4N13A

Crystal structure of psts (bb_0215) from borrelia burgdorferi
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
255
structure length
253
Chain Sequence
EKIVSIGGSTTVSPILDEMILRYDKINNNTKVTYDAQGSSVGINGLFNKIYKIAISSRDLTKEEIEQGAKETVFAYDALIFITSPEIKITNITEENLAKILNGEIQNWKQVGGPDAKINFINRDSSSGSYSSIKDLLLNKIFKTHEEAQFRQDGIVVKSNGEVIEKTSLTPHSIGYIGLGYAKNSIEKGLNILSVNSTYPTKETINSNKYTIKRNLIIVTNYEDKSVTQFIDFMTSSTGQDIVEEQGFLGIKT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Sequence, biophysical, and structural analyses of the PstS lipoprotein (BB0215) from Borrelia burgdorferi reveal a likely binding component of an ABC-type phosphate transporter.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Borrelia burgdorferi
molecule keywords Phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding pro
total genus 87
structure length 253
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n13A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n13A01
1USYE 3EHSA 4JWOA 2UVHA 2XXWA 3W15C 4AB6A 1MQDA 1XOCA 2VD3A 2Y7WA 1GVCA 3TQWA 2FNCA 4OFLA 4PFUA 3T9VA 1L5TA 4N6PA 4P0GA 4X1BA 3GBBA 4QSCA 3SEWA 4ZE8A 3K6VA 2XD2A 1II5A 1VFEA 4EDPA 1JVYA 2A5TB 3TTNA 2R6GE 3MP8A 4ZDMA 3S9NC 3Q27A 5TPAB 1SW5A 1YAEA 3T9UA 3HO7A 3KJ7A 4RY1A 5H8FB 2F7BA 3I3VA 2Y7KA 1BTJA 3CIJA 4POXA 3I6VA 1MH4A 4XIGQ 2Q8JA 1ZIUA 3TCFA 4IO3A 1QKBA 4YKKA 1O63A 2ZNSA 3CVGA 1D9VA 5KCJB 2ZMBA 2O84X 1SW2A 1IXIA 2DXRA 2YPNA 3ZS6A 4G4PA 1R9QA 4OXVA 4C0RA 4NF8B 4PETA 3IAZA 3KSJA 3QSLA 3VLWA 4EXLA 3FUZA 4UA8A 3VVEA 3DP8A 2X7PA 5DVIA 1SDXA 3KEIA 2O69A 1MY0A 4F3BA 5ICTA 4RYAA 4LQ5A 4R2BA 1FCKA 1YPNA 3SEYA 2THIA 3JZJA 1LAHE 3TTKA 1Y3NA 3PMVA 4KYSA 3F11A 3S9MC 4G68A 2R71A 2LAOA 1B3LA 5CMCA 1A99A 3MW0A 3OO8A 1QULA 1LAFE 3WAFA 4N07A 4ELRA 3K0VA 4E0WA 4F3SA 4P11A 1MRPA 2QRYA 1LCFA 3B6TA 1SW1A 