5A4QA

Dyrk1a in complex with chloro benzothiazole fragment
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
347
structure length
341
Chain Sequence
KVYNDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEKLPDGTWNLKKTEYKPPGTRKLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Probing the ATP-Binding Pocket of Protein Kinase Dyrk1A with Benzothiazole Fragment Molecules
pubmed doi rcsb
molecule keywords DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION-REGULATED KINASE 1
total genus 120
structure length 341
sequence length 347
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date 2015-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5a4qA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5a4qA01
5LMKA 3SG8A 4L7FA 4EWQA 5EOBA 1SNUA 4TYIA 4YJQA 4UBAA 5AAFA 4L7SA 4D9UA 4RX7A 3EZRA 3P5KA 3TACA 4BDGA 4F9YA 4GFGA 2WQMA 4WOVA 1OL1A 2YDJA 3K5UA 2CLQA 3BV3A 3DT1A 3FQEA 3NS9A 4FKVA 4WNMA 3QA8A 2OSCA 3QAME 2XMYA 3BLHA 3PYYA 4DTAA 3LFQA 3JPVA 3RZBA 4LGHA 4Z16A 1XKKA 4GKHA 3DAEA 4A9TA 1OITA 5EKNA 3SV0A 1OMWA 4QP7A 5BNJA 2OJJA 3EQPA 4DLJA 1PHKA 4IC7A 3R30A 1NY3A 4NTSA 5FDXA 5FTGA 5DH3A 4ERKA 4XG8A 1UVRA 3C5UA 2YM6A 5ANEA 4YTHA 3RPRA 4AUAA 3U9NA 5TE0A 3A61A 1KOBA 3CEKA 4QNYA 4E4MA 1H24A 2W1DA 4G6LA 3DDPA 3LE6A 3F69A 3IOKA 3FMEA 4FA2A 5DR6A 1Z9XA 2PVKA 4J52A 3VS3A 4BCPA 1BL6A 1OZ1A 2EXEA 2X39A 4X7QA 4BTKA 4PUZA 5KO1A 3F66A 3BX5A 5FM2A 3O8TA 4FKSA 1BKXA 3QU0A 4O6LA 4JG8A 3PVBA 4BCMA 3I0QA 2I1MA 1W82A 3COHA 2QOBA 5A46A 4NSTA 3CJGA 3MB6A 4P5ZA 3NAYA 2ITUA 2IZTA 2B7AA 2UW8A 2ZV2A 1PXKA 4W4YA 3RBWA 2PHKA 5A3XA 1OKVA 3KXMA 2Z7LA 5A4LA 4IJ9A 3U54A 4MAOA 1Q8ZA 2W5AA 3RWPA 4R3RA 4ZP5A 4O7NA 3EOCA 4MD7E 3BLRA 4QMSA 3R2YA 3KF7A 4GUEA 4MTAA 3OZ6A 4GIIA 4HVSA 1R0PA 2YLFA 3OMVA 3A7IA 2BDJA 3BYVA 3TL8A 4A9RA 4QTCA 3W55A 4CYJA 4E3CA 1V0PA 2BZKB 4F4PA 2VGPA 4HVIA 3LFSA 4ZK5A 4BCIA 4F70A 3OBJA 4QMOA 4YU2A 1EH4A 4CFXA 1I44A 1BUHA 3CS9A 3UIUA 5A6NA 4IM2A 1BI8A 4L43A 3R1NA 3EN5A 2OBJA 4F63A 5CSVA 5DIAA 5DEWA 1V0BA 5T6KA 1Q4LA 