4YMAA

Structure of the ligand-binding domain of glua2 in complex with the antagonist cng10109
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structure-Activity Relationship Study of Ionotropic Glutamate Receptor Antagonist (2S,3R)-3-(3-Carboxyphenyl)pyrrolidine-2-carboxylic Acid.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ymaA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ymaA02
1TT1A 1FQFA 4O3BA 3EPEA 3GLBA 3LSLA 5AA1A 4P11A 3U72A 1B7UA 2B3FA 5AE4A 4YB7A 4DIGA 1N0TA 3KEIA 3K01A 2V3QA 4ZE9A 4FJPA 4IO4A 3K1NA 1R1NA 2Z23A 3PUVE 4NTLA 1US5A 5KCJA 1JVYA 1H3DA 3IX1A 3PMWA 1Y4CA 4G68A 4NF5A 4ZECA 1B46A 4GL0A 4KCDA 4H5GA 3IO6A 4OFOA 2HAVA 1SVXB 3D4GA 4XKNA 1Z7NE 1B7HA 3HHFA 1ZLQA 3DM0A 4G4PA 1Z7ME 4THIA 3BBRA 1P1QA 1MXXA 3CSBA 3KGCA 1EZPA 1NH8A 1NL5A 5I56B 4RY1A 3OO6A 3Q29A 4FEDA 1XHYA 2I4BA 5ISUA 3RPWA 3K02A 3OEMA 3PUXE 4H5FA 1EZ9A 4U1ZA 3K6VA 3O9PA 2ZXTA 4YKPA 1MQIA 4NF8B 3S9NC 3RUMA 4IO5A 2D3IA 3DP4A 1B1XA 2GH9A 4R74A 4IO7A 2HFBA 3H6TA 3A09A 5CMMA 4XXUA 1S50A 4JWYA 3IAZA 5CBRA 1ELJA 4U23A 2XXQA 4R73A 5FHNA 2H9BA 1JVXA 4NE4A 3H6WA 4TOZA 3GXAA 4FE8A 1LSTA 4ZEBA 4M4GA 3M3LA 1IIWA 3DP6A 4OQOA 2FYIA 2ONSA 4JXIA 3LSWA 4N13A 3SDFA 3T9HB 3VXCA 1NNKA 2NUVA 4DZ1A 4HW8A 2REJA 1XC1A 2I0BA 1SI0A 2XXXA 2Q2CA 5H8QA 3KJ7A 3TELA 2Y7PA 5I2KA 4RNSA 4XKQA 4EXLA 1SI1A 1RKMA 1LB9A 1B3LA 3MVWA 3H03A 4ND9A 1GGGA 3TCHA 3MQ9A 4DXUA 5BWJA 2QS4A 4I9DA 1MY1A 1MPBA 3G3JA 2F34A 4OESA 1R9LA 4ELQA 3PPNA 4QFOA 3SEXA 1QW0A 3TDJA 2UVJA 3FJ7A 3R26A 2ZYOA 4F29A 3O6GA 3TQLA 3T9UA 5DEXA 1MDQA 4QRZA 4R6YA 1FTMA 5TPAA 4POWA 2Z8FA 1UTHA 1FQAA 4IO2A 4OMBA 5I84A 1IXGA 3CIJA 1A8FA 2GHBA 3QUJA 1QKBA 4F3BA 4LQ2A 4RXLA 4F3SA 2O6AA 1VE4A 3U94A 