4NF4A

Crystal structure of glun1/glun2a ligand-binding domain in complex with dcka and glutamate
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
284
structure length
277
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Insights into Competitive Antagonism in NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
total genus 75
structure length 277
sequence length 284
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf4A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf4A02
3H4ZA 3Q26A 2PX1A 3QAXA 1FTKA 3UGWA 1NNFA 1B3EA 1NKXA 1SYIA 1Y1ZA 4GF8A 3R7XA 4PFUA 3K6XA 3MVYA 4H6DA 4DCXA 4KQPA 1GR2A 1UTBB 4ZZAA 3CFLA 3TCHA 3D4GA 1UIUA 4OEVA 1N04A 2RC7A 3M3KA 4U21A 3RQTA 2O6AA 5DEXA 4QF9A 4P0IA 1ELJA 2HXWA 1D9YA 2O1LA 1PB9A 2LAOA 4EUOA 4DLDA 1IEJA 3N6UA 3KN3A 5H8HB 2ZNUA 3IOWA 4WEDA 4JXIA 1LFGA 1SW4A 4RA1A 4R74A 3OEMA 2PYYA 4WKMA 4H65A 1N84A 4XXUA 1LFIA 3GZGA 3KGCA 4RXLA 4U4XA 2H99A 3MZBA 1LAXA 4GRKA 1IUDA 1SD3A 3A3CA 4Q5TA 3HHFA 4GIZA 1B6HA 3FASA 3W9VA 2D3IA 1MH4A 1YAEA 3EN3A 4H67A 3QUJA 2I0CA 4RPOA 4NTLA 1IITA 3E3KA 3D4CA 2FYIA 2GHBA 2V25A 5IAIA 3LSXA 5H8NB 4EQBA 3LUYA 1NFTA 1RYXA 3CI8A 2DWIA 3FATA 4XKRA 3RN8A 5CM6A 1CE2A 1B2HA 3K6VA 3U93A 1B40A 3IR1A 1M5BA 3FIRA 3H6UA 1QULA 2IEEA 2OWSA 4G8NA 3ZKKA 4X48A 2DWHA 2R71A 2XX9A 3B6WA 3MAMA 4OMBA 1MXYA 3JYRA 1MY0A 2OBGA 3MP1A 4ND9A 1B3FA 1TXFA 3PUVE 1GVCA 2ONSA 1SBPA 3DELB 3UN6A 4XIGQ 1ZKBA 2XD3A 2P0SA 2Z8DA 4YMAA 4F22A 3CSGA 2QS4A 1LGBC 3QSLA 3RGYA 4JDFA 1VR5A 2B65A 4JWOA 1P1NA 3TZAA 3LSWA 4R2BA 4LQ5A 1SVXB 3QUFA 3QXMA 3ZS6A 3CR9A 3ZSFA 2OCUA 4G77A 3PPOA 3RPWA 4IO4A 1IXGA 5EYFA 3ONMA 4IGRA 2F6PA 3DLNA 3CSBA 1FW0A 1B0HA 3I5OA 2DWAA 2Y7WA 3K4UA 3IOTA 2X26A 1H76A 5H8QB 1H45A 1AL3A 