4TSBA

Structure of a lysozyme antibody complex
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Immune system/hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Structure of a lysozyme antibody complex
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4tsbA00
1GF5A 4XJFA 2H9KA 4OWBA 4H8YA 1VDPA 5LYMA 2D4IA 1QDTA 2I25L 2Z12A 4DDAA 1B5ZA 1LJEA 1JUGA 1HENA 1GB0A 5L9JA 1B7PA 1IC7Y 2MEGA 2Z2FA 1GFGA 1EQEA 154LA 4DWXA 4ETDA 2ZILA 3ZVQB 3N9EA 3F6ZA 1B7SA 4B1AA 1NBZC 1A2YC 1ZVYB 5LVIA 1F6RA 3N9CA 1HMLA 1B7OA 4P2EA 1LJ4A 1LZ8A 4ETAA 4N1CC 5I54A 3TXIA 2DQDY 4WOAA 3WPKA 5F16A 1GB8A 1OUHA 1HEMA 2MEDA 1GB2A 4N8ZA 4QGZA 1NQIA 1KIQC 1AT6A 4RLMA 1GDXA 2D91A 1BB4A 1GBXA 2ZWBA 1BVKC 4H9HA 4NGZA 1HF4A 1LZRA 2HEDA 1GFJA 5F9XA 3W6DA 2FYDA 4B49A 1CKHA 1HSXA 1GF3A 1LSCA 1CJ6A 1I1ZA 1YROA 1GD6A 4W94A 4CFOA 4J7VA 1DXJA 1LSBA 1LSFA 1LHIA 1LZTA 2MEFA 3WUMA 2HU3A 3A93A 1F6SA 5I4WA 3AGHA 3A91A 1EQ4A 1LHLA 1V7SA 3ATOA 1KXWA 1D0KA 1GE0A 2YBNA 4GLAA 1LZGA 4PJ2C 4GN5C 1VAUA 5B06A 4M4OA 5DLAA 1WQNA 4PGJB 1B5XA 2G4NA 4KPMA 1IC5Y 1YANA 1JJ1A 3CQLA 1KIRC 1LSPA 2LHMA 4WM1A 1LZYA 5FSTA 3A3RX 2ZIKA 2Z2EA 4NSHA 1EQ5A 4NGOA 1LKSA 1GBOA 3A90A 1QQYA 4HPEA 4KL7A 3EXDA 3D3DA 2Q0MX 5LAGA 1GB7A 4N0JA 2AUBA 4NSIA 1RJCB 4NGJA 4H9FA 1LJGA 1LYOA 6LYTA 5ILCA 1OUJA 1TDYA 4NG1A 1B9OA 3SP3A 1IY4A 1LSNA 4NEBA 1B7NA 5B1FA 1JWRA 1LZBA 4H9CA 2Z38A 5F9UA 3P65A 4XJHA 1KXXA 1IIZA 3WXUA 2BQKA 1DZBX 1GF7A 4L41A 3WXTA 4O34A 1BHZA 5LA8A 4H8ZA 5KXOA 4C3WA 4NGWA 3A67Y 4ET9A 4PPOA 1GFUA 1Z55A 4MR1A 1DKKA 1IR7A 5B59A 5HMJA 1GFTA 2YBLA 5LYTA 1XEJA 1OUGA 2FBBA 3B6LA 5HQ1A 1WTNA 1BB5A 4II8A 7LYZA 1YAPA 2BQLA 3LZTA 5I53A 5F14A 1NHEA 1RCMA 4M6DA 5KXRA 4LYBA 4WLYA 1VEDA 1B7MA 1LMQA 1QTEA 3AZ7A 2X0AA 1GE3A 1REMA 3ATNA 1B5UA 4RDSA 5LA5A 1TEWA 1JKAA 1JPOA 1T3PA 2C8PA 1G7MC 1IWYA 3LZ2A 