4ZE6A

Endothiapepsin in complex with fragment b39
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
330
structure length
329
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Endothiapepsin
publication title Structures of endothiapepsin-fragment complexes from crystallographic fragment screening using a novel, diverse and affordable 96-compound fragment library.
pubmed doi rcsb
total genus 81
structure length 329
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2015-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4ze6A02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4ze6A01
3N4LA 1PROA 1SH9A 3SA6A 1HBVA 5P6HA 3OHHA 1PSNA 4FAEA 3L5CA 3S2OA 3IXJA 1NPVA 1HXWA 4Z2ZA 2AQUA 5P7QA 4YBIA 5OZ8A 3APPA 4I1CA 1M0BA 5P4UA 2G1YA 3NDWA 4CPUA 4Q1NA 4QJ9A 5IVTA 3PWWA 5OZ4A 2Q11A 3MSKA 5P2WA 3VSWA 5UPJA 2OHUA 1YX9A 1GVUA 5DQCA 5P8EA 4BEKA 1ZPAA 1FQ5A 3NUJA 5P8HA 4RLDA 5P2FA 1FFFC 3K4VA 3EM6A 4D8CA 1HRNA 4H3FA 5P0QA 3EC0A 1K6TA 4GJDA 1D4KA 2IRZA 1HPXA 2G94A 5AH6A 2QHCA 2B8VA 3SLZA 4AZYA 2OAHA 5P0NA 3TPJA 4PHVA 4J55A 1VIJA 2FGUA 5P24A 3K5FA 1XDHA 4CPSA 4Y53A 3QRSA 5P4PA 2NNPA 3R0WA 5P8PA 5P38A 3S7LA 2ANLA 2JE4A 3ST5A 4EHCA 2XYEA 3LZYA 5P14A 4EJLA 2F81A 3PHVA 5EZXA 5P1UA 3OWNA 2VJ9A 1LYAA 1HXBA 5AH7A 2AOCA 4Y4JA 3ZKNA 1ODXA 1K6CA 4WY6A 5P1WA 4A6CA 3UDPA 5P84A 2QAKA 4YBFA 3INEA 5KR0A 4AA9A 4FIVA 3BGBA 3L5FA 3Q5HA 2MIPA 5P34A 3SA7A 2WL0A 5OYQA 2J9KA 4Y4GA 5HDZA 3CKRA 1ER8E 4Y3HA 1META 3UDYA 4Y3XA 5P1JA 4GIDA 5P1LA 4R8YA 2HAHA 4FRSA 5OZ0A 3ER5E 5P4DA 1UH9A 5P73A 5P13A 5P8SA 2FDEA 3EKYA 5P41A 4M8XA 4Y37A 3LZVA 5P4CA 5P4QA 3DV5A 1AJVA 3PGIA 2R8NA 3UHLA 2RSPA 2IQGA 1KJFA 2O4NA 5P6YA 4OBHA 4FRIA 3JW2A 5P6IA 1ENTE 2AODA 2AOFA 4NJUA 5P25A 4J0PA 2AOJA 1T6GA 1ZSRA 1QBSA 4JPCA 5P5SA 5P86A 5P70A 2PH8A 4CPXA 3PLLA 5P0FA 4J0TA 3UF3A 