1P1WA 4BDRA 3FIRA 4R72A 4ZEIA 4UA8A 3OO9A 1UTBB 3MZ9A 2FA7A 3RT8A 1NNPA 5H8FA 4FORA 3PU5A 3T9XB 4Q5TA 2GHAA 3CSGA 1MH4A 3FUZA 3K1PA 3O2AA 4RJZA 3K1MA 2CMOA 4U22A 4GIZA 4WEPA 1IITA 1MH3A 3E13X 2O1MA 4POXA 4FEBA 5H8NA 4R9FA 3FXQA 1MQGA 4PE5B 2XHDA 1A7LA 4R2FA 3ZSFA 4F2QA 1D9YA 4U4XA 2LAOA 1NKXA 3U92A 2B65A 1Y4TA 4OENA 3HSTA 1QUKA 3FVNA 3VXBA 3K00A 1Y3PA 4JBZA 2BJJX 3C9HA 5IKBA 2Z8DA 2D21A 4IY6A 4H8JA 1B6HA 4QHQA 2F35A 3MP8A 4KI0E 4GLIA 3I6VA 1JQFA 4ELPA 3TFLA 3O66A 4LONB 4DE8A 4OERA 3WAFA 2DXYA 3OENA 1TFDA 3UK4A 4F1YA 1MPCA 2Q2AA 2A5TB 4IGTA 3IOTA 4YB5A 3S9LC 4ELOA 3FV2A 4KYEA 4QSCA 4R6HA 2QPQA 1S7YA 4GXAA 4IGRA 4G2ZA 1OLCA 4DCXA 4JSOA 4NWCA 3U93A 5DVFA 3G3HA 1B58A 1SD3A 2VD3A 1B4ZA 4YKJA 2RCBA 5I56A 4HCYA 3KOSA 4UACA 3N94A 3B6TA 4KQPA 4E0WA 1NFTA 4H0WA 3H4ZA 1B5HA 2RF1A 2HAUA 3TUSA 4NF8A 1PB9A 3LR1A 4AB5A 3CFLA 3G3IA 3BFUA 1RYOA 5TP9A 1I6BA 1NH7A 2F7AA 4MLVA 4K3FA 1LGBC 5M2VA 3H6UA 4C1UA 2DP8A 5H8HA 4OEVA 3VE1B 1LBBA 3Q25A 5F1QA 5JEIA 2F6PA 4G68C 3RN8A 1JETA 5DTBA 3T22A 2Y7KA 1WODA 2O84X 4DXCA 2X7PA 2PMSA 3PPPA 4ONYA 4AB6A 4ZZEA 1JEUA 4IY5A 3V89B 2Q88A 1PBQA 5EHSA 4QSEA 2IA4A 1AIVA 3KN7A 4NEDA 3SEYA 5CC2A 1A99A 1MG1A 3E3KA 4JB7A 2AL4A 4ZEKA 2HXWA 5L9SA 2F5XA 2PYYA 3K6UA 3VLWA 1POTA 3QK6A 3M8UA 4PFYA 5LOMA 4KYSA 2XXPA 1B7ZA 1DOTA 5I59A 4MH5A 4F39A 3JYRA 4ECFA 4EF2A 4ISUA 3ILTB 1OIBA 4GFRA 3AXFA 1OVBA 3D4CA 1O64A 2I49A 3O28A 1QUIA 4ZEDA 4OVJA 3PD8A 3IB0A 1P1OA 1JNFA 1FTJA 4R9GA 4N6PA 1MY3A 3W9VA 1AOVA 2P0SA 4HS7A 4GVOA 2FNCA 3L6GA 2YPNA 1B52A 4GXSB 1ANFA 4PETA 3TTRA 2O51A 5L8DA 3E4RA 3W9WA 4YU0A 4U1OA 3V83A 1MQJA 2O1LA 2R6GE 1B40A 1B2HA 4DXBA 1SBPA 3LSFB 3PPOA 3HCQA 4H8IA 4U2RA 3SEUA 1ZTYA 3V8XB 1M5EA 2H98A 4F31B 