4MFIA 1B7UA 4MBPA 1DPEA 4NTLA 4U2RA 4OHNA 2IA4A 3N5LA 2ONRA 1WODA 3U93A 5AA4B 4GWOA 2NOOA 4X48A 3MZ9A 3KG2A 3HV1A 1ZMGA 1B2HA 3MZ1A 1NNPA 4DCYA 3K4UA 2ZNUA 1EH3A 3OELA 3O9PA 1EZ9A 1N04A 1QJMA 5ICQA 4PFTA 1POTA 3PPOA 4OESA 1ZLQA 1Y3PA 1EU8A 3SERA 3U92A 2PYYA 2HFBA 1MY2A 1YTVA 1PBPA 4KD5A 3K6UA 4F31B 1MQJA 2V84A 5I2KA 3HHFA 5HBCA 3MVYA 2F5XA 2XXRA 1NNKA 2OBGA 3OO6A 3KZGA 4R75A 3OOAA 3JV9A 1SD3A 2B3BA 1Y4TA 5CBRA 2AL4A 1GR2A 3JYRA 3MUQA 3KFMA 4GD5A 1LAXA 1UIVA 4QFLA 1B46A 4F29A 1MS7A 4NWDA 4H5GA 4KCCA 1MXZA 3PU5A 4LZ7A 1VE4A 5H8NA 1PBQA 1PB7A 3D4GA 3K1NA 3E4RA 2XX8A 2V25A 2XHDA 1JQFA 1M5FA 3FVNA 4EQ9A 2CZLA 4QFOA 4ZECA 3QUFA 4WEPA 4R9FA 1H45A 4IGRA 2RC8A 1MDP1 3KBRA 3T22A 1CE2A 3MZBA 3FV2A 2UYFA 3KOSA 2QS4A 1LFIA 5I59B 5A5XB 3S9EA 4BLAA 5CMMA 3FIRA 1LGBC 3IR1A 1SI1A 3VE1B 3UGWA 4E0XA 5CRYA 4POWA 4OWDA 1DTGA 1IIWA 1B9JA 3GBAA 4F3GA 4F1YA 2H4IA 3ZKKA 1LBCA 3PPNA 3M8UA 3SETA 4ZE9A 3MAMA 3OSRA 4OMBA 3Q25A 2DE3A 3PPPA 3CFLA 3C4MA 1RYOA 4GL8A 2F7CA 2ONSA 2OZZA 3GZGA 2DWJA 4GQOA 2A5TA 5HM4B 4R73A 3MVWA 5TPAA 2Q2CA 3KN3A 1MM6A 1B4HA 3K2DA 4NF6B 4OERA 4Z0IA 3DP4A 1MPBA 1POY1 3RT6B 2XXPA 5BWJA 2XD3A 2UVJA 1Q1KA 2H99A 3HCQA 3TELA 3TEPA 4DXUA 3K6XA 2UVIA 4QF9A 2AIXA 2I3WA 1ATGA 2UYEA 1UTHA 4H5FA 4PFWA 3S9LC 2KLFA 3QXMA 4RJZA 5DEXA 4NWCA 4EF1A 5TP9B 1PB9A 3QAXA 3EN3A 4TLMB 2F6PA 2V3TA 3UP9A 2VOZA 4GVOA 4ZS9A 5DVJA 4DIGA 4BDOA 3GXAA 4ZEDA 1Y9UA 3FXRA 2IEEA 4DE8A 1SVXB 4KI0E 1AIVA 3QUJA 5FTIA 5I56B 3BKIB 1NNTA 2Y84A 4H8IA 1F9BA 3K6WA 5ITPA 3UN6A 5CMBA 4G8MA 1N0TA 4RK9A 1P1QA 1B4ZA 1B5IA 3VVFA 1B1XA 4OFOA 2RC9A 4F1VA 2DP8A 1B40A 4Q5TA 3S4UA 3N6UA 2VHAA 4FE8A 4I9DA 1BIYA 2QSXA 2RF1A 1VSOA 4LQ2A 1O64A 2Z23A 1N7WA 3FVKA 2XXHA 3QYTA 3IJXB 3A3UA 4FJPA 2F78A 2UVGA 3KN8A 5AA2D 4KYDA 2YLNA 2D21A 2OWSA 2H98A 3PUZE 3PMWA 1D3KA 4WEDA 1URSA 1FQAA 