4YXGA

F96y mutant of plasmodium falciparum triosephosphate isomerase
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
246
structure length
238
Chain Sequence
RKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGSYTGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHYERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWTPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Connecting Active-Site Loop Conformations and Catalysis in Triosephosphate Isomerase: Insights from a Rare Variation at Residue 96 in the Plasmodial Enzyme
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 94
structure length 238
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2015-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4yxgA00
5CPNA 1Z44A 4NNCA 4HSNA 5EMUA 2V82A 4UIOA 3TROA 3DGRA 1V7YA 1W3TA 4JY8A 3L66A 3IIPA 4Q4KA 3GXPA 1YTKA 1LROA 4NJKA 1UASA 3M43A 2ZRYA 1JCJA 1JCYA 3GDKA 4GNJA 4JTJA 1VCFA 4AWUA 3T78A 1X7FA 4O28A 3F1QA 1EWDA 5E93A 1R2RA 3N19B 2FPVA 3O15A 2J9XA 3GVGA 1SPQA 2V2HA 1LZOA 3MO7A 3VE9A 4ZVJA 5FF4A 2WNZA 3PB0A 4QIUA 1AMKA 1WDWA 4FNPA 1GQNA 4JX6A 3IVUA 1SFJA 5KZMA 1S5WA 1YPFA 4NJJA 4OV9A 1M7PA 3LTYA 1JRCA 2ZRUA 5I3HA 4JGDA 4EIVA 3G1AA 5F2GA 3BW3A 3ZWTA 4YXGA 4PEKA 3W70A 1S5TA 3P80A 2WNQA 3MI3A 1B3OA 2YDAA 1RD5A 1KM1A 2GVLA 3DZ1A 1XI3A 2V30A 3NQAA 4Z1DA 3QQ0A 3HJZA 2NZLA 2YW4A 5HR7A 4WY0A 3NQGA 3C2RA 1GWJA 2DZVA 5LNSA 2R94A 3BGGA 4FNRA 1ZJIA 1CX9A 1YTDA 5C55A 1B57A 4N9DA 2V5LA 1I2OA 1TPFA 3LCHA 5DXYA 4LS0A 2OX1A 4O57A 2GPTA 3UWQA 5I3FA 2E1DA 2JK2A 3TH6A 4O10A 2FTPA 4P2VA 1JVNA 3I7QA 4E2BA 2YSWA 5LSMA 3NDOA 5FESA 3DKLA 2CLIA 1NSJA 1OFEA 1PCKA 1N55A 3KRSA 5AHEA 3SECA 3QYQA 1LLWA 4FEZA 3S6DA 1JQXA 3BW2A 3MP5A 2E77A 1HFBA 3LV5A 3NQFA 4YMZA 2YFNA 4K7YA 4N9EA 4RXGA 3TE9A 1H7WA 3MBFA 2DZXA 3G24A 3GKFA 1JCLA 1VRDA 1F74A 3NG3A 3SJ3A 1LOSA 4UTHA 3C61A 3FKKA 1Z41A 2X1UA 4BR1A 4DF2A 2NLIA 3NXFA 4B5NA 3IIVA 4Z1AA 2C19A 2VOMA 3W1UA 4IXXA 5BNKA 1M5WA 1RV8A 3LRLA 4LC8A 5CKSA 1SSDA 8TIMA 1YLVA 4CCEA 5BRBA 5CGQA 4ZQRA 1XBYA 