4DCYA 2DQVA 2XHDA 1MG1A 3EHSA 5EHMA 3K1NA 4JSDA 3IB0A 1JVYA 3PU5A 2GFEA 4OHNA 3BFUA 4MH5A 2V3QA 4OWDA 2Z22A 1VFDA 3SEUA 3T9HB 3O29A 4R6HA 3BFTA 3EHUA 1USYH 2YJPA 4QRZA 5L9MA 3TTMA 2ONKE 4XKPA 3PUXE 5K2XA 1JETA 4R2FA 1FTJA 1B46A 1S7YA 1MXZA 1MY4A 1UQWA 2GHAA 1B58A 2P1SA 4ZEBA 3C35A 3FD3A 1II5A 5KCJB 4BDMA 3QYTA 4IB2A 3G3HA 4GD5A 5FTIA 4IO6A 3IJXB 3FJ7A 2ZYKA 3FUZA 1OIBA 3TTKA 2X7QA 1MM6A 1MY3A 3VLUA 4ELQA 2QMXA 4MF3A 4OYVA 3CG1A 4N6PA 1ZBMA 4U23A 4LUBA 3TCFA 5I57B 3GXAA 5H8QA 3USDA 4NWCA 2QPQA 4RY1A 2HZLA 5TP9A 4FIMA 5KDTB 4KI0E 2XXHA 2I48A 4X9TA 2GRVA 1N0TA 3A3UA 5CC2A 1QKBA 2F6GA 2ZMBA 4FAJA 2XX7A 3IL1B 2DVCA 5B7DA 4GVOA 2QJEA 3KN8A 2HFBA 2XXTA 4U22A 1LAHE 1P1UA 4MLQA 1PB8A 5H8FB 2XX8A 1XS5A 4EQ7A 2Z23A 1NNPA 3DP4A 1B7UA 3MZ9A 4OXVA 4IY5A 1I6QA 2CMOA 2DVZA 2FNCA 3R6UA 4OZ9A 3RTFB 4C1TA 2XD2A 3VVEA 1MXXA 1GGGA 4F3GA 4JSOA 2UVHA 4BDRA 3S9LC 1A8EA 5ICTA 3V83A 1P99A 1NL5A 3HSTA 2VP1A 4WXJA 3SKPA 2PVUA 3HPIA 2Q89A 1UTHA 4XTCQ 5TPAB 1M5FA 3O6GA 1YCJA 1O64A 1B0LA 3KEIA 2I3WA 1N3XA 1IXCA 4ZZEA 4NF6B 4JBZA 2W7YA 1NNKA 1MXWA 1BKAA 3S4UA 1N76A 5I2NB 3MP6A 3SEVA 3G3KA 1YTVA 1BP5A 4HS7A 5L9SA 4ISUA 5I2KB 3LR1A 3RUMA 1R9LA 2ESNA 2O51A 3F11A 1EZOA 5LOMA 3N94A 4GLIA 1AMFA 3A09A 1Z7NE 4NEDA 4POWA 3TYHA 3TCGA 4OESA 3FVKA 4XKNA 4IO2A 4PP0A 1DPPA 1XT8A 3THIA 1LSTA 1JVXA 3RT8A 4DIGA 4POXA 5CMCA 3FVNA 3EHTA 3H7MA 5I56A 3VE1B 3GLBA 4JWYA 4LONB 4R6YA 3C9HA 4MBPA 1Q1KA 5AA2A 4ZDMA 1MH3A 5JTYB 4PFWA 2RC8A 5I59B 2YPNA 4G68B 1LFHA 2A5SA 3B7DA 1MDQA 4QFOA 1SW5A 3OO6A 2QMWA 3B6TA 3W15C 2VOZA 1SQYA 1LB9A 3TKDA 3OD7A 2NUVA 2RF1A 3G7WA 1FQFA 3E13X 4TLMB 1AH5A 4H5GA 4DXCA 1MPBA 2M8CA 4HTGA 3PUWE 4HCWA 3S9EA 2YLNA 4F1YA 4O3AA 2THIA 5I2KA 1OVTA 4N13A 1LBBA 2OWTA 