1OVTA 1B58A 2ABHA 1TXFA 3N26A 2V3QA 3E3KA 1GV8A 1TFDA 1SYIA 1LFGA 4ZEIA 3CFZA 4QSEA 3CSBA 2RKMA 1ELJA 2VP1A 1MH3A 5I58B 1QUIA 2RCAA 1A7LA 4G68C 4EUOA 1LB8A 1QKAA 4YAHX 1Z7ME 2GHBA 2M8CA 4N13A 2PMSA 2ZNTA 1SI0A 4THIA 1BKAA 3TFLA 4FECA 2HQ0A 3TUSA 2ZXTA 1R9LA 3UA8A 1B51A 2RC7A 3PD9A 2AL5A 1DMBA 2DVCA 1MXVA 2Q2AA 4QSDA 4YKIA 1XC1A 3MP6A 4P0IA 2DQVA 3PMXA 1IXHA 5J1DA 1LBBA 1ANFA 3HPIA 3V83A 1MY3A 1OVBA 4MH5A 1T0KA 1XS5A 2OLBA 5K2YA 4GXSB 5AA1A 1FQBA 1QUKA 2X26A 3LSLA 5M2VA 4ESWA 2D5WA 4RXLA 1M5DA 3G3IA 1I69A 2H5YA 4LZ5A 1LB9A 5H8HB 3CR9A 3OO9A 2O7IA 1MPCA 3IOUA 2PX1A 4PQJA 3PUYE 3T93B 1M5CA 5I2NA 1TT1A 1IQ7A 1NH8A 4IY6A 2G93A 1JEVA 1B3FA 4ZZAA 4F22A 4AQ4A 1B52A 4BDRA 3OXNA 3K00A 4QFPA 4HCYA 3I5OA 2F97A 4U1ZA 4Q8RA 2I3VA 1TFAA 4QFNA 1PB8A 3IJOB 4OEVA 4JB7A 5L9MA 3TTLA 4OTEA 4NF5B 5AA3A 4C1TA 3O2AA 4YB7A 3T9XB 4F2QA 3MVZA 5I57B 1ZU0A 3M3FA 1ZKBA 2E0SA 4IO2A 1QUJA 3RPWA 1NH7A 3A09A 1J1NA 2O68A 3FXUA 1QW0A 2ONKE 2WKYA 4XKNA 4XKPA 4JBZA 3RGYA 1MDQA 3U8QA 4YB5A 4F3PA 4DCXA 3Q26A 3D4CA 2DSFA 3B7DA 5F1QA 1B0HA 1Y4CA 2P2AA 3OSQA 2Q89A 3CI8A 2Q88A 1H76A 3PUWE 3N6TA 1MY4A 4HTGA 2PBWA 5BUUA 3IB0A 4Q30B 3VLVA 4HCWA 4LP2B 2V93A 3ONMA 3TZAA 3RLFE 2XXXA 1PEBA 1UTBA 3IL1B 2Y7IA 3FVGA 2X7QA 1FTJA 3V89B 5I56A 4EF2A 2ALUA 2F8DA 2O6AA 2NVUB 2OJTA 4KCDA 1A8FA 3FXQA 3H6VA 2RCBA 2REGA 2DYXA 3TCHA 4YKPA 4OETA 5FHOA 3G3GA 1H43A 1XVXA 3MP1A 5AE4A 4IB2A 1AMFA 2HXWA 2DOJA 1NNFA 1IITA 2DE4A 1BLFA 3TDJA 3BBRA 3LUYA 3FJ7A 3RN8A 1B6HA 2B65A 4GLIA 4LA9A 3MWBA 4QHQA 1P1UA 1UQWA 4ZEKA 1HSLA 2VGQA 3T66A 5KDTB 4ZEBA 1B1HA 5H8SA 4ISUA 4F2OA 5AA2B 3LR1A 1NL5A 3TTMA 4ELQA 3UIFA 4JWYA 3K1PA 2I48A 1JEUA 3TMGA 4G77A 3FD3A 3TYHA 1FQDA 3DLNA 3RUMA 5ISUA 4PP0A 4EXKA 5HPQA 3VDFA 3TPAA 1MY1A 2G29A 5B7DA 5IKBA 4GXAA 1FTLA 1LFHA 3FV1A 1IXGA 4XTCQ 4G68B 3C9HA 5H8FA 4X1DA 2P0SA 