4XEIA

Orthorhombic isomorph of bovine arp2/3 complex
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
415
structure length
400
Chain Sequence
MAGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystals of the Arp2/3 complex in two new space groups with structural information about actin-related protein 2 and potential WASP binding sites.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-related protein 3
total genus 102
structure length 400
sequence length 415
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 4xeiA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xeiA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xeiA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4xeiA04
4DCHA 3QBXA 4FPBA 3WXLA 2CGKA 2A42A 2HF3A 3FZFA 3SMSA 4CD3A 1YUWA 3MN7A 4BC5A 3VPZA 1MA9B 3LM9A 3J8AA 1DKGD 1BA0A 3ZEUA 5F1XA 3I33A 2F9TA 1NBWA 4BG9A 1HLUA 3DAWA 3EL2A 3H3OB 3KVGA 4CD1A 1JCEA 4BRQA 5F2RA 4B1VA 5LY3A 4BRFA 2NZTA 5TKYA 1C0GA 3H3NO 2QM1A 2IVNA 3WXJA 4CJ7A 4XH4A 5FPNA 3ATVA 3CJ1A 2GUPA 4WQ4C 3VEWA 3BF3A 3O8MA 4AM6A 3ENOA 3LDPA 3U9DA 5AZJA 2E1YA 1P8ZA 4CZEA 3UKRA 4MLHA 5JLHA 5AQNA 3CJ9A 4BR0A 2A5XA 1U2VB 3VERA 3FZHA 4RTFD 1BA1A 4BRLA 1GLLO 1BOTO 4H5VA 3CJAA 3UE5A 4LC9B 1RGIA 4I6MB 3VOVA 2P9NB 3CQXA 2A6AA 2QWMA 3A5NC 3HSCA 2Q2RA 2E8AA 1BWFO 1HJOA 3EZWA 5ADXA 2P9SB 2GTDA 4K43A 3VEXA 2E88A 3W3DA 4JN4A 2YHYA 3UKUA 4H5WA 2QW9A 1ATNA 3FGUA 4NB4A 3IFRA 4M63C 4FSVA 1NGBA 5CE3A 3TU5A 3WUHA 1D4XA 4CI6A 1HUXA 2D0OA 3GE1A 1HKCA 1X3NA 3HI0A 4EHTA 1WUAA 1IG8A 4YDUC 3ID8A 3SJHA 4M7YA 5AQQA 4FL9A 3BUZB 4DB3A 1SQKA 4M7XA 5E84A 2ASOA 1J6ZA 2E20A 3M6GA 3MK6A 4FWNA 4BGAA 4BQLA 2CH6A 2D4WA 4CZLA 2Q31A 1KAZA 3JS6A 3CJCA 4BRCA 3HBTA 1ATRA 2FF3B 1KAXA 3O80A 5EY4A 2P9UB 2QWPA 3O08A 3ZX3A 2E1ZA 4FWKA 2GWKA 4I6MA 3R9PA 2P9NA 3U4LA 2A41A 1ZC6A 5AQUA 1GLCG 3WXKA 4XEIA 2VYPA 4BC3A 1X9JA 