4MBPA

Maltodextrin binding protein with bound maltetrose
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Extensive features of tight oligosaccharide binding revealed in high-resolution structures of the maltodextrin transport/chemosensory receptor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Periplasmic binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN
total genus 128
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-08-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4mbpA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4mbpA01
3DP4A 3VLVA 4ESWA 4F22A 1BIYA 3MPLA 1LGBC 4YKJA 4ELOA 3L6HA 3PPQA 3LSWA 4GD5A 2KLFA 3TQLA 3UP9A 2REGA 2XX9A 4TQUQ 4NMYA 4WXJA 2V3TA 1VFDA 4I62A 4X48A 1UTHB 2D21A 4OYVA 3KN8A 1A8EA 4FEDA 4R9FA 4G77A 2A5SA 1AIVA 4JXIA 4MF3A 5AA2B 3TQWA 3N26A 1FTOA 2XXHA 2DE2A 4FJPA 2HZKA 1PC3A 4X9TA 2Q2CA 1MQGA 1MRPA 3O6GA 4G8HA 4EQ7A 1MG1A 4LZ8A 1B1XA 2IA4A 4RY1A 1M5FA 3PUXE 3TPAA 4KQPA 4LZ7A 5DVJA 2PT1A 5CMBA 4ELRA 4F3SA 4OWDA 3O28A 3RT6B 5AA4B 2OLBA 3O66A 4YZZA 3G3IA 2QS4A 1SW1A 1IITA 4X1DA 4LVQA 4ZEBA 2UVGA 2H25A 1OVBA 5CRYA 4P11A 4F1YA 5H8FB 2NVUB 4BDQA 1VE4A 4OENA 4TLMB 1DPPA 1A40A 4ESXA 1NNFA 3TCGA 2F7BA 2W7YA 3RUMA 2Z8EA 5H8HB 1MXVA 1NNTA 2F78A 2QMWA 3O97A 1NKXA 4G68A 5H8NB 2Y7KA 2H4IA 4HTGA 1OQHA 1US5A 4U2RA 1ZKBA 2CZLA 3CFZA 3E9XA 3CFXA 3HCQA 1B52A 1F9BA 2O1MA 3RY3A 3RTWB 1IXHA 3VDFA 1MXUA 3FUZA 4AQ4A 3IO6A 3MBPA 2Z22A 4LP2B 1LBCA 5JTYB 2ZYNA 1US4A 5DTBA 4EF1A 1BLFA 4KI0E 3OO9A 3OXNA 4OXVA 1FTMA 4PE5B 1I69A 1MPBA 1A8FA 4AB5A 4Z0IA 1UTBA 3TODA 5ITPA 1Y20A 4KCDA 2F97A 4R6HA 2XD2A 4QRZA 2G93A 2RC9A 2H99A 1IXIA 4OESA 3RNNA 5CMCA 3SEXA 4KD5A 3VLUA 1SYHA 3H6VA 1MS7A 1ZLQA 3CG3A 4IO7A 4R2BA 1FQAA 1FQCA 5I56A 4R74A 1A7LA 1LAXA 5I2NA 3SEWA 1N0TA 4DIGA 5CBSA 3O9PA 2AIXA 2XX7A 5A5XA 1MDQA 4BDLA 2H5YA 2XXYA 2UYEA 1NL5A 4RXLA 3DP6A 3ODBA 1LFGA 3VE1B 3C33A 1AH5A 3Q28A 2Y7WA 4OMBA 4HS7A 4RK9A 5TP9B 4DCYA 2DXYA 4OERA 