2IW6A 2W1HA 3ULZA 1YWRA 5GJDA 2WMUA 5I3RA 4YBKA 3EZVA 3MV5A 3CP9A 5FRIA 5HVYA 2ZM3A 3LOKA 3C7QA 3H0ZA 4PMPA 2YAAA 1S9JA 4XS2A 3DQXA 3I5NA 2YFXA 3E7OA 4UYAA 2A2AA 5J8IA 4E6QA 3QTWA 4OTFA 4YBJA 3KCKA 5CEIA 2XNMA 5JH6A 5BVEA 3C0GA 3HAVA 1AGWA 4J7BA 2BALA 4P7EA 5KMNA 3G6HA 3M1SA 4AA0A 4CCBA 2LGCA 1J7IA 3D7TA 3NGAA 4NUSA 1KE9A 4XHKB 4JBPA 1TQPA 2ZV9A 4FKTA 2C6KA 2WTDA 3OD6X 4EEVA 4ZS4A 3VAPA 4C62A 5HQ0A 4EH9A 3HP5A 4JAIA 4JDKA 1PMVA 4PL5A 5H8GA 4D2SA 5DYJA 4NH1A 2B52A 3IS5A 1WVWA 2FSMX 1ZYCA 3LZBA 3LKMA 1DAYA 2BRHA 3QTSA 4B8LA 4U9AA 1CMKE 3D5UA 4RX5A 2PULA 5KKRB 5IEYA 4HGTA 1VZOA 5EOLA 3ORZA 2R2PA 4FKOA 2E9OA 4L46A 5E8VA 3COMA 4BGHA 4JQEA 4YMJA 2C4GA 4CFVA 2XJ1A 2OXDA 3HRBA 3ALNA 3PE2A 4QNAA 4TWPA 4FV3A 4XP3A 1SVEA 5AAGA 4YJRA 1WBNA 2B0QA 2YITA 3VF8A 3WZDA 3R8UA 3A8WA 4DFZE 5KBQA 5IDNA 4FK6A 1YOJA 1Z5MA 2VTTA 4QQ5A 4FSQA 4BI1A 4CGAA 1OIQA 2HY81 3FQHA 3L1SA 5BVNA 2Z02A 2QI8A 3R0TA 4BF2A 3EQDA 4J99A 4HZRA 2R3QA 2ZDTA 5AR7A 4TWCA 5H8EA 3TKUA 3H4JA 2E9PA 3LPBA 5C1QB 4NCTC 2C6IA 3PSDA 2QU6A 1ZMWA 2DWBA 1WAKA 1Q41A 3NUYA 1VYWA 4IZ7A 4TWOA 4WD5A 4WKQA 3I4BA 2GFCA 3T9IA 3A7JA 2J0MB 3ZLYA 3JR1A 4YUQA 4JJRA 4ACDA 2OXYA 4QMUA 4C4IA 2G15A 3W8LA 4O0RA 4ANLA 4E93A 4EKLA 2QR7A 4X21A 4I6FA 3PG1A 5EHYA 4DFBA 3GFEA 1ND4A 5FEQA 2VN9A 4RWLA 4X3FC 3E3BX 3E62A 4JI9A 3RZFA 3NR9A 4R3PA 2VUWA 3R9NA 3UO4A 3NWWA 3N4TA 3GU4A 4WUAA 1VR2A 3MH0A 4QMZA 4WRGA 2YABA 3E88A 1H00A 5ANGA 2JFMA 2BAJA 3PSCA 1OKZA 4Q2AA 2X8DA 3E93A 4QMWA 4YZCA 4D1ZA 3FLNC 1M2PA 1JSUA 3PJ1A 4PPBA 4QP1A 4G31A 4RSSA 3MTFA 3HVCA 5CAUA 2W7XA 4I6HA 3O71A 3T9TA 3V6SA 5LMKC 1PJKA 2VTHA 3KXGA 1QCFA 2WMXA 4UWYA 2NRUA 5AR3A 3S1HA 3R7UA 1PXNA 3A4OX 4KABA 2X6DA 3Q96A 4RFMA 2RKUA 4YSJA 4IB0A 1A48A 4Z7HA 1Y8YA 3U4UA 3SX9A 3ULIA 4ACGA 5DRBA 5EDRA 3ZUTA 3FI4A 2IVVA 2B54A 3FZSA 4M13A 4EHZA 3AQVA 4AFJA 4FT7A 3QUEA 3E8EA 1ZOEA 4FV9A 4PDPA 3GU7A 2UZEA 1OPLA 2ETRA 4L68A 5EM5A 1YOLA 3DXQA 4WIHA 3QTUA 3R7VA 4IWPA 3F3TA 3IW8A 4NKAA 3UJGA 1NA7A 1Q3WA 5IPJA 2WZJA 2BAKA 4RJ6A 2ITNA 2WXVA 3MBLA 4W9WA 3UVPA 4HNIA 