4N07A

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j-l483y-n754s) in complex with glutamate and bpam-344 at 1.87 a resolution
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
262
structure length
261
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Synthesis, pharmacological and structural characterization, and thermodynamic aspects of GluA2-positive allosteric modulators with a 3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide scaffold.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 91
structure length 261
sequence length 262
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n07A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n07A02
1Y20A 1M5EA 5I2KB 2PT2A 1M5CA 2NXOA 4BDNA 4QFOA 4F2OA 1XVYA 3KN3A 5HBCA 2Q8JA 2DE4A 3Q29A 3H6TA 3AXFA 1SW1A 2QS2A 4WKMA 2QS1A 3PUVE 1YAEA 2I49A 4EUOA 3U92A 1R6ZA 4R75A 5ICQA 3IAZA 3TEPA 3O6HA 1D4NA 5ELVA 2NUVA 2ZYNA 4IO3A 4GOTA 4IY5A 1SW4A 1MS7A 3MZ9A 2X7PA 1TFAA 4RK9A 3G3HA 3ECRA 2RC7A 3IJOB 4R2FA 1LFHA 5I2KA 4OFOA 3N6UA 2BJJX 2W7YA 2PYYA 4GLIA 3PUWE 1MRPA 1MPDA 2B3FA 5IAIA 1FQFA 4E0XA 4RJZA 1QULA 3G7WA 1Y4CA 2NVUB 1BTJA 2ONKE 4QFKA 1B7ZA 4YKPA 1IQ7A 3RN8A 4POXA 1ZTYA 2DSFA 3EHSA 4OFLA 2F6PA 5ITPA 3SEYA 4GXSB 4ELQA 2F5XA 1NH7A 1OVTA 3KN8A 1PB9A 4ZE9A 2YPNA 1FQAA 5FHMA 4OFJA 1XT8A 1ZJLA 3KBRA 3HPIA 2HAUA 1ATGA 3SEWA 3B6QA 4OQOA 1TFDA 3T9XB 3OOAA 1Z7NE 4H1XA 4QHQA 3TODA 2X26A 1JETA 4H0WA 3B6WA 4DCXA 1YPNA 4G68C 4X9TA 3DP4A 3FV1A 1M5BA 1H43A 3VFJA 3GZGA 2DWIA 3RGYA 2DWJA 1MM6A 2QRYA 1GR2A 4U23A 1LLSA 1Q1KA 3MZ1A 3L6GA 1MH3A 5I59B 4XKNA 2H25A 2I3VA 3DLNA 2AYSA 3E4RA 3PUYE 5CBRA 1DPEA 4ZS9A 3K2DA 4G68B 1B9JA 1OLAA 5H8QB 1MQIA 3KG2A 3S2VA 5B7DA 1T0KA 4DXCA 1IXHA 4KYSA 1QUJA 1B40A 1O64A 2I0BA 4KQPA 4HTGA 3U1OA 3ZKLA 3OXNA 2Y7IA 3E9XA 3JV9A 5ISUA 1EZOA 1SW5A 1YCJA 5I59A 5AE4A 3BFTA 4G8MA 2V93A 2D5WA 1A8FA 1NFTA 2DQVA 4RXLA 4QFPA 3OSQA 3RLFE 1PDAA 3K0VA 4G68A 1LBCA 2V3UA 4U4SA 3IOTA 4RNSA 1JEUA 3RUMA 2Z8FA 5H8QA 