1P1WA 4F3PA 1I6BA 3OO6A 4U1ZA 4ELQA 4KPTA 2ZYOA 4NF8B 1UIUA 4H0WA 4ONYA 2XXQA 2DSFA 1H43A 1MXWA 3QYTA 1WODA 5I58A 1FTKA 2ZYKA 4Z7EA 4H1XA 1OMPA 3G3JA 1MXXA 2THIA 1MPDA 5ISUA 2Q89A 2PX1A 4MFIA 3M3KA 4JBZA 5LOMA 4PP0A 3FZVA 4I1DA 1SD3A 3B7DA 1QKAA 5H8QB 3BFUA 3FJGA 2Q8JA 3DELB 2GFEA 1LCTA 1N3WA 3ILUB 4O3BA 3K2DA 2OWTA 1NH7A 4C1UA 2DS9A 1PB8A 2I4BA 1II5A 4QSCA 3GBAA 4ZECA 4G2ZA 5B70A 4FAJA 1LB9A 1D9YA 4LONB 2VD2A 3FVNA 3MP6A 4FE8A 1T0KA 3SEUA 4YB6A 3FJMA 1POY1 3MVXA 3MAMA 4NF6B 1S50A 5I59A 4BLAA 4F39A 1SW4A 1ZTYA 3RPWA 3OO7A 4E0XA 3DP8A 4GQOA 3CR9A 1HSLA 1FW0A 4LATA 2Y84A 2PMSA 3H6UA 4F3BA 3P7IA 3V83A 1USYE 3IL1B 1R6ZA 1QKBA 4I9DA 4XKPA 1B05A 3KOTA 4L17A 1SI1A 3GXAA 3PMXA 1MY2A 1BP5A 1P1OA 3LR1A 2RKMA 5ELVA 4FECA 4NF4A 1DTZA 3BKIB 1R1NA 2E1SA 3KJTA 3S9NC 3A3CA 3PD9A 1P1NA 5FHMA 3HPIA 3RTFB 3K6VA 1DPEA 2X7PA 5DVIA 3PPRA 1LFHA 3WAFA 1O64A 4XKQA 1MQIA 2I3WA 4PQJA 1A54A 5DEXA 4H65A 5AA2A 3KZGA 4IY5A 2ABHA 4E0WA 5FHNA 2I6EA 3K02A 2PBWA 4KYDA 3MJNA 3W9VA 4ZE8A 2QS1A 4PFTA 1QULA 4MLQA 3KN3A 1OVTA 1A99A 3PV0E 4OTEA 3USDA 3SEYA 5CC2A 2QS2A 3TTLA 4ZEIA 4C0RA 3B6TA 4P0GA 1OLAA 2X7QA 1JETA 2D5WA 3E3KA 1A55A 3MW0A 4AB6A 4NE4A 1SQYA 1Y4TA 2REJA 4JWXA 1Y9UA 3T93B 1MDP1 2GH9A 1ZJLA 4PFUA 2DQVA 4Q30B 5H8FA 1MH3A 1SI0A 2I4CA 2Q2AA 3TKDA 3TELA 3SERA 4H8IA 1DSNA 1N3XA 2RC8A 1ZIUA 4IO2A 2X26A 3T22A 3U94A 3LSXA 1TXFA 4OFLA 1B46A 1B7UA 2ZYMA 4RPOA 1N7XA 2FYIA 4FIMA 5H8HA 2P1SA 1NNPA 3U93A 4OFOA 2F36A 2O51A 3D4CA 3FASA 4XTCQ 5TU0A 1URDA 1LFIA 4C1TA 2V84A 4F2OA 1SYIA 2YJPA 3F11A 4TOZA 1RYXA 2V3QA 3OD7A 3CIJA 4FATA 3IOUA 2QL3A 4YKIA 1J1NA 1B5IA 4DXCA 3T66A 3W15C 2Y7IA 3S9MC 1MY3A 3MPKA 3LBSA 4OHNA 4RYAA 4M4GA 2RC7A 1MQHA 1RKMA 3PMVA 3TTMA 3PD8A 1B0LA 3HV1A 2DYXA 2VGQA 3PU5A 3CSGA 3HHGA 4ZEDA 1LAHE 3TCFA 2ZNTA 1N76A 3S9LC 1B40A 3C36A 5BWJA 4R9GA 4HW8A 1OIBA 2ONRA 2UVJA 4QF9A 1MPCA 2F6GA 4EXLA 5I57A 4QFKA 4KR5A 1JVXA 3LSLA 3MZ1A 2A5TB 3FGSA 5I2KB 1B3EA 2HZLA 2I58A 5FTHA 5F1QA 4KHZE 