4ZQCA

Tryptophan synthase from salmonella typhimurium in complex with two molecules of n-(4'-trifluoromethoxybenzoyl)-2-amino-1-ethylphosphate (f6f) inhibitor in the alpha-site and a single f6f molecule in the beta-site at 1.54 angstrom resolution.
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGAENRGALPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
publication title Visualizing the tunnel in tryptophan synthase with crystallography: Insights into a selective filter for accommodating indole and rejecting water.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 101
structure length 268
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2015-05-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4zqcA00
1THFD 1UJPA 1OFQA 1Z48A 2J9ZA 5I3IA 1TPEA 2BXVA 1MEHA 4K38A 3KVLA 4K7YA 2CFFA 5LNVA 1YDVA 4GFSA 5IM51 4N4QA 5E1QA 2DZVA 3HGJA 3TE9A 1SW3A 4JYFA 1B4KA 1QMLA 3GX9A 2GVLA 1T99A 1OX5A 3FIGA 1PHQA 5DLCA 5LGZA 4JX5A 3W2NA 4AF0B 4NJGA 4O18A 1H63A 3TUUA 2V30A 4IX0A 2HS6A 2ZQ0A 1KTCA 5IBXA 2VFDA 3M6YA 4JD4A 3L68A 1O5XA 1ALDA 2YGYA 3FYPA 3GDTA 3A21A 3BV4A 1HUVA 1WOAA 4XTDA 4M5PA 4CNNA 1LOQA 2V5LA 1B9BA 1YLVA 3L66A 3LHUA 4UTJA 3BARA 1GWJA 3A9IA 4ORIA 1FCUA 3ZFHA 3SECA 1C29A 1EB3A 1NSJA 2QAFA 4OGZA 1AK5A 1VZWA 1BWLA 4GUHA 2B4GA 4JGDA 2G96A 2VEKA 1JRCA 3PG9A 1JVNA 1Z42A 4M7TA 1RD5A 2V2DA 3W1NA 4HHPA 4AHQA 1RQBA 4IQLA 3UD6A 2V2HA 1PCWA 1HO4A 4QIUA 3BGJA 5E0KA 1KV5A 3M0ZA 1I8JA 3T78A 1W56A 3S42A 1MXSA 3EKZA 1OVDA 2Z2UA 1HO1A 3IIVA 2WNZA 5FF2A 5AYXA 2HMCA 2NUXA 3WFAA 5I3HA 3KRSA 4C1LA 4EF9A 1KTNA 1W0MA 3LBMA 5FESA 3EWUA 3W73A 2E6AA 4UTKA 2E5BA 5CZ0A 2P1FA 3G22A 3QMRA 2WO5A 1KM0A 3W7OA 1VCVA 2RDUA 1M6JA 3W75A 1XXXA 2VEMA 3N19B 4BI7A 3Q94A 1UUMA 2J24A 1QR7A 2W6RA 1XCFA 4OV4A 3LTYA 3ATYA 4YLWA 4RX0A 3HPZA 4XQ6A 2X1TA 4K6AA 1TTJA 3BG9A 