1JW5A 4EDPA 4JB7A 3C31A 1B46A 3FVGA 2X7QA 4M4GA 4ZEKA 1MG1A 2ZYMA 2H98A 4F3BA 4H5GA 1FQEA 3GLBA 2XXUA 1B3LA 4OXVA 4IGTA 1A40A 1US5A 1UTHA 3RT6B 3K02A 3ZS6A 1UIVA 1B4HA 3G3GA 4IO6A 3K1PA 1D3KA 3UN6A 3C34A 1B3HA 4R73A 4F2QA 4MLVA 1GTKA 1N3WA 4TLMB 2REGA 5JEIA 1H44A 2R9JA 3Q26A 1O63A 2DVCA 4PFYA 1VSOA 1UQWA 4ZEBA 4LATA 1QKAA 2Y7PA 3TCGA 2PMSA 1QVSA 4GVOA 3KEIA 1URDA 4F1YA 2QL3A 4TOZA 4YU0A 5DVJA 4ISUA 3UP9A 2HXWA 1LAHE 5TPAB 1N84A 3HV1A 4WEDA 3MBPA 3LSLA 1S9TA 3FD3A 4ESWA 3CFXA 1DSNA 1II5A 3G3KA 3IO6A 2I4BA 2PT1A 3SEUA 5DT6A 2FA7A 4JWOA 4KPTA 1B3GA 4DE8A 5KDTB 3CRBA 4PP0A 4H6DA 3MZBA 4ZECA 2Q89A 4YAHX 4KYDA 1IITA 1POY1 1TXFA 1Y9UA 1MXZA 4F31B 4IO5A 2OK2A 2G29A 1MY4A 2DOJA 1IIWA 3H6VA 1Y1MA 1NL5A 3PPRA 2XXXA 2RC8A 4F3PA 3SEVA 2ZMBA 2PBWA 2H99A 5TPAA 3V83A 3GBAA 3E13X 1GGGA 3HO7A 4P11A 2P0SA 3EN3A 2M8CA 5I84A 2YLNA 3V89B 1GV8A 2ABHA 2UVJA 3KJTA 4U1ZA 1B1HA 3PU5A 5FHOA 1B05A 3OO8A 4EQBA 4FE8A 4QSDA 4LA9A 3I6VA 5KDTA 1LAXA 1XS5A 3T96B 1MQDA 2DS9A 4YMBA 3MP8A 1P1NA 4RPNA 3PUXE 3IB0A 2ZXTA 3ODBA 2XXYA 3CSBA 4Z0IA 1N76A 1EZ9A 2DXRA 3IK6B 3TYHA 1MXXA 2FNCA 1Y3QA 3K6XA 1JQFA 3SESA 1B7HA 4KR5A 4YICA 5JK4A 3JZJA 1H45A 3TELA 3UA8A 1N7WA 2WKYA 3MVYA 2IA4A 3OEKA 5F1QA 1SYIA 2YJPA 4EQ7A 3TQLA 3WAEA 3B6TA 3MP1A 3MPKA 3IJXB 3LR1A 2Q2CA 1QJMA 1MY0A 5EHSA 1JEVA 3ILUB 4KFQA 1MXVA 4JSDA 3T93B 2IEEA 3C36A 2F7AA 2XXWA 4LQ5A 5CBSA 3EPEA 3PV0E 3C32A 3VLUA 3HN0A 2XXHA 2F6GA 3H6WA 1IXCA 4RK2A 3GBBA 1LSTA 2F97A 3T66A 3K6VA 4O3BA 2A5SA 1NMUA 4F29A 3FIRA 2DWAA 1AH5A 1Y3PA 4EF2A 3LSFB 3H6UA 4Z7EA 2O68A 4OZ9A 4HCYA 3CR9A 1ZLQA 2VD3A 3THIA 4G4PA 4F19A 2I0CA 1B51A 1NNPA 4DLDA 4TQUQ 1D9YA 3IOVA 3G3IA 3VV5A 3O28A 3SERA 3K1MA 3FZVA 4MFIA 4OYVA 1VFEA 4NF5B 2OBGA 4RYAA 3TTNA 3TTRA 4R6YA 3EHTA 1R9LA 4ZZEA 3O66A 3R26A 2UVGA 3PPPA 1NNTA 3IB2A 3G3JA 2A5TB 4TLLB 4AB5A 1TT1A 4H8IA 2I58A 2Z22A 4R2BA 1SQYA 2DXYA 1A99A 1OMPA 1SW2A 3FVOA 4QSCA 4ZEDA 1FTOA 5CMCA 5DTBA 5B70A 3TDJA 4OERA 4UA8A 4IO4A 3W9WA 4XIGQ 1PBPA 4H65A 