4FOEA 2QWNA 4Y0WA 2V7YA 2P9SA 1TUYA 1XQSC 3RSEB 1BG3A 2E2PA 4Z94A 1T6CA 1NLVA 4ISEA 3SK3A 3GG4A 3AAQA 3CHWA 3MN6A 1V4TA 3LL3A 3VF6A 5BRFA 3WXIA 1G99A 4BVOA 4H0XB 1ESVA 4XH1A 1TUUA 2VWBA 2QWQA 1GLDG 3FFKB 2CGJA 3VETA 4JNEA 2IVOA 3CJBA 3L6QA 3ULEA 5AQRA 2ZF5O 1NGEA 1HKGA 4XH5A 1RFQA 2I7NA 5BN9A 3MDQA 4H0OA 4ISGA 3D2FA 2FLOA 5BPNA 2BTFA 3ATUA 2W40A 5AQLA 4BREA 5AFUA 2A40A 5FPMA 4L3QA 2FSKA 1OKJA 4JD2A 5AQKA 4CZMA 1ZBSA 2P9UA 3IUCA 5AZIA 1R59O 3D7EO 2J4RA 4O8KA 1ATSA 4CZGA 2YHWA 1Z6RA 3GDQA 3ZETB 5KPTA 1SAZA 1U6ZA 2DPNA 2YJFA 5JICA 1NGHA 3RSEA 5JMVA 1E4FT 3CIPA 4PKGA 2IIRA 1DGKN 3HTVA 5BN8A 3O1BA 1NM1A 2E2NA 4K42A 3ZX0A 3U8XA 4BVPA 2OANA 4J8FA 4FWQA 4EAHD 3G25A 3WQTA 1K8KB 3LDOA 1Q18A 3H45C 2D0PA 5FPEA 4FWOA 2P9KA 3OHRA 3P4IA 1MWKA 2P9IB 4H0VB 1XUPO 3VF4A 3A5OC 3LDLA 1HX1A 3L4IA 4A2AA 4YDUA 2ZGYA 4EIAA 4MO4A 5KQDA 5AR0A 3GL1A 3MMVA 3EKUA 4FO0A 5AQYA 1MWMA 3MN5A 5AQWA 4BRPA 4CBXA 1JCGA 3LDQA 3FE1A 3L0QA 5I9EB 3C7NB 5AQTA 4BRMA 1SZ2A 4FOIA 3WEEB 1T6DA 1HPMA 1QQOA 4HTLA 1JCFA 1GLAG 2W41A 3ZETA 1EQYA 3SMPA 2P9LB 1S22A 2GELA 3GBTA 3D2EB 1TYQB 1YXQA 4RWTA 5BPLA 2Q0UA 4BC2A 4MLEA 3MN9A 2HOEA 2Q1NA 1WOQA 3W0LA 5B8HA 5AQJA 2KHOA 3QBWA 4BRNA 2VCPA 5AQSA 2PBDA 1GLJO 3F9MA 3AAPA 3VENA 2PAVA 1BO5O 2P9IA 3AARA 3CERA 1U2VA 1X3MA 1GLFO 1ZXOA 2QWLA 4KBOA 2ASPA 4BRGA 3VESA 2E2OA 2NRHA 5EX5A 2AA4A 5AQPA 5AQMA 4CZHA 3IMXA 4FWSA 4BR4A 4AM7A 4K25A 1KAYA 2FSJA 1Z05A 2GEMA 3QB0A 2FF6A 3VEYA 4QS7A 4FWMA 3H6EA 3C7NA 3CJ7A 4B9QA 3WEEA 2A3ZA 2WUSA 1Y64A 3ZEUB 3O5BA 2YI1A 3FLCO 5KPZA 4CBWA 1E4GT 2P9PB 1T44A 3QDKA 1LCUA 2P9LA 1NGIA 4PKHA 3BF1A 3D2EA 5AQXA 1TYQA 3QICA 3BEXA 5ADXH 5ELZA 3C0BA 3DXKB 4BG8A 3A8YA 3DJCA 1XC3A 3FR0A 3O1WA 5AQZA 3VGMA 4PKIA 5FPDA 4DQ8A 2IVPA 2V51B 3VF2A 1GLBG 5BPMA 4BR5A 5BR9A 4QS8A 5AQOA 4DHYA 4A62A 3LM2A 3O4WA 3EO3A 4BGBA 1CZAN 3CQYA 4E1JA 4FWRA 3M1FA 4H03B 4B1YB 3H1VX 3LDNA 