3T96B 3K0VA 3O6IA 4POXA 1B0HA 4EUOA 3C35A 2GRVA 4GFRA 3FXUA 3K00A 3OEMA 3B6WA 1Z7ME 4OEUA 4N07A 4U23A 4ZZEA 5L8DA 2RF1A 4YKKA 1B7HA 3FD3A 4GL8A 1ANFA 3Q27A 1OQGA 3CRBA 3H6TA 3IOVA 1UQWA 2AL4A 2P2AA 4QFNA 5TPAB 2XXUA 3ZKLA 3H3GA 3EF7A 3PUWE 3RT8A 1B3GA 3K6XA 3VXBA 1B7ZA 4NF5A 1Y3NA 4GXAA 1FCKA 1PB7A 3H4ZA 2ZMBA 1URSA 3HHFA 1EZOA 4YICA 1GTKA 3FIRA 4IGTA 5J1DA 1IXGA 2QPQA 1MXZA 1MY0A 1TWYA 3OEKA 3V89B 4EQBA 3IB2A 1JEVA 4ZDMA 3U1OA 1JEUA 2GHBA 4EDPA 3VVFA 2NWJA 4GLIA 2QS3A 4BDNA 3TTRA 2O6AA 3DM0A 5L9SA 2R9JA 4NF6A 1B3HA 4ZEFA 2PVUA 2F6PA 4KFQA 2ALUA 3ZKKA 1R9QA 2OCUA 1JW4A 3VVEA 3TTNA 3Q26A 3O6HA 2DE4A 4YB7A 5ITOA 1QUJA 5K2YA 1D3KA 2HEUA 4OZ9A 1N7WA 1UIVA 2RCBA 3MQ9A 1XVYA 1ZMGA 2ONKE 5JEIA 2I3VA 3R6UA 4ECFA 1H45A 4Q5TA 4R73A 1AOVA 3FV1A 2D3IA 2DXRA 1URGA 3RLFE 2XXRA 2NOOA 3KSJA 1FTLA 4QSDA 3GBBA 2HAVA 4QSEA 2RINA 1B9JA 1SW5A 1B4HA 3KSXA 3CI8A 1IZ1A 3I3VA 2DVZA 4G68B 1BKAA 3PPNA 3GZGA 2FA7A 5HM4B 3OENA 3N6TA 2G29A 2F7AA 2ZNSA 4BDRA 4X1BA 4LQ2A 1NFTA 4JB7A 5AE4A 2UVHA 3UORA 1MY1A 4R6YA 5L9OA 3KEIA 5KCJB 3CSBA 2XXWA 3G3KA 2R71A 2NUVA 1B32A 1IUDA 2DWJA 3M3LA 5KDTA 1M5DA 3M3FA 1I6QA 4K3FA 1KWHA 1B3FA 4MLVA 3OELA 1IXCA 4GF8A 3ZS6A 1LLSA 4JDFA 3HO7A 3I5OA 4Q0CA 1B5HA 4GIZA 1LBBA 4DZ1A 4QFLA 5K2XA 3JYRA 4DLDA 2ONSA 1H44A 1LB8A 3QXMA 4O3CA 5I56B 5I2NB 2O7UA 2BJJX 3S9EA 3MVYA 1Q35A 4OETA 4G68C 3DLNA 2ZXTA 1B1HA 1PBPA 3PMWA 4F19A 3FATA 3OOAA 5A5XB 4IGRA 4QHQA 4H67A 1AMFA 3VLWA 3UN6A 4LQ5A 2ANJA 5M2VA 4P0IA 1FQFA 4F31B 3IO4A 1Y4CA 2PYYA 1L5TA 3A3UA 5CMKA 4F1VA 3SEVA 3TTKA 1YAEA 2UYFA 3U8QA 3ILTB 2O68A 4OVJA 2UVIA 3MP1A 3B6QA 2QMXA 4WKMA 1M5EA 3Q25A 5KZTA 3G3GA 1UTHA 3EN3A 4FORA 4WEPA 3TAJA 1S7YA 4ISUA 1EZPA 3KOSA 5I58B 1FQEA 1DTGA 2IEEA 4ND9A 3K1PA 5DT6A 1LAGE 2F35A 2XX8A 3BFTA 1PEBA 5B7DA 4IO4A 1B6HA 1H3DA 2LAOA 4R75A 1NMUA 3IB0A 3RN8A 2DWAA 4I8CA 4KYSA 3K1MA 3MZ9A 4N6PA 3ECRA 3CG1A 1SBPA 1FQDA 5EHMA 2V93A 5AA4A 4H5FA 3A09A 3MVZA 1VFEA 4G4PA 4F29A 2H9BA 5CM6A 2Z8FA 