5I3KA 1LRQA 4NNCA 3CEUA 1JCJA 5G1TA 1DQWA 1L9WA 5FEWA 4JNMA 1P4CA 3TJXA 3M44A 5F4XA 3L5LA 3NA8A 1RQHA 4IXHA 1VCGA 1K8ZA 4Y9AA 2A7RA 1W5OA 3EWWA 4Y8FA 5F2MA 4O19A 3FFSA 4K8EA 3KXQA 3P8IA 2X1SA 4PODA 3UY8A 2H3DA 1ICPA 4KFOA 1SPQA 2YW3A 3I7QA 2BLEA 5HWJA 5K9DA 1RR2A 3CC1A 1YXCA 1ZAHA 2YR1A 4QISA 2OZ0A 5E93A 2ZZ3A 2R94A 2NLIA 4A3UA 4K39A 4UFJA 4QITA 2FLIA 3HGRA 4UR8A 1IXPA 3LHZA 4ICNA 1FWNA 3CU2A 4LWWA 3PM6A 4DBEA 3NM1A 4LNYA 3STEA 3EXRA 1GVSA 5J5RA 2C19A 5D02A 1KTBA 2CLKA 3W1UA 2YFOA 2DZPA 1B4EA 4I9AA 1G4SA 3P5YA 3MW7A 4JTSA 1QPRA 3W7CA 5AHEA 1GTEA 1XFBA 1O60A 4XBSA 2ISSA 5HULA 3M16A 1S5VA 2WPBA 3VE7A 1PE1A 1OFOA 2H3BA 3LCXA 3GK0A 1D3HA 4EOUA 1LRTA 3WK0A 3NG3A 3PS7A 4JIQA 1LTDA 2PURA 2PRHA 2C16A 1KM3A 2WSQA 3CEPA 1T0OA 3TMLA 1SUXA 1UB3A 3ABSA 5DCDA 2QJGA 3G1YA 5G4WA 2C3ZA 3M41A 4P2VA 1KM4A 2ALDA 3QH2A 1QAPA 1SZGA 2ATSA 1JCMP 1A5SA 4LUJA 1TPDA 2CWNA 4JTUA 4X22A 3GXTA 3TC6A 3EB2A 3W87A 1J4EA 4IXXA 5L6UA 2J9YA 2HS8A 4IMGA 1SSDA 2VKZG 4N02A 3S5OA 1XKYA 3F1QA 5EBUA 4LV9A 3W2UA 3N14A 4K8HA 1TTQA 3MBFA 3DENA 3C6CA 5C55A 5CZTA 3P5ZA 5HWMA 3GLCA 4LVGA 1LYXA 3QPZA 1TO3A 1EUAA 3QQ0A 5D2WA 1KLYA 3OEXA 2EAWA 3SGZA 1W5QA 2CW6A 3LRKA 5G5IA 3C2EA 2X1RA 1QPNA 2CZ5A 1OYCA 2QR6A 2ISVA 3DI0A 4OHQA 2QKFA 3NL2A 1MO0A 2CLOA 2V5BA 3NEVA 2CU0A 1LP6A 1P0NA 1LRNA 1C8VA 3BLFA 2H90A 4IMDA 1TPH1 5C54A 3KFTA 3C56A 3KHJA 1I2OA 2OT0A 2B7OA 4TO8A 2GUUA 3W71A 2AAMA 3WJSA 5FI8A 3GDMA 2H6RA 1WXJA 1VLIA 3HIJA 4AB4A 4YMZA 3THAA 3HG3A 3TXZA 3G8RA 2W0UA 3I7SA 3HMJG 3JS3A 3ZWSA 3LHTA 1G7UA 1H51A 5TIMA 2ZRUA 1TB3A 5LHEA 4JN6A 4MZ8A 1DL3A 1FQ0A 4BWLC 1PL9A 5K7JA 1H7XA 3W83A 1QO2A 1X7FA 1IXNA 2RDTA 3O06A 2TMDA 5DY2A 4N6EA 4KWWA 3PWAA 1SR9A 4MIMA 3BK0A 2YXGA 2VFFA 4IUOA 1YDNA 1PHWA 1OF8A 4BK9A 1DV7A 4MYAA 3BO9A 4WX2A 1SZFA 3DFPA 1W5PA 2Q8ZA 3OVRA 4LOCA 4AXKA 4I7UA 1WX0A 4XTIA 4JTEA 