4WK9A

Crystal structure of human chitotriosidase-1 catalytic domain in complex with chitobiose (0.3mm) at 1.10 a resolution
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
369
structure length
368
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTENDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEESGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQELSLVPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitotriosidase-1
publication title New insights into the enzymatic mechanism of human chitotriosidase (CHIT1) catalytic domain by atomic resolution X-ray diffraction and hybrid QM/MM.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 132
structure length 368
sequence length 369
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4wk9A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4wk9A01
4CCCA 4GQRA 4IUGA 3SUUA 3VUPA 3SUTA 4ACYA 4AZCB 5IDIA 2W5FA 5FCZA 1UA3A 4MTVA 1PX8A 2CITA 1MQPA 4GZEA 2VNCA 1WO2A 4JCMA 1XV8A 2CBVA 3GNRA 2AOSA 4E8DA 5A8OA 2G3JA 5CPTA 4PTVA 2CBJA 3FHAA 4UZUA 4PTMA 3WDHA 2WHLA 1O7AA 1ZBKA 2WC7A 1LL6A 5ABFB 1K9EA 1GOKA 4L4OA 3F5KA 3KL0A 4W87A 4IPNB 4LYPA 1PIFA 2XHYA 2J7FA 2V3DA 4LGXA 2JEPA 4JKKA 2QF8A 1R7OA 3CZKA 4XV0A 3DHUA 3CUFA 3TTOA 2PWFA 4X9YA 1E4NA 3VX1A 2YLAA 1OINA 3VKKA 2W66A 4LYQA 4U3CA 1HXJA 3T0DA 2VCAA 2W67A 1QI2A 2DT1A 1V6XA 1PIGA 1OCQA 2X05A 3GXIA 3VNZA 3WL1A 3SCUA 3ZR6A 3OLEA 2CYGA 3EBVA 1H5VA 3W38A 1OGGA 5AC5A 4ZFMA 3K8LA 2VX4A 1QNOA 5A6AA 3AMGA 4U2YA 4QAWA 1VF8A 3KE0A 3MUIA 3WQWA 1GOIA 3L4XA 2WM0A 2VMFA 2OYLA 2ZUTA 3GH4A 1UWRA 3WF1A 1ZS2A 1PPIA 3WF2A 1PZ3A 1C7TA 1JF5A 2XM2A 3EMQA 2CBUA 1ZBCA 3OGSA 4M56A 4R27A 3U57A 2ZOXA 1JAEA 3AIUA 2WVVA 4JCLA 4CU7A 3AMDA 3S6TA 4AWEA 5HNNA 2CESA 4R5EA 1V02A 4GIAA 2O9PA 4B15A 1XD1A 3ARVA 1UYQA 1XCWA 2G3IA 3VGBA 1SMAA 3D5HA 2QLYA 3TONA 1MW2A 1XCXA 1JL8A 3AFBA 3M7SA 3UCQA 2VCBA 3BH4A 3BCDA 3BMVA 3WQ4A 2ZWZA 3IJ9A 4AZ7A 2E4TA 1MYRA 1E6ZA 4P7NA 3MV01 3ZJ8A 3BXWA 2ZX7A 5E0CA 4AD1A 3VDHA 2VURA 4P8XA 1GONA 1B3YA 1AQ0A 2J8GA 3AS0A 3VDBA 1UKOA 3GDBA 4AC1X 2J47A 4M1RA 4NRRA 5E6ZA 1NQ6A 3EYPA 3WUGA 1VFOA 3KWXA 5GQBA 3FN9A 4CD6A 2PB1A 2VX6A 3CUJA 4IM4A 1M01A 