYA 4YB5A 2F7CA 4QFPA 5L9SA 2ONKE 2HQ0A 3FUZA 1WDNA 1NKXA 3UP9A 1RYXA 4KYEA 1B2HA 1LAGE 3MBPA 1OLCA 4FEDA 5I2KA 3ILUB 2P2AA 1VFEA 1B40A 1R6ZA 3TQLA 1QW0A 1NH7A 4F19A 4ND9A 3U93A 4F2OA 1ZIUA 3MZ9A 5A5XA 5BWJA 4YICA 2GHAA 5KCJA 1LGBC 2NWJA 3FASA 4HS7A 2QMXA 4ZDMA 3N6TA 3M8UA 3O97A 2I58A 1EZOA 1SDXA 3DLNA 1QKBA 1Y3NA 3BFUA 2RCAA 5HBCA 3H6TA 1QULA 3M3LA 3FVKA 2DE4A 4ESWA 4FORA 4F3GA 2F6GA 3TMGA 1H43A 3RY3A 4GLIA 3VV5A 3ZKLA 4IGTA 3FXUA 4QFNA 1XC1A 4XKNA 4BDMA 1B7UA 1BLFA 5ELVA 3T96B 3KFMA 3LC8A 3D4GA 2V3TA 3H6VA 3MZBA 2G93A 3I5OA 3BKIB 4PETA 1IXHA 3CR9A 3RUMA 1FTKA 1S50A 1VFDA 2ONRA 5I56A 1B5JA 1HSJA 3FJ7A 1JW4A 2PT2A 2RKMA 5JTYA 5I59A 1MQDA 3LSWA 3RT6B 1H76A 3H03A 3MUQA 3SETA 2P0SA 3A3UA 5EYFA 1MDQA 4X9TA 4HW8A 4XIGQ 3TEPA 4KCCA 2XXRA 2GFEA 1CB6A 4NF4B 3T9XB 1YPNA 1US4A 1SW5A 4IO4A 1D9YA 3H3GA 1BTJA 4ZE9A 4XKRA 1B58A 4M1VA 4OESA 3GBAA 3ECRA 2RCBA 3OO8A 5DVJA 4G77A 5DEXA 1UTBB 4ZEDA 4QF9A 2HEUA 2UVHA 1IEJA 1FTJA 1PBQA 1URGA 1JEVA 3PUWE 5JK4A 2YJPA 1QVSA 3TELA 3OEMA 2WKYA 1IZ1A 2Y7RA 4AQ4A 3IK6B 4NF6B 2XX9A 4EF2A 1ZMGA 4F18A 2Z22A 4ZECA 3FJMA 2F35A 2PYYA 3W9VA 2ZYNA 3PD8A 3KZGA 1I6BA 4UA8A 4DXUA 3H6WA 2BJJX 3QK6A 4OHNA 4YMAA 3M3FA 4C1UA 4EDPA 5TP9B 2X7QA 4F39A 4R75A 2O51A 3CSBA 2V3QA 3BBRA 1ANFA 4JXIA 4KYDA 3O29A 4DXBA 5B7DA 3IOUA 3RTFB 5M2VA 3MVZA 1FQAA 1B52A 2XX7A 4PP0A 3IO4A 1LFGA 3H6UA 2Z8FA 5KDTA 3LSLA 1PB7A 1SYIA 3Q29A 3SKPA 3T93B 1MY0A 2ALUA 1BIYA 3SEXA 2PX1A 1Y3QA 2G29A 3B6WA 3I3VA 2B3FA 4RA1A 5TPAA 4F3PA 3V5AA 1Z7NE 2B65A 2OWSA 3AXFA 1FQEA 4DIGA 2HAUA 3EN3A 4OXVA 3EHTA 2DP8A 4R2BA 1MQGA 1OLAA 2I6EA 3TTNA 3UA8A 3USDA 1MXYA 4OFOA 3C35A 1B5HA 4PFYA 5K2XA 2I0CA 1M5BA 3K6VA 1EU8A 3U8QA 4IO2A 4Q5TA 3WAEA 4BDRA 4R72A 3OOAA 3FXRA 3R6UA 2O1LA 4ZE8A 1PDAA 4RXLA 1MXUA 5AA4A 3U94A 3RQTA 1NL5A 4Z0IA 4MFIA 1MPDA 3ZSFA 3TTRA 1Q1KA 1LLSA 1WVJA 2IEEA 3TODA 5H8FA 2GRVA 3KBRA 1T0KA 1USYE 3O2AA 2HZLA 1LBCA 2DQVA 4WXJA 2AIXA 1JVXA 3OO6A 2RC9A 1HSEA 4TLLB 1H3DA 2I3WA 1XHYA 5H8HA 2XHDA 4Z7EA 5H8QB 1A99A 5I58A 4Q0CA 1FQFA 3VVFA 3GBBA 2FYIA 