3WT0A 1BDGA 4K41A 4FWLA 4IXCA 3CI5A 3DWLA 3VGLA 3I8BA 4MO5A 4PL7A 4RCHA 3TPQA 4CBUA 1V4SA 2QWOA 1KXPA 4BRKA 2P9PA 3UKUB 2Q36A 1NGAA 3VEVA 3JXUA 4F9OA 3EN9A 4H5TA 4IZ9A 1NMDA 5BRDA 2CGLA 1S3XA 3HM8A 3QFPA 1NGJA 4B1WB 2AP1A 3CETA 3DXKA 3M3ZA 5F0XA 4FWPA 5JLFA 4CZIA 2V52B 3QMLA 5LJWA 4IJNA 5AQIA 2Q0RA 4IO8A 4BRAA 1DEJA 2ZGZA 1NGDA 3ENHA 2I7PA 4BC4A 4H0PA 1YAGA 5AQGA 3VEZA 5BREA 3H1QA 3HZ6A 5EXWA 1BU6O 4JHDB 4H0YB 5EVZA 2CH5A 2QWRA 2H3GX 5AFUH 1NWKA 2YHXA 5AQFA 3VGKA 2FXUA 5KPRA 5EOYA 4CZKA 4C23A 1K8KA 3AY9A 4BR2A 2ITMA 5BRHA 2V7ZA 4CZFA 4H5NA 4H5RA 1QZ6A 1QHAA 3DXMB 4ISFA 5AQVA 3BP8A 3H46O 3GOIA 4GY2B 2EWSA 3A5LC 4BR7A 4WQ5A 4B1UB 1QQNA 4BR9A 1LOTB 2Q97A 2F9WA 4PL8A 4IWVA 3IDHA 5E26A 3ULEB 2ASMA 4BRIA 4B1ZA 4FPAA 4HWIA 5KQ8A 3D2FB 4CZJA 4BRDA 3S41A 5LJVA 3MCPA 1NGCA 3KHYA 4IJAA 3WQUA 1C0FA 2YCHA 1HKBA 1QQMA 4JD2B 3R6MA 1YVNA 2E2QA 4O5FA 1QZ5A 5AZIB 4A61A 3O6WA 1NGFA 4WYBA 2QXLA 2BUPA 4BQZA 2UYTA 3EKSA 4JAXA 1BUPA 2YJEA 3U9ZA 2HMPA 4B1XB 4JHDA 4EHUA 2HF4A 4WQ5C 4QS9A 2ZWHA 4BROA 1RDWX 3FZLA 2FSNA 3QFUA 4BRHA 3A5MC 4NO7A 5AZJB 1MDUB 1H1VA 3A0IX 5AQHA 1NGGA 3UKRB 4EFHA 3FZMA 3FZKA 4GNIA 1GLEG 2GWJA 4A2BA 2P9KB 4H0TB 3DXMA 1IJJA 3B8AX 3VEOA 3R8EA 4WQ4A 3ZX2A 3UB5A 3KZBA 3SLCA 2D1KA 2NLXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HOTA 3VA3A 3FZFA 4B3SK 2F96A 4FLZA 4CD3A 1YUWA 2Z1IA 5HOOA 3DLBA 3ID6A 3HJFA 5SWMA 4E7JA 3LM9A 1C1AA 3NDKA 1BA0A 1RT1A 2A1RA 1T8EA 4LFCK 2HBLA 2XY5A 1RT3A 1VQ8N 4JRQA 5TKYA 4DU4A 3WXJA 4BDPA 4KHNA 3IG1A 1X9WA 3CJ1A 3VEWA 1RBTA 3O8MA 2DFHA 1I3AA 3DLRA 4DFJA 2NRRA 2E1YA 4CZEA 4J2BA 1C0UA 1LW2A 3P5JA 1SKSA 5AQNA 2E6MA 2HBKA 1KLNA 3VQQA 3NGYA 3I0RA 4FJ7A 1KD1O 4H5VA 4WFAL 1RGIA 4I6MB 3CQXA 1B92A 3A5NC 1KTQA 1A5WA 2Q2RA 2RPIA 4JK9A 4CEEA 1SL2A 3CCVN 2UUCK 2GTDA 4K43A 3W3DA 1WSHA 1WNSA 2YHYA 3KK3A 4H5WA 3N4PA 4E7IA 3FGUA 4NB4A 3RMDA 3HXMA 1NGBA 5CE3A 