1LB9A 3OO9A 3MC2A 4NF5A 5AA2D 1SDXA 2XD3A 1JW1A 2ZNTA 4X1DA 3A3UA 1DPPA 1MPCA 3FUZA 3MVZA 4KCDA 4NF6B 4BDMA 5CI5A 1NNKA 1JVYA 1LGBC 5H8FB 1DOTA 4LZ8A 1IUDA 2A5TA 1SVXB 1BP5A 5DVFA 3VLVA 2ESNA 3FASA 1P99A 2QMWA 4EXLA 1P1OA 4ZEFA 4QF9A 1MXYA 3CI8A 4NWCA 2QS4A 5K2YA 5AA2B 1FW0A 2V3QA 4FORA 3W9VA 3O9PA 4I8CA 3CVGA 3PMWA 3MP6A 3JYRA 5I58B 3U72A 4NTLA 1JW4A 5H8HB 1B0HA 3S9NC 3K6UA 2O1LA 2CMOA 4OMBA 4LONB 5FTIA 4F18A 1QKBA 1I6QA 4N07A 4GFRA 4NF6A 2VD2A 4P0GA 5L9SA 4HS7A 1N04A 3VVFA 1SD3A 5H8FA 2QS3A 1LCFA 1AL3A 3KOSA 4POWA 4YB5A 4OVJA 3LC8A 4R72A 5DEXB 5AA2A 3F11A 1B3FA 3H7MA 3EQ1A 3KN7A 3PGFA 2E1SA 2ANJA 3S9LC 4MBPA 4ELOA 3N94A 5I58A 3T9UA 1JNFA 3G3FA 2PVUA 5CMBA 3DP8A 5H8HA 3SEXA 3QAXA 3UIFA 2HCAA 1JVXA 1OQGA 5DYHA 3UK4A 5BUUA 1DTZA 4ZDMA 3U8QA 3QUJA 5L9OA 1OLCA 2F7BA 4FJPA 4NEDA 1A55A 3BBRA 5DEXA 2XXRA 5A5XB 3IO4A 2E0SA 2DYXA 1PEBA 4WEPA 4RPOA 2O6AA 1A54A 4F3SA 1XHYA 2Q88A 1RKMA 5AA1A 2XXQA 3PMVA 3FXQA 3KOTA 1BKAA 1I6AA 1IEJA 3OD7A 4K3FA 3TTKA 4FEBA 4R6KA 1I69A 2DWHA 5M2VA 1MDQA 3FVKA 5BWJA 3MW0A 1M5DA 1F9BA 4XKPA 4HW8A 2UXAA 1BLFA 3L6HA 1PC3A 4G8NA 1B58A 3K4UA 2AL4A 2H9BA 3R6UA 3QXMA 2RKMA 3CG3A 4JBZA 1XVXA 3O6IA 4LZ5A 5A5XA 5AA4B 3IL1B 4NWDA 4F1VA 4AQ4A 4PFTA 3A3CA 2OCUA 5CC2A 4PFUA 4C1TA 4O3CA 3FVNA 3V5AA 2O7IA 3I5OA 2DP8A 2VP1A 1SYHA 1FQBA 3SKPA 3H3GA 1PBQA 3MVWA 3R7XA 2HZLA 2O7UA 2HAVA 3M8UA 2ZNSA 4F3GA 1URSA 4NMYA 1DTGA 3OMBA 1Z7ME 4LUBA 2F7CA 4IO7A 1OQHA 3MQ9A 5AA4A 2Q2AA 4PE5B 1B3EA 3T9VA 3ZSFA 5ICTA 3K00A 4YB6A 1IZ1A 1VFDA 4THIA 2AIXA 4JWXA 3EF7A 3PD9A 4QFNA 3S4UA 4OEVA 1FTJA 2Q9TA 3KGCA 2RC9A 5TU0A 4U22A 2XX9A 2XXTA 4FAJA 3KFMA 3OENA 2Z8DA 2HQ0A 4GL0A 3TPAA 3QUFA 1WODA 4XKRA 3O6GA 1SBPA 1J1NA 1B5HA 4RY1A 1FTMA 3TKDA 2ONRA 1UIUA 2QPQA 4RA1A 3RY3A 4XKQA 2I48A 1OVBA 2DVZA 1OIBA 5EHMA 4M1VA 3M3FA 2QJEA 3LBSA 2R71A 4F1UA 3KSJA 5L8DA 4QFLA 1AMFA 1MQHA 2OZZA 3KSXA 2ONSA 5HM4B 2LAOA 1BIYA 2GRVA 4OHNA 3FATA 3MJNA 1VE4A 4F22A 5FTHA 4OTEA 3VDFA 3QSLA 4JWYA 2RF1A 4GF8A 2ZYKA 1A7LA 