2VA6A 2NXDA 2V16C 1MUIA 5P20A 4DQEA 2I4QA 5P23A 2XYFA 5P1FA 3K5GA 4FSEA 2BKTA 3ZMGA 3TNEA 2IGYA 4AA8A 1HIHA 4APEA 1KJHA 4HLAA 3L5EA 3INHA 3O9DA 4GZFA 2PK5A 3GGAA 5P3RA 3BXRA 3L58A 5CONA 1D4LA 2J9JA 3RTMA 3ZL7A 4NPTA 3PM4A 4Y35A 4U7QA 5P6FA 5JFPA 4Y3RA 3UFNA 2QNNA 5P8KA 2V12C 3HAWA 1NPWA 3BHEA 5OZIA 4D89A 3URJA 1B11A 5P8NA 1W5VA 4B0QA 3OADA 2SAMA 3JVYA 4FL8A 4KB9A 3CYWA 3IXOA 5KQFA 5CLMA 2G1SA 3TOHA 4A4QA 4I0JA 4Y4XA 5P49A 1W50A 3EKVA 1FG6C 5KQXA 1UH7A 1ODWA 2V00A 3KT5A 3CIBA 5P5FA 5P3OA 2QI6A 5DQ2A 4F74A 5P45A 3S45A 4Y3SA 2OHKA 3DM6A 2QZLA 1MESA 2HIZA 1FG8C 5P67A 1SGZA 4EQ0A 5P4JA 1F7AA 5P6QA 5OZGA 5P7PA 1PPKE 5DR3A 5P85A 3OHFA 1HPVA 3DK1A 1A9MA 2AZCA 5P3KA 5DR4A 4GB2A 3PWRA 5P2SA 3PJ6A 5P8AA 5HE5A 1T7IA 3UDJA 3DV1A 2O4SA 2JJIA 2JXRA 5OZPA 1C6YA 4ZLSA 5P56A 3ZKIA 1FQ6A 3O9LA 4Y36A 1LS5A 4DV9A 4YD3A 5P05A 2R5PA 4Y3PA 3UDNA 3BGCA 5P0MA 4DQHA 5P7AA 5P1BA 5P71A 4OBKA 5P2CA 2WF2A 4Y3QA 1W5YA 5P0YA 2QU2A 1TZSA 4L1AA 5P6LA 4RZ1A 1FFIC 4Y47A 3KFNA 3BVBA 3TOGA 5FIVA 4ZPGA 3M9FA 1FLHA 5P89A 5P2LA 3CKTA 1XN3A 3O9IA 5P2BA 5P6KA 3OU4B 1AZ5A 1JLDA 2WJOA 2I0DA 3D1YA 5P10A 4HVPA 3RVIA 1D4YA 3OAGA 5P11A 5KOSA 3KT2A 3OUDB 5P15A 1K1UA 5P1KA 1ZLFA 1MSMA 3O9HA 4OBDA 5P0EA 4Y5MA 4DJUA 5P3EA 5P35A 5P6CA 1HSHA 2V10C 4GJCA 6UPJA 3UQXA 1TSQA 3MXDA 2Q5KA 1B6MA 1W6HA 3OQDA 5ER1E 5P42A 3OGQA 2QI0A 3WZ7A 2IGXA 4DJPA 3LITA 1E5OE 4Y5PA 5P7XA 1HEGE 5I3XA 3IVIA 1PSAA 3K5DA 1WBKA 3NDXA 5P0PA 4PZXA 2PH6A 1K1TA 5P33A 4RROA 1NSOA 1GVVA 3EBZA 3PMYA 2IEOA 3BUHA 4Y41A 3VF5A 2G1RA 2FGVA 4I0EA 2PYNA 5P7WA 4DJOA 5P0TA 4D83A 5AHBA 5P19A 4K4RA 2P3DA 1W6IA 2P8HA 2RMPA 2JYSA 3PI0A 5P6VA 4Y5BA 3PBZA 6FIVA 2ZJLA 4RVXA 2ZDZA 1J71A 2A4FA 4Y5LA 1IVPA 5P0DA 3VEUA 1RL8A 5P76A 3S43A 5HDXA 3UTLA 5P1DA 5P0IA 1HTGA 5P4FA 3UPJA 2VS2A 1C6ZA 4LC7A 5P01A 4YCYA 1WBMA 1QRPE 4Q1XA 