2ABHA 3MJNA 2G93A 2XXVA 1EH3A 4ZE8A 4F19A 5I84A 3AXFA 3MZ1A 4ELOA 2REJA 1R9QA 4YB7A 4JWXA 3TTNA 4R9GA 2H4IA 3OENA 3M3LA 1AIVA 4GOTA 3VV5A 1OMPA 4R6KA 1PBQA 2DOJA 2F8DA 1MPCA 1IZ1A 1B3LA 4OQOA 1ZTYA 4YKIA 4Q8RA 1Q35A 1O7TA 3U8QA 1Y20A 1B4HA 5JTYA 4LZ8A 4PE5B 2DS9A 3HHGA 1UTBA 1S9TA 4H1XA 3SERA 4F31B 2OJTA 1I69A 4GL0A 4DXBA 1EU8A 3MC2A 1POY1 3OO8A 3PMVA 4N07A 5CMBA 3PMXA 4NF4B 1J1NA 4ZEFA 4PETA 5FHMA 3P7IA 1DOTA 4OVJA 3EPEA 1P1WA 3L6GA 2OZZA 4R9FA 1VSOA 3TEPA 2I49A 5H8HA 1T0KA 4I1DA 1SW2A 1PBPA 2HAVA 3IB1A 3UK4A 3OELA 3K1PA 1Y4CA 1OLCA 2UXAA 3V89B 4ELPA 5KZTA 2QS2A 3CG3A 3KBRA 1A54A 1JW5A 4BDNA 1FQDA 3VXBA 2DYXA 2A5TB 4QFPA 3TUSA 4MLVA 5CRYA 3VLWA 4KFQA 1SI0A 3C34A 3KJTA 1B05A 1Y3NA 1MXVA 4TLLB 4YMBA 1I6AA 4F18A 3PV0E 4RNSA 3JV9A 1ZIUA 4EQ9A 2FA7A 3U1OA 4E0WA 1R1NA 3MUQA 3O6IA 1XVXA 3HCQA 2F7AA 2B3BA 3TQWA 4G2ZA 3QIMA 1D3KA 2UYEA 3K2DA 1NH7A 2QL3A 4RYAA 1A55A 3W9WA 2H25A 3KZGA 4KYEA 5H8NA 4F2QA 4KCDA 4U1OA 5DYHA 5DTBA 2P2AA 1US5A 3N6TA 1DTGA 5CMMA 1ZLQA 2UVIA 4FJPA 1MQGA 2DXYA 4FEDA 4RPNA 3V8XB 3H6WA 3KJ7A 3IO6A 3PMWA 1Y3QA 2NWJA 4LZ5A 2IA4A 1OQHA 4NWDA 1MQDA 3PGFA 3LSFB 1TWYA 1ZU0A 1MXUA 1B1XA 3FVGA 3SEYA 1YPNA 4GL8A 3LBSA 2ANJA 4E0XA 1HSLA 5AE4A 4BLAA 2F97A 4KYDA 3ILUB 2DE4A 4FORA 2QRYA 4NF5B 3UP9A 3B6QA 3H6VA 1IXHA 1GV8A 3EQ1A 3DP8A 1GTKA 1PB7A 1LAGE 1B5IA 1KWHA 3TDJA 3O6HA 2UVGA 4F3SA 1JNFA 1DTZA 2D5WA 4JB7A 1JEUA 4G8MA 2Y7IA 2I0BA 3Q29A 2BJJX 4OENA 2Y7PA 3SDFA 3FJGA 3KOTA 3OEKA 4H8IA 3GBAA 2XXQA 4LQ2A 4M4GA 1S50A 2Y7RA 2X7PA 3K0VA 4ELRA 1VE4A 3Q25A 4PQJA 3MPLA 4U1ZA 3E4RA 5ITOA 1M5DA 4O3BA 3FV2A 3HO7A 2RCBA 5ISUA 3ECRA 2OK2A 4I9DA 5ELVA 4F3BA 5K2YA 1UIVA 3K6UA 1XOCA 1IXIA 3MVWA 3WAFA 1IIWA 3S9MC 2R6GE 4FATA 4PFYA 4KPTA 4THIA 4YAHX 