5A5XB

Crystal structure of se-met mltf from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
417
structure length
417
Chain Sequence
b'EGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFAQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQ'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
molecule tags Hydrolase
total genus 141
structure length 417
sequence length 417
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
B PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5a5xB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5a5xB02
1MXYA 4EQ9A 4ZEFA 5CMMA 2I3WA 1N3XA 4IY5A 4RJZA 1KWHA 1LFHA 1A40A 2OJTA 4E0WA 4RPOA 1Y4CA 1DTGA 1B5IA 3CFLA 4JWYA 5CBSA 4XTCQ 3MBPA 1QUJA 1B51A 3QSLA 5A5XB 4H1XA 3C34A 3PUWE 3QUJA 3UK4A 1BIYA 1I69A 2W7YA 2VD3A 4QFNA 4LP2B 4OERA 4IGTA 2XXXA 2HXWA 1PDAA 1ZJLA 1A99A 1B4ZA 1CE2A 2DXRA 2O1MA 3T22A 2X26A 1J1NA 4I9DA 1D9VA 5TP9B 5AA1A 4MLQA 3C31A 3PMVA 2ZYNA 3USDA 3T9HB 4DCXA 1TWYA 5L9OA 3K01A 3EQ1A 5M2VA 4R72A 4HCYA 3O97A 1SW5A 4F3PA 3GZGA 2PVUA 1MS7A 3OMBA 1B05A 1L5TA 1H44A 3T9VA 1FTOA 3B6TA 3K6UA 1ZTYA 3OO9A 4KYEA 3Q27A 3SERA 3C9HA 3FXRA 4YICA 4F39A 4OZ9A 4DXCA 2QMXA 3ECRA 2DVCA 3GXAA 3MAMA 1Y3QA 3SEWA 3VFJA 4QSEA 1JW4A 1IXGA 4YZZA 3DLNA 3IORA 1FTMA 2ANJA 2XXIA 1EZOA 2HZKA 3BFTA 5EYFA 4U2RA 1FCKA 3PUXE 1PB7A 3TFLA 4RK9A 3K00A 2UVHA 5A5XA 4U23A 2XXVA 2HZLA 1MXVA 2CZLA 1QJMA 3E4RA 4BDQA 2O84X 1YCJA 2Y7IA 2RCBA 3IOWA 1MQIA 4LZ8A 4U22A 2UYEA 2Y7WA 4AQ4A 1TFAA 4U4SA 3IL1B 3Q29A 4HCWA 1LAGE 1US4A 5TP9A 1POTA 3P7IA 3SETA 4MF3A 4KPTA 4GXAA 1Y3NA 1OQHA 3EF7A 2PBWA 3MQ9A 1SYHA 3G3GA 4QFLA 3V8XB 3S2VA 4G68C 3QAXA 3MVWA 1PB8A 3IO4A 4Z7EA 2I4BA 3WAEA 1OQGA 1Y1ZA 3FASA 2UVJA 1I6BA 4G4PA 1AH5A 2ABHA 3KN3A 4LQ5A 3FVGA 4ESXA 4QFOA 4MLVA 4RK2A 5K2YA 3MUQA 3PV0E 3M3FA 2X7QA 1JVYA 2PX1A 2F6GA 1ANFA 3K6XA 3CIJA 4JB7A 4R9FA 3MP8A 1SYIA 3EPEA 2OZZA 4ZEKA 4EQBA 5FHNA 3TTLA 1URGA 3TDJA 3JYRA 3K2DA 4YKPA 1MQHA 4QF9A 5TPAB 1I6QA 