4MVAA 3NQGA 2NV1A 2NXHA 3TK7A 3P81A 3TW6A 1A53A 3U6WA 1QWGA 3IIXA 4JDYA 1VHCA 4XBKA 3W1TA 4UXDA 4LTSA 1ZY9A 3EX6A 1HFBA 5T26A 4UMCA 3PB2A 3RMJA 1H1ZA 3IGSA 3P84A 5CZSA 1YPIA 5AYZA 4MLRA 1I2NA 4FNQA 3CIXA 3LXAA 4JEQA 3FYOA 4A21A 4DO5A 4TX9A 3MO7A 5AYYA 1CW2A 3W7LA 3W7PA 3G0SA 4GXMA 1DBTA 3DFSA 5DCEA 1OFEA 1AG1O 1VLWA 1WV2A 5D30A 3W7NA 3M47A 3C8FA 1XC4A 4Z0SA 5AC6A 3OVPA 4M6PA 3SI9A 5H91A 4IMCA 1Y0EA 2YSWA 4K7VA 3LXBA 5G1YA 2AQWA 5CSSA 5TQLA 2HTMA 2E5CA 5D32A 2XN1A 2QDHA 3EWYA 1XDMA 4Z08A 1G4EA 3KVJA 4JYDA 2DZTA 1XUZA 3NOEA 4HNVA 2KZHA 1GEQA 2DZWA 3M5YA 4Q33A 4N2YA 1S3HA 3P67A 4XKYA 2NV2A 3L67A 3C4UA 1OHLA 2RKXA 3ZWTA 4ZMGA 3W22A 5HNRA 3PUEA 2X30A 3JR2A 1OFDA 3VNDA 4QAIA 4HN4A 3MYOA 1DORA 1XI3A 4LS2A 5D09A 3O8AA 5CSRA 3G1SA 3TXVA 4Z1AA 1TYGA 2B7NA 4RLIA 2QCFA 3UQNA 1F7BA 4RCXA 4UUIA 4UTMA 4IWWA 4NZFA 3W7KA 3NQ6A 4O16A 1N8FA 1XBXA 3FA5A 4DO6A 1AL8A 3ATZA 1J2WA 2CLMA 1OX6A 2E6FA 4RK8A 5DY3A 3HB9A 3QFEA 5U4NA 4LRTA 2I14A 2ZZ5A 4ZQNA 3TH6A 1LBLA 1GOXA 2AGKA 4YCOA 5CPMA 3WK3A 4R53A 3BVJA 5J5DA 4JTHA 4LU0A 3MHFA 1H7NA 3HJZA 1EIXA 4LS0A 1L6SA 5AHFA 1FWTA 2QCLA 4WY0F 3EWZA 1OYAA 2PC4A 4FF7A 4IJBA 4Y96A 1JJKA 2X2GA 4QNWA 5LGXA 3G1HA 1EWEA 2YFNA 3W2MA 1TTIA 3W2LA 3UPBA 4O0ZA 5LNSA 1X1OA 5AHLA 2YDAA 3A5FA 1D3GA 4ZQPA 3DFNA 1F74A 1VYSX 2OT1A 4BI6A 5I3FA 1VQTA 2A7PA 4Z1DA 3G0UA 1XBVA 3LV5A 4O1DA 3CPRA 2FTPA 1VS1A 2QF7A 4ADTA 3IIPA 4WJEA 2WSYA 3DHDA 3B05A 1QOQA 4M6VA 3KVMA 5AOUA 1W31A 3KAOA 1FUYA 3W85A 2QCDB 3S5YA 1FWSA 2ZTJA 1YYAA 4UTLA 4KWVA 2WSRA 1EEPA 1FCQA 1D9EA 5BMXA 2RDWA 4HPXA 2CLLA 3FS2A 3W7EA 4LVFA 4I7WA 3IGUA 1SO6A 2DZUA 3NXFA 3D0CA 3W7HA 4O57A 4MFEA 1TCDA 2Q3OA 4ONVA 4BR1A 4R7JA 1LORA 2A6LA 2G95A 4MOZA 4N9CA 5D2YA 2FJKA 4AWUA 2CZDA 2Z6JA 3IRDA 3MUXA 4J9JA 5K3VA 1VPXA 1FX6A 1W3TA 3DZ1A 3FKKA 3R89A 3LRLA 3TSBA 4AEOA 1KBIA 4UMBA 3UWUA 5KINA 