1LHKA 3T36A 1IP1A 2DQCY 5AMYA 3AB6A 4WLTA 4XYYA 4YENA 1FLYA 1IWTA 5FDJA 1QDRA 1KIPC 1UCOA 2CWIA 4ANRA 2I6ZA 2YBMA 1LMTA 3LYMA 1LZ9A 1P2CC 1RFPA 3WVYA 1B7RA 4HTQA 4WLXA 1LZCA 1UACY 4AXTA 1GE1A 5T3FA 1CJ7A 4B4IA 1YAMA 1W08A 1IC4Y 1IP2A 1IP6A 1FLUA 3MGWA 1GXV2 1HERA 3EBAB 1QUSA 4GCBA 4HTNA 1WQRA 9LYZA 1GEZA 1GFVA 4XJBA 5II3A 1DPWA 1G7HC 1GAZA 4B4EA 5FHWA 5APEA 1B0DA 3LN2A 1NDMC 4AGAA 1HEQA 3LYTA 2HEBA 1XEIA 1GFHA 5KXZA 1HFZA 1LJHA 1N4FA 1GFRA 193LA 1RI8B 3OJPA 4N9RA 3TXKA 4YF2A 2DQAA 1VDTA 5LXWA 1GE2A 5KXTA 1LAAA 1O23A 1WVUA 2MEIA 3G3BB 1BB3A 1LJ3A 1WQPA 2BAAA 1J1PY 5EBHA 3P4ZA 4ET8A 4ZFPA 1UIGA 1AM7A 2BQBA 2BQEA 4NIJA 1LZ5A 3TXFA 4NHTA 2WARA 4R0FA 2BQOA 6LYZA 1PZYA 4X3BA 2XTHA 3B0IA 2HUBA 3RZ4A 4OOOA 1VDQA 5APDA 4DT3A 4PRUA 4Z98A 1UIHA 4I8SA 4PHIA 1JTOL 2Z37A 2W1MA 3WVXA 4LYCA 1B5VA 1LZDA 2N5ZA 3RT5X 1UUZC 132LA 3AZ4A 1BWJA 3N9AA 5ILFA 1MELL 3W6EA 1JEFA 4NGLA 1PS5A 1YAQA 1JSEA 1OUBA 3TXGA 1LZSA 3W6BA 4A7DA 4LT0A 5IDDA 5LVGA 1SQ2L 3AW7A 1WTMA 1YL0X 1QSAA 1XSFA 5B07A 4Z46A 3AZ5A 1GFEA 4LFPA 5LVJA 1LMCA 3AGIA 1IWXA 5I4XA 4TWSA 2PC2A 1LZ4A 4QY9A 4TSBA 8LYZA 2G4PA 4NFVA 4H9AA 1NWGA 1BB7A 3TMXA 1OUFA 1NF5A 5FEKA 4IJ4A 4OW1A 3WULA 3WW6A 1G7JC 1LKRA 1BGIA 2DQFC 4XJDA 3IWRA 3TXJA 3WUNA 1FN5A 3LYOA 5LIOA 1JISA 1LJFA 4YEOA 153LA 1WQOA 4H9IA 2G4QA 1D6PA 3WPJA 3WYHA 3CB7A 1LTMA 5FCPA 2FBDA 1HSWA 1HFXA 4OOTA 2YVBA 208LA 4WM6A 4C5FA 2LYZA 3K3TA 5C6IA 2VB1A 2F4GA 1D0MA 1QUTA 1GF6A 1C08C 2ZQ4A 3QY4A 1YQVY 2BQJA 3BKHA 4D9ZA 1BQLY 2BQNA 4G4CA 4LYMA 1TBYA 1OUAA 1BB6A 1JKCA 1LMPA 2W1XA 3FI7A 3HBHA 4WO6A 3TXDA 1GBSA 1JSFA 1UIFA 4LT1A 4XADA 2MEAA 2F30A 4U3XB 1RE2A 1QIOA 3P68A 1GWDA 1UIBA 1D0LA 1GHLA 1H87A 1IWVA 1LMOA 4G9SA 5IELA 2BQAA 2BQMA 2DQHY 1OUEA 4H94A 4TUNA 1T6VL 1IR9A 1UIDA 1IOCA 1B7QA 2DQJY 4XENA 5DN4A 3A3QA 4Z3MA 2EPEA 2EKSC 5B05A 2BQDA 