2F7AA 2XXWA 2QMWA 3DM0A 3S9EA 4ZZEA 2OLBA 3MVXA 1SD3A 2DS9A 2QS3A 1LCFA 2AL4A 5ICTA 4Q5TA 1O7TA 2IA4A 3IX1A 3MP6A 2ZMBA 2PT1A 5I57A 2O69A 4Q0CA 3UORA 3SEXA 4OXVA 3RLFE 1S50A 1IQ7A 3O6HA 4U4XA 4EQ7A 2VP1A 2XX8A 3BBRA 2R9JA 4R6YA 5I84A 3CVGA 3EHTA 1DSNA 3FIRA 3GLBA 4EUOA 4NE4A 3LSWA 5LOMA 4F2OA 4BDNA 3FATA 3RPWA 1LB9A 1OMPA 4THIA 1D9YA 4HTGA 3H03A 4KD5A 3H6UA 4F22A 3RGYA 2A5TB 3VLVA 3TKDA 3CSBA 2IEEA 1ZBMA 2RCAA 4N13A 3TODA 1R1NA 2PMSA 4ISUA 1S9TA 1JNFA 2XXTA 3O9PA 1O63A 3Q28A 3PPRA 2RC8A 5L9SA 1N0TA 1ZKBA 4C1UA 5I59B 3CRBA 3FV2A 4RA1A 2B65A 4OFOA 3B6WA 3W15C 4QSDA 4FATA 4ELPA 2BJJX 2V3TA 1XC1A 4AB6A 2H99A 2NXOA 1MDQA 2Y84A 4LUBA 2E1SA 2GFEA 5AA2B 4DDDA 1NNFA 4F1YA 2H98A 4X9TA 4ND9A 3V5AA 3G3JA 1BP5A 2UVIA 3OD7A 4GFRA 2ZNSA 1A8EA 1H43A 4GLIA 2OWSA 1A54A 1ELJA 3OO8A 3FJGA 1B6HA 4BDLA 2A5TA 2AIXA 2NUVA 5IKBA 1GR2A 4BDOA 5H8SA 1B1HA 4NF8A 1FQBA 3I5OA 1EU8A 3H4ZA 4BLAA 3RUMA 1ATGA 2XXQA 3OSRA 3MC2A 1XT8A 4GWOA 1AOVA 1B0LA 4O3CA 1LAFE 1XVXA 2P2AA 2XHDA 5I59A 3MP1A 4GF8A 3O2AA 1QW0A 3VXBA 1DPEA 3HHFA 4DXBA 1Y3PA 4F3BA 4FORA 3H7MA 4YAHX 1PB9A 4LA9A 2QPQA 4IO2A 3DP8A 1R6ZA 2A5SA 1H3DA 3MWBA 5AA2A 4OEUA 2RINA 1M5DA 2HAUA 1GVCA 4R2BA 2F5XA 1LGBC 2D21A 1OIBA 3T9XB 2LAOA 5CBRA 4JSOA 4GIZA 4YKKA 3I6VA 3MZBA 1H45A 5I58B 2QS4A 3RNNA 2ALUA 4F19A 3CI8A 2THIA 3LC8A 5DTBA 4ZDMA 2Q8JA 3K4UA 4BDRA 4I62A 2DWAA 3VVDA 4OHNA 1QUIA 1MM7A 4MFIA 5F7VA 5DYHA 4IGRA 4KI0E 4F3SA 1LBCA 1MXUA 1TT1A 3G3KA 3PUYE 2Z22A 4R9GA 3LR1A 4DE8A 3D4GA 3PD9A 2B3BA 3MJNA 2I4CA 5ISUA 4ONYA 3KBRA 2F7BA 3FVOA 4XXUA 1JW5A 5ICQA 4FECA 1B5HA 1R9LA 4YMBA 4NWDA 4JDFA 2UVGA 4K3FA 3PGFA 2Z8DA 3M3KA 1SW1A 3TZAA 1LSTA 4QFKA 1IUDA 2RKMA 2OWTA 3H3GA 5DEXB 3OENA 3SEYA 2H25A 4POXA 4YB6A 4PFYA 3M8UA 3C32A 3IJOB 4QSCA 4KR5A 1N7XA 5I2NB 5DVJA 4U21A 1I6AA 2WKYA 4F1UA 3MVZA 1NMUA 1MY2A 5I58A 3O29A 5KZTA 3BKIB 2FYIA 3PU5A 2HEUA 3KN7A 3LBSA 1FQDA 2D5WA 3O6GA 1B5JA 3S9NC 5DT6A 4C0RA 4FIMA 3H6VA 1JETA 2XXYA 4FE8A 3GBAA 