2GH9A 3C32A 3IJOB 3Q27A 1B5JA 2Z8FA 4QHQA 3OO9A 3KG2A 2I4BA 4K3FA 2CZLA 3RLFE 4F3PA 1JEVA 3IAZA 4NMYA 2E1SA 1WODA 2F34A 1A40A 1EZ9A 4OETA 4QSCA 3V5AA 2D21A 1XC1A 1TFDA 2H9BA 3C33A 3FV1A 1Y1MA 1I6BA 3PUYE 3VVFA 1NMUA 2HAUA 1L5TA 2I3VA 3RTWB 5KCJA 2QS1A 3MQ9A 2KLFA 3PPNA 4ZE9A 3PPPA 4C0RA 5BUUA 1FQAA 3G3GA 2OLBA 5HPQA 3DP6A 4O3CA 1DPEA 4QFNA 1PEBA 3DM0A 3H3GA 5CI5A 3IOVA 3T66A 3FVOA 4KHZE 2ALUA 2F36A 1B3HA 3S9NC 5I57A 3ODBA 3T22A 1FTMA 4Q30B 1O63A 5KDTA 1OQGA 3BBRA 1XHYA 1QUKA 3SETA 2UYFA 4MFIA 2V3TA 1SYHA 3TAJA 4NF8B 2F5XA 4ZS9A 4Z7EA 2F78A 1ZMGA 3TMGA 2UVJA 4OFJA 4OERA 5AA4B 3U72A 2ZNSA 4U2RA 2F35A 4FE8A 1MM7A 2DXRA 4NE4A 2DP8A 5A5XB 4ZEKA 5H8FA 4P11A 2ZNTA 1Y3PA 3N26A 3H03A 3FJMA 4G68C 3TODA 3VXCA 3K00A 4QSDA 5FHOA 2NVUB 1MDP1 4DZ1A 1MQHA 1HSJA 3IO4A 5TPAA 3ZKLA 1P1OA 4EF2A 2AL5A 1EZPA 2RC9A 2ZXTA 2Q2AA 4NF6A 5I58B 1MY2A 2O1MA 3K6WA 3K02A 5I2NA 5JK4A 4QSEA 4C1UA 4I8CA 4GQOA 4IY6A 1URGA 4NF8A 5F1QA 5AA4A 3PUZE 4RJZA 1TFAA 3VVDA 2PMSA 1N7WA 1VFEA 2DE2A 4OEUA 5J1DA 3PD8A 1IQ7A 5A5XA 4F29A 1FTLA 4GFRA 3MPKA 1NNTA 3MWBA 2R9JA 1M5EA 4H8JA 5FHNA 2XXYA 3OOAA 3O9PA 4OTEA 5AA1A 1URSA 1LB8A 1B9JA 1LCTA 1POTA 2Y84A 5I59A 4YB6A 3FZVA 4G68A 2REGA 4LZ7A 1H3DA 1DSNA 2RINA 1SW1A 2ONRA 2DE3A 2Q88A 3FXRA 5DVFA 5M2VA 2DWJA 1TT1A 4G4PA 1BIYA 3E9XA 4EXKA 3I6VA 2VD2A 3O28A 5I58A 2O7UA 2Q8JA 2ZYMA 4GXAA 1PDAA 3BKIB 5DVJA 2O84X 4I62A 1URDA 1MY1A 5TU0A 3HN0A 3WAEA 3O2AA 3PD9A 4Z0IA 2XXRA 1LLSA 1A7LA 2ZYOA 4P0GA 3IX1A 4LP2B 2XXXA 1LBCA 3GBBA 3I3VA 3U92A 3CIJA 1BLFA 3H6TA 5F7VA 3O66A 1BTJA 3TTLA 4EXLA 2PBWA 4DXUA 5CBSA 1M5CA 4F39A 4G8HA 4YZZA 2O7IA 4H5FA 1AOVA 1QKAA 1QUJA 2PT2A 1XVYA 4FEBA 2PT1A 3T9UA 2Z8EA 1QUIA 4DDDA 4RK2A 1B32A 1F9BA 4QFKA 4ECFA 3MVZA 