The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
56
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
DCSILELLKVKNQWREAFGEGHHRVQFGLELWKRFFDTHPEVKGLFKGVNGDNIYSPEFAAHAERVLSGLDMTIGLLDDTNAFKAQVTHLHSQHVERSINPEFYEHFLGALLHVLPKYLGTKLDQDAWTKCFHTIADGIKG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Globin a chain
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| publication title |
The structure of the giant haemoglobin from Glossoscolex paulistus.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
56
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
H, L, S, W, a, h, l, p
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-08-04 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| D | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3M3B A; 3G4Q A; 3OO5 B; 1MCY A; 1HLB A; 1FLP A; 2ZSY A; 1X3K A; 2O5B X; 2ZSN A; 3UHZ A; 4M4B B; 1Y8K A; 1V5H A; 3SZK B; 2ZST A; 1G9V B; 4G51 B; 2ZLX B; 1V4X A; 1SI4 A; 1Y09 A; 1IRD B; 1EMY A; 3NL7 A; 1FAW A; 1BZ0 B; 1MBI A; 2R1H B; 2GDM A; 2Z8A A; 2ZLU B; 4NI0 B; 1WMU B; 2LHB A; 2OHA A; 2VYZ A; 3FH9 A; 1A0Z B; 2DN2 A; 2H8D A; 4TWV A; 4MXL A; 3FS4 A; 1A3N A; 2D2M D; 1MWC A; 1Y31 B; 2ZLV B; 3EOK A; 1YMB A; 4KN3 A; 1MTJ A; 1YDZ A; 3SDH A; 5C6E A; 1B86 B; 4DWT A; 1YVQ A; 4L7Y B; 1S5X B; 3R5I A; 1LFL B; 1LHS A; 1S6A A; 5HU6 A; 6HBW A; 3BA2 A; 2YRS A; 1LFQ B; 1Y4R B; 3GYS A; 1HBA B; 1VXG A; 3CY5 B; 3IC2 B; 3WR1 B; 2QSP A; 3BCQ A; 1GZX B; 1GCW A; 3UH3 A; 1XZ7 B; 1N9X A; 2RAO B; 1HHO B; 1MYM A; 3GQG A; 1MGN A; 3LQD A; 2OH8 A; 1CMY A; 1DXT B; 2HHD A; 1S69 A; 1HDS B; 3WCT D; 1Y83 A; 3QJB B; 4ROL B; 2BK9 A; 3TLD A; 2G0V A; 3ZH0 A; 1A01 A; 4NI1 A; 3UHK A; 3WFT A; 1SHR B; 1NS9 B; 2G10 A; 1OUT A; 1LH6 A; 2G14 A; 3S1J A; 3BJ2 A; 3WCV B; 1HGC A; 3UHB A; 1Y46 A; 1DWR A; 2EKU A; 2MYA A; 3BJ3 A; 3D1K B; 1Y35 B; 111M A; 1THB B; 2HCO A; 1ABY A; 1HSY A; 1HAB A; 3AQ8 A; 3G4R A; 3WTG A; 1A4F B; 4O4T A; 1GBU A; 4PNJ A; 3PT7 B; 1LH3 A; 1RQ3 A; 2JHO A; 1O1N B; 3NFE B; 2VEB A; 1J3Y B; 5AB8 A; 3VHB A; 1EBC A; 4PQC A; 2MYC A; 1A0U B; 1BZ1 A; 1Y0C B; 1D8U A; 1O1O A; 5HY8 B; 1YH9 A; 1MKO B; 2BW9 M; 1GCV A; 2G11 A; 1XZ2 B; 1NQP A; 1NEJ B; 1T1N A; 1JP9 A; 1O1I B; 3K8B A; 5EUI B; 2EVK A; 3DHT B; 1CH1 A; 2AA1 A; 1YCA A; 3U3E A; 1Y4V B; 1OBM A; 3UHH