1VYRA 2HS6A 1GYLA 4AMAA 2PE4A 4Q33A 5LNRA 5HUOA 3P8IA 3PUOA 3W1QA 3W7LA 2ABBA 3R2GA 4UUIA 4KWWA 1A5CA 2A0NA 4O18A 1LRQA 3NM3A 3B8DA 2VFDA 4JDBA 3TIMA 3ZS4A 3B04A 3L67A 1W3IA 3ABQA 3W1LA 2FB2A 1XUUA 4ALDA 3ZWSA 1XC4A 2E5BA 2VEMA 1P4CA 3M0ZA 4NXSA 3G1VA 2NV1A 1RQHA 1SU5A 4IMGA 3OIXA 5D09A 1QPOA 4IXHA 2J88A 1SSGA 3AJXA 1I2NA 1OABA 3N34A 3NL2A 1B4KA 4IJBA 1HUVA 1SFLA 5HWNA 1MSSA 3KX6A 1WYIA 3S0CA 4NVTA 5HNRA 4FX8A 5LZLA 1KM3A 3TJXA 1JCMP 5CPOA 3TC6A 5C5YA 3G1YA 1LLZA 4M19A 3MHFA 1KTCA 1XL9A 3L2IA 2TRSA 3SW6A 4LRSA 2VENA 4JS3A 4NNAA 1ZCOA 5U7SA 1OFQA 2BZNA 2YW3A 1F7BA 4J9JA 4WOZA 1AL8A 1I4NA 1QO2A 4R34A 4MY1A 4EF8A 3N73A 4XKYB 1GPWA 3G0SA 1LBFA 3TCEA 4AF0B 4ORIA 3C2VA 4O0KA 3N2MA 4IX0A 5KINA 1SO3A 3NQDA 5FF2A 1FCQA 2NX3A 5FF3A 4NXKA 2O7QA 1MXSA 4Q32A 4UC5A 1ZENA 3NPXA 3DH7A 4POCA 1OFDA 2VFEA 3HQ1A 3TXVA 2FFCA 4NU7A 1SR9A 1ZHAA 4LW7A 4R53A 2OJPA 4DBDA 5KITA 4CQ8A 5HWMA 5D32A 3QEZA 4TO8A 3TV8A 3S1VA 2YFOA 3MP3A 2Y6ZA 4HT3A 4OE7A 4MUZA 2KZHA 1ZALA 1LOQA 2ZCGA 4O1CA 3R89A 3EWXA 4QISA 3W2UA 3WK1A 4M7TA 4O13A 3P7YA 1FQ0A 4K38A 3HF3A 4M7SA 4UFIA 7TIMA 3WJYA 3KVMA 3W84A 2ALDA 4WD0A 4JTGA 3B0UX 3P81A 2RFGA 1KFKA 5K4ZA 3TMQA 5HJLA 3DFOA 1FDZA 4CNNA 1QOPA 2XFWA 3SZ8A 4UTWC 1O5XA 1TQXA 3L0NA 4O17A 4MZ1A 3T7VA 4D2JA 4O1BA 2ZA1A 1BWLA 3GNDA 1LOLA 3C56A 5TBOA 4UTMA 3GIYA 1FX6A 4O50A 2OT1A 5FF0A 2OT0A 1QMLA 3LLDA 3ABSA 1CI1A 3EX2A 5LHFA 3JRKA 1KM6A 1K8XA 1XXXA 4O14A 3QSTA 2NUWA 1SO4A 1VC4A 1W1ZA 3L0GA 5HUPA 5FEPA 3LGEA 3LBCA 5LGXA 1B9BA 3Q2DA 2Y7FA 3NQ2A 2RHGA 3TFXA 3W2MA 4AHOA 5K9CA 2Z2UA 3W7IA 3DFQA 2CLMA 2E09A 4MYAA 1EB3A 2BLEA 4H4IA 3EX1A 5CPLA 4DQWA 3R12A 4BI6A 4E0CA 3FEMA 3ABOA 1I2PA 2Y63A 3UZJA 1QDSA 1J4EA 1WAUA 4FHAA 4MFEA 2QDHA 3TUUA 1KFBA 3CEPA 1EX5A 2PURA 2J27A 2X2GA 3H53A 4PTNA 4RZ6A 2QCFA 4N02A 1OFPA 1XFBA 3BPWA 3V75A 5J5RA 4MLRA 4DBEA 1H7NA 4HPXA 4GFSA 4LT9A 2VFHA 1PIIA 5LNWA 4UXDA 2JBMA 1OFAA 4O4VA 2NXIA 2VKZG 3UWWA 3FLUA 2QF7A 1TTQA 3QW3A 5K9DA 3E02A 5C6MA 2QJIA 1GVQA 2X30A 5DY2A 5H2ZA 4BI5A 2J9YA 1OF6A 3PF3A 2D73A 3P5YA 1TQJA 