1H7OA 4O15A 4TMCA 1H62A 3GDKA 3W2KA 3LCGA 1F05A 2Y61A 3C2OA 1O94A 5G4EA 3PUDA 2R14A 5CZJA 1EUNA 5SWUA 1ICSA 1I2PA 3FLUA 3DHFA 3O6CA 3NL5A 1GVRA 2QJIA 5D37A 2E09A 1EP3A 2XN2A 4MY8A 3CQ0A 1LLWA 3G0XA 5KSWA 4O12A 4UTWA 1M7OA 1SSGA 2R91A 2QAPA 4FNSA 3W7MA 5G2WA 1B57A 3MI6A 5HQEA 1GYNA 3TR2A 1JCYA 5CKSA 4NNAA 3O05A 3T55A 5LKYA 3ZS4A 2ZCGA 4KFNA 3RFAA 4JY9A 4E2DA 4ALDA 2JBMA 2X16A 4MLJA 3I7RA 1A5CA 3R12A 2CLIA 4MPQA 1PIIA 5F4WA 2GQ9A 4TIMA 2ZDRA 2QUVA 1UASA 3EX4A 1SW0A 1QFEA 4NX5A 3N73A 3CWNA 3MWAA 4JY8A 3T40A 1BKSA 1Q6QA 3QSRA 3MI2A 2Z1BA 4JIPA 5U7SA 5AFDA 1KFEA 4O13A 1L6WA 4WXYA 3W1AA 5G2IA 4QSHA 3W23A 1LDCA 3S0CA 3S6DA 1G67A 3KVKA 3C0JA 4GUFA 3H55A 1GJPA 4Q32A 3EKLA 3IVUA 1PS9A 3M7WA 3E02A 1EP2A 3UZ5A 4UFIA 1FXQA 3S1XA 2C14A 3NVTA 3QQ1A 3SGUA 3GB6A 4MFDA 1OFBA 3PR2A 2Y70A 3ANYA 4YCPA 3W86A 2C1HA 2VFEA 3TA6A 2VXNA 3LGEA 3WJXA 4ZL1A 4JTGA 3A24A 3HQ1A 3W1MA 3HPXA 5LSMA 1TRDA 1IXQA 4LV4A 3KX6A 1Q6RA 1JCXA 3ABRA 4RR4A 3TFCA 3WJZA 3PAJA 1GPWA 4HKPA 3DGRA 5D05A 2XN0A 1FBAA 2CLEA 2EHHA 2CLFA 4WQ6A 2NWRA 2ZRZA 1A50A 1K03A 3GYEA 2RH9A 2ZZ7A 1H7PA 3CB8A 4IOTA 4GC4A 1G6CA 2J9XA 1AL7A 2V81A 4X2RA 4PTNA 1TJPA 3PF3A 8TIMA 1OJXA 3GDRA 2BX7A 5FF3A 3SW6A 3NZRA 3A23A 1QO5A 3C52A 4LVAA 3W84A 5MHBA 4S1FA 3P7YA 4NJIA 5I3JA 3W6YA 5K4ZA 3NDOA 3CT7A 4O50A 1Q6LA 4O11A 3TV8A 3W7GA 4WOQA 4GUJA 4UMAA 3V75A 3TW7A 4IMEA 3W3OA 1G4PA 4DELA 2QCEA 3A5VA 1OX4A 3RU6A 4WOZA 3U2OA 4A22A 1ZNNA 3G3DA 3MMTA 3UWZA 2Y88A 1UUOA 4Z0JA 4BFAA 1VYRA 1SFJA 2VEPA 1XUUA 5BOOA 1PV8A 4KKXA 3T4CA 2ZZ6A 1BEUA 3VCRA 3MYPA 6TIMA 3HGSA 3W1RA 3PBWA 2O7QA 1U83A 4RZ6A 1VH7A 3FEMA 2BZNA 3TQKA 3G18A 3B06A 3G1VA 1JQVA 1R2TA 1TPUA 3BW4A 4OQVA 5FF0A 3N2MA 3UWQA 2VEIA 4JTKA 5HUPA 3NL6A 1VR6A 1UBSA 3C61A 2YYUA 3OIXA 3I65A 3W7QA 3LHVA 3AJXA 1TV8A 4LC6A 4HSNA 4GUIA 1O95A 1AW5A 2DP3A 3G8EA 3M5VA 1Q3NA 