A; 1Y45 B; 3A0G B; 1HLM A; 1GJN A; 1YE0 B; 2MGG A; 1FHJ A; 4OF9 A; 4MQJ B; 1AJ9 A; 2BLJ M; 2VEE A; 1KR7 A; 2D2M A; 2ZLT B; 2V1G A; 1Y7G B; 1Y4P A; 1Y0W A; 2ZS0 B; 3UHU A; 1YMA A; 3QM5 A; 1YEO A; 3HEN A; 3IC0 A; 3D7O B; 1UVY A; 2W6V B; 2LH7 A; 1O1M B; 1C7D A; 3HEP A; 4MU5 A; 2GLN A; 4FWZ A; 2VHB A; 3MJP B; 4N7N A; 2XKI A; 5ILR A; 2VLY A; 1YIH B; 1MLG A; 1V4W A; 2H8F B; 1A9W E; 1YMC A; 1EBT A; 3M38 A; 3GKT A; 1SPE A; 1NXF A; 3QZX A; 2B7H B; 3MBA A; 1YVT A; 1YHR A; 1Y0D A; 4NS2 A; 1FSX B; 3GQP A; 2NSR A; 1JEB A; 1CH3 A; 1LH5 A; 2FRI X; 2Z85 A; 5B84 A; 3A9M A; 2ZSP A; 1BIJ A; 1J40 B; 4VHB A; 3WCT A; 1S5Y A; 1MYZ A; 3RJ6 A; 1OUU A; 1HGA B; 1YEU A; 2DN1 B; 2LH5 A; 1J41 B; 2AV0 A; 1HBS A; 3WCV D; 3ZJP A; 3QM9 A; 1LFV A; 4KMV A; 2GTL A; 1QXE B; 2O5T X; 1HV4 A; 1VWT A; 1Y5K B; 1J3Z B; 1SDK B; 2EF2 A; 3M3A A; 1KD2 A; 4M4A A; 1XZV A; 1RPS B; 3GKV B; 1O1K A; 4FC3 A; 2LH3 A; 1V75 A; 4OOD A; 1K1K B; 1MOH A; 1B0B A; 2DHB A; 1VXH A; 2D2M C; 3OO5 A; 3KUN A; 4G1V A; 4F6J A; 2R4Z A; 4M4B A; 1VRE A; 3SZK A; 2W6Y A; 4G51 A; 1M9P B; 2ZLX A; 1Y5F B; 1Y85 B; 1IRD A; 1MWB A; 4LPI A; 1UVX A; 1MBD A; 1C40 B; 2XYK A; 1NWN A; 5EQM A; 2R1H A; 5JDO E; 3HC9 A; 2ZLU A; 1XQ5 A; 4NI0 A; 1WMU A; 1Y0T B; 1HBH B; 1KFR A; 1DO7 A; 1ECA A; 1A0Z A; 3V2V A; 1Y31 A; 1B86 A; 3ORD A; 4L7Y A; 1S5X A; 3WCT C; 5AZR A; 1LFL A; 5ILP A; 2H35 B; 1MLS A; 4MQI B; 5HLQ A; 1LFQ A; 2QU0 B; 2G12 A; 1Y4R A; 1HBA A; 1FN3 B; 3CY5 A; 3WFX A; 1DTM A; 1HDB B; 3IC2 A; 3HEO A; 3WR1 A; 4HRR B; 1DKE B; 2ZWJ A; 109M A; 1GZX A; 3GDJ B; 4AVD A; 1XZ7 A; 1BVC A; 3QJC B; 4WCH D; 2RAO A; 1RQ4 B; 1JF4 A; 1DTI A; 1HHO A; 1LA6 B; 2MGF A; 1CH2 A; 4XS0 B; 1HBR B; 2ZS1 B; 1HBI A; 3AQ7 A; 3IXF A; 5D1V A; 3HF4 B; 3UH6 A; 1DXT A; 1Y7Z B; 2OHB A; 1HDS A; 2R80 B; 1QSH B; 3QJB A; 4ROL A; 1Y7D B; 1H97 A; 1SHR A; 1NS9 A; 4MBN A; 3S66 B; 3ZOM A; 1G0B B; 3WCV A; 1CG8 B; 3D1K A; 5EYS A; 3AT5 B; 1Y35 A; 1THB A; 4U8U B; 1UMO A; 1DXU B; 1MLN A; 1GLI B; 5CNF A; 4MQC B; 2RI4 B; 2LH2 A; 2OIF A; 4F68 A; 1MLF A; 1NWI A; 1MLQ A; 3HYU B; 2GRF A; 1A4F A; 1URY A; 1ITH A; 2V1K A; 3PT7 A; 105M A; 5AZQ A; 1O1N A; 2BMM A; 3NFE A; 2IG3 A; 1J3Y A; 3KUO A; 2NRM A; 3A59 B; 3UBC A; 1C7C B; 1A0U A; 1LJW B; 1Y0C A; 2FAM A; 2EB8 A; 2MGH A; 5HY8 A; 2SPO A; 1MKO A; 2O5O X; 1XZ2 A; 