1O7TA 5B70A 3O6IA 3TKDA 1EH3A 1FQCA 4DDDA 4LATA 2RKMA 3K0VA 5ICQA 4Q0CA 2HZKA 4XKPA 3B6QA 1ZMGA 1WDNA 2ZMBA 5KZTA 5I57B 3Q26A 1MY0A 5CMKA 1IZ1A 5JK4A 2HQ0A 4EXKA 5HM4B 3MC2A 3G3FA 1B5JA 1B32A 3F11A 2UYFA 3ZKLA 5ELVA 3N5LA 2V3TA 2O7UA 4H1XA 3T93B 1SDXA 4BDNA 5IAIA 2A5TA 4QFKA 4EQ7A 1QUJA 2ESNA 3BKIB 3ECRA 3N26A 2GFEA 1MXZA 2O7IA 4G8MA 4OTEA 2AYSA 4LZ8A 2PVUA 3EN3A 3MAMA 3I3VA 4ZEFA 2M8CA 1IQ7A 4Q8RA 4Q30B 1B0LA 4IB2A 2I3VA 4L17A 3QAXA 3JV9A 3THIA 2QMXA 4OYVA 3V5AA 5AA2B 2F97A 1BIYA 4F18A 4XTCQ 1MQDA 3UORA 3MVYA 3C35A 3VVEA 4KFQA 3UGWA 1IUDA 1KWHA 1LAXA 2ONRA 3KFMA 5F7VA 2PT2A 3LSXA 2XXRA 2F8DA 1YCJA 3SESA 4TLMB 3O29A 3RY3A 4LP2B 3ONMA 4G77A 2I48A 3FZVA 3FVKA 2DE3A 2OWTA 2UVIA 2O68A 1D3KA 3TTKA 4ZE8A 4MLQA 4NF6B 1PDAA 1S9TA 2NXOA 1USYE 1DSNA 3FVGA 1OQGA 2OJTA 4I1DA 4RPOA 2DQVA 3TQWA 3KSXA 1LFGA 2VGQA 4DLDA 3MUQA 2Q8JA 1NNTA 2REGA 3G3KA 3K4UA 1M5FA 2Q89A 5KCJB 3RTWB 3IOVA 5HBCA 3UN6A 4OHNA 2XX8A 2V93A 2Z8EA 1SYHA 2DE4A 2DYXA 5DVIA 3TTNA 5KDTA 3MW0A 3M3FA 2VP1A 3KOTA 2DE2A 3G7WA 4F19A 4F22A 2Z22A 1IXHA 3GZGA 1N3WA 3PGFA 3KZGA 1LAGE 2O69A 4LZ5A 4RK9A 2ONKE 2WKYA 4PFWA 4F2OA 4RK2A 2XXIA 2OK2A 2ZNTA 1XS5A 4NF4B 1ZKBA 2AL5A 5FHMA 2AIXA 2PX1A 2THIA 2NVUB 4WXJA 4JWXA 1N3XA 1MM7A 2RC9A 3CFZA 3VVFA 4U21A 1Y1MA 4R2BA 2NWJA 2ABHA 3Q28A 3KJTA 1MXVA 2F7BA 3EHUA 3PMXA 3VLVA 1A8EA 1XOCA 1GV8A 3EHTA 5DT6A 1HSLA 2R71A 1DPEA 2RCAA 3MZBA 2ZYMA 3A3CA 1MM6A 4H67A 4R75A 2DWAA 2UYEA 2ZNUA 2RC7A 1D4NA 5H8SA 2QS1A 3TCFA 5H8QB 4BDQA 3RNNA 4TLLB 3S4UA 4HTGA 1H43A 3PD9A 1NMUA 4YZZA 3A3UA 1J1NA 1GR2A 5ITOA 3RLFE 3MPKA 4C1TA 3LC8A 3OMBA 3ODBA 4RYAA 4EDPA 4KD5A 3IOWA 3OO7A 2DS9A 3FASA 2DWIA 4ESXA 1Y20A 3VDFA 4QFLA 1CB6A 1UIUA 3N6TA 3T96B 4G8HA 4PFTA 