4UTIA 3MBDA 1XL9A 4W9TA 1ICQA 1DHPA 3O07A 2JKPA 1HG3A 1I2RA 4O4VA 2X1UA 3BPWA 3LTSA 2G5WA 3FOKA 2PRMA 4NU7A 3L0GA 4R33A 3E9AA 3QJAA 4S2BA 1E51A 3DU0A 5FEXA 1K7XA 4UTUA 1W3NA 1I2QA 5ABTA 2WNNA 3GAKA 3KOFA 1F6PA 3L5MA 4O1AA 3GNDA 2NX1A 4EF8A 1H1YA 2PRLA 4ZQRA 1FCBA 2VFGA 2Y6ZA 4LT9A 5HR7A 2C13A 2Y62A 2GOUA 2TYSA 1G7VA 1ZCOA 4E2BA 4YWIA 5CG7A 3UWWA 3PG8A 3QRHA 4A2SA 1LCOA 1NAL1 1CX9A 1JQXA 5DBUA 3TAKA 3Q2DA 1I4NA 1WA3A 2ZRVA 5CPNA 1AW2A 3N9SA 5KTLA 1WOBA 1RZMA 1XDLA 1TV5A 3NQ2A 1IF2A 1H7RA 1GVQA 1VYPX 4B5NA 1JULA 3C3NA 2V82A 1SO3A 3W9ZA 1A5BA 3SIZA 4XUGA 5D2XA 2QUTA 3I6RA 3ELFA 4NQ1A 3ZR4A 3B04A 3W7JA 1DKWA 1TREA 2C15A 3EXSA 5AC8A 1W5MA 1GTHA 3M1ZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1J5S A;  4B15 A;  1UJP A;  2J9Z A;  2BXV A;  3CMF A;  1WKF A;  2WVV B;  4N4Q A;  4C1N A;  2OSY A;  2DZV A;  2D20 A;  4YVV A;  3TE9 A;  3WEO A;  3NCO A;  3M4H A;  1QML A;  1D3C A;  3BMX A;  2GVL A;  1T99 A;  3FIG A;  1PHQ A;  3SBF A;  3WDQ A;  1CLK A;  5DLC A;  1PPI A;  7ENL A;  2Z26 A;  4H9Y A;  4IX0 A;  5IBX A;  1KTC A;  3WH5 A;  2VFD A;  1EH9 A;  3SCO A;  2YGY A;  3FYP A;  3BV4 A;  1SJA A;  4M5P A;  4CNN A;  4DUO A;  3LY0 A;  4C5Z A;  2BXZ A;  3EKG A;  1EJS C;  3L66 A;  1U30 A;  1XYF A;  1FCU A;  2X0S A;  4D71 A;  4OGZ A;  5CC5 A;  4CKQ A;  3MV1 1;  3OG2 A;  2VEK A;  2VDH A;  1XWY A;  2DY3 A;  3PG9 A;  2FMN A;  4E4P A;  1WPC A;  4M7T A;  1RD5 A;  4ACY A;  2V2D A;  2DH2 A;  4GKT A;  4AHQ A;  2QHA A;  1DTN A;  3RXZ A;  2POZ A;  2X42 A;  1UP2 A;  1BYA A;  3KLL A;  1FWJ C;  1W56 A;  3V35 A;  3AIW A;  5DML A;  1UBP C;  2Z2U A;  3II1 A;  5FF2 A;  3BMV A;  4I9T A;  4WCJ A;  1ZBV A;  3CO4 A;  3WFA A;  3KRS A;  2OKO A;  2CZV A;  1UQY A;  1EHA A;  3EWU A;  2F8Q A;  2PTY A;  1W9D M;  5KZ6 A;  2OOF A; 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