2NOOA 1ZJLA 3UIFA 3HV1A 3KOSA 3FXUA 4WEPA 2O69A 4F2OA 3H06B 1B51A 4XKQA 4NF4A 2F7CA 2Y7KA 3KSJA 3K1MA 2XXWA 1SI1A 1FCKA 2I6EA 2E0SA 3JZJA 4TOZA 4IGTA 4UACA 4AB6A 1Y9UA 1D4NA 1B52A 4EDPA 4RK9A 2V84A 2RCAA 3TQLA 5FTHA 1LCFA 3O97A 4YB5A 2A5TA 3VDFA 4Q0CA 3RY3A 3RNNA 3T93B 2I4CA 2QS3A 5CMKA 5ITPA 2DSFA 1A99A 1LAFE 1B7HA 1Y4TA 2XXIA 3OO7A 3C4MA 4BDLA 3MVXA 1FQCA 1OVBA 3EF7A 3MBPA 4YICA 3VFJA 3MW0A 3M8UA 5ICQA 3CRBA 3T9VA 3TELA 5TP9B 1WDNA 3N5LA 3PPQA 2HEUA 4HCYA 4KCCA 1H44A 2NXOA 1RYOA 3G3FA 1MS7A 4DE8A 2XXPA 5DVIA 4BDQA 2V93A 1OLAA 3KN7A 5IKBA 4YU0A 1QJMA 2AIXA 4YKKA 4EF1A 4F1UA 2B3FA 3VLVA 4M1VA 2ZYNA 5B70A 3LC8A 4IO5A 4KD5A 2AYSA 1B5HA 1B4ZA 3SESA 4ESXA 3TFLA 3T96B 4KYSA 4OFLA 1MQIA 4ZECA 5EHSA 4X1DA 4ZEDA 4ONYA 1MPDA 1FQBA 3C31A 4YKPA 4X1BA 3Q28A 4ESWA 4AB5A 3OMBA 2AL4A 3FGSA 3MP8A 1UTHB 3PPRA 4R75A 3OSRA 4GWOA 1JW1A 5CBRA 4NF5A 1B7ZA 4LA9A 4UA8A 2VGQA 4TQUQ 1FQEA 3SEXA 5DT6A 1ANFA 3L6HA 5L9OA 3IORA 2O68A 4BDOA 3R26A 3OXNA 3G3JA 3T9XB 1USYE 4QFLA 2HCAA 3TPAA 3OSQA 4LATA 5BWJA 2H5YA 3CFZA 4PFTA 2QSXA 4IO7A 2G29A 4GXSB 2HQ0A 2Q2CA 3RT6B 3CVGA 1US4A 3LSLA 5AA2D 1RKMA 1WVJA 3UORA 1NH8A 4F1VA 1P1QA 4FECA 2I58A 1R6ZA 1FTOA 2VHAA 2Q9TA 4U4SA 4IO3A 5HM4B 5HBCA 1A8FA 3QK6A 3CFXA 4YKJA 1MRPA 1D9VA 2F7BA 2H98A 1N7XA 1QVSA 5I56B 1JQFA 5AA2B 4L17A 4H0WA 3KFMA 1SDXA 2WKYA 2XXUA 1JW4A 5JEIA 3S2VA 2RKMA 3IB2A 4HW8A 3KSXA 1Z7ME 1QW0A 4AQ4A 3M3FA 4KR5A 5DEXB 5AA3A 1HSEA 3ILTB 3UA8A 3C36A 1DMBA 5H8SA 3IK6B 1MQJA 3G3IA 1B3GA 4ZEIA 1PC3A 2V3UA 4R72A 3SEWA 2VD3A 3U94A 4OFOA 3K01A 5L8DA 3IOUA 1H43A 1CB6A 4LVQA 2HZKA 1ATGA 3TTRA 3FXQA 4R73A 1B1HA 1N3WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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