4R72A 1Y1MA 4F39A 1DOTA 4G8NA 4IGTA 3WAEA 3O28A 2HCAA 1JW4A 1CB6A 4G2ZA 5KCJA 3K02A 3OENA 1A55A 3U94A 3C33A 4KR5A 3FATA 4ELOA 4H67A 2O7UA 3ECRA 3P7IA 1MQHA 3EF7A 5H8QB 4NF8A 4HW8A 1P1NA 2F36A 3DELB 3PGFA 3HHGA 4U21A 4H8JA 1DPPA 4NMYA 2QS3A 2XX9A 3LSWA 2O1MA 3C32A 4BDQA 4PE5B 4BDLA 4DXCA 1DSNA 1FW0A 3RTFB 2I4CA 1ZJLA 1Q35A 1A54A 1GGGA 2P1SA 2VD2A 4FIMA 3W9WA 4U4XA 3CRBA 3TQLA 1B32A 4ND9A 4ECFA 4M1VA 4OZ9A 3MQ9A 3PUXE 5FTHA 4I1DA 2ZYOA 2F34A 3CSGA 3FJMA 4X9TA 3SEUA 2V3UA 3OMBA 4NF5A 2DVZA 4JSDA 3IORA 2OK2A 5AA4A 4TOZA 4DXBA 5H8NB 1JETA 5FHMA 1O7TA 2ZYKA 1XHYA 4WXJA 3VLUA 3E9XA 2B3FA 1Y1ZA 1WVJA 1MXUA 1FQEA 3QIMA 1MQGA 3SKPA 3TODA 1GTKA 3H7MA 2OCUA 4YKJA 4F18A 2A5SA 3UK4A 1SQYA 4ZZEA 3C36A 1MG1A 4WKMA 4GF8A 2REJA 3W9VA 3C34A 4GIZA 4UACA 1B0LA 1IEJA 4ELPA 3USDA 4YU0A 1B3GA 5CI5A 2RINA 1P99A 2FA7A 3IO6A 1A8EA 3O6GA 1B7ZA 1H3DA 2QJEA 3QK6A 4O3BA 5DT6A 4YICA 4C1UA 1M5BA 3VXBA 3UORA 3E13X 1D9YA 2XXIA 1P1WA 3IOVA 2I0CA 3G3JA 4NE4A 1MXXA 4NF4B 4H1XA 2QMWA 4ESXA 1QVSA 2Z22A 4XKRA 1AH5A 4KHZE 1MM7A 4IO4A 4O3CA 1P1OA 4MF3A 1Y3QA 3IOTA 4ZEFA 1BP5A 4U23A 1OLAA 4U1OA 1R6ZA 4Z7EA 4OENA 4GOTA 3O6IA 1LCTA 1MQIA 1S7YA 5DVFA 3KOTA 4LVQA 5I84A 3PD8A 5F7VA 3H3GA 4TQUQ 3ILUB 3MPKA 2XXVA 1RYXA 1FTOA 3U72A 5CBSA 3O66A 5I59A 3H03A 5A5XA 1RKMA 5JTYB 3KGCA 5FHNA 1ZBMA 1UIUA 5KDTA 1US5A 4R6HA 1S50A 4PFYA 5AA2A 4LUBA 1DTZA 3H6WA 3IO4A 1B05A 1UTHB 1URDA 3T9HB 3CFXA 4DZ1A 4BDNA 2Z8FA 5DEXB 5IAIA 4R2FA 5K2XA 2AYSA 2XXQA 4R74A 1B5JA 3V5AA 3KN7A 1D4NA 2R9JA 4H0WA 4NF6A 1VR5A 1SW4A 2GH9A 4RPNA 3T96B 4IY5A 5L9SA 4RK2A 4R6YA 4QRZA 3OD7A 3FASA 2GHAA 3MPLA 2I49A 3L6GA 3O97A 4KQPA 4YB6A 3VVDA 3IB1A 2HAVA 1IXCA 3N94A 3ZKLA 1PDAA 5H8QA 1MXYA 3S2VA 3VFJA 4OVJA 2FYIA 4O3AA 1VFDA 1EZOA 3EPEA 2HZKA 4OFJA 3EHUA 5EHSA 5JEIA 4JSOA 5TP9A 3C31A 2I58A 1I6BA 3H6UA 1FTKA 3SEVA 