1NEJ A; 1O1I A; 5EUI A; 3DHT A; 3MN0 A; 1EW6 A; 3MOU A; 1XCH A; 1Y4V A; 1Y45 A; 1N9I A; 2GNW A; 3A0G A; 3UH5 A; 4MQG B; 1N9F A; 1CLS B; 1YE0 A; 1BVD A; 3ECL A; 1DO3 A; 4F4O B; 4MQK B; 3S1I A; 4MQJ A; 1CPW A; 2ZLT A; 1YEV B; 1Y7G A; 2ZS0 A; 3BOM B; 1JP8 A; 3D7O A; 4N7O B; 2W6V A; 2PEG B; 2M6Z B; 1O1M A; 3O89 A; 1UC3 A; 3MJP A; 4TWU A; 2WTG A; 1YIH A; 3WHM B; 2ZLW B; 3ZJH A; 3DR9 A; 3G4Y A; 2H8F A; 2HZ1 A; 2EKT A; 1DXV B; 4MBA A; 1UIW B; 2ZSO A; 1MYI A; 3EDB A; 3RJN B; 2VRY A; 3UHE A; 2MYE A; 3NG6 B; 3WCV C; 1Y4F B; 2B7H A; 3ZJM A; 1I3E A; 4KJT A; 1YEN B; 4ROM B; 1FSX A; 1HDA B; 2Z6T A; 2MHB B; 5EE4 D; 2ZS1 D; 3PI4 A; 1J40 A; 3PI2 A; 2GNV A; 4FH6 A; 3VAU A; 1VXC A; 1HGA A; 1YZI B; 2V1H A; 2DN1 A; 1J41 A; 1F5P A; 3AT6 B; 3ONZ B; 2WY4 A; 3M39 A; 4MPM A; 3K3U A; 2D2N D; 2HHB B; 3P5Q B; 3UHR A; 3UHI A; 3TM3 A; 1QXE A; 4NK1 A; 1MWD A; 4U8U D; 2VM0 A; 2HBC B; 1Y5K A; 1J3Z A; 1SDK A; 2OH9 A; 1RTX A; 1DXC A; 3QQQ A; 1GVH A; 1RPS A; 3GKV A; 1K1K A; 1MLM A; 2KSC A; 2ZS0 C; 1IWH B; 1XZU B; 1MNK A; 1Y7C B; 1NPF A; 3PT8 B; 1YHE A; 1Y5F A; 1IT3 A; 1Y85 A; 3UHY A; 3D17 B; 3WI8 A; 1HBG A; 1C40 A; 1BZZ B; 2V1F A; 5CMV A; 4PQ6 A; 5JGG B; 2ZFO D; 1QI8 B; 3UHD A; 1CIO A; 5CNB A; 1MBO A; 1UX9 A; 4H0B A; 2XKG A; 4N8T B; 2HZ2 A; 1Y0T A; 1HBH A; 1JWN A; 2OLP A; 1NZ4 A; 5JOM A; 4ESA B; 1URV A; 2AUR A; 4FWX A; 1Y8H B; 3LB1 A; 3ARK A; 3AG0 A; 1BZR A; 1DWT A; 1Y8W B; 3QJE B; 6HBI A; 1MLK A; 5D5R A; 3ODQ B; 1O1P B; 3D1A B; 2MYD A; 1XY0 B; 5MBN A; 2NRL A; 1Y4Q B; 5CHR A; 3MKB B; 1IT2 A; 3V2Z A; 5E83 B; 1VXA A; 4UUR A; 2V1J A; 1YOG A; 2H35 A; 4FWY A; 4MQI A; 3DUT B; 1H1X A; 2QU0 A; 2SPN A; 1FN3 A; 1J3F A; 1HDB A; 2QSS B; 3HHB B; 3MYN A; 1DKE A; 4HRR A; 1VHB A; 4DC7 A; 2R4Y A; 107M A; 1R1Y B; 1O1J B; 3GDJ A; 1V07 A; 1LFZ B; 3QJC A; 1RQ4 A; 1JDO A; 1LA6 A; 1M6C A; 1NZ5 A; 1S0H B; 1COH B; 2ZT1 A; 4XS0 A; 1LFY B; 1HBR A; 2ZS1 A; 1RQA B; 1RSE A; 1Y7Z A; 2O5S X; 2WTH A; 2R80 A; 1BAB B; 1QSH A; 1Y7D A; 1JL6 A; 5HLU A; 1XZ5 B; 1NAZ A; 3S66 A; 1OFK A; 1QXD B; 3G4U A; 1G0B A; 1SPG B; 4MAX A; 5HBI A; 5CN4 A; 1A6M A; 1CG8 A; 1MTK A; 1YE2 B; 1BUW B; 2ZT3 A; 3AT5 A; 1G09 B; 1DLY A; 1QPW B; 4U8U A; 1DXU A; 2V1E A; 1GLI A; 4MQC A; 2RI4 A; 1AJG A; 2GKN A; 1OJ6 A; 1CQ2 A; 102M A; 1MBA A; 3HYU A; 1CO8 A; 5C6E B; 3D4X