4RZ5A 1FUYA 4QAIA 1QCWA 5G1TA 1W31A 4RZ4A 3OVRA 3QF0A 2A6LA 1AG1O 1OYBA 3UYCA 2RDUA 3TSDA 4LVAA 5J5DA 1GVRA 1IXOA 2CLLA 4MY9A 2B7QA 3INPA 5E1QA 3W1MA 1DHPA 5BMWA 4N9BA 4HNVA 2WOQA 3OA3A 4O0ZA 1OVDA 5DN1A 4UNKA 4R7JA 1OK4A 2I1OA 2PRMA 2V81A 4N9CA 1DOSA 3IGUA 3BARA 3SGZA 3L0KA 2QCNA 4IWWA 3E0IA 5FEXA 1LM1A 2QCEA 3FOKA 4QNWA 1VLWA 4QJ1A 1GEQA 4S2BA 4JEQA 1UUMA 5AOUA 3L9CA 3W3OA 1C8VA 1T96A 1U83A 5I3JA 4XBKA 1L2UA 2H3BA 1SO5A 5D33A 2XN2A 2OMAA 1LBLA 1EUAA 3O07A 3TW7A 3DFTA 3LHUA 1N7KA 2E68A 4TR9A 3W7RA 2V9DA 2Y61A 1DVJA 1GZGA 2QUUA 3K30A 1ONRA 3W76A 3W7PA 1NF0A 1W5MA 2ZZ5A 2PCQA 4AB4A 5G1YA 3O8AA 3L65A 1FWSA 4FO4A 3CM4A 3W83A 1W5OA 4LVGA 2YYUA 2A85A 1JJKA 4NZJA 2DZSA 2QAFA 3LCFA 3FJ6A 1H51A 4PL1A 1HL2A 1TPC1 3LLFA 3UY7A 1C9DA 2C13A 4GE8A 4JTEA 3OEXA 1FXQA 1Q6RA 4M5PA 4DEFA 3TXZA 3F4NA 1DQWA 1R2SA 3STFA 4WUIA 4E2DA 1EIXA 4OQVA 5D2WA 1XM3A 2NUXA 5LKYA 1G7UA 3LXBA 3HOJA 4DF0A 1SZEA 1H5YA 3KAOA 3PR2A 1FY6A 4GWEA 3UXDA 3LM7A 5EL1A 1M7OA 1XBXA 3M6YA 3ZR4A 3M16A 3IIZA 1DV7A 4JTFA 2QUVA 4PCFA 4UTTA 1YPIA 5AHLA 2EAWA 2QCLA 4BWLA 2R14A 4I7VA 1MEIA 4N2YA 4LWWA 3L68A 3TFCA 3LX9A 4MVAA 3HGSA 3QH2A 4O8RA 4JN6A 3T4CA 3WFAA 3W7OA 3QMRA 1F76A 5AHFA 3G1DA 3OG3A 4TMCA 1LYXA 2FLIA 3EWZA 4Z08A 2J24A 2WV8A 5EBUA 4OHQA 1LCOA 3THAA 1D3HA 3I7RA 3AO0A 4NT0A 5DLCA 4WZHA 1GVSA 2NX1A 3KRUA 1ML1A 3MI2A 4KFOA 5DCEA 3G8EA 1X1ZA 1GVOA 3G22A 4DF1A 2QAPA 4HIBA 3EX6A 2PRLA 3EWBX 3NQEA 2ATSA 4WXYA 2R8WA 3G0XA 4O54A 3H54A 4ZZ9A 5U4NA 3PUEA 1KLZA 4AWTA 3P5ZA 3W22A 2DZPA 3WJZA 3S1XA 1G67A 1FCBA 1ICQA 3R5EA 3EX4A 3N9RA 3PY2A 4GUGA 1L6WA 1OFBA 3HGRA 4CQAA 2DU2A 2H3DA 2FIQA 3FFSA 3O6DA 3B05A 4W9TA 4UTIA 3S8HA 1Q6OA 3IRDA 3N14A 3BG9A 1SZFA 3SY5A 1AW2A 1U5JA 1ZAHA 3TA6A 3DENA 1IIHA 2W79A 3NL6A 4IMEA 5T26A 1UBSA 3DHFA 3LHVA 4MKNA 2YYTA 2NV2A 1TV5A 4WXZA 1TMHA 1QPQA 2DZTA 2V0TA 3KVJA 4FF7A 3HG2A 1K3UA 1R47A 4IMDA 3CEUA 4LNYA 3O06A 4LU0A 3B0VC 4PC8A 2ZZ6A 1WA3A 2A7RA 4QQ3A 4MJMA 4JTUA 5DELA 1TTJA 1KBIA 4UTKA 5IBXA 1OG0A 3ATZA 4FNSA 4LVFA 5HMSA 1KFLA 3UPBA 3PBYA 3S9YA 4M6PA 