3IX1A 4GXSB 1OLCA 2VOZA 1Y3QA 1XS5A 2F34A 4U4XA 2O1LA 3UIFA 4OFJA 4RPNA 3KJ7A 1BTJA 5I59B 2Z23A 5H8SA 3EHSA 3G3HA 1QW0A 1M5CA 2DVCA 1MY4A 4N13A 3FVKA 4NWCA 5H8NA 2ZNUA 3ZSFA 2ESNA 2B65A 4JSOA 3SDFA 3TFLA 3HSTA 3PGFA 1ZU0A 3VXCA 2DWIA 3C34A 2OBGA 3PUVE 2QSXA 3MUQA 3QK6A 4KCCA 1WDNA 3QUJA 1MM6A 4UA8A 3WAEA 1Z7NE 4IO3A 4YMAA 5JTYA 4PETA 1MQDA 3QSLA 3OMBA 1YPNA 3OSQA 4NF4B 4EF2A 2NXOA 1GR2A 4XXUA 1B3LA 4TLLB 2Z8DA 5FHOA 5FTIA 1DOTA 2VP1A 3KG2A 1JW5A 2HFBA 1CE2A 4PFYA 5EYFA 4MBPA 3IR1A 3KGCA 3V8XB 1POTA 2AL5A 4GOTA 1CB6A 5DEXB 5DYHA 2DE3A 1GV8A 4YB5A 2I0BA 3LSFB 3KN7A 3GLBA 1B2HA 2F5XA 3K6WA 2VD3A 1JQFA 1GVCA 4XKRA 1Q1KA 5AA1A 2QJEA 3V5AA 3IAZA 5IAIA 4G8NA 4RNSA 4JWOA 1SVXB 5HBCA 4U22A 1YTVA 5TP9A 2OJTA 2CMOA 5DVFA 3JZJA 3MC2A 1AL3A 3FVGA 4HCWA 1PDAA 2M8CA 2Q9TA 3JV9A 4LA9A 3S4UA 2XXPA 4NF8A 4U1OA 4G8MA 1I6AA 3T9UA 1XOCA 1M5BA 3R7XA 1IEJA 3IORA 3IJXB 2HQ0A 3KFMA 2B3BA 3K01A 4M1VA 4EQ9A 1SW2A 4Q8RA 4H6DA 4JWYA 2XXVA 3FXQA 1ZBMA 5EHSA 1P1UA 2RCAA 3FJ7A 4NEDA 2P0SA 1ELJA 4UACA 5JK4A 3TMGA 1NH8A 2I0CA 2AYSA 2FNCA 1B58A 1RYOA 5HPQA 5H8QA 2PT2A 2E0SA 5I84A 2V25A 1GGGA 3VFJA 4DE8A 1HSEA 1B4ZA 5KCJA 3H06B 1NNKA 4DXUA 2R6GE 3T9HB 3VVDA 1QUKA 3UGWA 4YU0A 3O2AA 4IO6A 1USYH 1MXYA 4BDMA 4EXKA 1VR5A 5CI5A 1LSTA 1QUIA 2DOJA 4IB2A 3L6GA 4H8JA 3TEPA 3C4MA 4R6KA 5CBRA 5ICQA 3U72A 4YKPA 1QVSA 1VSOA 3AXFA 3IOTA 3EHTA 3U92A 1IQ7A 2OZZA 1PBQA 3N6UA 5ICTA 3LC8A 2XHDA 1XC1A 3N5LA 5I57B 2DWHA 1Y3PA 2I49A 4OQOA 3UA8A 3IJOB 1FTJA 3HN0A 3TCHA 4IO5A 3MWBA 3D4GA 1QJMA 3C9HA 4NTLA 1WVJA 2HXWA 3E13X 1TT1A 5BUUA 2VHAA 1ATGA 4GWOA 2UXAA 3H6WA 3IK6B 2OK2A 3H03A 3EPEA 3I6VA 3OSRA 4YMBA 4DCXA 4R2FA 1LAFE 3T9XB 2XXTA 4R72A 4FEBA 2F8DA 3C31A 2OWSA 4DDDA 3RGYA 2HAUA 4NF5B 1O63A 3PPOA 3FVOA 4ELPA 3CFLA 3SKPA 1D9VA 3IB1A 3IOWA 1UTBB 2GHAA 4F1UA 1TFAA 5IKBA 3KBRA 3QAXA 1TFDA 3FV2A 3S2VA 2XXIA 1N04A 1N84A 4NWDA 4U4SA 3SETA 1EU8A 4ZE9A 4IY6A 3R26A 4F3GA 1H76A 4WEDA 4GL0A 3PUZE 5F7VA 1D4NA 3RQTA 