4CI6A 1UA0A 1HKCA 4CGJA 4IBNA 4OPHA 3O9RA 3CCUN 2UXBK 3L3VA 4M7YA 5GAGP 4FJKA 3U3GA 1A5XA 1RBVA 1VSDA 3VA0A 3CD6N 4DR6K 4BQLA 2D4WA 3CFPA 3K5LA 4LFBK 3HBTA 3CCSN 2FF3B 1L3SA 5KI6A 2HHUA 3ZX3A 1VQNN 1GOBA 4DU3A 2GWKA 3R9PA 1VQ6N 5AQUA 1GLCG 3WXKA 2IGIA 3OJUA 5CZ2A 1K6YA 4FOEA 4R5PA 1EKEA 4KHYA 4LSLA 2HHVA 3OYHA 4Z94A 4ISEA 1TV6A 3E9OA 3CHWA 1V4TA 4BEBA 5BRFA 4BVOA 3TAQA 2HVHA 5TKWA 2VWBA 2Z1HA 3FFKB 1BCMA 4Z4EA 4DG1A 3OW2M 2CGJA 4YORA 4M3UA 3AVFA 3ULEA 2ZF5O 3V1QA 4OPJA 4XH5A 2I7NA 4ISGA 1RTDA 3OY9A 2O4GA 2FBXA 3MX5A 3QLHA 2W40A 3O9SA 2FSKA 4AHRA 4CZMA 4CIGA 3ZT1A 3UIQA 4RW9A 4GW6A 3I56N 3ENBA 3M8PA 1HNXK 3NF8A 4KHPK 3DMJA 3O4NA 2DPNA 1WBBA 3OYBA 3AGRA 2HHQA 1DGKN 3SQ0A 3ZX0A 2QTDA 4K42A 3K5NA 5SZTA 3VQCA 4FWQA 1VSFA 3LWLA 3PSFA 3G25A 3LP3A 1LAVA 3WQTA 2D0PA 2P9KA 2GBZA 1ZYQA 2Q3SA 1L3UA 2O8CB 3M8SA 1I94K 2HHHK 1E3MA 4OGEA 3EEQA 4CGHA 4PA1A 4AF1A 4FJIA 1MWMA 2KKZA 4FVMA 4IG0A 5HBMA 1WBDA 4KB0A 2C1GA 4CBXA 3BDPA 2O8EA 1C6VA 3TAGA 5KRSA 4OO1J 3VQ5A 1RDDA 4NCAA 4FOIA 3WEEB 1EWRA 3CM6A 1JCFA 4PWDA 1OVYA 2X78A 2EX3A 3ZETA 4BE7B 1EQYA 1OH6A 3SV4A 1D9DA 3G10A 1NK8A 4DV6K 3D2EB 1TYQB 4CIEA 4RWTA 4J2EA 4FJ8A 2HOEA 5B8HA 1L3VA 4RW7A 1QVGM 4BRNA 2XO7A 3CERA 1S1XA 2HHSA 3SAHA 1GLFO 4DLEA 4ELVA 4X66K 4YOVA 1RDCA 2E2OA 5MLCQ 3KKRA 5AQMA 3VN5A 4CZHA 4DTJA 3IMXA 1HNVA 1VQ7N 4K25A 4FJMA 1Z05A 1RBRA 4GVMA 3V9SA 4WE1A 3VEYA 4JI1K 3CF5L 1JL2A 4B9QA 2A3ZA 1QSYA 4DS5A 2YI1A 5DMRA 4X62K 4JKGA 3I55N 2X74A 1HR0K 2P9PB 3ZSXA 3QDKA 1WSFA 3O4QA 2P9LA 4KB1A 1NGIA 4PKHA 3BF1A 3CC4N 1FK9A 3SQ2A 3F5TA 4B3MK 4RW8A 4WCEL 4BACA 4ELUA 4DTRA 3OS0A 3A8YA 3O1WA 5GIOA 2ZJQL 3G0ZA 4PKIA 4GMJB 2V51B 1GLBG 3MWTA 3CQ8A 3DM2A 5BR8K 1GOCA 1U04A 3SPZA 4E1JA 1CZAN 4JKAA 4B1YB 3H1VX 3WT0A 1CXUA 5J2PA 4IEIA 4FLYA 4FWLA 3CI5A 5C0YA 3RR8A 4MO5A 4JK7A 3CXCM 1JLEA 3C65A 5GADP 4PL7A 2B6AA 2JWLA 4RCHA 3CG7A 4CBUA 4MFBA 3AO4A 