4QTEA 2BMCA 4AN9A 3UMXA 3WILA 4GT5A 4NM0A 4O0XA 3S3IA 4FGBA 3V6RA 4GFOA 4JNWA 5FGKA 1ZRZA 1YXVA 2JDRA 4G3EA 4IJPA 4UZHA 4BCOA 4EBVA 4N0SA 5H2UA 3QYZA 3D15A 2W96B 4RIWA 5M09A 2R7IA 4OTIA 3RHXA 5KUPA 5LVPA 1G8AA 3UIBA 3SA0A 2UV2A 2BTRA 1GIIA 4RJ7A 5EYKA 4JR3A 3I5ZA 2FB8A 4JOAA 4TPTA 5GZAA 1PKDA 2FGIA 4IAZA 3SXSA 4E8AA 4IXPA 5M4UA 4NZWB 2C6EA 4ZZOA 2HZ0A 3F5UA 4FKQA 2V7OA 4G3CA 3HMNA 3W18A 1FPUA 3KRLA 2PUIA 3UGCA 3I79A 3QFVA 3VBYA 4G1WA 4F9WA 4D4RA 1W0XC 2UZTA 5GZ8A 3EMGA 2PVMA 4XOZA 5C01A 4FKWA 5K5NA 5IU2A 4YTIA 2C0TA 3OW4A 3FC2A 2YZLA 1IA9A 4BZOA 4QQCA 2JDTA 5AIKA 3G9NA 4WG3A 3LMGA 3QQLA 2O2UA 5GJFA 5M4IA 5F1ZA 5BMSA 2YIRA 2I7QA 3V01A 1WBVA 4G2FA 4FEXA 4FICA 2WQEA 4FV1A 4FEWA 2IW8A 4O0VA 4NT4A 5I9UA 4AZEA 4LRMA 4DCAA 4IHPA 5HIDA 4UEUA 3R2BA 1XWSA 5JRQA 3TNWA 3EQCA 4GUBA 4EH4A 3AT4A 3IONA 4C58A 5HVKA 5J9ZA 3TDVA 4BWXA 4DEAA 1DAWA 3E7VA 4ZY4A 2OIBA 4XV2A 2OJIA 3AGMA 3LQ8A 4FNZA 4UMUA 4RZVA 3ZZWA 5C03A 1LP4A 3PZEA 4J1RA 5CF8A 3KREA 2XNPA 4KBCA 3DLSA 3UNZA 5IQEA 5H9BA 4TYHA 3QRKA 5FLFA 5TF9A 3TXOA 3BEGA 3O23A 5EM6A 3P0MA 5M44A 4O7TA 2ZYBA 1OL7A 3BYOA 5E91A 5CSHA 1V0OA 4FSMA 2BRBA 4RIXA 4HYUA 1K2PA 1UNHA 1GZKA 3O96A 4USDA 3A62A 3GU8A 3E8CA 2KULA 3LJ0A 4E26A 3QLFA 4CRSA 5J9LA 3ETAA 3BELA 3V8TA 3ZU7A 3F3UA 3RI1A 4F7JA 3EN7A 2OJGA 4FKJA 4FL2A 3QTXA 3TNIA 4PPCA 1H01A 1YDRE 1WMKA 3IPHA 2WPAA 4L01A 4C3FA 5T68A 4XG2A 3MH2A 4Y72A 4V01A 3WF6A 3FLYA 3KXNA 2VTRA 4LUDA 5HLPA 4RGJA 2FSOX 4QP9A 3R7OA 2RFNA 4IEBA 4M3QA 3OUKA 3FL4A 4BDJA 5J1VA 3ZC6A 1UNLA 2BILB 2IO6A 3G6GA 5JSMA 4CCUA 2EUFB 2R3FA 2J0JA 4FSTA 4DHFA 1IAJA 4LV5A 5AP4A 4ITIA 5JRSA 3DU8A 4XEYA 4XG7A 2BHEA 2ITOA 3D0EA 2QLUA 4EH6A 3DXPA 1BX6A 1GIJA 3LMHA 3F5XA 4C37A 4TZRA 2OK1A 5DI1A 4ANMA 2VWZA 2QHMA 3QUDA 4PMTA 4BBMA 3JS2A 4AOIA 4I21A 3UOHA 3FUPA 2P2HA 3D5XA 4AG8A 2X1NA 2Y6OA 3NYNA 4MHAA 4ANOA 3BWJA 3CR0A 2JKMA 4UB7A 4BGGA 2XIZA 3UZRA 3F2NA 3ODYX 3KL8A 4HCTA 1I09A 3BQRA 3NPCA 2WTKC 1GJOA 3FY2A 4RQVA 3IW7A 4FIIA 4NM7A 3AC1A 4CG9A 4QTBA 4TTHB 2YDKA 4L42A 2YEXA 1KE6A 4QP2A 5AMNA 