1YILA 2BLXA 3KAMA 1DKJA 3TXEA 2W1YA 3AW6A 1VDSA 4OWAA 1F0WA 1GF9A 3EMSA 4HV2A 4LYTA 2MECA 4DD2A 2BQGA 1LOZA 4TTDA 2DBTA 5HNLA 4CGEA 1D6QA 1CJ8A 1JKBA 1ALCA 5L3IA 3ZVQA 2BQIA 1GFKA 1YAOA 1C7PA 4H8XA 5KXWA 4IATA 1LPIA 4WG1A 2LZTA 3AZ6A 3B0OA 4WM4A 1UBZA 4QDNA 5DL9A 1GBZA 1LHHA 3CT1A 5B1GA 1SLYA 1G7IC 5C6LA 134LA 1UIEA 2BPUA 4LYZA 3RU5A 3W6FA 1IR8A 3B0KA 1V7TA 4NWHA 1LSMA 1IO5A 4LGKA 1OP9B 1J1XY 3AJNA 4OWHA 3LYZA 3ZEKA 4GCDA 1GB6A 2BLYA 4KT3A 3TXBA 1IY3A 1JJ0A 4LT2A 4HSFA 1AZFA 1CKCA 3WU9A 1DI5A 2EIZC 1LZAA 5HNCA 5APFA 1GEVA 1YKYX 4TSCA 5KXMA 1HHLA 4NGVA 1WVVA 4WL7A 4KXIA 1LCNA 4ZIXA 1G7LC 1GBYA 1C46A 1LMNA 2H9JA 4OWEA 5LYZA 4HJVA 3LHMA 1IP5A 1IWUA 1NBYC 1LJIA 2D4KA 4J0LA 4RW1A 5L3HA 1J1OY 1NMMA 5LVHA 3A94A 207LA 5KXYA 1HC0A 1IEEA 3TXHA 4NG8A 5KY1A 5KXLA 1GAYA 1LSAA 1AT5A 2DQEY 2RSCA 1JKDA 1XEKA 2HEAA 1DI4A 3CSRA 3OK0A 3TMUA 4ETCA 5I4YA 3A6BY 1LSEA 1GE4A 3HBEX 2I26L 1LZEA 4UWNA 1HELA 3A92A 1XGTC 4N1EI 2Z19A 2YDGA 4GCCA 3FE0A 1LJNA 4Z41A 1LJKA 4WM2A 4TX7A 4OWCA 1LSDA 3P64A 4H9BA 2LZ2A 1VATA 1LSYA 1NDGC 1D9UA 4WO9A 3BKVA 4BS7A 1LSZA 4DD3A 3TMWA 4DDCA 1ZMYL 2F4AA 2XBRA 4DDBA 5F81A 4CFPA 1WQMA 5J7CA 1DPXA 1CKGA 4NHQA 1IWWA 4XJIA 1B5YA 1YKXX 5E9RA 4NHIA 2Z39A 3WMKA 5LINA 3A8ZA 1INUA 4B0DA 5FELA 1VFBC 1YIKA 2IFFY 4QEQA 4BADA 1QTKA 4N5RA 4NWEA 4B4JA 1GB3A 1DI3A 3G3AB 3IJUA 1TCYA 1IWZA 1FKQA 4UWUA 4NY5A 1EL1A 2F2NA 1IP3A 3A34A 4ML7A 4DC4A 4RW2A 1OUDA 4NHPA 4LYOA 2YBIA 5M1YA 5K7OA 1DQJC 2ZIJA 1E8LA 1B2KA 1LZ6A 3IJVA 2FYCA 4GLVA 3WPLA 2CJLA 3CT5A 5D5CA 3CSZA 4HJYA 1GPQC 2ZQ3A 1FKVA 2EQLA 4WM5A 1C10A 3ULRA 1LHMA 1FBIX 4NGIA 3T6UA 1B7LA 2XBSA 3RNXA 3WW5A 4MSTA 4RLNA 4DD0A 4BAFA 2MEBA 1LYYA 3GXKA 3P66A 4LZTA 1JJ3A 1F10A 1TAYA 5APCA 1JHLA 4HPIA 4ETBA 4HP0A 1FDLY 5KXSA 4NGYA 1IOTA 4YEMA 3B72A 3W6AA 1H6MA 4GCFA 3AGGG 4LFXA 5KXNA 1LMAA 