1DWIM 5D9OA 1Q6EA 3EMZA 3BAWA 5LA0A 2ZX9A 1FA2A 1EXPA 4K68A 3CO4A 1U30A 2DIEA 4GO8A 1A3HA 4HZ6A 4YPJA 3I3BA 3W25A 1A47A 4LYRA 3MSDA 4B16A 3WH8A 2PF0A 4C7GA 5C70A 3JUGA 3WQ5A 3WBAA 2J74A 1L8NA 3LPFA 1KWKA 1M53A 1R8LA 1VEPA 1Z32X 1K9TA 2Y4SA 1BGAA 3L4UA 1KWGA 1UH2A 2E9MA 1HIZA 3WEMA 2VX5A 1CWYA 3N13A 4UQCA 3N17A 5M03A 3BAKA 1UR2A 5BRPA 2VZVA 1W1PA 1CGXA 5CQ1A 4U3AA 3SUVA 1W9BM 1NWUA 1E6QM 3HN3A 1M04A 3WD1A 1G0CA 2B31A 1G9HA 5CGTA 1KQYA 1TZ7A 3PBGA 4W7WA 4JKLA 2X8RA 1BSIA 3OGRA 2XVPA 4PSPA 1HKIA 2Y8VA 1K9DA 4TUFA 4JFVA 1PZ2A 2D0FA 3NDYA 5C8BB 2WC4A 4AD3A 3BAIA 3AXIA 3II1A 2GSJA 4E2OA 1EDTA 4B3LA 2QMJA 3CZGA 4HU8A 4J3SA 3ARWA 1LLOA 1B3ZA 4GZIA 2J78A 1CTNA 4LXFA 3B9EA 3NUKA 1E55A 1ZJAA 3ZSSA 3AHTA 1W3HA 2GDUA 2Y24A 3CHEA 2XG9A 8A3HA 3VM7A 3VOCA 1EDQA 4FF5A 4H8UA 1BGGA 2PBGA 1CZ1A 3W6LA 5DFAA 4WKFA 4PUDA 5A2AA 3WD3A 3DHPA 2BXZA 1MVYA 3VIHA 3BSGA 3NSNA 1E9LA 2EPNA 2W62A 1XH2A 4OJYA 5BROA 3VIFA 3WDRA 3OG2A 1RP8A 1QNPA 3SCVA 5M5DA 1KCLA 1QHZA 2FHCA 3KL5A 4AZHA 1CGUA 1NP0A 1QHOA 1I1WA 3QHMA 5I79A 2Y2WA 5JIPA 1D3CA 4MB3A 2Z1KA 1V02E 1GQJA 3PN8A 2VTFA 1W3JA 1UZ4A 3PZTA 5A3HA 1W1VA 1XHGA 3WUEA 3AJ7A 1J12A 1XYFA 4GPNA 4U2ZA 5D8WA 1B2YA 3WD4A 2D20A 1LL4A 3AQUA 3PZ9A 5IFPA 1QHPA 1NWSA 3MMWA 3SCWA 2TAAA 3FXYA 4H7VA 1TA3B 2WVSA 1H41A 3WELA 1CXHA 1JYWA 1C3FA 3AS1A 1XGZA 1QI0A 4AD0A 2J75A 2JEQA 4TXEA 2FGLA 2FGZA 3MS8A 3VIPA 2XJ7A 4PMOA 2VL4A 4CCDA 4MB5A 1VJSA 3B8SA 1XSKA 2GFTA 2ZX8A 3KEHA 3ECQA 2NSXA 3BGAA 3AZSA 1E6NA 2W61A 1AQHA 1V0LA 1GPFA 4YHEA 1ISXA 2E8ZA 4ATLA 3VILA 3T09A 3VD9A 4MAVA 3PZUA 3I3DA 1PBGA 1QOXA 2WVUA 2YJQA 1ZU8A 4MADA 3N9KA 1BVNP 2YKKA 3AHVA 3ZJ7A 2CKSA 3QOKA 4PEEA 3EDJA 4PMVA 1UR0A 2GK1A 1ITXA 2OSWA 2XFRA 3EDEA 1JAKA 3AIVA 3PZVA 4F8XA 5LYRA 1LG2A 2DSVA 1B0IA 2JIEA 5IXEA 4C7FA 3M46A 5GPRA 2EO7A 5HXMA 1TFVA 5BWFA 4LX4A 1CXEA 1RP9A 2VUYA 4PMUA 1CENA 2J7BA 2EBNA 4J3VA 3ZT6A 1JF6A 2CHOA 5CPQA 2WMFA 4AEFA 4WJXA 1MFVA 3EDFA 1KR0A 3VGFA 3RM8A 5D4YA 2WAGA 5GNYA 4BQ4A 2VVNA 1GW1A 4JZ5A 2CCRA 3O6AA 3AIRA 5DO8A 3PZQA 1VBRA 2IXUA 4CU6A 3RDKA 2ZE0A 3AXXA 3SUWA 1XH0A 1BYAA 4F9DA 1HJQA 1EOMA 4L4PA 3I3EA 2FHBA 1E40A 4AZBA 1I75A 4LPCA 5BRQA 5AY7A 2D3NA 2YDRA 2YA1A 