1KWHA 3E3KA 4BDLA 3Q27A 1H3DA 3H06B 1POTA 2NOOA 2H4IA 1R1NA 2F78A 3DELB 3LSXA 3O97A 3FV2A 4JDFA 4YKIA 3BKIB 3T9HB 4GWOA 2O69A 1I6BA 2OWSA 3H03A 3TZAA 4LQ2A 2O84X 2OLBA 3RTWB 3VXCA 4G2ZA 1FQCA 3S9MC 2RINA 4O3AA 3RPWA 3KZGA 4YKKA 1LFIA 2V25A 1FTLA 1SI1A 1ZIUA 4LP2B 5F7VA 1RYOA 2Y7KA 3C4MA 1H76A 2RCBA 4FEDA 4I62A 1EH3A 2I3WA 3K1NA 2HFBA 4IB2A 1LFGA 3VXBA 2XXPA 5JTYB 1N7XA 1LAFE 2THIA 4BDQA 2HEUA 4PETA 4QSEA 1XOCA 4ESXA 4Q0CA 5I56B 1USYE 3QYTA 3OELA 3OO7A 3IOUA 2VOZA 2Y7WA 1IXIA 3A09A 2GFEA 3OEMA 3C33A 4ELPA 4KYEA 4I1DA 4KD5A 1QUIA 4G77A 2XHDA 3QK6A 2OWTA 3RQTA 3VE1B 4PQJA 3C35A 1B2HA 3HHFA 4ND9A 3MUQA 2UVIA 3IX1A 4KCCA 4OEUA 4IY6A 2AL5A 2KLFA 1ZBMA 3TMGA 3M3LA 5JTYA 3P7IA 1A8EA 2V3TA 5LOMA 1P1WA 5I56A 4FECA 4IO2A 3IR1A 3C9HA 1LB8A 3Q28A 1EZPA 3MWBA 4G8HA 4MF3A 1NKXA 4N6PA 1L5TA 1B6HA 4YZZA 1LCTA 4LVQA 3CFZA 2I6EA 5CRYA 3PPOA 1D9VA 1PB8A 5IKBA 3CSGA 2XX7A 4KI0E 2D21A 3O29A 3LUYA 1FTKA 3T22A 3UORA 4FATA 3U94A 2O51A 4OENA 2B65A 1MQGA 1ANFA 1WDNA 3PPNA 4QRZA 1UTBB 4JSOA 3RNNA 4X48A 1P1QA 1MH4A 4YMAA 1S50A 2HZKA 2REJA 4NF8B 3W15C 3RTFB 2XXIA 1WVJA 4GQOA 4Q30B 4ZEIA 1MY2A 4OWDA 4R9FA 2XD2A 4OESA 3Q25A 1MPBA 4IGRA 3QIMA 2RCAA 2O1MA 1M5FA 3ONMA 3TFLA 1MY3A 2Z23A 3VLWA 2NWJA 1TWYA 3ZKKA 1CE2A 1HSJA 1MM7A 4UACA 3MAMA 1N3XA 3LSWA 4GRKA 1RYXA 1IXGA 2OJTA 1UTBA 2V84A 1MQJA 3FJMA 3H4ZA 1VR5A 2CZLA 5CMKA 1ZMGA 2ALUA 4ZE8A 4NF8A 4C1UA 4U1OA 1NH8A 3HHGA 5H8SA 1UTHB 5CMMA 4ECFA 4EQ9A 1Y1ZA 5KZTA 4DXUA 2P2AA 2FYIA 4GIZA 3K6WA 2Y84A 3PPQA 4MH5A 2Z8EA 2H5YA 1MDP1 5DVIA 4YB7A 1ZU0A 3TCFA 4H8JA 2QSXA 5TP9B 1P1UA 1Q35A 3SETA 4H5FA 4NF4B 4FIMA 5AA3A 2VGQA 3OO6A 3VVEA 4X1BA 2GH9A 3DP6A 3TUSA 4PFWA 1XC1A 2DE3A 3N26A 1Y3NA 1HSLA 2F35A 4OETA 3N5LA 4XXUA 3CFLA 3FJGA 4GXAA 4ZZAA 3V8XB 2UYFA 2F34A 5J1DA 4P0IA 1AIVA 4ELRA 5H8NB 3IB1A 4JXIA 1USYH 4E0WA 4U4XA 1B5IA 1URGA 3MPLA 1LAGE 1QUKA 1R9QA 5TP9A 5FHNA 4GD5A 4DCYA 4NF4A 1B52A 5L9MA 4H67A 3U93A 4R6HA 3TQWA 1FCKA 4F39A 2ZNUA 4WXJA 3RT8A 2QMXA 3TCHA 2UYEA 