5P75A 2Q3KA 5OZBA 2CEJA 4XX4A 3EKQA 5P40A 5E5JA 2WF1A 5P1ZA 2BPVA 1BIMA 3LIYA 5OYUA 5BRYA 5P5XA 1ZSFA 5P30A 2NR6A 3GI4A 3PSGA 5P5IA 4OD9B 4Y3GA 5P8DA 2PK6A 1GVXA 2V0ZC 1LYWB 5P3FA 3EKWA 4J0YA 5P68A 5P08A 5JFUA 5OZJA 4OBGA 3T3CA 3VSXA 5OZYA 5P32A 4YA8A 3VV7A 4J1EA 3IGBA 4J1HA 1EC3A 1MRXA 5P3WA 5P50A 4QGIA 5P5NA 3G72A 1XN2A 3VLAA 3QI1A 2QI7A 2NPHA 1HEFE 1K2BA 1Q9PA 2Q15A 3PRSA 1IZIA 5P44A 5P58A 1DMPA 3WZ8A 1QDMA 2QD6A 4NPUA 6APRE 5P0AA 4GMIA 5P03A 3L38A 2O40A 2Q55A 5P5OA 1EC2A 2ER0E 1YTIA 2XFKA 5DR1A 5OZHA 5P8UA 5J25A 3DOXA 3PCWA 3TKGA 1E82E 5P4NA 4DJYA 5OZ1A 3KA2A 4EQJA 5DR0A 2ZJHA 3FX5A 5P80A 1AVFA 2IKUA 5P7FA 1T3RA 2VJ6A 5P7NA 5P7GA 3LIVA 5OZAA 5P6MA 3SACA 4K4PA 1MTBA 3KF0A 1B6LA 5P62A 1LV1A 2B8LA 7UPJA 3HAUA 2Q64A 5P8VA 3T7QA 3OGPA 5P1PA 4Y5GA 2AVOA 2QMFA 4XKXA 5HE4A 4GJ8A 2H6SA 4F73A 1DP5A 1HVKA 3EL9A 4F76A 1AAQA 2I4UA 5P3LA 5TOLA 5P27A 5AHAA 4GYEA 5KOQA 1HVIA 5P59A 2O4LA 3OQKA 5P54A 4OC6B 4FM8A 3QVCA 4H3GA 3H0BA 5IVQA 2UPJA 2P3AA 5IS4A 5P5JA 4Y4WA 4Y51A 3KN0A 4CPTA 4Y3NA 3KM4A 2WKZA 1EAGA 1GNMA 1XE6A 2FXEA 1PFZA 4K8SA 1UH8A 4TRWA 2A1EA 2O4PA 5P4LA 1HVRA 4BFDA 4Y4ZA 5P7IA 3NWXA 4RCEA 3LPKA 5P3CA 3T7XA 5P6DA 5P7BA 2NMYA 5OZWA 5OYXA 4EP3A 5P88A 1FMXA 3CMSA 2AVMA 5P7EA 1BVGA 5P7KA 3PBDA 4RCDA 4Q1WA 2ZJNA 4EPJA 4HEGA 5P0BA 1GVTA 2FDDA 4B1CA 3ZPTA 2BKSA 1GKTA 1HTFA 2ER6E 4JECA 4EP2A 2UXZA 4DJQA 5I3YA 1RV7A 5P57A 4RRSA 5DGUA 3APRE 3SAAA 3VYEA 4HE9A 1APWE 4HA5A 5OZMA 4J1IA 5P5CA 1B5FB 3QIHA 5ENKA 1KJGA 4DFGA 3LPIA 4HZTA 4B1EA 1FMBA 3WB5A 3ZLQA 5P8TA 3FIVA 1TSUA 5P4XA 4Y50A 4DJVA 5P18A 3TKWA 3ZPSA 1MIQA 2QI4A 1B6JA 3IXKA 3LZSA 1XS7D 5P6PA 4YD4A 3HW1A 2OHPA 5P7UA 1A8KA 4DQBA 2NXLA 1CMSA 3EMYA 5P1MA 2AZBA 4APRE 1NPAA 4Y3TA 3QROA 5OZKA 3EKPA 4FSLA 3DCRA 4Y3DA 2AOEA 5P83A 1PPME 5P3UA 2ER7E 1F34A 5P3PA 5P7MA 1D4HA 2VA5A 2ZHVA 