4TX9A 3HO8A 1G4SA 3O16A 2ZA3A 2ZZ7A 3TKFA 5A5WA 1WQ5A 1SZNA 1T0OA 5H91A 3W85A 1JUEA 2ZTJA 3NL3A 1MEHA 3MYPA 3W87A 3EWWA 3SI9A 2AQWA 2CW6A 2A2IA 5F1UA 3NYZA 4X22A 1PS9A 3UWVA 2YPIA 4AAJA 2ZZ2A 2X1RA 4A21A 4IOTA 1JR1A 1P1XA 4UFJA 4CCDA 3RLVA 1T8XA 2QCCA 1O95A 3GXNA 3SR7A 3GB6A 2YR1A 1K02A 3FYPA 5G2HA 2YZRA 3LCLA 1OFRA 1TV7A 1SUXA 3QMTA 1PHWA 1DBTA 1LBMA 2QJHA 1TPWA 2H6RA 3NZ1A 4UTJA 4WQ6A 1K8ZA 4X2RA 1KW1A 4UNLA 1VZWA 4E38A 4XUGA 1NFBA 1IGSA 3HGJA 5AYYA 2O7SA 1UJPA 1QOQA 3A5VA 3PG8A 2ZA2A 3EXTA 5BOOA 1H7XA 3HG4A 1QR7A 3C0JA 2HTMA 3FS2A 3W7KA 5LNUA 4M6VA 4ZQNA 3KFTA 1TPB1 4OGZA 2Y7EA 3WK3A 1LDCA 5KMYA 2ABAA 2WQPA 1ALDA 4HN4A 4JYEA 5D2YA 4M6QA 4EVZA 1X1OA 3R13A 2RDWA 3HMJG 5DY3A 4JD4A 2LLEA 3BLFA 3W7GA 2FPYA 4UFHA 1K7EA 3S5OA 2WKJA 4JDYA 4YLWA 4OWGA 3NO5A 4RCXA 4JR5A 1E51A 1GTEA 2QCGA 4RV8A 4RJEA 3TJLA 2VFIA 2Y62A 4FNUA 2Q8LA 3P60A 1SW3A 4AHQA 1G4EA 2V2CA 2E6FA 3D0CA 1OJXA 3WJWA 3M41A 2B0MA 3WK2A 3LXCA 1PCWA 4WY0B 1VJIA 3MYOA 3B03A 4FIRA 3BV4A 1H61A 5EPDA 3VNDA 4RKAA 1W56A 1QWGA 3PM6A 4NJGA 4MFDA 1TIMA 3HIJA 2C18A 4ZQMA 4NUWA 3EKZA 4H3DA 1OK6A 5K9XA 3PC0A 3W7HA 5AHNA 2C16A 3CQ0A 3S5YA 5G2IA 1PHQA 3W2JA 1Q6QA 1VCVA 3FIGA 3E96A 1H7OA 3PWAA 3W2KA 5KTLA 1Q3NA 1A5SA 2DJLA 3LHTA 1EEPA 3C2OA 4GBUA 3QW4B 4K37A 3ANYA 5AB3A 3W73A 4PL2A 1WXJA 2BSLA 3HPSA 4XTDA 1VHNA 1QNVA 3NPVA 3OVQA 1FWTA 5CZTA 1TO3A 2B4GA 2AAMA 4JTKA 3SSJA 4LRTA 1JUKA 4O16A 3CT7A 1PE1A 1J2WA 5I3IA 1P0KA 3W9ZA 1W54A 3M47A 3LTSA 5AYXA 1I45A 3GZ3A 3KXQA 3T40A 3BK0A 4IGHA 1BTMA 4I7WA 3NEVA 2JKEA 4MIMA 2OZ0A 2WSRA 4Y96A 4EOUA 3CLMA 4HNNA 5AYZA 2ZZ4A 1PL9A 1XUZA 3TSBA 1Z42A 1G6CA 1MZHA 1IIGA 1H7PA 3G1XA 3TK7A 2ZQ0A 3TC7A 4OBTA 3O1NA 3GK0A 4XWUA 5GVJA 4BF9A 3A21A 1QPRA 3GDLA 4AH7A 4G1KA 2VXNA 4LUJA 1OX4A 3FKRA 3GKAA 1A50A 4DO5A 2ZRWA 3LHZA 3CWOX 2C1HA 4FNQA 4UTLA 1WX0A 5L6UA 3G18A 1FXPA 5LHEA 3KHJA 1S3HA 4KFNA 1G69A 2X1SA 3LBMA 1TB3A 4I7UA 3W6YA 1KV8A 1KTBA 4ADUA 3S5ZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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