1Q5KA 3CBLA 4YC8A 2C69A 3RJCA 3RK9A 2PZPA 3OHTA 3TKIA 4IB3A 3BV2A 4OTQA 4OAUC 4EOQA 1E1XA 5K4JA 2P4IA 2VX3A 2W1GA 3AC8A 4IAKA 4JL9A 1P5EA 3QTQA 4LL5A 4F1OA 5CANA 5EYCA 3ORMA 3VF9A 3OXTA 2A27A 4RT7A 2R3LA 2PY3A 1Q97A 3KN5A 2PK9A 4IADA 4I94A 3W33A 2UUEA 4WUNA 1NXKA 3D9VA 2HWOA 1R78A 3HRCA 5GNKA 3HLLA 4BIBA 5HE2A 1YXUA 2XK4A 3UOJA 4K8AA 5M4FA 3LM0A 4ZTRA 3RTPA 4S2ZA 5IA3A 3MW1A 5KZIA 4U41A 1IAHA 1MUOA 4QP6A 3KXHA 4FBXA 3MA3A 3QQKA 3HZTA 1J3HA 1XH4A 4YLKA 5DEYA 5BUIA 4ALWA 2X2MA 4RJ5A 3DY7A 4EL9A 3F2RA 2ZMDA 4P5QA 4KSPA 3BE9A 3FLSA 2PSQA 4GK2A 4RVTA 5AR8A 3ZDUA 3SLSA 4AS0A 2CN5A 4FV5A 4EQUA 4RMZA 4R5YA 3QF9A 4LGGA 4IE9A 1OBGA 5IQGA 3HDNA 4EOLA 4DH1A 5KMOA 1Q24A 4F7SA 5AA8A 2OF2A 2OG8A 1SVHA 2CMWA 2ONLA 1QPEA 4IZ5A 5HG5A 2BVAA 3PZHA 4IB1A 2WTKB 5K3YA 4EOIA 3ORKA 3TG1A 2C6MA 3Q5ZA 3QD2B 3HNGA 3ZOSA 4U81A 4X2KA 4R8QA 4L53A 4AZTA 5CTPA 4CG8A 5KE0A 1W8CA 4K77A 3D94A 3HV4A 1JSTA 3ROYA 3U55A 4ZMFA 3P78A 5AV0A 5HNGA 3IGOA 2AC5A 4JXFA 3FJQE 3LJ1A 3T3VA 2QONA 3EFLA 4GIHA 5HTIA 3B8RA 3DNEA 3KKVA 4AZWA 4GYIA 3NUAA 4BKZA 4BDAA 2ETKA 2CKQA 2XA4A 2X4FA 3MJ1A 3UOKA 5CVGA 3QRJA 4Y8DA 4QPAA 4BZDA 4MD8E 4U3ZA 1TVOA 5HNBA 4AX8A 3HMPA 4Y46A 3R04A 5CSPA 3RPVA 2VO3A 2JDVA 3PSBA 3BCEA 4CKRA 5LWNA 3PWYA 3F6XA 3ERKA 3W32A 4YC3A 4CFMA 4ZSGA 2BDFA 4Y95A 2PWLA 3FZRA 4N4SA 2GQSA 5AX9A 3U87A 2R3IA 1NT2A 3VUIA 2W1FA 2VTJA 3SOAA 3E8NA 4QMVA 5HBHA 3RHKA 3VHKA 5K5XA 4LMUA 3WZEA 4BI0A 4E6CA 2OI4X 3F5PA 5ANOA 4YR8A 2BCJA 1JKKA 2J51A 4O0YA 3SDJA 2GQRA 2FYSA 4TNDA 1PMNA 4N6ZA 5L6PA 4ORKA 3WOWA 3K3JA 4W9XA 2GSFA 3F3ZA 5C8KA 4IWQA 2B9HA 2QU5A 2VTIA 1LR4A 3UC3A 3VHEA 2WTJA 1BMKA 4FZ7A 2C5XA 1ZYDA 3PA5A 5BPYA 4BCGA 4RIWB 2VTQA 4GFMA 4KKHA 4EH8A 5J79A 4J8MA 4KS7A 3OOGA 4H3BA 4ASDA 5CT0A 4C02A 4RJ4A 3VS0A 5CSWA 4DFNA 1PXJA 5CF6A 1B6CB 2X6EA 5FQDC 4OR5A 4OT6A 4GSBA 4GK3A 2J50A 2YJSA 3ORNA 4ZTQA 3SD0A 3MFSA 1ZWSA 1XJDA 4EONA 1M2QA 3QHRA 2E2BA 5L4QA 2C5NA 2F49A 2X81A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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