4YM8A 2CGIA 5KKIA 2HEFA 4NSGA 4WG7A 3CSQA 2DKVA 4G4BA 1FLQA 2DQGY 5KXXA 1YL1X 1BWHA 2HEEA 2Y8PA 5D5FA 1XGUC 2W1LA 1BWIA 1HEWA 1I56A 4H92A 1UICA 4H90A 1REZA 4WL6A 4XJGA 4CJ2A 1IOSA 2BQCA 4DYGA 1LYZA 1HEPA 1IP7A 4J1BA 4XN6A 2LYMA 4NGKA 4CHXA 1FLWA 2YBJA 2DQIY 3A96A 4H9EA 1CKFA 1KXYA 1LSGA 1CKDA 4GN3A 4NHSA 4DD9A 5A3EA 1XGQC 1I20A 1GDWA 1GFAA 1LZNA 1REYA 4G4HA 3TMVA 1IVMA 2YBHA 4UWVA 133LA 2NWDX 2BQFA 3J6KA 5C6JA 1JITA 1IX0A 2HECA 5HLLA 3QE8A 2A7FA 1IORA 4DD7A 1XGPC 4R6CA 1ZV5L 135LA 3WU7A 2MEEA 3M18B 3VWOA 2ZNXY 1YKZX 1OUIA 4ETEA 2ZYPA 4GCEA 3RW8A 1NKHA 2CDSA 3WH1A 1OQMA 4PRQA 1HNLA 1C43A 4IASA 1LYSA 4FJRA 3WUAA 3HFMY 4NSJA 5DM9A 5DN5A 1C45A 4HTKA 4H91A 1B5WA 4I0CA 2BQHA 4WM3A 3D9AC 4DD1A 5E4PA 5HMVA 2IHLA 3M3UA 4MCKA 194LA 1QSWA 4EMNA 1AKIA 4FDYA 1HEOA 2ZYCA 5LVKA 1OUCA 2LYOA 1UIAA 1GF8A 1GB5A 4YOPA 5A3ZA 1GB9A 1UA6Y 1ZVHL 1XFPL 3A95A 1UC0A 4E3UA 5I5QA 2HTXA 1IP4A 4HV1A 2Z18A 1BVXA 2C8OA 3E3DA 1GF0A 2B5ZA 3A6CY 4H1PA 4ZEEA 3EO5A 5IHGA 4J1AA 4G49A 3W6CA 4W96A 5LAFA 2H5ZA 1GF4A 1CNSA 1JTTL 2YSSC 5JENB 4BAPA 5KXKA 2MEHA 1CJ9A 3J4GA 1JIYA 1LHJA 1LJJA 2GV0A 4GN4A 1REXA 1W6ZA 2ZNWY 1HMKA 3QNGA 3GXRA 3W3EA 1MLCE 2D6BA 1HFYA 2A7DA 3HBDA 1GBWA 2D4JA 4HJZA 3AYQA 4LT3A 5KKJA 4H93A 2XJWA 1A4VA 3WU8A 4WLDA 3WL2A 1XGRC 2HU1A 4EOFA 1LZ1A 1WQQA 3CT0A 4WMGA 5KXPA 1JTPL 1IOQA 1GXXA 5KJ9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GF5A 1VDPA 3NY9A 1LJEA 1HENA 2Q9DA 2Z2FA 3HUKA 4ETDA 3ZVQB 3N9EA 3NYAA 4B1AA 1B7SA 1NBZC 2CUUA 5LVIA 1F6RA 3N9CA 1HMLA 4P2EA 1LJ4A 1LZ8A 4LDLA 4N1CC 5F16A 2MEDA 1L03A 4QGZA 2D91A 2ZWBA 1BVKC 4NGZA 1T8AA 1EPYA 3DN0A 1CKHA 1LSBA 1C6PA 1LHLA 1V7SA 3ATOA 1KXWA 1D0KA 5DLAA 4PGJB 177LA 4OO9A 3HH6A 1IC5Y 1YANA 1KIRC 4WM1A 3A3RX 4ARLA 4NSHA 1GBOA 1QQYA 3EXDA 4NGJA 4H9FA 1LJGA 1QT3A 1QUGA 1B9OA 1IY4A 4NEBA 5B1FA 