1E1EA 3UR7A 2Y8KA 1CXFA 3W82A 3WF3A 1JZ8A 3VM5A 2WCSA 4Q22A 1C93A 9CGTA 2WLYA 3A47A 5HDRA 3WNPA 3RCNA 1CIUA 4D6FA 1H4PA 1PX3A 4B3KA 4S3JA 1EDGA 3TA9A 4RE4A 1E6XM 4PCTA 2ZUMA 4DM2A 2X1IA 3SCPA 1ZBVA 2DT2A 1MW1A 1C8QA 1FH9A 1IT0A 1JZ6A 4EAMA 2J7GA 4WIWA 1JI2A 2BHUA 2YL9A 3VVGA 5DT7A 2JF7A 1V6VA 1ITCA 5ABGA 1GQIA 4AY1A 2VC9A 4CUCA 4HU0A 3VTRA 3VGEA 1UR9A 1MW0A 5EB8A 3BCFA 4CKQA 2W4XA 4DUWA 1RPKA 4H2CA 3OA5A 1GJWA 2WWDA 4KWUA 1E0VA 4JIEA 1JNEA 3APGA 2A3CA 4DWSB 4X0NA 1J11A 1WP6A 1CEOA 4D6JA 4GO9A 3BLKA 1BFNA 1CBGA 2C0HA 1GUVA 3VINA 1CGVA 4AW7A 4D6HA 1CLXA 1JGIA 2ZUSA 1R86A 4OUEA 1EA9C 1V3IA 1ISVA 2E0PA 4ZEPA 3W28A 4EK7A 3AZTA 2J7EA 5I3DA 4CD7A 3WH7A 2XFFA 2CXGA 2DGAA 3AIQA 2YA2A 1MQQA 2J4GA 4D6GA 2JIWA 1UD4A 1BPLB 4EANA 1B30A 5DF0A 5A8PA 1CXIA 1CYGA 2D23A 2DH2A 2YDQA 4FLOA 5CGMA 1I1XA 2OSYA 1XSJA 4MAZA 4Z2IA 2PC8A 3ZJKA 4GI6A 3VD3A 4HMEA 1VB9A 2PWDA 2BY0A 3WDPP 2J79A 3GXDA 5CJ5A 4AD2A 1UKSA 3GBEA 4GZJA 3T0AA 4J3XA 3AIBA 1EHNA 1QPKA 1KXHA 4C7DA 3CMGA 2G41A 2YDSA 3WEZA 3OIHA 4ZENA 5A6BD 1E4MM 2WZEA 1DEDA 5EMYA 1OD8A 2DT3A 1GJUA 4UR9A 3RM9A 3SCRA 4J27A 2BVYA 2PWEA 1PEZA 4LQ1A 4GQQA 3QR3A 5JUVA 4W8LA 3FNDA 3MMUA 1V3KA 3VDCA 1NOUA 2CIPA 2BHYA 1EQCA 2XGIA 1QI4A 5A69A 2VZTA 5E6YA 1BYBA 3DYMA 4M8UA 1BF2A 1AMYA 2GJXA 3THDA 1UWQA 2V3GA 2J62A 4ACZA 1BAGA 2Q8XA 4OBSA 4UTFA 1X6LA 1HP4A 3HMCA 1GQKA 3GXFA 1H3GA 2WMIA 4D6IA 1V3LA 3CLWA 4HTYA 3T2OA 6TAAA 2Y5EA 1WDQA 3VMOA 5A8MA 5I6SA 1EH9A 1VEOA 1VEMA 3POHA 4WK9A 1QW8A 4UQDA 2WZIA 3GM8A 3WNNA 4W8BA 3DECA 2X0HA 1US3A 1GOOA 2WZHA 2YIHA 2D3LA 1G1YA 3VX0A 3PZGA 3U5UA 4CD5A 1E15A 4MNLA 5CLTA 6A3HA 3HU7A 3BAJA 1JDAA 1U33A 2F2HA 4CN6A 4AD5A 1HP5A 4W85A 1TCMA 1UR4A 2CKRA 4YN5A 3WD0A 2XSAA 1HN1A 1UD5A 2D24A 1KCKA 1HVQA 1PAMA 4U31A 2GJRA 2EPMX 1W9PA 3EDKA 3SCNA 3PHAA 2EQDA 1K9FA 5KZ6A 4WSKA 3MV11 1NM9A 1WZKA 2HVMA 1UR8A 4HOZA 3A4XA 3MKKA 1UOKA 4RL3A 2CERA 3D3AA 5I23A 2IUZA 2IXVA 2UY3A 1VFFA 4MDOA 3AIEA 3J7HA 1PJ9A 5M17A 3GH5A 3IJ8A 4RE2A 1V0KA 5GNZA 5A6MA 2YBUA 1GORA 2V3EA 3VGHA 2WLZA 3RMEA 2DSUA 2BHZA 2JF6A 4D1JA 2WVTA 1JYNA 1E4IA 4ACZB 4PMZA 4DUVA 1PX4A 2A3HA 3MANA 2E9LA 3UERA 2F61A 4H04A 3QHNA 3F4VA 2YOCA 1BG4A 3ARRA 