2QS1A 5L9OA 1AL3A 1N76A 3K01A 3LSXA 3Q28A 3EQ1A 1I6AA 2XXUA 3MVXA 4ONYA 1HSEA 3H6TA 3RTWB 2H25A 3SEXA 4LATA 4I8CA 1B3HA 1AOVA 4BDMA 2E1SA 1KWHA 2NWJA 4FORA 1YCJA 3FJGA 3LC8A 2D3IA 2QS2A 4YZZA 4F19A 3IK6B 3O29A 3LSFB 3RQTA 3M3KA 3DM0A 4DDDA 2BJJX 3H4ZA 1NMUA 3R6UA 2XXYA 2Y7PA 4Q0CA 1S9TA 3C35A 3B6QA 4RA1A 3CG1A 2Z8EA 1OIBA 4MLVA 3L6HA 2NUVA 3G3KA 3KJTA 1LAGE 3TAJA 3LBSA 3DP6A 4FEDA 1XT8A 3PPRA 4KFQA 3G7WA 4F1UA 5JK4A 1USYH 2I0BA 4K3FA 3R7XA 4YMBA 4TLLB 4GRKA 3OO7A 1JNFA 1FQFA 4JWXA 1N7XA 2QPQA 4L17A 4FATA 3B6WA 3TKDA 3FZVA 3RT8A 2DXYA 5I58A 3H06B 4OEUA 2F6GA 3MBPA 1OQGA 5KZTA 5TU0A 3EHTA 2F35A 1N3WA 2ZYNA 1JW1A 1FQCA 5I2NB 2O1LA 3BFTA 2DWIA 2HZLA 3IB2A 4NF4A 1M5EA 4RPOA 1H44A 2H9BA 2ZYMA 3ILTB 1Z7NE 2XXTA 4LZ8A 2ANJA 5CC2A 2DWAA 4XXUA 1MPDA 3OEMA 3VXCA 4AB5A 1IUDA 2PT1A 3A3CA 4R6KA 2GRVA 4EQBA 4LONB 1MXWA 2PVUA 5DTBA 3FVOA 5ITOA 5JTYA 1B3EA 3Q29A 3PPQA 3KSXA 4GFRA 3PV0E 5DYHA 3RNNA 1A40A 4IO6A 4RNSA 4YMAA 3PUVE 4FEBA 1SYHA 2Y7RA 5CMKA 1OMPA 1PC3A 5H8HA 3O6HA 5LOMA 3M3LA 4MLQA 3FGSA 3ODBA 4EQ7A 4JXIA 5L8DA 1Y20A 4H6DA 1NFTA 3U1OA 5EYFA 3IX1A 3ZSFA 2QL3A 1R1NA 3CG3A 3IOWA 5I2KB 3HSTA 4M4GA 4QFKA 2F7AA 3G3HA 2DE2A 2Z8DA 4R9GA 4IO7A 2YJPA 1I6QA 3AXFA 4KYEA 3TCGA 3G3FA 3R26A 1UTBB 2UXAA 4IO5A 1LLSA 4GL0A 1HSJA 3BFUA 1OQHA 3GLBA 3V8XB 1LSTA 2GFEA 3SESA 4KPTA 4U4SA 4JDFA 1NKXA 2DWHA 4U22A 1US4A 3HN0A 3SDFA 1URGA 5CM6A 3THIA 2XX7A 2O51A 4HS7A 2I6EA 5I57A 2Q9TA 2DS9A 2HEUA 1IZ1A 2I4BA 2QMXA 4NEDA 3OEKA 4XKQA 1B7HA 4FAJA 1JVXA 1XVYA 1N84A 2PT2A 1FTMA 1JW5A 3K1MA 2W7YA 2OWTA 5ELVA 3TTRA 4I62A 4H65A 4OQOA 1SBPA 1WDNA 3VV5A 4G8HA 5B70A 3MJNA 3MC2A 1B5HA 2ESNA 1TWYA 3RY3A 1EZPA 5EHMA 1OLCA 1N3XA 2CMOA 4DLDA 4OYVA 2HAUA 1ZTYA 2NXOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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