5I57A 1LCFA 2I6EA 5FTIA 4JDFA 3PPQA 5ITPA 4XKRA 1MPDA 2P1SA 3QYTA 1B3EA 2Y84A 5DEXB 4X1BA 3MP1A 1FTOA 4OFJA 1LBCA 1FQDA 2DVZA 3FJMA 3ZS6A 1UIVA 4X1DA 1EU8A 1HSJA 1YAEA 3BFTA 2R9JA 4WKMA 3S2VA 2XX9A 1B05A 3HN0A 1AL3A 3EHSA 1M5BA 3TTLA 2XX7A 2VHAA 5I2NB 1A54A 1H76A 3B7DA 1SW5A 3H7MA 3P7IA 2Y7IA 4PFUA 4YKKA 3IB1A 3S9MC 1Y3QA 4RPNA 1N76A 1PB8A 2XXVA 2H5YA 5H8FB 4QSDA 1ZJLA 4MF3A 5AA2D 2DXRA 1BTJA 3CG1A 1TWYA 2UVHA 1URGA 3EF7A 3IB2A 3FGSA 4O3CA 1QJMA 5TU0A 4MBPA 2QRYA 3T66A 4M1VA 1MXYA 1L5TA 3UIFA 3LBSA 2X7QA 2V25A 1LLSA 3OOAA 5L9OA 4KCCA 4LA9A 4PP0A 4YAHX 1ZBMA 1H45A 2YLNA 4NF6A 4P0IA 1N7XA 4IO3A 4FECA 3HO7A 5K2YA 5CMCA 3H3GA 3PUWE 1AMFA 3TCGA 4GD5A 3PUYE 4ZZAA 1IXCA 2XD2A 1UTBA 1B0HA 1JW4A 2XXTA 4TQUQ 3G3GA 2ZNSA 4JSDA 1N84A 1O63A 3R6UA 3OXNA 2I0CA 5I58B 1Q1KA 5AA4B 4EQBA 4QFPA 1Q35A 5J1DA 1VFEA 2VOZA 2OZZA 4OWDA 3VV5A 3C4MA 2DWHA 3IR1A 3QIMA 3QUFA 1MY4A 3RQTA 3MBPA 3DP8A 3OD7A 1B9JA 1A55A 3U8QA 4MFIA 2W7YA 4NF4A 3MPLA 1IEJA 2X26A 1USYH 1QKAA 4YKIA 3HPIA 4GF8A 1JEVA 1B3FA 5BUUA 2V3UA 2DSFA 4OZ9A 4ESWA 2XXHA 5L9MA 5TP9B 2NOOA 3C31A 4LZ7A 4EUOA 1LAHE 4O3AA 2HZLA 4ELRA 4FATA 1B4HA 4PQJA 4BDMA 3K2DA 4YMAA 1FQBA 4GL8A 1VR5A 5H8HB 1FQEA 3CI8A 1Y9UA 1GVCA 1CE2A 4F3PA 2Y7RA 5A5XB 3SETA 1F9BA 2A5SA 1LFIA 3PV0E 2OBGA 3R7XA 5B7DA 3MVZA 2QMWA 4ZDMA 4X9TA 1Y1ZA 2RINA 2VD2A 3N6UA 3WAEA 2I4CA 3IO4A 1TXFA 1LCTA 2DOJA 2Y7WA 4EQ9A 2UVGA 3TTMA 2QS2A 1MRPA 1JW5A 1II5A 2GRVA 2XXWA 3MP6A 1LAFE 1LFHA 4KYDA 2V84A 4C0RA 4X48A 1VFDA 5JTYB 2OCUA 3OSRA 3KN3A 3CR9A 3IOUA 3T9VA 1POY1 1M5CA 3TEPA 1N7WA 4YB6A 2KLFA 1I6AA 1MXWA 2HEUA 4BDLA 4NWDA 3ZKKA 1BP5A 1I69A 2I58A 1ZU0A 3IJOB 5I59B 1B3HA 2OLBA 3H06B 4Z0IA 1R6ZA 3DELB 1BKAA 4H65A 4FAJA 2DVCA 