3GXMA 3VIGA 3WMCA 5IFTA 5FL1A 4CVUA 3VGGA 4D6CA 1H0GA 3GBDA 2UY5A 5FKYA 2WVVB 1YQ2A 1KBKA 1B1YA 4WF7A 2GVYA 1WZLA 4KGJA 3WUFA 3WN6A 1JNDA 1TUXA 3WEOA 1H0IA 1NP2A 2ZXQA 1D2KA 2YL8A 3ZT7A 5E0FA 1CGWA 4DWSD 3W81A 4HA4A 4HPGA 4NI3A 4NF7A 2WMGA 1UH4A 3PTKA 1JIBA 3FHQA 3AHYA 2QV4A 4W84A 3WDQA 2J25A 4ZE4A 3ZSTA 2BNJA 2V3FA 1TVPA 1UD8A 3W29A 4B9ZA 2WKGA 2VQUA 3L4ZA 4PMRA 4W93A 4Z2JA 4JKMA 4PCSA 4W88A 3VO0A 1DWFM 3RM4A 3VD5A 3ARZA 1V3JA 4MNJA 1OGSA 4KRUA 4MB1A 4FLRA 4CN1A 1GVIA 4F66A 1C7SA 1FH8A 4UQBA 5BXRA 4EKJA 5M3WA 5JIWA 3A4WA 4UQ9A 4F79A 3WF4A 4Z2GA 1WAWA 5A95A 1CXKA 2VX7A 1C92A 1J0HA 3DC0A 4M82A 4MDPA 1Q6GA 4NRSA 5A1AA 2WHJA 4BCEA 2VRQA 3NYDA 1WDRA 1CLVA 3F5LA 4JAWA 3WFZA 3AYSA 3W53A 1UG6A 3U5YA 4D71A 2J7HA 1BVZA 3VIOA 4XZWA 1X6NA 4OOUA 3UG4A 2RGLA 2WKLA 1W9VA 2VZUA 1J10A 1GOWA 1O6IA 1BYDA 1XRVA 5CG0A 3AI0A 5EFFA 2XIIA 3WFLA 3O9NA 1W32A 4GI9A 5BYWA 3WDJA 3VIIA 4UFKA 3OLIA 3WQ8A 3B9DA 2G3MA 4AZGA 1V6YA 2RGMA 5EBAA 2UY4A 4D6EA 1GVYA 2DPEA 2DH3A 1ISYA 1QBBA 2VZSA 4UNIA 6CGTA 1QVBA 1M7XA 4BQ2A 3MUAA 4AIEA 4DWSC 1UWSA 2ZXAA 3CUHA 4GKLA 2WYSA 4GINA 3K46A 1E0XA 1KGWA 4QCFA 1US2A 2CHNA 1MXGA 3EDDA 1RH9A 1UA7A 4JFUA 3SCTA 3WUBA 3PZOA 5I78A 1AQMA 3AHZA 4W5UA 4P7RA 4MJ2A 2PWGA 3VGDA 4BQ5A 4CD8A 2A3EA 2DSKA 1LWHA 1E71M 7TAAA 1H11A 3K8MA 4WLCA 3O2LA 2EPKX 4AIOA 4M81A 4U5KA 1CPUA 5JBDA 1S46A 4P8UA 3B9AA 3UG5A 2WSKA 5E70A 1C8YA 2D2OA 4NSBA 3DYPA 3U7VA 2G8ZA 2W91A 2ZICA 1GOMA 2O9OA 3KZSA 1C8XA 2OSXA 1EGZA 1E5JA 2VR4A 5KEZA 1V0NA 3WNLA 1IV8A 1Q6CA 1TVNA 1MQRA 5CZKA 5FD0A 2QHAA 2ZIDA 5ECUA 2CETA 1BHGA 3MO4A 1BTCA 3NCOA 3IK2A 4AYSA 1HJUA 4OKDA 4HA1A 3BC9A 3W24A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3NQ2 A;  1ONX A;  3LBM A;  3UI5 A;  2YR1 A;  3KXQ A;  1FQ0 A;  3ZVH A;  3REQ B;  1D7J A;  2OQL A;  4K7Y A;  3C61 A;  4O4W A;  5HJX A;  2PPN A;  3N1A A;  3QTP A;  3ZLG A;  1PL9 A;  2F6U A;  3OZO A;  1R87 A;  3SUR A;  1U1H A;  2W9M A;  3ONC A;  2VEF A;  3C0L A;  1OX4 B;  4P7Q A;  1NY1 A;  1GQL A;  3WMB A;  5E93 A;  4M24 A;  4FOJ A;  1OBA A;  3GB6 A;  4BQ3 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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