B; 1A00 B; 3G53 A; 3B75 B; 3VRE B; 5CNE A; 2G0X A; 112M A; 1XXT B; 1DUO A; 1MOA A; 5IKS A; 2HBE B; 1A6N A; 3A59 A; 1C7C A; 1LJW A; 1M6M A; 1G0A B; 2EB9 A; 1VXB A; 1YGF B; 3DHR B; 4H2L B; 5KER B; 1FDH G; 1YEQ B; 3R0G A; 2O5L X; 3MYM A; 1NS6 B; 3KMF A; 2G0Z A; 1UT0 A; 4MQG A; 1ABW B; 1CLS A; 1MNO A; 5EV5 A; 1GDL A; 4F4O A; 4MQK A; 1V4U B; 2E2Y A; 4JYQ A; 3WFU A; 4N7P B; 1YEV A; 2W31 A; 1G9V A; 1YOH A; 3BOM A; 3ZHW A; 5CNG A; 5EE4 C; 2ZS1 C; 2ZT0 A; 1J7Y B; 4N7O A; 5KDQ B; 1HRM A; 4O35 A; 1IOP A; 2HBS B; 2M6Z A; 2PEG A; 1BZ0 A; 2ZSQ A; 3VRF B; 3ECX A; 3WHM A; 2ZLW A; 3PI8 B; 1YCB A; 1F5O A; 1K0Y B; 1DXV A; 1OR6 A; 2DN3 B; 1F65 A; 2DXM B; 2AUQ A; 3S48 C; 3NG6 A; 1Y4F A; 4KMW A; 1UX8 A; 1I3D A; 2ZLV A; 4NXA A; 1GDI A; 1CP5 A; 2NX0 A; 4ROM A; 1CP0 A; 2QMB B; 1NIH B; 1HDA A; 4U8U C; 1RVW B; 2VLX A; 3LR9 A; 2MHB A; 4FH7 A; 1CH9 A; 1JZM A; 4ZVB A; 3UHV A; 4H07 A; 5CNC A; 1BZ1 B; 3HXN B; 4IT8 A; 3E55 A; 1YZI A; 2BLI A; 3CIU B; 1ECN A; 1YG5 B; 4X0L B; 2AA1 B; 3AT6 A; 2MGE A; 3TM9 A; 1JY7 B; 3ONZ A; 1YGD B; 1DWS A; 3OK5 A; 2D5X B; 2MGK A; 2HHB A; 5EOH A; 3P5Q A; 5EYJ A; 3H58 A; 2HBG A; 1CG5 B; 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1BIN A; 1MLH A; 1XZ5 A; 2ZT2 A; 3GQR B; 1OFJ A; 3QM7 A; 2ZT4 A; 1QXD A; 3ASE A; 3WCU B; 1SPG A; 2GL3 A; 3QQR A; 3VRG B; 1LHT A; 1XQ5 B; 1YE2 A; 1BUW A; 3ZJQ A; 4F6D A; 5E29 B; 1GBV B; 1G09 A; 1QPW A; 3OGB A; 2D6C A; 4JAC A; 1AZI A; 2QRW A; 2VYY A; 1NZ2 A; 4O1T A; 1BZ6 A; 2MGL A; 1MTI A; 1WLA A; 1YIE B; 3MJU B; 2D60 B; 1HAC B; 3AQ5 A; 1X9F B; 1YHU D; 1Y01 B; 3D4X A; 3WCW B; 1A00 A; 4DC8 A; 104M A; 3B75 A; 3VRE A; 5CN7 A; 3K9Z A; 5CN8 A; 2R4X A; 3LHB A; 1CH4 A; 1XXT A; 2HBE A; 3UHT A; 2ZSS A; 1G0A A; 2MGD A; 3ARJ A; 1MYJ A; 1YGF A; 3DHR A; 106M A; 4H2L A; 3LB3 A; 2FAL A; 5ILE A; 5KER A; 1YEQ A; 2Z6N B; 1Z8U B; 2MGI A; 2ZSR A; 5C6Y A; 1NS6 A; 4HRT B; 1FCS A; 1A3O B; 1ECO A; 1Y2Z B; 1ABW A; 1QSI B; 1SDL B; 2V1I A; 4DWU A; 3QJD B; 5F2A A; 1JL7 A; 1V4U A; 2O5Q X; 2ZFB B; 2HBF B; 4N7P A; 2IN4 A; 4NZI A; 1M9P A; 4ODC B; 1J7Y A; 5KDQ A; 4L2M A; 1TES A; 2HBS A; 4F6I A; 3AQ9 A; 1HCO B; 1ASH A; 3VRF A; 3OO4 B; 1U7R A; 4IRO B; 1YFF B; 3PI8 A; 1K0Y A; 1G08 B; 1Y0A B; 3LR7 A; 3PIA B; 2DN3 A; 1MYG A; 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