2DWJA 3C36A 3SERA 1DPPA 3FXUA 1A40A 2XD3A 1OVTA 3U1OA 3FD3A 3MWBA 4LQ5A 3FVOA 2F6GA 4F3GA 3QXMA 4G68B 3RGYA 2E0SA 4NF5B 4RA1A 5I2NA 3OO8A 1SYIA 4HCWA 1H44A 3O6HA 1FCKA 1MXUA 3B6WA 1B3GA 1DTZA 3O97A 1PBPA 5FHOA 1HSEA 2F36A 1US4A 3SKPA 3PUZE 1PC3A 1YTVA 3H6VA 3S9EA 1JW1A 1P99A 2PBWA 2PT1A 1I6QA 3CG3A 1NNFA 1P1UA 3I5OA 4YICA 4IO6A 3KG2A 1FW0A 2XXUA 1T0KA 2QS3A 4F1VA 2UXAA 2I3WA 4Z7EA 3C32A 4LVQA 2HCAA 3OEKA 3CFXA 1XVYA 3IL1B 1OQHA 1B5IA 1QULA 4FIMA 2E1SA 1BLFA 1N04A 4N07A 5HPQA 4BDOA 3GBBA 4JWOA 3TMGA 4I8CA 3W15C 4WEDA 3UP9A 3SEWA 5CM6A 1OLAA 1MDP1 3RTFB 1SW2A 3MZ1A 1R9QA 1LB8A 3HHGA 1ATGA 1MS7A 3IORA 3QSLA 2QL3A 1WVJA 3PPRA 1PB7A 3K6XA 3CRBA 4KR5A 1Y3NA 4F1UA 1ZIUA 2Q9TA 5I58A 2F7CA 1SQYA 3TODA 3MVXA 2F78A 3MJNA 5AA4A 4GWOA 2RC8A 4NMYA 1QVSA 2QJEA 3FXRA 1DTGA 2H25A 1GTKA 5I2KB 2ZYNA 4I62A 1UQWA 4QFNA 1FTLA 1D9VA 3KSJA 2B3BA 1AH5A 2IEEA 3C34A 1OMPA 2OWSA 3KBRA 4OETA 3OSQA 3LUYA 2CZLA 1M5DA 5FTHA 1B51A 3EQ1A 3TAJA 3FJGA 3K6WA 3M3KA 1XVXA 3TZAA 5EYFA 3UA8A 4YMBA 1URDA 4E0XA 3PMVA 3C33A 4AQ4A 4KHZE 1IXIA 4OEUA 5TPAB 1PEBA 2P2AA 3Q27A 5CMBA 5EHMA 1UTHB 1URSA 1XT8A 3RT6B 2ALUA 3USDA 5K2XA 4OXVA 2D5WA 3VFJA 4XIGQ 4BLAA 4GRKA 5A5XA 1MY2A 3CVGA 3IJXB 3TPAA 3OELA 4OFLA 3FATA 4DCYA 3DLNA 5CI5A 4H6DA 4G8NA 4QF9A 4P0GA 3HV1A 2G29A 2H4IA 3JZJA 4EF1A 3GBAA 1SW1A 3ILUB 1FTKA 5ICTA 5CBSA 3E9XA 4ZS9A 3SEVA 3VVDA 3TYHA 5AA3A 1P1NA 5DVJA 4R6KA 1VSOA 1MQHA 4U4SA 5AA2A 2ANJA 4GOTA 2ZYKA 3L6HA 2H99A 5KDTB 3FV1A 1TFAA 5JTYA 1YPNA 3KN8A 2G93A 2YJPA 4KPTA 3VLUA 4LUBA 3IK6B 1DMBA 5DYHA 2XXYA 2QSXA 1RYXA 5H8NB 1EZOA 5CRYA 1B1HA 1SW4A 4GQOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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