3EHUA 4N13A 1SI0A 3TTLA 4BDOA 3DM0A 1NNFA 4I9DA 4HCWA 3VVDA 1S7YA 4U21A 2R6GE 1O7TA 2Y7RA 5K2XA 4XTCQ 3PMXA 3N6TA 1B5JA 3I3VA 3FGSA 5H8NA 3BFUA 3PUZE 1B32A 3HCQA 2UVHA 1GVCA 2B3BA 2XX8A 3D4CA 3S9EA 5I2NB 1N0TA 2VHAA 3USDA 3IOWA 1MXUA 1B4ZA 4EXKA 1US4A 3B7DA 1FQDA 3TAJA 4U2RA 1ZKBA 2PX1A 1HSEA 4BDRA 3FXUA 5EYFA 3D4GA 2F8DA 5KCJB 3K01A 5I57B 1B7UA 2XXVA 2P1SA 4EF1A 1Y4TA 4R9GA 1MXWA 4C0RA 2D3IA 3O2AA 1QW0A 3CIJA 4DXBA 4AB6A 3GXAA 4DIGA 4DDDA 1DMBA 1CB6A 2GHAA 1LBBA 4Q8RA 2G93A 5I2NA 4YKJA 2DE2A 3PD8A 1MY1A 3HSTA 3ILTB 3SDFA 4MLQA 3FJ7A 2GHBA 4DZ1A 3IORA 2I4CA 4L17A 3KJ7A 2F36A 1PB7A 4NE4A 1B1XA 3FXRA 1ELJA 5KCJA 5I57A 1B0LA 2ZYOA 1EU8A 5CM6A 4ONYA 4BLAA 4R74A 4LZ7A 1YTVA 1AOVA 3CG1A 4KHZE 3OSRA 5HPQA 3TTMA 3M3KA 3WAFA 4Q5TA 3MVXA 5ITOA 4GL8A 3UGWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AS4A 1Y20A 1M5EA 5I2KB 2PT2A 1M5CA 2NXOA 4BDNA 4QFOA 4F2OA 1XVYA 3KN3A 5HBCA 2GQ1A 2Q8JA 4MNPA 1IMDA 2DE4A 3Q29A 3H6TA 3AXFA 1SW1A 2QS2A 4WKMA 2QS1A 3PUVE 1YAEA 2I49A 4EUOA 3U92A 1R6ZA 4R75A 5ICQA 3IAZA 4N81A 2ZZWA 3TEPA 3O6HA 1D4NA 5ELVA 2NUVA 2ZYNA 4IO3A 4GOTA 2BJIA 4O94A 4IY5A 3B50A 1SW4A 1MS7A 3MZ9A 5F24A 4OA4A 2X7PA 3GYYA 1TFAA 4RK9A 3G3HA 3ECRA 2RC7A 3IJOB 4R2FA 1LFHA 5I2KA 4OFOA 3N6UA 2BJJX 2W7YA 2PYYA 4GLIA 3PUWE 2JJKA 1MRPA 1MPDA 2B3FA 2KQZA 5IAIA 1FQFA 1FPDA 4E0XA 4RJZA 1QULA 3G7WA 3HFUA 1IMEA 1Y4CA 2NVUB 1BTJA 2ONKE 4QFKA 1B7ZA 4YKPA 1IQ7A 3RN8A 4POXA 1ZTYA 2DSFA 3EHSA 4OFLA 2F6PA 5ITPA 1FTAA 3SEYA 4GXSB 4ELQA 2F5XA 3SZPA 4MJOA 1FSAA 1NH7A 1OVTA 3KN8A 1PB9A 4ZE9A 2YPNA 1FQAA 5FHMA 4OFJA 1XT8A 1ZJLA 3KBRA 3HPIA 1YYZA 2HAUA 2FVZA 2XWKA 1ATGA 3SEWA 3B6QA 4OQOA 1TFDA 3T9XB 2HXRA 5I7IA 3OOAA 1Z7NE 4H1XA 4P1EA 4GX6A 4QHQA 4PCDA 3TODA 2X26A 1JETA 4H0WA 3B6WA 2Q74A 4DCXA 1YPNA 4O7MA 4G68C 4X9TA 3DP4A 3FV1A 1M5BA 1H43A 3VFJA 3GZGA 2DWIA 3RGYA 2DWJA 1MM6A 2QRYA 1GR2A 4PE3A 4U23A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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