1LPYA 3CDTA 3DN2A 195LA 3P65A 4XJHA 3WXUA 1DZBX 1P3NA 4O34A 3HWLA 4PPOA 188LA 4MR1A 5B59A 5HMJA 1C66A 1GFTA 2YBLA 5LYTA 1OUGA 2FBBA 3B6LA 1BB5A 7LYZA 2BQLA 5I53A 5F14A 1L39A 1CU5A 1T97A 1D2YA 3ATNA 2C8PA 1LHKA 1CV5A 1L36A 4YENA 4GBRB 1IWTA 1KIPC 4ANRA 3LYMA 1LZ9A 4HTQA 1L96A 1LYEA 4AXTA 1IP2A 3GUJA 4HTNA 9LYZA 1GFVA 5II3A 1G7HC 1GAZA 240LA 3LN2A 1NDMC 1PQDA 2HEBA 190LA 1HFZA 1N4FA 1GFRA 193LA 1RI8B 2QB0B 4YF2A 1L54A 5KXTA 1O23A 2MEIA 3G3BB 187LA 1WQPA 3P4ZA 257LA 4ET8A 1UIGA 2BQBA 3TXFA 4NHTA 2BQOA 4X3BA 1L49A 3RUNA 3RZ4A 4OOOA 4DJHA 1VDQA 4DT3A 1QSQA 4PRUA 2W1MA 3HT8A 1B5VA 132LA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GF5 A;  4XJF A;  2H9K A;  4OWB A;  4H8Y A;  1VDP A;  5LYM A;  2D4I A;  1QDT A;  2I25 L;  2Z12 A;  4DDA A;  1B5Z A;  1LJE A;  1JUG A;  1HEN A;  1GB0 A;  5L9J A;  1B7P A;  1IC7 Y;  2MEG A;  2Z2F A;  1GFG A;  1EQE A;  154L A;  4DWX A;  4ETD A;  2ZIL A;  3ZVQ B;  3N9E A;  3F6Z A;  1B7S A;  4B1A A;  1NBZ C;  1A2Y C;  1ZVY B;  5LVI A;  1F6R A;  3N9C A;  1HML A;  1B7O A;  4P2E A;  1LJ4 A;  1LZ8 A;  4ETA A;  4N1C C;  5I54 A;  3TXI A;  2DQD Y;  4WOA A;  3WPK A;  5F16 A;  1GB8 A;  1OUH A;  1HEM A;  2MED A;  1GB2 A;  4N8Z A;  4QGZ A;  1NQI A;  1KIQ C;  1AT6 A;  4RLM A;  1GDX A;  2D91 A;  1BB4 A;  1GBX A;  2ZWB A;  1BVK C;  4H9H A;  4NGZ A;  1HF4 A;  1LZR A;  2HED A;  1GFJ A;  5F9X A;  3W6D A;  2FYD A;  4B49 A;  1CKH A;  1HSX A;  1GF3 A;  1LSC A;  1CJ6 A;  1I1Z A;  1YRO A;  1GD6 A;  4W94 A;  4CFO A;  4J7V A;  1DXJ A;  1LSB A;  1LSF A;  1LHI A;  1LZT A;  2MEF A;  3WUM A;  2HU3 A;  3A93 A;  1F6S A;  5I4W A;  3AGH A;  3A91 A;  1EQ4 A;  1LHL A;  1V7S A;  3ATO A;  1KXW A;  1D0K A;  1GE0 A;  2YBN A;  4GLA A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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