3AXFA 3A09A 4ZEBA 3T9UA 4PE5B 1HSJA 2RF1A 3FUZA 3FVNA 2DWHA 1MM6A 1Y20A 3S9LC 5I57B 4OETA 2QS1A 3Q25A 3IB2A 3JZJA 2GHBA 4OYVA 2XX7A 4H5FA 1SDXA 4OVJA 4DCYA 3MZ9A 4GD5A 2HQ0A 4RXLA 3TELA 1B7HA 4F3GA 4XIGQ 1QUKA 3V89B 3HHGA 5DVFA 1B3GA 1XOCA 3RQTA 5DEXA 3MZ1A 5B70A 1OVTA 3Q26A 3TTKA 3LSXA 2RC7A 5I2NA 3MVYA 4L17A 4LZ7A 3T66A 5ITPA 2F6PA 4KYDA 1QVSA 2PT2A 4U1ZA 5KDTB 1MQDA 5CRYA 2OCUA 4LVQA 4GL8A 4R6KA 1P1NA 2Q2CA 1FQFA 3WAFA 4C1TA 3IR1A 1NFTA 3CFZA 1FQAA 1N76A 2F36A 2VGQA 3B6QA 2QSXA 2DVZA 1Y1MA 4DZ1A 4LONB 1II5A 4DLDA 3JV9A 1VSOA 4YB7A 2F97A 3T93B 1XVYA 3UGWA 2O6AA 4TLLB 3MW0A 4XKPA 2R71A 4O3AA 4RY1A 3FXUA 1LBBA 1GV8A 1RKMA 3RY3A 3FGSA 4R6HA 3UIFA 3TMGA 2H5YA 5CMCA 1MH3A 5H8HB 1URSA 4WEDA 3UA8A 1LCTA 4YB5A 1B58A 3TTNA 3DP4A 3FJ7A 2REJA 1B4HA 3M3LA 2ZYKA 3U94A 4ZS9A 3DP6A 4GRKA 2GHAA 4YU0A 3FJMA 5KDTA 5B7DA 1NL5A 3ZSFA 1PC3A 1Y9UA 1SI1A 1IITA 3SKPA 3N94A 3R7XA 4NF8B 1P1OA 5JTYB 3L6GA 2DSFA 4R73A 3TYHA 3H06B 4R75A 3IOVA 1EZ9A 1JEVA 5CI5A 1ZLQA 4H8JA 3A3UA 1UTHB 5HM4B 5H8QB 3K1NA 3R6UA 1SQYA 5CM6A 2Z23A 3KFMA 4H8IA 1A55A 5CMBA 1M5EA 3RN8A 4RPNA 3T96B 4I1DA 1VFDA 1MDP1 4IB2A 4HS7A 3VV5A 4PETA 4ZE8A 5FHMA 3I3VA 2V3QA 1LLSA 1Z7ME 1WVJA 4JSDA 4WXJA 1R9QA 1PEBA 1MY1A 1Y4TA 3KJ7A 3QXMA 2FA7A 1Q1KA 5AA4B 3HSTA 1DPPA 2F35A 1OVBA 4ZECA 4KCDA 4PFUA 5H8HA 4EDPA 1PBPA 1NNTA 3KJTA 3K1PA 4DIGA 2F34A 3C36A 3ILUB 1H76A 2O68A 3L6HA 4H6DA 3U8QA 3H6WA 5DVIA 3ZKLA 5JK4A 3A3CA 2YPNA 4GL0A 4IO5A 3K02A 2GRVA 4ZE9A 5HBCA 2V3UA 2YJPA 2Y7PA 3K1MA 3DELB 1UQWA 2E0SA 2I0CA 2NWJA 2HCAA 5K2XA 5JTYA 2XXHA 1XS5A 5FTHA 2QJEA 2FNCA 2ZXTA 3TCHA 1B9JA 3S4UA 1UTHA 5KCJB 5H8QA 1UTBA 2DXYA 5BUUA 1JVXA 4KYSA 3PD8A 4PP0A 3UN6A 3EN3A 2Q2AA 2O1LA 3SEUA 2Z8EA 1AMFA 1F9BA 1P1UA 3OEKA 2NVUB 3EHSA 1P1WA 3K6VA 3N26A 1FW0A 5L9MA 3K6WA 1MPCA 5AA4A 4ELQA 2Y7RA 1LFIA 4P11A 1NNPA 4F1VA 2ONRA 1USYE 1BKAA 4RYAA 3TCGA 4FEBA 3HO7A 1IEJA 1D4NA 2Y7KA 1DTZA 4QHQA 2Q88A 1AL3A 3BFUA 5TU0A 4OFLA 3RTFB 4IO6A 1NNKA 5F1QA 