4F2QA 2F7CA 1XVXA 2HCAA 4GVOA 3N94A 1B5JA 5CMMA 3VV5A 3TYHA 4HCYA 1JW1A 3M8UA 3PUYE 4YAHX 4O3AA 2O69A 1LCFA 2V3UA 3CVGA 2Y7RA 3K1NA 1Y1MA 1Y1ZA 1R9LA 3K6UA 4H5GA 4ZS9A 4THIA 3O29A 1JNFA 1S9TA 3EHUA 2H98A 3K4UA 3QIMA 4QFOA 2I48A 4MH5A 2WKYA 4JSDA 1B51A 4ZEKA 1XHYA 4BDOA 3ONMA 3OO8A 2O7IA 3G3FA 3UK4A 3BBRA 2Y7PA 4QFPA 1EZ9A 1XT8A 3Q29A 4DXBA 2XD3A 3EQ1A 2QRYA 3QUFA 4RK2A 3MP8A 4LZ5A 1P1QA 1DMBA 3E4RA 1P99A 3TZAA 2YLNA 4XIGQ 4GRKA 3H7MA 3MZBA 2A5TA 5I2KA 4OEVA 4U21A 3FXRA 1MQJA 3TUSA 5KDTB 2B3FA 3LUYA 3PPPA 1JVYA 4RJZA 3C32A 1O7TA 5AA2D 5AA3A 2XXXA 1MH4A 4XKNA 2YPNA 1MM7A 3W9WA 2DP8A 3G7WA 1PB9A 1FQBA 3SESA 1IIWA 1EH3A 3THIA 5L9MA 4KYEA 2Q88A 1HSJA 4PFWA 4F18A 1YCJA 3MVWA 5TPAA 4RA1A 2O84X 1SDXA 4POWA 3TDJA 4LUBA 3T9VA 4ZZAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DP4A 3VLVA 4ESWA 5EYGA 4F22A 1BIYA 5F24A 3MPLA 1CNQA 1LGBC 2Q8MA 4YKJA 1EYIA 4ELOA 3L6HA 3PPQA 3LSWA 4GD5A 2KLFA 3TQLA 3UP9A 2REGA 2XX9A 4TQUQ 4NMYA 4WXJA 2V3TA 2R8TA 1VFDA 4I62A 1LBWA 4X48A 1UTHB 2D21A 4OYVA 2V4CA 3KN8A 1A8EA 4FEDA 2PCRA 4R9FA 4G77A 2A5SA 1AIVA 4MNPA 4JXIA 4MF3A 5AA2B 3TQWA 3N26A 1FTOA 2XXHA 2DE2A 4FJPA 3B50A 2HZKA 1PC3A 4X9TA 2Q2CA 1MQGA 1MRPA 3O6GA 4G8HA 4EQ7A 1MG1A 4LZ8A 1B1XA 2IA4A 4O7IA 4RY1A 1FPDA 1M5FA 3PUXE 3TPAA 4KQPA 4LZ7A 5DVJA 2PT1A 5CMBA 4ELRA 4F3SA 1EYKA 4OWDA 3O28A 3RT6B 5AA4B 1FPLA 2OLBA 3O66A 4YZZA 3G3IA 2QS4A 1SW1A 1IITA 4X1DA 4LVQA 4GX3A 1IMDA 4ZEBA 4PE3A 2UVGA 4LN5A 2H25A 1OVBA 5CRYA 4P11A 4F1YA 4XEQA 5H8FB 1NV5A 2NVUB 4BDQA 1VE4A 2KR0A 4OENA 4TLMB 3B8BA 1DPPA 1A40A 4ESXA 1NNFA 3TCGA 2F7BA 2W7YA 3RUMA 2Z8EA 5H8HB 1K9ZA 2XWIA 1MXVA 1NNTA 2F78A 4KXPA 2QMWA 3O97A 1NKXA 4G68A 5H8NB 2Y7KA 4XFEA 2H4IA 4HTGA 1OQHA 1US5A 4U2RA 1ZKBA 2CZLA 3CFZA 3E9XA 3CFXA 3HCQA 1B52A 1F9BA 5ET6A 2O1MA 3RY3A 3RTWB 1IXHA 3VDFA 1MXUA 3FUZA 4AQ4A 3IO6A 3MBPA 2Z22A 4LP2B 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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