1BXOA 1IZEA 5P2GA 4FAFA 4DJRA 1FB7A 5BS4A 3D20A 3HLOA 1LYBB 3VYDA 5COOA 5P7TA 1OHRA 3NU9A 3LPJA 1PPLE 3MSJA 5P7RA 3CKPA 3EL0A 5P1GA 3TLHA 4Y3MA 3VF3A 4NJTA 4L7HA 1IIQA 5COKA 1EPQE 5P2JA 4U8WA 3OUBA 1EPNE 5P1VA 3I8WA 5P7LA 5P3MA 2QZWA 4HDPA 5P6WA 1FKNA 5OZ3A 5OZTA 2BB9A 2OHSA 2QNQA 3TPLA 3S8IA 3OK9A 3SFCA 3IAWA 3KDCA 5OZEA 5HE7A 3MWSA 1BWBA 5P29A 4R93A 5P5WA 3OU4A 3RSVA 5IE1A 3EM3A 2WEDA 5P1XA 4ZIPA 5P66A 5P1HA 1DW6C 4R91A 3OUDA 2RKGA 3SM2A 1HIIA 5P4GA 5PEPA 3HD8A 4Y57A 5ER2E 5P2UA 1MERA 3S54A 5OZLA 4LBTA 4QJ7A 3AUPA 1BILA 5OZXA 3NDTA 1D4SA 1DIFA 2WF0A 5HDUA 5P8MA 2AVQA 1TCXA 5DGWA 5P6NA 5SY3A 1SDTA 3BRAA 2F3EA 1W5XA 4L6BA 5P4HA 4TRZA 5P7OA 4ER2E 2P3CA 3UDRA 5P53A 5P1RA 1EC0A 3OXWA 1HVJA 3SQFA 4X2LA 1T7JA 3OU3A 5P0LA 4GJ6A 1FGCC 2QZXA 4Y5NA 5P4ZA 3O9BA 1MPPA 2BPZA 2FXDA 3QPJA 1MT8A 3HZCA 3LIZA 5P1IA 4GJ9A 2HS2A 4FRKA 5C9BA 2FS4A 2BPYA 3ZKSA 3U71A 1FIVA 3NYGA 5OZFA 3EL4A 1BVEA 1YTHA 5P3GA 4LXAA 4RCFA 2Q63A 4COEA 2P3BB 5P3QA 1G35A 3AIDA 3LZUA 1PSOE 3PVKA 1BDQA 1EBYA 4H3IA 3SM1A 3SO9A 1E81E 3O9EA 3O9GA 5P0RA 4B72A 4CPWA 5HCOA 3VLBA 3NU4A 5P09A 2WEAA 2FLEA 1FQXA 2F80A 2PC0A 4QJ2A 5P7HA 1TCWA 3GGXA 5KQZA 5P3ZA 4HDBA 2QMGA 4YDGA 4QJ6A 1Z1HA 1QBTA 4OD9A 4LXKA 5OZUA 2H6TA 4I0HA 1LYWA 4J0VA 2RENA 1KJ7A 2AOGA 5P2XA 4CPRA 3D3TA 5P0UA 4CMSA 4Q5MA 3S7MA 2QNPA 2VA7A 3QBFA 5SY2A 4D88A 4NJVA 1W5WA 2VIZA 2V13A 2QD7A 4CPQA 1EPLE 5P8QA 5IVRA 3DCKA 3B7VA 4RVJA 3UQUA 5P5LA 3ZKGA 1IZHA 5P3BA 5P17A 5P78A 4I0DA 1RPIA 3RTHA 3L59A 4Q1YA 5P04A 1LF2A 5P2OA 1YTGA 4BFBA 1YTJA 3BXSA 3DUYA 3SKGA 4ZE6A 1GNOA 1HTRB 3Q70A 2HC0A 4JP9A 3L5BA 3SA8A 3NU5A 4Y4BA 1EPRE 3T7PA 3QBHA 4Y4DA 2ZJKA 2QMPA 5OYRA 2ZJJA 2G20A 5P5ZA 4NJSA 5P6SA 4I8ZA 2XFIA 1IDBA 3G70A 1YG9A 2OHRA 2VIJA 5OYTA 4TVGA 3RTNA 3WB4A 3I7EA 5P5KA 4PYVA 3HVPA 5E5KA 5OZ2A 5P0OA 1HVHA 5ISJA 5OYYA 