4P0IA 1B3LA 3CFXA 1GTKA 3C33A 4WKMA 4OEVA 1IXIA 5H8FB 1B1XA 3E3KA 1MPDA 3FZVA 2Z8FA 2DP8A 4NF6B 1MQGA 4FJPA 1EH3A 2X7PA 2ONKE 1M5BA 4YKIA 1QULA 2DE3A 3G7WA 1TXFA 1B3HA 4G8HA 3OXNA 1HSEA 3U93A 5KCJA 1MG1A 4NF5B 3RT6B 1YPNA 3N6UA 1UIUA 1N3WA 4UACA 1XHYA 5JEIA 1UIVA 3N5LA 3R26A 4ZEDA 1JQFA 2V93A 3IOUA 5ELVA 1QKBA 4OMBA 3PUZE 3KSJA 3KOTA 5CMKA 1IZ1A 2F8DA 2AYSA 1LFGA 1MY0A 3F11A 4Q30B 3C4MA 4X48A 4XKQA 4N6PA 4H67A 4JXIA 4G77A 2R6GE 3U72A 1B32A 1BLFA 3O28A 2I6EA 3IAZA 4ZZAA 2QS2A 1T0KA 4IO7A 4TOZA 1P1QA 4ELOA 4EXKA 1URDA 3SDFA 3OOAA 1SVXB 4X1BA 2ZNUA 1N84A 4GVOA 4LZ5A 4QRZA 5J1DA 2VHAA 5H8FA 4M1VA 3U92A 4NF6A 1SI0A 1MQJA 4F18A 1FTLA 3G3FA 3PPQA 2D3IA 4KHZE 3ZS6A 1BTJA 3OO6A 2ESNA 1Z7NE 3PMWA 2O7UA 1ZIUA 4LQ2A 1ZU0A 2RC9A 4KCCA 4H5GA 4NF5A 1MY3A 1DMBA 2V84A 4EXLA 4RNSA 4EF2A 3KSXA 2O7IA 3TEPA 2QL3A 4KQPA 2VOZA 3OEMA 3TQWA 2CMOA 4N07A 3O6IA 2NOOA 3FVKA 1RYOA 4F29A 1MXZA 3FD3A 3D4CA 5AA2D 2DE4A 3ODBA 3TQLA 1PBQA 5HPQA 3UP9A 3CG3A 3EHUA 4XKRA 1AIVA 2XXRA 1IXHA 2P0SA 5BWJA 3H6TA 4U1OA 1YAEA 5ITOA 3VVEA 3N6TA 5I2KB 5IAIA 2OBGA 3HPIA 2Q9TA 2Q89A 4TQUQ 3IB1A 1MRPA 5AA3A 4AB5A 1SW4A 3W9VA 2UXAA 3RT8A 3ONMA 3KGCA 4M4GA 3CSGA 4GXSB 4OTEA 4MBPA 4NF4B 2ZNTA 2QRYA 1B3EA 4NTLA 1SBPA 3QYTA 1NH7A 4FEDA 5I56B 1SW2A 4TLMB 1ZMGA 2ZYOA 1MXXA 2V25A 2KLFA 3FXQA 4I8CA 1QKAA 3VXCA 1A8FA 1M5CA 3PMXA 3KN8A 1POY1 4G8NA 1IIWA 3U1OA 1MXWA 2I0BA 3PPOA 1MPBA 4G8MA 3FV1A 2B3FA 3HV1A 1GGGA 3IOTA 3KZGA 1NKXA 4F31B 4POWA 3VLWA 1O64A 4PFWA 3TCFA 2REGA 5EHMA 4IO4A 3VLUA 1JW1A 3PPPA 3QIMA 1CB6A 2ZYMA 1S7YA 5AE4A 3RTWB 1OLAA 2I58A 4O3BA 1EZPA 3W9WA 2YLNA 5I2KA 4GQOA 2F7CA 5FHOA 4QFPA 4HW8A 5CC2A 2XX9A 4PQJA 1B40A 4DXUA 4G2ZA 4Z0IA 2DWJA 3C35A 4WEPA 1HSLA 3E9XA 3SESA 3QUFA 1WDNA 2ONSA 4F2QA 1P99A 2DE2A 4FAJA 3HCQA 1DOTA 4LATA 3OSQA 1N7WA 4XKNA 4IY6A 2XD3A 4NF4A 1USYH 4OFJA 1VFEA 3VE1B 3QK6A 1M5FA 2XXPA 5I56A 1B2HA 3TUSA 4IO3A 2AL5A 3E13X 2G93A 1A7LA 3GBBA 3S9MC 1UTBB 4PFTA 1LAHE 1FTJA 3SEVA 