4OETA 1P1OA 4HCWA 4U21A 2AYSA 4LZ8A 2OBGA 4C1TA 3PPOA 1JW5A 4BDNA 3MWBA 1URSA 2LAOA 3QAXA 4XTCQ 3UGWA 3PGFA 3VFJA 3CI8A 1VSOA 1H45A 1IXGA 1SVXB 3OENA 4JWYA 3Q26A 4GOTA 5DVFA 1FTOA 5FTIA 1XVXA 3S9LC 3GXAA 4ESXA 2PVUA 3TUSA 1UTHA 2PBWA 3HO7A 2DXYA 3RN8A 3G3KA 5BUUA 3K01A 3CFLA 1MDP1 2F36A 4OVJA 1NMUA 4OTEA 4PFUA 1MM7A 1JETA 3IB1A 2ANJA 4JB7A 3B6TA 4MLQA 4JDFA 4BDQA 4GD5A 3O6IA 3LSFB 4RY1A 2O84X 5AA1A 1QJMA 3VXBA 4QSEA 5CM6A 3CFXA 3QUJA 4G2ZA 1VE4A 1M5CA 3O6GA 1A55A 3HV1A 4KYSA 3T22A 2Q2CA 4MBPA 1II5A 3RNNA 5IAIA 1UIUA 2V84A 2V25A 4LQ2A 2DVCA 3GLBA 3FV1A 1MM6A 4IGRA 1N7WA 3PMXA 1I6QA 2DE3A 3PUZE 1B3EA 2I4BA 4YKPA 2Y7IA 3E9XA 4UACA 1SW4A 1PBPA 1DTZA 3TZAA 2R71A 3EHUA 2ESNA 3FV2A 3L6HA 1B7ZA 1BP5A 2XXQA 1B6HA 1SQYA 4FIMA 4NF6A 1B51A 4YKJA 4OENA 3ZS6A 1Y1ZA 4U1OA 1B0HA 3OO7A 4F1VA 1A8FA 4TLMB 3G3GA 3RGYA 3GZGA 3S9NC 4OERA 1YAEA 3FXQA 5CMCA 5I2NB 1B3LA 3H4ZA 3OD7A 2DWIA 5AA2D 5AE4A 4R74A 5I57A 4QSCA 1MXWA 1B3GA 3LSXA 4I8CA 1Y3PA 2H9BA 3E13X 1DOTA 4OQOA 3LUYA 5CC2A 3LR1A 2QRYA 3FGSA 4K3FA 4LONB 2DWHA 4G8HA 3PV0E 1H44A 2R9JA 1MY4A 4NTLA 2DWJA 3BFTA 1AMFA 1JW1A 3TTMA 5B70A 4POXA 5TU0A 1LAFE 3HSTA 2OCUA 2NVUB 5AA2A 2RC8A 2VD3A 5FTHA 1MXZA 5L8DA 3SDFA 3VE1B 2XXYA 5EHSA 4G68A 2Q8JA 3ODBA 2OLBA 3Q25A 4IB2A 4NF5B 4EQ7A 3TKDA 1EH3A 3I6VA 1B0LA 2ZYOA 2Q89A 1S7YA 3UIFA 1ZLQA 3VXCA 3MC2A 2F8DA 4NWCA 4F1UA 3TQWA 1MY3A 4P11A 1A7LA 1IUDA 3EPEA 1DPEA 4G4PA 1P1WA 3Q27A 3FATA 3KJ7A 2OJTA 4R6HA 1MY2A 3CFZA 3K1NA 3P7IA 5F1QA 1LBBA 3MZ1A 5FHOA 3Q28A 2F6PA 1O64A 3MW0A 4ISUA 4Q30B 1P1UA 3V8XB 3WAFA 3CIJA 5H8SA 1AH5A 4FJPA 3E3KA 4XKPA 3O28A 1B9JA 4U2RA 4MF3A 3QIMA 3SESA 3IOWA 4ZEKA 1MY1A 2O7UA 5DVIA 2H99A 4I1DA 1LAHE 3KGCA 2A5TA 4U22A 3IL1B 2Z8DA 3KOSA 5I2KB 3DP8A 2RF1A 4JWXA 1N7XA 1LB8A 4P0IA 3G3FA 2THIA 1B46A 4EXKA 3IAZA 3C34A 5A5XB 4R6YA 4F29A 3ZKKA 4U4SA 5H8NA 2O7IA 4KD5A 3VVEA 4N07A 3U1OA 3C31A 1SYHA 1HSLA 3B6QA 1Y20A 4U23A 4H67A 1Z7ME 4GXAA 3TTLA 1AIVA 3QXMA 4EQBA 4IO5A 1TT1A 4JBZA 5L9OA 5F7VA 3QUFA 4EF1A 1B4HA 4ECFA 1ZTYA 2DVZA 3V89B 2Z8EA 1GR2A 