5P1QA 1AJXA 5OZSA 4Z4XA 2I4VA 3OUAA 2G1OA 4ZSMA 4KE0A 2OHTA 2HB4A 3OADB 1RQ9A 4Y56A 1IVQA 4GJAA 2QHZA 4Z22A 1BV7A 2F8GA 4QJAA 3N3IA 3VYFA 2PWRA 5P6UA 5OZCA 4B78A 2NTRA 3ZKMA 1AM5A 5P26A 4FS4A 2QCIA 4DPFA 4J17A 4Y39A 4L7JA 4DVFA 4LXMA 4YCKA 5KR1A 1BV9A 5P5DA 3KDDA 2IKOA 1SMRA 3GI0A 5ISKA 5OZ6A 5P5GA 3VFAA 4ACXA 4XXSA 5P0ZA 4Y5KA 2P4JA 4EWOA 4OBJA 4YHQA 3VFBA 3L3AA 4D85A 5OZ7A 1YM2A 5P46A 2V11C 5P6RA 1HVSA 4ZSPA 3IA9A 5P87A 3TL9A 1AIDA 1RNEA 5P2ZA 1IDAA 5DPZA 5DR8A 4Z50A 1KZKA 2OF0A 5OZOA 3T6IA 4FRJA 3LIQA 5AGZA 4FM7A 5P4AA 1EBWA 3QRVA 5P2DA 4XX3A 3LINA 3OU1B 3T11A 2PYMA 3A2OA 5HDVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3N4L A;  1PRO A;  1SH9 A;  3SA6 A;  1HBV A;  5P6H A;  3OHH A;  1PSN A;  4FAE A;  3L5C A;  3S2O A;  3IXJ A;  1NPV A;  1HXW A;  4Z2Z A;  2AQU A;  5P7Q A;  4YBI A;  5OZ8 A;  3APP A;  4I1C A;  1M0B A;  5P4U A;  2G1Y A;  3NDW A;  4CPU A;  4Q1N A;  4QJ9 A;  5IVT A;  3PWW A;  5OZ4 A;  2Q11 A;  3MSK A;  5P2W A;  3VSW A;  5UPJ A;  2OHU A;  1YX9 A;  1GVU A;  5DQC A;  5P8E A;  4BEK A;  1ZPA A;  1FQ5 A;  3NUJ A;  5P8H A;  4RLD A;  5P2F A;  1FFF C;  3K4V A;  3EM6 A;  4D8C A;  1HRN A;  4H3F A;  5P0Q A;  3EC0 A;  1K6T A;  4GJD A;  1D4K A;  2IRZ A;  1HPX A;  2G94 A;  5AH6 A;  2QHC A;  2B8V A;  3SLZ A;  4AZY A;  2OAH A;  5P0N A;  3TPJ A;  4PHV A;  4J55 A;  1VIJ A;  2FGU A;  5P24 A;  3K5F A;  1XDH A;  4CPS A;  4Y53 A;  3QRS A;  5P4P A;  2NNP A;  3R0W A;  5P8P A;  5P38 A;  3S7L A;  2ANL A;  2JE4 A;  3ST5 A;  4EHC A;  2XYE A;  3LZY A;  5P14 A;  4EJL A;  2F81 A;  3PHV A;  5EZX A;  5P1U A;  3OWN A;  2VJ9 A;  1LYA A;  1HXB A;  5AH7 A;  2AOC A;  4Y4J A;  3ZKN A;  1ODX A;  1K6C A;  4WY6 A;  5P1W A;  4A6C A;  3UDP A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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