1MH4A 1D3KA 4JBZA 5TPAA 1FQCA 4ESWA 4BDMA 4OENA 3VDFA 2P1SA 3KEIA 2G29A 1IXCA 4YKJA 1JEUA 4G68B 2H9BA 3K0VA 4MH5A 1B3FA 3VVFA 4NMYA 4E0XA 3MPKA 5H8NB 3TTMA 4ELRA 4H65A 4OESA 2GH9A 1FTKA 2XXUA 1VR5A 2I49A 1FQEA 2I3VA 2DYXA 4GOTA 3PUVE 3TTRA 4NEDA 1WODA 2XD2A 1LAXA 3OELA 2DOJA 4P0GA 3PPNA 1B0HA 4Q8RA 4JWXA 2PYYA 4ECFA 4ZEIA 4R74A 5FTIA 3THIA 1VE4A 1NH8A 2O51A 3LUYA 3KOSA 1Q35A 1TFDA 4X1DA 3MPLA 1MY4A 3IJXB 2VD2A 4EF1A 5L8DA 1RYXA 3B7DA 1B52A 2M8CA 4NWCA 1B7ZA 2I48A 3G3HA 3IK6B 2OK2A 3V83A 3TAJA 1B7UA 3IB0A 4OQOA 3ZKKA 4KFQA 1YTVA 3LSLA 2DWIA 4OWDA 3O66A 5EHSA 3IO6A 2DQVA 4JWOA 1OLCA 3CR9A 3HN0A 4G68A 3OO7A 2F78A 2UYFA 2HAVA 3KG2A 3CG1A 1B46A 3TPAA 5H8NA 3G3IA 4R2FA 2H4IA 1LB8A 1US5A 4YMAA 1N04A 2HFBA 4H0WA 3LSFB 3ILTB 4UA8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ISPA 1MXYA 4EQ9A 4ZEFA 5CMMA 2I3WA 1N3XA 4IY5A 4RJZA 1KWHA 1LFHA 1FJ6A 1A40A 2OJTA 4E0WA 3KC1A 4RPOA 1Y4CA 4NG7A 1DTGA 4PGPA 1B5IA 3CFLA 4JWYA 5CBSA 4XTCQ 3MBPA 2ZZWA 1QUJA 1B51A 3QSLA 5A5XB 4H1XA 3C34A 3PUWE 3QUJA 3UK4A 3CHGA 1BIYA 1I69A 2W7YA 2VD3A 4QFNA 3IFCA 4PF6A 4LP2B 4OERA 4AS5A 4IGTA 2XXXA 2HXWA 1PDAA 1ZJLA 1A99A 1B4ZA 1CE2A 2DXRA 2O1MA 3T22A 2X26A 1J1NA 4I9DA 1D9VA 5TP9B 3FXBA 5AA1A 4MLQA 3C31A 3PMVA 5EYHA 2ZYNA 3USDA 2WEFA 4PFIA 3T9HB 4DCXA 1JP4A 1TWYA 5L9OA 4JVCA 3K01A 3EQ1A 5M2VA 4R72A 3HFUA 4HCYA 3O97A 1SW5A 4F3PA 3GZGA 2PVUA 1MS7A 3OMBA 1B05A 1L5TA 1H44A 3T9VA 1FTOA 3B6TA 3K6UA 1ZTYA 3OO9A 4KYEA 3Q27A 3SERA 2OX3A 3C9HA 3FXRA 4YICA 4F39A 4OZ9A 4DXCA 2QMXA 3ECRA 2DVCA 3GXAA 3MAMA 1Y3QA 3SEWA 3VFJA 4QSEA 1JW4A 1IXGA 4YZZA 3DLNA 3IORA 4N91A 1FTMA 2ANJA 2XXIA 1EZOA 2HZKA 3BFTA 5EYFA 4U2RA 1FCKA 3PUXE 1PB7A 3TFLA 4RK9A 3K00A 2UVHA 5A5XA 4U23A 2XXVA 2HZLA 1MXVA 2CZLA 1QJMA 3E4RA 2CZKA 4BDQA 2O84X 1YCJA 2Y7IA 2RCBA 3IOWA 1MQIA 4LZ8A 4U22A 2UYEA 2Y7WA 4AQ4A 4PAIA 1NV6A 1TFAA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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