4ZS9A 1QKAA 4ZEFA 1PB9A 4RK9A 1NFTA 1OIBA 5DT6A 2VGQA 3C9HA 4QFOA 2O69A 2NXOA 2QS4A 3RTWB 3RT8A 4C0RA 2CMOA 4G68C 4NEDA 2PMSA 3VVDA 4X1DA 2QL3A 3KN8A 1A8EA 4KPTA 4NF8A 4PFTA 5I56B 2PT1A 2ABHA 3R26A 2ONSA 1Q35A 3TPAA 5JTYB 2W7YA 5I59B 2HFBA 1DMBA 3FVOA 4HCYA 4QFLA 1XOCA 4DDDA 1MH4A 3TYHA 1JVYA 4RPNA 4IY5A 1ZBMA 2XXUA 1SBPA 4ELQA 3OELA 4JSDA 4IY6A 1AOVA 4GL8A 2YLNA 4BLAA 3IOVA 1Y1MA 1ELJA 1LCTA 4I62A 4OYVA 5L9MA 1SI0A 4LUBA 4U1ZA 3MVYA 5DEXB 3MPLA 1MG1A 2F78A 2F5XA 5I84A 2XXHA 1R1NA 4TOZA 1MPBA 1KWHA 3G7WA 1SD3A 3IORA 4RYAA 4E0XA 4EXLA 4LVQA 3K00A 5FHMA 3O66A 2XX8A 4EUOA 1BKAA 3IR1A 5HM4B 4YAHX 2Q9TA 3C32A 4YZZA 3MPKA 3VLWA 4OMBA 4POWA 3VDFA 3MVWA 1MH3A 1OMPA 2F7AA 2DXRA 4G8NA 2UXAA 1N3XA 4QSDA 2QSXA 1UQWA 3DM0A 3CSGA 1EZPA 2Z23A 4JWOA 2X26A 5CBRA 5KDTB 3TDJA 3K1MA 4O3AA 3FJGA 3M3KA 3DELB 2H5YA 2O6AA 1A54A 1B7HA 2HCAA 4NE4A 3S4UA 1POTA 2D21A 5TPAB 1POY1 2R6GE 5FHNA 4TQUQ 1LFIA 1S9TA 2O1MA 4F1YA 3IJXB 1ATGA 5CBSA 2YPNA 1TFDA 4QFKA 3IJOB 2AL5A 2VOZA 3TCHA 3KN7A 4WEPA 4YMBA 3CG1A 4RPOA 1RYOA 1L5TA 4F3SA 4NF4A 2NOOA 3CVGA 4YKKA 4DZ1A 5HPQA 2D5WA 5ISUA 4F22A 1NNFA 1B4ZA 2XXPA 1NNTA 1SW2A 1R9QA 4H0WA 3HN0A 2FNCA 3MAMA 4H8JA 1LCFA 3IOTA 1MQJA 1UTBA 5AA4B 3MJNA 2M8CA 2UVJA 2HZKA 3HHGA 2ZNTA 4ZZAA 4LP2B 2DWAA 5H8FB 1YCJA 1Y4CA 1OVBA 4GIZA 4RNSA 4KR5A 5DTBA 1B1HA 3EHSA 1O63A 4GQOA 2UYEA 1N3WA 3PMVA 3A3CA 2ZMBA 1WODA 3TAJA 4OFJA 1USYH 1OQHA 4R73A 4NWDA 4FATA 2REJA 4FAJA 5H8HB 5I58B 1PC3A 2QPQA 1D3KA 1QUJA 5TP9A 2H25A 3VLVA 3T66A 1M5EA 4ONYA 2H4IA 1AL3A 2XXXA 1I6AA 3FIRA 3TTKA 4H5FA 4R2FA 4RJZA 4F2QA 4O3BA 4IO7A 4EQ9A 4PFWA 1F9BA 1TFAA 5EHMA 1DSNA 4GF8A 4ELPA 2I0BA 4X1BA 1M5FA 3G3JA 3CRBA 3K6UA 1IXIA 5CRYA 4ELRA 3UK4A 3W9WA 4U4XA 2DOJA 4DE8A 4GL0A 4LZ5A 1UTHB 1I69A 3JV9A 3PPNA 1Y4TA 4OEVA 3N94A 3IB2A 2A5SA 1LSTA 3K4UA 4XKQA 1IITA 4RK2A 3E4RA 1M5DA 1MRPA 1N0TA 4IO3A 1D4NA 1P1NA 3OEKA 5ITOA 4GFRA 3KEIA 1YTVA 2V3UA 3PUVE 4QRZA 2Y7PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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