1OH7A 2QWOA 2KW4A 3CC7N 2IAJA 4Z4GA 3L2WA 4F2SA 1NK7A 5CHIA 3LAMA 1YT3A 4F9OA 3HO1A 2ZQBA 2BGGA 4B3TK 1EXQA 4CEFA 4CGGA 1S6PA 5CY4A 1KRPA 1HNIA 4IFEA 3AVGA 4B8AB 4K8XA 1B9DA 3CETA 1YHQN 4DTUA 2D0AA 1FKPA 5F0XA 5KRTA 5JLFA 1NJZA 3NE6A 5GIPA 3VQBA 1T7PA 1NK4A 4JI7K 4KHUA 4L8RB 2UXCK 3CPWM 2V52B 5LJWA 4OKEA 5JS2A 1JXEA 2Q0RA 3S5TA 2GUIA 3PX0A 3ENHA 4DUYK 1UA1A 4Y1DA 1KVCA 2G8KA 3HPGA 5BREA 1IKXA 2VG7A 1ASVA 3K59A 2OYQA 5EVZA 3WXMB 4CVNE 2H3GX 3L4QA 4RW6A 3HPHA 2F7TA 4NLBA 3VGKA 2FXUA 3THXB 3B6PA 4E1MA 2GV9A 4U67L 1W0HA 1HPZA 4DKWA 2O4IA 1Q82O 4BR7A 2EWSA 3A5LC 3QETA 2F9WA 3ULEB 3TR8A 1ZBUA 4DV0K 3KKSA 2P51A 4CZJA 1T03A 5LJVA 3P39A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5EX5 A;  1J53 A;  2YNI A;  5CZ1 A;  4BR4 A;  1TKT A;  3NMU A;  4FWM A;  4DR3 K;  3TSQ A;  3AVC A;  2WUS A;  3ZEU B;  3L2Q A;  1P90 A;  3HM9 A;  5LMU K;  3TAN A;  3K57 A;  3S3N A;  1TK8 A;  1HYS A;  4CBW A;  1WSJ A;  3ULD A;  1N6Q A;  1T44 A;  4DFM A;  3E9L A;  2DTU A;  4KH6 A;  1HNZ K;  1DT9 A;  3OYM A;  1W97 L;  3DXK B;  2RE2 A;  3FR0 A;  1N32 K;  5GAE P;  4DTN A;  3THY A;  2NRT A;  3VF2 A;  5BPM A;  1X1P A;  4BR5 A;  4FM0 A;  4EP4 A;  3T7Z A;  4AH9 A;  2P5G A;  1BDG A;  2PZS A;  2WOM A;  5FRO A;  4C8L A;  4K41 A;  2RF2 A;  4FM2 A;  2HNZ A;  4KHW A;  3VQP A;  3VGL A;  3PX4 A;  3O3G A;  5I42 A;  3I8B A;  4FJ9 A;  4FLW A;  4KTQ A;  4FK2 A;  2RHK A;  3TPQ A;  5M1F A;  1YJW N;  1KXP A;  4DR4 K;  4CJQ A;  3MXI A;  3VEV A;  3JXU A;  4KI6 A;  3F2K A;  4IZ9 A;  3SQ4 A;  5BRD A;  2CGL A;  1S3X A;  4GKK K;  2JWK A;  2AP1 A;  3I0S A;  3U3Y A;  4BE2 A;  3NCI A;  1YJ9 N;  4DTO A;  2IC3 A;  4E1N A;  4AQY K;  2OCE A;  4X64 K;  4CFB A;  3VMF B;  4CES A;  5C42 A;  4HUE A;  3K9J A;  4TSX A;  1OH8 A;  1Q8I A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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